4XADA

Crystal structure of hen egg white lysozyme in complex with galf-glcnac
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Crystal structure of hen egg white lysozyme in complex with Galf-GlcNAc, an O-linked disaccharide core from Trypanosoma cruzi
rcsb
total genus 52
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-12-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4xadA00
5F14A 1IC7Y 4DT3A 1TDYA 4CHXA 1D0MA 2LYOA 3A3QA 2BQLA 3MGWA 3G3AB 4H9EA 1VATA 1B9OA 5KXMA 4LT3A 1YAOA 4GCBA 2BQOA 1IP3A 3W3EA 4IJ4A 1IWZA 1HEPA 3W6EA 132LA 4J1BA 4MSTA 1OUAA 1WVVA 1QSWA 1LSAA 3ATOA 2YBIA 3AJNA 1CJ8A 2G4QA 3WPKA 1FDLY 1CKHA 4LT1A 1C08C 1QQYA 4GLAA 1G7JC 1LHJA 4LGKA 5I4WA 4DDCA 1IP7A 4G49A 1DKKA 3KAMA 2MECA 5L9JA 3A95A 5C6IA 4X3BA 3RNXA 4RDSA 4RW1A 3SP3A 4DD9A 4HJVA 4H9FA 5HNCA 5LAFA 5FCPA 1GB0A 4LZTA 1GF5A 3GXRA 4WL7A 1UUZC 5FELA 2DQAA 5E9RA 4BAPA 4DD1A 4YEMA 3N9AA 4HV1A 2MEAA 5LXWA 4N1EI 1QUSA 1BWHA 2A7DA 2MEFA 1WQRA 5T3FA 2HEAA 2LZ2A 2HTXA 1LMCA 4O34A 1HMKA 1GBOA 4NG1A 7LYZA 5IDDA 1IWTA 1ALCA 1HENA 3D3DA 1GFJA 1BB5A 1LZ1A 5LVJA 4CFOA 4OOTA 4R0FA 1D9UA 1H6MA 1DQJC 2C8PA 5APFA 3W6BA 1CNSA 1GFKA 1JJ1A 1A2YC 1OUDA 2BQNA 1IC4Y 2XBRA 3CB7A 3FI7A 4ET9A 3TMVA 1IWUA 3F6ZA 5LYMA 1TAYA 1XSFA 3ZEKA 4TSBA 1CJ6A 4YF2A 1OUEA 1JKAA 1JKCA 1UA6Y 1J1XY 1LMQA 3A90A 1GB7A 3LYTA 193LA 5LAGA 3TXBA 1XGPC 1BWJA 1LTMA 3TMXA 4BADA 4C3WA 3QY4A 4TTDA 4B49A 1G7IC 4DD7A 4KXIA 4M4OA 4QDNA 1IR7A 3LYMA 3CQLA 3AYQA 4H91A 2BQJA 5F16A 9LYZA 3AW6A 2WARA 1GEVA 2EPEA 1BB7A 1IOTA 2XTHA 4WM6A 1GE2A 3G3BB 3B0KA 4YOPA 3AGGG 8LYZA 2MEHA 1LJNA 1I56A 1GBSA 1Z55A 1IEEA 1LZYA 1FLYA 4WO6A 2CWIA 1JSFA 2CGIA 1WQPA 5I54A 1DI3A 1B7QA 1WQNA 2ZWBA 194LA 1QTEA 2MEEA 4GN4A 2ZYPA 1B5XA 4HTNA 5KXWA 1LZBA 4XJBA 5KXOA 4W94A 1I20A 5ILFA 2G4NA 4OWHA 153LA 2YBMA 1OUHA 2LZTA 1XGRC 1IP2A 4WL6A 3LN2A 1GAZA 1GWDA 4H8XA 2NWDX 1VDQA 3A94A 1HEQA 5LYTA 1GFRA 1YKXX 4N0JA 1HSXA 1RJCB 2Z39A 3A34A 1UIBA 5DLAA 2HEFA 3TXEA 5J7CA 5L3IA 3M3UA 2F30A 3RT5X 3GXKA 1JISA 3HBEX 5C6JA 2I25L 4FJRA 3D9AC 1GFAA 4RW2A 1LJJA 1UIEA 4UWUA 5HNLA 2HECA 2FBDA 4QY9A 3IJVA 1GDWA 2Z38A 1NBZC 2BLXA 1YROA 1NF5A 