1LWGA

Multiple methionine substitutions are tolerated in t4 lysozyme and have coupled effects on folding and stability
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKMKPMYDSMDAVRRAAMINMVFQMGETGMAGFTNSMRMMQQKRWDEAAVNMAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Multiple methionine substitutions are tolerated in T4 lysozyme and have coupled effects on folding and stability.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 61
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2002-05-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lwgA00
2RAYX 130LA 1L0JA 1C63A 1KW5A 251LA 1OV7A 2OU0X 174LA 3OE9A 3HWLA 1T8GA 147LA 1SX2A 113LA 3DN8A 3NY8A 3GUJA 2L78A 258LA 1OVJA 3G3WA 222LA 3HTFA 1L86A 144LA 1C6LA 1ZWNA 149LA 4W53A 1G1WA 126LA 1L67A 1C6BA 1L14A 1G0LA 169LA 1LYJA 3OE0A 1CUPA 252LA 1L55A 3F9LA 3F8VA 4I7QA 2RBQA 239LA 1L94A 236LA 3HH3A 1SWZA 183LA 1G07A 1L57A 4DJHA 1CU2A 1P3NA 3DMVA 1LYDA 1L51A 110LA 1DYDA 1QT6A 7LZMA 3HT9A 4YX7C 1P2RA 3HH6A 2OU8A 3QAKA 1L74A 2O4WA 3SB9A 219LA 1L05A 3OE8A 1L35A 1PQJA 3DNAA 1L81A 1D3NA 1L99A 1L00A 1C6HA 138LA 1P64A 1C60A 1L95A 211LA 3DN4A 1LWGA 1C6JA 1QSQA 3GUKA 4GBRB 2B74A 227LA 260LA 1L08A 3SN6R 165LA 3JR6A 1L76A 177LA 112LA 2HUMA 3C7ZA 1KY1A 2OTZX 1L50A 1L34A 1OV5A 259LA 3C81A 178LA 167LA 3K2RA 1C68A 3VW7A 163LA 1P36A 2HULA 2ANVA 1CV3A 120LA 1L98A 2B7XA 1L49A 1JTNA 111LA 1LYEA 4S0WA 2A4TA 1ZYTA 3CDRA 168LA 1L80A 2O79A 3C7YA 210LA 1L90A 4W59A 190LA 1CU5A 1DYBA 139LA 4EKQA 182LA 1P2LA 2B6XA 1LWKA 4I7TA 170LA 247LA 1L88A 142LA 2B6YA 1DYAA 2B70A 3DN0A 233LA 2LCBA 1NHBA 4EPFA 4DAJA 237LA 1L22A 1C69A 1L92A 4LDEA 131LA 2ANXA 2OE9X 4I7OA 1QTDA 1LI3A 4LDLA 1C65A 4YXCA 2RB2X 1QUGA 1C6AA 118LA 1L75A 1C6KA 1L73A 1LLHA 3RUNA 1I6SA 4W51A 1LI2A 146LA 215LA 232LA 3C82A 137LA 1L27A 224LA 1QUDA 4ARQA 244LA 1C6QA 1LYFA 205LA 6LZMA 103LA 1CU0A 1L11A 1QS9A 5I14A 1L17A 175LA 1LW9A 4I7LA 1QSBA 3FA0A 2B6TA 1G0GA 1L26A 214LA 1L43A 4EPIA 109LA 1L96A 1L82A 3V2YA 1L30A 4ARMB 1LGUA 253LA 1KY0A 4E97A 1C6DA 1L72A 1LGWA 1QS5A 1L25A 4AQNA 1P46A 3DMXA 155LA 3SB6A 1L18A 3GUNA 1D2YA 1XEPA 1C6MA 1QUHA 2LZMA 2NTGA 2IGCA 1OVKA 188LA 3FADA 4W58A 3GUPA 209LA 1L0KA 