1L64A

Tolerance of t4 lysozyme to multiple xaa (right arrow) ala substitutions: a polyalanine alpha-helix containing ten consecutive alanines
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLAAAAAAAAAAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Folding and function of a T4 lysozyme containing 10 consecutive alanines illustrate the redundancy of information in an amino acid sequence.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 55
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1991-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l64A00
111LA 1DYGA 1L89A 142LA 1CU5A 3NY9A 1L54A 1C6BA 1D2WA 1QT5A 1C65A 1KY1A 2RB1X 1XJTA 4W51A 1L29A 184LA 1P5CA 3RZEA 3OE6A 1P64A 1DYDA 197LA 138LA 126LA 1C69A 1D3FA 1L41A 1P36A 2F2QA 256LA 3OE8A 1L52A 1LGXA 1L38A 1L95A 188LA 1QS9A 1C6MA 1L50A 1LWGA 1P2LA 1L18A 1L26A 2RAYX 235LA 1L01A 1QTZA 1G0KA 262LA 245LA 2HULA 1QUHA 4I7OA 1L55A 146LA 1L37A 3OE0A 2A4TA 1L70A 1L46A 4DKLA 176LA 3JR6A 1DYAA 1LYFA 1G0GA 1L81A 4W55A 1D3JA 152LA 2NTGA 7LZMA 1C6IA 115LA 169LA 127LA 1CVKA 250LA 1SWYA 1C63A 1L12A 1SWZA 221LA 228LA 1LYJA 1KS3A 1L97A 1P3NA 2RB2X 1I6SA 1L83A 1KNIA 3DN2A 165LA 1G0MA 1T8AA 4IAPA 1CV4A 213LA 3GUIA 128LA 1C68A 1T6HA 230LA 3HUKA 1P46A 1C6EA 1L39A 1L21A 1L82A 1D2YA 159LA 4I7KA 1P37A 205LA 145LA 4EPIA 241LA 1CV3A 1LI2A 190LA 201LA 1L09A 1L15A 4AQNA 1PQJA 171LA 3HU8A 2OEAX 1QTDA 3SB9A 3DNAA 2QARC 1C6QA 1L67A 242LA 246LA 206LA 1G0JA 1L34A 131LA 1C60A 1OVKA 175LA 164LA 139LA 3DMXA 1CX6A 249LA 3V2YA 108LA 5LZMA 3DN0A 3HH5A 3RUNA 3NYAA 2QB0B 6LZMA 1SX2A 1L07A 180LA 1L10A 215LA 119LA 1P56A 1P2RA 1B6IA 238LA 1EPYA 1C62A 4ARLA 1QT4A 1L04A 251LA 1L47A 1QT8A 1NHBA 155LA 1L66A 1L32A 2NTHA 186LA 2OU9A 1L74A 137LA 1L77A 1L19A 4EKRA 2OE4X 2B6WA 1G0PA 1L22A 1L80A 3GUKA 3HH4A 4DAJA 1QS5A 2Z6BA 1CU6A 123LA 130LA 1L98A 3K2RA 113LA 1C6NA 1LYHA 1L91A 3HDFA 1QT7A 3C8RA 1L59A 4E97A 1CV5A 4I7RA 170LA 3L64A 2B6YA 2LCBA 181LA 3FADA 1L64A 1T8GA 231LA 244LA 160LA 259LA 4I7SA 3CDQA 3GUJA 1ZURA 3SB7A 209LA 1OV5A 3PDSA 2LC9A 237LA 1L25A 3NY8A 1CU2A 1KW7A 182LA 1L57A 2OTZX 1L94A 1CV1A 1L02A 220LA 144LA 3G3WA 1DYCA 1C6LA 229LA 2ANXA 2B70A 141LA 