3NY9A

Crystal structure of the human beta2 adrenergic receptor in complex with a novel inverse agonist
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
439
structure length
439
Chain Sequence
WVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIWTLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein
molecule keywords Beta-2 adrenergic receptor, Lysozyme
publication title Conserved Binding Mode of Human beta(2) Adrenergic Receptor Inverse Agonists and Antagonist Revealed by X-ray Crystallography
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 162
structure length 439
sequence length 439
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-07-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3ny9A02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3ny9A01
151LA 3P0GA 3HH5A 3X3CA 1L02A 2RB2X 4W56A 2YCYA 258LA 4JR8A 139LA 4WAVA 4XTLA 4Y9HA 1EHKB 1L93A 2YDOA 1D2WA 3QBKA 5EN0A 3L64A 4GYCA 1L82A 2Z6BA 4PJZA 1L12A 5G54A 1BRXA 1L53A 5B6YA 2EI4A 3A7KA 1LYJA 237LA 1L52A 4AMIA 3GUNA 3QDCA 2OTZX 4DJHA 2B7XA 5B6WA 220LA 3GULA 1OV7A 5AX0A 1QM8A 5DHHA 4L6RA 231LA 3K2RA 1L27A 140LA 3HUQA 1PXSA 1PQJA 2KSAA 1QTZA 4ARJA 3ABWA 2B75A 2YCWA 4W54A 1GUEA 2VT4A 1CUQA 3CAPA 5B6XA 119LA 1QUDA 227LA 3VW7A 3DMZA 3HDFA 3DMVA 172LA 3COCA 3CDQA 5BR2A 1LW9A 3SB8A 1L86A 115LA 1L79A 1QUGA 2OE7X 3PQRA 2OU0X 1DYFA 1L18A 5DHGA 3HT6A 3S3CB 1S51A 129LA 4HWLA 103LA 3HU9A 211LA 2I1XA 3GUJA 5A44A 195LA 1L25A 1P8IA 4HYJA 157LA 1L0MA 1SX7A 102LA 1D2YA 5B6VA 3HTBA 1L95A 200LA 3HTDA 1QKPA 1DYGA 3C7YA 1TN0A 7LZMA 4XT1A 175LA 1K28A 1X0K1 3SN6R 1LYEA 4QRYA 2F95A 192LA 3HWLA 1L40A 3HDEA 1KW7A 1L24A 4GP4B 1C6AA 3EH3B 144LA 1L50A 4AQNA 3HH6A 1F4ZA 4IARA 2O7AA 186LA 249LA 4UG2A 5AHZA 141LA 199LA 5H2PA 215LA 4E97A 1L01A 3PBLA 1VGOA 1L22A 3GUOA 2LNLA 2R4RA 1CU0A 1QT4A 1LYGA 1OWZA 3F9LA 2OEAX 4EPIA 2RBNA 4KLYA 4W52A 1PY6A 3UTXA 3C83A 3UZAA 1T97A 201LA 232LA 5JJNA 1CV6A 5A8EA 1DYCA 1L56A 1LGXA 4XXJA 4NC3A 3QBGA 4G7QB 4XTOA 1C60A 4ZPUA 1S54A 3C7WA 223LA 1L39A 1L88A 171LA 198LA 1CV1A 4G7RB 4I7LA 1T8FA 4W55A 4QIDA 4I7RA 2Y01A 4G71B 1P56A 1L99A 214LA 2Y02A 2PEDA 110LA 191LA 1L75A 4I7KA 2QB0B 1L03A 1C6HA 3G3VA 5DYSA 120LA 1QT6A 1ZYTA 217LA 2J4YA 1L57A 1WTHA 3QJVB 1SSYA 1QUHA 2B6XA 5AWZA 4W51A 2ZZLA 4W53A 1P64A 212LA 