1GE0A

Crystal structure of mutant human lysozyme substituted at left-handed helical positions
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGGNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Role of non-glycine residues in left-handed helical conformation for the conformational stability of human lysozyme
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME C
total genus 53
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ge0A00
5E4PA 2DQCY 1LZ1A 5APFA 4KXIA 1LMPA 2BLYA 4CGEA 4TSBA 1LYZA 2HEFA 4GLVA 1REZA 3KAMA 4H8ZA 2LZ2A 4NSIA 3WXTA 1GB0A 1KXWA 1TDYA 4BS7A 4B49A 4LYZA 2BQCA 1IP6A 1GF4A 1W6ZA 1IWTA 3B0OA 4Z46A 4H9AA 3SP3A 1YAOA 1GB7A 1BHZA 4TX7A 1LJFA 1IP2A 1SQ2L 5DLAA 5I5QA 3ZVQB 1IWZA 1NQIA 4DD2A 2CDSA 2DQEY 4IJ4A 5LYZA 1REXA 4J1BA 1LZCA 1JJ3A 4WM5A 2F4GA 4HV2A 1GF6A 5FEKA 4UWUA 3CT5A 4B4EA 4GN5C 2MEIA 5LXWA 1IOQA 1LZYA 5HNCA 1UUZC 1PS5A 4TWSA 2HEAA 1LZTA 1LYSA 2ZIKA 4W94A 5LA5A 5LINA 1B5VA 1KXYA 2D4JA 2DKVA 4B4IA 1HEOA 1BB3A 2HEBA 3TMUA 4YOPA 1LPIA 5HQ1A 3WVXA 1UA6Y 4BAPA 1IC4Y 4RW1A 4CHXA 3FE0A 1IORA 3QY4A 2XBRA 4B4JA 5KKJA 4XJGA 1GPQC 3B72A 1GE2A 4HPIA 4GCBA 5FDJA 4P2EA 5KXPA 1IIZA 1GF7A 1GE1A 3TXHA 6LYZA 4HJZA 4DC4A 1GFTA 4UWNA 5APEA 1RI8B 3RU5A 5FSTA 3J6KA 1KIRC 1IR8A 1FLQA 1LKRA 1AKIA 1OUAA 4DD7A 4WMGA 1LJHA 4XN6A 1UC0A 1UCOA 4LGKA 4UWVA 3TXBA 2ZQ3A 5KKIA 1GFVA 2FYDA 4H91A 4CFPA 5KXRA 1GE0A 4NGWA 1GE3A 1WQOA 2YBMA 4H9HA 1FDLY 1D0MA 3AW7A 2FBDA 4NGIA 4OW1A 5K7OA 3A93A 4NG1A 1JKCA 1AZFA 4LT0A 4XJBA 1LHHA 1DZBX 4PJ2C 2Y8PA 2W1LA 1LSZA 9LYZA 1IOCA 1UIDA 4H1PA 193LA 1D0LA 4XYYA 1UIBA 3G3AB 5LAFA 3A8ZA 1ZVHL 4N5RA 1CKHA 4H9EA 1LSYA 1LHIA 5IHGA 1F10A 1LCNA 2C8OA 4NGJA 3CT1A 3D9AC 5KXWA 3MGWA 1IP1A 1BWHA 1F6RA 1TCYA 1B5UA 1JKAA 3LYTA 4QY9A 1UIHA 1QDTA 1ZMYL 1LJ3A 4DDBA 1N4FA 1INUA 4H93A 5APDA 4DD9A 2B5ZA 2BQEA 2F30A 3TXJA 4R0FA 4YM8A 4XENA 3A3RX 3IJVA 1BVKC 1AT6A 1IP3A 2BQAA 3AGHA 1LKSA 1V7TA 3ZEKA 1JISA 1B7MA 4H94A 1VAUA 1WQNA 2X0AA 1JITA 1B9OA 4ETEA 4LYCA 1G7IC 1KIQC 2BQJA 3B0IA 1TBYA 3CT0A 4H9BA 3A95A 1IP5A 2MEHA 1UACY 5KXSA 4LZTA 4NWHA 