1NF5A

Crystal structure of lactose synthase, complex with glucose
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
123
structure length
123
Chain Sequence
TELTKCKVSHAIKDIDGYQGISLLEWACVLFHTSGYDTQAVVNDNGSTEYGLFQISDRFWCKSSEFPESENICGISCDKLLDDELDDDIACAKKILAIKGIDYWKAYKPMCSEKLEQWRCEKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase
molecule keywords Alpha-lactalbumin
publication title Crystal Structure of Lactose Synthase Reveals a Large Conformational Change in its Catalytic Component, the beta-1,4-galactosyltransferase
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 39
structure length 123
sequence length 123
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-12-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1nf5A00
1GB8A 1UC0A 2A7DA 2ZQ3A 3B6LA 2YBHA 3M3UA 5LINA 3D3DA 1IWYA 1IO5A 4NGLA 3M18B 1JJ0A 3FE0A 1RE2A 4G4HA 1IP5A 1XEJA 4NHPA 4OWCA 4DYGA 1OUAA 5F9XA 1GFTA 4AXTA 5II3A 1IR8A 3AYQA 4NGWA 1KIRC 3IWRA 3WVYA 4TSBA 1INUA 1B5UA 2HEEA 3WU8A 1BGIA 3ATNA 3WH1A 4CFPA 3TXKA 1DKKA 1HSXA 5LA8A 2HEFA 2D91A 3P4ZA 5FDJA 1LSNA 1YKXX 3RZ4A 1D0LA 3A95A 5B07A 1REXA 3J6KA 1CKCA 1LMTA 2YBIA 3TMVA 1WTMA 1UACY 1TAYA 3W6FA 1HFZA 135LA 1DI4A 3D9AC 4H9EA 1V7TA 1GFHA 1JSEA 5LYZA 4H9FA 1REZA 5APDA 3LZTA 4ETEA 5C6LA 3ZVQB 5A3EA 1HEOA 4EMNA 4RDSA 1D6QA 1GPQC 2XTHA 4WG7A 1G7LC 2D4IA 1OUHA 1C43A 1LJHA 1JKDA 3AGGG 2GV0A 4XJIA 1QUSA 4LYCA 1BVKC 4GLAA 1T6VL 1RCMA 3WVXA 4WM4A 4WLYA 4G49A 7LYZA 5KXLA 1VATA 4LYBA 1HEQA 4Z46A 4ZIXA 1LZYA 4YF2A 2D4JA 4GCEA 4C5FA 5I4WA 1IP1A 2I26L 1GBYA 1IR7A 3AJNA 2Z18A 1BWJA 3AZ5A 2H9JA 1CKDA 1KXYA 1TDYA 1LPIA 4N0JA 1YAPA 1TCYA 1GF5A 3CT5A 4PJ2C 4YM8A 1HHLA 1MLCE 4FJRA 2W1LA 3QNGA 1XGPC 1SLYA 3TXJA 1REMA 2BQJA 1J1XY 2PC2A 5HLLA 4M4OA 3A8ZA 1LJGA 2YDGA 4NG8A 4NWEA 2BQEA 2HEBA 1YANA 1JJ1A 2EPEA 4DC4A 3LYZA 1QUTA 3A96A 4ETCA 1ALCA 4XN6A 1YKYX 3GXKA 1HERA 5ILFA 4R6CA 5J7CA 4M6DA 2G4NA 4KT3A 