155LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFANALRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 56
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 155lA00
142LA 3RZEA 3G3XA 242LA 1KY0A 4ARQA 1T97A 220LA 1LYHA 236LA 1SWYA 2B75A 1L97A 255LA 184LA 2RBPA 1KNIA 1G06A 3PDSA 3NY9A 1DYEA 195LA 3C7WA 4W53A 1JTNA 1L73A 229LA 3CDTA 2B6ZA 1P56A 4I7TA 4W56A 4I7JA 2HUKA 4ARMA 1L10A 1L59A 114LA 1CV1A 1B6IA 1L07A 1CV3A 1XJTA 1CV6A 5LZMA 1P64A 1L38A 3FA0A 252LA 4ARQB 4I7MA 180LA 1L67A 232LA 4I7KA 104LA 4IAPA 3FADA 3SB5A 3HTGA 4EKQA 2B73A 3DKEX 4YXAC 1CVKA 1G0QA 4PJZA 4I7OA 1L87A 1L03A 162LA 1G1WA 1L14A 2B6WA 4ARMB 1CUPA 4ARPA 2RB1X 1WTHA 113LA 251LA 4LDOA 239LA 3SB8A 4W58A 1PQIA 3HTDA 138LA 1L93A 1OV7A 1C6HA 1L49A 226LA 3HDFA 1OWYA 3HH6A 3DMZA 3HTBA 1TLAA 259LA 1L85A 1LWKA 3DN4A 3PBLA 3OE9A 3SB7A 4EPFA 2F32A 1L39A 214LA 4I7RA 1L76A 4ZPUA 1QT8A 1L27A 129LA 2NTGA 149LA 2QB0B 160LA 1DYFA 1QSBA 247LA 257LA 1CU5A 1C6DA 245LA 3C83A 253LA 125LA 1L75A 131LA 187LA 4YXCA 1L13A 1L83A 1T6HA 240LA 1L71A 1C66A 4I7SA 111LA 1C6EA 196LA 2F2QA 3DN3A 1C61A 1L35A 1L62A 1L98A 2ANVA 2IGCA 1LYEA 3GUPA 213LA 2OU0X 222LA 137LA 221LA 1QS5A 237LA 183LA 120LA 1C6TA 1L32A 1L82A 190LA 3L2XA 1L51A 1LYFA 197LA 1ZURA 3GUIA 1OVJA 1L01A 1C6GA 250LA 140LA 1QS9A 1QUGA 2OTYX 1L69A 1LYIA 227LA 3LZMA 1P7SA 176LA 3GUJA 3C7YA 4W57A 4DJHA 2RB0X 1SWZA 3RUNA 2Q9DA 1T8FA 1DYBA 168LA 1LGWA 1C6QA 110LA 1PQKA 209LA 3C81A 1C6KA 1L08A 1CU3A 1G07A 1L06A 3DMXA 1G0LA 1G0GA 1L74A 4LZMA 233LA 1T8GA 3HDEA 1EPYA 3OE8A 228LA 200LA 4LDEA 1LPYA 1QUDA 4S0WA 1L15A 262LA 1LGUA 1L58A 1PQMA 199LA 3C8QA 181LA 1C6CA 146LA 3DN0A 178LA 2B72A 112LA 2OE4X 1P6YA 1C6IA 219LA 144LA 241LA 3OE6A 1C63A 2O7AA 3C8SA 1CU6A 231LA 3C80A 3UONA 260LA 1L81A 3HH4A 4EXMA 206LA 4W59A 4EKPA 158LA 3CDRA 1SX7A 205LA 1CTWA 1L37A 1PQDA 3VW7A 108LA 128LA 3HT8A 4W51A 3GULA 1L66A 1NHBA 3EMLA 4AQNA 1KY1A 3SB9A 1L02A 3DNAA 3HWLA 1L89A 1C6AA 4I7LA 1L54A 2ANXA 3DN1A 4W52A 1D3JA 1L17A 1L42A 3SN6R 3DN8A 3JR6A 1C67A 7LZMA 159LA 1C6JA 2NTHA 2OEAX 4ARJA 2F47A 2B74A 1QTBA 1LGXA 201LA 