158LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNALAMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 56
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 158lA00
213LA 1C6PA 1CU2A 4EKRA 249LA 1P64A 1XJUA 3ODUA 1L81A 3HT8A 4I7TA 188LA 1L96A 165LA 1L61A 4DKLA 1OWZA 3C8SA 1L98A 4AQNA 1P36A 3C82A 1L14A 1DYAA 1L12A 1G0KA 1L36A 1QUGA 186LA 2B75A 1D3FA 2B6WA 2OU0X 3D4SA 2RBSA 3JR6A 2B72A 3GUJA 3HTBA 1P6YA 1D3NA 1C67A 158LA 1LYFA 1QSQA 1T97A 217LA 1L51A 1L21A 1D3MA 3SBAA 258LA 1ZURA 1L58A 3SBBC 3LZMA 1OYUA 2LZMA 1T8GA 3G3XA 1L93A 1L31A 2HULA 3C81A 1G0GA 1KY0A 4I7RA 1L22A 161LA 3DN3A 1C6AA 1G0PA 1L10A 3HTFA 1L44A 2HUMA 3DMXA 4YXAC 1L63A 4I7KA 1P3NA 257LA 4EPFA 250LA 1KW7A 156LA 4EXMA 3RZEA 3C80A 1QT5A 1PQJA 1L25A 1TLAA 3SB9A 3NY8A 2A4TA 4I7OA 1CUPA 3SB5A 3SB8A 6LZMA 1OVJA 1PQDA 1L47A 167LA 1L45A 1SWYA 1L79A 1P46A 1C6TA 199LA 104LA 1KNIA 3HTGA 169LA 2RB1X 2RBOA 3UONA 2B6ZA 3DN0A 1L56A 231LA 4LDLA 1K28A 164LA 3DKEX 2RB0X 1C65A 3DN6A 4OO9A 4ARQA 1QS9A 240LA 2CUUA 1I6SA 1SX2A 157LA 178LA 1CTWA 1JTMA 4I7LA 1G1WA 160LA 144LA 226LA 129LA 3HT7A 120LA 4LZMA 2IGCA 1C62A 146LA 1QT4A 4EJ4A 1CU0A 1L60A 4EKQA 228LA 2O7AA 182LA 1L53A 163LA 2OU9A 4I7MA 4ARJA 1SSWA 1QUHA 3K2RA 1C64A 1L50A 1DYGA 251LA 4DJHA 187LA 1G0QA 1NHBA 1L46A 1CV5A 1P5CA 1DYBA 1PQOA 3CDQA 255LA 150LA 253LA 237LA 4S0WA 166LA 3CDVA 1CU3A 214LA 107LA 222LA 3HT6A 173LA 1L03A 1QUOA 225LA 2RBPA 111LA 3HUQA 1L23A 1C6QA 1G0JA 1L15A 141LA 3RUNA 1D2WA 3G3WA 1L33A 119LA 1L69A 127LA 4I7JA 4W52A 1D2YA 3HU8A 224LA 1L64A 1C6JA 137LA 1OWYA 2B73A 1L39A 2B74A 1SX7A 2B7XA 1L67A 4I7QA 183LA 170LA 4LDEA 1L73A 1QT7A 4W58A 1L0KA 1PQKA 3C8QA 3L64A 3DN1A 4ARLA 1L91A 1C66A 1L85A 1L38A 4YXCA 1L35A 1L87A 1L48A 1CX7A 1L00A 3L2XA 1L13A 1L74A 212LA 3GUMA 1QT6A 2OE4X 1OVKA 3QAKA 1P2RA 1G07A 4ARMA 1T8AA 3GUKA 4W51A 1KS3A 1L27A 2F47A 1LYHA 1L84A 3GUNA 245LA 3C7YA 140LA 3HH3A 5LZMA 1LW9A 1C63A 3FADA 180LA 1OV7A 246LA 1JQUA 4I7SA 3DN2A 4W57A 1C6DA 3SB6A 1LYIA 1QTZA 198LA 4PK0A 3HUAA 1L71A 1XJTA 1QUDA 3VW7A 1L65A 1L30A 227LA 1P7SA 3HU9A 215LA 112LA 