1LSZA

Crystal structure of the mutant d52s hen egg white lysozyme with an oligosaccharide product
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTSYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Gallus gallus
publication title Crystal structure of the mutant D52S hen egg white lysozyme with an oligosaccharide product.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEN EGG WHITE LYSOZYME
total genus 49
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-09-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lszA00
1WQOA 2A7DA 4NSGA 3HBEX 1NF5A 1UIHA 4R6CA 1EQEA 5M1YA 1LZ5A 4HTQA 3G3AB 4NGVA 1XEJA 2HTXA 4PJ2C 1HEWA 5B59A 1LKSA 3CSRA 4H9FA 1CJ9A 1JWRA 2DQJY 1GFHA 2EIZC 1YAOA 3N9AA 1GHLA 1H87A 4NHPA 4RLNA 1LZ6A 2G4PA 1QDTA 1LMPA 1IWZA 4WLYA 1OUDA 3J6KA 4HTNA 4OWHA 1IR8A 1C43A 1GBYA 2BQMA 2YBMA 1OUHA 2IFFY 1GFKA 1HHLA 1LHIA 4J0LA 1WQPA 4OWAA 1GF7A 1GBWA 1LMCA 5KXNA 4ZFPA 4YEOA 3M18B 5DN4A 2RSCA 5LYZA 1LZSA 1NQIA 4LFXA 3A3RX 3B0KA 4J7VA 2D4IA 2LZTA 4WOAA 4IASA 4NGWA 1HENA 1LMOA 3FI7A 1EL1A 1LMAA 1RI8B 1GDXA 5IELA 2H9JA 1FLQA 1G7HC 2W1XA 4NHSA 5K7OA 4CHXA 4AGAA 1IC4Y 1LCNA 1TAYA 4N1CC 1KXWA 3A8ZA 1LSYA 5II3A 4PRQA 1LSNA 1YAPA 4YOPA 4XJHA 4H9CA 3TXFA 3BKHA 1B7SA 1I56A 1TDYA 3GXKA 1IY4A 7LYZA 2CDSA 3TXKA 1CKGA 5APEA 1BB5A 5B06A 4GCBA 5KY1A 4HSFA 5L3HA 4ETAA 1LMTA 3J4GA 2D4KA 5IDDA 4UWVA 1UIFA 1IP7A 1HEOA 5APCA 4OWBA 1OUBA 3ATNA 4QEQA 1VATA 2C8OA 1FKQA 4G4BA 4M6DA 4UWUA 1LZBA 1XGUC 4WG7A 5HNCA 3WUAA 4GCDA 1J1XY 2DQDY 1UIGA 2Z2EA 1ZMYL 2MEGA 4G4HA 5I4XA 1XEIA 1QUTA 3ATOA 2GV0A 2XJWA 1IY3A 1ZV5L 2BQGA 4NGOA 4WM4A 3K3TA 1LZGA 2AUBA 4PPOA 2Q0MX 4R0FA 5L3IA 5FDJA 1YAMA 1UC0A 1YKXX 3IWRA 1HC0A 4KXIA 1LMQA 1FLUA 5B07A 3BKVA 4RDSA 1GWDA 2PC2A 4LYZA 4MCKA 4XADA 4XJIA 1LPIA 1UIDA 3MGWA 4H8YA 5F16A 5C6IA 4B4EA 2BPUA 2DQCY 2ZNWY 2F30A 4KL7A 1C08C 2ZNXY 4NHIA 3W6FA 1UIAA 4I0CA 4WLTA 4HPEA 1CKFA 1GFUA 3GXRA 4WO9A 3EBAB 1JKBA 5FSTA 3AYQA 6LYZA 1EQ5A 4H9HA 4G4CA 4ET8A 4HJYA 1DI4A 1IORA 1IP5A 1OUCA 4C3WA 1WQMA 1B0DA 5FELA 1GFGA 3EXDA 4Z3MA 4PHIA 2D91A 4WL7A 5A3EA 4HV1A 2DQFC 4NY5A 3P64A 