1G7HC

Crystal structure of hen egg white lysozyme (hel) complexed with the mutant anti-hel monoclonal antibody d1.3(vlw92a)
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase inhibitor/hydrolase
source organism Mus musculus
publication title Estimation of the hydrophobic effect in an antigen-antibody protein-protein interface.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ANTI-HEN EGG WHITE LYSOZYME MONOCLONAL ANTIBODY D1.3
total genus 44
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1g7hC00
5LA5A 2A7FA 1C08C 1UIHA 3QNGA 1I1ZA 1GB7A 4DWXA 4LYBA 1IWTA 4PGJB 4R0FA 5HNLA 4QDNA 1UA6Y 2CGIA 4GN3A 1T3PA 3A95A 4NWEA 5D5CA 4P2EA 1B7MA 1FLWA 1NKHA 4N5RA 1C45A 3AGIA 4HTQA 5K7OA 1OUDA 3HBDA 4TX7A 1LYZA 2BPUA 4A7DA 2MECA 3AZ4A 4NHIA 1D6QA 1HENA 3P68A 1NBZC 1LZTA 1DI3A 1LHJA 2BQDA 1WTMA 4PHIA 2MEIA 5E9RA 2W1YA 4ZEEA 5KKJA 3M18B 5KXXA 1YQVY 5KXWA 5J7CA 1HNLA 1BB4A 1FDLY 1LCNA 5KXPA 5LVHA 4B49A 3ATOA 4ETCA 4QY9A 1XEKA 5C6LA 4NIJA 3ZVQA 1FKVA 1OUEA 2BQAA 3TXEA 2H9JA 1LMNA 1WTNA 1JJ1A 1LJKA 4WM6A 5IDDA 3LYTA 5LVKA 1B5ZA 3W6DA 1CJ9A 1LYYA 4TSCA 1REYA 4TWSA 4C5FA 1QUSA 1W08A 1IP1A 1G7MC 1D0KA 1LSEA 1GFUA 1OQMA 1GDXA 1Z55A 1H87A 5DL9A 5I54A 1VDQA 4H9BA 1JSEA 4N0JA 2FBDA 4H9FA 5IELA 4LGKA 5D5FA 3B0IA 1LZNA 1GF6A 1WQMA 2BQMA 2B5ZA 4GLVA 1EQ5A 1JEFA 1OUIA 1IP7A 1UACY 3HFMY 4KPMA 3ZVQB 1GBYA 1TBYA 1WQPA 2MEGA 1DQJC 2ZYCA 4CFPA 1IVMA 3RT5X 1LSZA 1TDYA 1YILA 3AGGG 1V7TA 4H8XA 3AW7A 1CKHA 2HU1A 5E4PA 1UIBA 2Z37A 4G49A 1MLCE 5KXSA 4D9ZA 3A6BY 5LA8A 4MR1A 1UIFA 2BQBA 4WM2A 153LA 2NWDX 3TMVA 1KXWA 1RJCB 2BQHA 3TXIA 4LT2A 4NGYA 1NMMA 1D6PA 4Z46A 1LZ4A 1LSPA 1ZVYB 1IWVA 2BQEA 4NHQA 4EOFA 4BAFA 1GFEA 1UIDA 3TMWA 5KXLA 1NDGC 1NBYC 1BVXA 1QDRA 1N4FA 2HEFA 4I0CA 4RW1A 1LJIA 4XJIA 1GB3A 5B05A 1H6MA 1IWZA 1LZYA 3CSRA 1LZCA 1LJFA 4N1CC 4G4HA 3RZ4A 4IJ4A 1TEWA 2BQJA 1XFPL 3CSZA 5LIOA 1INUA 3WXUA 5HMJA 3G3BB 3IWRA 1GFGA 1YKZX 1DPXA 3T6UA 1BWIA 5FHWA 1JUGA 2YBNA 1HFXA 1JWRA 1IC7Y 1D0MA 2C8PA 3EBAB 4LFXA 3E3DA 1J1XY 1GBXA 2FYCA 5ILCA 4XYYA 1GHLA 2CWIA 4LT0A 2XBSA 4WM1A 5APDA 2DKVA 3RW8A 1YIKA 1BB6A 