2LYZA 2W1MA 1LPIA 2D91A 133LA 1IP5A 1BVKC 2MEDA 2ZQ4A 4LYCA 1W6ZA 2D4KA 5A3EA 2ZNWY 1WVUA 1JPOA 2Z37A 4TUNA 2YBHA 2F4GA 3CSRA 2Q0MX 3TXGA 2DQIY 5E4PA 1GFUA 1LZNA 4HSFA 1HERA 2LHMA 1B5VA 1OUJA 2HU1A 2VB1A 1OUBA 2HU3A 1FLUA 3OK0A 2W1LA 3RU5A 5K7OA 1INUA 4IASA 1JJ0A 2BQEA 3AGIA 3P64A 4CGEA 1JTPL 4J7VA 1DPXA 3CT0A 3WU8A 1XGQC 3IJUA 4NGIA 1LZEA 1LSEA 1NBYC 3AZ4A 2YDGA 5B59A 4H93A 2Z19A 3WUMA 1JTTL 1LYOA 1OUCA 1GBWA 4NHPA 1XEKA 1IOSA 4DWXA 1JUGA 2D6BA 4BS7A 1B7NA 2LYMA 3LYOA 1LZ9A 1BB6A 1LZ6A 2X0AA 1GAYA 4HPIA 4NWHA 4M6DA 2ZILA 1XEIA 4LT0A 1N4FA 3IWRA 5KJ9A 4L41A 1LZ5A 3P66A 4OOOA 5B1FA 4ZEEA 4DYGA 3WUAA 4R6CA 2DQDY 1DKJA 1UIHA 2CDSA 1IOQA 5EBHA 1B5YA 4EOFA 1NMMA 4EMNA 1V7SA 1LHKA 1VEDA 2D4IA 3W6CA 1XGTC 1VDSA 2YVBA 3TXFA 1GE0A 4NIJA 3WW5A 1MLCE 4PPOA 1GB2A 1IY3A 1GXXA 3AZ7A 5KXZA 3ATNA 2B5ZA 1BWIA 3QNGA 4ZFPA 1AM7A 1LZRA 4ETEA 2I6ZA 4WLDA 1GB5A 1LZSA 4YM8A 5IELA 1KXXA 1IP4A 4GN5C 1LHIA 1AT5A 2ZNXY 1GFTA 3A91A 1GEZA 1EQEA 1B7LA 2YBLA 2ZIJA 4C5FA 2MEBA 4XJDA 2Y8PA 4NSGA 2YBJA 1YKZX 1W08A 4LYMA 5HQ1A 4N8ZA 4WM2A 4DDBA 3QE8A 2IFFY 5D5CA 4NGZA 5LVKA 3WYHA 4G4CA 1GDXA 4LYOA 4WM4A 3WVYA 1LJEA 2FYCA 1B2KA 1BGIA 1GFVA 1GHLA 4PGJB 1ZVHL 2XBSA 3EBAB 5HLLA 1XEJA 2DBTA 4B0DA 4D9ZA 5F9UA 1BQLY 5KXKA 2BQAA 4HTQA 1KXYA 4KL7A 1V7TA 1VDPA 4HJZA 5KXYA 5JENB 1DXJA 4RLMA 1GE3A 1LMAA 1GPQC 1LSPA 5LA8A 1NHEA 3WU7A 5FEKA 4Z3MA 1JTOL 1WQMA 1B7MA 4UWNA 5B1GA 1B7PA 1YIKA 3WW6A 1LMNA 2G4PA 4DD0A 3LZ2A 4E3UA 4H9AA 1LSYA 1O23A 4NGVA 3W6DA 1LJKA 4H1PA 2IHLA 2C8OA 5LYZA 5KXTA 1GB9A 2F4AA 1QUTA 1TBYA 3WPJA 3ZVQB 1YKYX 2DQJY 3TXKA 3TXJA 1UIAA 135LA 1IORA 1UIFA 1GFHA 2CJLA 1IWWA 3T36A 3FE0A 1LJHA 1RI8B 3T6UA 5DN4A 3WPLA 1IO5A 1WTNA 4LFPA 3P4ZA 4DC4A 2BQBA 1RE2A 1HC0A 5ILCA 1LMOA 2BQGA 1JWRA 1HF4A 5LVGA 2EQLA 1NDMC 2BQCA 1G7MC 4NGLA 4OWAA 4NY5A 1XGUC 5B07A 4B4JA 2BLYA 3BKVA 2BAAA 4LYTA 5KXNA 5IHGA 4I0CA 1BHZA 4OWBA 4XADA 1HFZA 5KXRA 1HHLA 134LA 154LA 5KKIA 2I26L 1JIYA 4LYZA 5LVHA 1H87A 4WO9A 5DN5A 3CSZA 1UIDA 4W96A 4UWVA 2DKVA 3W6FA 1F0WA 1GBYA 1REYA 1WQQA 4QGZA 4XN6A 2MEIA 1ZV5L 1LZCA 4G9SA 1LSMA 4H9CA 1JKDA 1OUGA 4DD2A 5DL9A 3A6BY 1HNLA 1LJ3A 4NGJA 4AGAA 