2ZIKA 1NMMA 3EO5A 1JKBA 1LZ9A 1LZ4A 1LSDA 2HEAA 1FKQA 2Q0MX 194LA 1WQPA 2IHLA 4LYZA 4OWEA 3CSZA 4DD7A 1UIEA 3P64A 4J7VA 2Y8PA 1BB7A 1LMCA 5LVKA 5T3FA 3QY4A 1AT6A 1C08C 4HJZA 3N9EA 2XBRA 1UUZC 5LIOA 4I8SA 1C46A 1LZDA 1G7JC 5B1GA 1MELL 3WPLA 3KAMA 4B4IA 4DD3A 4H9IA 1G7IC 5APFA 4DD1A 2Z12A 4ETDA 3LYMA 154LA 1JKAA 4LZTA 1LJ3A 1B5XA 4NGZA 5FEKA 4KL7A 1QIOA 4A7DA 2DKVA 3BKVA 4Z3MA 4X3BA 1EL1A 1GB2A 4H93A 1VDQA 4HTQA 3W6AA 2MEGA 1LJFA 1JSFA 4GLVA 4BS7A 4AGAA 3A34A 1HMLA 1BWIA 3GXRA 4HV2A 2MECA 5KXMA 2IFFY 1GXV2 1PZYA 4J0LA 1JPOA 4OWBA 3EBAB 4DWXA 1ZV5L 1LHHA 1NF5A 2HEDA 1C7PA 2X0AA 4NGKA 1DPXA 1LJNA 1OP9B 1BHZA 3F6ZA 5LAGA 2BQMA 2HECA 4QDNA 5D5FA 1QDTA 1LJJA 1GE4A 1LSCA 1OUJA 1PS5A 2Z2EA 3CB7A 4RW1A 3RW8A 3WPKA 1HEPA 3WUAA 1GE1A 5L3IA 4YENA 1IC5Y 2Z2FA 1HF4A 3A92A 1GF8A 1UCOA 3WXUA 1GFVA 4YEMA 3TMXA 2BQBA 1GBSA 1IX0A 3WL2A 1KIQC 4ML7A 1LSEA 1IWTA 5F9UA 5B06A 5HNCA 2ZIJA 3EMSA 1VDSA 2F4AA 1KXWA 1WQQA 3P68A 1VFBC 4TTDA 5F81A 4LT3A 1GB5A 4H8ZA 2LYZA 4NHIA 3WPJA 1JTPL 1KXXA 2CJLA 2LZ2A 1B7LA 1UIHA 2ZNWY 2ZQ4A 1XSFA 2EKSC 3G3BB 1GF9A 4H8XA 4ET9A 4XADA 3B0KA 5KY1A 2LYOA 2HTXA 5KXXA 1JTOL 1GF6A 2ZYCA 2BQOA 1B5ZA 1XEKA 1I1ZA 1LSMA 2FYDA 4HP0A 1F6RA 4OOTA 3WUNA 4ANRA 1F0WA 1F10A 208LA 3A93A 1LZ1A 2DQCY 3W6CA 1GEVA 1IOQA 4TUNA 1WTNA 4PHIA 1FKVA 3TMWA 2ZYPA 1B7QA 1JJ3A 1GF3A 3W3EA 4DD0A 4DD2A 5FELA 1GFEA 2DQFC 3IJVA 4TX7A 3E3DA 4N1CC 1UIBA 5LVIA 1YAOA 4LYOA 1JEFA 4D9ZA 2F2NA 2VB1A 1GFAA 4H8YA 1WVUA 2MEAA 2BLXA 3EXDA 4MCKA 4PGJB 3A90A 1P2CC 4WG1A 2MEBA 1JIYA 1LZ5A 5APCA 1D0MA 1B7MA 1IWUA 3A3QA 1GFGA 1CJ7A 2YVBA 5JENB 1LSPA 4Z98A 1LAAA 1LHLA 2DQDY 4B49A 4DDAA 1LZBA 2G4QA 4WL7A 5DM9A 4H9CA 4GCBA 1IOTA 4NSGA 1V7SA 3IJUA 4LYMA 5FHWA 4WMGA 5KKJA 5LYTA 2DQHY 1IWXA 2BAAA 3AW7A 5KXSA 4ETBA 2LHMA 1H6MA 1WQRA 1Z55A 2ZILA 1RFPA 1IEEA 5F16A 5KXPA 5KXZA 2CWIA 2YBNA 1NDGC 2BQLA 3ZEKA 1EQ4A 1OUEA 4ET8A 2LYMA 1QSWA 2MEEA 2HU1A 1YL1X 3HBDA 132LA 1HEMA 