151LA

Conservation of solvent-binding sites in 10 crystal forms of t4 lysozyme
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLAAAASLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Conservation of solvent-binding sites in 10 crystal forms of T4 lysozyme.
pubmed rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 48
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 151lA00
108LA 3GUMA 1L15A 1KW7A 1LWGA 1P6YA 255LA 1L94A 122LA 1D3FA 1L24A 4EKPA 1LYHA 2OTYX 3DN2A 139LA 222LA 1L49A 213LA 228LA 2Q9EA 1L95A 2B6ZA 1L07A 128LA 1LI3A 1L97A 1P37A 1QT4A 2RH1A 198LA 1QSBA 244LA 3C8RA 3GUIA 1L79A 1PQIA 223LA 3C8QA 1G0LA 189LA 1L86A 103LA 1L30A 182LA 216LA 145LA 1G0KA 1L72A 1L55A 2B6YA 162LA 2RBSA 234LA 4OO9A 1CVKA 3FI5A 4I7OA 1QS5A 3OE6A 4I7LA 243LA 3V2WA 1SX2A 4W52A 1L25A 4YXAC 1LWKA 160LA 1L20A 3G3WA 1WTHA 1L87A 1L23A 4I7KA 1KW5A 3HT8A 2HULA 3D4SA 3HUQA 205LA 3PDSA 2RBQA 3C81A 1C6AA 1QT6A 1EPYA 120LA 3RZEA 1G0JA 1CU5A 1OVKA 137LA 261LA 3L2XA 2O4WA 1L41A 3C7YA 1DYGA 1L70A 4K5YA 1C6KA 1L56A 1LGUA 1G0GA 170LA 4I7PA 196LA 1C6JA 3OE8A 1D2YA 3HH6A 2OU9A 1L32A 2OE9X 4W54A 1DYFA 1G07A 1P56A 2Q9DA 2F2QA 2OE4X 4I7QA 184LA 163LA 192LA 1L05A 3HWLA 104LA 241LA 1OV5A 3GUKA 156LA 1C62A 4I7TA 1L64A 3QAKA 1L60A 3C83A 1L38A 1L47A 1L17A 1C64A 1L59A 1L39A 2B72A 252LA 258LA 114LA 2OU8A 1L46A 4ARLA 2B75A 1D2WA 7LZMA 115LA 2O79A 3LZMA 1CU3A 1L01A 262LA 2B7XA 2RBOA 4W56A 2CUUA 1C6MA 129LA 3GULA 175LA 1TLAA 1CV0A 250LA 2B70A 3HTGA 3CDRA 1PQDA 1KY0A 4I7RA 3C7WA 142LA 233LA 3HDFA 3UONA 209LA 1L19A 1LI2A 3HH5A 1P36A 1L83A 1QS9A 1QT8A 111LA 3VW7A 1JTNA 3DN4A 183LA 1SSWA 1L45A 143LA 173LA 256LA 1D3JA 1L04A 1L28A 1L12A 3JR6A 1C6DA 219LA 180LA 1L0KA 195LA 214LA 1QT3A 107LA 2B6XA 1C6QA 1CU6A 1L75A 1DYAA 1L74A 1PQKA 1LYEA 2QB0B 2B73A 1T8AA 1QTDA 3SB6A 253LA 2HUMA 3SB5A 1L53A 4ARMA 2B6TA 3EMLA 3ODUA 4ARMB 4E97A 141LA 164LA 1L85A 245LA 1QT5A 257LA 1L91A 4W58A 1OV7A 2RAZX 2LZMA 3FA0A 187LA 1L80A 3GUJA 150LA 1XEPA 242LA 119LA 1OWZA 3PBLA 1P2LA 1L99A 169LA 224LA 3DN0A 1D3NA 3C82A 4PJZA 236LA 3V2YA 1L03A 191LA 138LA 159LA 1P3NA 227LA 4ARPA 176LA 1L34A 4IAPA 1P46A 3DN1A 