4LT1A

Hewl co-crystallised with carboplatin in non-nacl conditions: crystal 1 processed using the xds software package
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Carboplatin binding to a model protein in non-NaCl conditions to eliminate partial conversion to cisplatin, and the use of different criteria to choose the resolution limit
rcsb
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4lt1A00
1WVUA 2BQGA 4NSGA 5KXZA 1LZYA 1XEKA 4H9FA 1GFGA 4NG8A 4XADA 3QE8A 1UA6Y 4WLYA 5DN5A 4Z46A 3M3UA 4XENA 2BAAA 5KXKA 3CQLA 3LN2A 4DT3A 1EQ4A 1QTKA 3WPKA 2F30A 1V7SA 1LSEA 2BQFA 1GXV2 2BQIA 2DQAA 3LYTA 4QEQA 1HERA 1B7MA 3W6AA 4WOAA 1IEEA 4WO9A 5HNLA 1IP1A 4NHSA 3TXHA 4ANRA 3QY4A 1IOSA 3LYOA 4NWHA 3WW5A 2HEEA 1YAOA 3HBHA 5KXYA 5C6LA 1TAYA 5F9UA 4LYBA 1LJJA 1BB4A 1GFHA 1LSPA 1LYYA 1CNSA 1CJ7A 1G7IC 2IFFY 1GBYA 2ZIKA 4H1PA 3SP3A 2BQEA 1IOCA 4XJDA 1LZ6A 4H91A 4HJYA 1YQVY 3LZ2A 4YEMA 1JJ3A 2XTHA 1QUTA 1LZGA 5A3ZA 1QSAA 1JJ0A 5II3A 1HSWA 1HNLA 4HSFA 5EBHA 1HFXA 1QIOA 5LIOA 1WQRA 4XJFA 3WVXA 4OWCA 3P4ZA 4MCKA 5LVGA 1BB5A 1W08A 2W1MA 4E3UA 3HFMY 4NHIA 1MELL 3M18B 1JPOA 1GB5A 5M1YA 4UWNA 1HELA 1NHEA 1CKHA 1HEWA 1I1ZA 1B7SA 1UBZA 1XGUC 5LVKA 4LT0A 2DQEY 2BQKA 1RE2A 1HENA 2BPUA 2YVBA 2Z37A 1BHZA 4YENA 4MSTA 4B4IA 2G4QA 154LA 3T6UA 1LHKA 3MGWA 4XJIA 4J1BA 1T6VL 4H90A 3D9AC 3ATOA 4ZIXA 1LZCA 1CJ9A 1IWVA 2ZILA 1BWJA 3FE0A 1CKGA 194LA 1JKCA 2H9KA 1BVKC 1JWRA 5LAGA 5LYTA 2BQOA 1CKCA 1GB2A 1IWZA 1DXJA 5C6IA 4WL6A 4I0CA 1GFTA 1WQOA 3CT5A 1JSEA 1OUGA 1WQQA 132LA 1XGPC 2D91A 4X3BA 2EIZC 1UACY 4ET8A 4NGVA 3AZ4A 1LHLA 3WW6A 3P64A 4NFVA 4WG7A 1IP5A 208LA 3A6CY 4KPMA 1AT6A 1NF5A 4B49A 1J1XY 1IP3A 1HHLA 1NQIA 1G7HC 3D3DA 1LZ1A 2FYDA 1UICA 4NGIA 1D0MA 4OW1A 2LZ2A 3W6DA 2F2NA 1LZ9A 4M6DA 1DKJA 5LXWA 2DBTA 1NWGA 1WQNA 4GLVA 5I4XA 2DKVA 1YKZX 3AGGG 5FEKA 5B59A 4DD1A 5DL9A 2ZIJA 1VDPA 1GB6A 1GHLA 2DQGY 2BQMA 4N5RA 5KXWA 5T3FA 2I25L 2Z39A 1LKRA 4G4CA 4H92A 1I56A 1HSXA 1JTTL 2YBLA 1UIBA 1GE1A 4WM1A 2XBSA 1IWYA 1QSWA 1LSCA 1XEIA 1KXYA 1BB3A 2CDSA 3CT1A 2XJWA 4WLXA 1B5XA 4GLAA 4YOPA 4WL7A 