3TXJA 4ETEA 1HEMA 5L3HA 1RI8B 1JTPL 2DQIY 2Z19A 1WQQA 2Z38A 4OWAA 1XGPC 1JKAA 2EIZC 1GXV2 3WW5A 4Z41A 1LZ9A 7LYZA 3A91A 4FDYA 194LA 1IWWA 1HSWA 1GXXA 5F14A 2F30A 1IP5A 4XJHA 1AZFA 1EQ4A 1OUBA 1LHKA 1DPWA 135LA 1LHHA 1LSMA 1LSGA 4HJVA 1DZBX 4MCKA 1JHLA 1NF5A 3BKHA 2BAAA 4MSTA 1G7LC 1GB2A 3VWOA 1D0LA 3CT5A 3P65A 1DKJA 4KL7A 1LHIA 132LA 2H9KA 4NSGA 5FEKA 1BWJA 5KXRA 4XJDA 1A2YC 3WL2A 4OW1A 1GBZA 4YEMA 2YBIA 4H92A 4H93A 4UWUA 5HNCA 1XEJA 1XSFA 2DQJY 1LOZA 1IP2A 5FCPA 4NG8A 2XBRA 4GN4A 1JTOL 5AMYA 4N8ZA 3FE0A 1B7LA 1LHMA 4HJZA 3W6EA 4NGJA 2YSSC 1B7QA 1HEWA 1RCMA 3B6LA 5C6JA 1GBWA 1JPOA 4ZFPA 1IX0A 3A3QA 1IR7A 1B7RA 1UC0A 1LMOA 3A92A 1LTMA 4OWBA 1UICA 3F6ZA 5I4XA 4XJFA 2BQNA 1DI4A 1ZMYL 4I8SA 1F6SA 2ZNWY 1YL0X 1EQEA 1JKDA 4HTKA 1HEOA 2D4IA 5KXOA 3WU7A 1YKXX 1BVKC 1BB3A 1OUJA 2MEFA 3P66A 5DN4A 5F81A 4XENA 3GXKA 3TXBA 9LYZA 4DT3A 1GPQC 1CNSA 5HMVA 1GB9A 1HF4A 1GBOA 5B1FA 1CKFA 1GFRA 1LSBA 2DQHY 1NHEA 1LMTA 1BQLY 1KIPC 4WM5A 1VATA 1ZVHL 1E8LA 3WPKA 2BLYA 2Y8PA 2EKSC 1HFYA 1LJHA 1IY4A 1WQRA 1GF8A 2MEDA 4OWCA 1DXJA 4RLNA 4NHPA 1JJ0A 4TTDA 3CB7A 5KJ9A 1VDTA 1GAZA 1QQYA 4WM4A 4DD7A 4NHTA 1FLYA 4DD9A 1JITA 1KIRC 3FI7A 2HTXA 1LMQA 5ILFA 4ETAA 5L9JA 1CKCA 1LKSA 5DLAA 4NGOA 1GE1A 3AJNA 4LZTA 1OUCA 5LYZA 1HMLA 2EPEA 3A3RX 5F9XA 1GB5A 4LT3A 1HHLA 1UIEA 2BQLA 4NSJA 4XN6A 4YF2A 1REMA 4CGEA 5I4WA 5B59A 3A67Y 1LZ1A 5F9UA 5FELA 5KXZA 3A94A 4HV2A 2BQKA 4WO9A 1ZV5L 4GCEA 1RFPA 2ZNXY 4N1EI 4W94A 5T3FA 133LA 2Z2FA 4LYMA 2ZIJA 1GFTA 1KXYA 4XJBA 3TMXA 2D91A 3CT0A 5II3A 4PPOA 3N9CA 3W3EA 3WVXA 3LZTA 1P2CC 4H94A 3P4ZA 2Q0MX 4WL7A 3WU8A 1XGQC 2AUBA 3AZ6A 2RSCA 4TSBA 4XADA 1IOSA 4LYZA 4J1AA 2WARA 4II8A 2CJLA 4NWHA 4CHXA 3D9AC 5APFA 2MEAA 4ET9A 1KIQC 1HC0A 1IO5A 1XEIA 4H91A 2DQAA 3WYHA 3LYOA 2N5ZA 1B5YA 3A34A 3J4GA 1IWYA 1LMAA 1DKKA 1TAYA 1GB6A 1SQ2L 2VB1A 3KAMA 2LYMA 3LZ2A 5LAFA 1VEDA 4B0DA 4DD2A 1GEVA 1LJJA 1GFAA 4H9EA 1GF3A 4GCBA 134LA 1GFHA 4C3WA 3WUAA 1GFKA 1HERA 1IP4A 1YL1X 5KXNA 1JTTL 3BKVA 2W1LA 1IOCA 1QTEA 1WVUA 2LZTA 2I25L 1F10A 4NGZA 4Z3MA 2DQGY 4TUNA 2YBLA 4HSFA 2ZQ4A 4EMNA 1WVVA 4NSHA 3K3TA 1VDSA 