3BKHA 3MGWA 1W6ZA 5KXYA 3ATOA 4YOPA 1UICA 1DI3A 2HUBA 3HFMY 3SP3A 3TXGA 5HQ1A 1NKHA 4NGOA 3N9CA 4NHSA 5KXRA 4PRUA 1LZEA 2CDSA 1DKJA 2D4KA 2FYCA 5E9RA 4QEQA 2BQDA 2W1YA 5LAFA 3W6BA 4LT2A 1B7RA 4HV1A 4WM2A 1CNSA 1XEIA 1EQ5A 3WU7A 1CKFA 5ILCA 1CJ9A 1IC7Y 1HC0A 3RU5A 2LZTA 4O34A 4G4BA 1HFXA 1HELA 1GAZA 1LHMA 1LZ8A 1LZNA 3LHMA 4GCFA 3TMUA 1YL0X 5F14A 4NEBA 4B4JA 1VAUA 1BB4A 1CJ6A 4KXIA 1GFKA 1H87A 4P2EA 1T3PA 3CSRA 4H1PA 3WW6A 4H90A 1LMOA 3CQLA 4NY5A 5C6JA 2XBSA 2Z39A 3TXBA 8LYZA 4C3WA 3WULA 1LKRA 5K7OA 5D5CA 1IP3A 2DQAA 1LHKA 2F30A 5FSTA 1QTKA 3WXTA 4HTNA 1FDLY 1YIKA 4WLXA 4B1AA 1DZBX 2FBDA 4II8A 3T36A 5KKIA 3TXFA 1FLWA 5I5QA 3OK0A 2Z38A 2B5ZA 2RSCA 1LYZA 4MR1A 4GCDA 2H9KA 5KJ9A 1BWHA 1B5VA 2BPUA 4I0CA 4N8ZA 1GF7A 1JUGA 4H94A 4HJVA 5C6IA 4DD9A 1N4FA 3ZVQA 193LA 1YAQA 1IP2A 1B7OA 3J4GA 1XGQC 4WOAA 1LTMA 5A3ZA 1RI8B 4CHXA 1C10A 1GAYA 3LN2A 1LYYA 1IP6A 4LGKA 4RLNA 5HMJA 5I4XA 4G4CA 4DDCA 5IELA 4WM6A 134LA 1A4VA 4XJBA 2YBMA 1HENA 5DN5A 4L41A 2MEIA 1TBYA 3WYHA 2BLYA 3B72A 1BVXA 1JWRA 1YROA 4J1BA 1LYOA 1ZMYL 3A6BY 6LYTA 4BAPA 4ZFPA 4HJYA 1UIAA 4B4EA 4H9AA 1JKCA 2BQNA 1JISA 4IJ4A 1AM7A 4LT1A 5DL9A 2Z19A 2D6BA 4WLDA 3RNXA 3CT1A 4ZEEA 1LMPA 5LVGA 4OWAA 1XGTC 3A94A 4OW1A 1IC4Y 3LYOA 4LFXA 4NGYA 1HFYA 4N1EI 5LA5A 1GB7A 4NG1A 3G3AB 3TXEA 3A67Y 4LT0A 4QY9A 4NSIA 3AZ6A 1OUIA 2BQHA 1IWVA 2FBBA 1GB3A 4UWNA 1FBIX 3HBHA 1GFRA 4GCCA 4CJ2A 2EIZC 5B59A 4WL6A 2DQEY 3N9AA 3W6EA 1UIFA 1VDTA 1GD6A 1LZGA 6LYZA 1GFUA 3CT0A 1IP7A 3HBEX 1GBXA 4W96A 1GB9A 5DLAA 5DN4A 1EQEA 4NIJA 1LMNA 1HSWA 1LSZA 1AT5A 1HNLA 1LYSA 2BQAA 3K3TA 4NSJA 1FLYA 3TXHA 3TXDA 4ETAA 4HPIA 1WQMA 4H92A 4OOOA 4BADA 1CKGA 1NBYC 3P65A 1OUCA 1JITA 4GN3A 4YEOA 4RW2A 1GHLA 1LSAA 2I25L 1FLUA 1OUFA 5KXTA 4NHQA 4XJGA 1CJ8A 1B2KA 2HU3A 4GN4A 5AMYA 1DPWA 4G9SA 5IDDA 1I20A 4H9HA 4R0FA 4UWVA 4NGVA 4WLTA 1QQYA 1YILA 4MSTA 1XGUC 1GB6A 3W6DA 1E8LA 4N5RA 4HSFA 1G7HC 1BQLY 1J1OY 2DBTA 1DI5A 