3RW8A 9LYZA 1LZ4A 2VB1A 1TBYA 3TXEA 1OUEA 3WPLA 2G4PA 1OUJA 4FJRA 3A94A 1HFYA 1D0KA 1LZ5A 3WL2A 1NDGC 1AM7A 1QQYA 3HBDA 5AMYA 5D5CA 1YIKA 4B1AA 4DDBA 1FKVA 3WUMA 1GE4A 5KXRA 1E8LA 1C7PA 1YANA 1F6RA 1GXXA 2HEDA 1VFBC 2Q0MX 3T36A 133LA 1GF3A 1LAAA 2BQNA 3A67Y 4N0JA 2CWIA 4PHIA 1GFJA 2PC2A 4DWXA 1EL1A 4YF2A 1GBOA 4NGZA 5LYZA 5IELA 3ZEKA 2IHLA 4NHQA 1IOQA 1GF6A 2C8OA 1IP2A 1IR7A 1CJ8A 2BQJA 1XSFA 2HEAA 2HUBA 2G4NA 5B06A 1GF9A 1JISA 4TTDA 2BQAA 3QNGA 1RI8B 3N9CA 1OUFA 1ZV5L 3A8ZA 3A95A 1GFKA 5I5QA 2D4JA 3W6FA 1A2YC 1B7RA 5LINA 1YKXX 4ETEA 5KXOA 2LYMA 3GXRA 4QDNA 5KXXA 3TXIA 1GE3A 3BKHA 2Z2FA 1IP4A 4TSCA 1FLUA 5HNCA 4GCDA 4GCFA 1HFZA 3WMKA 1JTOL 3CT0A 1FLWA 4B4JA 4WO6A 1JSFA 3TXJA 4NGWA 3P68A 4XN6A 4C5FA 3ATNA 1YAMA 3CB7A 4HTKA 1LHHA 1KXWA 1LPIA 3TXGA 2BQHA 2H5ZA 1LMTA 5E9RA 1BVXA 4GN3A 1LJGA 5B05A 5I4YA 1SQ2L 1IWTA 1FLQA 1FKQA 1MLCE 4G4HA 4HV1A 1IWUA 1C10A 1IP7A 1QTEA 3AB6A 4O34A 4ETBA 1JKAA 1HMKA 1KIPC 1UIHA 1HC0A 2CGIA 4WM2A 1IR8A 4H9EA 1CKDA 1IR9A 1GBSA 4DDCA 5B1FA 1AT5A 1HMLA 1LZAA 4MR1A 1LSFA 4UWUA 1XFPL 3J4GA 4KT3A 1C43A 5FDJA 4WM6A 2YBJA 4EOFA 1LMQA 134LA 4EMNA 1JEFA 2EPEA 2ZQ4A 5APCA 2Z18A 3HBEX 4OWHA 3A93A 4BADA 1WVVA 4ET9A 1IY3A 4NHTA 4HV2A 4AGAA 1NBZC 4ETDA 4HP0A 7LYZA 2D4IA 2DQCY 5IHGA 1OUDA 2HTXA 4FDYA 4IJ4A 1LZ8A 2W1XA 1VDQA 3E3DA 4LFXA 4OOOA 1JTPL 4RW1A 1TDYA 4PPOA 3TMUA 1XGRC 5B1GA 5LYMA 1FBIX 2RSCA 4II8A 4U3XB 1LJEA 4B4EA 2Z2EA 1B5VA 4N8ZA 5APDA 4I8SA 1GD6A 4NSHA 3OJPA 3WULA 1B7PA 1IWXA 5I53A 3F6ZA 1VAUA 2W1YA 4LYZA 4CGEA 3AW7A 5J7CA 1W6ZA 5JENB 4IATA 1KXXA 2YBIA 3TXKA 1RCMA 5HLLA 1KIQC 4NY5A 5ILFA 4WM4A 3AJNA 1LMOA 3B72A 4D9ZA 4ZEEA 2N5ZA 2YBMA 5APEA 1JKDA 4TSBA 1WTMA 1LZSA 3B6LA 4LYCA 3WVYA 1GDWA 1D0LA 1FN5A 5APFA 1UCOA 2YBHA 4N9RA 4DD9A 4XJGA 1LHIA 1GF7A 1RJCB 1UIEA 1V7TA 5LVIA 1REMA 1JIYA 1KIRC 1LZRA 1LYZA 5FELA 1GE2A 3RU5A 1ZMYL 1C45A 4KL7A 5FCPA 1LMCA 1JHLA 1YL1X 1B7LA 1QDRA 5KY1A 4RLNA 4J1AA 4NSJA 1VATA 1LSZA 4PGJB 3LHMA 3ULRA 2MEGA 1NBYC 4ETAA 3WUAA 5KXMA 3IJUA 2DQHY 4H8YA 3CSZA 4HJVA 153LA 1XGQC 4IASA 3A90A 4M4OA 3WUNA 4NWEA 1DZBX 