1NBZC 3AJNA 1IWUA 4NGYA 3WPJA 2DQHY 5HNLA 1KXXA 1DQJC 3WUNA 2YSSC 1YL0X 2DQFC 1RE2A 2IFFY 1B5YA 2DQGY 1LMQA 1QDRA 4NSHA 3D3DA 1I56A 5EBHA 1I20A 2FBBA 5LYMA 4II8A 4QGZA 4H9CA 1LZSA 1QUTA 1DPXA 2Z2FA 4X3BA 3W6CA 1FKQA 1OUCA 1WQRA 5KXZA 3E3DA 1VFBC 1JIYA 1YAQA 1SLYA 3RT5X 4MR1A 1CKDA 5E9RA 3A91A 1GHLA 1QTKA 1GBZA 1DKJA 1BB4A 2G4PA 1NF5A 1UBZA 4GLAA 1IVMA 1HFXA 1GXV2 1JTOL 2CWIA 4KT3A 1W08A 1OUEA 4FJRA 1KIPC 1LZBA 2RSCA 3BKHA 3AYQA 1VDTA 2BQLA 1DI4A 4LYOA 1JUGA 2YVBA 4QEQA 5J7CA 4L41A 5KJ9A 5M1YA 2Z18A 2G4NA 1IWYA 2MEBA 4W96A 1LMCA 1VATA 5L3HA 1GB2A 3G3BB 4NGVA 4NWEA 1C46A 1FBIX 1P2CC 1HHLA 2BQBA 1DXJA 1B7NA 4LT2A 4RLMA 4WM3A 4OOOA 3EXDA 1B7SA 1HFZA 4D9ZA 1HEMA 5LVHA 1LZEA 2D91A 2W1XA 1GDXA 1LZ5A 4R6CA 1A2YC 3P64A 1IR9A 2F4AA 2LHMA 4HJYA 4GCEA 4NHQA 1J1OY 4GN4A 4HSFA 4NIJA 5LVKA 3T36A 3TXGA 4C3WA 4EMNA 2MEDA 1DPWA 1VDSA 4ETBA 1LHJA 2AUBA 4WLTA 1GFRA 1HMKA 4H8YA 2BLXA 4WO9A 2BQGA 3WU7A 1IWXA 1EQ5A 3WU9A 4LYBA 4GCDA 1AM7A 1FKVA 1HENA 1RJCB 4YEOA 154LA 1GBSA 5LVGA 4OWBA 3WW6A 1B7PA 4DYGA 4KL7A 1J1PY 5HLLA 1LZ9A 2N5ZA 1QQYA 1JJ0A 4J7VA 4OWEA 5I4WA 1VEDA 1NKHA 4I8SA 5KXKA 1JJ1A 4ZFPA 1OP9B 3AZ5A 4GCFA 4G9SA 3HBEX 4J1AA 4OWCA 4WM6A 4XJDA 3AW6A 5C6LA 4WOAA 5F14A 3CQLA 3WW5A 3LZ2A 1LSMA 2EPEA 1HC0A 2Z38A 1LMTA 4NHSA 1H87A 1HSWA 2XBSA 1XEIA 1UICA 1EL1A 1G7LC 2MEAA 5B1FA 4Z41A 1HSXA 1BVXA 1XGPC 4H92A 3CSRA 2YBIA 4XJIA 2ZILA 4EOFA 4WLYA 3WUAA 1HERA 2DQJY 1D6PA 1G7HC 1A4VA 2BAAA 2Z2EA 4RDSA 3W6BA 3AZ7A 1LJ4A 3LZTA 4ANRA 4BADA 1CJ7A 4N0JA 4A7DA 4C5FA 1GBWA 3WU8A 4NGZA 1LZ6A 4H9FA 2ZNWY 4HTNA 1HEQA 5B05A 5F16A 1NHEA 4N1EI 1LJEA 3FI7A 1JKDA 1FLUA 4H9IA 4HTKA 4NHTA 1IP7A 1F0WA 133LA 5C6IA 1LJNA 4OOTA 2H5ZA 1HF4A 2EIZC 2Z39A 3CB7A 3J4GA 4PHIA 4YENA 2F2NA 1GFUA 4OWHA 5I53A 6LYTA 1HELA 2ZYPA 3A96A 1J1XY 4AGAA 2HU3A 1D6QA 5B07A 1JHLA 1GAZA 2XTHA 7LYZA 1GB3A 2IHLA 2D4KA 3M3UA 2LYOA 1LSPA 1LSBA 5LVIA 4CJ2A 1D0KA 2MECA 3QNGA 5LA8A 2ZWBA 1GXXA 1JTTL 1XEKA 1IWWA 3AZ4A 3LN2A 3EO5A 1YANA 2LZTA 4DDAA 4PPOA 1NWGA 1GB8A 1LAAA 4IASA 5A3EA 1YKYX 1HNLA 194LA 1IC7Y 1LJIA 1GDWA 3ATNA 4NHIA 2YBHA 1FLYA 