1LSFA 1LZTA 3LZ2A 1OUDA 4EOFA 4XENA 1OQMA 3AB6A 3AZ4A 5I53A 3WUMA 1OUBA 1QDRA 3B0IA 1CKHA 4WO9A 1LZRA 1B5WA 3QE8A 1JHLA 2BQKA 5IHGA 1LSBA 1GBWA 4WM5A 5LYMA 2DQGY 2WARA 1LZ6A 4NSHA 1LZSA 1LJKA 4XJHA 2AUBA 5LXWA 1IOCA 153LA 4OWHA 1NHEA 1GXXA 3VWOA 2CGIA 3T6UA 1GE0A 1GDWA 1UA6Y 2YSSC 2DQJY 1SQ2L 5LVJA 1LHIA 1LJEA 1FLQA 207LA 1I56A 1OUGA 1LHJA 2Z37A 2MEDA 4WO6A 1W08A 3CSQA 3AW6A 1D0KA 1NBZC 1D9UA 1KIPC 4KPMA 4N9RA 2MEHA 1RJCB 1GEZA 4XJDA 4NWHA 4TWSA 4CGEA 5HMVA 1UBZA 1IVMA 1B7NA 1HEWA 1YQVY 1B7SA 2H5ZA 4NHTA 1D6PA 1NWGA 1AKIA 2XJWA 4WM3A 2BQCA 2ZNXY 4B0DA 1LOZA 1QTEA 4DDBA 1ZVHL 1TEWA 1HMKA 1GDXA 1O23A 2N5ZA 1IOSA 4FDYA 1NQIA 1LZAA 3OJPA 5I54A 1LJ4A 2W1XA 2YBJA 5EBHA 1BB6A 2G4PA 1GF4A 2I6ZA 5KXWA 1GE3A 2F4GA 2MEFA 3A6CY 5APEA 3WU9A 4W94A 2NWDX 1NDMC 1REYA 1A2YC 1IY3A 5HNLA 1VEDA 4PRQA 5B1FA 5KXOA 4U3XB 1J1PY 3TXIA 4NGJA 5E4PA 1UIGA 4CFOA 1IIZA 4GN5C 4BAFA 1GWDA 4XYYA 2BQFA 5M1YA 1B9OA 1YAMA 1DQJC 1BB3A 4NGIA 1G7MC 1YKZX 1BB5A 1VDPA 1WQOA 1JTTL 4LYTA 1UIDA 4IATA 1IY4A 4HPEA 1GFJA 2BQIA 4NFVA 1GB0A 1IR9A 1F6SA 4QGZA 4UWUA 4WM1A 4PPOA 4Z41A 1B0DA 1LKSA 1IORA 1GBOA 1ZVYB 2BQGA 1LCNA 4RLMA 5L3HA 1C45A 2A7FA 4HTKA 3ULRA 3WW5A 3A3RX 1B7PA 9LYZA 5KXNA 3B0OA 1IP4A 1WQNA 1GBZA 3P66A 1QSAA 4H9BA 2DQIY 2YBLA 5B05A 3AGIA 3AZ7A 1AZFA 1IWZA 1XFPL 5FCPA 4H91A 1LJIA 3AGHA 4XJFA 4IASA 5I4YA 3FI7A 1LZCA 5KXKA 1GE2A 3LYTA 4TSCA 1XGRC 2C8OA 5L9JA 1LMAA 1LMQA 4J1AA 4E3UA 3WMKA 2W1MA 2ZWBA 3A91A 133LA 1LSGA 1GF0A 3RT5X 4DT3A 1IWWA 4LFPA 1WVVA 1B5YA 2C8PA 1LSYA 1FN5A 5LVHA 2EQLA 1DXJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GB8A 2ZQ3A 251LA 3D3DA 3M18B 2OU9A 4OWCA 1OUAA 5F9XA 3HUQA 5II3A 3IWRA 4TSBA 1C6EA 3DN1A 1T8GA 4CFPA 3TXKA 3FI5A 1CU6A 5FDJA 1D0LA 1L24A 5B07A 1L46A 2YBIA 1WTMA 1UACY 3W6FA 1C6JA 1GFHA 5APDA 3ZVQB 5A3EA 221LA 1BVKC 1PQKA 3SB9A 4WLYA 4G49A 3CDVA 1CV1A 1P37A 3AJNA 237LA 1BWJA 1TDYA 4N0JA 1TCYA 2W1LA 1SLYA 5HLLA 