1IR9A

Im mutant of lysozyme
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKMVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords lysozyme
publication title Tolerance of point substitution of methionine for isoleucine in hen egg white lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Gallus gallus
total genus 51
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2001-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ir9A00
1HF4A 3W6DA 4D9ZA 2YBHA 1WQQA 1IC4Y 4N1EI 1LJ3A 1LMNA 1C10A 1B5VA 1QSAA 1GFAA 3WH1A 4B1AA 2C8PA 2HEEA 2W1YA 2YBNA 2IFFY 2MEGA 1IP5A 1LZGA 3IJVA 4DD7A 4Z41A 1BB4A 2MEIA 1D6QA 4ET8A 5KXMA 1CJ6A 3LZTA 4HJYA 1WVUA 3RW8A 3P68A 1LZSA 2BQMA 4DDBA 1GFTA 3B6LA 1JHLA 4XADA 4XJGA 3A93A 1ZVHL 1YKYX 4NGKA 1QTKA 1CKDA 4B49A 3A94A 1BB5A 1GB9A 4J7VA 1VDSA 4QY9A 1ZMYL 1DI3A 1LZDA 1JKAA 1REYA 3GXKA 1DXJA 2DQDY 2HEAA 2B5ZA 1HNLA 1AZFA 1QSWA 2Y8PA 3LYTA 4HV1A 3AZ5A 2D4IA 4LT1A 1XGTC 3AGIA 1EQEA 4YF2A 1GFUA 1NDGC 1FKVA 3FI7A 1LZ6A 1B5XA 3P4ZA 4W94A 4W96A 3CB7A 4J1BA 1LSEA 3B0KA 2H9KA 5IHGA 4H9AA 4GCCA 1IY3A 1RCMA 2Z2EA 1HFYA 3TMVA 4LYCA 1DQJC 1JJ3A 4BS7A 1LHKA 3A67Y 3AB6A 1GB7A 2XBSA 1GPQC 3T36A 2Z2FA 1GF9A 1REXA 2BQJA 5DL9A 5KXZA 2N5ZA 1AM7A 1BGIA 2W1LA 1WQNA 4ZFPA 4R6CA 1EL1A 1HEMA 2G4QA 1LHIA 1LZ9A 1SLYA 1VFBC 2ZILA 4YEOA 4C3WA 4CJ2A 1WVVA 1YAQA 4IASA 5B1GA 1JKCA 4LFXA 3AZ4A 4NGVA 4WOAA 4YENA 5KXPA 5LINA 1FKQA 1FLWA 4A7DA 5APCA 5I4YA 2BQIA 4H92A 2YBMA 1GF3A 1B7QA 1GB2A 4GN3A 2BQLA 2MEEA 3P66A 1UIEA 2YVBA 4HTKA 1TBYA 4CGEA 2BQOA 5LA8A 3WL2A 1NBZC 3HFMY 4TX7A 4XJHA 1ALCA 5E4PA 4BAPA 1GDWA 4GCBA 5FSTA 1UCOA 2YDGA 4UWUA 4ETEA 1OUCA 2D4KA 1GE3A 3KAMA 4RW2A 4U3XB 4BAFA 5HQ1A 1DZBX 1KIRC 1F0WA 2ZWBA 1T3PA 5LVKA 1LYOA 3ATOA 3BKHA 3M18B 4NG1A 3E3DA 1GFEA 1LTMA 5A3ZA 4M4OA 5EBHA 4HTQA 6LYTA 1YAPA 4NHQA 2BLXA 4NSGA 4LYTA 3W6CA 1IOCA 1LMPA 1JSEA 2I6ZA 5LVGA 4PRQA 3AJNA 4NGLA 1HHLA 2DQFC 1XGPC 5I4WA 1GFJA 4DDAA 4ML7A 3CT0A 2D6BA 1G7HC 4DDCA 1XGQC 4DD3A 1YIKA 4NY5A 3TXJA 2ZIJA 3IWRA 5LYMA 1WQMA 1LMTA 1FLYA 2C8OA 3W3EA 4WM2A 1VDQA 2Z37A 5LXWA 1GB3A 4N8ZA 