3NY9A

Crystal structure of the human beta2 adrenergic receptor in complex with a novel inverse agonist
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
439
structure length
439
Chain Sequence
WVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIWTLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein
molecule keywords Beta-2 adrenergic receptor, Lysozyme
publication title Conserved Binding Mode of Human beta(2) Adrenergic Receptor Inverse Agonists and Antagonist Revealed by X-ray Crystallography
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 162
structure length 439
sequence length 439
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-07-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3ny9A02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3ny9A01
1S52A 4XTNA 1T6HA 139LA 1L06A 1CU6A 216LA 2PEDA 146LA 147LA 1S8JA 1HZXA 1L42A 2ANVA 3CDQA 2RBOA 2O7AA 1L17A 5A44A 4N4YB 4S0WA 4ARLA 1G07A 5B2NA 3S8FB 5KKHA 159LA 1ZWNA 3EH5B 5G53A 4ZPUA 1LI6A 2OU8A 2HULA 213LA 3VW7A 2R4RA 5G2AA 211LA 4XT1A 1GUEA 1L9HA 236LA 3NS0A 3QJRB 1C6KA 1UAZA 3AM6A 1C6JA 3VVKA 4W57A 1JTNA 1TLAA 1LYHA 1C63A 227LA 1LYIA 1G0MA 1L22A 1LLHA 3DN2A 1BM1A 4EPFA 3C9MA 2LZMA 4PXKA 1P37A 186LA 1B6IA 1PQMA 3QAPA 3GUIA 1L09A 245LA 3DN4A 3HT7A 1L99A 1JTMA 2RBSA 1F4ZA 3QBLA 1L79A 3DN6A 3C7YA 3UZCA 3SB5A 130LA 1PQIA 1L25A 258LA 212LA 1L75A 4LDLA 1L39A 3C7ZA 1SSYA 2R4SA 143LA 1C62A 5ETZA 2O79A 1L72A 1DYBA 1LYEA 2RB1X 3OE0A 4W59A 1C6TA 2RB2X 3GULA 5B6WA 123LA 1LGXA 1C6EA 218LA 1OV5A 1QTHA 3QJQB 4ARQB 1L04A 3C82A 1WTHA 1QT8A 2B6YA 2OE9X 1E0PA 3LZMA 1U19A 1P46A 1PQOA 1QT4A 2RBQA 1L86A 3DQBA 3HTGA 1OYUA 3SB9A 1G1VA 3VGAA 2YCYA 1OV7A 2ZIYA 3P0GA 3T45A 3HAQA 1L26A 3HTFA 1X0SA 2ZFEA 5H2OA 1L43A 3GUJA 2Z55A 5DHGA 2KS9A 1SX7A 1TN5A 1ZYTA 3HAOA 2B6XA 2OE4X 233LA 3HWLA 1QUGA 2OTYX 2RBPA 191LA 3CDTA 3SB7A 1CU3A 167LA 1L83A 1QT7A 1JV7A 1L44A 1OVKA 2RBRA 3X3BA 1LYGA 209LA 2IGCA 250LA 5C1MA 3UG9A 232LA 1C6DA 1D3FA 1C8SA 3C9LA 4FA7B 242LA 173LA 127LA 1QUHA 1L50A 1FBBA 1L69A 1SWYA 1P36A 3RUNA 4HYXA 4IARA 3HAPA 1EPYA 1D3MA 1CWQA 1CV1A 5B6YA 3V2YA 1QTDA 4GRVA 5A8EA 3QJSB 2QPEB 1L51A 174LA 3HT8A 228LA 1LWKA 3UTXA 5ITCA 4I7NA 3JR6A 4ARJA 235LA 178LA 1R84A 4DAJA 4NC3A 1Q5IA 2YDOA 2LC9A 1L87A 1L0MA 2Z6BA 1C64A 2VT4A 3HH5A 1CU2A 3X3CA 4I7RA 165LA 3HUKA 4W53A 