3GUIA 2LC9A 1C67A 1KW7A 1L87A 1L46A 1QT3A 122LA 3DN6A 1L64A 1L71A 1L79A 1L31A 115LA 1P37A 4YXAC 1L52A 1L41A 1L47A 3HTGA 3NYAA 2B6ZA 1D3JA 1L04A 1G1VA 186LA 1D2WA 1CV6A 1CVKA 1QT7A 4I7PA 1C6EA 1DYFA 119LA 1PQDA 1L40A 1T97A 1T8FA 1XJUA 108LA 1L68A 4LZMA 192LA 1L54A 1P56A 1SWYA 230LA 150LA 1C6FA 3HUKA 181LA 3HT7A 4EKPA 3HT8A 1CTWA 4EKRA 1G0QA 1G0JA 1C64A 3HUAA 216LA 2CUUA 1CV1A 1L02A 1L23A 1L09A 3D4SA 1SX7A 2OEAX 4W52A 228LA 2Q9DA 1L37A 166LA 250LA 1LGXA 217LA 1L61A 1L84A 1C6IA 180LA 3C8SA 4PK0A 256LA 2RB0X 1CV4A 3HH5A 3C7WA 4EJ4A 3C8RA 3HU8A 1G0MA 4ZPUA 254LA 1LPYA 4ARPA 3LZMA 2F47A 3SB5A 2RH1A 3HTDA 148LE 4ARJA 4IAPA 2NTHA 3SB7A 3C83A 1L10A 241LA 1OWZA 2F32A 4K5YA 102LA 1L03A 1P6YA 2RBOA 3HDFA 1QTVA 1L12A 1L97A 1L91A 1QT5A 3C80A 1D9WA 1EPYA 125LA 1K28A 4GRVA 1CX7A 3OE6A 1L70A 1QT4A 199LA 1QUOA 196LA 3EMLA 151LA 1L01A 3DKEX 4I7SA 3SBAA 1OYUA 213LA 1G0PA 257LA 1L07A 1L48A 262LA 4W56A 1JTMA 173LA 2RAZX 3DN2A 223LA 4EXMA 123LA 4I7NA 3V2WA 249LA 212LA 143LA 231LA 1QTBA 1QTZA 3SBBC 4W55A 1PQKA 1L20A 1L39A 1D3FA 3G3VA 218LA 4OO9A 198LA 1TLAA 1SSWA 1L32A 4DKLA 1L21A 185LA 1L33A 1L63A 1C6NA 1C6GA 2OE4X 1QTCA 3ODUA 161LA 261LA 160LA 1L13A 189LA 1LYIA 140LA 1JQUA 1G06A 1PQMA 225LA 3CDQA 3HH4A 1L38A 3FI5A 4ARMA 1P5CA 3HDEA 3G3XA 3UONA 191LA 1D3MA 4EKSA 1LI6A 1L16A 3RZEA 5LZMA 1DYCA 4W57A 157LA 246LA 1CU3A 234LA 3HU9A 1L69A 1L28A 1CU6A 206LA 229LA 1ZURA 1L36A 184LA 1L65A 242LA 2RB1X 2HUKA 1DYEA 1LYGA 1OWYA 4I7KA 1DYGA 187LA 1L85A 141LA 220LA 240LA 255LA 1L66A 2QB0B 104LA 1C61A 2RBSA 1C6CA 1QTHA 158LA 2B6WA 1C62A 2F2QA 2RBNA 3DN1A 1CUQA 245LA 1L15A 4PJZA 2B75A 1CV5A 1XJTA 3PBLA 3L64A 3HTBA 1G0KA 2QARC 1QT8A 1PQOA 159LA 3PDSA 107LA 162LA 2O7AA 145LA 1KNIA 2OE7X 1B6IA 1L42A 197LA 3GUMA 3NY9A 1L56A 1LYHA 4LDOA 4ARLA 1T8AA 3GULA 1PQIA 201LA 3HT6A 3CDVA 1C6TA 4I7JA 1L24A 152LA 1L59A 3GUOA 1L19A 235LA 3HUQA 1L45A 2OTYX 1L44A 3CDTA 4I7RA 195LA 4W54A 156LA 3L2XA 2RBPA 1C66A 248LA 1L89A 1L62A 3SB8A 1L77A 129LA 238LA 221LA 1OVHA 4ARQB 114LA 2Q9EA 1WTHA 226LA 2B72A 1CX6A 200LA 3DN3A 1CV0A 1L83A 1P7SA 128LA 1L06A 243LA 1T6HA 1KS3A 1L58A 171LA 164LA 127LA 176LA 4I7MA 2OU9A 3DMZA 1L53A 3C8QA 1C6PA 1L60A 2B73A 1L29A 1SSYA 172LA 3CDOA 2RBRA 1L93A 2Z6BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