1UIGA 2Z18A 1EQ4A 2BQCA 4N0JA 4OWBA 1HC0A 1PZYA 4ZEEA 3ZEKA 3AW6A 1GDXA 2EPEA 1IEEA 5B07A 4PGJB 1C7PA 5A3EA 2ZYPA 1GAZA 2G4PA 4HSFA 1HFXA 1BWJA 3ATNA 4LZTA 1QDRA 1QTEA 4TTDA 1CKFA 2AUBA 3OJPA 1OUFA 3N9EA 1GF8A 5F9XA 3ZVQA 1VDPA 5T3FA 1RJCB 1F10A 2HEDA 1FDLY 2Z39A 4RLNA 5I4XA 1GBZA 1VAUA 1NBYC 2BQKA 1B7NA 1BHZA 5B1FA 1AT6A 1XGUC 4FDYA 1GBWA 1D6PA 4GLVA 4LFPA 4PJ2C 4UWVA 2RSCA 3TXGA 1GF4A 4AXTA 5F14A 1Z55A 2MECA 1BB6A 1LSGA 4P2EA 1OUEA 3WPLA 3RNXA 1LKSA 3A6BY 1IP4A 5I53A 4H9BA 1CKGA 1GF7A 1LMQA 1OUBA 1TEWA 4Z46A 1ZV5L 2HECA 4ET9A 4ZIXA 1B7PA 4H8ZA 1JJ1A 1LZEA 1UIDA 2FBBA 1RE2A 4GN4A 1LPIA 2HTXA 1B7RA 4NGJA 5APDA 1N4FA 3T6UA 1NMMA 4TSBA 1H6MA 5D5FA 1B5UA 5DN5A 4I0CA 2MEFA 2MEBA 2ZIKA 9LYZA 1LMCA 4GCEA 4XENA 2H5ZA 1NKHA 3AZ6A 5KY1A 1KXXA 132LA 4MCKA 2DQGY 1GE4A 4NHTA 1LZ1A 1XEJA 4ETBA 1LJKA 1GHLA 1V7SA 5F81A 1UBZA 2F30A 1OUHA 3WYHA 4CFOA 4EOFA 1SQ2L 4RLMA 3WXUA 4DT3A 5B59A 3WW5A 5KXXA 1GE2A 1YL0X 4OW1A 2EIZC 1JITA 5LVJA 1W6ZA 3G3BB 4FJRA 1LZAA 4ETDA 4Z98A 4LYOA 1JWRA 3B0IA 2FYDA 2YBIA 4O34A 4X3BA 3A3QA 1FN5A 1LCNA 4HTNA 3WUNA 3WU8A 5DN4A 5E9RA 3RT5X 2DQIY 3AZ7A 2FYCA 1J1OY 4ANRA 5KKJA 4WG7A 1JIYA 1GF0A 4LYBA 1LSFA 3B72A 4QEQA 5F9UA 5LVIA 3RU5A 1GB6A 1GF5A 1JTTL 5FELA 1CKHA 2WARA 1ZVYB 2EQLA 3WUAA 1IR7A 1GFVA 4G4HA 194LA 1LMOA 2DQEY 1XEKA 1B0DA 1RI8B 3LYMA 4C5FA 4HV2A 4XYYA 1LSCA 1AT5A 4Z3MA 3A91A 3TXIA 4UWNA 1UUZC 1IOQA 4M6DA 1LKRA 3CSQA 4OWCA 5KJ9A 1IIZA 4GCFA 1IORA 3TXFA 2IHLA 4OOTA 2YBLA 1GB0A 2BQBA 4WMGA 1NWGA 2BQNA 4J0LA 4LT3A 4XJDA 1G7MC 1LSAA 1LSPA 1IY4A 3LYZA 4HJZA 3CSZA 1F6RA 2BQGA 5KXLA 1OUJA 1B7MA 133LA 4R0FA 4H94A 4NIJA 1B9OA 1UIHA 1VATA 1JPOA 1V7TA 4RW1A 2I25L 4XJFA 1AKIA 1FLUA 3TMXA 1HMLA 4DD0A 1QDTA 5C6LA 5FHWA 4NGOA 134LA 1LOZA 1NDMC 1LJFA 1JEFA 2DKVA 5K7OA 2MEHA 4XN6A 1QUSA 1CJ8A 193LA 4KXIA 5IDDA 1NHEA 1B7LA 1BB7A 4OOOA 2BQFA 5FCPA 4HPIA 1LJJA 3A3RX 4DYGA 4KL7A 4B4EA 4NHPA 1UC0A 1XSFA 3WPJA 4DC4A 5JENB 1HEQA 1RFPA 3A90A 1UIAA 1WQPA 1DI4A 2BQEA 1IO5A 1DPWA 3A6CY 3WXTA 3J4GA 4NEBA 3ZVQB 4WO9A 1UACY 5DM9A 2ZQ3A 4LT2A 1LSMA 1EQ5A 1LJEA 4G49A 2D4JA 4N1CC 