185LA 4ARPA 149LA 1C61A 155LA 233LA 1L49A 1LI2A 1KY1A 2L78A 2Q9DA 4K5YA 3C7WA 114LA 196LA 3EMLA 3FI5A 1LYEA 2OE9X 1L19A 4GBRB 152LA 1G1VA 262LA 1L18A 168LA 2RH1A 1L89A 1PQIA 1L95A 1LLHA 4W56A 143LA 1C6BA 1P2LA 1QSBA 128LA 1C6CA 2NTHA 1L42A 1C6FA 2LCBA 1G0LA 1C6NA 1C6EA 1L75A 1C68A 1L99A 2RB2X 1LWKA 184LA 175LA 192LA 230LA 151LA 195LA 1C6LA 3OE9A 1L59A 1L52A 3SN6R 1LGXA 1C69A 103LA 1L66A 1G0MA 1L32A 2F2QA 1LGUA 2O79A 2RBNA 5I14A 126LA 162LA 1QTBA 1CX6A 219LA 138LA 122LA 1L37A 1CV4A 1L01A 3CDRA 239LA 1CU6A 2OTYX 4ARQB 110LA 1C6KA 1CVKA 3FA0A 3HT9A 2RAYX 139LA 4YX7C 191LA 1L57A 1L54A 244LA 205LA 3GUPA 2ANXA 3HH5A 3GULA 1L17A 1QT3A 113LA 1QT8A 221LA 125LA 1L94A 1QTVA 1XEPA 4EPIA 1L86A 190LA 1OV5A 108LA 1L04A 1L40A 3NYAA 3DMZA 1CV3A 3OE6A 201LA 238LA 118LA 1C6MA 123LA 1DYFA 1CV0A 1CUQA 256LA 1C6HA 2O4WA 3HH6A 176LA 1L06A 1PQMA 259LA 4DAJA 1T8FA 181LA 2ANVA 3NY9A 1L88A 232LA 235LA 1L08A 3G3VA 4EKPA 4GRVA 1L0JA 4I7PA 1L68A 1QTCA 1L82A 1C60A 1L24A 211LA 223LA 3F8VA 2OU8A 145LA 4EKSA 1DYDA 130LA 4I7NA 102LA 3HWLA 3HDFA 3CDTA 3DNAA 1LYGA 1L26A 1LGWA 2RBRA 4W55A 1P37A 4E97A 261LA 4PJZA 3F9LA 218LA 147LA 206LA 1LWGA 1CV1A 229LA 3V2YA 1L02A 1OVHA 189LA 1QS5A 1LPYA 172LA 115LA 1L77A 2Q9EA 2NTGA 159LA 4LDOA 1ZWNA 3DN4A 1D9WA 2B6TA 3HH4A 2F32A 1G06A 3SB7A 2QB0B 2Z6BA 1JTNA 1QTHA 1L07A 1L20A 1EPYA 236LA 1SSYA 142LA 1P56A 4W53A 1L76A 1L90A 2RBQA 247LA 1T6HA 3CDOA 1L41A 3HTDA 2OEAX 2QARC 1CV6A 1L43A 3DN8A 1L29A 4ARMB 1B6IA 1QTDA 1L55A 197LA 131LA 1SWZA 1DYCA 1L92A 1ZYTA 3C83A 174LA 1LI3A 216LA 3OE8A 1L83A 1LI6A 260LA 3HDEA 1LYJA 2B70A 171LA 3GUIA 220LA 243LA 1L70A 252LA 1KW5A 1DYEA 1L72A 148LE 3DMVA 2B6XA 3PDSA 4IAPA 234LA 3C7ZA 2RAZX 1D3JA 1L16A 2LC9A 177LA 210LA 3GUOA 3HUKA 7LZMA 2OTZX 3PBLA 1L05A 2B6YA 1L11A 209LA 4W54A 248LA 1C6GA 2HUKA 3OE0A 1L62A 200LA 1WTHA 1C6IA 4ZPUA 3V2WA 4W59A 1L34A 242LA 1L97A 1L80A 3C8RA 1L09A 1L28A 254LA 1CU5A 109LA 241LA 2OE7X 1LYDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