1HEMA 1GF3A 1QDTA 2N5ZA 1KIRC 2MEGA 1IC5Y 1BB4A 1YQVY 3LYZA 2Z18A 4MCKA 4NWEA 5FSTA 3WUNA 3EO5A 1RFPA 1LSGA 4PRUA 1CKCA 1GB6A 1IY4A 1UC0A 4PJ2C 1LYYA 2ZIKA 1J1OY 4A7DA 5LINA 3WU9A 1T3PA 1P2CC 4H92A 3ULRA 3B6LA 4H8ZA 1CJ9A 5D5FA 1GF0A 2DQCY 3ZVQA 4DD3A 4ZIXA 1NWGA 1C43A 3M18B 4B4IA 3J4GA 4TX7A 1JJ3A 1TEWA 4GCCA 1LAAA 2YSSC 4IATA 4GCFA 1LOZA 5APCA 4AXTA 1QDRA 1D0LA 1UIGA 1LMPA 4B4EA 1ZVYB 4OWEA 1MELL 3A93A 1HFYA 3N9EA 3WXUA 1F6RA 1A4VA 2F2NA 3CT1A 1D6PA 1GB3A 1OP9B 1AT6A 4H94A 2BQIA 1RCMA 3AZ6A 4NSIA 1LJFA 4PHIA 2YBNA 4H9HA 4XJIA 5I5QA 3TMUA 3TMWA 4H90A 4N1CC 1LSDA 4XJGA 5I53A 1BB3A 1IWVA 4NSJA 4XENA 1B5WA 1OUIA 2H9JA 5APDA 1JHLA 1IWXA 1HEOA 4HV2A 4TWSA 2EKSC 1WQOA 4LYBA 1B5ZA 1IVMA 4N5RA 1LKSA 1B7RA 4ETAA 5C6LA 4OW1A 1DI5A 1LHHA 1LKRA 2H5ZA 4N9RA 4NEBA 1FLQA 5HMJA 5FHWA 4WG7A 1IP6A 3J6KA 4TSCA 3OJPA 2Z2FA 5KY1A 2ZQ3A 4WLYA 1C7PA 1IR9A 1F10A 4HP0A 4Z98A 1LSFA 1GE1A 1GF7A 4NG8A 2BQKA 4LT2A 1GFGA 2BQDA 1B7OA 4NGWA 1G7HC 2Z2EA 5APEA 2RSCA 4NSHA 1YAQA 1GD6A 2H9KA 1LCNA 3RW8A 1GBXA 4WG1A 3A6CY 1JSEA 3HBDA 1GF6A 1LZTA 5FDJA 5LIOA 1IP1A 1NKHA 4NHIA 4MR1A 6LYZA 1BVXA 4YEOA 1GF9A 4U3XB 3B72A 4YENA 1GBZA 2W1YA 4OWCA 1G7LC 1D0KA 3WVXA 3AB6A 5AMYA 1LZGA 1FKVA 3A96A 1HELA 4Z41A 1LYZA 1LJ4A 1VDTA 2FBBA 1QIOA 1LMTA 5KXSA 1DI4A 1YAMA 4ET8A 6LYTA 2BQHA 4QEQA 4ML7A 1B0DA 4J0LA 1LSNA 4WLXA 5KXLA 1IIZA 1IX0A 4KPMA 1SQ2L 3CT5A 1YANA 4KT3A 1C10A 3WULA 1LZ8A 4HJYA 1LYSA 5HMVA 207LA 1JITA 5DM9A 2W1XA 1KIQC 4WMGA 1UBZA 3HFMY 4GN3A 4H8YA 1B7SA 2EIZC 4CJ2A 3WH1A 1E8LA 1GFEA 2DQEY 5LA5A 5B05A 3BKHA 2FYDA 1XFPL 2HUBA 4ETCA 5II3A 1TCYA 3K3TA 3AW7A 4BAFA 1CJ7A 1OQMA 3W6AA 3P65A 2PC2A 1LJIA 3LHMA 3E3DA 4GCEA 1C45A 1DPWA 2ZYCA 3EXDA 4NHQA 4WLTA 1JKBA 1QTKA 1VAUA 2DQFC 5LVIA 1CKDA 1YL1X 1C46A 1LZAA 1T6VL 4NHSA 1FLWA 1GF8A 2BPUA 3A3RX 1AKIA 1YAPA 1YILA 1KXWA 4I8SA 1LZDA 1LZ4A 4NFVA 1GB8A 3A8ZA 1AZFA 3HBHA 1HFXA 1LSZA 1WTMA 4G4HA 4CFPA 4NHTA 4Z46A 1LSBA 1IWYA 1UICA 1DZBX 3TXHA 1GE4A 2A7FA 2HEDA 4HPEA 4LFXA 1REZA 2DQHY 1D6QA 3AZ5A 208LA 1HEWA 1CKGA 3N9CA 4WM5A 1REMA 2Z12A 3CSQA 4G4BA 4RLNA 4ANRA 5L3HA 3VWOA 3B0IA 1IOCA 5B06A 1GXV2 1YL0X 4PRQA 1EL1A 