1I1ZA 2DQJY 1B7OA 4N9RA 4WM5A 4NGYA 4WM4A 1CNSA 3VWOA 3A92A 4LT0A 1JKBA 1B5ZA 2MEDA 4PRUA 2XJWA 4PHIA 4NFVA 1GWDA 4XJIA 3WW6A 3MGWA 1IP1A 1G7LC 1HENA 3CQLA 4PPOA 3RZ4A 1WQRA 1LZ8A 5C6JA 1HSXA 2FBDA 1GD6A 1YL1X 4GCDA 5L3HA 1C08C 2DQCY 1HMKA 1GAYA 2EKSC 1OP9B 1G7JC 1DI5A 7LYZA 4LYZA 3WVXA 2F4AA 1YANA 5KXTA 1OUAA 2LYMA 4QDNA 4HJVA 3QNGA 1HEOA 5J7CA 2DQAA 1BWIA 2A7FA 4DD2A 1GEVA 8LYZA 4H9FA 1DKKA 1GXV2 1TAYA 1IWTA 1HFZA 1D9UA 1REMA 2HU1A 1WTMA 4G9SA 4NWEA 1E8LA 4TSCA 1O23A 3LN2A 1XEIA 1PS5A 2BPUA 3EO5A 4H9HA 5FDJA 4XJBA 1LZ4A 1CKCA 135LA 1GBXA 2BQAA 4E3UA 1YKXX 2LYZA 3A8ZA 4B4IA 2DQHY 4ETAA 5KXWA 4WLYA 2CDSA 2ZYCA 4H1PA 5KXKA 4GN5C 4WL7A 1C46A 1GFRA 1LZBA 1REZA 3IJUA 3EBAB 4L41A 1VEDA 2YBJA 2BLYA 2ZNWY 1KXWA 4WG1A 4EMNA 1LZYA 3BKVA 4HP0A 5C6IA 4B4JA 1A2YC 3A34A 2D91A 4N5RA 2MEAA 1BQLY 1YAOA 4G4CA 4I8SA 5HMVA 5LVHA 1IP7A 1IOTA 1LJHA 4H9IA 5ILCA 1OUDA 4YOPA 1IR8A 1LHHA 208LA 1C43A 1GBSA 5II3A 4MSTA 3TMWA 2ZQ4A 1IC7Y 3WVYA 1QIOA 1LJIA 4WL6A 5ILFA 4WM1A 1LZTA 3LZ2A 4NHSA 3M3UA 1UIFA 4B0DA 1BB3A 1FLQA 1NQIA 1UA6Y 4HPEA 4WO6A 4H8YA 3K3TA 4OWHA 2X0AA 1YAMA 3AGGG 4DWXA 3FE0A 2LZTA 1GBOA 5LIOA 5M1YA 1JKDA 153LA 1IP3A 1BVXA 3AGHA 5LA5A 3OK0A 1VDTA 3CT5A 2DBTA 1D0KA 1B2KA 1LJNA 2BQDA 2PC2A 4H90A 4NGWA 1LMAA 5KXYA 1UICA 3F6ZA 1IWUA 3LYOA 5LAFA 3WU7A 1GXXA 1JJ0A 4BADA 1J1XY 1GEZA 2Z19A 3WUMA 1INUA 2H9JA 4H9CA 4II8A 2W1MA 5I54A 3TXHA 2W1XA 1P2CC 3A96A 1LHJA 5HNCA 2Z38A 4NHIA 1IVMA 3N9CA 2Q0MX 5FEKA 4RDSA 1HERA 6LYZA 4WM6A 4DD9A 1CJ9A 1CJ7A 2F2NA 1GE0A 2F4GA 4OWAA 1IP2A 3D3DA 3TXEA 2VB1A 3LHMA 1I56A 1IWYA 4H9EA 4IATA 1JISA 1LJ4A 1NF5A 5L3IA 5APFA 4H8XA 5KXNA 1XFPL 2LHMA 4NGZA 1JTOL 2BQHA 1WTNA 4KT3A 3W6AA 3J6KA 2LYOA 1IP6A 1D0LA 1KIPC 3EMSA 3TXBA 4LGKA 3TMUA 1JUGA 1MELL 5HMJA 1QUTA 1LSBA 2A7DA 1BWHA 1D0MA 3B0OA 1GFHA 1TCYA 1TDYA 1LZCA 1GB5A 207LA 3P64A 3W6EA 1LAAA 1J1PY 2HEFA 5KKIA 4WM3A 2GV0A 4GLAA 2G4NA 2XBRA 1OQMA 1B5WA 1LYSA 3TXDA 1YILA 3WPKA 2Z12A 1T6VL 4YM8A 1WQOA 3HBEX 1LYYA 5KXRA 3WULA 4H91A 3AW7A 5AMYA 1GB8A 1LHLA 3GXRA 3G3AB 3A95A 1LZRA 3QY4A 1LHMA 4TUNA 4CHXA 1G7IC 