3GUNA

T4 lysozyme m102e/l99a mutant with buried charge in apolar cavity--aniline binding
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
162
structure length
161
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDCEGYYTIGIGHLLTKSPDLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAINEVFQMGVTGVAGFTNVLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQCPDRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Use of stabilizing mutations to engineer a charged group within a ligand-binding hydrophobic cavity in T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 51
structure length 161
sequence length 162
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2009-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3gunA00
1C67A 4ARMB 1PQIA 1JTNA 109LA 1D2YA 1G0QA 142LA 169LA 1L49A 1L12A 1C6DA 1L68A 1D3MA 3ODUA 4EKPA 4W56A 150LA 1I6SA 1L94A 3DMVA 238LA 216LA 2OTZX 3C83A 3HT6A 4ARMA 181LA 1L58A 1CUPA 2HULA 1DYFA 1L60A 1CX7A 1L19A 3DN8A 232LA 113LA 1P3NA 4ARPA 1QT4A 125LA 138LA 242LA 1CVKA 1G07A 2NTHA 127LA 1L27A 1C60A 1P7SA 1L15A 3SB5A 1L07A 1L42A 2NTGA 4LZMA 1C6NA 2LCBA 3HTGA 4YX7C 141LA 1L04A 233LA 107LA 1G0PA 219LA 1L21A 1G0GA 198LA 257LA 3UONA 3K2RA 4PK0A 1L41A 1L44A 1L69A 1L85A 2RB2X 115LA 254LA 1C64A 209LA 1CUQA 1LYIA 111LA 1L67A 4EXMA 223LA 4ARLA 1C6PA 220LA 252LA 131LA 1L39A 2RB0X 1QSBA 1L17A 1L22A 1L30A 1L34A 1CU6A 1G0MA 1KS3A 1C6AA 1L76A 3F8VA 3HH5A 3PDSA 1ZYTA 256LA 3C8QA 1L71A 168LA 235LA 3GUNA 1L03A 6LZMA 2F47A 3C7YA 1G0JA 255LA 1P6YA 2B6ZA 3L2XA 1L48A 1QTBA 1EPYA 3CDVA 1L08A 1SWYA 1QS5A 1L36A 3HTDA 110LA 4I7NA 2Z6BA 4I7KA 2F32A 1C68A 3G3XA 3NY9A 3SB8A 1L33A 3L64A 1L61A 4S0WA 1C6QA 1L64A 1P56A 1L88A 1LYDA 174LA 144LA 2OEAX 1T8FA 137LA 1L82A 231LA 1KY1A 1XEPA 227LA 1L47A 205LA 1QT8A 1OVJA 261LA 3SB7A 1L01A 3GUMA 1CU3A 1K28A 1CU0A 152LA 3HU9A 172LA 1OVKA 158LA 1L0JA 3C7WA 1L92A 1QUHA 4DKLA 1LGUA 1SSWA 2ANXA 160LA 1L14A 1P37A 1XJUA 212LA 225LA 237LA 229LA 239LA 1QUGA 171LA 1L26A 1T8GA 1QTZA 3LZMA 102LA 1L57A 1T6HA 4DAJA 3DN2A 1L98A 2OU8A 1LYFA 1L53A 243LA 1L96A 1L13A 118LA 1L74A 3C8SA 4W51A 2IGCA 1G0KA 4I7TA 161LA 1L83A 1P5CA 3C80A 1DYCA 1G0LA 3RUNA 1L66A 4ARJA 4I7LA 4EJ4A 1L79A 3GUPA 240LA 206LA 1LWGA 4I7PA 1L11A 1L75A 1SX2A 1QTDA 259LA 139LA 192LA 2OE4X 182LA 211LA 3HUQA 176LA 1OVHA 1QT3A 170LA 2RBNA 234LA 1L90A 173LA 1L40A 244LA 4W54A 1OWYA 