1P7SA 1C6HA 253LA 2O7AA 248LA 4ARPA 233LA 1L0KA 168LA 1CTWA 3CDOA 1OWYA 2RBPA 236LA 3GULA 1L92A 173LA 1L69A 1L00A 4ARJA 4PK0A 162LA 2O79A 1LWKA 4W54A 189LA 4EKQA 1PQDA 1L87A 1T97A 1L20A 1L65A 260LA 177LA 1CV6A 1QTCA 218LA 3HTGA 163LA 4EJ4A 157LA 232LA 3DN1A 3L2XA 1L93A 3VW7A 2HUMA 1L28A 2RBRA 1L86A 3HU9A 247LA 1QTBA 4I7NA 3HH6A 191LA 1OVJA 1L35A 196LA 125LA 3GUPA 140LA 1DYFA 1KY0A 2O4WA 3HT8A 3FA0A 1L14A 4W52A 4EKPA 1QT3A 1P6YA 216LA 1L13A 3SN6R 2RB0X 1L33A 252LA 1L43A 225LA 3HTBA 3SBAA 1L63A 1C6GA 1LI3A 4LDEA 4W57A 1LGUA 4LDOA 3DN4A 1L99A 261LA 2B73A 1L62A 226LA 227LA 1C6AA 4S0WA 257LA 1C66A 1C64A 4ARQB 120LA 1D3NA 224LA 1L85A 239LA 1C6TA 1L11A 212LA 2B6ZA 3DN8A 3HH3A 1C6PA 3CDRA 4I7PA 1QSQA 3CDVA 102LA 4GRVA 2B7XA 178LA 1C6FA 1WTHA 4EKSA 3QAKA 1CU3A 1LYDA 3DN3A 4W58A 4ARMB 112LA 234LA 1OVHA 1L96A 1G1WA 3GUMA 2OTYX 3LZMA 4YXAC 1G0QA 1LPYA 3C7YA 4W59A 2Q9DA 1L51A 2OE9X 2IGCA 211LA 1OV7A 2RAZX 1CUQA 223LA 3SB5A 3UONA 255LA 1L68A 214LA 1L23A 114LA 1LGWA 2RBQA 1L90A 4GBRB 3SBBC 1C6JA 4I7QA 1L31A 1C6KA 3CDTA 4I7TA 2OU0X 1L36A 2B72A 3C7WA 2F32A 2OU8A 3HT6A 3HTFA 219LA 143LA 1QSBA 1C67A 3G3XA 1DYEA 167LA 109LA 172LA 118LA 1QTVA 1L76A 222LA 1C6DA 199LA 166LA 156LA 1L49A 2HUKA 1G07A 3EMLA 1L0JA 107LA 4LZMA 122LA 1L84A 1D3MA 1L60A 1QUGA 1C6CA 3FI5A 3C81A 2RH1A 3C8QA 1LI6A 2B74A 1L88A 148LE 240LA 104LA 2ANVA 1LYIA 4EXMA 3SB6A 1L44A 158LA 1L72A 1QT6A 1L40A 1L42A 3OE9A 1L17A 1QTHA 210LA 1L53A 2RBNA 1D9WA 1PQIA 3C82A 4W53A 1L48A 3HDEA 1G06A 3HTDA 3DKEX 2RBOA 5I14A 2F47A 174LA 1LLHA 4EPFA 1L71A 3DMVA 1L27A 4ARQA 198LA 1QUDA 3C83A 243LA 1SSWA 1L08A 1ZWNA 1LYGA 4LDLA 3C7ZA 3GUOA 3F8VA 183LA 3D4SA 4YX7C 151LA 1L58A 4ZPUA 3SB8A 1L45A 200LA 110LA 1LW9A 1L61A 3HT7A 4K5YA 4DJHA 4YXCA 1T8FA 3C8SA 4W56A 4ARMA 3GUNA 1L30A 3DN6A 1TLAA 4I7LA 3C80A 2RBSA 1PQOA 1L24A 2L78A 1L79A 1G1VA 1OWZA 2Q9EA 3DMZA 254LA 1CUPA 1L75A 1L16A 129LA 1PQKA 1G0LA 2OE7X 1L56A 1SSYA 1L05A 2B6TA 3HUQA 1CV0A 1LYEA 150LA 149LA 1ZYTA 1JTMA 4I7JA 1XEPA 4I7MA 1SX7A 2LZMA 2B6XA 185LA 1XJUA 1QUOA 3HT9A 1L06A 1K28A 195LA 1KW5A 1JTNA 2CUUA 187LA 217LA 161LA 3V2WA 103LA 1CX7A 2B75A 1JQUA 1L73A 4PJZA 3F9LA 1DYBA 4OO9A 258LA 147LA 