3T6UA 3ZVQA 4CGEA 2DQAA 4AXTA 3LHMA 4U3XB 3WL2A 1NHEA 1GB5A 4NGLA 1B5WA 3D9AC 1WQRA 4WL6A 3LYTA 4LT2A 5EBHA 4DYGA 1RFPA 3WU7A 1IC7Y 2DQHY 4BADA 1QSAA 4J1BA 4YENA 3TXBA 4EMNA 2Z18A 3E3DA 4BAPA 4BS7A 2BQCA 3P4ZA 1JHLA 4H8ZA 1OUAA 1NBYC 2HEAA 4WM1A 1VDSA 5KXSA 1B9OA 4DWXA 2MECA 3AZ4A 1INUA 2DQIY 4I8SA 1JJ1A 1B7OA 1LZNA 1QUSA 2ZQ3A 1GB0A 4NEBA 1GEVA 4GCCA 5D5CA 4NFVA 5APFA 4DDAA 2YBIA 1J1PY 1B5ZA 3WU8A 5I54A 1LHKA 1LZYA 1OUFA 4HPIA 4HTKA 1IWVA 4KT3A 1YILA 4DD2A 4ETBA 1DPWA 1F0WA 4NG8A 4GN3A 4IATA 3W6CA 1GF4A 3T36A 1JIYA 3A6BY 4N0JA 1DQJC 1KXYA 1LYOA 3QE8A 4XJBA 4XJFA 3F6ZA 2BQLA 1PZYA 1CJ8A 1TBYA 2W1LA 4IJ4A 1LHJA 132LA 4NWHA 1DI5A 1TEWA 2W1YA 1LZRA 4CFPA 5B05A 2BLYA 1GFAA 4BAFA 1B5YA 4P2EA 1JJ0A 1HSXA 1BHZA 5A3ZA 1VDTA 2BQDA 2DQGY 1XGQC 2BQNA 3AZ7A 2MEFA 5T3FA 3ZEKA 3ZVQB 1REXA 4NHTA 1LJ4A 1LOZA 1V7SA 1XEKA 1BGIA 1LZ1A 2N5ZA 2DBTA 1IWTA 1BQLY 4TSBA 4DD1A 1AZFA 2FBDA 1FKVA 1IWXA 3A95A 3CT5A 3TXGA 4G9SA 2BQIA 1ALCA 1REZA 1LSFA 1OQMA 1BB6A 1KIQC 4C5FA 1D6QA 4H91A 4HV2A 1GBZA 1GF3A 3CQLA 3WH1A 1QTKA 1LJFA 1JEFA 1LZ9A 1MLCE 3RZ4A 1LZ4A 5D5FA 4CFOA 4NGZA 5FEKA 3KAMA 2BQAA 1IR9A 1G7MC 1D6PA 3W6EA 2HU1A 1LSGA 1SLYA 1RCMA 4GN4A 5KXPA 5I4YA 1IX0A 2G4NA 4H92A 1QDRA 4H90A 4O34A 1NWGA 1CNSA 2F4GA 2Z39A 4H1PA 2H5ZA 1LZCA 2BQFA 4QGZA 1TCYA 4B0DA 1UIBA 2LHMA 4J1AA 5I5QA 1LAAA 3AGGG 1FN5A 3A96A 1G7LC 1OUJA 2C8PA 1I1ZA 3RNXA 3B72A 1BB7A 5AMYA 1WQNA 5LAGA 1A2YC 1OP9B 3WPLA 5L9JA 1RJCB 1LYZA 3TMWA 1CJ7A 1B7NA 1GFJA 1IC5Y 4NHQA 3WXUA 8LYZA 1XGRC 1GB8A 1GE3A 1LSMA 2H9KA 1HEMA 1AKIA 2D6BA 3AJNA 1YKYX 1ZVYB 1BB4A 1WQQA 1DXJA 1UACY 3OK0A 4ANRA 2A7FA 1REMA 4LGKA 1IIZA 1CKHA 3WUMA 1YL1X 2EPEA 3A67Y 4WM2A 1B5UA 5KXLA 5KKIA 1YROA 3LZTA 1LHHA 1HF4A 3M3UA 5HMJA 4WMGA 1NDGC 1HELA 1DPXA 1IVMA 2BLXA 1LJHA 4LYTA 4GLAA 4GCFA 1YQVY 1DI3A 2YVBA 4H93A 4OW1A 3OJPA 1GFVA 4X3BA 1LSEA 2CWIA 4DT3A 1G7JC 3B0IA 4NGJA 5LYMA 1B7QA 2MEAA 4B1AA 1UUZC 1JKCA 1LYYA 1NBZC 1JSEA 1JTTL 4PRUA 134LA 1YL0X 5KXOA 5ILCA 5F9XA 1LJIA 4DDCA 1GE1A 5C6LA 3P68A 4XYYA 154LA 1B7LA 5J7CA 1E8LA 1DKJA 1T3PA 3VWOA 3QNGA 1HEPA 1T6VL 1LZ8A 2FYCA 4G49A 