1L18A 3JR6A 1D3NA 1DYAA 250LA 2B6TA 3RZEA 1L50A 1L46A 221LA 1G1VA 1L45A 3F9LA 4W55A 1QUOA 1LPYA 1PQKA 3V2YA 1G1WA 1KNIA 119LA 190LA 3FADA 1XJTA 185LA 251LA 213LA 3HTBA 4LDLA 4YXCA 249LA 2QARC 1PQDA 1C6HA 1L29A 162LA 1G06A 2RB1X 4W57A 126LA 178LA 1L09A 1CU2A 2RBOA 1DYBA 1L35A 191LA 2Q9DA 177LA 120LA 1D3FA 1L73A 258LA 1P46A 1L20A 1LYJA 1CU5A 3CDTA 1LI2A 114LA 159LA 217LA 1PQMA 143LA 1C6BA 1C62A 1LYHA 1JTMA 236LA 1KW5A 3DN6A 1B6IA 4I7QA 5I14A 1WTHA 1QTHA 1LWKA 1LW9A 1QS9A 215LA 1C6FA 157LA 1L86A 1L97A 104LA 3GULA 2L78A 103LA 4LDOA 1OV7A 3CDOA 2O7AA 183LA 4EKSA 145LA 166LA 1L55A 4I7RA 3SB9A 1L38A 1L10A 1C6CA 1L95A 1C66A 3DN0A 1C63A 2B70A 1L02A 146LA 1T97A 226LA 214LA 3HTFA 4PJZA 128LA 1OV5A 1L80A 122LA 147LA 4DJHA 1L59A 3GUKA 1QUDA 3C7ZA 2A4TA 2B7XA 195LA 1SWZA 4ARQB 1LLHA 3GUIA 151LA 2B74A 3G3VA 3DMXA 262LA 3HH6A 246LA 164LA 2O4WA 1T8AA 3HWLA 3CDRA 1L0KA 1QT5A 2QB0B 1L70A 4ARQA 3OE9A 1L52A 188LA 1CV3A 1L16A 4K5YA 1L06A 1L31A 3DN4A 4EPIA 1SX7A 3FA0A 1L63A 200LA 230LA 1CV4A 1LYEA 3C81A 1L84A 5LZMA 4EKRA 7LZMA 129LA 1L25A 1C65A 1DYGA 175LA 1JQUA 4I7OA 4ZPUA 2ANVA 2HUKA 2B6YA 1CTWA 156LA 2RAZX 1QSQA 1P64A 1C6GA 2OE9X 1L54A 3SBAA 1C6LA 199LA 1L24A 180LA 1TLAA 3DN3A 3SBBC 155LA 2RAYX 1DYEA 1C6TA 1L43A 3SB6A 1LI6A 1QTCA 1L99A 222LA 3DMZA 2OU0X 4E97A 123LA 167LA 3OE8A 3HUAA 189LA 1NHBA 2RBPA 4I7SA 3G3WA 1L56A 3C82A 4LDEA 1L23A 3HU8A 112LA 2F2QA 1C6MA 3DN1A 1CV1A 1L62A 4W53A 1L89A 1L81A 2RBSA 148LE 2OTYX 201LA 1OWZA 2O79A 1ZURA 1LYGA 1QTVA 4IAPA 3SN6R 248LA 3D4SA 2RH1A 2LZMA 1D3JA 1L65A 1DYDA 1C61A 1QT7A 1CV6A 4AQNA 1D9WA 1L00A 3EMLA 4EKQA 2B72A 1L51A 3NY8A 1QT6A 4OO9A 1L91A 1C6KA 210LA 2RBRA 1C6IA 130LA 3C8RA 108LA 1L05A 224LA 2HUMA 1C6EA 3HT9A 2RBQA 1C6JA 4GBRB 228LA 1ZWNA 1LI3A 3DKEX 1L93A 245LA 1P36A 253LA 3OE6A 165LA 2B75A 3VW7A 2B73A 3HH3A 1L77A 241LA 3HDFA 1L72A 1KW7A 187LA 1CV0A 1L37A 149LA 1L28A 4GRVA 1L32A 2LC9A 2OE7X 3HUKA 1OYUA 4W52A 1P2RA 197LA 3DNAA 260LA 4EPFA 1KY0A 4W59A 3OE0A 3HT8A 1PQJA 2B6XA 3HT7A 218LA 3GUOA 3HDEA 1LGXA 1C69A 1CX6A 1SSYA 3V2WA 186LA 163LA 3FI5A 3QAKA 1P2LA 3HH4A 3PBLA 4I7MA 4YXAC 2Q9EA 1CV5A 1PQOA 3CDQA 4I7JA 1LGWA 3NYAA 247LA 2OU9A 3GUJA 140LA 2CUUA 2B6WA 184LA 196LA 4W58A 1L87A 1D2WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LJGA 1JTNA 169LA 4YENA 4PGJB 1IWZA 5KXLA 3DMVA 1B5ZA 4C5FA 2OTZX 3VWOA 3WU8A 1CX7A 3DN8A 2Z2FA 1P3NA 3B0OA 