1CX6A

T4 lysozyme substituted with selenomethionine
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKMKPVYDSMDAVRRAAMINMVFQMGETGVAGFTNSMRMMQQKRWDEAAVNMAKSRWYNQTPNRAKRVITTMRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Substitution with selenomethionine can enhance the stability of methionine-rich proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
total genus 43
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1cx6A00
3SB8A 1CV4A 2HUMA 1LYFA 160LA 138LA 3SB7A 3NYAA 2LC9A 140LA 118LA 1C6TA 1LPYA 144LA 3GUPA 1SWYA 110LA 151LA 1L03A 253LA 1SSWA 107LA 1QTVA 1L43A 1CVKA 243LA 1CX6A 240LA 3L64A 3QAKA 1L22A 1L62A 258LA 197LA 2QB0B 2B6ZA 201LA 221LA 1L06A 212LA 1QTDA 1PQMA 205LA 1CTWA 1L82A 3DN3A 4AQNA 2RH1A 4ZPUA 1K28A 1OV7A 217LA 2OU8A 254LA 1DYFA 3D4SA 195LA 1OWZA 248LA 1L64A 2A4TA 5I14A 1L86A 2B75A 1XJTA 235LA 2L78A 181LA 1C6HA 174LA 1L01A 3HT6A 3DN1A 2OTZX 1G1WA 1C6QA 225LA 2RB2X 4YXCA 1CV5A 1L52A 2HUKA 209LA 3NY8A 3SBBC 3DMZA 4ARMB 4GRVA 3HT7A 252LA 196LA 4W51A 1C6PA 1C6AA 231LA 184LA 2IGCA 3GUJA 3HTFA 4W54A 4K5YA 1D3FA 3SB5A 1JTMA 4ARLA 1L63A 2QARC 1L44A 2RBOA 1C61A 1C65A 128LA 113LA 2OEAX 1QT4A 1C64A 1L58A 3CDTA 1LYEA 1OYUA 4EJ4A 1LGUA 1L65A 223LA 220LA 159LA 1B6IA 2F2QA 2B6YA 2B6TA 1G0QA 1C6JA 2RBQA 1D3MA 155LA 3G3VA 4ARPA 1QTHA 2RB1X 183LA 1CU2A 1LYHA 1L29A 3C8QA 260LA 1C6KA 1L77A 1QS9A 1L92A 241LA 1ZYTA 130LA 3SB9A 226LA 2RBSA 229LA 1C6DA 1L57A 1LGXA 1T8AA 3C7WA 1KNIA 188LA 1L04A 1NHBA 3C7YA 162LA 1L05A 141LA 1L56A 1XJUA 1L81A 4GBRB 247LA 4I7LA 2B72A 206LA 1CV1A 1L15A 1T6HA 1L45A 156LA 1C62A 1LW9A 1L75A 177LA 139LA 3FI5A 1L55A 111LA 123LA 157LA 222LA 4W57A 1KS3A 1OVJA 1QTBA 1KY0A 1L10A 4I7NA 165LA 1L37A 3HDEA 112LA 3ODUA 1L11A 244LA 1DYBA 176LA 1QUDA 3HUAA 1L72A 1P5CA 1L16A 4ARJA 173LA 3GUIA 1L53A 1L24A 1C60A 4PJZA 2B7XA 1JQUA 3HWLA 1P36A 4ARMA 3GUNA 3CDRA 1L51A 3RZEA 1OVHA 2Q9DA 1C6BA 1L09A 1L76A 215LA 4DJHA 1CU3A 2O7AA 1T97A 250LA 242LA 246LA 4ARQB 1QUHA 1L54A 3HT8A 1P2LA 1L23A 166LA 4EXMA 1ZURA 1ZWNA 1CU5A 2Z6BA 3HH6A 2NTHA 1C6CA 1P56A 2NTGA 3HH4A 3VW7A 3SBAA 1QSQA 1C6FA 3GUOA 1C67A 115LA 2OU0X 1L34A 1QT6A 3G3XA 