1SX7A

Use of an ion-binding site to bypass the 1000-atom limit to ab initio structure determination by direct methods
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVAAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRECALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Use of an ion-binding site to bypass the 1000-atom limit to structure determination by direct methods.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2004-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1sx7A00
1XEPA 4LZMA 150LA 223LA 3OE0A 4I7NA 161LA 1QT4A 174LA 1L06A 1L46A 3SBAA 1QUHA 2B75A 1L38A 1PQDA 2RH1A 144LA 3OE6A 2OTZX 4I7JA 2Q9DA 3PBLA 1L41A 118LA 215LA 3HU8A 1LYEA 125LA 1C68A 1C6EA 4EKPA 3C8SA 3DN2A 1DYBA 1C64A 1L24A 181LA 3HTFA 109LA 1LI2A 3HH5A 1P2RA 126LA 4W56A 4GBRB 4EPFA 1CUPA 1L50A 2RBSA 2RBPA 139LA 178LA 186LA 4I7OA 1LYDA 1LYHA 1T8GA 1L97A 6LZMA 1LYIA 1PQJA 1L31A 2OE7X 3DNAA 1LYGA 184LA 1C6QA 216LA 1L45A 1LGUA 2OE9X 1L64A 1L53A 5I14A 1ZWNA 165LA 249LA 3K2RA 3HH6A 1L0KA 1L72A 260LA 1P56A 1G0GA 1L12A 1L90A 2OU9A 1L23A 4W57A 1L02A 1L11A 1L71A 3HT7A 248LA 3OE9A 141LA 3C7ZA 1L21A 1PQIA 1L69A 3DN6A 2F32A 1OWZA 219LA 3GUMA 2ANVA 3SB9A 3GUPA 1L98A 1G1VA 1L65A 111LA 3NY9A 240LA 1L68A 114LA 225LA 3SB6A 1L89A 2OU8A 4IAPA 4I7RA 3C81A 1L35A 1TLAA 1L44A 229LA 1L61A 4AQNA 3HTBA 1LI3A 242LA 1L34A 1KW7A 235LA 2B74A 3HTDA 4W59A 1C60A 199LA 259LA 256LA 2RB0X 1L91A 140LA 2ANXA 4GRVA 228LA 2RBNA 1L0JA 255LA 1L66A 212LA 4ARMB 149LA 195LA 1L93A 104LA 107LA 3LZMA 1JTMA 1QUOA 145LA 156LA 2RAYX 198LA 1LGXA 1L25A 3V2WA 1QUDA 1L56A 1SSWA 152LA 4YXAC 113LA 3DMXA 3HUAA 251LA 159LA 196LA 163LA 1G0MA 1L75A 1L19A 1C62A 1KY0A 3DN3A 3GUIA 1L36A 2O4WA 2HUKA 1D2WA 232LA 1SX2A 231LA 4PK0A 4ARQA 157LA 7LZMA 2B73A 1L94A 224LA 252LA 246LA 1L16A 3UONA 1T6HA 1CU3A 1SSYA 1CV5A 3HWLA 1JTNA 1KW5A 1C6DA 2L78A 3NY8A 3SB8A 1C6JA 1OVJA 3CDTA 4EKSA 1L73A 1QT8A 1L96A 1L48A 143LA 1L60A 3G3VA 1L05A 1CU5A 151LA 1L49A 1P46A 222LA 1OVKA 3QAKA 3HUQA 1G0LA 1C61A 3C80A 3F9LA 128LA 1L26A 4PJZA 1L43A 1PQMA 1QTZA 1G0JA 1L29A 131LA 1OVHA 200LA 1G1WA 1L04A 2RBOA 2RB1X 1L87A 1L47A 1XJUA 197LA 2IGCA 191LA 162LA 1L33A 4W52A 