3TXDA

Hewl co-crystallization with carboplatin in aqueous media with glycerol as the cryoprotectant
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
publication title Experience with exchange and archiving of raw data: comparison of data from two diffractometers and four software packages on a series of lysozyme crystals.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 44
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3txdA00
5C6JA 1FBIX 2ZQ3A 1GDXA 5APDA 4NSJA 3TXDA 1B7MA 1LHJA 1JTOL 2BQGA 4UWUA 1XEKA 1G7HC 4NSHA 4LYCA 1PZYA 3HBHA 5E9RA 1QUSA 4M6DA 1WQQA 3A90A 3E3DA 3F6ZA 2HTXA 3WYHA 1B5UA 4ET9A 1GWDA 2CGIA 1GBYA 3SP3A 1BWHA 1GAZA 3J6KA 1Z55A 3K3TA 4CJ2A 1D9UA 1IO5A 1YAQA 4C3WA 1FDLY 1DQJC 2F4GA 1LMPA 2W1XA 1B5XA 1FKVA 3AZ4A 133LA 2XBRA 2YBIA 4HJVA 4XJIA 4XJBA 1BB7A 3LZ2A 4Z98A 1SLYA 3TMUA 3WXTA 4B1AA 3BKVA 1LYOA 1LHKA 1GE3A 4A7DA 4DDCA 1JSEA 1DI3A 4TUNA 2YBHA 1IR7A 3AGGG 1JTTL 1V7TA 1YKXX 1A4VA 4GCEA 4G4HA 3RU5A 1C10A 5B06A 3WPKA 4H9HA 5KXRA 1CKCA 3CT5A 193LA 1IWYA 2CJLA 1DI5A 1F6RA 1B7QA 3ZVQB 1BVXA 3WU9A 2YVBA 4XADA 1DPXA 1IP5A 3P65A 1HSWA 1YANA 1UBZA 4ETDA 1ZV5L 1BB6A 2FBDA 4OWHA 4ZEEA 5F14A 1LZTA 1H6MA 1LHIA 4CFPA 1OUBA 4NWEA 1KIRC 2HEBA 2W1MA 132LA 4E3UA 4CGEA 3B6LA 2NWDX 1IOSA 5KJ9A 1LSEA 5B1GA 1IY3A 1MELL 2C8PA 4XENA 1VDTA 3D9AC 1JJ0A 1LYZA 4GLVA 4Z46A 2YSSC 5K7OA 4XJHA 1I20A 1LZ4A 2BQJA 4QY9A 1NBZC 1WQMA 2D4JA 2HU1A 1JKDA 1QIOA 4GN5C 4TTDA 5KXLA 1YAPA 1LTMA 207LA 1GFJA 1GEVA 2I6ZA 1HF4A 1IY4A 2Z18A 2ZNXY 1H87A 1LSNA 1IP1A 4M4OA 3B0KA 1LMQA 1QUTA 3AW6A 4ETBA 3W6EA 4W96A 3RNXA 1GBSA 3AB6A 4NGLA 1LHLA 1LZSA 5D5CA 1BHZA 4AXTA 2H9JA 1TCYA 1LJJA 5C6IA 4NY5A 1GEZA 1GFRA 5I4WA 2EIZC 1KIQC 2RSCA 1JKBA 4DD1A 5A3EA 4G4CA 1LSPA 1LSBA 3W6FA 4WLXA 1XGRC 4N5RA 1YL0X 3A95A 3M3UA 2HEFA 4J1AA 5HLLA 4RDSA 3ZEKA 5LVIA 1EQ4A 2MEIA 4QEQA 6LYTA 4HV1A 1IWXA 2BQHA 1LSYA 1LZRA 3WXUA 5I4XA 4YF2A 1INUA 3WL2A 4H9EA 4L41A 1OUHA 1WTNA 2WARA 1BWIA 4WL6A 4II8A 4C5FA 1OUJA 4G9SA 1WVVA 2A7DA 1REMA 3MGWA 4IASA 4J1BA 1QSAA 4PRUA 2YBNA 4ETAA 3LYOA 3OJPA 2LZ2A 3M18B 5DN5A 