5D5CA 3T6UA 1LJJA 3BKVA 1OUJA 3N9CA 4HP0A 4WLDA 4NG8A 4RLNA 1GBOA 1QSAA 1IOSA 2I25L 3VWOA 2I6ZA 5KXMA 4NHPA 1B5XA 1OUIA 1CKFA 1V7SA 2ZIJA 3P68A 4I0CA 4TSCA 3CSZA 3LYMA 3P65A 5FHWA 5B1GA 1NMMA 1XSFA 5KXTA 3HBHA 4NGKA 1IOTA 2CGIA 2ZYCA 5DL9A 3LHMA 1GB9A 3A6BY 4GCCA 1JKBA 4NSJA 3ZVQA 5KXXA 1G7JC 5KXNA 207LA 3OJPA 4XJFA 2XJWA 5F9UA 5A3ZA 1GF3A 1UIAA 1WTMA 2HUBA 5KXYA 1H6MA 2DQAA 5DM9A 4DD1A 2DQIY 1LYYA 1AT5A 2BQNA 2D4IA 3TXKA 2EQLA 1IR7A 1QUSA 1B7QA 1XGTC 3A67Y 1JPOA 1LZAA 1MLCE 4PGJB 5LVJA 4WO6A 1LMOA 3WVYA 3A3QA 1LMAA 1LHLA 2BPUA 5B06A 3WPLA 3A92A 3WH1A 2YDGA 1Z55A 4OWAA 1LSDA 4FDYA 3WULA 1WVUA 1IO5A 4NY5A 1LZGA 3W6DA 4TUNA 3WUMA 1BB6A 1RFPA 1ZV5L 3AGIA 1GFAA 1XEJA 5F9XA 4XJHA 1WTNA 3B6LA 1LZ4A 1HEPA 2MEEA 2LYMA 1LZNA 2WARA 3P66A 1TEWA 5F81A 1JSFA 1OUBA 3TXIA 1GFKA 1QIOA 3WXUA 1DI5A 4ETDA 4HJVA 1T3PA 4BAFA 1LJKA 2ZQ4A 3AGGG 3TMVA 4DD3A 5L9JA 1YAMA 1IP4A 4G49A 5APCA 1GEZA 1XGRC 5IELA 1EQ4A 3N9AA 2HEDA 2BQOA 2BQDA 3A6CY 4J0LA 2HU1A 2Q0MX 4GN3A 3F6ZA 1JSEA 1LZ8A 1WVVA 5DN5A 4LT3A 1BWIA 1C43A 2VB1A 3CSQA 1HFYA 1OQMA 1EQEA 1LSEA 4M4OA 1XGUC 208LA 4G4HA 5DN4A 1YL1X 1GE4A 2CJLA 3TXFA 2GV0A 4DD0A 1D9UA 1C45A 1GB5A 1WQMA 1BB7A 1NBYC 3W6FA 5D5FA 2HECA 4NGLA 3B0KA 1WQPA 1XFPL 4NSGA 4WM2A 3WL2A 1F6SA 3HBDA 1GF5A 2PC2A 1O23A 1RCMA 4CFOA 3IJUA 1GFJA 5L3IA 1GFEA 4WLXA 4LFXA 5HMVA 2YBLA 2LYZA 2W1MA 5ILCA 1LSCA 2BQKA 2NWDX 4G4CA 1B7OA 1LZRA 2C8PA 5C6JA 4H8XA 1PZYA 4IATA 4MCKA 2MEFA 3EBAB 4WG7A 2MEGA 4ZIXA 1GFGA 1LSNA 4ETAA 4LYMA 3K3TA 1GWDA 2EKSC 4H90A 2ZNXY 1REYA 1JTPL 1WQQA 3M18B 2BQHA 4HTQA 1JEFA 1CKCA 5LIOA 1YIKA 3TMWA 4XADA 4DDCA 2G4QA 1GB6A 2BQFA 1YILA 3QE8A 2YBJA 4WM4A 1LHMA 8LYZA 1LSGA 1QSWA 1B5ZA 1CKGA 4DT3A 4ETCA 4YEMA 4G4BA 1GF9A 1C7PA 1NDMC 3TXDA 4NEBA 4NGOA 4PRQA 1FN5A 3WPKA 1OUHA 3GXRA 2HEEA 3WMKA 4ZEEA 4LT1A 3AB6A 1GF8A 1LMNA 5I4YA 3ULRA 1CJ6A 1VDPA 1LZDA 1B5WA 1LOZA 1C08C 3N9EA 3P4ZA 1VDQA 3A94A 1REMA 3W6EA 1YQVY 4AXTA 132LA 5I54A 2A7DA 4Z3MA 1GEVA 1JWRA 4ML7A 1IC5Y 4RW2A 1LJGA 2DBTA 3A34A 1LHKA 1CJ9A 4Z98A 4E3UA 1GD6A 5KXLA 1IWVA 1G7MC 1IY4A 1OUFA 3W3EA 2HTXA 3IWRA 