213LA 1QTKA 1L81A 2A7FA 2YBNA 188LA 3WU9A 5FHWA 1DYAA 2B6WA 1JISA 1UIEA 1GFKA 5D5CA 3HTBA 158LA 1QSQA 1D3MA 1IOQA 2ZIJA 1L58A 3SBBC 1IWYA 1F0WA 2N5ZA 1L31A 1KY0A 4I7RA 3LYOA 1YAMA 5KXTA 1P2CC 2F4GA 3HTFA 4HSFA 5KXLA 1IWVA 2HUMA 3J6KA 4YXAC 4I7KA 1P3NA 257LA 1LJHA 4ETCA 1GAZA 1GBSA 4NGWA 5KXNA 1IC7Y 1GWDA 1LZYA 3AZ7A 4ETDA 1FLUA 1L47A 5ILFA 1LKRA 104LA 1UIDA 169LA 4NGVA 2RBOA 1IR7A 3AJNA 5B05A 1EL1A 1L56A 2RB0X 1C65A 4II8A 1IWXA 1GFEA 3WULA 1LZBA 2MEAA 3RW8A 1G1WA 1VDQA 2YDGA 1LJFA 120LA 3TXEA 2IGCA 1VEDA 1L60A 4YM8A 1GBOA 182LA 1CKGA 3G3AB 2OU9A 1TBYA 4QY9A 1C46A 1OUFA 4HTQA 2IFFY 1DYGA 251LA 194LA 187LA 4YOPA 1BB7A 4M4OA 1D0LA 1CV5A 1DYBA 1GFJA 4N5RA 3VWOA 2D91A 1NF5A 173LA 2RBPA 1G0JA 1IWUA 3TMXA 1L33A 119LA 1E8LA 4NY5A 127LA 3AGIA 4XADA 1YAOA 4W52A 3AGGG 2MEFA 2BQLA 4HTKA 1L64A 1C6JA 1W6ZA 2B73A 3CT1A 4MSTA 1B7SA 4HPIA 1LCNA 4YENA 4H9EA 1PZYA 5HNLA 1L0KA 1LZEA 5M1YA 154LA 4LYZA 1L91A 1H6MA 1A2YC 4YXCA 5DLAA 1GFRA 3L2XA 1IWWA 1L74A 4WO6A 4FDYA 2DBTA 2HEDA 3IJUA 2DKVA 4W51A 2F47A 1L84A 2CGIA 245LA 4GCDA 3GXKA 3C7YA 1W08A 4DT3A 1AT6A 1C08C 1JKDA 1LZ6A 1BHZA 5HMJA 3B0IA 1LMAA 4WM4A 4XENA 1LSGA 4DWXA 1LYIA 1IP7A 1IR8A 1FKVA 1B7MA 4WLDA 1JEFA 3HUAA 1IO5A 1B7RA 1QUDA 3KAMA 1L65A 1L30A 4KXIA 1P7SA 215LA 185LA 1LMPA 1GFGA 1GXV2 1L49A 1LI2A 3EMSA 1D0KA 2L78A 2Q9DA 2YBLA 1LYOA 1QUTA 1GF5A 1LYEA 1G1VA 1EQ4A 1FLYA 2HECA 3B6LA 5B1GA 1DKKA 2ZNXY 1L42A 2FYDA 4HTNA 1C68A 4RLNA 2BQJA 1REXA 2RB2X 4CFPA 1OUIA 1BWJA 4DC4A 4AGAA 4WG1A 3OE9A 2FBDA 5B07A 5LVJA 2LZTA 5LIOA 1LKSA 3ZVQA 4NHQA 4WM2A 2O79A 4LT1A 2BQAA 5I14A 1OUBA 4H94A 3W3EA 138LA 4XJHA 3WXUA 3CDRA 1GB0A 4ZEEA 1XEKA 3FA0A 1GFAA 1LYYA 4DDCA 3HT9A 3W6BA 2RAYX 4YX7C 4NHTA 1L54A 2F4AA 3GULA 221LA 125LA 2W1YA 1VATA 1JTTL 1L86A 4NGOA 1L04A 5II3A 3NYAA 1C6MA 2A7DA 123LA 1DYFA 4AXTA 1JJ1A 3HH6A 1PQMA 1JKAA 1UCOA 1YL0X 1T8FA 1L88A 4XJFA 235LA 1L0JA 1QTCA 2YBMA 2Z38A 1GB9A 1HSXA 4WO9A 1C10A 4I0CA 4C5FA 1G7HC 5APFA 261LA 2H5ZA 3F9LA 218LA 4A7DA 147LA 206LA 4XJDA 1B5ZA 229LA 3V2YA 4G4CA 4QEQA 4WL7A 3G3BB 172LA 5C6IA 2HTXA 4LDOA 3W6DA 3P64A 2F32A 4NWEA 2Z6BA 1A4VA 1LSCA 1L20A 1B7OA 1WTMA 1HMLA 1EPYA 1P56A 5F14A 1IP3A 2G4PA 1GFVA 