2LZ2A 3LYMA 4DC4A 1JKBA 5L3IA 3J6KA 1ALCA 1GF7A 1IWXA 4WLXA 4LFPA 5I53A 1LZBA 4NG1A 3W6AA 4WOAA 1IC5Y 1J1OY 1VFBC 3W6CA 3WVYA 4OOOA 4YEOA 1GF5A 3WUMA 2CDSA 1IOTA 5HLLA 2A7DA 1KXXA 4HP0A 3ZEKA 2G4PA 1PZYA 1EL1A 1JSFA 4RLMA 4M4OA 1JKCA 4YENA 3AW6A 5DM9A 4ET8A 1AKIA 1GDWA 1QIOA 3T36A 5LVJA 4PJ2C 5JENB 4ETDA 1GFJA 2D6BA 4UWNA 1B5UA 1WQNA 3WPLA 4B1AA 1I56A 1LYSA 1REZA 1GE2A 3IJVA 2XJWA 3QE8A 1GE4A 4NSIA 4WM3A 4H1PA 2Z2EA 3AYQA 1GD6A 2W1MA 1NQIA 3TXKA 1B7NA 5A3ZA 6LYTA 1UUZC 1FLUA 1LKRA 1QUTA 1IOQA 2Z39A 3IJUA 1LPIA 1HFZA 4UWVA 1CJ8A 1LMPA 2Z18A 1B5VA 2G4NA 4BAPA 3A96A 1IP3A 1B0DA 2F4AA 4HJYA 2LHMA 4GLAA 4NGKA 1VAUA 2HEDA 4NGIA 2F2NA 2ZQ3A 4WMGA 4ETBA 1WQOA 4ZIXA 2BQCA 2YVBA 3HBEX 4H90A 4L41A 4R6CA 1LZAA 1UCOA 1GE3A 1VDPA 4DDCA 3EXDA 207LA 1LZ5A 2ZWBA 3TXHA 3WMKA 3GXRA 1JJ3A 1REXA 1TCYA 1W6ZA 1QDTA 1BHZA 5LYMA 1C43A 1I20A 3TXDA 2IFFY 4G4BA 1IR9A 5I5QA 4WLTA 4CJ2A 1HELA 1D9UA 1UIAA 3A90A 1LSDA 4OWHA 2ZIKA 5LVGA 4GCDA 1LJ3A 4YOPA 4B4EA 4KT3A 5KXTA 1LSNA 1LJNA 1OUAA 2BQGA 4AGAA 1DI5A 4OWEA 5KXYA 3CSQA 4RDSA 1LSAA 3W6BA 2ZILA 4BADA 5M1YA 2LYZA 2LYOA 1G7IC 1HEPA 1OP9B 1BWHA 4NY5A 4B4IA 4H9AA 5LXWA 1LAAA 1B9OA 5B07A 4AXTA 4HPEA 2BLXA 2BQOA 2I6ZA 1GWDA 1LSFA 2YBMA 4RW2A 1GF0A 1CJ6A 1C7PA 5KXMA 4M6DA 1YAQA 5I4YA 4WG1A 2GV0A 1HEQA 1YAOA 3A6CY 4HV1A 1B7OA 4PRQA 1LZRA 2MEEA 1QSAA 1LSYA 1A4VA 3A93A 4QEQA 4WO6A 4NEBA 4W96A 5KKIA 5F16A 4FJRA 2FBBA 1BB7A 1CJ7A 2DQCY 4E3UA 5A3EA 1F0WA 4CFOA 3QY4A 5EBHA 3RU5A 5HQ1A 1OUHA 2HEAA 1IORA 3EO5A 4YM8A 1HMKA 1GFVA 3SP3A 3LHMA 5LAGA 2DBTA 1JISA 2HEBA 2YDGA 4PRUA 3CQLA 3WXTA 4G9SA 1F6RA 2H5ZA 2BQFA 4G4CA 4LT1A 4IASA 5FDJA 1V7SA 2I26L 1LZ6A 4OOTA 4GCCA 1CKDA 2C8OA 5KXKA 3G3AB 4WLYA 2HU3A 3D3DA 1LZEA 3AZ5A 4HTNA 5FSTA 4NGLA 1AT5A 1LZGA 4J7VA 3WPJA 1C10A 1FLQA 1YKYX 4WG7A 2YBJA 3B0KA 2F4GA 3AB6A 3WH1A 1LHLA 1QSWA 5KY1A 1IEEA 1B7SA 3ULRA 4H8YA 3W6FA 4DDBA 1OUFA 1G7JC 1XGUC 1QTKA 4LYTA 2XTHA 1NWGA 4ANRA 1HSXA 1CKGA 3WUNA 2W1XA 1GB8A 154LA 1MELL 4LYCA 4NFVA 1YROA 5LVIA 5IHGA 1JIYA 3OK0A 1GEZA 2Z12A 5C6IA 1IP6A 2D4KA 1AT6A 1B5WA 4J1BA 2YBHA 4IATA 3A8ZA 4U3XB 1FN5A 