1OUCA 2B5ZA 2FYCA 1GF5A 4H9AA 1Z55A 4P2EA 2F4GA 4LGKA 2MECA 1LJHA 1WQPA 1A4VA 2LZTA 1J1OY 1HEQA 3WYHA 4AXTA 4W94A 4NEBA 3TMWA 2ZWBA 3K3TA 1LMPA 2DQDY 1GFAA 2MEIA 4G9SA 1OP9B 1UIGA 4LFPA 1INUA 4NIJA 1SLYA 1LMAA 1LYOA 4WM5A 4DYGA 1DI4A 1LSDA 3TXFA 4A7DA 4WLTA 4LT3A 4LZTA 5LVHA 2FBDA 3GXKA 2Z38A 1D6PA 3WU9A 1YILA 2MEAA 3TMVA 1GBZA 5KKJA 4CFPA 1IIZA 3AGIA 3EBAB 4Z98A 1NMMA 2FBBA 2ZYCA 4CJ2A 1LJFA 1REYA 1B9OA 2XBRA 1BGIA 1GB7A 4LYOA 4R6CA 4G4BA 5HMVA 3W3EA 1TEWA 3W6EA 1B7QA 1TCYA 1UIAA 2F4AA 2I26L 3N9AA 2D6BA 1O23A 1B7OA 3RT5X 4QY9A 1B7NA 6LYTA 5K7OA 1LSMA 1LMNA 1DI5A 2Z12A 3A96A 1H87A 1BQLY 3B0OA 4XJBA 3KAMA 1J1PY 3G3BB 4DD3A 2BLXA 1ALCA 1REZA 4J7VA 4R0FA 1N4FA 4DC4A 5KJ9A 1YROA 1LHJA 1F6SA 1GPQC 2BQCA 5HMJA 4XYYA 5F81A 1NKHA 4KXIA 5B07A 1JKBA 3TMXA 5KXLA 2MEEA 5ILCA 4N1CC 1PS5A 4YM8A 4YEOA 1IO5A 2LHMA 4PRUA 1G7JC 2BQBA 2DQIY 5IDDA 1ZVHL 2HECA 1LZEA 2MEBA 4WLDA 3AYQA 3IJVA 1GE0A 4RDSA 5FHWA 4B0DA 1GFVA 1IWWA 3A3QA 5FSTA 4DD7A 1FLYA 2YDGA 1LZBA 5LVJA 2MEFA 1LKSA 4DD2A 5KXTA 1D9UA 1LOZA 1G7LC 1DPXA 2HEBA 2D4KA 3WXUA 5DLAA 4PJ2C 1NDMC 4GCCA 4H9IA 1BB7A 4Z41A 1GDXA 4HTNA 3RZ4A 2DQFC 3B0IA 1VDTA 2WARA 3EXDA 4NGOA 1IY4A 2C8PA 4NG1A 5L3IA 4ETCA 1GBWA 1GF8A 2BQLA 2ZQ3A 1GFEA 1AKIA 5DN4A 5L9JA 4GCBA 3LYMA 1GBXA 1B5WA 4HPIA 3LYZA 1B2KA 5E4PA 5I4WA 3G3AB 1LZTA 3ZVQB 1RFPA 1DI3A 4TX7A 1IVMA 3A92A 1OUHA 1LZNA 3AZ6A 6LYZA 1DKKA 2A7DA 4NGYA 8LYZA 1LJKA 3OK0A 2X0AA 1GB3A 1VEDA 3RNXA 2AUBA 4NSIA 5KXSA 4NGLA 1HEOA 1YAPA 4HTQA 5HQ1A 3VWOA 1GAYA 1LSGA 5DM9A 1GB9A 4WG1A 1GEVA 3A6BY 2DQJY 2I6ZA 3AZ7A 2LYZA 4QGZA 4ZFPA 1QDTA 5F14A 1UIFA 1F0WA 1LJ4A 1JITA 2MEDA 5LA8A 4RW2A 1UIDA 1LYSA 1OQMA 1D6QA 1LSYA 3EO5A 4J0LA 4TUNA 4WM3A 4Z3MA 2W1LA 1GB0A 3WXTA 4H8ZA 4W96A 1LSAA 2BQDA 3N9EA 1HF4A 193LA 3J6KA 1LTMA 2YSSC 4H9HA 2YBNA 4LT2A 4NHPA 4G49A 4OWEA 5I54A 5LAFA 1QUSA 4GN4A 1CJ6A 4C3WA 1LJNA 4CHXA 1LSBA 1OUIA 3B0KA 1IC5Y 1BWIA 1LCNA 2HU1A 1LJIA 4N1EI 1XEJA 1GFUA 4LYTA 1LJ3A 3WPJA 5KXPA 2EQLA 3A34A 4H93A 3WU7A 5C6JA 1B5UA 1B5ZA 1OUBA 3P66A 5KKIA 3EMSA 1IP6A 3BKVA 1IC7Y 4DDAA 5A3EA 1IC4Y 4LYMA 