1DZEA 1P8HA 3AYMA 1L02A 3QJTB 219LA 1L90A 5B6VA 2F2QA 4YXCA 1LN6A 1P7SA 2Q9EA 4GBRA 4Y9HA 5B34A 1G0QA 2Z73A 5FJGA 1T8GA 3HTDA 1IW6A 1OVJA 5JJNA 1KMEA 4AMIA 1L20A 4EIYA 1C6BA 3HASA 1DYDA 1P64A 4ARMB 3DN3A 1KW5A 1L76A 1IXFA 1LYJA 148LE 259LA 3UTWA 1L62A 4GPOA 1LGUA 1QS9A 190LA 3COCA 3CDOA 5G2DA 1L33A 196LA 3ODUA 1D2YA 169LA 4PXFA 118LA 1LI2A 1L98A 197LA 152LA 1L67A 161LA 3ABWA 4W55A 255LA 1BRRA 1L77A 1L96A 244LA 3NSBA 1CVKA 1TN0A 1G0KA 3NY9A 1XJIA 1D3NA 2YDVA 1L68A 3HT6A 1PXRA 4WW3A 3UZAA 4MD1A 2EI4A 5EN0A 1C6MA 238LA 182LA 3HDEA 2KSBA 3HT9A 2L6XA 2F47A 2YCXA 1T8AA 4ARPA 3A7KA 4J4QA 251LA 3C8RA 1KY1A 2L78A 1L49A 1QT5A 1QUDA 262LA 5BR2A 1L73A 1C6QA 1L41A 1KGBA 2NTUA 3G3WA 1QKOA 2I21A 104LA 2I35A 1L92A 3S8GB 2X72A 231LA 1LPYA 5H2MA 4EPIA 1L60A 155LA 1PQKA 2NTHA 3HH4A 4W51A 1L66A 3D4SA 3L2XA 4KLYA 1L10A 1L11A 1JQUA 1DYGA 1L52A 2OEAX 2HUMA 225LA 2ZZLA 3G3XA 3REYA 4TL3A 4LDOA 3PQRA 1XJTA 1L65A 1O0AA 4WAVA 1C6FA 1JFPA 3EMLA 1PQDA 185LA 2OU9A 2ANXA 4HYJA 5A45A 4MD2A 4L6RA 210LA 1P56A 4OV0A 2O4WA 1L40A 1GZMA 220LA 1L38A 252LA 5G36A 5AWZA 4I7MA 1CTWA 1L48A 177LA 3SB6A 222LA 1L91A 1KG8A 183LA 217LA 205LA 1C8RA 2Y01A 4QIDA 1C6AA 254LA 4W52A 1C67A 2JAFA 3DN1A 4MQTA 4A4MA 1L15A 2B70A 1QSQA 2OE7X 1L03A 3HUQA 3SBBC 2I1XA 4I7KA 1L88A 237LA 3PDSA 2F93A 175LA 261LA 1M0MA 1L95A 3HH6A 3QAKA 3CDRA 1L16A 4I7TA 4I7JA 241LA 1PY6A 3CODA 3C8QA 171LA 3HUAA 6LZMA 2QPDB 4EKRA 3DNAA 1L47A 3FADA 5H2LA 125LA 4I7LA 103LA 2HPYA 240LA 1D2WA 2B6TA 1VGOA 4YXAC 1L74A 3C8SA 1QM8A 4JQ6A 1K28A 3ZPRA 1CX7A 1X0I1 1XEPA 5BR5A 1QSBA 1XMEB 5AX1A 1L82A 1S53A 4GP4B 5G54A 1BRXA 1P5CA 4BEZA 2NTGA 4I7OA 4XTLA 5B35A 1L00A 234LA 3WQJA 3UTVA 214LA 1L36A 3OE8A 1DYAA 149LA 1KS3A 5LWEA 1C6CA 166LA 4EKQA 1L93A 1CUPA 2Y03A 1L18A 158LA 1C69A 200LA 184LA 1M0KA 3S3BB 3QJUB 1QTVA 1CU5A 1L53A 1C6PA 2HUKA 3VG9A 157LA 3OE6A 4G70B 192LA 1C65A 3UONA 4N6HA 3HTBA 3GUMA 1C6NA 140LA 1G0PA 3NYAA 1QKPA 2G87A 2J4YA 3BVDB 4BEYA 141LA 1QUOA 1C6GA 1ZURA 1XIOA 1LW9A 1JV6A 3PWHA 115LA 126LA 1Q5JA 239LA 1KY0A 4N4WA 144LA 1L30A 229LA 1S54A 5H2JA 4UHRA 1C68A 1CV4A 5G28A 4UG2A 1H68A 1L35A 3DDLA 142LA 2B6ZA 4GP8B 110LA 4EJ4A 156LA 1L55A 1L64A 2Y00A 1P2LA 195LA 170LA 1F50A 4GYCA 199LA 3GUOA 1GU8A 1OVHA 5G2CA 5ITEA 2Y04A 112LA 187LA 3GUKA 129LA 4ARQA 224LA 1BRDA 3KJ6A 1P6YA 253LA 4KNFA 5H2PA 5B0WA 4EKSA 1LWGA 