1L63A 3NY8A 148LE 146LA 1C6IA 181LA 249LA 3HTDA 6LZMA 5I14A 1QTHA 1C6NA 240LA 2RB0X 2OEAX 4DAJA 1L40A 1C60A 3GUOA 3DN8A 1L88A 155LA 2NTHA 2RB2X 1QTBA 4EXMA 190LA 3DN3A 248LA 1PQOA 1C6GA 1C61A 1T6HA 1PQJA 225LA 1SSYA 4EPIA 1XJUA 2OE7X 168LA 1CUQA 3HU9A 201LA 3RUNA 1LPYA 1L29A 144LA 1C68A 1L54A 1L13A 231LA 1CV5A 1QUOA 2QARC 1L52A 1T8GA 1P5CA 254LA 1L16A 1L33A 1SX7A 3F8VA 1L00A 260LA 3CDTA 1L11A 1L48A 1L42A 1CX7A 5LZMA 147LA 4S0WA 1C6PA 1CTWA 1L35A 3C8SA 3DKEX 3DN6A 4I7MA 4AQNA 3SB7A 167LA 1C69A 1K28A 1C63A 4GRVA 1CUPA 1L58A 1DYDA 3HTBA 3DMVA 237LA 3HT9A 1L71A 161LA 2ANVA 4EJ4A 1DYEA 1L08A 1L26A 1L98A 158LA 246LA 3G3VA 1C6FA 1L89A 1XJTA 1L36A 1L84A 1LGXA 4GBRB 1L90A 1L68A 4I7JA 127LA 4I7SA 3SN6R 4W57A 1DYBA 1PQMA 212LA 4DKLA 1L92A 1I6SA 1DYCA 229LA 1CV4A 3DMZA 1CV3A 4EKRA 1CU0A 1L57A 230LA 178LA 3FADA 218LA 1C6HA 226LA 1P64A 1KY1A 1LW9A 3OE9A 1LYGA 3C7ZA 1G06A 3HT6A 3K2RA 1LLHA 1CU2A 165LA 1LI6A 3NY9A 2B74A 2HUKA 259LA 2F47A 221LA 112LA 102LA 238LA 2RAYX 149LA 118LA 1G0QA 3SB8A 4W53A 1OWYA 3L64A 1L27A 1L0JA 188LA 1T97A 4LDLA 197LA 3GUNA 1CX6A 1L14A 1QTZA 2O7AA 3SB9A 186LA 2B6WA 3DMXA 1L77A 1ZURA 1C6CA 174LA 3NYAA 110LA 4YX7C 2Z6BA 3HT7A 1L31A 1OVJA 172LA 1C6EA 1KNIA 1KS3A 1L43A 1L51A 3HH4A 2RBRA 3F9LA 2LC9A 1L65A 4EKQA 2L78A 215LA 3DNAA 4PK0A 1L02A 4ARQA 1G1WA 1CV6A 4ARQB 4W59A 1L67A 235LA 1L69A 2IGCA 4ZPUA 1L62A 1L18A 1C6LA 185LA 1JTMA 1QSQA 2OU0X 1D9WA 239LA 3OE0A 2OTZX 1OYUA 2NTGA 171LA 4LDOA 4EPFA 211LA 2RBNA 2F32A 1SWZA 1QUHA 3HUKA 1JQUA 1L21A 251LA 1OVHA 2RB1X 4DJHA 152LA 3SBBC 1D3MA 1LYFA 4LDEA 130LA 1ZYTA 3HH3A 210LA 1LYDA 2A4TA 2ANXA 1L37A 1LYIA 113LA 1G1VA 1QUDA 1C6TA 3CDQA 4I7NA 3G3XA 1L44A 1L66A 1SWYA 4W55A 1QTVA 1L09A 126LA 1L50A 166LA 3SBAA 1L22A 1G0PA 125LA 1NHBA 3HU8A 4W51A 1L10A 151LA 3GUPA 206LA 1CV1A 217LA 1P2RA 3CDVA 123LA 1C6BA 3CDOA 1L96A 2RBPA 1B6IA 1L93A 4EKSA 220LA 1C65A 1QUGA 109LA 3C80A 1LYJA 1QTCA 4YXCA 1T8FA 232LA 1C67A 1L82A 2LCBA 157LA 1LGWA 3HDEA 199LA 4LZMA 131LA 140LA 1G0MA 1ZWNA 3HUAA 177LA 4ARJA 3HTFA 1L76A 247LA 1C66A 1QT7A 1P7SA 200LA 1L73A 1L81A 1L61A 1L06A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3F6ZA 