2BLYA 5LA5A 4XJHA 1GWDA 4H9BA 4NGKA 5F9XA 1REXA 3TXBA 2NWDX 1EQ5A 1FDLY 1LHMA 4H94A 1GB8A 2ZNWY 1YAQA 1B0DA 4TWSA 1BB6A 1ZVYB 3IWRA 1LZDA 4L41A 4WMGA 4RLMA 4PRQA 3W6BA 4BS7A 2Y8PA 1IORA 1JJ1A 4GCEA 4BAPA 3A3RX 207LA 4HJZA 5F16A 4ML7A 1CKFA 1GF0A 1WQMA 2EKSC 5D5FA 4BAFA 1YL0X 3ZVQA 3AGHA 3CSQA 1EQEA 3TXDA 4GN5C 4OOTA 1T3PA 3A91A 1B5YA 1P2CC 2HEFA 1C08C 1IX0A 3AW6A 1PZYA 4OWAA 4DD0A 1GEZA 2LYOA 4UWVA 3W6CA 1OUAA 1LSNA 1DQJC 1HEMA 1AZFA 1VDSA 3AZ5A 3CSRA 4HPEA 1F10A 4H8XA 2ZNXY 1GAZA 1JUGA 1IOTA 1UUZC 2CJLA 2HU3A 1BWHA 2Z19A 1DPWA 3P65A 4OWBA 2MEHA 2ZYPA 3WH1A 1XGTC 4H9CA 4NGJA 1UC0A 1C46A 4CFOA 1YKYX 3LZTA 1HEPA 2H9JA 1GF4A 1GFRA 1I20A 1WTNA 2GV0A 3FI7A 5L3HA 135LA 2A7FA 1H6MA 3WU8A 5KXNA 4LT1A 1G7MC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WVUA 1L55A 115LA 1LZYA 1XEKA 1GFGA 4NG8A 1KY1A 5KXKA 197LA 1QTKA 1QTZA 2BQFA 3HT7A 4WOAA 1IEEA 4ARJA 3QY4A 1IOSA 1TAYA 4H1PA 1LYYA 3SP3A 1G1WA 1GBYA 1LZ6A 3HUAA 4HJYA 4YEMA 209LA 1JJ3A 1LZGA 1JJ0A 1HFXA 222LA 3P4ZA 4MCKA 1C60A 242LA 1JPOA 5M1YA 3F9LA 1UBZA 1P37A 4MSTA 1LYHA 2ANVA 2G4QA 3C83A 3T6UA 3MGWA 1CU0A 2L78A 3ATOA 1L68A 1D3JA 2ZILA 1BWJA 3FE0A 1CKGA 1BVKC 5LAGA 5LYTA 2BQOA 1CKCA 1GFTA 1C65A 1JSEA 1L22A 1PQJA 1WQQA 4PJZA 1XGPC 2D91A 258LA 4NGVA 3WW6A 1LHLA 102LA 4NGIA 2FYDA 1D0MA 3HUQA 2B74A 196LA 3W6DA 2F2NA 4M6DA 1DKJA 1C6PA 2DKVA 1YKZX 2ZIJA 1VDPA 1GB6A 2I25L 1HSXA 5LZMA 1C63A 4WM1A 126LA 2XBSA 1L92A 1BB3A 3CT1A 1LZ4A 252LA 1OUJA 4FJRA 3A94A 1AM7A 1CU2A 5AMYA 123LA 168LA 4LDLA 1F6RA 1L21A 2HUKA 1L60A 2CWIA 1GFJA 2PC2A 4NGZA 1PQDA 7LZMA 4NHQA 250LA 4W52A 1L35A 5B06A 2BQAA 3HH5A 3PBLA 3QNGA 1OUFA 4ARQB 2NTGA 1GFKA 3L64A 1A2YC 2LYMA 3HU8A 1GE3A 1FLUA 1HFZA 3WMKA 1PQOA 4B4JA 1L25A 1YAMA 2OE9X 3ATNA 1P7SA 4ARPA 1G0JA 5E9RA 1LMTA 4GN3A 1IWTA 1FKQA 4ETBA 240LA 1LYDA 1HC0A 3FA0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1WVU A;  2BQG A;  4NSG A;  5KXZ A;  1LZY A;  1XEK A;  4H9F A;  1GFG A;  4NG8 A;  4XAD A;  3QE8 A;  1UA6 Y;  4WLY A;  5DN5 A;  4Z46 A;  3M3U A;  4XEN A;  2BAA A;  5KXK A;  3CQL A;  3LN2 