2WJLA 4X1HA 1P8IA 5AHYA 4L35A 2RBNA 3FA0A 3PBLA 4FBZA 108LA 3DMXA 2M3GA 176LA 1L12A 1L08A 3S3CB 189LA 1L21A 2KSYA 4PJZA 1L71A 2Q9DA 4IB4A 1CV0A 2BRDA 1T8FA 4QI1A 150LA 172LA 248LA 2KSAA 3FI5A 1EHKB 3DKEX 4W54A 1AT9A 230LA 226LA 246LA 4GBRB 4K5YA 1MGYA 5H2IA 2B72A 3CDVA 4YX7C 1QTBA 2Y02A 2OU0X 1R2NA 163LA 1DYFA 1I6SA 2LNLA 3DMVA 120LA 4EXMA 5AZDA 1L0JA 1F88A 1G0GA 5AHZA 3DN0A 2JAGA 3C7WA 223LA 1D9WA 4G7QB 2RH1A 5B6ZA 1L61A 1CV3A 3HDFA 3SBAA 1VJMA 3QDCA 137LA 3QBIA 4I7PA 1C66A 5DHHA 5F8UA 4MQSA 1LYFA 3DN8A 2QB0B 5H2HA 1P8UA 215LA 3RZEA 1QTCA 3AYNA 1C6LA 1L34A 168LA 4IAPA 1L24A 122LA 7LZMA 2YCZA 1L01A 2OTZX 3HARA 1SX2A 4MBSA 5AX0A 4EA3A 2NTWA 1FBKA 1SWZA 109LA 2B74A 1C61A 4G72B 247LA 3G3VA 1JGJA 3HANA 5J7AA 2B73A 4BUOA 1E12A 1QT3A 1G06A 1L45A 164LA 4G7SB 1L27A 2B6WA 1L58A 2AT9A 3GUNA 4X32A 5I14A 119LA 198LA 3QBKA 5LZMA 4DJHA 162LA 1CX6A 4ARMA 1P2RA 1L46A 4XT3A 4I7SA 1D3JA 1G1WA 5H2NA 4BWBA 4DKLA 5B6XA 1CU0A 4QRYA 3K2RA 1OWZA 4PK0A 3VHZA 1L05A 3F8VA 1M0LA 4G7RB 257LA 128LA 5TGZA 5JJJA 1S51A 138LA 1L57A 4EKPA 2RAZX 3ZEVA 1CV5A 1L0KA 2A4TA 243LA 102LA 260LA 4X31A 1L59A 2F32A 3SB8A 1LYDA 3OAXA 3C81A 188LA 113LA 1DYCA 1C6IA 1L31A 1L97A 4I7QA 4FAAB 1L37A 3C80A 3MBVA 3V2WA 2RB0X 1L54A 3VI0A 3C83A 1L81A 4AMJA 4IAQA 2F95A 1QHJA 111LA 5JJEA 4LZMA 3HH3A 2RAYX 3EH4B 1OWYA 4FPDA 4LDEA 1L07A 3QJVB 160LA 5DYSA 2LCBA 1PXSA 131LA 1L32A 4JKVA 5H2KA 206LA 4W58A 4G71B 4XXJA 3L64A 114LA 4BVNA 1L28A 1L89A 4JR8A 2WJKA 3OE9A 1KW7A 1L85A 1L94A 1DYEA 1P3NA 3F9LA 1CUQA 151LA 1L29A 1UCQA 1AP9A 1L70A 1L56A 1QT6A 1L63A 3SN6R 1L84A 1NHBA 1PQJA 1QTZA 1C3WA 180LA 3S3DB 1XJUA 2B7XA 3UTYA 4HWLA 3NY8A 1S8LA 3GUPA 2YCWA 181LA 221LA 1QS5A 107LA 1L19A 1T97A 2I20A 1G0JA 4XTOA 2B75A 1SSWA 1L14A 4W56A 2CUUA 1KG9A 3CAPA 3RFMA 1C6HA 4OO9A 3HU8A 1L23A 1LI3A 3ZPQA 3PXOA 1L80A 4E97A 145LA 4BV0A 256LA 1H2SA 4GP5B 1CV6A 1IW9A 201LA 3DMZA 1X0K1 1LGWA 2QARC 1C60A 3HU9A 4AQNA 249LA 3QBGA 3EH3B 1G0LA 1KNIA 1L13A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L06A 4NGWA 2PEDA 1HZXA 4I8SA 2ANVA 4DQJA 2RBOA 1L17A 4WM1A 3S8FB 1G07A 1GPQC 5KKHA 3EH5B 1B7QA 1OUAA 1LHIA 2HULA 213LA 1B5YA 4WO9A 236LA 1C6KA 1HFYA 1IOQA 1PS5A 2YBMA 1C63A 1YL0X 1L22A 1LLHA 4G4CA 1ZV5L 3AZ6A 4PGJB 186LA 2G4PA 3EBAB 3BKVA 4IASA 2RBSA 1F4ZA 1IORA 3UZCA 2B5ZA 1SSYA 5ETZA 2O79A 4OOTA 1LYEA 1C6TA 