158LA 1JQUA 1QTVA 1CV6A 1G0KA 1P7SA 148LE 1QUGA 1LWGA 1C66A 1B6IA 1QT3A 4K5YA 1QS5A 1LYJA 1D3JA 214LA 233LA 3GUOA 1C63A 3HDFA 1L20A 210LA 1C6HA 1LYFA 160LA 1L52A 1DYGA 3CDVA 206LA 4S0WA 1L70A 3HTGA 3V2YA 190LA 2Q9EA 4ARJA 1CU6A 110LA 2B72A 3C83A 1G0QA 1L32A 2QB0B 4W54A 4W51A 1CV0A 4I7SA 1D9WA 3G3XA 4OO9A 3FI5A 142LA 2OEAX 129LA 4DKLA 1KY1A 1P3NA 1L62A 1C6AA 1G06A 3L2XA 1CV4A 4YXCA 1DYEA 234LA 123LA 226LA 4ZPUA 1QTHA 3HT9A 1L13A 4W55A 103LA 2NTGA 187LA 4W58A 2B6YA 254LA 262LA 2B6XA 189LA 1L03A 164LA 1DYDA 3OE8A 4LDEA 2OTYX 4I7QA 3CDQA 1L76A 3DN4A 1LGWA 1CU2A 1DYAA 1DYCA 2O79A 1T8FA 4LDLA 1L17A 1L74A 1D3NA 1EPYA 1L14A 3HT8A 217LA 4I7TA 167LA 211LA 5LZMA 258LA 3F8VA 1SX7A 1L95A 1C69A 1CU0A 1C6BA 1L67A 4ARPA 1C6IA 168LA 1L99A 170LA 1QTCA 261LA 4ARMA 1C6LA 3JR6A 122LA 1LLHA 1QTBA 205LA 180LA 1CX7A 1L79A 245LA 1L15A 3DMZA 1ZURA 3FA0A 2B6WA 1P6YA 1LPYA 4ARLA 4W53A 1L27A 1L01A 220LA 244LA 3PDSA 172LA 1L54A 3ODUA 1C6KA 1G07A 1L08A 1L00A 3HU9A 3RZEA 1DYFA 1C6MA 1C6TA 1WTHA 177LA 2RAZX 3HT6A 1KNIA 4DAJA 130LA 4EXMA 1L55A 239LA 112LA 3G3WA 1C65A 3C7WA 2NTHA 213LA 2O7AA 241LA 1PQOA 146LA 4EJ4A 1OWYA 1CV3A 155LA 1KS3A 3GUJA 2CUUA 1PQKA 1QS9A 3CDOA 2F47A 3C8QA 253LA 2RBQA 4I7PA 1D2YA 138LA 1L86A 169LA 1OYUA 1L42A 173LA 2B6TA 127LA 3DN1A 2HUMA 1D3MA 1L39A 4DJHA 176LA 1CV1A 236LA 1QT6A 1CX6A 185LA 119LA 2RBRA 1T8AA 1L88A 1T97A 2LC9A 1L09A 171LA 1LI6A 4E97A 3DMVA 1P5CA 4LDOA 1L82A 1L58A 1L83A 4EKQA 1P36A 201LA 1L30A 1QSQA 1LW9A 3EMLA 3HH4A 1L40A 1ZYTA 2LZMA 3C8RA 1C67A 1L59A 102LA 137LA 4I7LA 1L81A 4YX7C 250LA 1LWKA 243LA 3SBBC 166LA 3D4SA 3DKEX 4EPIA 3HDEA 3FADA 4I7KA 183LA 1QT5A 3VW7A 2Z6BA 1K28A 1QTDA 2RB2X 1SWZA 1OV5A 221LA 1QT7A 1CVKA 1L80A 3L64A 120LA 2A4TA 227LA 257LA 2B7XA 237LA 3CDRA 1L22A 2HULA 1L84A 1CUQA 3C82A 247LA 3GULA 1L57A 1P64A 1L92A 3C7YA 1G0PA 1OV7A 1C6NA 1L63A 115LA 209LA 108LA 218LA 3HUKA 1L37A 147LA 1I6SA 3SN6R 1P37A 2B70A 230LA 2F2QA 1C6PA 1C6FA 1L85A 1L77A 192LA 175LA 1L51A 4ARQB 1CTWA 238LA 4EKRA 1L18A 1NHBA 4I7MA 182LA 1L28A 3DN8A 3RUNA 1L07A 2LCBA 1L10A 1QSBA 1XJTA 3HH3A 1SWYA 3SB5A 2B6ZA 1D3FA 2OE4X 3SB7A 3DN0A 188LA 1C6GA 1C6CA 3GUKA 1P2LA 3GUNA 2OU0X 3NYAA 