2RBNA 1L99A 3LZMA 1L89A 2HULA 3HT9A 4I7OA 1QTZA 119LA 214LA 251LA 1QT5A 3FA0A 1L71A 1CUPA 4E97A 1LYJA 2RAYX 1C6GA 1EPYA 1CUQA 1L84A 1P3NA 4IAPA 3SN6R 3DN2A 4YX7C 198LA 2LZMA 1L98A 1LYDA 4I7SA 1QUGA 2RBPA 3DNAA 4EKQA 1L0KA 1L83A 3SB6A 3L2XA 168LA 191LA 3HUKA 3C81A 1G0GA 189LA 3DKEX 1LGWA 149LA 1D2WA 230LA 1P7SA 1L96A 2B74A 1LYGA 2B70A 1G0JA 109LA 1C66A 1L13A 1T8GA 125LA 1C6NA 1L49A 239LA 1SWZA 227LA 1L38A 1L73A 103LA 2RBRA 4LDLA 169LA 1G06A 131LA 1L36A 3C8SA 1G0KA 1L91A 3OE9A 192LA 4LDEA 1DYCA 3HUQA 4W59A 3C7ZA 1C68A 1D3JA 3EMLA 3HDFA 1KY1A 1L17A 104LA 3DMXA 161LA 1L88A 1LI2A 1P64A 1QUOA 3PBLA 4I7QA 3OE6A 4W55A 4ARQA 3HH5A 1L31A 1LI3A 178LA 3GULA 1LI6A 4EKRA 1SX7A 210LA 1L87A 1PQKA 137LA 1PQIA 3V2WA 4OO9A 1L12A 1L39A 1L67A 255LA 3HH3A 1G07A 3PDSA 1P46A 4I7JA 1G0MA 5LZMA 4EPFA 3DMVA 3GUMA 233LA 1L02A 2OE7X 1L32A 1L59A 129LA 187LA 256LA 186LA 1L30A 1L47A 216LA 1L79A 1L18A 4EKSA 1CX7A 3CDOA 1L35A 2B6XA 1L42A 1KW7A 1L19A 1L21A 148LE 3DN4A 1L95A 1XEPA 3K2RA 211LA 185LA 1C69A 1L69A 170LA 4DAJA 1CV6A 1L08A 1L20A 1LYIA 3G3WA 4PK0A 167LA 1DYAA 1OWYA 3HU8A 236LA 147LA 1L61A 120LA 1CV3A 1JTNA 1TLAA 102LA 190LA 3RUNA 1L68A 1L66A 1L46A 126LA 2ANXA 3F8VA 1L93A 1D3NA 1C6IA 1G0PA 1L27A 218LA 108LA 1L85A 1DYGA 232LA 1L40A 1LLHA 1L70A 2O4WA 1P6YA 228LA 1L07A 3C8RA 219LA 262LA 127LA 213LA 2OE9X 1G0LA 1L97A 4S0WA 4YXAC 1C63A 3CDVA 2B6WA 1L60A 234LA 224LA 2OU9A 1WTHA 1DYEA 1QT8A 1DYDA 200LA 257LA 1L33A 146LA 1L94A 3HTDA 3UONA 245LA 2RB0X 1L50A 3GUKA 1D2YA 150LA 261LA 143LA 1OV5A 1L41A 1PQOA 122LA 172LA 2LCBA 1L90A 4I7PA 1L28A 171LA 152LA 1L25A 3DN0A 1SSYA 158LA 2Q9EA 3JR6A 4LDOA 1L14A 4W56A 1QS5A 3DN8A 4I7KA 3OE8A 175LA 238LA 4W53A 3FADA 1T8FA 3DN6A 2ANVA 3C82A 2F47A 4I7RA 6LZMA 1P2RA 2F32A 1C6EA 1CV0A 3HTBA 1P37A 1OVKA 3CDQA 3OE0A 1L0JA 1KW5A 1L26A 3V2YA 237LA 4DKLA 1PQJA 4I7TA 3C80A 163LA 1L00A 180LA 145LA 1LWKA 2CUUA 1CU0A 4I7MA 142LA 1QT7A 4EPIA 1LWGA 1G1VA 1PQDA 164LA 1L74A 199LA 3HU9A 4EKPA 3F9LA 1QTCA 1I6SA 7LZMA 3NY9A 2O79A 1C6MA 2RAZX 249LA 114LA 1CU6A 4W58A 3HTGA 1QT3A 4W52A 259LA 4LZMA 1C6LA 182LA 2B73A 1QSBA 1L80A 2OTYX 2OE4X 3C83A 1D9WA 1SX2A 