4I7NA

T4 lysozyme l99a/m102h with 1-phenyl-2-propyn-1-ol bound
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
175
structure length
175
Chain Sequence
PTTENLYFQGSMNIFEMLRIDEGLRLKIYKDCEGYYTIGIGHLLTKSPDLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCAAINHVFQMGVTGVAGFTNVLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQCPDRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title The impact of introducing a histidine into an apolar cavity site on docking and ligand recognition.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 65
structure length 175
sequence length 175
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4i7nA00
1G06A 1C6CA 1KY0A 1L39A 4W55A 1LWKA 248LA 1LYEA 196LA 4W59A 1L32A 2OTYX 1EPYA 4I7SA 3DMXA 4W53A 4ZPUA 169LA 1L73A 113LA 1LWGA 212LA 2Q9DA 1C6EA 3HUAA 1C65A 1P56A 1L02A 1L61A 3C80A 1QUDA 1L96A 1C63A 1DYDA 1CU5A 1L71A 1L59A 1L20A 3HTGA 3NY9A 1L29A 1L60A 2RBRA 205LA 148LE 4W57A 1D3MA 1L36A 162LA 118LA 1L72A 1QTHA 173LA 3GUMA 4OO9A 4ARPA 1PQIA 2LC9A 1L22A 4W52A 3PBLA 1C6NA 4LDLA 229LA 1L25A 4EPFA 192LA 206LA 3RUNA 176LA 4K5YA 3OE9A 254LA 1L93A 3HTBA 1L0JA 1OVKA 3CDVA 211LA 4I7MA 159LA 1DYAA 3SB5A 1OYUA 127LA 4ARMB 4W51A 3GUIA 218LA 1L70A 4I7LA 1CUPA 2LZMA 1L81A 4YX7C 236LA 1L24A 1L17A 1L03A 221LA 1P2LA 1L97A 151LA 249LA 1L65A 2B6TA 3HT6A 214LA 3GUNA 2HUKA 181LA 2OE4X 1L08A 1L26A 188LA 4I7PA 2B74A 3EMLA 4EKPA 2IGCA 200LA 1L68A 178LA 213LA 4YXAC 216LA 1QSQA 1QUOA 225LA 1QT4A 3L64A 3C8QA 3ODUA 110LA 3RZEA 171LA 260LA 3F8VA 1JTMA 107LA 1LI6A 3C8RA 1CV6A 3SB7A 1OVHA 156LA 1SWYA 142LA 1SX2A 1QTDA 1C64A 1L84A 3OE8A 1D3JA 1P7SA 261LA 1L58A 4EKSA 2OEAX 4AQNA 1L07A 1K28A 3DMZA 209LA 4DAJA 1LI2A 1LLHA 2RBPA 115LA 1LPYA 2HULA 3DN3A 1LYGA 4DJHA 1L74A 1C60A 3C7WA 145LA 2OU0X 1L35A 3GUPA 3DN4A 174LA 1SWZA 3K2RA 1CX7A 2B6ZA 164LA 234LA 1C6AA 1ZYTA 1L92A 2O7AA 3HH4A 119LA 168LA 3C8SA 2OU8A 1QT7A 2QARC 1DYGA 3C7YA 5LZMA 1JQUA 1QS5A 1L82A 4PK0A 2L78A 240LA 143LA 1CU0A 255LA 4ARQA 1L79A 3JR6A 3C7ZA 1L40A 1D3FA 167LA 190LA 140LA 1L54A 1C6BA 1L51A 1OWZA 244LA 155LA 1D9WA 3UONA 246LA 1L04A 1L44A 185LA 4EKQA 1DYFA 3G3XA 3HUQA 4LDEA 180LA 1C69A 3DMVA 1L55A 1L67A 1P36A 3PDSA 