1KW7A 4RDSA 1HMLA 1LMTA 1JTTL 1L95A 1LJIA 1LI3A 1VFBC 3RU5A 2YBHA 1QSBA 244LA 3GUIA 1QIOA 3C8QA 3ZVQA 189LA 1L86A 182LA 216LA 145LA 1LHIA 1LHJA 1L72A 2B6YA 162LA 2RBSA 1HMKA 4I7OA 4I7LA 243LA 4R0FA 3V2WA 1IVMA 1GF5A 5II3A 1GF4A 1RE2A 5KXMA 1JITA 1MLCE 5T3FA 1LZBA 3D4SA 1WTMA 205LA 2FBDA 1RCMA 1GB6A 1C6AA 1QT6A 4H8XA 1EPYA 4YF2A 1CU5A 3W6CA 1JKDA 2F30A 1L56A 1G0GA 4I7PA 4DD9A 196LA 4IJ4A 1D6PA 1NBZC 1GD6A 3HH6A 2OE9X 1BWIA 5B06A 2Q9DA 2HEDA 1IIZA 104LA 241LA 5KXYA 1OV5A 1LZ8A 4DD3A 4X3BA 5L3HA 1L64A 5HNLA 1L38A 1L17A 1LZTA 1C64A 1GF3A 3A91A 1UCOA 1HFXA 252LA 2B75A 115LA 4J1BA 2Y8PA 1CU3A 3LZMA 2RBOA 4W56A 1C6MA 2W1XA 2Z19A 4WL7A 5LVKA 3B0IA 2Q0MX 3HTGA 4I7RA 3HDFA 3UONA 209LA 2GV0A 3HH5A 3WVXA 3WMKA 5DN5A 3W6DA 3DN4A 4XYYA 1SSWA 1L45A 173LA 5KXKA 193LA 1C6DA 1GBZA 3RNXA 3D9AC 2RSCA 1L0KA 1GF0A 4UWNA 2B6XA 1WQMA 3AZ6A 1L75A 1DYAA 1L74A 1PQKA 2BLXA 4H8YA 3WU9A 1LYEA 4WLYA 2B73A 1QTDA 3SB6A 2HUMA 4U3XB 1DPXA 3SB5A 5HMJA 3P66A 1IP2A 2CWIA 1J1PY 5DN4A 5APFA 3AGIA 164LA 4HV1A 257LA 3MGWA 2LZMA 3CT5A 1CNSA 1LJNA 1GFVA 3GUJA 169LA 3DN0A 4PJZA 1LSDA 1L03A 5LYMA 2HU1A 133LA 4WL6A 4J0LA 4NG1A 1P46A 1XGQC 1L63A 5APDA 148LE 1LZRA 4LT3A 1YILA 4ML7A 1D0MA 1GAYA 3AW7A 1IP6A 2G4PA 240LA 5I54A 2RB0X 5APCA 1B7LA 2Z38A 3A93A 5LVHA 1L88A 1LZSA 4ETCA 4YM8A 4G9SA 4NHSA 1C6GA 1C61A 1PQJA 1SSYA 1BVKC 3TXGA 4WM3A 1L29A 1PZYA 1C68A 2D4JA 4ETEA 3IWRA 1QUOA 1INUA 1T8GA 1P5CA 2F2NA 2DQEY 1LTMA 4UWUA 1L42A 4DD1A 4Z41A 1C6PA 1CTWA 3C8SA 2D6BA 1V7SA 3DN6A 4BADA 1C69A 1K28A 4QEQA 1C63A 1CUPA 1N4FA 2MEEA 3HT9A 4ETDA 4MSTA 1DYEA 1L26A 4RLMA 3TXFA 4GBRB 1I20A 1L90A 4GN3A 2HU3A 1IWZA 1L92A 1T6VL 1CV3A 1JEFA 4KT3A 4NGZA 1B7PA 1DI5A 3K3TA 1FDLY 1CJ6A 1C6HA 5I5QA 226LA 1YL1X 2CGIA 1GB3A 3K2RA 165LA 4XADA 4XJDA 3NY9A 2HUKA 2F47A 2YBNA 238LA 2BAAA 2RAYX 149LA 1G0QA 1QDRA 3W6BA 4XJFA 1LHMA 1JPOA 1FLWA 3TXIA 2Z2EA 1CKGA 4FJRA 3DMXA 1F6SA 1IWUA 1L77A 4PPOA 4DDAA 1H6MA 4XJBA 4QDNA 2DQAA 2EQLA 4LFXA 5FCPA 4ZFPA 1KS3A 1L65A 5F9UA 1GEZA 3CT0A 4EKQA 4PK0A 4YOPA 1L02A 1LSMA 1CV6A 1IWXA 4ARQB 1BVXA 2FYDA 4HPEA 235LA 1C6LA 1G7LC 3OK0A 2MEAA 2OU0X 1LJ4A 1IWTA 1YKYX 171LA 1LMNA 5B07A 4NGKA 