3NY8A 2O4WA 188LA 1OVKA 4E97A 258LA 3V2YA 103LA 1L22A 1L64A 3GUOA 1L20A 4W54A 1CV5A 4EJ4A 1L44A 2RAYX 2CUUA 1G0PA 3L64A 1L26A 1SSWA 1SX2A 3DN6A 2HUMA 4LDLA 2OE7X 1CU0A 1L84A 4EKSA 166LA 2RBNA 1L46A 1L94A 1L09A 1CV4A 177LA 150LA 1CV0A 2RH1A 130LA 1L0KA 1D3FA 164LA 261LA 198LA 2Z6BA 1XEPA 4YX7C 182LA 115LA 1QT6A 1L79A 1DYAA 3CDVA 148LE 1L11A 3C8RA 3HU8A 1QUOA 223LA 2O79A 1P5CA 2B7XA 4W55A 1L30A 1L25A 169LA 1L88A 2OTZX 2LCBA 3V2WA 3HU9A 167LA 1P3NA 1L72A 1P2LA 2RB2X 2LC9A 3HTFA 3C82A 216LA 5I14A 1L18A 3F8VA 1C6MA 230LA 157LA 122LA 2OU8A 1DYCA 1C69A 246LA 238LA 1G0JA 1QT7A 173LA 3K2RA 1C60A 1L0JA 256LA 1LW9A 192LA 1L56A 3GUNA 1L34A 1KW7A 152LA 1JTMA 1T8AA 224LA 1P2RA 1P36A 127LA 1L40A 3SB6A 1DYGA 147LA 123LA 1C65A 1C62A 4ARLA 1L91A 186LA 3HUKA 4GBRB 107LA 1C68A 151LA 3CDQA 3DMVA 3HT6A 1L70A 1L92A 1LLHA 1D2WA 1QTVA 1CU2A 3F9LA 218LA 1L31A 1DYDA 1CUQA 4EPIA 1G0KA 2HULA 1JQUA 165LA 243LA 2RBSA 1L12A 189LA 3GUKA 2B6YA 1L53A 1P46A 3HT9A 1L61A 212LA 3D4SA 1D2YA 1QTHA 211LA 1QSQA 1LI3A 2B6TA 1ZYTA 1QT5A 2OE9X 1CX6A 1L24A 4GRVA 1L86A 1L55A 1KW5A 3ODUA 102LA 6LZMA 1L23A 1C6FA 2A4TA 1L05A 2B6XA 118LA 2QARC 1L68A 3NYAA 1D3NA 3HUQA 1L77A 217LA 175LA 1C6LA 145LA 143LA 174LA 1QT4A 119LA 1LI6A 1L47A 4I7QA 244LA 1SSYA 3FI5A 3SBAA 1P37A 1L36A 1LYGA 172LA 1G0MA 4I7NA 163LA 1C6PA 1L63A 1D3MA 1KS3A 1L28A 3QAKA 1L99A 1OYUA 3G3VA 171LA 3HH3A 1D9WA 3HUAA 4DKLA 1PQOA 210LA 215LA 1C6NA 1L04A 1LYJA 4EKRA 2Q9EA 248LA 4I7PA 1C64A 225LA 1L80A 1PQJA 1QTZA 1XJUA 1L95A 1QUHA 1ZWNA 185LA 1QTCA 109LA 1CX7A 1L96A 2B70A 139LA 1QTDA 1L45A 1L52A 1L33A 1L29A 1OV5A 249LA 1L19A 161LA 3HH5A 191LA 4PK0A 254LA 2OU9A 2RBQA 1L57A 1L65A 1L43A 156LA 1L90A 2RAZX 3CDOA 4DAJA 235LA 1G1VA 1L00A 1I6SA 1K28A 1OWZA 3C7ZA 2RBOA 126LA 4OO9A 1LI2A 1L60A 3HT7A 2L78A 3G3WA 1C6BA 1L41A 1L48A 1OVHA 2LZMA 234LA 1LYDA 2RBRA 3GUMA 1L21A 1LWGA 4K5YA 3SBBC 3OE0A 1L16A 141LA 170LA 1L50A 1QT3A 155LA 3DN2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