3FE0A 208LA 1LJEA 1UICA 2DKVA 1QQYA 2BQBA 4NSJA 3WXTA 5LVJA 1LZAA 3A93A 3TMVA 1UIEA 1YANA 194LA 3TMXA 3W6BA 4L41A 5FHWA 1AT6A 1GE0A 1XSFA 3A92A 1IWYA 3CSZA 1IEEA 4PGJB 1GF6A 1VEDA 3WU9A 1F10A 3TXJA 5F14A 1YAQA 3SP3A 193LA 1GBOA 3A90A 2X0AA 3IJVA 3AGHA 207LA 1HMKA 2BQHA 3AZ6A 1HSWA 5KXWA 4WLXA 4TSCA 3CB7A 4ETCA 1LHLA 2ZYPA 3EMSA 3D3DA 1IO5A 1CKCA 2BQKA 1GXV2 1HMLA 2MEEA 2W1MA 4HJVA 1GB3A 5KXZA 4LT0A 2LYOA 1IWUA 4OOOA 1B7MA 1GB9A 1IP2A 1HNLA 2I26L 153LA 1LJKA 1JISA 1LYSA 3AGIA 1GF5A 4NGYA 4OOTA 1HFYA 1LSBA 2G4QA 4NIJA 4WM6A 4TTDA 5LAFA 3WW5A 4DD0A 4LYMA 2YBHA 5KXMA 1D0KA 2LYZA 2MEHA 5KXTA 1OUGA 1XGPC 3LZ2A 2F2NA 5APDA 2MEIA 1LKRA 1GB7A 3AW7A 1GPQC 1P2CC 5E4PA 1C7PA 1GAZA 3W3EA 4DD9A 1B5XA 4TX7A 1UA6Y 4H8XA 4ETEA 5LINA 4OWCA 1VFBC 2XTHA 5F81A 2MEDA 5ILFA 3LN2A 4H9IA 1BWIA 1AT5A 3EO5A 3HBHA 2YSSC 4LZTA 3ULRA 3W6DA 2ZIKA 4H9EA 2FYDA 5DLAA 4II8A 2I6ZA 4N8ZA 1GDWA 3AW6A 1FBIX 5LVIA 4XJGA 2HEDA 1REYA 3WW6A 1GE4A 2EQLA 1YIKA 4WM3A 5LIOA 4MR1A 5LXWA 1HFXA 1KXXA 1LJ3A 5KXXA 3B0OA 1GFEA 2HEFA 4LT3A 4H9AA 1D0LA 4FDYA 4NSIA 5KKJA 5DM9A 4ETDA 1W6ZA 4XENA 1IOSA 2HEBA 1GAYA 1LSDA 1BVKC 1ZVHL 1GBSA 2Z37A 4ZEEA 4H9BA 1GFRA 1VDPA 3RU5A 4DD3A 1LTMA 5LYTA 4N1EI 5LA8A 4YM8A 1N4FA 1B7PA 1V7TA 1IOTA 3WULA 5E9RA 3LYZA 4W94A 2F4AA 4RW2A 2XBRA 1IR7A 4XJDA 1FLYA 2BQOA 3AB6A 2YBNA 1QSWA 4N5RA 5I53A 4Z46A 5KJ9A 4RLMA 1WTNA 1NKHA 4M4OA 2FBBA 4RW1A 1O23A 4XN6A 4CJ2A 2BQEA 4LFPA 4KPMA 1JTPL 1PS5A 4DD7A 3P65A 3A6CY 1KIPC 1WTMA 3A34A 2YBJA 3AZ5A 1HERA 1LZEA 3CT1A 4WO6A 2Z19A 1VDQA 135LA 4NGIA 4YEMA 2HECA 1KIRC 1QIOA 1GE2A 4WM5A 5B1GA 3WYHA 4Z41A 2ZWBA 4ML7A 4W96A 5LVHA 2HU3A 3LYMA 1LMNA 2LYMA 1H6MA 2Z38A 1D0MA 5C6JA 133LA 2LZ2A 4B4IA 1LSCA 2D4JA 1GB6A 1Z55A 1NMMA 4MSTA 1GB2A 1GD6A 1XGTC 5KXRA 1IP1A 1LSPA 2CGIA 3TMUA 1LJJA 4LYCA 1F6SA 4E3UA 1IOQA 4GN5C 4OWEA 3QY4A 2DQEY 4NGKA 3HFMY 4TUNA 2BQJA 3B6LA 4LT1A 6LYTA 1NDMC 4B49A 1IOCA 1FLWA 1GF9A 1LZDA 2MEBA 4LYBA 1A4VA 4QDNA 1BVXA 1JPOA 3G3BB 1UBZA 1B5VA 1SQ2L 4GLVA 3CT0A 1VAUA 3WVXA 1BWJA 1LHMA 1C46A 5DL9A 5F9UA 1UCOA 3LYOA 2CJLA 4DDBA 4YF2A 2WARA 1B7RA 3TXIA 4ZIXA 4FJRA 