130LA 3OE9A 3WMKA 1T8GA 207LA 1C08C 3NY8A 5II3A 2D4IA 2L78A 5B05A 1OVJA 1HMLA 144LA 4WG7A 126LA 1L67A 1G0LA 2EPEA 169LA 252LA 4I7QA 239LA 2FBDA 1JITA 2D6BA 183LA 1L57A 5J7CA 1GAYA 4B0DA 1GF0A 3WL2A 2VB1A 4NG8A 1FBIX 1DYDA 1P2RA 5I5QA 3QAKA 3IJUA 2BPUA 3SB9A 3OE8A 4PJ2C 4GLAA 2XTHA 2H9JA 1E8LA 4TWSA 138LA 1LPIA 3ZEKA 3A6BY 2ZQ3A 1C6JA 1DKKA 1F10A 1O23A 1JUGA 1L08A 2W1LA 1NDMC 165LA 4WM4A 5KXMA 1LJJA 2DQFC 1KY1A 1OV5A 3ATNA 5LINA 1LJEA 167LA 1VDSA 3VW7A 163LA 5KXRA 2HULA 1LJHA 1L49A 1YKZX 3A93A 1D6QA 4G9SA 3TXDA 2BQHA 2A4TA 4PRQA 1L80A 210LA 4W59A 1CU5A 4WO6A 4EKQA 182LA 3MGWA 170LA 1MLCE 233LA 1GBXA 3D9AC 5JENB 1YKXX 1C69A 1ZV5L 1L92A 4LDEA 4NGWA 131LA 2ANXA 1B2KA 4LDLA 1C65A 1P2CC 2RB2X 2DBTA 1C6AA 3IJVA 3P4ZA 4N9RA 118LA 4CJ2A 1LOZA 208LA 1LJNA 3RUNA 4NHPA 2BQKA 215LA 4H1PA 3LN2A 1QUDA 4DDAA 1L11A 4QEQA 1OP9B 1LJ3A 4HTKA 3LYMA 4LGKA 3CSRA 3WULA 1G0GA 1L26A 4WLYA 2DQAA 1DI4A 109LA 1L96A 1BB5A 1JJ0A 2MEEA 1L30A 1LGUA 253LA 1QS5A 2F4AA 1L25A 1XGPC 3LYZA 3CSQA 4LYBA 1GFHA 4GCBA 5D5FA 4XJBA 2BQDA 2FBBA 1KIPC 1LHMA 2LC9A 1KW7A 2HU3A 1L64A 2YBLA 1GFTA 1L79A 3LYOA 3VWOA 115LA 1LSNA 4YXAC 4IJ4A 1FKVA 4LT0A 1XGRC 1L52A 1L47A 2CWIA 1D3JA 1UA6Y 5LVIA 1QT7A 1PQDA 1HFYA 4NSGA 4C5FA 5LYTA 5KXWA 1LMCA 1REZA 1JTOL 1L68A 3TMXA 4LZMA 150LA 1IEEA 3CT5A 1C6FA 3HUKA 3RZ4A 3HT8A 1LZRA 4N0JA 1C64A 1D0MA 1FKQA 4NHIA 3HUAA 1C7PA 216LA 5LA8A 1L02A 3D4SA 1LAAA 1L84A 1W08A 2H9KA 1KXXA 1NQIA 2AUBA 1FLWA 3C8SA 1CV4A 3A96A 2MECA 2Z2FA 9LYZA 1LSMA 254LA 1VDQA 2F47A 1RE2A 1TBYA 4H9EA 2BQIA 2NTHA 1REYA 241LA 2N5ZA 1P6YA 3HDFA 1QTVA 5K7OA 1L97A 3ZVQB 2BAAA 3OE6A 151LA 1HFXA 1GFVA 3WH1A 1G0PA 262LA 1JTTL 4I8SA 4PRUA 1JTMA 2RAZX 3DN2A 5F81A 123LA 1UIHA 3WU8A 212LA 4NHSA 3W6FA 1HERA 5FEKA 4ZIXA 4YENA 1EQ4A 1NWGA 1PQKA 218LA 4BS7A 4HTNA 1KXYA 1GDXA 1L21A 185LA 1I56A 4KXIA 1QTCA 4LT1A 4X3BA 3WXTA 1KIRC 225LA 1L38A 3FI7A 1B5XA 3FI5A 3TXBA 4ARMA 2DQGY 3N9EA 3A6CY 191LA 2IFFY 1OUIA 3HBDA 4H8XA 5A3EA 3G3AB 1DYCA 4ANRA 1RJCB 4W96A 1L28A 1L36A 4H9BA 3QNGA 1J1PY 1L65A 1YL0X 4B4EA 4GCFA 1LYGA 1LMNA 1WTMA 2IHLA 1LZ1A 1QTHA 4G49A 2B6WA 2H5ZA 