3W6AA

Crystal structure of cross-linked tetragonal hen egg white lysozyme soaked wiht 5mm [ru(benzene)cl2]2
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Solid Artificial Metalloenzymes: Post-Engineering of Porous Protein Crystals by Organometallic Complexes
rcsb
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3w6aA00
3A34A 4MSTA 4BS7A 1D0KA 3AW7A 1XSFA 4XJDA 3TXKA 5KXNA 5KXSA 4ET8A 2EPEA 5APCA 1LZCA 1GB3A 3W6DA 3IJUA 1V7TA 1UICA 2BLXA 1N4FA 4H9AA 1LSCA 5D5CA 3AZ4A 1H87A 3T36A 3TXJA 5ILFA 1IX0A 1JKDA 1H6MA 1C08C 1C7PA 2DQJY 2YVBA 5LVKA 1FBIX 2Z37A 1F6RA 2F4AA 4PPOA 3RW8A 2DQIY 4TWSA 1BB3A 4AXTA 1LZDA 2IHLA 2VB1A 1LMNA 3WMKA 4OWCA 1LZAA 5APDA 5I4XA 5I4WA 1LJGA 1B0DA 2YSSC 1JTTL 1JTPL 1LSPA 3BKHA 4CGEA 1XGTC 1HSXA 1LKSA 2BQNA 1XEKA 4C3WA 4WLTA 2NWDX 4LYMA 3W6EA 5C6LA 1UIFA 2Z39A 3CB7A 3W3EA 4HJYA 2HTXA 3B0IA 3FE0A 1GB8A 1JJ0A 1GF3A 4LYBA 4B0DA 5KY1A 1NBYC 1PZYA 1DI4A 1D6QA 1JKCA 1FN5A 1WQQA 4LT2A 1LSGA 1NDGC 2BQEA 5K7OA 4TSCA 5B1GA 1LSDA 2EQLA 1EQ4A 3B72A 4HJZA 5LVIA 4Z46A 4CJ2A 3LHMA 1HFXA 1HFZA 2RSCA 2HU3A 4NHTA 1LSBA 1QSAA 4GCBA 2ZQ3A 4NG8A 5B06A 3TMXA 3ATNA 1CJ8A 2BQCA 1OUAA 1P2CC 4XJHA 4LT0A 4NHQA 2D4KA 1HEPA 5KXYA 1KIQC 1GBOA 1XGRC 1GFTA 3WUMA 2I25L 4W94A 1LZTA 1NF5A 1IP5A 5HNLA 1CJ7A 1LMQA 2YBMA 4GCCA 4J1BA 1HFYA 4NSIA 5B07A 4WM3A 4DDBA 4DD7A 5LAFA 4BAPA 1WQMA 1C46A 1HERA 4H9CA 5KXTA 3WPJA 4J7VA 5DN4A 1GB5A 4G4HA 1LZYA 1JJ1A 3RT5X 4XENA 1IVMA 1YANA 1JSEA 2Z18A 2XBRA 1JTOL 2G4PA 4WLDA 1LPIA 4Z98A 4O34A 4QDNA 4WL7A 1GDWA 1LJ3A 4LGKA 3CSZA 1DPXA 3K3TA 1OUEA 1QDTA 4HV2A 4NSHA 1IOQA 2XTHA 2YBHA 1IR8A 4G9SA 4NEBA 1GFJA 4XJGA 3HBEX 1GBZA 4PRUA 1OP9B 2Z12A 1ALCA 4LYZA 1LZ5A 1SLYA 4B1AA 4XJFA 4XN6A 1OUCA 5I53A 1HMKA 1RCMA 2BQGA 5LA8A 1GE4A 5FCPA 5APEA 194LA 1B7MA 1IC5Y 1LHHA 1RFPA 2FYCA 1FLQA 1QIOA 2YBNA 2ZILA 1W6ZA 1KIPC 