2BQAA 5F14A 4NGIA 133LA 2NTHA 4B0DA 5KXXA 1WVUA 1VATA 2MEFA 2ZYPA 4E3UA 4LZMA 3TXDA 4UWNA 4D9ZA 1HSWA 2AUBA 4YX7C 233LA 2N5ZA 3P64A 1HNLA 219LA 4NIJA 1YIKA 3WPKA 1HEQA 2HEAA 3UONA 3K2RA 1JISA 1B7RA 1XGRC 1L44A 1W6ZA 2RB2X 1QSAA 209LA 4XJHA 1CUQA 111LA 5D5FA 1GF0A 3A90A 4TTDA 2BQIA 4PRUA 1NF5A 1QSBA 1IWTA 4NSHA 1L34A 2YBMA 3WW5A 3B72A 4IASA 3F8VA 1CJ7A 1UUZC 3HH5A 1LTMA 4NWHA 3WUAA 5KY1A 1L71A 3GUNA 6LZMA 1G0JA 1NKHA 1P6YA 3CB7A 1EPYA 1L08A 3A6BY 4OOTA 5DN5A 5L3HA 2Z12A 4I7KA 3SB8A 1P2CC 1L88A 174LA 4H1PA 137LA 1L82A 3W6BA 1XEPA 1L47A 205LA 1T3PA 1QT8A 1CU3A 3WPLA 1CU0A 152LA 3HU9A 4GCEA 1L0JA 4RLMA 3A93A 1XGPC 1TCYA 3IJUA 1ZVHL 1BB3A 1LHKA 5II3A 239LA 3CQLA 5K7OA 1T8GA 5F9UA 102LA 1XGTC 1B2KA 4N1EI 1T6HA 2OU8A 4XN6A 5B1FA 1L53A 1L96A 118LA 4DD1A 5B1GA 1LZAA 1B7NA 3RUNA 4HJZA 1JKBA 1LWGA 4I7PA 2OE4X 4RDSA 1O23A 3HUQA 2YBHA 1QT3A 170LA 3A94A 1TDYA 1L18A 3A34A 2B6TA 2Z2EA 1GB3A 1L45A 3F9LA 1FLWA 1C08C 1W08A 190LA 4HJVA 249LA 1C6HA 1L29A 2BQCA 1GBOA 2RB1X 1FLYA 1CU2A 2RBOA 1KXWA 1KIRC 4J0LA 191LA 3ATOA 1CJ9A 177LA 3W6FA 2H9JA 3F6ZA 1CU5A 3CDTA 4MSTA 1LI2A 5HNLA 4TX7A 1QSWA 1GD6A 217LA 143LA 1PQMA 1JTMA 2H5ZA 4I7QA 1GWDA 5I14A 1LWKA 1QS9A 4HV1A 4LT3A 3M18B 157LA 4TWSA 4LT0A 1D0LA 3TXBA 183LA 3AYQA 5LVJA 1L38A 1UC0A 1C6CA 1L95A 1MELL 1KIPC 1DPXA 3AZ7A 146LA 134LA 1UIDA 1T97A 226LA 1GFGA 5FHWA 2CGIA 3IWRA 147LA 3GUKA 3C7ZA 2HEBA 2B7XA 1JJ3A 1OUDA 5F81A 2LYZA 1DQJC 1C10A 4MCKA 2B74A 3G3VA 3P68A 2DQAA 3HH6A 246LA 3HWLA 1EL1A 1IC4Y 2W1YA 1IIZA 3TXGA 3OE9A 1L52A 2BQGA 3P4ZA 1IEEA 4H93A 3K3TA 1LMNA 4YOPA 4CGEA 1D6PA 4GN4A 2HTXA 4LYTA 5DN4A 1BWIA 1I20A 7LZMA 1WQNA 175LA 1LMAA 1JQUA 2LYMA 3WU7A 5KXZA 5KXSA 2HUKA 1CTWA 4NGKA 1P64A 1C6GA 3QE8A 2D91A 3J4GA 2DQJY 5LINA 1L24A 180LA 1TLAA 2DQHY 4XJGA 1DYEA 1L43A 3SB6A 1LZTA 2FBBA 4NGYA 2F4AA 4HPIA 2OU0X 4O34A 1GF4A 4KT3A 4E97A 167LA 3OE8A 1LJFA 189LA 3TXKA 3AGHA 2RBPA 4I7SA 1IX0A 1GB5A 1F10A 3M3UA 3EBAB 4BADA 1JIYA 3DN1A 1L62A 3A92A 1JTOL 1L81A 2X0AA 1LSPA 2RBSA 1HHLA 1IY3A 1OWZA 1LYGA 4N0JA 2G4NA 1YKZX 3D4SA 4ZEEA 1MLCE 2VB1A 1QT7A 4AQNA 4HTNA 1LZ8A 4XJDA 1LZ5A 4TSBA 2MEDA 1QT6A 1UIAA 2MEBA 4LZTA 4OO9A 210LA 1C6IA 130LA 1LJJA 2LZTA 224LA 2HUMA 1QTKA 2FBDA 2YBJA 3J6KA 1C6JA 1GF9A 4I8SA 1GDWA 228LA 2BQJA 1LI3A 8LYZA 2B75A 1LMQA 3ZEKA 4PRQA 4WLDA 4R6CA 4LFXA 2BQEA 4NSIA 2LC9A 5E4PA 1P2RA 7LYZA 4QY9A 1HFYA 1CKHA 1KY0A 3A8ZA 1XGUC 3HT7A 