5F9XA 1EQ4A 1QSAA 3WMKA 1LHMA 1LHLA 1OUFA 4NGKA 5I4XA 1UCOA 2HEBA 4GCDA 3EMSA 4WOAA 4XYYA 1F6SA 4ETDA 2AUBA 1REXA 2BQFA 4B1AA 1CKFA 5KXPA 4DDAA 1HMLA 2BQMA 4H9BA 3LZTA 4II8A 1KIPC 2HEEA 5F81A 1HSWA 4HTKA 1EQ5A 2GV0A 2XJWA 4H9IA 4XJFA 1FN5A 2D4JA 4P2EA 1NQIA 4J1AA 1SLYA 4WM3A 5A3ZA 3A67Y 3WXTA 1LJGA 1IR8A 1LSCA 1ZMYL 4WM1A 4ETBA 1PZYA 5KXXA 3TXDA 3AGHA 5I4YA 3P68A 2DQGY 5M1YA 1JEFA 3B0OA 4GLVA 1UACY 1FBIX 1FKQA 1NDGC 1VFBC 1PS5A 4NGOA 4NGYA 3TXIA 1GF4A 3RZ4A 5KKJA 1B5UA 1I1ZA 3A92A 4XJHA 3WL2A 1J1PY 4FDYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IC7Y 1LGWA 4DT3A 1CV1A 3G3AB 4LT3A 1YAOA 1IP3A 3GUPA 3W6EA 132LA 1LSAA 1L03A 181LA 1FDLY 1CKHA 4LT1A 195LA 4LGKA 5I4WA 4G49A 1DKKA 186LA 5L9JA 209LA 5HNCA 5LAFA 5FCPA 1GB0A 1GF5A 1UUZC 5E9RA 4EKRA 1QTDA 5LXWA 4N1EI 1BWHA 2A7DA 1L06A 1ZYTA 1LMCA 4NG1A 4LZMA 5IDDA 157LA 4E97A 1GFJA 1D9UA 1C6LA 1JJ1A 1G0KA 1TAYA 4TSBA 1OUEA 1J1XY 5LAGA 3TXBA 1XGPC 4BADA 4C3WA 4TTDA 257LA 4B49A 3LYMA 3CQLA 3AYQA 1L80A 129LA 3AW6A 4ARJA 3AGGG 2MEHA 1GBSA 1LZYA 1L25A 1WQPA 1D3JA 4I7TA 1L53A 3DN1A 4HTNA 5KXWA 217LA 1XGRC 227LA 4WL6A 3LN2A 1GAZA 5LYTA 1HSXA 1C6GA 1RJCB 1C6QA 2HEFA 1L26A 1C6BA 1L91A 4EXMA 1LYEA 4FJRA 5C6JA 4I7SA 4UWUA 2FBDA 1L23A 2BLXA 2LYZA 3TXEA 2ZQ4A 4LYCA 1IP5A 2ZNWY 4TUNA 1L56A 1LZNA 2VB1A 3CDOA 1OUBA 2HU3A 1FLUA 3OK0A 4IASA 1JJ0A 4CGEA 1JTPL 3WU8A 1L0KA 3WUMA 2OE9X 1L00A 1GBWA 4DWXA 1BB6A 1GAYA 3IWRA 1L85A 1L20A 2RB2X 4DYGA 1L72A 240LA 1NMMA 4EMNA 1VDSA 3TXFA 4NIJA 5LZMA 4ARMA 3WW5A 4PPOA 1GB2A 2B7XA 4GBRB 4WLDA 3C7YA 4YM8A 1KXXA 5I14A 4I7NA 1EQEA 1B7LA 2MEBA 4XJDA 1KW7A 152LA 5D5CA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5F14 A;  1IC7 Y;  4DT3 A;  1TDY A;  4CHX A;  1D0M A;  2LYO A;  3A3Q A;  2BQL A;  3MGW A;  3G3A B;  4H9E A;  1VAT A;  1B9O A;  5KXM A;  4LT3 A;  1YAO A;  4GCB A;  2BQO A;  1IP3 A;  3W3E A;  4IJ4 A;  1IWZ A;  1HEP A;  3W6E A;  132L A;  4J1B A;  4MST A;  1OUA A;  1WVV A;  1QSW A;  1LSA A;  3ATO A;  2YBI A;  3AJN A;  1CJ8 A;  2G4Q A;  3WPK A;  1FDL Y;  1CKH A;  4LT1 A;  1C08 C;  1QQY A;  4GLA A;  1G7J C;  1LHJ A;  4LGK A;  5I4W A;  4DDC A;  1IP7 