4HJVA 1DKJA 1IOCA 4NGJA 2F30A 2LHMA 2ZYPA 3AGHA 2HEEA 4N1EI 1KXYA 5LAGA 1AT5A 3HBDA 3QE8A 1I56A 3E3DA 1IWYA 1CKGA 4ANRA 1ZV5L 5C6IA 3N9AA 3TXBA 3OK0A 1B5WA 3A94A 1IP4A 3AZ6A 4YEOA 1KIRC 5KXZA 5B1FA 3N9CA 1GF8A 1MLCE 1GFUA 1VDQA 2LYMA 5LA5A 4J0LA 1LSYA 1V7SA 1UIBA 1DI5A 4Z41A 1VFBC 207LA 4WM6A 1CKHA 3LYTA 1LZ6A 3N9EA 4LYTA 4NHIA 3SP3A 1TBYA 1ZMYL 1XEJA 4W96A 2C8PA 1DZBX 4WO9A 4UWVA 4OW1A 1BHZA 1QTEA 4HTQA 5IDDA 1GB0A 3WXTA 4GN5C 3TXHA 4ETBA 1UUZC 1B7SA 3A93A 3QY4A 4BADA 1LHKA 1HEMA 1LJEA 5A3ZA 6LYZA 3CQLA 1IC7Y 3B6LA 1BB5A 1IWZA 1IWXA 4RW2A 1G7IC 1LHLA 5DL9A 1GBSA 2Y8PA 4H92A 1FLWA 2W1MA 4G4CA 2F2NA 4LYCA 1YILA 4R6CA 5DM9A 2YDGA 5FDJA 3P64A 2HECA 2DQHY 3WULA 3OJPA 4OWBA 4NGZA 1LYSA 4PGJB 1BGIA 1LHIA 3P66A 4UWNA 2MEIA 4DDAA 1C45A 4WM4A 4ETEA 1GF6A 134LA 1HMLA 2BQHA 2EIZC 4G49A 5E4PA 1IR7A 2HEBA 1UIEA 1BB4A 2F4GA 1VEDA 3B0KA 3G3BB 4L41A 1GF4A 3J6KA 3P68A 4TSBA 5E9RA 3P4ZA 5F9UA 2LZ2A 3WYHA 4GCFA 4XJIA 4WG7A 1CJ9A 5LYTA 4KXIA 5L3HA 1QDRA 1WQNA 1GAZA 1LMOA 208LA 2CWIA 1GB9A 1UACY 3ULRA 4ETAA 4HTKA 3LZTA 1B5XA 1B7QA 4P2EA 1FLUA 1UIDA 1O23A 1YKXX 3G3AB 5L9JA 2G4NA 1KXXA 1LZBA 5KXMA 2DQAA 3M3UA 3A3RX 1JEFA 2C8OA 4OWHA 4N5RA 1LSEA 3CT1A 2X0AA 1D9UA 4NIJA 1FDLY 1CKFA 1VDTA 4B4EA 1OUGA 3RZ4A 2LYZA 1DQJC 4OOOA 2BQLA 1IP2A 1LMTA 1UIHA 1LZ4A 2Q0MX 2DQGY 5HQ1A 2ZQ4A 2BQBA 4QY9A 1REZA 1GE1A 1JSFA 4WL6A 1GXXA 4WLXA 4RLMA 5I4YA 4H9HA 2LYOA 1UCOA 4NY5A 1GFRA 5LINA 3F6ZA 2HU1A 2H9JA 3RU5A 3WPKA 4GLAA 4ZEEA 1GF9A 1G7JC 1CKDA 1PS5A 1UC0A 4M6DA 5M1YA 3WVYA 4ETDA 1GFHA 1IP1A 4NGIA 8LYZA 4DD2A 1TDYA 1BWIA 4ET9A 4NGOA 2Z38A 1IP7A 1YL1X 4PHIA 1ZVYB 3EXDA 4RDSA 5KXPA 1IWTA 1YROA 3IWRA 1IOTA 1GBYA 4J1AA 1FLYA 1B5YA 1GFKA 4RLNA 1GBWA 1GE3A 2D4JA 2D6BA 2YBIA 1B7NA 4DD3A 2BQFA 2ZWBA 3TXGA 1IY3A 1VAUA 1GE2A 2DQCY 1KXWA 5FEKA 1F10A 5LYMA 1J1XY 1WQRA 153LA 1YAMA 