1L49A 1L63A 3GULA 1L34A 1LYHA 3HH3A 1QTZA 1L76A 191LA 1L95A 2RBSA 1L64A 230LA 125LA 3FA0A 3L2XA 182LA 1T97A 3SB6A 157LA 1SX7A 1L83A 1L13A 112LA 144LA 4E97A 4I7QA 1QT3A 4I7RA 120LA 131LA 166LA 201LA 1C6GA 183LA 1D2WA 1L45A 1PQJA 1L31A 2B72A 2F32A 1LW9A 1KNIA 1OV7A 3CDOA 126LA 1L50A 1C61A 6LZMA 4EJ4A 163LA 1XEPA 1LGUA 1QS9A 1L85A 241LA 2B75A 1I6SA 1QT6A 3V2YA 1G0QA 1P37A 1OVJA 1L28A 1SSWA 1P6YA 253LA 3GUKA 1DYCA 3HTFA 3SB9A 161LA 1PQKA 3DN0A 1C68A 1G1WA 227LA 3GUJA 4GRVA 1G07A 1L77A 2B6YA 4DKLA 1CU6A 2Q9EA 2RB2X 2RBQA 1C6MA 4I7TA 2B7XA 2CUUA 149LA 1C6TA 1C6JA 2RH1A 3HUKA 1G0MA 1L41A 1LYDA 1L47A 2RB0X 184LA 1L14A 4W54A 1C6HA 231LA 3HT9A 122LA 1P46A 2QB0B 1D3NA 2OTZX 1CV3A 3QAKA 1XJUA 108LA 1L11A 4I7OA 111LA 1L30A 3HU8A 1C6KA 130LA 1CU3A 2OU9A 1C62A 4W58A 3DN2A 3SBAA 239LA 1L88A 1QTCA 4PJZA 172LA 1L43A 189LA 1QTVA 1D2YA 3DN1A 1L90A 2OE9X 3SN6R 3VW7A 4I7KA 1TLAA 1L27A 1LYFA 139LA 1G1VA 3GUOA 138LA 3NYAA 4ARQB 3HTDA 1CV0A 2A4TA 1DYEA 1P3NA 3CDTA 160LA 103LA 1NHBA 220LA 4GBRB 219LA 2B73A 1L86A 197LA 1L91A 4YXCA 1L69A 1PQMA 1C67A 102LA 1G0GA 237LA 158LA 1G0LA 1L00A 3OE6A 123LA 2B70A 1C66A 1ZURA 3G3VA 3HH6A 1P2RA 217LA 259LA 228LA 4LZMA 1CU2A 1LYJA 1C6PA 1L66A 1B6IA 1CV1A 2B6XA 7LZMA 1T8AA 3HH5A 4LDOA 2RBOA 177LA 1L0KA 2RB1X 1C6IA 1L09A 3C81A 3CDQA 147LA 3D4SA 5I14A 3LZMA 3FI5A 2ANXA 4W56A 1L57A 245LA 1L38A 1L62A 4I7JA 152LA 1CTWA 1L56A 1LGXA 1L94A 1CVKA 1G0KA 251LA 1L05A 1L53A 238LA 1L23A 224LA 141LA 4ARLA 1PQDA 2NTGA 198LA 1G0JA 114LA 1L16A 262LA 2O79A 4EKRA 1OWYA 1LI3A 137LA 170LA 3HWLA 1P64A 104LA 1KW5A 1C6DA 1C6QA 1L18A 1L48A 1QUHA 1T6HA 1XJTA 3DKEX 1P5CA 1WTHA 3DNAA 1L89A 150LA 1KY1A 1QSBA 250LA 1C6FA 4ARMA 1L21A 2Z6BA 2O4WA 1L10A 3SB8A 1LYIA 1L06A 1QUGA 2F47A 1OV5A 1QTBA 1L12A 3CDRA 1L19A 1CX6A 2LCBA 1L42A 3NY8A 2B6WA 195LA 3SBBC 1QT8A 1T8GA 3C82A 1L98A 1QT5A 2OE7X 252LA 165LA 4IAPA 1L80A 1L01A 2RBNA 233LA 128LA 215LA 1L99A 242LA 1L52A 146LA 175LA 1L15A 3C83A 257LA 109LA 1C6LA 1L75A 3DN8A 1JTNA 4EXMA 199LA 2HUMA 1L33A 232LA 1L46A 3HDFA 3HT7A 1ZWNA 1KS3A 1CV5A 3HDEA 256LA 235LA 4EPIA 4S0WA 1CV4A 210LA 2RAZX 2F2QA 1SSYA 1PQOA 1G0PA 1T8FA 1CUQA 3G3WA 3HU9A 2RAYX 3DN6A 258LA 247LA 2ANVA 3F9LA 226LA 