A;  4G49 A;  1DKK A;  3KAM A;  2MEC A;  5L9J A;  3A95 A;  5C6I A;  4X3B A;  3RNX A;  4RDS A;  4RW1 A;  3SP3 A;  4DD9 A;  4HJV A;  4H9F A;  5HNC A;  5LAF A;  5FCP A;  1GB0 A;  4LZT A;  1GF5 A;  3GXR A;  4WL7 A;  1UUZ C;  5FEL A;  2DQA A;  5E9R A;  4BAP A;  4DD1 A;  4YEM A;  3N9A A;  4HV1 A;  2MEA A;  5LXW A;  4N1E I;  1QUS A;  1BWH A;  2A7D A;  2MEF A;  1WQR A;  5T3F A;  2HEA A;  2LZ2 A;  2HTX A;  1LMC A;  4O34 A;  1HMK A;  1GBO A;  4NG1 A;  7LYZ A;  5IDD A;  1IWT A;  1ALC A;  1HEN A;  3D3D A;  1GFJ A;  1BB5 A;  1LZ1 A;  5LVJ A;  4CFO A;  4OOT A;  4R0F A; 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 1CKD A;  1YL1 X;  1C46 A;  1LZA A;  1T6V L;  4NHS A;  1FLW A;  1GF8 A;  2BPU A;  3A3R X;  1AKI A;  1YAP A;  1YIL A;  1KXW A;  4I8S A;  1LZD A;  1LZ4 A;  4NFV A;  1GB8 A;  3A8Z A;  1AZF A;  3HBH A;  1HFX A;  1LSZ A;  1WTM A;  4G4H A;  4CFP A;  4NHT A;  4Z46 A;  1LSB A;  1IWY A;  1UIC A;  1DZB X;  3TXH A;  1GE4 A;  2A7F A;  2HED A;  4HPE A;  4LFX A;  1REZ A;  2DQH Y;  1D6Q A;  3AZ5 A;  208L A;  1HEW A;  1CKG A;  3N9C A;  4WM5 A;  1REM A;  2Z12 A;  3CSQ A;  4G4B A;  4RLN A;  4ANR A;  5L3H A;  3VWO A;  3B0I A;  1IOC A;  5B06 A;  1GXV 2;  1YL0 X;  4PRQ A;  1EL1 A;  5F9X A;  1EQ4 A;  1QSA A;  3WMK A;  1LHM A;  1LHL A;  1OUF A;  4NGK A;  5I4X A;  1UCO A;  2HEB A;  4GCD A;  3EMS A;  4WOA A;  4XYY A;  1F6S A;  4ETD A;  2AUB A;  1REX A;  2BQF A;  4B1A A;  1CKF A;  5KXP A;  4DDA A;  1HML A;  2BQM A;  4H9B A;  3LZT A;  4II8 A;  1KIP C;  2HEE A;  5F81 A;  1HSW A;  4HTK A;  1EQ5 A;  2GV0 A;  2XJW A;  4H9I A;  4XJF A;  1FN5 A;  2D4J A;  4P2E A;  1NQI A;  4J1A A;  1SLY A;  4WM3 A;  5A3Z A;  3A67 Y;  3WXT A;  1LJG A;  1IR8 A;  1LSC A;  1ZMY L;  4WM1 A;  4ETB A;  1PZY A;  5KXX A;  3TXD A;  3AGH A;  5I4Y A;  3P68 A;  2DQG Y;  5M1Y A;  1JEF A;  3B0O A;  4GLV A;  1UAC Y;  1FBI X;  1FKQ A;  1NDG C;  1VFB C;  1PS5 A;  4NGO A;  4NGY A;  3TXI A;  1GF4 A;  3RZ4 A;  5KKJ A;  1B5U A;  1I1Z A;  3A92 A;  4XJH A;  3WL2 A;  1J1P Y;  4FDY A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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