4YXAC 1L06A 234LA 221LA 4A4MA 3LZMA 4PXFA 1P36A 3C8QA 5G36A 3NY8A 127LA 107LA 161LA 1C6GA 1TLAA 2LZMA 3SBBC 5G2DA 3G3XA 3UZCA 4EPFA 219LA 2Q9EA 3RZEA 196LA 1D3FA 1L43A 1QT5A 2L78A 1L44A 5AHYA 3HUKA 3GUKA 1Q5JA 1C6IA 1L32A 1X0I1 2JAGA 3HAQA 4L35A 3C8SA 1P8UA 3DKEX 1L96A 1L87A 209LA 5H2IA 1C6MA 1UCQA 1C6BA 112LA 1L15A 1XJUA 1L64A 3HAOA 1L68A 3GUIA 4G7SB 3PWHA 2Y00A 2ZIYA 4BWBA 1OVHA 224LA 1PXRA 5B35A 2B74A 5H2KA 1P2RA 1L97A 1AT9A 4I7SA 109LA 183LA 1L30A 176LA 260LA 1S8LA 2B6TA 3QBIA 3MBVA 4EIYA 1OYUA 2RBQA 1D9WA 4ARMA 5G2AA 3OE6A 181LA 1L07A 1CX7A 3OE9A 1L63A 247LA 1L45A 3VI0A 1D3NA 2OE9X 2NTWA 1CV4A 2Z73A 2HUKA 2Q9DA 2RBSA 3C8RA 5ITCA 1L47A 2O4WA 3NY9A 1L37A 118LA 1KNIA 1QSBA 2YCXA 3HT8A 1C6NA 1L60A 1KG8A 3DMXA 168LA 3RFMA 1L33A 205LA 5B34A 3AM6A 1IW9A 1L54A 2AT9A 126LA 2IGCA 256LA 251LA 137LA 3DN8A 3OE8A 4XTNA 1S53A 1C61A 5G53A 5B0WA 4DAJA 2HUMA 4EXMA 2F93A 162LA 3AYNA 1DYAA 1C69A 1P37A 1S8JA 4GBRB 4GP8B 222LA 239LA 169LA 155LA 163LA 1L66A 3PXOA 2B73A 1KMEA 2Y04A 4LDEA 5B6ZA 156LA 262LA 1L71A 184LA 1L90A 143LA 1L08A 216LA 4GP5B 1CX6A 255LA 1JV7A 170LA 1QTVA 4N4WA 4UHRA 2YDVA 2RB1X 4N4YB 3X3BA 4BUOA 2KSBA 4GPOA 122LA 3VGAA 1I6SA 1JQUA 3ODUA 2ZFEA 1L81A 3HARA 1Q5IA 3L2XA 3T45A 1L14A 1T8AA 3CDVA 1C6TA 1QTHA 177LA 2RB0X 4FPDA 1E0PA 1L62A 4PK0A 1B6IA 4N6HA 1QT7A 4BV0A 1CV0A 5H2LA 4MD1A 2NTGA 1L10A 5JJJA 3F8VA 1L83A 1L51A 4MQTA 2M3GA 3WQJA 1OVKA 4YXCA 3S8FB 1L59A 4XT3A 3ZPQA 187LA 206LA 1KG9A 4ARQA 1C62A 1F50A 242LA 1KY1A 3QBLA 3HTFA 3HH3A 1CVKA 1PQOA 4I7QA 4PXKA 1HZXA 2X72A 1LYDA 1L76A 233LA 4S0WA 1L85A 2ANXA 1QT8A 182LA 5LWEA 261LA 3S8GB 3QJUB 1LI3A 4ARLA 1QSQA 1G0JA 6LZMA 1QS5A 2F2QA 1G07A 1C6QA 146LA 1D3JA 3UONA 4LDOA 128LA 4IAPA 1C66A 2B70A 2YCZA 1ZURA 1XIOA 3ZEVA 145LA 2HULA 2HPYA 3CDTA 1L72A 1P3NA 226LA 1L09A 1LYIA 254LA 138LA 1CTWA 2RBPA 1L13A 5TGZA 1DYEA 3HU8A 4I7MA 1P6YA 4I7TA 164LA 1P7SA 1L35A 259LA 5AX1A 1OWYA 225LA 197LA 1C6CA 4YX7C 1LLHA 108LA 1C64A 123LA 2CUUA 3UG9A 166LA 1QTBA 3FI5A 1FBBA 1FBKA 2O79A 1C6PA 1CU5A 4I7PA 3KJ6A 2QPDB 1M0LA 4FA7B 3BVDB 1ZWNA 2Z55A 1QTCA 4OV0A 3ZPRA 2NTUA 1G1WA 3NYAA 3EH5B 1G0KA 2RBOA 5JJEA 3DN3A 1O0AA 1G0LA 1BM1A 4KNFA 1L42A 3CDOA 3OE0A 3S3BB 1KW5A 1SX2A 5A45A 2RAZX 160LA 3OAXA 1P8HA 4HYXA 1L84A 1H68A 252LA 5J7AA 1L05A 1L0KA 2WJLA 4W59A 1F88A 