5I4YA 2BQOA 3ATOA 1D0LA 3CSZA 3B0OA 3W3EA 3HUKA 1JQUA 2RB1X 1IC7Y 2LYZA 2LYOA 4LDEA 130LA 1TDYA 4H91A 2BQIA 113LA 1C6TA 1GF8A 5D5FA 2D91A 1L44A 4W55A 1L09A 3J4GA 4HTQA 3P64A 1L50A 3SBAA 1G0PA 1QSWA 4W51A 1JKBA 1GDXA 3GUPA 2BPUA 2G4QA 4QY9A 2RBPA 1JKAA 1IP4A 1B6IA 2W1YA 1GB5A 4H8ZA 1LYJA 1B7NA 1LGWA 1UBZA 1KIRC 131LA 140LA 1UIEA 3HUAA 2BQFA 2BQKA 4ARJA 1IR7A 3AYQA 2HEBA 1HEOA 1GF7A 5A3ZA 1L06A 1B5YA 1LZ5A 4DD7A 1AT5A 3WU7A 1LYHA 2OTYX 2H9JA 5FHWA 3DN2A 3AGGG 222LA 1KXXA 2Q9EA 1L07A 1GE3A 3FE0A 3N9EA 4NHIA 5B1GA 2ZQ3A 1G7IC 1L79A 4NGYA 3ATNA 1VDSA 234LA 1CVKA 4CHXA 3FI5A 1UIHA 4B4EA 1QS5A 3OE6A 1G7JC 1UACY 4GN5C 1SX2A 4DYGA 2XQOA 1L25A 3HBEX 1LWKA 4P2EA 1L87A 1OUIA 1L23A 4WO6A 4H9AA 3QE8A 3W6AA 2HULA 1B7SA 4NFVA 5HMVA 2RBQA 4HSFA 3TMVA 3BKHA 5KKJA 1G0JA 2MEGA 4G4BA 1L41A 4N8ZA 3SP3A 4B4JA 1WQPA 4ET9A 1QUTA 1GF6A 2F2QA 5FEKA 4I7QA 4LYCA 1L05A 4HJVA 156LA 1XGUC 1C62A 1J1XY 1HFZA 1SQ2L 2MEIA 1L60A 1L47A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3F6Z A;  1KW7 A;  4RDS A;  1HML A;  1LMT A;  1JTT L;  1L95 A;  1LJI A;  1LI3 A;  1VFB C;  3RU5 A;  2YBH A;  1QSB A;  244L A;  3GUI A;  1QIO A;  3C8Q A;  3ZVQ A;  189L A;  1L86 A;  182L A;  216L A;  145L A;  1LHI A;  1LHJ A;  1L72 A;  2B6Y A;  162L A;  2RBS A;  1HMK A;  4I7O A;  4I7L A;  243L A;  4R0F A;  3V2W A;  1IVM A;  1GF5 A;  5II3 A;  1GF4 A;  1RE2 A;  5KXM A;  1JIT A;  1MLC E;  5T3F A;  1LZB A;  3D4S A;  1WTM A;  205L A;  2FBD A;  1RCM A;  1GB6 A;  1C6A A;  1QT6 A;  4H8X A;  1EPY A;  4YF2 A;  1CU5 A;  3W6C A;  1JKD A;  2F30 A;  1L56 A;  1G0G A;  4I7P A;  4DD9 A;  196L A;  4IJ4 A;  1D6P A;  1NBZ C;  1GD6 A;  3HH6 A;  2OE9 X;  1BWI A;  5B06 A;  2Q9D A;  2HED A;  1IIZ A;  104L A;  241L A;  5KXY A;  1OV5 A;  1LZ8 A;  4DD3 A;  4X3B A;  5L3H A;  1L64 A;  5HNL A;  1L38 A;  1L17 A;  1LZT A;  1C64 A;  1GF3 A;  3A91 A;  1UCO A;  1HFX A;  252L A;  2B75 A;  115L A;  4J1B A;  2Y8P A;  1CU3 A;  3LZM A;  2RBO A;  4W56 A;  1C6M A;  2W1X A;  2Z19 A;  4WL7 A;  5LVK A;  3B0I A;  2Q0M X;  3HTG A;  4I7R A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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