157LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFAAALAALAAKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 57
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 157lA00
1L90A 244LA 1L36A 1LGXA 158LA 2Q9EA 2F2QA 3G3XA 151LA 200LA 213LA 1P56A 180LA 1L54A 1L74A 1C6QA 229LA 241LA 2OTYX 2F32A 4ARLA 1PQDA 237LA 1DYDA 1L45A 1L97A 1K28A 4GBRB 152LA 1KW5A 3OE0A 3DN4A 1L50A 1L32A 3DN2A 2B6YA 162LA 3HH4A 1L20A 2RBQA 3SB9A 138LA 1P2RA 148LE 217LA 4S0WA 3OE9A 1L66A 103LA 3C7YA 252LA 104LA 1CV6A 143LA 1L08A 226LA 1KY1A 233LA 3DKEX 2L78A 4I7RA 4ARMA 122LA 1L57A 3HT7A 1DYEA 1JTMA 2B70A 149LA 165LA 255LA 4W52A 3DN0A 118LA 1PQJA 3FADA 239LA 4LDEA 1T8AA 220LA 2B6TA 1CV5A 1L38A 1L99A 1L84A 1SWZA 3OE8A 4ARMB 190LA 4YXCA 1L61A 4W53A 1QSQA 4OO9A 3GUPA 1L34A 1L01A 167LA 1C6CA 1L62A 3HDFA 1CV3A 228LA 169LA 261LA 4EKSA 1CV1A 1L48A 3CDVA 1L35A 109LA 3HUKA 224LA 195LA 3DN1A 4LZMA 4W54A 2RAYX 4LDOA 113LA 1L73A 1SWYA 4K5YA 185LA 1L0JA 137LA 4ZPUA 3GUNA 3HT8A 1QTDA 214LA 3HTDA 1CUQA 1PQMA 3DMZA 2Z6BA 3V2WA 1CVKA 256LA 1D3MA 110LA 123LA 1C6AA 1L58A 1QUGA 182LA 1NHBA 1G1VA 1L04A 3CDTA 1LI3A 3NY9A 7LZMA 2QB0B 4I7QA 1L23A 1L00A 4I7OA 1XJUA 2RBOA 1ZWNA 2B6WA 1LYFA 2A4TA 4EPFA 115LA 2RB0X 3HU9A 1L67A 2LZMA 2LCBA 1L42A 3CDRA 1QTCA 102LA 159LA 1P5CA 2RB1X 3C8RA 128LA 3DN6A 2OU9A 1L64A 234LA 3PBLA 2CUUA 1C6BA 2LC9A 1L81A 212LA 2IGCA 1LW9A 1DYAA 1C6MA 186LA 1OWZA 130LA 1DYBA 2RBNA 3DN8A 1C6GA 4I7NA 125LA 2HULA 3C81A 3HH5A 4W59A 3ODUA 1L51A 1QT5A 172LA 3SBBC 3HDEA 4EXMA 1T8FA 163LA 1G06A 120LA 2B73A 2RAZX 3SB6A 170LA 1OYUA 4W55A 1L43A 5LZMA 1CU0A 119LA 1L46A 1G0KA 3NYAA 4W58A 1G1WA 1SX7A 1C6IA 1L75A 142LA 1C6JA 3LZMA 1L83A 1L33A 1PQKA 1D3FA 1L88A 157LA 1L02A 171LA 1OVJA 174LA 219LA 1OWYA 2O7AA 3V2YA 4YX7C 1KW7A 4W57A 1L91A 3DN3A 1L31A 210LA 3C80A 4DAJA 1QTBA 1L56A 254LA 1QUDA 1P64A 1C6DA 2NTGA 1LYDA 225LA 3GUJA 1L05A 1L92A 3GUOA 1D2YA 1C68A 1QT3A 176LA 1G0JA 235LA 221LA 1C64A 3GUKA 1C6EA 1CU3A 1L82A 2B74A 1D9WA 4PK0A 1L85A 3QAKA 3SB8A 3C8QA 1G0MA 1LWGA 1XEPA 222LA 3GUMA 140LA 184LA 1CU2A 187LA 2ANVA 