1IR9A 1KXYA 1LKRA 1O23A 5L3HA 4DT3A 3TXIA 5LVJA 1LSAA 1LHHA 1LZ9A 3P66A 3TXJA 4HPEA 1JJ1A 1XGQC 3A96A 4NG8A 4Z41A 1GE4A 1LSDA 1JEFA 1FN5A 1G7LC 2BQCA 4HTKA 4NGJA 1UIFA 4XJFA 3AGIA 2MECA 1WQPA 2N5ZA 5A3ZA 1LOZA 3WUAA 2W1LA 5F9XA 1UC0A 1YKYX 1IORA 2CDSA 3W3EA 1TDYA 2MEDA 3GXRA 3P68A 2XBSA 2PC2A 4WG7A 1HMLA 4N0JA 2ZILA 1OUDA 1UUZC 1WQNA 1REZA 1W08A 5HNLA 4YEMA 1B0DA 4LYTA 2MEFA 4FDYA 1UIAA 2Y8PA 5LXWA 1HEQA 1HEOA 1SQ2L 2ZQ4A 4TWSA 4WM1A 1KXXA 1LZBA 1QTEA 3T6UA 3A3RX 1GF3A 3IWRA 4HPIA 4H8YA 3LHMA 4B4IA 2DQHY 4B49A 2D4IA 2LYZA 1LJGA 2Z2EA 5KXSA 1GFKA 1LJ3A 1IOCA 3WPJA 1B2KA 1IWTA 1V7SA 1VDSA 4H90A 2IHLA 1LZDA 2G4QA 4DYGA 3EMSA 1YROA 4UWVA 3A3QA 2D91A 5LYTA 2G4NA 2BAAA 9LYZA 1GXV2 1OUCA 2DQAA 3N9EA 1GF7A 3D3DA 1LKSA 1B5VA 2HECA 2DQJY 4H9CA 1GD6A 4NHQA 1FLWA 1OUFA 1JWRA 3A67Y 4X3BA 1HC0A 1HEPA 1T6VL 3ATNA 2ZNWY 5IELA 1CNSA 4BADA 4NEBA 1HNLA 1D0KA 1LZ5A 1CJ8A 4LZTA 3WW5A 1IP4A 1LZAA 1P2CC 1LCNA 2BLYA 1B5ZA 1GF6A 2HU3A 1GFUA 1RI8B 135LA 1GBZA 3LN2A 1IOQA 3A8ZA 1UA6Y 1CKGA 3WULA 2BLXA 5LAFA 3TXGA 5J7CA 2BQFA 4H9IA 1VEDA 1IR8A 1W6ZA 2MEAA 1GB2A 2DQCY 1HELA 3AJNA 1YAMA 2EPEA 4NGOA 1AT5A 2BQDA 1B7LA 5KXOA 3A91A 1XGTC 3QE8A 3LZTA 4QDNA 4TX7A 3ULRA 1C43A 1IX0A 1RCMA 1QTKA 1LSMA 1LZYA 2YDGA 2LYOA 1LSGA 3TMXA 3TMVA 1REYA 3WUNA 2DQEY 5LYZA 1LZ6A 1DXJA 3LYZA 5LVHA 4TSCA 2BQLA 1GB9A 5I5QA 4GCCA 2YBLA 3A6BY 4LFXA 4D9ZA 5KKIA 2H9KA 1CKFA 4DD3A 4FJRA 2XJWA 3BKHA 1HFYA 5KKJA 4G4BA 3OK0A 1GFVA 4N8ZA 1WQRA 1UIGA 4LT3A 4DD9A 4ML7A 1BQLY 1BB4A 4LYMA 4XJGA 4ET8A 4N1EI 1T3PA 3T36A 1JKCA 1HSXA 4WM3A 5F81A 1IWUA 1NDGC 3A92A 3TXHA 4NHSA 4LT2A 4KL7A 4PRQA 5FSTA 1UIHA 1UACY 1UIEA 1LMAA 2I26L 1PS5A 3WPLA 3A93A 1ZVHL 4RLMA 4BAFA 1ZMYL 2BQEA 3IJUA 3LYMA 1GE1A 1QSWA 1HFZA 2Z39A 1XFPL 4DDAA 4H9FA 1C46A 1BB3A 2F4AA 5KXYA 1I56A 1JIYA 1FKQA 1A2YC 1B7OA 1LJIA 2BQNA 4WL7A 4DD7A 1YIKA 3IJVA 1NHEA 3HBDA 4RW2A 2Q0MX 4WOAA 5HNCA 1B7SA 4DDBA 3WVYA 6LYZA 1LMOA 4B4JA 2Z19A 1IC5Y 5D5FA 1LZEA 5I54A 2ZYPA 4HJYA 1EL1A 2BQAA 4HTQA 4PJ2C 5FDJA 2F30A 4NHIA 5KY1A 1B9OA 2A7FA 2BQIA 1EQEA 2Z37A 2FYDA 4WLDA 1IVMA 4CHXA 1UIBA 