2QARC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H1PA 5IELA 1LJ3A 3OE0A 3ZVQB 161LA 3N9CA 174LA 1GBXA 4WOAA 3SBAA 5D5FA 2B75A 3OE6A 1GFHA 3MGWA 1JTTL 4I7JA 1CKCA 1LSAA 1LZDA 3PBLA 4LYMA 4BS7A 4WM2A 1B7MA 4GCDA 1LZCA 109LA 1LI2A 1P2RA 5LVGA 4DQ7A 4GBRB 2HEBA 2A7DA 4B0DA 2XBSA 1EQ5A 139LA 178LA 3E3DA 1LYHA 1L97A 1QTKA 2OE7X 4TSCA 2A7FA 184LA 216LA 1L45A 1L64A 1L53A 4J7VA 1XFPL 2MEBA 4H8ZA 1L0KA 1IWVA 1QUSA 1BVKC 4W57A 1IY4A 3HT7A 248LA 4NWHA 1L21A 4QY9A 1OWZA 1XGRC 1LMAA 2MEEA 1HF4A 3A3RX 3GUPA 2YBIA 1L65A 240LA 3SB6A 225LA 5HMVA 1L89A 2OU8A 1L35A 1TLAA 4GN4A 3WXTA 1D6PA 1L61A 5LYZA 4I0CA 1GFRA 2X0AA 2BQKA 1UC0A 1IWXA 4GCBA 235LA 3HTDA 3A93A 2MEGA 2ZYCA 1L91A 1GD6A 4GRVA 5LA8A 228LA 1L0JA 2FBBA 1CJ8A 133LA 1JIYA 212LA 4ARMB 1L93A 1GB9A 1XGQC 4C3WA 2MECA 1LGXA 1G7MC 5KXRA 5F16A 1LMQA 1JKBA 152LA 4WM1A 5KJ9A 159LA 3TXDA 2XQOA 3ULRA 5KXWA 2AUBA 1PZYA 1W6ZA 5ILCA 1C62A 5C6LA 4UWNA 1HEOA 1L94A 4HV1A 2MEDA 1WVUA 1T6HA 1SSYA 3HWLA 1DKJA 1C6DA 1OUDA 2Z2FA 4YOPA 3SB8A 2Z2EA 3AB6A 3CDTA 4XJGA 4XENA 4EKSA 143LA 4TWSA 1CU5A 151LA 1IWZA 1LHLA 3FE0A 1G0LA 3HUQA 5C6IA 4PJZA 128LA 1QTZA 4DD1A 1LZ5A 197LA 1XJUA 5KY1A 1XSFA 2H9JA 4W52A 158LA 1JQUA 5A3EA 1D0MA 2G4PA 1GDXA 1LJKA 1P7SA 3WXUA 4DQ5A 1C66A 4B49A 4K5YA 1QS5A 1BVXA 1LYZA 1E8LA 1C63A 1L20A 1RE2A 1C6HA 4ML7A 1REYA 1DYGA 1NHEA 2LZ2A 3CDVA 5FSTA 190LA 1CJ7A 2BQAA 3B0OA 4OWAA 3G3XA 142LA 4YF2A 2DQFC 3AGHA 4KL7A 1FN5A 5DM9A 1IIZA 1G06A 1I1ZA 1LHKA 4LYTA 1LJJA 1QTHA 1CJ9A 4ETDA 3HT9A 4W55A 4W58A 3K3TA 1G7JC 2B6XA 4LDEA 4NHPA 1LJEA 2OTYX 1B7OA 5T3FA 1H87A 1EQ4A 1LSYA 4HTKA 1EPYA 1IOSA 4I7TA 217LA 211LA 1HEMA 1RJCB 1J1XY 1B9OA 1QSWA 2F4AA 3A92A 5HNLA 2Z18A 1ZVYB 5L3HA 1L99A 1LJGA 3JR6A 122LA 1LYOA 2ZQ4A 180LA 3LYMA 1GB6A 1QIOA 1LHHA 2YBJA 4ETBA 4Z46A 3T6UA 1LJNA 4W53A 1L27A 4WM3A 244LA 1G07A 3WVYA 1L08A 1L00A 3RZEA 1C6MA 1WTHA 1KNIA 130LA 5LVIA 3C7WA 4PGJB 1DI4A 3CT1A 4EJ4A 1CV3A 155LA 2Z37A 1PQKA 5DLAA 1GE4A 1L86A 1OYUA 5FDJA 2B6TA 1IO5A 1UICA 1P2CC 1L39A 3WULA 2HTXA 4NSIA 2LHMA 5APEA 3DMVA 5APDA 3EBAB 1A2YC 4GN5C 3EMLA 3TXIA 2BPUA 5LXWA 1C67A 102LA 1LZNA 3D4SA 1FLWA 4WG1A 3W6DA 1UIFA 4I7KA 4W96A 3AZ7A 1JSFA 2RB2X 1SWZA 1L80A 