3A3QA 4H94A 3HBDA 1GFTA 5KXYA 1YKZX 1WVVA 1B2KA 2ZQ4A 1JITA 1CKDA 1LSZA 2ZILA 5HLLA 1RE2A 1IP3A 4EOFA 1MELL 2ZYCA 1J1OY 1JUGA 5IHGA 5HMVA 1JKDA 1HFZA 2VB1A 5LA5A 1LJNA 1LZTA 5LVGA 2EKSC 1I20A 3TXEA 1WVUA 1FDLY 2Y8PA 3RT5X 1JJ3A 9LYZA 2HEEA 1BWHA 2Z2FA 5KXKA 2B5ZA 3WMKA 1G7IC 1GBXA 1XFPL 1DZBX 1EQ4A 1GF8A 2HUBA 4WLDA 3WVYA 3TXHA 1HEQA 1OUIA 5HQ1A 3WUNA 2YDGA 3N9CA 4HP0A 4D9ZA 1C45A 4LYOA 3A91A 3CSQA 1C10A 4QY9A 2I25L 1CJ6A 1D9UA 1LSAA 2Z12A 4WG1A 1GXXA 4HJZA 1JKAA 3TXDA 2BAAA 2NWDX 3W6AA 4ET9A 5LVKA 1W08A 2YBLA 2ZIJA 2XBSA 5JENB 5B1FA 4NG1A 4DC4A 5FCPA 4UWNA 1BB3A 3P66A 1QTEA 5HNLA 1LJGA 1F6RA 4NSHA 1IWWA 4NWEA 1IP6A 4GCEA 3IJUA 5I4WA 4A7DA 1AM7A 1JTOL 3N9EA 1IP4A 4TWSA 3A94A 4N9RA 1GF0A 2IHLA 5DN5A 4Z98A 3WPJA 1DKKA 3RW8A 4B4JA 1OUEA 1JSFA 3WPKA 1GEZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WQOA 1NF5A 3G3AB 1XEJA 4PJ2C 126LA 1LKSA 1OWZA 1CJ9A 1L44A 1YAOA 122LA 1H87A 249LA 1OUDA 1L17A 2YBMA 1P7SA 1GFKA 1HHLA 1C69A 1WQPA 5LYZA 222LA 4IASA 1LYHA 1QTHA 4NGWA 1LMAA 1RI8B 1G7HC 4CHXA 1LCNA 1L85A 1OVJA 4YOPA 4XJHA 1I56A 242LA 1IY4A 1CKGA 102LA 5APEA 5L3HA 1C6FA 3V2WA 1L07A 5APCA 3HU9A 4UWUA 4WG7A 1G0LA 2B6YA 151LA 128LA 4GCDA 2MEGA 1L34A 4OO9A 4LDLA 1IY3A 1ZV5L 1DYEA 4NGOA 4WM4A 3K3TA 1UC0A 1HC0A 180LA 1GWDA 4B4EA 2BPUA 3C82A 178LA 1UIAA 4HPEA 1CKFA 1GFUA 3EBAB 6LYZA 3AYQA 1EQ5A 123LA 4HJYA 1DI4A 1IP5A 1WQMA 1B0DA 1L31A 1GFGA 3L64A 4Z3MA 176LA 3DMVA 4CGEA 3L2XA 1D3NA 4U3XB 104LA 4NGLA 1B5WA 3DKEX 5EBHA 1KY1A 4GBRB 2DQHY 1L41A 1C6NA 1L90A 1OUAA 4DWXA 1B9OA 1L47A 3G3XA 3AZ4A 1G06A 1INUA 1LYDA 1LZNA 1QUSA 4NEBA 1GEVA 4GCCA 4NFVA 2QB0B 5APFA 1J1PY 5I54A 1OUFA 2RBQA 3C83A 1DPWA 1GF4A 216LA 1JIYA 3A6BY 4XJBA 4XJFA 1CJ8A 2W1LA 1LHJA 247LA 2BLYA 1L60A 3HT9A 5A3ZA 2BQDA 2DQGY 5T3FA 1LOZA 241LA 1V7SA 1XEKA 1LZ1A 2B6ZA 1IWTA 2LCBA 4EKRA 175LA 1C6MA 4G9SA 1BB6A 1G0GA 4W52A 4W58A 1GBZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1WQO A;  2A7D A;  4NSG A;  3HBE X;  1NF5 A;  1UIH A;  4R6C A;  1EQE A;  5M1Y A;  1LZ5 A;  4HTQ A;  3G3A B;  4NGV A;  1XEJ A;  2HTX A;  4PJ2 C;  1HEW A;  5B59 