223LA 243LA 1L37A 3OE0A 3FADA 2NTHA 187LA 4ARJA 4I7NA 1LGWA 1L87A 129LA 3V2WA 1KW7A 3HT8A 186LA 1DYBA 222LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1G06A 4W55A 3WMKA 5I4XA 1L32A 3DMXA 2BQAA 1AT5A 1HF4A 3A96A 4PJ2C 2LZTA 1C65A 4NGYA 1GB5A 5FCPA 1CU5A 1L71A 2H5ZA 1T6VL 1IWTA 5FEKA 3NY9A 2LZ2A 1L60A 4XN6A 1PS5A 2WARA 1IWZA 3T36A 1D3MA 162LA 1VDPA 4PRUA 2DBTA 3GUMA 5KXNA 1L22A 3PBLA 1C6NA 1LSYA 2ZYCA 206LA 4K5YA 4KL7A 1JKDA 4IJ4A 3HTBA 1CKHA 1LYYA 211LA 3GUIA 4WLYA 1L81A 1IWXA 1L24A 1V7TA 151LA 5KXTA 5C6LA 3HT6A 4BS7A 1VFBC 2OE4X 5JENB 1L26A 4P2EA 4X3BA 4EKPA 200LA 1IP3A 3FI7A 1JUGA 4YXAC 3LYOA 3MGWA 2FYCA 3C8QA 3EMSA 2ZIKA 2BQNA 5D5FA 260LA 1DI3A 1LI6A 5FDJA 1GFGA 4DD1A 1WQQA 1WQOA 1SWYA 1UCOA 3B0OA 1B7NA 2I6ZA 1D3JA 2Z38A 3DMZA 5M1YA 4LFPA 3D9AC 1JIYA 115LA 1GE4A 1BVXA 1LYGA 1L74A 2CDSA 3A91A 1L35A 1CNSA 1CKDA 3QNGA 5FELA 1G7HC 1CJ7A 5L9JA 5II3A 1L92A 3G3AB 119LA 3C8SA 4HV1A 2FYDA 4B49A 1GXV2 1IEEA 1HERA 1CU0A 2HECA 3JR6A 1L40A 1YILA 1B2KA 140LA 1L54A 1XGTC 4HPIA 1GE2A 3ZVQA 4H90A 155LA 4EKQA 5K7OA 1FLYA 6LYZA 4TTDA 1LYHA 4ETDA 3G3BB 1GB2A 4N0JA 1GFKA 3CT0A 230LA 125LA 3L2XA 1T97A 2BQDA 5HMVA 1LJFA 1L13A 1RI8B 112LA 1LAAA 3LN2A 4E97A 4I7QA 1QDRA 1JPOA 131LA 1NDMC 1L31A 2B72A 4WL6A 1GF5A 1BB7A 1KNIA 2YSSC 1OV7A 2BQCA 6LZMA 1C61A 3A8ZA 2DQGY 4J0LA 3V2YA 4DDAA 1SSWA 253LA 1GHLA 1LHJA 161LA 1PQKA 1G1WA 3GUJA 4GRVA 4XJBA 2B6YA 5KJ9A 1LZ4A 2RBQA 2CUUA 149LA 1LJNA 1GBYA 1Z55A 1LSMA 2HEAA 1GDXA 1GBXA 1DPWA 2GV0A 4NGKA 4XJIA 1LSCA 1UIHA 3A34A 1FKQA 4WM4A 1L14A 1J1PY 1UACY 1B5VA 1P46A 1D0KA 1D3NA 1LZGA 1QUSA 1XJUA 5EBHA 3WUAA 1IP1A 1FKVA 111LA 1LZAA 1B7QA 239LA 1ZVHL 4M6DA 1QTCA 1JJ1A 4PJZA 1L90A 3A92A 2F4AA 3W6CA 1B7PA 3AZ6A 138LA 1SLYA 1BHZA 3HTDA 2A4TA 1DYEA 1BQLY 5KKJA 2I26L 1NHBA 1LMPA 3ZVQB 5LVJA 220LA 1LSAA 1BWIA 1HHLA 1LHHA 1GB3A 2XBRA 2XBSA 1C67A 3WH1A 1UIEA 1WQRA 1G0LA 3OE6A 6LYTA 4Z46A 1C66A 1TBYA 5LVHA 3LHMA 228LA 1LYJA 3TMXA 5I5QA 4WM6A 4GLVA 1QSWA 3HH5A 207LA 4NGZA 1QTKA 2RB1X 3FE0A 1C6IA 1L09A 3CDQA 147LA 3T6UA 134LA 3D4SA 1L57A 1L62A 4I7JA 1JTPL 1L56A 1LGXA 1L23A 5LYTA 4DQJA 4MSTA 4A7DA 198LA 2D4JA 1L16A 3LYMA 2EQLA 4B4IA 137LA 4WLDA 5KXXA 3DKEX 3DNAA 250LA 5LVKA 1IC5Y 3SB8A 1L12A 