156LA 1L79A 3L2XA 3RUNA 1L98A 240LA 1OV5A 3K2RA 4ARQB 1C6LA 242LA 1L27A 262LA 4I7LA 1L37A 2F47A 3VW7A 183LA 1L13A 1L47A 248LA 3JR6A 245LA 1CUPA 1L07A 1G0LA 1L12A 1OV7A 4DKLA 3OE6A 258LA 2RH1A 3HU8A 257LA 3HTFA 2OE7X 3NY8A 3D4SA 1L77A 1L70A 178LA 4YXAC 1L18A 3SBAA 3HUQA 1QT6A 129LA 1L49A 206LA 4W51A 1P6YA 1LYEA 1TLAA 1C6TA 1L40A 243LA 127LA 147LA 1P46A 173LA 1P2LA 2NTHA 3EMLA 1T8GA 1QS9A 126LA 2RBRA 4I7JA 232LA 2QARC 1G0QA 247LA 1L52A 205LA 1T6HA 3GULA 1L15A 1P36A 1LGWA 3PDSA 4I7MA 1L22A 1D3NA 1QT8A 1C6NA 1CTWA 3F8VA 2B6XA 6LZMA 2HUKA 251LA 139LA 1L94A 260LA 1L87A 3DNAA 1L28A 1LYGA 3HH6A 2OEAX 1L29A 199LA 238LA 246LA 189LA 2B75A 4AQNA 1L06A 4EKRA 3CDOA 1L26A 175LA 1L60A 1CX6A 1I6SA 1T97A 2RB2X 4EKQA 192LA 3DMVA 1C67A 1L59A 1QTVA 131LA 112LA 3FI5A 211LA 1L53A 1LWKA 1QS5A 250LA 3C7ZA 3G3WA 168LA 1L69A 141LA 1L21A 2O79A 2O4WA 209LA 3HTGA 3CDQA 4I7PA 4I7TA 1D2WA 155LA 3SB7A 1CV4A 3GUIA 4IAPA 1L71A 1C65A 1QTHA 1C6PA 3DMXA 4LDLA 1QSBA 107LA 216LA 196LA 227LA 3C7WA 4PJZA 1P3NA 1LPYA 1C62A 218LA 1L30A 1QTZA 1C6FA 1QT7A 1G0GA 1QUHA 4EPIA 2OTZX 1OVHA 164LA 230LA 2OU0X 2OU8A 1LI6A 4ARQA 1LGUA 181LA 1SSWA 3HT9A 1CV0A 1CU6A 259LA 1OVKA 4ARPA 4GRVA 253LA 145LA 1C6HA 1DYGA 1L0KA 4ARJA 3L64A 236LA 197LA 160LA 1SSYA 3HH3A 1CU5A 1LLHA 1WTHA 177LA 1LI2A 191LA 1LYIA 2RBPA 2ANXA 3C8SA 3RZEA 1L65A 1KNIA 1L39A 1L25A 3HUAA 201LA 1L03A 3UONA 1LYHA 1L80A 1L11A 144LA 108LA 146LA 1L44A 1C69A 4DJHA 198LA 4W56A 3F9LA 1PQIA 1G0PA 1EPYA 1L55A 1L10A 1L41A 111LA 2RBSA 3C82A 2OE9X 3HWLA 1L16A 1L93A 223LA 215LA 4I7SA 1ZURA 3HTBA 1C60A 166LA 1L86A 1L17A 1JTNA 1G07A 1JQUA 1L68A 3G3VA 1C63A 1L89A 1LYJA 150LA 3C83A 1ZYTA 1L76A 114LA 2OE4X 2B6ZA 1L95A 3SN6R 161LA 4E97A 1XJTA 3SB5A 2Q9DA 1QT4A 231LA 1P37A 1SX2A 2B72A 1L96A 1L19A 3HT6A 1KY0A 1QUOA 4I7KA 1L63A 1C66A 188LA 249LA 1L14A 1KS3A 2HUMA 1DYCA 4EKPA 1P7SA 1L24A 1DYFA 1C6KA 1D3JA 4EJ4A 5I14A 1PQOA 1CX7A 3FA0A 2B7XA 1B6IA 1C61A 1L72A 1L09A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EMSA 1L90A 1LZ1A 5I5QA 2CGIA 5APEA 1YAPA 200LA 4W94A 213LA 1KIPC 1LSFA 3M3UA 