4K5YA 1CV5A 3EH4B 3FADA 3EMLA 2OE4X 3DN4A 3G3WA 2B6ZA 1LYFA 2QPEB 1L36A 1EPYA 1SWZA 4EJ4A 2I20A 4QI1A 2B6WA 152LA 1G0PA 3NS0A 4W57A 158LA 1AP9A 4G70B 218LA 1JGJA 2OTYX 174LA 4EKSA 180LA 1L16A 3GUPA 1LWKA 5G2CA 1L89A 236LA 142LA 3DN0A 4GRVA 1LPYA 246LA 3RUNA 1QTDA 1L74A 3DNAA 243LA 1C68A 4BEYA 3HT9A 3UTVA 4BEZA 4I7JA 1JTNA 185LA 1LGWA 3C80A 4MQSA 1H2SA 2F47A 3DN2A 1L20A 1R84A 3DN6A 1IXFA 3VVKA 257LA 5G28A 1GZMA 159LA 3REYA 178LA 5KKHA 1C6KA 2B6YA 3QJTB 4EA3A 4GBRA 1XMEB 3SBAA 1LI2A 1MGYA 1L21A 3PDSA 2LC9A 1C6DA 1C6LA 3FA0A 4ARQB 4IAQA 4IB4A 5FJGA 1G1VA 245LA 1DZEA 1PQDA 3HH4A 1BRRA 111LA 1L29A 1P46A 2NTHA 1L77A 1L58A 4BVNA 2A4TA 2OU9A 2G87A 2R4SA 1E12A 5AZDA 147LA 3DN1A 1X0SA 1C6FA 3C81A 3QAKA 1L00A 1DYDA 1JTMA 1L67A 3QAPA 4X32A 5H2OA 5H2JA 4G72B 1KGBA 1L69A 3UTWA 253LA 3DDLA 1CUPA 4FBZA 1L98A 1XJTA 4LZMA 4I7NA 4WW3A 4LDLA 1CU3A 1L70A 1PQIA 1UAZA 1L28A 235LA 1M0MA 3AYMA 114LA 190LA 1L46A 3HAPA 1L94A 4AMJA 104LA 2I21A 165LA 1QT3A 2RAYX 2QARC 3HTGA 1KY0A 1L38A 1CU6A 244LA 1C6JA 1C63A 1LN6A 3CODA 3HASA 130LA 1L34A 1NHBA 1L19A 238LA 1CWQA 3NSBA 3CDRA 149LA 1C67A 230LA 1L92A 1U19A 1C6EA 2JAFA 4TL3A 2ANVA 1SWYA 148LE 3C9MA 1DYBA 5C1MA 3SB5A 2Y03A 248LA 4OO9A 2L6XA 2F32A 1BRDA 4I7OA 1JV6A 1SSWA 188LA 1L9HA 3QJSB 240LA 1GU8A 1L11A 1OV5A 5I14A 3HUAA 167LA 189LA 2WJKA 3VG9A 3V2WA 3C9LA 2KSYA 4EKRA 1L17A 1LGUA 5H2HA 3HANA 1P2LA 3S3DB 4EKPA 1VJMA 1LWGA 1XJIA 4X31A 3GUMA 3QJRB 1L55A 1L73A 125LA 2RBRA 1JFPA 3DQBA 1L41A 1C3WA 3UTYA 1L26A 3SB7A 241LA 1C8SA 3SB6A 1L61A 1P5CA 2LCBA 3D4SA 2KS9A 5ETZA 5F8UA 1L0JA 1L91A 4J4QA 4JKVA 4MD2A 4FAAB 2BRDA 1PQKA 5H2MA 5LZMA 4ARMB 4W58A 4DKLA 4JQ6A 3V2YA 3SB9A 1L23A 5BR5A 1QHJA 4MBSA 1G06A 1TN5A 1L31A 2RH1A 1LI6A 3JR6A 228LA 3VHZA 2I35A 4X1HA 2B72A 4EKQA 3QJQB 1C65A 1G0MA 1G0GA 4ARPA 1C8RA 1L04A 1QS9A 5H2NA 1IW6A 1T8GA 1QKOA 1CV3A 1L49A 1D3MA 1R2NA 1L65A 1LYHA 173LA 1L80A 131LA 113LA 5B2NA 3HT7A 1KS3A 1PQMA 250LA 5ITEA 210LA 1M0KA 2OU8A 1XEPA 229LA 3C7ZA 3C82A 1CU2A 1OVJA 150LA 1L48A 213LA 1S52A 1QUOA 1G0QA 1T6HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1J1PY 5I54A 3P0GA 1LZCA 5HNCA 1L02A 2RB2X 5LYMA 258LA 4XTLA 139LA 1EHKB 4NSIA 4GYCA 2Y8PA 4PJZA 5I5QA 5G54A 1BRXA 3A7KA 1LYJA 1L52A 3GUNA 4NHPA 4H8XA 3QDCA 2B7XA 1OV7A 5KXWA 5DHHA 3ABWA 4ARJA 1CKGA 2B75A 