5B6WA 5KXWA 1OV5A 1SQ2L 1XEJA 3FE0A 3B0KA 1F0WA 4OWCA 4LFPA 1U19A 3DQBA 3A6CY 3VGAA 1OV7A 2ZIKA 1GBWA 3HAQA 1L26A 2ZFEA 1NDMC 1YKYX 3TXHA 2C8OA 1IP5A 1LMQA 4B4JA 2OE4X 4GN3A 233LA 2RBPA 191LA 3CDTA 1GEZA 1CU3A 1N4FA 1L44A 1OVKA 4H9FA 3X3BA 3B0IA 1LSAA 2EPEA 209LA 2IGCA 232LA 1C6DA 2DQFC 1D3FA 2RSCA 242LA 3W6CA 173LA 1B5ZA 2YBIA 4ANRA 1QUHA 1FBBA 3E3DA 4HSFA 4HYXA 2D91A 1CV1A 1IR7A 1GF0A 1LJFA 1OQMA 1BVKC 3QJSB 2QPEB 1L51A 1D9UA 1D6QA 3ZEKA 3ZVQB 5KXSA 2MEAA 235LA 1R84A 1NMMA 1Q5IA 2YDOA 1JTTL 2LC9A 1L0MA 3A94A 1B5UA 2Z37A 1G7JC 4W53A 1DZEA 1L02A 1L90A 1P7SA 4GBRA 5B34A 3KAMA 1G0QA 1IW6A 1HNLA 1IWTA 1KIQC 4RDSA 5HMVA 1AT5A 3AZ7A 1SLYA 5F9UA 1LYJA 148LE 4NHTA 3UTWA 1B0DA 3CDOA 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 1G0J A;  4XTO A;  2B75 A;  1SSW A;  1L14 A;  4W56 A;  2CUU A;  1KG9 A;  3CAP A;  3RFM A;  1C6H A;  4OO9 A;  3HU8 A;  1L23 A;  1LI3 A;  3ZPQ A;  3PXO A;  1L80 A;  4E97 A;  145L A;  4BV0 A;  256L A;  1H2S A;  4GP5 B;  1CV6 A;  1IW9 A;  201L A;  3DMZ A;  1X0K 1;  1LGW A;  2QAR C;  1C60 A;  3HU9 A;  4AQN A;  249L A;  3QBG A;  3EH3 B;  1G0L A;  1KNI A;  1L13 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5LA8 A;  4H9C A;  195L A;  4BAD A;  1LZG A;  3GUO A;  1UAC Y;  187L A;  2XBS A;  5D5C A;  4GLA A;  3QNG A;  2WJL A;  4X1H A;  2RBN A;  4HJV A;  108L A;  1GFJ A;  3DMX A;  5AMY A;  1DI5 A;  4NGI A;  1B7L A;  4IB4 A;  4QI1 A;  2BRD A;  1T8F A;  1LZN A;  1WQR A;  1QDT A;  1AM7 A;  4WM6 A;  2MEE A;  3WMK A;  1AT9 A;  246L A;  4GBR B;  2B72 A;  4YX7 C;  2Y02 A;  1R2N A;  163L A;  1GE1 A;  120L A;  4EXM A;  5F81 A;  1L0J A;  1F88 A;  5AZD A;  1GE0 A;  3LYM A;  4ML7 A;  1LSP A;  3C7W A;  1LZE A;  2W1M A;  4O34 A;  1D9W A;  2RH1 A;  1CV3 A;  1YL1 X;  4ZEE A;  1VJM A;  3QBI A;  1GF8 A;  5DHH A;  5F8U A;  4MQS A;  1LYF A;  3AZ5 A;  5LAF A;  1GHL A;  1P8U A;  215L A;  168L A;  5LVH A;  2YCZ A;  2OTZ X;  4B4E A;  5AX0 A;  4EA3 A;  3TXI A;  4G9S A;  5J7A A;  4BUO A;  3TXK A;  1VDQ A;  1G7I C;  2A7D A;  5LZM A;  1LHM A;  1L46 A;  1D3J A;  2ZIL A;  1G1W A;  1EQ5 A;  2D4K A;  1D6P A;  4DD7 A;  4IAT A;  4XYY A;  5B6X A;  4CFO A;  4QRY A;  2Z18 A;  4PK0 A;  3WPJ A;  4XJH A;  257L A;  5TGZ A;  1S51 A;  1TBY A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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