3G3BB 2NWDX 3WVXA 1K28A 152LA 1CKCA 1L50A 3HH4A 1A2YC 162LA 3J4GA 2RBQA 5T3FA 2EQLA 3OE9A 1FLQA 1REZA 4GN3A 154LA 1CV6A 1L08A 233LA 1KXWA 122LA 1CKFA 1NMMA 1GEZA 2G4NA 3P66A 165LA 4W52A 2HUBA 4C3WA 4LDEA 1T8AA 1CJ9A 4ARMB 3CT1A 1LZRA 1QSQA 1YKZX 4E3UA 5I4YA 3OJPA 4H9IA 1CV3A 4LT1A 4EKSA 1IO5A 1CV1A 4LYTA 1L48A 3CDVA 4I0CA 4N5RA 1L35A 3AJNA 2W1XA 3FI7A 3DN1A 2F2NA 3A94A 1QTKA 1SWYA 185LA 1LJ3A 137LA 1QTDA 1FDLY 4H94A 3QY4A 3DMZA 4GCFA 1QUGA 1L58A 4HP0A 1LZDA 1NHBA 1G1VA 1B5VA 2QB0B 4I7QA 1HEWA 2EKSC 2RBOA 4CFPA 1B7NA 1QQYA 1HMKA 3GXKA 4KT3A 7LYZA 4B4JA 5HLLA 1LYFA 3AW6A 2RB0X 2LZMA 5KXTA 1SQ2L 128LA 2C8PA 4GCBA 3DN6A 2Z2FA 3CSQA 1IORA 1LMCA 2CUUA 2LC9A 1F6RA 3ULRA 5LYTA 1DYAA 1UICA 1P2CC 130LA 1DYBA 1IWVA 3G3AB 3A3QA 3HH5A 2D4JA 4TSBA 2FBBA 5LA8A 1JJ1A 1LJ4A 1AT5A 1UCOA 3WVYA 120LA 3SB6A 4BAPA 1L43A 4WM6A 119LA 1GF5A 3NYAA 4PPOA 3AGIA 1C6JA 1WQPA 2BQAA 1GB8A 1PQKA 3CB7A 5L3HA 1L88A 1J1PY 2BQJA 3B6LA 2AUBA 2BQCA 4NHIA 1OVJA 219LA 3V2YA 1KW7A 1QSWA 1C46A 2D4KA 1QDRA 5J7CA 3SP3A 3DN3A 1LZGA 3C80A 254LA 4GN4A 4H9CA 4WMGA 1GXXA 2NTGA 1L05A 4DD9A 1GDXA 176LA 4HTNA 5HQ1A 3GUKA 1C6EA 1L82A 2Z12A 2B74A 3WULA 1L85A 1CKDA 5IELA 3C8QA 1XEPA 1CU2A 4HJYA 3A93A 3D3DA 3RUNA 1L98A 3WU9A 1PZYA 5ILFA 242LA 3RNXA 4UWVA 2CJLA 4I7LA 2W1MA 1L37A 5DN4A 2F47A 183LA 1HHLA 1L47A 4H93A 248LA 132LA 5I54A 3F6ZA 1T6VL 1OUHA 4DKLA 4KPMA 1IOQA 1GFVA 1LYOA 1VATA 258LA 2RH1A 2F4GA 4H9AA 3HTFA 2OE7X 1KXYA 1G7LC 178LA 4GLVA 3SBAA 3HUQA 2MEHA 129LA 1L49A 243LA 147LA 173LA 1P2LA 1T8GA 1QS9A 5I53A 126LA 1QSAA 4I7JA 4HSFA 1NDGC 2VB1A 3GULA 2MEBA 1T6HA 1GF9A 1L15A 4KXIA 1J1XY 1BWJA 4CHXA 1L22A 1HFYA 1JPOA 6LZMA 4WM5A 5LIOA 1E8LA 2Z39A 5FELA 4G49A 260LA 3DNAA 1JUGA 1LOZA 2OEAX 4AQNA 2YVBA 2Z18A 3EXDA 1L26A 1L60A 1CX6A 2LYOA 5LXWA 4HTQA 2HECA 4EKQA 3KAMA 3B72A 1J1OY 1HENA 211LA 1L53A 1ZV5L 250LA 4NGIA 2CDSA 1C7PA 2I26L 3T36A 5KXWA 3W6BA 2O79A 1QDTA 3N9CA 3W6CA 1IP3A 1GFRA 2ZYCA 2O4WA 5HNLA 1D2WA 1UC0A 4IAPA 1QTHA 3DMXA 2DQEY 1REYA 4WM3A 107LA 1VAUA 216LA 2HEBA 196LA 227LA 3C7WA 3M18B 4EMNA 218LA 4EPIA 2LZ2A 1B7SA 1GXV2 