1LJNA 1GBXA 4X3BA 3WPLA 1IWWA 4DWXA 4WM5A 1WQOA 3WUNA 1B7OA 1D0LA 1NMMA 1OQMA 1LHJA 1XEIA 4PJ2C 2BQMA 1JKAA 1YL0X 4YENA 3WU9A 1EL1A 1WTMA 1UIGA 1IR9A 4OWAA 4GN3A 2BQKA 1GEVA 2EKSC 5B59A 4NWEA 4TTDA 1REMA 4WM2A 4N1CC 5JENB 2W1XA 4FDYA 5LXWA 1LMCA 1LAAA 4YM8A 1HNLA 4M4OA 3GXRA 2FYDA 1IOSA 4G4BA 4H8YA 1HHLA 1IC4Y 3LN2A 5AMYA 1CNSA 4EMNA 1HEQA 2FBBA 1IP3A 4IASA 1GEZA 3TMWA 1LYYA 3WW6A 5IELA 4TX7A 3J4GA 1EQ5A 1AM7A 1B7LA 5HLLA 5L3IA 4GN4A 1LSAA 5F9XA 5KXRA 2CJLA 1QUSA 3MGWA 4IJ4A 4NHPA 4DD0A 5EBHA 1HF4A 5II3A 5LVHA 2CGIA 4DDCA 5KKIA 4H1PA 2ZNXY 4NGWA 1GDXA 1REYA 1GFEA 5KXKA 4R0FA 1JWRA 7LYZA 1TEWA 2DBTA 4XYYA 1BQLY 4NSGA 1XGQC 3EO5A 4NG1A 1LMAA 1UA6Y 2HEDA 1VATA 4WO6A 1GHLA 4HPEA 1NWGA 1LKRA 1TAYA 2YBLA 1JJ3A 3D3DA 1WTNA 1GE0A 3TMUA 4MCKA 4LFXA 3CT5A 2CDSA 4WM1A 1IORA 4WOAA 5FELA 4LYOA 1RE2A 2GV0A 3ATOA 1BWJA 3GXKA 1RI8B 1E8LA 2MEGA 2A7FA 3CSRA 1LTMA 1LYOA 1WQPA 1YAQA 5KXXA 5LVGA 1GXV2 1TCYA 3EMSA 4LT1A 2Z2FA 3HBHA 3LZ2A 1EQEA 1G7LC 1FKVA 4B4IA 3D9AC 2MEDA 1YQVY 3A95A 1GF7A 9LYZA 1YKZX 4NFVA 3W6BA 4NGYA 5LIOA 3CSQA 1HENA 1LZEA 1LSNA 1A2YC 1B2KA 1FKQA 2AUBA 1LZRA 2HEFA 5LVJA 4YOPA 1GF0A 1LMPA 5IHGA 1IWUA 4UWUA 2BPUA 1JKBA 4YEMA 3LYZA 1LSFA 4XADA 4GCEA 1BWHA 3W6AA 4ML7A 4ETCA 2DQDY 1JPOA 4WLYA 4XJBA 2YBJA 1OUBA 2BAAA 4HPIA 4QEQA 1JITA 1HELA 3VWOA 5F81A 4H8XA 1W08A 3QNGA 154LA 3FI7A 1GB6A 1LJHA 135LA 3A6BY 1GPQC 4WMGA 1LHMA 3AB6A 2MEAA 1OUJA 1IIZA 4GLVA 4H9EA 3RNXA 4ZIXA 3BKVA 4QGZA 5I54A 3WU7A 2BQIA 1JIYA 4LFPA 4LZTA 4E3UA 1DPWA 1XFPL 1LZ8A 2B5ZA 1LZSA 1JUGA 1B5VA 5A3EA 4OWEA 1NQIA 5D5FA 5FSTA 1AKIA 4H8ZA 4B4JA 4II8A 4NGLA 3A91A 4ZFPA 3TMVA 5HMVA 3TXIA 1NKHA 1T3PA 1NHEA 4H91A 4OOTA 1F0WA 4A7DA 3A92A 2N5ZA 1B5ZA 3A6CY 3LYOA 4IATA 1LJIA 4MR1A 1SQ2L 1C43A 4HTNA 1D0MA 1DXJA 1NDMC 1VDPA 3AZ5A 1GFGA 1GB2A 1GFVA 2BQDA 2MEFA 5KXLA 1T6VL 2ZIJA 1GAYA 