192LA 1PQMA 1CU0A 3G3VA 3PBLA 3HUAA 3ODUA 1C61A 1OYUA 1L03A 3HWLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4J7VA 5KXYA 3NY9A 4Z3MA 1REXA 1C65A 1B2KA 1G7LC 3B6LA 1D6QA 1JKCA 5FHWA 184LA 1P5CA 4G4CA 1P64A 1LYYA 1DYDA 126LA 1C69A 1CJ6A 1KXWA 1D3FA 1L41A 1P36A 2BQLA 3D3DA 2F2QA 256LA 4RLMA 1L95A 1QS9A 4LFXA 1LWGA 1OUEA 1NMMA 1P2LA 3WVYA 2RAYX 1HSWA 4DD9A 3TMVA 245LA 3B0KA 5LYZA 2HULA 1GAYA 2DQCY 2A4TA 1QQYA 1L46A 1LHJA 5HNLA 1RE2A 1OUIA 1F10A 115LA 169LA 127LA 1YL1X 250LA 5B1GA 228LA 4GLAA 1LYJA 5KXSA 4DD2A 2RB2X 1WQRA 1JUGA 3MGWA 4DDBA 165LA 1G0MA 1CV4A 3GUIA 1T6HA 3HUKA 1LKSA 1C6EA 4LYBA 1P2CC 3WUMA 159LA 1GBSA 3A91A 145LA 2G4PA 1C08C 2H5ZA 1GB8A 2IHLA 171LA 3EBAB 3B72A 242LA 3P68A 246LA 4DWXA 1VEDA 164LA 139LA 4ETBA 249LA 4XJFA 1JJ3A 1HFYA 4XYYA 2I25L 2ZNXY 3NYAA 2QB0B 1IC5Y 3N9EA 1IO5A 1DKJA 5ILCA 1DZBX 1AT6A 3T6UA 1QT4A 1L04A 1L47A 1NHBA 1L32A 6LYZA 1B7OA 1BWJA 3AGIA 4XJIA 4EKRA 1UIFA 1TDYA 2B6WA 4WOAA 1L22A 3TXIA 2Z6BA 4DAJA 1L98A 4XJBA 4WLXA 1YKXX 1L91A 3HDFA 1L59A 1LSDA 5LYTA 2LHMA 3L64A 4UWUA 1L64A 1LZEA 2HEBA 1DXJA 259LA 1LHHA 3SB7A 2BQDA 4HTKA 3PDSA 1UBZA 3NY8A 2YBHA 1RFPA 4RW2A 1EQEA 2ANXA 2B70A 1GF8A 1ZVYB 4ARPA 236LA 3GULA 1L92A 2ZQ4A 173LA 1L00A 2BQNA 162LA 1LWKA 1XGRC 4MR1A 1JTTL 2HU1A 5KXMA 1L93A 3VW7A 2RBRA 1L86A 2MECA 3RU5A 2MEEA 247LA 5KJ9A 1UC0A 191LA 1OVJA 5IDDA 5AMYA 3WL2A 3KAMA 125LA 3GUPA 1GBXA 1DYFA 2DQFC 3HT8A 4W52A 216LA 2RB0X 3SBAA 1L63A 1REZA 1C6GA 3OJPA 4LDEA 4N8ZA 1LGUA 4LDOA 3DN4A 1LZ1A 1L99A 1XEJA 1JSFA 7LYZA 227LA 1GFGA 1C6AA 4S0WA 257LA 4OOTA 1C64A 1GF4A 3LYOA 224LA 1L11A 4P2EA 1GDWA 4N9RA 1C6PA 5DM9A 4GRVA 1UACY 1TEWA 1D0MA 3WVXA 1KIPC 1LYDA 3DN3A 1ZMYL 4G4HA 1GFKA 1B7LA 2ZIJA 2NWDX 1G1WA 5KXLA 1ALCA 1G0QA 3W6FA 2IGCA 1B9OA 1QDRA 2BQHA 1L68A 1L23A 4GN4A 3SBBC 3A67Y 3ZVQB 5KXRA 1DPXA 1D9UA 3WMKA 194LA 2OU8A 3HT6A 219LA 5A3ZA 3G3XA 1GF5A 1LZNA 2FYCA 4NWHA 5KKJA 4G4BA 172LA 2ZNWY 4H8ZA 2X0AA 199LA 156LA 2Z18A 5KXZA 1L84A 1C6CA 1GE4A 1HNLA 4EXMA 1L44A 5F14A 1JIYA 3OE9A 9LYZA 5I53A 1A4VA 2BQJA 8LYZA 4LT3A 1L48A 2F4GA 4KXIA 1SLYA 1L08A 3C7ZA 3F8VA 4GN3A 4QDNA 1GE3A 4ZPUA 1LZ4A 4LT0A 4DJHA 1LYOA 4YXCA 1QTKA 4TTDA 1LJHA 1GXV2 1TLAA 2XQOA 