A;  4DT3 A;  1EQ4 A;  1QTK A;  3WPK A;  2F30 A;  1V7S A;  1LSE A;  2BQF A;  1GXV 2;  2BQI A;  2DQA A;  3LYT A;  4QEQ A;  1HER A;  1B7M A;  3W6A A;  4WOA A;  1IEE A;  4WO9 A;  5HNL A;  1IP1 A;  4NHS A;  3TXH A;  4ANR A;  3QY4 A;  1IOS A;  3LYO A;  4NWH A;  3WW5 A;  2HEE A;  1YAO A;  3HBH A;  5KXY A;  5C6L A;  1TAY A;  5F9U A;  4LYB A;  1LJJ A;  1BB4 A;  1GFH A;  1LSP A;  1LYY A;  1CNS A;  1CJ7 A;  1G7I C;  2IFF Y;  1GBY A;  2ZIK A;  4H1P A;  3SP3 A;  2BQE A;  1IOC A;  4XJD A;  1LZ6 A;  4H91 A;  4HJY A;  1YQV Y;  3LZ2 A;  4YEM A;  1JJ3 A;  2XTH A;  1QUT A;  1LZG A;  5A3Z A;  1QSA A;  1JJ0 A;  5II3 A;  1HSW A;  1HNL A;  4HSF A;  5EBH A;  1HFX A;  1QIO A;  5LIO A;  1WQR A;  4XJF A;  3WVX A;  4OWC A;  3P4Z A;  4MCK A;  5LVG A;  1BB5 A;  1W08 A;  2W1M A;  4E3U A;  3HFM Y;  4NHI A;  1MEL L;  3M18 B;  1JPO A;  1GB5 A; 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 1IC5 Y;  1BWI A;  1LCN A;  2HU1 A;  1LJI A;  4N1E I;  1XEJ A;  1GFU A;  4LYT A;  1LJ3 A;  3WPJ A;  5KXP A;  2EQL A;  3A34 A;  4H93 A;  3WU7 A;  5C6J A;  1B5U A;  1B5Z A;  1OUB A;  3P66 A;  5KKI A;  3EMS A;  1IP6 A;  3BKV A;  1IC7 Y;  4DDA A;  5A3E A;  1IC4 Y;  4LYM A;  2BLY A;  5LA5 A;  4XJH A;  1GWD A;  4H9B A;  4NGK A;  5F9X A;  1REX A;  3TXB A;  2NWD X;  1EQ5 A;  1FDL Y;  1LHM A;  4H94 A;  1GB8 A;  2ZNW Y;  1YAQ A;  1B0D A;  4TWS A;  1BB6 A;  1ZVY B;  3IWR A;  1LZD A;  4L41 A;  4WMG A;  4RLM A;  4PRQ A;  3W6B A;  4BS7 A;  2Y8P A;  1IOR A;  1JJ1 A;  4GCE A;  4BAP A;  3A3R X;  207L A;  4HJZ A;  5F16 A;  4ML7 A;  1CKF A;  1GF0 A;  1WQM A;  2EKS C;  5D5F A;  4BAF A;  1YL0 X;  3ZVQ A;  3AGH A;  3CSQ A;  1EQE A;  3TXD A;  4GN5 C;  4OOT A;  1T3P A;  3A91 A;  1B5Y A;  1P2C C;  2HEF A;  1C08 C;  1IX0 A;  3AW6 A;  1PZY A;  4OWA A;  4DD0 A;  1GEZ A;  2LYO A;  4UWV A;  3W6C A;  1OUA A;  1LSN A;  1DQJ C;  1HEM A;  1AZF A;  1VDS A;  3AZ5 A;  3CSR A;  4HPE A;  1F10 A;  4H8X A;  2ZNX Y;  1GAZ A;  1JUG A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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