2DKVA 1ZVHL 2FBDA 4EOFA 1OUHA 4KL7A 1B7RA 3AGIA 2XBSA 1IWVA 1GD6A 5FHWA 1XGUC 1YAOA 4DT3A 4U3XB 3TXEA 1OUIA 1QSWA 2ZYCA 3A96A 4H9IA 4N9RA 3WH1A 5B05A 3W6FA 4CFOA 2H5ZA 3W6CA 1BVKC 2DQFC 1C10A 3AJNA 3AYQA 4NSJA 2PC2A 1IEEA 5C6JA 3HFMY 6LYTA 1LJJA 1QUTA 3CT0A 1D6PA 2BQJA 2DQEY 3WVXA 2D4IA 2XJWA 2G4QA 1LSZA 3KAMA 4H90A 4B49A 2W1LA 4HSFA 4DD9A 1Z55A 2ZIKA 5HMJA 1YAPA 2Z2EA 1LZNA 5HNCA 1WVUA 3TXDA 3WW5A 2I6ZA 5KXOA 1QTKA 1UBZA 1XGPC 1B5UA 2MEBA 3WUAA 5LYZA 2MECA 1JISA 1LOZA 3M18B 1DKKA 3A67Y 4LT3A 1CJ6A 2BQAA 3WXUA 4NGVA 1IO5A 1LJKA 3AW6A 1LZ1A 4CHXA 1LJFA 1F6SA 2MEEA 4NWHA 1I1ZA 2H9KA 1MELL 133LA 1B9OA 1UIAA 2W1YA 4KT3A 5I5QA 1J1OY 1I20A 4DD1A 4YF2A 1WVVA 2HEAA 5J7CA 2BLYA 4WG1A 3TXFA 1OUFA 1BB7A 1LYZA 1REXA 4HV1A 4DC4A 3LYMA 1HSWA 1YIKA 4I0CA 4FJRA 2WARA 4H94A 3P65A 4TUNA 1GFAA 4KPMA 3T6UA 1NBZC 4H9FA 1RJCB 4N0JA 4C5FA 1HEWA 4NGKA 4I8SA 2MEHA 3ZEKA 1J1PY 4GCDA 5DLAA 3WU8A 2IFFY 3AZ7A 4DYGA 1YKYX 4D9ZA 193LA 4Z3MA 1JHLA 3EBAB 5T3FA 3ZVQA 132LA 1G7MC 4AGAA 1G7HC 3A90A 1OUDA 1LSMA 1HEOA 1BVXA 2LZTA 4H9BA 5F16A 1INUA 2I26L 1LJ4A 5APFA 4HP0A 3WL2A 1VDSA 2HUBA 4H93A 5KKJA 4BAFA 2ZNWY 1A4VA 2A7DA 2Z19A 1LZ9A 1HC0A 1AZFA 4CFPA 1LZGA 1AT6A 1B7PA 3A8ZA 1IP6A 1IY4A 1DI3A 1GWDA 1QQYA 2D91A 5F14A 1LCNA 4NHSA 5KXWA 3A3QA 4RW1A 1GF5A 3ZVQB 1GB7A 1BB6A 4N8ZA 5ILCA 3IJVA 1CKCA 5KJ9A 2BQOA 4PRQA 3AGGG 5DN5A 3B0OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AW7A 3CDQA 1D3NA 180LA 1N4FA 5D5CA 1CV5A 1L47A 2RB1X 1C6FA 3EMLA 1C7PA 2YVBA 2Z37A 224LA 4I7OA 2DQIY 4AXTA 1C6AA 2VB1A 1LMNA 244LA 1LJGA 1JTTL 1LGWA 4WLTA 176LA 5I14A 1L01A 4I7LA 5KY1A 1GB8A 1JJ0A 1PZYA 1WQQA 4LT2A 137LA 5LVIA 4CJ2A 2RSCA 173LA 2F32A 168LA 4NG8A 3TMXA 126LA 4YX7C 2BQCA 1OUAA 4LT0A 1GBOA 1C6CA 1NF5A 1IP5A 1CJ7A 1LMQA 1HFYA 1L87A 4H9CA 1L27A 167LA 1GB5A 226LA 1IVMA 1JSEA 2OE9X 