1EQ5A 2EKSC 1FLYA 4H9BA 1GWDA 1B7SA 5LVHA 1G1VA 1D0KA 1LZYA 1VDTA 4CFOA 5LVKA 3CT0A 1SSYA 1HMKA 2B6TA 1LJGA 4EOFA 1JTMA 4I7JA 4I7MA 185LA 1QUOA 1L06A 1K28A 1JTNA 2BLXA 1CX7A 4B4JA 2B75A 4H91A 1OUJA 5B05A 1DYBA 4NIJA 1GF0A 4QEQA 1GB3A 1L03A 5APFA 111LA 1DYGA 1MELL 1BB5A 3WU8A 1L89A 1YKYX 5J7CA 1CU5A 2LZTA 1QT5A 4NHTA 2F2NA 3A90A 4LYZA 4H94A 4M6DA 1XJTA 1UUZC 1DQJC 1XGQC 197LA 1QSAA 5I54A 1FLQA 3B0OA 1LGXA 3TXBA 1L38A 2XBSA 188LA 1UIBA 1L26A 235LA 1WVUA 5L3IA 1JITA 2H9JA 3ZEKA 3ULRA 4DKLA 1DYAA 1LZ6A 4WMGA 1LYFA 4HPIA 5I4XA 1LKRA 1C6IA 3AZ7A 2ZQ3A 1SWYA 1E8LA 1FN5A 221LA 4X3BA 1QDTA 1GE1A 1UIHA 1L97A 1P3NA 1IP6A 1L83A 1LJ4A 1KNIA 4PGJB 1IP3A 1T8AA 4IAPA 4WL7A 1I20A 1YQVY 1L39A 4BS7A 1B7PA 1L82A 4N1CC 3WU7A 1CV3A 190LA 3RW8A 1L15A 1AZFA 3A96A 1GXXA 1IOTA 3HU8A 1QTDA 2QARC 1C6QA 1L67A 3A3RX 1VAUA 1AM7A 1G0JA 131LA 175LA 1QUSA 2D4JA 1CX6A 5LVGA 4NSHA 4C5FA 108LA 1LSFA 5LZMA 3DN0A 5DN4A 2EPEA 4NHIA 5FELA 4ZEEA 1LJ3A 4NGLA 1EPYA 1LZ5A 1BWIA 251LA 3AJNA 5F16A 4DD1A 2NTHA 1GD6A 4NHSA 2OU9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4J7V A;  5KXY A;  3NY9 A;  4Z3M A;  1REX A;  1C65 A;  1B2K A;  1G7L C;  3B6L A;  1D6Q A;  1JKC A;  5FHW A;  184L A;  1P5C A;  4G4C A;  1P64 A;  1LYY A;  1DYD A;  126L A;  1C69 A;  1CJ6 A;  1KXW A;  1D3F A;  1L41 A;  1P36 A;  2BQL A;  3D3D A;  2F2Q A;  256L A;  4RLM A;  1L95 A;  1QS9 A;  4LFX A;  1LWG A;  1OUE A;  1NMM A;  1P2L A;  3WVY A;  2RAY X;  1HSW A;  4DD9 A;  3TMV A;  245L A;  3B0K A;  5LYZ A;  2HUL A;  1GAY A;  2DQC Y;  2A4T A;  1QQY A;  1L46 A;  1LHJ A;  5HNL A;  1RE2 A;  1OUI A;  1F10 A;  115L A;  169L A;  127L A;  1YL1 X;  250L A;  5B1G A;  228L A;  4GLA A;  1LYJ A;  5KXS A;  4DD2 A;  2RB2 X;  1WQR A;  1JUG A;  3MGW A;  4DDB A;  165L A;  1G0M A;  1CV4 A;  3GUI A;  1T6H A;  3HUK A;  1LKS A;  1C6E A;  4LYB A;  1P2C C;  3WUM A;  159L A;  1GBS A;  3A91 A;  145L A;  2G4P A;  1C08 C;  2H5Z A;  1GB8 A;  2IHL A;  171L A;  3EBA B;  3B72 A;  242L A;  3P68 A;  246L A;  4DWX A;  1VED A;  164L A;  139L A;  4ETB A;  249L A;  4XJF A;  1JJ3 A;  1HFY A;  4XYY A;  2I25 L;  2ZNX Y;  3NYA A;  2QB0 B; 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