142LA 4WM6A 3G3XA 3W3EA 4WL7A 5I54A 5LINA 1BQLY 4H9CA 1G06A 4WLXA 1GD6A 1LTMA 193LA 195LA 2F4GA 3C7WA 2Z12A 4GLVA 2B6ZA 1P56A 1ALCA 5J7CA 4ARMA 1LMAA 1HFXA 2BQGA 3AYQA 1RI8B 1HHLA 1UIFA 1YROA 1WVVA 1NF5A 104LA 3HTGA 4I0CA 4EKQA 2C8OA 4YXAC 3TMVA 1H6MA 4I7OA 2ZWBA 4ARPA 113LA 4LDOA 1LOZA 4LT1A 1PQIA 2D91A 3HDFA 1D9UA 3HH6A 1UC0A 259LA 1C10A 4H8YA 5T3FA 3LN2A 4ML7A 1IX0A 4EPFA 1L39A 3TXKA 129LA 4NEBA 2QB0B 160LA 4L41A 3RT5X 1OUEA 5KXPA 4OWAA 247LA 1LJEA 1GBSA 2MEIA 153LA 2HECA 1T6HA 154LA 111LA 1C6EA 1G7IC 1CKCA 4PPOA 5FEKA 213LA 2OU0X 1YQVY 1YANA 4IATA 1IR7A 3EXDA 1BVXA 4UWUA 4EOFA 1C6TA 4WM3A 4FJRA 2HU3A 1ZURA 4U3XB 4H93A 2XQOA 5LAFA 1L01A 3AW7A 250LA 1QUGA 4GN4A 1LZCA 227LA 3LZMA 3GUJA 1IEEA 4B1AA 4DJHA 4XJIA 2RB0X 5E9RA 1LGWA 5APCA 209LA 3C81A 4LT2A 1ZMYL 1PZYA 1NWGA 3LYZA 1T8GA 4OW1A 3OE8A 5B07A 4TSCA 1HENA 4ET8A 4LDEA 4M6DA 1QUDA 1B7OA 4S0WA 1FLYA 5KXOA 262LA 4NSJA 1REXA 3A90A 3RU5A 1L58A 1B2KA 1GB8A 146LA 178LA 2B72A 2OE4X 1GFVA 219LA 144LA 1PS5A 4XN6A 1D0KA 3C8SA 1D0LA 3UONA 1C45A 206LA 4WO9A 4EKPA 3CDRA 1SX7A 5AMYA 4E3UA 1L37A 2BQEA 1IORA 2CGIA 3WYHA 5KJ9A 1AM7A 3HT8A 1L66A 3RNXA 1KY1A 1L89A 4NG8A 1L42A 1AZFA 2NTHA 2OEAX 2F47A 1KIQC 2VB1A 3LYTA 1GE2A 2O4WA 1GB7A 1OVKA 1LZTA 4BS7A 2Z2FA 4J1BA 1L20A 4HTKA 3B6LA 4I8SA 5M1YA 1IP7A 4NSHA 2RAYX 2CUUA 4TTDA 2IHLA 1REZA 1AT6A 5HMJA 7LYZA 166LA 2RBNA 2DKVA 2DQCY 182LA 3F6ZA 1LZ5A 4LT0A 1WQOA 3TXBA 4NGKA 1KIPC 2B7XA 1CKHA 4HJZA 5II3A 1L72A 1P2LA 5KXNA 4DDAA 2RB2X 1C08C 1DI5A 1GBXA 3F8VA 5LVIA 1IR9A 1C69A 4PGJB 246LA 4FDYA 3A92A 4XJHA 4DYGA 5LXWA 1C60A 1L0JA 3GUNA 1XEKA 1NQIA 1L34A 1IP1A 1FN5A 3HBEX 1XEIA 1LSZA 224LA 4A7DA 5LVHA 1P36A 3SB6A 1C65A 2Z2EA 4ARLA 1L91A 186LA 107LA 3HT6A 2XBSA 1JTTL 1V7SA 3P68A 1QTVA 1CU2A 4EPIA 1G0KA 4NHSA 1JQUA 2RBSA 1DPXA 3GUKA 3AGGG 2LYZA 5C6JA 212LA 3A3RX 3A34A 3A67Y 1QTHA 4DDCA 2PC2A 4IASA 2FBDA 1D6QA 4D9ZA 4BAFA 2B6TA 1ZYTA 1QT5A 1GFKA 1L24A 5HLLA 1L86A 1B5YA 5DN5A 1JJ0A 102LA 1RFPA 2B6XA 1JWRA 1DXJA 3TXDA 1XGTC 5L3HA 1YKYX 174LA 2LYOA 3W6DA 4G9SA 1P37A 1IOQA 4HJVA 3AZ7A 1LSYA 5I53A 1IY4A 4H9HA 1C6PA 1L63A 1OYUA 2IFFY 2H5ZA 4BADA 4NSIA 4GCDA 1D9WA 4DKLA 5A3ZA 1F6SA 3J6KA 1C6NA 2ZIJA 4I7PA 1LKRA 1QTZA 1XJUA 