3L64A 227LA 4H9EA 1WQNA 2B7XA 3TMXA 1L22A 3TXFA 247LA 2F30A 1GFAA 4DC4A 4LGKA 1L92A 1UCOA 2F2NA 4TSBA 1B7RA 1I20A 2HUBA 3LZ2A 1L63A 3CT0A 1FLYA 4IATA 1JJ0A 5LVKA 3SN6R 1P37A 1KXWA 1LZ1A 1C6FA 1LHMA 1WQMA 4ARQB 1Z55A 238LA 4TUNA 2FBDA 182LA 3DN8A 3RUNA 3CT5A 1QSBA 3HH3A 1SWYA 1REXA 2IFFY 4WG7A 2MEAA 4G49A 5DN4A 4H9BA 1OQMA 1C7PA 4OOTA 4LZMA 4PRUA 4HSFA 1LYYA 1XEIA 4J1AA 1QUHA 1JJ3A 4CJ2A 2Q9DA 1L41A 1OUEA 2DQAA 1HELA 1BB3A 2N5ZA 1YQVY 1C6EA 3C8SA 1L24A 4EOFA 181LA 1FBIX 3HH5A 126LA 4CFOA 4XYYA 4EPFA 4B4JA 135LA 2RBSA 4DD7A 3LYTA 2RBPA 1VFBC 5M1YA 186LA 1LYDA 3ZEKA 1QSAA 3AW6A 1BB4A 4LFPA 249LA 3K2RA 4NEBA 4WM4A 1DQJC 2Z39A 4N8ZA 1HENA 1L90A 1QUTA 207LA 4KT3A 5F9UA 1L02A 1L71A 2HEEA 3OE9A 4WO9A 1PQIA 4Z3MA 3DN6A 1JHLA 4XJBA 1B7NA 1HERA 1HEWA 2BQDA 1G1VA 4GLVA 111LA 1YKXX 4NGIA 4NGOA 4IAPA 1L44A 229LA 3CSZA 1LI3A 2ZIKA 4QDNA 1L34A 1KW7A 5I5QA 1C60A 199LA 3W6FA 4HJYA 2RB0X 1LSPA 140LA 2RBNA 2YBHA 255LA 3G3BB 1L66A 1V7SA 2DKVA 195LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4H1P A;  5IEL A;  1LJ3 A;  3OE0 A;  3ZVQ B;  161L A;  3N9C A;  174L A;  1GBX A;  4WOA A;  3SBA A;  5D5F A;  2B75 A;  3OE6 A;  1GFH A;  3MGW A;  1JTT L;  4I7J A;  1CKC A;  1LSA A;  1LZD A;  3PBL A;  4LYM A;  4BS7 A;  4WM2 A;  1B7M A;  4GCD A;  1LZC A;  109L A;  1LI2 A;  1P2R A;  5LVG A;  4DQ7 A;  4GBR B;  2HEB A;  2A7D A;  4B0D A;  2XBS A;  1EQ5 A;  139L A;  178L A;  3E3D A;  1LYH A;  1L97 A;  1QTK A;  2OE7 X;  4TSC A;  2A7F A;  184L A;  216L A;  1L45 A;  1L64 A;  1L53 A;  4J7V A;  1XFP L;  2MEB A;  4H8Z A;  1L0K A;  1IWV A;  1QUS A;  1BVK C;  4W57 A;  1IY4 A;  3HT7 A;  248L A;  4NWH A;  1L21 A;  4QY9 A;  1OWZ A;  1XGR C;  1LMA A;  2MEE A;  1HF4 A;  3A3R X;  3GUP A;  2YBI A;  1L65 A;  240L A;  3SB6 A;  225L A;  5HMV A;  1L89 A;  2OU8 A;  1L35 A;  1TLA A;  4GN4 A;  3WXT A;  1D6P A;  1L61 A;  5LYZ A;  4I0C A;  1GFR A;  2X0A A;  2BQK A;  1UC0 A;  1IWX A;  4GCB A;  235L A;  3HTD A;  3A93 A;  2MEG A;  2ZYC A;  1L91 A;  1GD6 A;  4GRV A;  5LA8 A;  228L A;  1L0J A;  2FBB A;  1CJ8 A;  133L A;  1JIY A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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