2YCWA 5B07A 4W54A 3CAPA 2VT4A 119LA 1OP9B 227LA 4W94A 2XTHA 4NSGA 4N0JA 4XN6A 1GE4A 4GLAA 3COCA 4FBZA 1L86A 2OE7X 4DD2A 2OU0X 1L18A 3ZEKA 1AT5A 1NWGA 4RW1A 3S3CB 1IOQA 2FYDA 1S51A 4LYBA 103LA 1S52A 3IJVA 1C7PA 4NGWA 4C3WA 3HTBA 200LA 3HTDA 1GF4A 2IFFY 5L3IA 5F81A 1X0K1 2HU3A 1L40A 4HV2A 1LHIA 1NBYC 5LYZA 9LYZA 144LA 1L50A 3EH3B 4IARA 4WLYA 2O7AA 5H2PA 215LA 1QDRA 1LSPA 4QEQA 1QT4A 1OWZA 3W6BA 4W52A 1IOTA 1DI5A 5A8EA 1W08A 4XXJA 1LJJA 3QBGA 1V7SA 4G7QB 3MGWA 1C60A 2I26L 1FLQA 3C7WA 198LA 1GFGA 1GWDA 2CDSA 4W55A 4QIDA 2Y01A 5APCA 3FE0A 4HPEA 1L75A 1DKJA 4WMGA 2QB0B 1FKVA 5DYSA 1LKRA 1YKXX 1QT6A 4GN3A 1ZYTA 3QJVB 4DD1A 5F9UA 2ZZLA 1IY4A 4YXAC 1LMOA 5KXZA 1L06A 3LZMA 1HF4A 5G36A 161LA 2LZMA 1C6GA 4YEMA 2A7DA 1XEJA 3AGHA 4WL6A 2Q9EA 1D3FA 1L43A 2L78A 1Q5JA 1X0I1 1VDSA 2JAGA 3HAQA 3DKEX 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 1FBK A;  2O79 A;  1C6P A;  1CU5 A;  4I7P A;  3KJ6 A;  2QPD B;  1M0L A;  4FA7 B;  3BVD B;  1ZWN A;  2Z55 A;  1QTC A;  4OV0 A;  3ZPR A;  2NTU A;  1G1W A;  3NYA A;  3EH5 B;  1G0K A;  2RBO A;  5JJE A;  3DN3 A;  1O0A A;  1G0L A;  1BM1 A;  4KNF A;  1L42 A;  3CDO A;  3OE0 A;  3S3B B;  1KW5 A;  1SX2 A;  5A45 A;  2RAZ X;  160L A;  3OAX A;  1P8H A;  4HYX A;  1L84 A;  1H68 A;  252L A;  5J7A A;  1L05 A;  1L0K A;  2WJL A;  4W59 A;  1F88 A;  4K5Y A;  1CV5 A;  3EH4 B;  3FAD A;  3EML A;  2OE4 X;  3DN4 A;  3G3W A;  2B6Z A;  1LYF A;  2QPE B;  1L36 A;  1EPY A;  1SWZ A;  4EJ4 A;  2I20 A;  4QI1 A;  2B6W A;  152L A;  1G0P A;  3NS0 A;  4W57 A;  158L A;  1AP9 A;  4G70 B;  218L A;  1JGJ A;  2OTY X;  174L A;  4EKS A;  180L A;  1L16 A;  3GUP A;  1LWK A;  5G2C A;  1L89 A;  236L A;  142L A;  3DN0 A;  4GRV A;  1LPY A;  246L A;  3RUN A;  1QTD A;  1L74 A;  3DNA A;  243L A;  1C68 A;  4BEY A;  3HT9 A;  3UTV A;  4BEZ A;  4I7J A;  1JTN A;  185L A;  1LGW A;  3C80 A;  4MQS A;  1H2S A;  2F47 A;  3DN2 A;  1L20 A;  1R84 A;  3DN6 A; 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 3CDR A;  149L A;  1C67 A;  230L A;  1L92 A;  1U19 A;  1C6E A;  2JAF A;  4TL3 A;  2ANV A;  1SWY A;  148L E;  3C9M A;  1DYB A;  5C1M A;  3SB5 A;  2Y03 A;  248L A;  4OO9 A;  2L6X A;  2F32 A;  1BRD A;  4I7O A;  1JV6 A;  1SSW A;  188L A;  1L9H A;  3QJS B;  240L A;  1GU8 A;  1L11 A;  1OV5 A;  5I14 A;  3HUA A;  167L