4WM5A 1XEJA 3CB7A 4PPOA 3EXDA 1IP7A 5APFA 1OUGA 2MEGA 3G3BB 1GB7A 2HEEA 2GV0A 2HUBA 1GF4A 3RZ4A 4OOTA 2H5ZA 1JTPL 1GAYA 1LJNA 2HEDA 4NHPA 4NHTA 3WW6A 2BQBA 5B05A 1HEMA 1JHLA 1GFEA 1YILA 4NIJA 1LZGA 4EOFA 4ANRA 1QQYA 7LYZA 2ZYCA 1YKZX 1LSCA 4Z3MA 134LA 3CSQA 1DPWA 1DKKA 4NGWA 3W6BA 3N9AA 1DI4A 1BWJA 1TBYA 4KXIA 3KAMA 4LGKA 1VDQA 194LA 1LMTA 1I1ZA 1HEWA 3AZ6A 1XEIA 1VATA 2YBMA 4XJDA 3LYTA 1B5WA 1GB8A 1AM7A 1J1XY 1MLCE 3G3AB 4WO9A 1YQVY 1LJFA 2EQLA 5LA8A 3A6CY 3AGHA 4OWCA 4KPMA 3CSRA 5L9JA 8LYZA 1WTMA 2W1YA 2DBTA 1F6SA 1QDRA 1IIZA 1LZNA 4NSGA 1LZCA 3TXFA 3ATOA 2Z12A 5APEA 4H9BA 1LAAA 1JSFA 1GB3A 1GB6A 2DQIY 1J1OY 4LFPA 2D6BA 5LIOA 5LVGA 5IDDA 3WVXA 1LJKA 1XGUC 1IWZA 4WM6A 1AZFA 4ZFPA 3WUMA 4NGYA 1J1PY 4UWNA 1HENA 1NWGA 5DLAA 2FYCA 4LYOA 5T3FA 1GE0A 1GFAA 4GCFA 1EQ5A 3WH1A 4MR1A 5HMJA 1QDTA 1VDPA 1XSFA 2AUBA 1HERA 3AW7A 4H92A 5HQ1A 1LJ4A 3J4GA 1RFPA 4GN4A 2BPUA 3W6AA 2VB1A 1D0MA 5KXWA 1REXA 1LYSA 1CJ6A 3EO5A 4HSFA 3AYQA 2BQMA 5ILCA 4OW1A 4CFOA 1G7JC 4R6CA 5L3IA 5LINA 1HMKA 1LYYA 1JKAA 1KIPC 1OUEA 5KXXA 1GBOA 4WLTA 1GFHA 4QGZA 2FBBA 4OWAA 4GCDA 1D0LA 3W6DA 1IWWA 2YBJA 1GFGA 2DQDY 3EBAB 4PHIA 4WO6A 3VWOA 4B0DA 4B4EA 4YEOA 1GF8A 4H8XA 4LYBA 4NFVA 2D4KA 3A94A 3FI7A 3FE0A 2CWIA 4WM4A 3QNGA 3WU8A 2LZTA 4H93A 5HMVA 4H9AA 1NBYC 3CT1A 1IP3A 1F10A 1UIDA 5DN4A 4H8ZA 1C7PA 1DZBX 2C8OA 4RW1A 1OUIA 1GDWA 2F2NA 1LZ1A 1YAOA 1BB5A 1TEWA 2EKSC 4NGKA 4NWHA 1UICA 5KXKA 1IEEA 1NQIA 3WU7A 4NG1A 1IC4Y 5AMYA 4ETCA 1IP6A 4IATA 4NSIA 1NMMA 1B7PA 1LHMA 2ZWBA 3B0OA 4WM2A 4TSBA 1NDMC 1LJHA 5I53A 1ALCA 5KXZA 3HBEX 2ZIJA 3CSZA 3A34A 4OOOA 3N9CA 2B5ZA 1FLYA 1RJCB 4DD0A 1JISA 1HFXA 2BQKA 4BAPA 1GB0A 1GFTA 5F16A 1LMNA 4WMGA 4WLYA 4YM8A 5LVKA 1LJEA 1LSZA 2G4PA 4J0LA 5IHGA 4DD2A 4LYZA 2BQOA 3HFMY 3GXKA 1FLQA 4I8SA 1BGIA 5LA5A 1IOTA 2DQGY 4XYYA 5APCA 3CQLA 5B1FA 4YOPA 5FCPA 1JUGA 3P64A 5E4PA 4LT1A 1HHLA 1XGPC 4OWBA 3TXKA 3TXEA 1AT6A 1CKDA 5FEKA 1GXXA 1JITA 1GF0A 4O34A 3RW8A 1OQMA 1KXWA 4RLNA 2DKVA 4XN6A 4MCKA 3WMKA 5II3A 5KXMA 154LA 1IWVA 3B0IA 5F9UA 1TAYA 4BS7A 4W94A 1WQOA 3AZ5A 4LT0A 1NKHA 4H1PA 