1G7HC 1AM7A 1YAMA 2D4JA 2MEBA 4QGZA 3WULA 2DQFC 1IWUA 4NGVA 1B7PA 3TXFA 5LINA 4ML7A 4GN5C 1LJEA 4NHSA 1GBSA 2PC2A 3AGHA 1GF4A 4DD3A 1LMCA 2HEEA 4J0LA 4DYGA 4KXIA 3TMUA 1LYOA 2IHLA 1YAPA 4DDAA 4H9HA 1RE2A 4DD1A 1O23A 5LYTA 1GF9A 6LYZA 2BQIA 1T6VL 4H9IA 1XGTC 3M3UA 1FBIX 1UIGA 2DQDY 1GAYA 1LSCA 3N9AA 4XJGA 1IC4Y 1GE0A 2X0AA 5APCA 3LYZA 5B06A 3N9EA 2HECA 4Z98A 4B4JA 4NGWA 2DQEY 1NDMC 4X3BA 1OUGA 3WW6A 5B1GA 4O34A 1FKQA 3AZ7A 3ATNA 3CT1A 8LYZA 4BS7A 1IIZA 1LZ8A 1IY3A 4LYOA 2ZYPA 3EMSA 3HBHA 2MEHA 1YANA 1XGRC 1LJ4A 2G4QA 1BB5A 1B2KA 5DN5A 2EQLA 4WL6A 3RNXA 1J1PY 3P64A 1SLYA 1UBZA 3B0OA 4DD0A 3MGWA 2FYDA 2HUBA 4H8ZA 3TXGA 1PS5A 1B5XA 3WU9A 3LN2A 1GB0A 3B72A 4GCFA 1C46A 4H9CA 1LZSA 1IR8A 4HPIA 1BGIA 4WLDA 5APEA 1LZDA 193LA 208LA 1LJGA 3OJPA 4N9RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5LA5A 1UIHA 2O7AA 3QNGA 4R0FA 2F2QA 5HNLA 1G0KA 246LA 3DKEX 4W54A 1NKHA 4TX7A 3HBDA 4A7DA 1G0GA 2MECA 243LA 1D6QA 1DI3A 2BQDA 5E9RA 2W1YA 4ZEEA 5KKJA 1LYHA 5KXXA 3ATOA 3SBAA 1QSQA 1XEKA 3C81A 4NIJA 1FKVA 3ZVQA 1OUEA 3HTFA 1JJ1A 1QUOA 4WM6A 3SB5A 231LA 1KY0A 1OV5A 1QUSA 1IP1A 3DMZA 1GFUA 1OQMA 4H9BA 1JSEA 4W56A 4LGKA 1CU6A 1EQ5A 1C6AA 1TBYA 1WQPA 1DQJC 4CFPA 3CDRA 1L53A 1L39A 3AW7A 1CKHA 2HU1A 1CVKA 4G49A 1KW7A 5LA8A 2NWDX 1C66A 1KXWA 260LA 4LT2A 1D6PA 2OTYX 2B73A 1LZ4A 1LSPA 1P64A 1IWVA 1ZVYB 2BQEA 4Z46A 4EOFA 4BAFA 3TMWA 3K2RA 1QDRA 1N4FA 4EKRA 2RBPA 1L31A 4G4HA 3CSZA 1P7SA 3IWRA 3T6UA 1GFGA 1JUGA 2YBNA 1D0MA 2C8PA 3EBAB 5ILCA 4ARQB 239LA 7LZMA 4S0WA 1P2LA 1RI8B 1JTPL 4OWAA 187LA 1JKAA 1GXV2 4FDYA 1C60A 1D3FA 5F14A 2F30A 1L72A 1T8AA 1AZFA 1LHKA 3VW7A 1LHHA 1G7LC 1C6EA 217LA 1LGXA 1C68A 1LHIA 2H9KA 5FEKA 5KXRA 262LA 4OW1A 1LLHA 1XEJA 1XSFA 1IP2A 2XBRA 4GN4A 1JTOL 5AMYA 4N8ZA 1B7LA 4HJZA 1RCMA 3B6LA 3V2YA 1IX0A 1LMOA 4OWBA 2BQNA 3HWLA 1YL0X 1EQEA 4I7PA 2D4IA 228LA 1BVKC 3P66A 2MEFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5LA5 A;  2A7F A;  1C08 C;  1UIH A;  3QNG A;  1I1Z A;  1GB7 A;  4DWX A;  4LYB A;  1IWT A;  4PGJ B;  4R0F A;  5HNL A;  4QDN A;  1UA6 Y;  2CGI A;  4GN3 A;  1T3P A;  