A;  189L A;  2WJK A;  3VG9 A;  3V2W A;  3C9L A;  2KSY A;  4EKR A;  1L17 A;  1LGU A;  5H2H A;  3HAN A;  1P2L A;  3S3D B;  4EKP A;  1VJM A;  1LWG A;  1XJI A;  4X31 A;  3GUM A;  3QJR B;  1L55 A;  1L73 A;  125L A;  2RBR A;  1JFP A;  3DQB A;  1L41 A;  1C3W A;  3UTY A;  1L26 A;  3SB7 A;  241L A;  1C8S A;  3SB6 A;  1L61 A;  1P5C A;  2LCB A;  3D4S A;  2KS9 A;  5ETZ A;  5F8U A;  1L0J A;  1L91 A;  4J4Q A;  4JKV A;  4MD2 A;  4FAA B;  2BRD A;  1PQK A;  5H2M A;  5LZM A;  4ARM B;  4W58 A;  4DKL A;  4JQ6 A;  3V2Y A;  3SB9 A;  1L23 A;  5BR5 A;  1QHJ A;  4MBS A;  1G06 A;  1TN5 A;  1L31 A;  2RH1 A;  1LI6 A;  3JR6 A;  228L A;  3VHZ A;  2I35 A;  4X1H A;  2B72 A;  4EKQ A;  3QJQ B;  1C65 A;  1G0M A;  1G0G A;  4ARP A;  1C8R A;  1L04 A;  1QS9 A;  5H2N A;  1IW6 A;  1T8G A;  1QKO A;  1CV3 A;  1L49 A;  1D3M A;  1R2N A;  1L65 A;  1LYH A;  173L A;  1L80 A;  131L A;  113L A;  5B2N A;  3HT7 A;  1KS3 A;  1PQM A;  250L A;  5ITE A;  210L A;  1M0K A;  2OU8 A;  1XEP A;  229L A;  3C7Z A;  3C82 A;  1CU2 A;  1OVJ A;  150L A;  1L48 A;  213L A;  1S52 A;  1QUO A;  1G0Q A;  1T6H A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2I26 L;  1FLQ A;  3C7W A;  198L A;  1GFG A;  1GWD A;  2CDS A;  4W55 A;  4QID A;  2Y01 A;  5APC A;  3FE0 A;  4HPE A;  1L75 A;  1DKJ A;  4WMG A;  2QB0 B;  1FKV A;  5DYS A;  1LKR A;  1YKX X;  1QT6 A;  4GN3 A;  1ZYT A;  3QJV B;  4DD1 A;  5F9U A;  2ZZL A;  1IY4 A;  4YXA C;  1LMO A;  5KXZ A;  1L06 A;  3LZM A;  1HF4 A;  5G36 A;  161L A;  2LZM A;  1C6G A;  4YEM A;  2A7D A;  1XEJ A;  3AGH A;  4WL6 A;  2Q9E A;  1D3F A;  1L43 A;  2L78 A;  1Q5J A;  1X0I 1;  1VDS A;  2JAG A;  3HAQ A;  3DKE X;  4ETA A;  1T3P A;  4QGZ A;  1C6M A;  1UCQ A;  1L15 A;  2YBN A;  1XJU A;  1L64 A;  4GLV A;  3PWH A;  4BWB A;  1OVH A;  3WMK A;  4H92 A;  8LYZ A;  3QBI A;  1S8L A;  176L A;  1D9W A;  5G2A A;  5APE A;  2HTX A;  4CFO A;  2PC2 A;  1LYZ A;  4DDB A;  1L63 A;  247L A;  5F9X A;  4TWS A;  134L A;  2NTW A;  1UBZ A;  2OE9 X;  4YF2 A;  1KXX A;  2RBS A;  1HFZ A;  4YEN A;  3NY9 A;  5JEN B;  3W6C A;  1JTT L;  1D0K A;  4KPM A;  1HFY A;  3LYM A;  168L A;  1IWZ A;  3RFM A;  4OWB A;  4YM8 A;  1HFX A;  5B34 A;  1LHJ A;  1QIO A;  3WVX A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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