4HP0A 4P2EA 5DM9A 5ILFA 1G7IC 5B59A 4PGJB 1AKIA 1CKHA 5LAGA 5I4YA 1GB5A 1B7NA 4G49A 1GF5A 4U3XB 1GHLA 5B07A 4YENA 1CJ7A 5FELA 1N4FA 1JPOA 1GE2A 1GF9A 4HJZA 2Z2FA 4GN3A 4HTNA 4AGAA 4WG1A 4DC4A 2LHMA 2MEEA 4MSTA 4OWEA 3AZ7A 4DWXA 2MEBA 1C08C 4ETEA 3TXBA 3W6CA 1F0WA 3P4ZA 4GLAA 4EMNA 2LYMA 2MEHA 5DL9A 1E8LA 1LMCA 1GBXA 1VAUA 5KXPA 4H94A 4HV2A 1ZVYB 4NGZA 1YL1X 4NGVA 2IFFY 1CJ9A 2Z38A 4R0FA 3TMWA 1B5YA 1LPIA 1GPQC 4N9RA 1B7RA 5EBHA 1OP9B 1OUAA 3RT5X 5KXTA 1WVUA 1GBWA 4N1CC 2ZIKA 1G7MC 5C6LA 2XTHA 1VFBC 4I0CA 5KXNA 4H91A 1IC7Y 1RE2A 1LZ8A 153LA 4NGIA 1D6PA 4GCBA 3QY4A 4IJ4A 1C45A 1D6QA 4ZIXA 208LA 1UCOA 1IP2A 4J7VA 1NF5A 1DKJA 3CT0A 3ZVQA 5LYMA 4KT3A 1BVKC 1FLUA 2HEAA 2I25L 5FHWA 2DQFC 2X0AA 3B72A 1LSFA 5JENB 1JJ3A 5M1YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FBIX 1LLHA 1GDXA 1B7MA 1LHJA 1JTOL 177LA 1PZYA 1WQQA 1C64A 3E3DA 1L98A 2HTXA 3F6ZA 4OO9A 4ET9A 2CGIA 1ZWNA 3SP3A 3K3TA 1C62A 1FDLY 3JR6A 2F4GA 231LA 2YBIA 4HJVA 4XJBA 4Z98A 1PQJA 4B1AA 3BKVA 1LYOA 3L2XA 215LA 1DI3A 3HH5A 1JTTL 1CV5A 4GCEA 1C10A 190LA 161LA 3WPKA 1JTMA 4XADA 1D3FA 241LA 171LA 253LA 1ZV5L 1BB6A 178LA 3HT8A 211LA 4ZEEA 5F14A 1L95A 1H6MA 2W1MA 4ARLA 1L35A 4I7SA 168LA 3GUOA 1C66A 3D9AC 4W53A 4GLVA 2YSSC 1I20A 1LZ4A 1L37A 2BQJA 1L17A 1QT8A 1SSWA 1QUDA 1IY4A 2ZNXY 1LSNA 1IP1A 1LMQA 4W96A 3AB6A 4AXTA 1QT4A 4NY5A 164LA 4ARMB 1L52A 1L02A 1LYIA 2EIZC 1JKBA 2OTYX 1L44A 1D9WA 4WLXA 1XGRC 163LA 4N5RA 3M3UA 3F9LA 2QB0B 5HLLA 1L47A 4QEQA 2BQHA 107LA 1QS9A 3WXUA 4YF2A 3WL2A 1P2RA 145LA 1OUHA 1WTNA 1BWIA 4C5FA 1L51A 2A7DA 1REMA 3MGWA 2HUMA 1L50A 138LA 5DN5A 1IR9A 1KXYA 3TXIA 1L36A 3P66A 2RB2X 3TXJA 4HPEA 1XGQC 2BQCA 1FN5A 1G7LC 4W55A 1UIFA 5A3ZA 1OVJA 2N5ZA 2B73A 1LOZA 2W1LA 1YKYX 1DYEA 1TDYA 2MEDA 3GXRA 148LE 4N0JA 152LA 216LA 5LZMA 4LYTA 1HEQA 2ZQ4A 4DQ5A 4WM1A 1KXXA 4H8YA 2LYZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5C6J A;  1FBI X;  2ZQ3 A;  1GDX A;  5APD A;  4NSJ A;  3TXD A;  1B7M A;  1LHJ A;  1JTO L;  2BQG A;  4UWU A;  1XEK A;  1G7H C;  4NSH A;  4LYC A;  1PZY A;  3HBH A;  5E9R A;  1QUS