2QARC 3GXRA 4ANRA 4ARMB 4DD2A 1L55A 197LA 1DYCA 4RW1A 3C83A 1GF4A 2MECA 216LA 4ZIXA 4IASA 1LI6A 260LA 2BQIA 3TXGA 1GE0A 4HV1A 1TEWA 1UACY 4H8ZA 2B6XA 4CGEA 1T3PA 4XJBA 4N9RA 3C7ZA 1HF4A 2RAZX 1ALCA 1L16A 1LZDA 1UUZC 210LA 4DQ7A 3HUKA 1CKHA 7LZMA 4W54A 248LA 1C6GA 3OE0A 5F9UA 1WTHA 4NGKA 4XYYA 4W59A 4OWBA 1OUAA 3RT5X 1REZA 1KXWA 1GBZA 1LZ8A 3ODUA 1VDPA 4I7TA 1AM7A 1FDLY 165LA 4DKLA 1IVMA 1OWZA 5F16A 3C82A 1L14A 4HJZA 1G0KA 4TWSA 2HEEA 1D6PA 2B75A 1D3FA 4OW1A 1JTOL 2OU0X 1BB6A 4H92A 5HQ1A 1WVUA 1D3NA 4W96A 4NHPA 1L51A 1L21A 2LHMA 1IP2A 4KL7A 1UICA 1ZVHL 2HULA 4Z46A 1G0GA 1LZCA 1GB8A 161LA 1C6AA 1IR9A 3DMXA 1L63A 4EPFA 250LA 3WUNA 1KW7A 1B7NA 1KIPC 2DQGY 1PQJA 1L25A 1IC5Y 2ZYCA 3MGWA 2Z2FA 1OUGA 2NWDX 5D5FA 3B0KA 2D4JA 3W6AA 1PQDA 2MEIA 3A34A 1L79A 1XGTC 1P46A 199LA 1KNIA 1GB7A 4OWEA 2RB1X 2EKSC 2B6ZA 134LA 4WLXA 1OQMA 231LA 4LDLA 1K28A 164LA 4WM3A 1JJ3A 4OO9A 1QS9A 2CUUA 4NSJA 1G7MC 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 213L A;  1QTK A;  1L81 A;  2A7F A;  2YBN A;  188L A;  3WU9 A;  5FHW A;  1DYA A;  2B6W A;  1JIS A;  1UIE A;  1GFK A;  5D5C A;  3HTB A;  158L A;  1QSQ A;  1D3M A;  1IOQ A;  2ZIJ A;  1L58 A;  3SBB C;  1IWY A;  1F0W A;  2N5Z A;  1L31 A;  1KY0 A;  4I7R A;  3LYO A;  1YAM A;  5KXT A;  1P2C C;  2F4G A;  3HTF A;  4HSF A;  5KXL A;  1IWV A;  2HUM A;  3J6K A;  4YXA C;  4I7K A;  1P3N A;  257L A;  1LJH A;  4ETC A;  1GAZ A;  1GBS A;  4NGW A;  5KXN A;  1IC7 Y;  1GWD A;  1LZY A;  3AZ7 A;  4ETD A;  1FLU A;  1L47 A;  5ILF A;  1LKR A;  104L A;  1UID A;  169L A;  4NGV A;  2RBO A;  1IR7 A;  3AJN A;  5B05 A;  1EL1 A;  1L56 A;  2RB0 X;  1C65 A;  4II8 A;  1IWX A;  1GFE A;  3WUL A;  1LZB A;  2MEA A;  3RW8 A;  1G1W A;  1VDQ A;  2YDG A;  1LJF A;  120L A;  3TXE A;  2IGC A;  1VED A;  1L60 A;  4YM8 A;  1GBO A;  182L A;  1CKG A;  3G3A B;  2OU9 A;  1TBY A;  4QY9 A;  1C46 A;  1OUF A;  4HTQ A;  2IFF Y;  1DYG A;  251L A;  194L A;  187L A;  4YOP A;  1BB7 A;  4M4O A;  1D0L A;  1CV5 A;  1DYB A;  1GFJ A;  4N5R A;  3VWO A;  2D91 A; 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