3CDRA 1L19A 1L42A 4DWXA 1LZDA 3SBBC 1B7SA 2OE7X 3LZTA 2MEGA 128LA 242LA 4ET8A 1CKGA 109LA 4LGKA 1GE0A 1C6LA 1GWDA 5B07A 2HUMA 1OUJA 3HDFA 2EIZC 2YDGA 1ZWNA 4R0FA 1CV5A 153LA 4C5FA 2DQJY 3G3WA 4B4JA 1GFJA 247LA 2ANVA 4WMGA 5KXPA 4BAPA 4ETEA 1LYOA 1YAMA 2B5ZA 3ATOA 4ARJA 4I7NA 1UIGA 1KW7A 1DYBA 2G4PA 1YROA 2BQGA 1LWKA 248LA 1IX0A 2OTYX 1EPYA 2DQFC 5KXWA 4AXTA 3VWOA 169LA 2EKSC 3RU5A 1C6EA 1HEMA 2MEBA 3HUAA 1JISA 1L02A 3C80A 1LZEA 3GXKA 1QUDA 4DD2A 4II8A 5B1GA 1L59A 1L20A 1B5XA 1JTTL 2ZIJA 205LA 5DN4A 118LA 1QTHA 173LA 4OO9A 4ARPA 3AGGG 3M18B 4W52A 4LDLA 3N9CA 4NHTA 3AZ7A 1EL1A 4NGOA 1IP2A 1L0JA 1OVKA 3CDVA 1UA6Y 2IHLA 127LA 218LA 4I7LA 1UICA 1C10A 2LZMA 5B1FA 221LA 4LZTA 214LA 3GUNA 2HUKA 5I54A 1GF7A 1L08A 1GFHA 4O34A 4NGVA 4NGJA 4H9HA 1QSQA 1BB5A 1O23A 1QT4A 3ODUA 110LA 1VAUA 1GEVA 4TWSA 1GAZA 1IR7A 1T3PA 2A7DA 1JSEA 1SX2A 1C64A 1CKCA 1IC7Y 1GFRA 3CSZA 4MR1A 5KKIA 3OE8A 1P7SA 1KXXA 261LA 1L58A 4EKSA 2OEAX 4G4BA 4AGAA 3HFMY 1BWHA 1IIZA 1K28A 1LZCA 2RBPA 4H9EA 3AZ4A 145LA 1LJEA 5DN5A 174LA 1SWZA 1G7IC 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1G06 A;  4W55 A;  3WMK A;  5I4X A;  1L32 A;  3DMX A;  2BQA A;  1AT5 A;  1HF4 A;  3A96 A;  4PJ2 C;  2LZT A;  1C65 A;  4NGY A;  1GB5 A;  5FCP A;  1CU5 A;  1L71 A;  2H5Z A;  1T6V L;  1IWT A;  5FEK A;  3NY9 A;  2LZ2 A;  1L60 A;  4XN6 A;  1PS5 A;  2WAR A;  1IWZ A;  3T36 A;  1D3M A;  162L A;  1VDP A;  4PRU A;  2DBT A;  3GUM A;  5KXN A;  1L22 A;  3PBL A;  1C6N A;  1LSY A;  2ZYC A;  206L A;  4K5Y A;  4KL7 A;  1JKD A;  4IJ4 A;  3HTB A;  1CKH A;  1LYY A;  211L A;  3GUI A;  4WLY A;  1L81 A;  1IWX A;  1L24 A;  1V7T A;  151L A;  5KXT A;  5C6L A;  3HT6 A;  4BS7 A;  1VFB C;  2OE4 X;  5JEN B;  1L26 A;  4P2E A;  4X3B A;  4EKP A;  200L A;  1IP3 A;  3FI7 A;  1JUG A;  4YXA C;  3LYO A;  3MGW A;  2FYC A;  3C8Q A;  3EMS A;  2ZIK A;  2BQN A;  5D5F A;  260L A;  1DI3 A;  1LI6 A;  5FDJ A;  1GFG A;  4DD1 A;  1WQQ A;  1WQO A;  1SWY A;  1UCO A;  3B0O A;  1B7N A;  2I6Z A;  1D3J A;  2Z38 A;  3DMZ A;  5M1Y A;  4LFP A;  3D9A C;  1JIY A;  115L A;  1GE4 A;  1BVX A;  1LYG A;  1L74 A;  2CDS A;  3A91 A;  1L35 A;  1CNS A;  1CKD A; 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