1LPIA 1D2YA 1DPXA 1L86A 1QUDA 1GBZA 4PRUA 1OP9B 4LYZA 2Q9EA 1SLYA 4XN6A 1L75A 1HMKA 214LA 1RFPA 1W6ZA 1IOCA 1D3FA 227LA 2F30A 4NGJA 1QUGA 2HEEA 1IWYA 1CKGA 1I6SA 5C6IA 1C63A 1IP4A 3AZ6A 4YEOA 1KIRC 5B1FA 3HT6A 1GF8A 5LA5A 112LA 1L00A 207LA 2QARC 4NHIA 3SB5A 3SP3A 1ZMYL 1SSWA 4UWVA 1QTEA 1GB0A 1B7SA 1G0LA 2B6YA 1LHKA 1L24A 1IWXA 4RW2A 1LHLA 2OE4X 2F2NA 5DM9A 4R6CA 175LA 192LA 2YDGA 4NGZA 4PGJB 1LHIA 1LGXA 2RBPA 1C45A 2BQHA 2EIZC 3J6KA 3P68A 4I7KA 230LA 4GCFA 1LI6A 5LYTA 4KXIA 1L04A 1QDRA 2CWIA 1UACY 3ULRA 2B6WA 3LZTA 1YKXX 2OU0X 3CT1A 4OO9A 1CUPA 1D9UA 1FDLY 1CKFA 2B6XA 1DQJC 1IP2A 1LMTA 151LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3A34 A;  4MST A;  4BS7 A;  1D0K A;  3AW7 A;  1XSF A;  4XJD A;  3TXK A;  5KXN A;  5KXS A;  4ET8 A;  2EPE A;  5APC A;  1LZC A;  1GB3 A;  3W6D A;  3IJU A;  1V7T A;  1UIC A;  2BLX A;  1N4F A;  4H9A A;  1LSC A;  5D5C A;  3AZ4 A;  1H87 A;  3T36 A;  3TXJ A;  5ILF A;  1IX0 A;  1JKD A;  1H6M A;  1C08 C;  1C7P A;  2DQJ Y;  2YVB A;  5LVK A;  1FBI X;  2Z37 A;  1F6R A;  2F4A A;  4PPO A;  3RW8 A;  2DQI Y;  4TWS A;  1BB3 A;  4AXT A;  1LZD A;  2IHL A;  2VB1 A;  1LMN A;  3WMK A;  4OWC A;  1LZA A;  5APD A;  5I4X A;  5I4W A;  1LJG A;  1B0D A;  2YSS C;  1JTT L;  1JTP L;  1LSP A;  3BKH A;  4CGE A;  1XGT C;  1HSX A;  1LKS A;  2BQN A;  1XEK A;  4C3W A;  4WLT A;  2NWD X;  4LYM A;  3W6E A;  5C6L A;  1UIF A;  2Z39 A;  3CB7 A;  3W3E A;  4HJY A;  2HTX A;  3B0I A;  3FE0 A;  1GB8 A;  1JJ0 A;  1GF3 A;  4LYB A;  4B0D A;  5KY1 A;  1NBY C;  1PZY A;  1DI4 A;  1D6Q A;  1JKC A;  1FN5 A;  1WQQ A;  4LT2 A;  1LSG A;  1NDG C;  2BQE A;  5K7O A;  4TSC A;  5B1G A;  1LSD A;  2EQL A;  1EQ4 A;  3B72 A;  4HJZ A;  5LVI A;  4Z46 A;  4CJ2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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