4GLAA 1SSYA 5APCA 1P2LA 3PBLA 4MR1A 2Q9EA 2XBSA 4ZFPA 4PJ2C 1LHLA 4WM3A 1BVKC 1GFUA 2YSSC 1H6MA 4H9EA 4ETCA 109LA 142LA 2BPUA 1D3MA 3KAMA 1BWHA 5KKIA 3WUMA 1DPWA 3HFMY 1UICA 1J1PY 1L94A 181LA 1L58A 1JTPL 4H8XA 1L19A 1VDPA 1WTNA 1REXA 125LA 132LA 3RZ4A 1G07A 127LA 1BB4A 3SB5A 1L07A 1L42A 5I54A 1IC7Y 1XFPL 1KXYA 1VDQA 1L04A 107LA 5KJ9A 1REMA 1GAYA 1G7MC 1L41A 1IORA 1JSFA 5LVHA 2ZIKA 1FKQA 4TUNA 223LA 220LA 2BAAA 5LAGA 131LA 2RB0X 1LSFA 1NQIA 1L22A 3A3RX 1OP9B 2EIZC 1RFPA 5B59A 1QIOA 3C8QA 3RNXA 4H9AA 168LA 1LZ1A 4NGLA 2F47A 3C7YA 2B6ZA 3W6CA 1L48A 2CWIA 1QTBA 2BQKA 1SWYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1CV0 A;  1L37 A;  149L A;  1L28 A;  4GRV A;  1L32 A;  2LC9 A;  2OE7 X;  3HUK A;  1OYU A;  4W52 A;  1P2R A;  197L A;  3DNA A;  260L A;  4EPF A;  1KY0 A;  4W59 A;  3OE0 A;  3HT8 A;  1PQJ A;  2B6X A;  3HT7 A;  218L A;  3GUO A;  3HDE A;  1LGX A;  1C69 A;  1CX6 A;  1SSY A;  3V2W A;  186L A;  163L A;  3FI5 A;  3QAK A;  1P2L A;  3HH4 A;  3PBL A;  4I7M A;  4YXA C;  2Q9E A;  1CV5 A;  1PQO A;  3CDQ A;  4I7J A;  1LGW A;  3NYA A;  247L A;  2OU9 A;  3GUJ A;  140L A;  2CUU A;  2B6W A;  184L A;  196L A;  4W58 A;  1L87 A;  1D2W A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1LJG A;  1JTN A;  169L A;  4YEN A;  4PGJ B;  1IWZ A;  5KXL A;  3DMV A;  1B5Z A;  4C5F A;  2OTZ X;  3VWO A;  3WU8 A;  1CX7 A;  3DN8 A;  2Z2F A;  1P3N A;  3B0O A;  2BQA A;  5F14 A;  4NGI A;  133L A;  2NTH A;  4B0D A;  5KXX A;  1WVU A;  1VAT A;  2MEF A;  2ZYP A;  4E3U A;  4LZM A;  3TXD A;  4UWN A;  4D9Z A;  1HSW A;  2AUB A;  4YX7 C;  233L A;  2N5Z A;  3P64 A;  1HNL A;  219L A;  4NIJ A;  1YIK A;  3WPK A;  1HEQ A;  2HEA A;  3UON A;  3K2R A;  1JIS A;  1B7R A;  1XGR C;  1L44 A;  1W6Z A;  2RB2 X;  1QSA A;  209L A;  4XJH A;  1CUQ A;  111L A;  5D5F A;  1GF0 A;  3A90 A;  4TTD A;  2BQI A;  4PRU A;  1NF5 A;  1QSB A;  1IWT A;  4NSH A;  1L34 A;  2YBM A;  3WW5 A;  3B72 A;  4IAS A;  3F8V A;  1CJ7 A;  1UUZ C;  3HH5 A;  1LTM A;  4NWH A;  3WUA A;  5KY1 A;  1L71 A;  3GUN A;  6LZM A;  1G0J A;  1NKH A;  1P6Y A;  3CB7 A;  1EPY A;  1L08 A;  3A6B Y;  4OOT A;  5DN5 A;  5L3H A;  2Z12 A;  4I7K A;  3SB8 A;  1P2C C;  1L88 A;  174L A;  4H1P A;  137L A;  1L82 A;  3W6B A;  1XEP A;  1L47 A;  205L A;  1T3P A;  1QT8 A;  1CU3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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