4GCEA 1ZWNA 1QTCA 5HQ1A 139LA 5B06A 4ETBA 1QTDA 1L45A 1GPQC 4H9EA 134LA 249LA 2LYMA 1REYA 4DT3A 2ZNXY 4PK0A 5HNLA 1L43A 3GXKA 4UWNA 3WVXA 156LA 3TMXA 4DAJA 1LMCA 2RBOA 4OO9A 4ETAA 1DI3A 4CJ2A 3G3WA 1LHLA 1L41A 4XADA 4DD3A 2DQEY 5IELA 4CHXA 2FYDA 2CDSA 4GN3A 4LFPA 1L50A 4WG1A 3DN2A 1F0WA 242LA 4LYMA 1T97A 2G4PA 3TXIA 236LA 255LA 184LA 2RBPA 5DN4A 4XJBA 3PDSA 3NY9A 1IO5A 2ZQ3A 1GF5A 1LSEA 1JTNA 5F9XA 4PRQA 4W56A 1HF4A 1I56A 1L10A 1UA6Y 1GE4A 1GFTA 114LA 1L07A 4IJ4A 3N9CA 1JSEA 3WW6A 1GBOA 1IWYA 180LA 4KPMA 2ZNWY 1HSXA 4W96A 1ZV5L 4HP0A 1L87A 1L03A 5JENB 1LZGA 162LA 1L14A 4QEQA 2RB1X 2HUBA 1CJ7A 1LZDA 4W58A 1B7MA 138LA 1JISA 3DMZA 4G4HA 1WTMA 3P64A 2ZYCA 1H87A 3DN4A 4HJYA 1TAYA 214LA 2HTXA 1L76A 4H9FA 2YVBA 1QT8A 2NTGA 5KXRA 5FCPA 1UIDA 1T6VL 4YXCA 1L13A 2YBMA 196LA 3DN3A 3ZEKA 2IGCA 1HEPA 2ANVA 2YBHA 4H92A 1C43A 137LA 1GF7A 2MEFA 1L32A 3L2XA 1LYFA 197LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 142L A;  4WM6 A;  3G3X A;  3W3E A;  4WL7 A;  5I54 A;  5LIN A;  1BQL Y;  4H9C A;  1G06 A;  4WLX A;  1GD6 A;  1LTM A;  193L A;  195L A;  2F4G A;  3C7W A;  2Z12 A;  4GLV A;  2B6Z A;  1P56 A;  1ALC A;  5J7C A;  4ARM A;  1LMA A;  1HFX A;  2BQG A;  3AYQ A;  1RI8 B;  1HHL A;  1UIF A;  1YRO A;  1WVV A;  1NF5 A;  104L A;  3HTG A;  4I0C A;  4EKQ A;  2C8O A;  4YXA C;  3TMV A;  1H6M A;  4I7O A;  2ZWB A;  4ARP A;  113L A;  4LDO A;  1LOZ A;  4LT1 A;  1PQI A;  2D91 A;  3HDF A;  1D9U A;  3HH6 A;  1UC0 A;  259L A;  1C10 A;  4H8Y A;  5T3F A;  3LN2 A;  4ML7 A;  1IX0 A;  4EPF A;  1L39 A;  3TXK A;  129L A;  4NEB A;  2QB0 B;  160L A;  4L41 A;  3RT5 X;  1OUE A;  5KXP A;  4OWA A;  247L A;  1LJE A;  1GBS A;  2MEI A;  153L A;  2HEC A;  1T6H A;  154L A;  111L A;  1C6E A;  1G7I C;  1CKC A;  4PPO A;  5FEK A;  213L A;  2OU0 X;  1YQV Y;  1YAN A;  4IAT A;  1IR7 A;  3EXD A;  1BVX A;  4UWU A;  4EOF A;  1C6T A;  4WM3 A;  4FJR A;  2HU3 A;  1ZUR A;  4U3X B;  4H93 A;  2XQO A;  5LAF A;  1L01 A;  3AW7 A;  250L A;  1QUG A;  4GN4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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