3A95 A;  4NWE A;  5D5C A;  4P2E A;  1B7M A;  1FLW A;  1NKH A;  4N5R A;  1C45 A;  3AGI A;  4HTQ A;  5K7O A;  1OUD A;  3HBD A;  4TX7 A;  1LYZ A;  2BPU A;  4A7D A;  2MEC A;  3AZ4 A;  4NHI A;  1D6Q A;  1HEN A;  3P68 A;  1NBZ C;  1LZT A;  1DI3 A;  1LHJ A;  2BQD A;  1WTM A;  4PHI A;  2MEI A;  5E9R A;  2W1Y A;  4ZEE A;  5KKJ A;  3M18 B;  5KXX A;  1YQV Y;  5KXW A;  5J7C A;  1HNL A;  1BB4 A;  1FDL Y;  1LCN A;  5KXP A;  5LVH A;  4B49 A;  3ATO A;  4ETC A;  4QY9 A;  1XEK A;  5C6L A;  4NIJ A;  3ZVQ A;  1FKV A;  1OUE A;  2BQA A;  3TXE A;  2H9J A;  1LMN A;  1WTN A;  1JJ1 A;  1LJK A;  4WM6 A;  5IDD A;  3LYT A;  5LVK A;  1B5Z A;  3W6D A;  1CJ9 A;  1LYY A;  4TSC A;  1REY A;  4TWS A;  4C5F A;  1QUS A;  1W08 A;  1IP1 A;  1G7M C;  1D0K A;  1LSE A;  1GFU A;  1OQM A;  1GDX A;  1Z55 A;  1H87 A;  5DL9 A;  5I54 A;  1VDQ A;  4H9B A;  1JSE A;  4N0J A;  2FBD A; 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 1GB8 A;  154L A;  1MEL L;  4LYC A;  4NFV A;  1YRO A;  5LVI A;  5IHG A;  1JIY A;  3OK0 A;  1GEZ A;  2Z12 A;  5C6I A;  1IP6 A;  2D4K A;  1AT6 A;  1B5W A;  4J1B A;  2YBH A;  4IAT A;  3A8Z A;  4U3X B;  1FN5 A;  1G7H C;  1AM7 A;  1YAM A;  2D4J A;  2MEB A;  4QGZ A;  3WUL A;  2DQF C;  1IWU A;  4NGV A;  1B7P A;  3TXF A;  5LIN A;  4ML7 A;  4GN5 C;  1LJE A;  4NHS A;  1GBS A;  2PC2 A;  3AGH A;  1GF4 A;  4DD3 A;  1LMC A;  2HEE A;  4J0L A;  4DYG A;  4KXI A;  3TMU A;  1LYO A;  2IHL A;  1YAP A;  4DDA A;  4H9H A;  1RE2 A;  4DD1 A;  1O23 A;  5LYT A;  1GF9 A;  6LYZ A;  2BQI A;  1T6V L;  4H9I A;  1XGT C;  3M3U A;  1FBI X;  1UIG A;  2DQD Y;  1GAY A;  1LSC A;  3N9A A;  4XJG A;  1IC4 Y;  1GE0 A;  2X0A A;  5APC A;  3LYZ A;  5B06 A;  3N9E A;  2HEC A;  4Z98 A;  4B4J A;  4NGW A;  2DQE Y;  1NDM C;  4X3B A;  1OUG A;  3WW6 A;  5B1G A;  4O34 A;  1FKQ A;  3AZ7 A;  3ATN A;  3CT1 A;  8LYZ A;  4BS7 A;  1IIZ A;  1LZ8 A;  1IY3 A;  4LYO A;  2ZYP A;  3EMS A;  3HBH A;  2MEH A;  1YAN A;  1XGR C;  1LJ4 A;  2G4Q A;  1BB5 A;  1B2K A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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