2HEBA 4NSJA 5L9JA 1YQVY 1HSWA 1KIQC 1GFKA 1LSDA 5HLLA 1DPXA 4NSIA 1GF6A 4OWEA 4AGAA 5KXOA 1IC5Y 1W08A 3HBDA 4CFPA 2CGIA 3ULRA 1GBYA 1QQYA 3D9AC 3P65A 4LYMA 2LZ2A 2ZNXY 2HUBA 3HBHA 4IJ4A 5HNLA 1OUGA 3WMKA 1LSYA 1F6SA 4KPMA 4NGIA 1JSFA 1UIBA 5APEA 1IWZA 5B06A 1MLCE 1BVKC 2CWIA 2HU3A 5IELA 3EXDA 3WU9A 3QE8A 1LJGA 4TWSA 2BAAA 5KXSA 4QGZA 4ETCA 1IOSA 4WLXA 2CJLA 5F16A 1IR9A 1IX0A 154LA 1I20A 1GFGA 1OUIA 2NWDX 1LZNA 4H93A 1XGRC 1KXYA 1YROA 1B7SA 1FBIX 5DLAA 1JTPL 1C45A 1IWVA 4G4BA 3TXKA 1IWWA 1LSNA 4WLDA 1A4VA 1H87A 4J1AA 4NWHA 5I5QA 1LSZA 1HEPA 1IWXA 1DKJA 2YSSC 3W6FA 1B5YA 3W6BA 4MR1A 3N9AA 5D5CA 1YKZX 1HELA 4NSHA 1GE1A 1LYZA 4YEMA 1HEWA 4DD1A 5LAGA 4WLTA 3SP3A 4NG8A 3CSRA 3CT1A 5LYZA 5LYTA 3AYQA 5B05A 2XTHA 2I26L 1LZ5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L52A 1IC4Y 1C10A 3WH1A 2B6ZA 2IFFY 1P64A 1L97A 1BB4A 1L68A 1D6QA 1KS3A 1CJ6A 4HJYA 3GUJA 3B6LA 4NGKA 177LA 1CU5A 1GB9A 1REYA 1C62A 1DXJA 1L43A 3LYTA 2Y8PA 2D4IA 4LT1A 1XGTC 1FKVA 1LZ6A 1B5XA 4W96A 1QSBA 151LA 4GCCA 1IY3A 4YXCA 113LA 1HFYA 3A67Y 2XBSA 2LCBA 2Z2FA 1GF9A 169LA 1WQNA 1LZ9A 4CJ2A 4YEOA 1C6JA 156LA 1YAQA 3SB5A 1JTNA 3AZ4A 4WOAA 5KXPA 5APCA 2YBMA 1B7QA 2MEEA 4HTKA 157LA 1LI6A 3HFMY 1ALCA 4BAPA 1GDWA 4UWUA 3DN6A 7LZMA 4BAFA 5HQ1A 1KIRC 1T3PA 4M4OA 4W58A 1GFEA 6LYTA 1YAPA 4NHQA 4LYTA 4W51A 5LVGA 1L34A 1L31A 1L33A 1XGPC 4DDAA 3CT0A 2D6BA 1YIKA 2ZIJA 3IWRA 1LMTA 1CUPA 1FLYA 1EQ4A 212LA 4N0JA 3AW6A 1GAZA 1BWJA 1QDRA 4EJ4A 2B70A 1FDLY 4RLNA 200LA 1BHZA 1AT6A 1L47A 1CU3A 3DMVA 2RSCA 3TXGA 4ZPUA 1Z55A 1SX2A 1BB6A 1LSGA 1LKSA 1T8FA 1IP4A 119LA 1LMQA 1TEWA 2HECA 4ET9A 4ARQB 1JJ1A 2FBBA 1RE2A 198LA 2HTXA 4NGJA 1L83A 3HH6A 1N4FA 1C63A 1NMMA 4W56A 2HUMA 125LA 2H5ZA 1NKHA 5KY1A 1L51A 1LZ1A 4I7RA 228LA 1V7SA 2XQOA 2F30A 1L89A 1CX7A 1DYDA 1YL0X 1L11A 4OW1A 2EIZC 1JITA 4ETDA 3G3BB 4FJRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1HF4 A;  3W6D A;  4D9Z A;  2YBH A;  1WQQ A;  1IC4 Y;  4N1E I;  1LJ3 A;  1LMN A;  1C10 A;  1B5V A;  1QSA A;  1GFA A;  3WH1 A;  4B1A A;  2C8P A;  2HEE A;  2W1Y A;  2YBN A;  2IFF