3AZ6A 2A7FA 5IDDA 1B7LA 1IY3A 3LYOA 2DQDY 4M6DA 1LSAA 1B0DA 1BB5A 4HV1A 4DWXA 1GF0A 1UIGA 1LYOA 5FCPA 1DI3A 4ET9A 5T3FA 1OUGA 3ATOA 1YROA 3GXKA 1FLWA 1BQLY 1E8LA 5I4XA 1NDGC 1YKZX 2Z12A 4MSTA 4WL7A 3RNXA 2YBNA 5LYTA 1DKKA 3WYHA 1GBYA 153LA 1T6VL 4KPMA 2H9KA 5ILFA 2BQIA 5AMYA 1BGIA 1LSFA 4N9RA 1CJ8A 3W6AA 4N1CC 4B1AA 1GFHA 5JENB 1YAPA 1GAYA 2W1YA 1IEEA 2Z19A 5KY1A 5II3A 5HMJA 1GBXA 1HEWA 3A90A 1B2KA 4LFPA 134LA 4N8ZA 4TTDA 1HMLA 1UIEA 5KXOA 1OUDA 4HPEA 4B0DA 1YKXX 3HFMY 4NFVA 1IX0A 3TXEA 1C10A 5FELA 2BQMA 1CNSA 4O34A 2I26L 5LAGA 3RZ4A 1MELL 1XGQC 2H9JA 4PRUA 2Z37A 135LA 1ZVYB 2D6BA 4ET8A 1UIFA 1B7RA 1ALCA 4WG1A 4YF2A 4WL6A 4WM1A 1TAYA 1LTMA 4QDNA 3RW8A 3TMXA 4U3XB 4LYTA 5B59A 1I1ZA 1QTEA 3OK0A 3EMSA 2FYCA 3LYZA 1BWJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YXAC 1LMPA 3HT9A 4GLVA 3KAMA 4H8ZA 2LZ2A 1KXWA 1TDYA 1XJUA 3HT6A 4B49A 1C6CA 1W6ZA 184LA 1L80A 1GB7A 4TX7A 5DLAA 1SQ2L 4DJHA 3ZVQB 4I7JA 2CDSA 5LYZA 232LA 1LGWA 4WM5A 130LA 2LC9A 4HV2A 4B4EA 1LYFA 1L60A 4GN5C 2MEIA 258LA 2DKVA 1KXYA 1HEOA 2HEBA 3WVXA 1C67A 1IC4Y 1L35A 4B4JA 4XJGA 2Q9DA 5FDJA 2QB0B 1CTWA 1WTHA 1L21A 4DC4A 1L42A 1CX7A 1RI8B 192LA 3J6KA 4WMGA 1UCOA 181LA 5KXRA 4NGWA 1P6YA 2YBMA 4H9HA 1LWGA 2FBDA 5K7OA 4NG1A 1LHHA 4PJ2C 5LAFA 3G3AB 1ZVHL 1L48A 1TCYA 3LYTA 1CUQA 4DDBA 3DN1A 3D4SA 2B5ZA 2BQEA 3TXJA 1L25A 3IJVA 2BQAA 3ZEKA 3PBLA 1VAUA 4ETEA 1L44A 1B9OA 4IAPA 107LA 1L13A 1G0LA 2BQJA 1L0KA 3A95A 5KXSA 4LDLA 1L65A 1KXXA 1DQJC 1C6HA 1KW5A 1L59A 3WUNA 1YL0X 206LA 1LMQA 1QDRA 196LA 1L29A 2FBBA 4QGZA 4H9CA 172LA 1OYUA 229LA 1FKQA 1P46A 1SLYA 4ARQA 4MR1A 205LA 5E9RA 2HUKA 1DKJA 4GLAA 2CWIA 2HUMA 1W08A 1KIPC 2O7AA 2YVBA 5M1YA 2RAYX 3SB8A 4ZPUA 170LA 1GB2A 3G3BB 1HHLA 4LT2A 4WM3A 1JQUA 3EXDA 1B7SA 1HEMA 212LA 186LA 1L72A 1T8GA 2RBSA 2F4AA 1L37A 4GN4A 4HSFA 3T36A 1D3FA 1HMKA 2BQGA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5E4P A;  2DQC Y;  1LZ1 A;  5APF A;  4KXI A;  1LMP A;  2BLY A;  4CGE A;  4TSB A;  1LYZ A;  2HEF A;  4GLV A;  1REZ A;  3KAM A;  4H8Z A;  2LZ2 A;  4NSI A;  3WXT A;  1GB0 A;  