1CUQA 4GN4A 3PBLA 1LMTA 1IOQA 159LA 107LA 4LT3A 162LA 1IVMA 1UIGA 5LYMA 1UIFA 1L42A 3IWRA 4WM1A 4NFVA 1GB8A 4H91A 1HFZA 2D91A 1T8AA 3GULA 201LA 1LJIA 3GUOA 1L19A 3HUQA 1D6PA 4HTQA 4GN5C 2OTYX 2Z2EA 2Q0MX 3CDTA 4L41A 1F6SA 4H9IA 2B5ZA 4W54A 248LA 2ZNWY 1L77A 4QY9A 2F4GA 3GXKA 4HPEA 1P7SA 3W6DA 4YEOA 4CHXA 4Z3MA 4I7MA 3TXKA 1GB2A 1JPOA 1L29A 172LA 3CDOA 2RBRA 1L93A 3AB6A 1GHLA 2RAYX 1L0JA 1C63A 1KW5A 1OV7A 174LA 1IIZA 147LA 4NY5A 4OW1A 1SX2A 113LA 1VEDA 4G4HA 2W1XA 258LA 3G3WA 222LA 3HTFA 1L86A 1WQRA 1UIDA 4MCKA 4WG1A 1LHJA 5DL9A 2W1YA 1OUGA 4HJZA 2RBQA 3EMSA 1HEPA 3HH3A 4XJGA 5LAFA 1LZBA 5LIOA 3CT1A 1LYDA 4NGLA 1GDWA 3HT9A 4WO9A 1F0WA 1JKDA 1GB3A 1LYZA 1L74A 4KPMA 1LSEA 3WW6A 1PQJA 1LJFA 1A4VA 1PS5A 1YAPA 1BQLY 3AGIA 1LCNA 1TCYA 1C6HA 1C60A 1VDPA 1VFBC 1QSQA 4GBRB 2B74A 1B7OA 4NHQA 4B1AA 5ILFA 1WQOA 3JR6A 1HEWA 177LA 2HUMA 2OTZX 4H92A 4B4JA 2YBIA 1XEKA 1C68A 1LSFA 1P36A 1JIYA 5F9XA 1CV3A 120LA 1LYEA 4S0WA 1ZYTA 1UACY 2DQDY 1FN5A 1JWRA 3WUAA 190LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 130L A;  3OE9 A;  3WMK A;  1T8G A;  207L A;  1C08 C;  3NY8 A;  5II3 A;  2D4I A;  2L78 A;  5B05 A;  1OVJ A;  1HML A;  144L A;  4WG7 A;  126L A;  1L67 A;  1G0L A;  2EPE A;  169L A;  252L A;  4I7Q A;  239L A;  2FBD A;  1JIT A;  2D6B A;  183L A;  1L57 A;  5J7C A;  1GAY A;  4B0D A;  1GF0 A;  3WL2 A;  2VB1 A;  4NG8 A;  1FBI X;  1DYD A;  1P2R A;  5I5Q A;  3QAK A;  3IJU A;  2BPU A;  3SB9 A;  3OE8 A;  4PJ2 C;  4GLA A;  2XTH A;  2H9J A;  1E8L A;  4TWS A;  138L A;  1LPI A;  3ZEK A;  3A6B Y;  2ZQ3 A;  1C6J A;  1DKK A;  1F10 A;  1O23 A;  1JUG A;  1L08 A;  2W1L A;  1NDM C;  165L A;  4WM4 A;  5KXM A;  1LJJ A;  2DQF C;  1KY1 A;  1OV5 A;  3ATN A;  5LIN A;  1LJE A;  167L A;  1VDS A;  3VW7 A;  163L A;  5KXR A;  2HUL A;  1LJH A;  1L49 A;  1YKZ X;  3A93 A;  1D6Q A;  4G9S A;  3TXD A;  2BQH A;  2A4T A;  4PRQ A;  1L80 A;  210L A;  4W59 A;  1CU5 A;  4WO6 A;  4EKQ A;  182L A;  3MGW A;  170L A;  1MLC E;  233L A;  1GBX A;  3D9A C;  5JEN B;  1YKX X;  1C69 A;  1ZV5 L;  1L92 A;  4LDE A;  4NGW A;  131L A;  2ANX A;  1B2K A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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