5KXZA 5LAFA 2OU8A 3ATOA 1JKCA 1UBZA 5K7OA 1IIZA 3AYQA 1SSWA 1CV0A 1NKHA 5A3ZA 4WG7A 4NGWA 259LA 1Z55A 1C6HA 1QTEA 3HH3A 3OK0A 1QUSA 1WTHA 177LA 1LI2A 1BB3A 191LA 1HEMA 3HFMY 1LZ6A 3RZEA 1T3PA 1L65A 1JJ3A 1LJKA 1L25A 1C10A 1L03A 4NY5A 1B7MA 1XEKA 146LA 4DJHA 2Z38A 3F9LA 1PQIA 3A6BY 1GBXA 111LA 1OUFA 2OE9X 223LA 1QIOA 1ZURA 4H8YA 1OUEA 1JTNA 1G07A 1JQUA 4DT3A 4DWXA 4N1CC 1XEJA 3G3VA 5B06A 5DM9A 1OUDA 1VDTA 3C83A 1HNLA 1L76A 1EQ4A 2N5ZA 2B6ZA 2XTHA 4H1PA 4NWEA 1NF5A 5E4PA 4E97A 1IC4Y 5KJ9A 3A8ZA 4HV2A 1L96A 2ZNXY 4PJ2C 1UUZC 1C66A 2IHLA 1KS3A 4XJGA 1L24A 3FA0A 1CX7A 2B7XA 1B6IA 1LAAA 1L06A 4N1EI 2ZIJA 1I20A 1L36A 1LGXA 4DD1A 1PS5A 4ML7A 2Q9EA 2F2QA 4B1AA 4C5FA 151LA 1P56A 2OTYX 2BLXA 2F32A 5LA5A 1F6SA 3B0KA 1DI4A 3A96A 1AM7A 1YQVY 1VFBC 5KXPA 1XGTC 3OE0A 1LTMA 1GB0A 3DN2A 3DN4A 1V7TA 1NHEA 3AGHA 148LE 1GFHA 217LA 2BQHA 3P68A 3LYZA 4ETDA 3TMVA 1CJ6A 252LA 104LA 143LA 3DKEX 1JITA 3VWOA 1L57A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3EMS A;  1L90 A;  1LZ1 A;  5I5Q A;  2CGI A;  5APE A;  1YAP A;  200L A;  4W94 A;  213L A;  1KIP C;  1LSF A;  3M3U A;  3G3B B;  2NWD X;  3WVX A;  1K28 A;  152L A;  1CKC A;  1L50 A;  3HH4 A;  1A2Y C;  162L A;  3J4G A;  2RBQ A;  5T3F A;  2EQL A;  3OE9 A;  1FLQ A;  1REZ A;  4GN3 A;  154L A;  1CV6 A;  1L08 A;  233L A;  1KXW A;  122L A;  1CKF A;  1NMM A;  1GEZ A;  2G4N A;  3P66 A;  165L A;  4W52 A;  2HUB A;  4C3W A;  4LDE A;  1T8A A;  1CJ9 A;  4ARM B;  3CT1 A;  1LZR A;  1QSQ A;  1YKZ X;  4E3U A;  5I4Y A;  3OJP A;  4H9I A;  1CV3 A;  4LT1 A;  4EKS A;  1IO5 A;  1CV1 A;  4LYT A;  1L48 A;  3CDV A;  4I0C A;  4N5R A;  1L35 A;  3AJN A;  2W1X A;  3FI7 A;  3DN1 A;  2F2N A;  3A94 A;  1QTK A;  1SWY A;  185L A;  1LJ3 A;  137L A;  1QTD A;  1FDL Y;  4H94 A;  3QY4 A;  3DMZ A;  4GCF A;  1QUG A;  1L58 A;  4HP0 A;  1LZD A;  1NHB A;  1G1V A;  1B5V A;  2QB0 B;  4I7Q A;  1HEW A;  2EKS C;  2RBO A;  4CFP A;  1B7N A;  1QQY A;  1HMK A;  3GXK A;  4KT3 A;  7LYZ A;  4B4J A;  5HLL A;  1LYF A;  3AW6 A;  2RB0 X;  2LZM A;  5KXT A; 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