1KXW A;  1TDY A;  4BS7 A;  4B49 A;  4LYZ A;  2BQC A;  1IP6 A;  1GF4 A;  1W6Z A;  1IWT A;  3B0O A;  4Z46 A;  4H9A A;  3SP3 A;  1YAO A;  1GB7 A;  1BHZ A;  4TX7 A;  1LJF A;  1IP2 A;  1SQ2 L;  5DLA A;  5I5Q A;  3ZVQ B;  1IWZ A;  1NQI A;  4DD2 A;  2CDS A;  2DQE Y;  4IJ4 A;  5LYZ A;  1REX A;  4J1B A;  1LZC A;  1JJ3 A;  4WM5 A;  2F4G A;  4HV2 A;  1GF6 A;  5FEK A;  4UWU A;  3CT5 A;  4B4E A;  4GN5 C;  2MEI A;  5LXW A;  1IOQ A;  1LZY A;  5HNC A;  1UUZ C;  1PS5 A;  4TWS A;  2HEA A;  1LZT A;  1LYS A;  2ZIK A;  4W94 A;  5LA5 A;  5LIN A;  1B5V A;  1KXY A;  2D4J A;  2DKV A;  4B4I A;  1HEO A;  1BB3 A;  2HEB A;  3TMU A;  4YOP A;  1LPI A;  5HQ1 A;  3WVX A;  1UA6 Y;  4BAP A;  1IC4 Y;  4RW1 A;  4CHX A;  3FE0 A;  1IOR A;  3QY4 A;  2XBR A;  4B4J A;  5KKJ A;  4XJG A;  1GPQ C;  3B72 A;  1GE2 A;  4HPI A;  4GCB A;  5FDJ A;  4P2E A;  5KXP A;  1IIZ A; 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 1YQV Y;  4AXT A;  132L A;  5I54 A;  2A7D A;  4Z3M A;  1GEV A;  1JWR A;  4ML7 A;  1IC5 Y;  4RW2 A;  1LJG A;  2DBT A;  3A34 A;  1LHK A;  1CJ9 A;  4Z98 A;  4E3U A;  1GD6 A;  5KXL A;  1IWV A;  1G7M C;  1IY4 A;  1OUF A;  3W3E A;  2HTX A;  3IWR A;  3AZ6 A;  2A7F A;  5IDD A;  1B7L A;  1IY3 A;  3LYO A;  2DQD Y;  4M6D A;  1LSA A;  1B0D A;  1BB5 A;  4HV1 A;  4DWX A;  1GF0 A;  1UIG A;  1LYO A;  5FCP A;  1DI3 A;  4ET9 A;  5T3F A;  1OUG A;  3ATO A;  1YRO A;  3GXK A;  1FLW A;  1BQL Y;  1E8L A;  5I4X A;  1NDG C;  1YKZ X;  2Z12 A;  4MST A;  4WL7 A;  3RNX A;  2YBN A;  5LYT A;  1DKK A;  3WYH A;  1GBY A;  153L A;  1T6V L;  4KPM A;  2H9K A;  5ILF A;  2BQI A;  5AMY A;  1BGI A;  1LSF A;  4N9R A;  1CJ8 A;  3W6A A;  4N1C C;  4B1A A;  1GFH A;  5JEN B;  1YAP A;  1GAY A;  2W1Y A;  1IEE A;  2Z19 A;  5KY1 A;  5II3 A;  5HMJ A;  1GBX A;  1HEW A;  3A90 A;  1B2K A;  4LFP A;  134L A;  4N8Z A;  4TTD A;  1HML A;  1UIE A;  5KXO A;  1OUD A;  4HPE A;  4B0D A;  1YKX X;  3HFM Y;  4NFV A;  1IX0 A;  3TXE A;  1C10 A;  5FEL A;  2BQM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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