1L48A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SB8A 3RU5A 5L9JA 144LA 110LA 1L03A 4YOPA 1KXYA 2MEBA 1GE2A 4J1BA 4H9CA 2LYOA 1HMKA 2ZIKA 1IC7Y 201LA 1LZDA 1L06A 1PQMA 5FSTA 1CTWA 2RH1A 4BS7A 1LHIA 1OV7A 254LA 2YBMA 1DYFA 1OWZA 5I14A 1L64A 4DD0A 1LSCA 1XJTA 235LA 2L78A 181LA 1C6HA 3DN1A 3TXBA 1G1WA 4NG8A 2BQLA 1L52A 3SBBC 4ARMB 4GRVA 196LA 5C6LA 153LA 1C6PA 5B59A 3G3AB 1D3FA 4ARLA 4UWVA 2QARC 2W1YA 1C65A 2OEAX 4ETBA 1L65A 1BHZA 2F2QA 2MEIA 2F4AA 3W6DA 2B6TA 3W6CA 155LA 1QDRA 183LA 1CKGA 2MEDA 4HP0A 2LHMA 260LA 1QS9A 1SQ2L 1L92A 4W96A 4LT0A 3SB9A 1QUSA 1LSNA 1LGXA 5APCA 1L04A 4Z46A 1XJUA 1L81A 4GBRB 247LA 5LYTA 1LSBA 4Z98A 4J0LA 1L15A 1FBIX 1LW9A 2C8PA 4NWEA 177LA 5KXSA 111LA 1GB8A 1UACY 1OUFA 4LFXA 5ILFA 1LYYA 1GBZA 1KY0A 1L10A 4I7NA 1B7PA 1LJNA 4N1EI 4H9AA 4LT3A 244LA 1DYBA 4GCBA 4QDNA 4DDAA 1G7LC 5F16A 2MEGA 1W6ZA 1JQUA 4CFPA 3GUNA 4C3WA 5LXWA 5HQ1A 3RZEA 3WVXA 2D4JA 1OUAA 2O7AA 4ET9A 1T97A 250LA 242LA 4WM3A 3HT8A 1L23A 1VDTA 1ZWNA 3HH6A 1C6CA 3P65A 3HH4A 5HNLA 1LHHA 5E9RA 5L3HA 1XFPL 1XEJA 1YROA 1IY3A 4DD2A 2RBNA 1L99A 4ZIXA 2HULA 1GFKA 1B0DA 1EQ5A 1HFXA 5IHGA 1L71A 1CUPA 3W6FA 1D0MA 3TXHA 4NGWA 1C6GA 1CUQA 4IAPA 1YAQA 3TMXA 5L3IA 1GF9A 2LZMA 1IWUA 1L98A 4MR1A 4PRUA 3VWOA 4EKQA 5B06A 1GF4A 168LA 2Z2FA 3CSRA 3C81A 1G0GA 189LA 1AT5A 3A96A 135LA 3DKEX 1HMLA 3KAMA 5A3ZA 1I1ZA 2B74A 1GB5A 2B70A 3P68A 109LA 1C66A 1HEPA 1WQPA 5ILCA 227LA 2EKSC 2G4NA 2YBHA 3GXKA 1GDXA 3LZ2A 3LYTA 3CSZA 131LA 1D6QA 1L36A 2CWIA 5K7OA 1HFYA 5KKIA 1DZBX 192LA 1ZVHL 1DYCA 4LFPA 4GLVA 2F30A 5I54A 5I4XA 1IVMA 1KY1A 4LYTA 3AZ5A 4W55A 161LA 3PBLA 1QUOA 4I7QA 3A94A 4ARQA 1LI3A 178LA 4Z3MA 1GFTA 2EQLA 1GF6A 4ZFPA 1L87A 5B1GA 1L39A 255LA 3HH3A 2Z18A 2F2NA 1VATA 4I7JA 3P4ZA 1GB9A 5LZMA 1FN5A 3WL2A 3GUMA 4HTNA 256LA 129LA 4W94A 1LZYA 3W6AA 1IP1A 4EKSA 3AW7A 1OUJA 3WUAA 3CDOA 4HTQA 1L35A 1GEZA 3A92A 1LSEA 1GF5A 1GFVA 1XEPA 185LA 1C69A 1L69A 3CT0A 1LMTA 1L08A 3WULA 1DYAA 2YBIA 2BQMA 2DQFC 3B0KA 1GBXA 2ZILA 1NHEA 3RUNA 126LA 4HSFA 4TTDA 2Z37A 4WL6A 1L85A 4ZEEA 3SP3A 228LA 3C8RA 4H94A 4BADA 1VDSA 4H90A 2CJLA 3HBHA 4NGLA 5HNCA 5B07A 1UIHA 1G0LA 1L97A 1UIBA 1REZA 1LJIA 3QE8A 