A;  4M6D A;  1WQQ A;  3A90 A;  3E3D A;  3F6Z A;  2HTX A;  3WYH A;  1B5U A;  4ET9 A;  1GWD A;  2CGI A;  1GBY A;  3SP3 A;  1BWH A;  1GAZ A;  3J6K A;  1Z55 A;  3K3T A;  4CJ2 A;  1D9U A;  1IO5 A;  1YAQ A;  4C3W A;  1FDL Y;  1DQJ C;  2F4G A;  1LMP A;  2W1X A;  1B5X A;  1FKV A;  3AZ4 A;  133L A;  2XBR A;  2YBI A;  4HJV A;  4XJI A;  4XJB A;  1BB7 A;  3LZ2 A;  4Z98 A;  1SLY A;  3TMU A;  3WXT A;  4B1A A;  3BKV A;  1LYO A;  1LHK A;  1GE3 A;  4A7D A;  4DDC A;  1JSE A;  1DI3 A;  4TUN A;  2YBH A;  1IR7 A;  3AGG G;  1JTT L;  1V7T A;  1YKX X;  1A4V A;  4GCE A;  4G4H A;  3RU5 A;  1C10 A;  5B06 A;  3WPK A;  4H9H A;  5KXR A;  1CKC A;  3CT5 A;  193L A;  1IWY A;  2CJL A;  1DI5 A;  1F6R A;  1B7Q A;  3ZVQ B;  1BVX A;  3WU9 A;  2YVB A;  4XAD A;  1DPX A;  1IP5 A;  3P65 A;  1HSW A;  1YAN A;  1UBZ A;  4ETD A;  1ZV5 L;  1BB6 A;  2FBD A;  4OWH A; 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 5FEK A;  1GXX A;  1JIT A;  1GF0 A;  4O34 A;  3RW8 A;  1OQM A;  1KXW A;  4RLN A;  2DKV A;  4XN6 A;  4MCK A;  3WMK A;  5II3 A;  5KXM A;  154L A;  1IWV A;  3B0I A;  5F9U A;  1TAY A;  4BS7 A;  4W94 A;  1WQO A;  3AZ5 A;  4LT0 A;  1NKH A;  4H1P A;  4HP0 A;  4P2E A;  5DM9 A;  5ILF A;  1G7I C;  5B59 A;  4PGJ B;  1AKI A;  1CKH A;  5LAG A;  5I4Y A;  1GB5 A;  1B7N A;  4G49 A;  1GF5 A;  4U3X B;  1GHL A;  5B07 A;  4YEN A;  1CJ7 A;  5FEL A;  1N4F A;  1JPO A;  1GE2 A;  1GF9 A;  4HJZ A;  2Z2F A;  4GN3 A;  4HTN A;  4AGA A;  4WG1 A;  4DC4 A;  2LHM A;  2MEE A;  4MST A;  4OWE A;  3AZ7 A;  4DWX A;  2MEB A;  1C08 C;  4ETE A;  3TXB A;  3W6C A;  1F0W A;  3P4Z A;  4GLA A;  4EMN A;  2LYM A;  2MEH A;  5DL9 A;  1E8L A;  1LMC A;  1GBX A;  1VAU A;  5KXP A;  4H94 A;  4HV2 A;  1ZVY B;  4NGZ A;  1YL1 X;  4NGV A;  2IFF Y;  1CJ9 A;  2Z38 A;  4R0F A;  3TMW A;  1B5Y A;  1LPI A;  1GPQ C;  4N9R A;  1B7R A;  5EBH A;  1OP9 B;  1OUA A;  3RT5 X;  5KXT A;  1WVU A;  1GBW A;  4N1C C;  2ZIK A;  1G7M C;  5C6L A;  2XTH A;  1VFB C;  4I0C A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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