A;  1LKS A;  3CSR A;  4H9F A;  1CJ9 A;  1JWR A;  2DQJ Y;  1GFH A;  2EIZ C;  1YAO A;  3N9A A;  1GHL A;  1H87 A;  4NHP A;  4RLN A;  1LZ6 A;  2G4P A;  1QDT A;  1LMP A;  1IWZ A;  4WLY A;  1OUD A;  3J6K A;  4HTN A;  4OWH A;  1IR8 A;  1C43 A;  1GBY A;  2BQM A;  2YBM A;  1OUH A;  2IFF Y;  1GFK A;  1HHL A;  1LHI A;  4J0L A;  1WQP A;  4OWA A;  1GF7 A;  1GBW A;  1LMC A;  5KXN A;  4ZFP A;  4YEO A;  3M18 B;  5DN4 A;  2RSC A;  5LYZ A;  1LZS A;  1NQI A;  4LFX A;  3A3R X;  3B0K A;  4J7V A;  2D4I A;  2LZT A;  4WOA A;  4IAS A;  4NGW A;  1HEN A;  1LMO A;  3FI7 A;  1EL1 A;  1LMA A;  1RI8 B;  1GDX A;  5IEL A;  2H9J A;  1FLQ A;  1G7H C;  2W1X A;  4NHS A;  5K7O A;  4CHX A;  4AGA A;  1IC4 Y;  1LCN A;  1TAY A;  4N1C C;  1KXW A;  3A8Z A;  1LSY A;  5II3 A;  4PRQ A;  1LSN A;  1YAP A;  4YOP A;  4XJH A;  4H9C A;  3TXF A;  3BKH A;  1B7S A;  1I56 A;  1TDY A;  3GXK A; 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 1B5V A;  1SQ2 L;  4GLV A;  3CT0 A;  1VAU A;  3WVX A;  1BWJ A;  1LHM A;  1C46 A;  5DL9 A;  5F9U A;  1UCO A;  3LYO A;  2CJL A;  4DDB A;  4YF2 A;  2WAR A;  1B7R A;  3TXI A;  4ZIX A;  4FJR A;  3A3Q A;  4H94 A;  3HBD A;  1GFT A;  5KXY A;  1YKZ X;  1WVV A;  1B2K A;  2ZQ4 A;  1JIT A;  1CKD A;  1LSZ A;  2ZIL A;  5HLL A;  1RE2 A;  1IP3 A;  4EOF A;  1MEL L;  2ZYC A;  1J1O Y;  1JUG A;  5IHG A;  5HMV A;  1JKD A;  1HFZ A;  2VB1 A;  5LA5 A;  1LJN A;  1LZT A;  5LVG A;  2EKS C;  1I20 A;  3TXE A;  1WVU A;  1FDL Y;  2Y8P A;  3RT5 X;  1JJ3 A;  9LYZ A;  2HEE A;  1BWH A;  2Z2F A;  5KXK A;  2B5Z A;  3WMK A;  1G7I C;  1GBX A;  1XFP L;  1DZB X;  1EQ4 A;  1GF8 A;  2HUB A;  4WLD A;  3WVY A;  3TXH A;  1HEQ A;  1OUI A;  5HQ1 A;  3WUN A;  2YDG A;  3N9C A;  4HP0 A;  4D9Z A;  1C45 A;  4LYO A;  3A91 A;  3CSQ A;  1C10 A;  4QY9 A;  2I25 L;  1CJ6 A;  1D9U A;  1LSA A;  2Z12 A;  4WG1 A;  1GXX A;  4HJZ A;  1JKA A;  3TXD A;  2BAA A;  2NWD X;  3W6A A;  4ET9 A;  5LVK A;  1W08 A;  2YBL A;  2ZIJ A;  2XBS A;  5JEN B;  5B1F A;  4NG1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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