3W6EA 3TXJA 4NHSA 4NEBA 1L33A 146LA 1UIDA 3M3UA 3CT5A 5I4YA 1L50A 4NGKA 1D2YA 4YENA 3RNXA 150LA 1HELA 1OV5A 1OUDA 3OJPA 4WO6A 1PQOA 1LSPA 133LA 2HEEA 1EL1A 152LA 4XJFA 1SSYA 1E8LA 1JWRA 3TMVA 3DN8A 5KXLA 2G4PA 3B0IA 3LYZA 1LPIA 2YBJA 1IP4A 2F32A 1P37A 2LZ2A 4M4OA 4H9EA 1OQMA 4WM6A 3BKHA 4I7TA 1YANA 2DQIY 4WLDA 2FBBA 4GCCA 163LA 1TEWA 2CUUA 4GCDA 1CU0A 4TSBA 1QT7A 1UIGA 4NGVA 3HU9A 1FDLY 3AW6A 1B5WA 5HMJA 3A8ZA 2RAZX 249LA 1UUZC 4W52A 2DQJY 1GFEA 1C6LA 2HECA 1QSBA 5KXRA 4J1AA 2OTYX 2PC2A 3C83A 1ZMYL 1CV4A 1LYFA 3NYAA 1OUBA 2LC9A 1OUHA 1AKIA 3MGWA 132LA 4XENA 4ETCA 1SSWA 1BWJA 1HENA 1CVKA 243LA 3QAKA 240LA 3L64A 1NQIA 3T36A 1L62A 258LA 5HMVA 4YEMA 1DXJA 2ZNXY 2MEHA 5F81A 3DN3A 4AQNA 5FHWA 1LZSA 2EIZC 1LJGA 2OU8A 3B0OA 2A7DA 1GFUA 1L86A 2OTZX 4ANRA 1C6QA 1RCMA 1WQMA 3RT5X 3CSQA 4YXCA 2LYMA 3NY8A 252LA 1IWYA 184LA 5KXPA 2I25L 2IGCA 5I53A 8LYZA 1LZGA 3HTFA 5B05A 4K5YA 1GDWA 3SB5A 2ZNWY 1B9OA 207LA 2RBOA 128LA 1UC0A 3CDTA 159LA 4PRQA 4CJ2A 1YILA 2BLYA 1G0QA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3SB8 A;  3RU5 A;  5L9J A;  144L A;  110L A;  1L03 A;  4YOP A;  1KXY A;  2MEB A;  1GE2 A;  4J1B A;  4H9C A;  2LYO A;  1HMK A;  2ZIK A;  1IC7 Y;  201L A;  1LZD A;  1L06 A;  1PQM A;  5FST A;  1CTW A;  2RH1 A;  4BS7 A;  1LHI A;  1OV7 A;  254L A;  2YBM A;  1DYF A;  1OWZ A;  5I14 A;  1L64 A;  4DD0 A;  1LSC A;  1XJT A;  235L A;  2L78 A;  181L A;  1C6H A;  3DN1 A;  3TXB A;  1G1W A;  4NG8 A;  2BQL A;  1L52 A;  3SBB C;  4ARM B;  4GRV A;  196L A;  5C6L A;  153L A;  1C6P A;  5B59 A;  3G3A B;  1D3F A;  4ARL A;  4UWV A;  2QAR C;  2W1Y A;  1C65 A;  2OEA X;  4ETB A;  1L65 A;  1BHZ A;  2F2Q A;  2MEI A;  2F4A A;  3W6D A;  2B6T A;  3W6C A;  155L A;  1QDR A;  183L A;  1CKG A;  2MED A;  4HP0 A;  2LHM A;  260L A;  1QS9 A;  1SQ2 L;  1L92 A;  4W96 A;  4LT0 A;  3SB9 A;  1QUS A;  1LSN A;  1LGX A;  5APC A;  1L04 A;  4Z46 A;  1XJU A;  1L81 A;  4GBR B;  247L A;  5LYT A;  1LSB A;  4Z98 A;  4J0L A;  1L15 A;  1FBI X;  1LW9 A;  2C8P A;  4NWE A;  177L A;  5KXS A;  111L A;  1GB8 A;  1UAC Y;  1OUF A;  4LFX A;  5ILF A;  1LYY A; 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