Y;  2MEG A;  1IP5 A;  1LZG A;  3IJV A;  4DD7 A;  4Z41 A;  1BB4 A;  2MEI A;  1D6Q A;  4ET8 A;  5KXM A;  1CJ6 A;  3LZT A;  4HJY A;  1WVU A;  3RW8 A;  3P68 A;  1LZS A;  2BQM A;  4DDB A;  1GFT A;  3B6L A;  1JHL A;  4XAD A;  4XJG A;  3A93 A;  1ZVH L;  1YKY X;  4NGK A;  1QTK A;  1CKD A;  4B49 A;  3A94 A;  1BB5 A;  1GB9 A;  4J7V A;  1VDS A;  4QY9 A;  1ZMY L;  1DI3 A;  1LZD A;  1JKA A;  1REY A;  3GXK A;  1DXJ A;  2DQD Y;  2HEA A;  2B5Z A;  1HNL A;  1AZF A;  1QSW A;  2Y8P A;  3LYT A;  4HV1 A;  3AZ5 A;  2D4I A;  4LT1 A;  1XGT C;  3AGI A;  1EQE A;  4YF2 A;  1GFU A;  1NDG C;  1FKV A;  3FI7 A;  1LZ6 A;  1B5X A;  3P4Z A;  4W94 A;  4W96 A;  3CB7 A;  4J1B A;  1LSE A;  3B0K A;  2H9K A;  5IHG A;  4H9A A;  4GCC A;  1IY3 A;  1RCM A;  2Z2E A;  1HFY A;  3TMV A;  4LYC A;  1DQJ C;  1JJ3 A;  4BS7 A;  1LHK A;  3A67 Y;  3AB6 A;  1GB7 A;  2XBS A; 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 1B5W A;  1LYS A;  3TXD A;  1YIL A;  3WPK A;  2Z12 A;  1T6V L;  4YM8 A;  1WQO A;  3HBE X;  1LYY A;  5KXR A;  3WUL A;  4H91 A;  3AW7 A;  5AMY A;  1GB8 A;  1LHL A;  3GXR A;  3G3A B;  3A95 A;  1LZR A;  3QY4 A;  1LHM A;  4TUN A;  4CHX A;  1G7I C;  2HEB A;  4NSJ A;  5L9J A;  1YQV Y;  1HSW A;  1KIQ C;  1GFK A;  1LSD A;  5HLL A;  1DPX A;  4NSI A;  1GF6 A;  4OWE A;  4AGA A;  5KXO A;  1IC5 Y;  1W08 A;  3HBD A;  4CFP A;  2CGI A;  3ULR A;  1GBY A;  1QQY A;  3D9A C;  3P65 A;  4LYM A;  2LZ2 A;  2ZNX Y;  2HUB A;  3HBH A;  4IJ4 A;  5HNL A;  1OUG A;  3WMK A;  1LSY A;  1F6S A;  4KPM A;  4NGI A;  1JSF A;  1UIB A;  5APE A;  1IWZ A;  5B06 A;  1MLC E;  1BVK C;  2CWI A;  2HU3 A;  5IEL A;  3EXD A;  3WU9 A;  3QE8 A;  1LJG A;  4TWS A;  2BAA A;  5KXS A;  4QGZ A;  4ETC A;  1IOS A;  4WLX A;  2CJL A;  5F16 A;  1IR9 A;  1IX0 A;  154L A;  1I20 A;  1GFG A;  1OUI A;  2NWD X;  1LZN A;  4H93 A;  1XGR C;  1KXY A;  1YRO A;  1B7S A;  1FBI X;  5DLA A;  1JTP L;  1C45 A;  1IWV A;  4G4B A;  3TXK A;  1IWW A;  1LSN A;  4WLD A;  1A4V A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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