1CU3A 1LJGA 2BQEA 233LA 175LA 166LA 1D2WA 255LA 4ARJA 1LLHA 4W51A 3GXKA 5ILFA 4R6CA 4M6DA 1NMMA 4S0WA 1LZ9A 2HEAA 1L84A 1L51A 2Q0MX 1ZURA 4DD7A 1DYCA 3L2XA 5LVKA 5T3FA 3N9EA 2XBRA 3G3WA 1LZDA 1L79A 4W56A 4DD3A 1SSYA 228LA 1QTVA 3LYMA 1JKAA 1QIOA 249LA 2MEGA 1LJFA 1JSFA 5KXMA 2OEAX 1PZYA 4J0LA 4EKQA 4DWXA 1XEPA 1ZV5L 1LHHA 1DPXA 1LJNA 3F6ZA 5LAGA 2HECA 1P2RA 4OO9A 1GE4A 4RW1A 3WPKA 3WUAA 1GE1A 4YENA 2Z2FA 4YEMA 3FADA 3HT8A 2BQBA 1IX0A 4ML7A 5B06A 171LA 146LA 3GUJA 1VDSA 2F4AA 1KXWA 3P68A 1VFBC 3WPJA 1JTPL 4FJRA 1B7LA 1L01A 3G3BB 1GF9A 1JQUA 2HTXA 5KXXA 1L86A 1B5ZA 1XEKA 2FYDA 1LSMA 1F6RA 2OTZX 4ANRA 2RAYX 1L00A 1WTNA 2ZYPA 1B7QA 1JJ3A 1GF3A 4PJZA 2RBSA 4DD2A 1QT7A 4LYOA 1JEFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GB8 A;  1UC0 A;  2A7D A;  2ZQ3 A;  3B6L A;  2YBH A;  3M3U A;  5LIN A;  3D3D A;  1IWY A;  1IO5 A;  4NGL A;  3M18 B;  1JJ0 A;  3FE0 A;  1RE2 A;  4G4H A;  1IP5 A;  1XEJ A;  4NHP A;  4OWC A;  4DYG A;  1OUA A;  5F9X A;  1GFT A;  4AXT A;  5II3 A;  1IR8 A;  3AYQ A;  4NGW A;  1KIR C;  3IWR A;  3WVY A;  4TSB A;  1INU A;  1B5U A;  2HEE A;  3WU8 A;  1BGI A;  3ATN A;  3WH1 A;  4CFP A;  3TXK A;  1DKK A;  1HSX A;  5LA8 A;  2HEF A;  2D91 A;  3P4Z A;  5FDJ A;  1LSN A;  1YKX X;  3RZ4 A;  1D0L A;  3A95 A;  5B07 A;  1REX A;  3J6K A;  1CKC A;  1LMT A;  2YBI A;  3TMV A;  1WTM A;  1UAC Y;  1TAY A;  3W6F A;  1HFZ A;  135L A;  1DI4 A;  3D9A C;  4H9E A;  1V7T A;  1GFH A;  1JSE A;  5LYZ A;  4H9F A;  1REZ A;  5APD A;  3LZT A;  4ETE A;  5C6L A;  3ZVQ B;  5A3E A;  1HEO A;  4EMN A;  4RDS A;  1D6Q A;  1GPQ C;  2XTH A;  4WG7 A;  1G7L C;  2D4I A;  1OUH A;  1C43 A;  1LJH A;  1JKD A;  3AGG G;  2GV0 A;  4XJI A;  1QUS A;  4LYC A;  1BVK C;  4GLA A;  1T6V L;  1RCM A;  3WVX A;  4WM4 A;  4WLY A;  4G49 A;  7LYZ A;  5KXL A;  1VAT A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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