159LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLAMLQAKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 159lA00
1L20A 103LA 1KS3A 141LA 3VW7A 1CVKA 1L22A 3HH6A 3NY9A 1L75A 148LE 4W58A 1D3NA 1OVKA 3G3VA 1L12A 3HTDA 1CUPA 2HUKA 1CV4A 226LA 6LZMA 1L10A 3F8VA 1D3FA 3DMXA 1LYGA 2B6ZA 1LYIA 4I7OA 162LA 4W52A 1KW7A 188LA 1T6HA 4LDEA 3V2YA 1SX7A 1L67A 260LA 1L35A 3C8RA 3HTFA 2RB1X 4YXAC 205LA 3OE8A 4I7PA 2NTGA 2RAZX 223LA 1QTHA 1QT6A 3SN6R 250LA 1XJUA 152LA 3OE0A 175LA 215LA 4ZPUA 1L47A 2LZMA 1L05A 1L66A 1LGUA 126LA 3QAKA 1L80A 1L87A 3C7YA 4K5YA 1L82A 3HWLA 3GUKA 1L15A 3C8SA 3HTBA 1L49A 4ARPA 1P56A 197LA 2OEAX 1L38A 1L32A 1KY1A 3HUAA 3DN2A 1L18A 1D9WA 1KY0A 2RBOA 261LA 2B74A 109LA 1CU0A 3HDFA 1LI3A 1L16A 1QT3A 214LA 3HH4A 4EKPA 1T97A 3GUPA 1L17A 191LA 3HT7A 1L07A 210LA 4W57A 147LA 4YX7C 4LDLA 114LA 3HUKA 1L69A 1OWYA 161LA 173LA 1LYDA 1C63A 1L03A 1SSWA 1L93A 3LZMA 5I14A 1L64A 1ZYTA 1CV5A 257LA 187LA 1CV3A 2F47A 3G3XA 129LA 1LYJA 1C69A 1L53A 1G1WA 1L48A 1C6GA 1L73A 1P37A 1C61A 3FI5A 1C64A 1L61A 1LLHA 1L28A 3SBBC 1CX7A 4E97A 3CDOA 1L13A 4ARQA 3C83A 2Z6BA 1L43A 3UONA 1QTCA 1ZURA 1SWZA 3EMLA 144LA 4ARMB 2OE9X 122LA 145LA 4EJ4A 1LI6A 1C6HA 1L21A 1D2WA 182LA 1L92A 1JTNA 4I7NA 1C6FA 118LA 3DMZA 1DYEA 238LA 1L70A 1L84A 1L97A 3GUOA 1L37A 1QUDA 138LA 1KNIA 3C7WA 146LA 4PJZA 211LA 2B6TA 1G0JA 4S0WA 1L04A 1C6BA 4W55A 4DAJA 1T8GA 2LC9A 160LA 1OYUA 1TLAA 1CU5A 4LZMA 3HH3A 1G0QA 1L81A 1CV0A 1B6IA 112LA 1L86A 1L88A 1PQJA 1P5CA 216LA 1C6PA 1LWKA 4I7JA 4ARLA 2Q9EA 2RBPA 1L60A 1L0KA 4ARJA 178LA 192LA 1G0GA 1C60A 4AQNA 1L23A 164LA 1PQDA 1L01A 229LA 184LA 246LA 2NTHA 2F2QA 1L85A 1L08A 143LA 1CTWA 120LA 3FA0A 1L44A 1XJTA 209LA 2HUMA 180LA 2RBRA 1OVJA 3C81A 4GBRB 1L77A 1PQKA 195LA 1L40A 3GUNA 186LA 2IGCA 1P2RA 1JQUA 249LA 1NHBA 1C66A 1C6IA 1PQIA 227LA 128LA 150LA 1L52A 111LA 213LA 2A4TA 248LA 1C6NA 1QT4A 185LA 3HTGA 2QARC 4W51A 3L2XA 174LA 2B6XA 1T8AA 5LZMA 3RZEA 151LA 113LA 1OVHA 1L19A 3HDEA 183LA 258LA 3SB6A 166LA 217LA 102LA 2RBSA 2O7AA 212LA 3OE6A 163LA 4ARQB 1CU2A 2B73A 241LA 247LA 1CU3A 1C65A 4W53A 1L71A 4I7RA 3CDVA 1QT7A 1C6CA 1C6MA 4EKRA 1QUOA 2O4WA 236LA 2B75A 1L31A 2HULA 1DYBA 1DYGA 2B6WA 1G1VA 3C8QA 3SB8A 2B6YA 198LA 3FADA 1P2LA 1G06A 3DN8A 1OV7A 232LA 2RB2X 4PK0A 127LA 156LA 199LA 1L02A 245LA 3C7ZA 237LA 1L51A 181LA 1JTMA 1L41A 1C6DA 1OV5A 1DYCA 172LA 2RBQA 1L24A 1L65A 1L68A 3DN3A 1LPYA 3DN4A 1D2YA 2B7XA 1LW9A 176LA 1QUHA 1P7SA 4GRVA 1EPYA 4ARMA 1KW5A 1SSYA 3HT9A 159LA 165LA 4I7KA 1C6TA 3DKEX 3PBLA 1L79A 1QT5A 139LA 4W59A 130LA 1L0JA 4DJHA 3C80A 1C6LA 1QTDA 2B70A 3HU9A 2RBNA 1QT8A 262LA 3GUMA 3JR6A 123LA 2Q9DA 1L11A 1L45A 1L46A 2OU8A 140LA 4IAPA 1L06A 2ANXA 4EPIA 158LA 1QTZA 1L58A 4EKSA 1L62A 1XEPA 1SX2A 1C6QA 243LA 2OTYX 256LA 3C82A 7LZMA 1L29A 1L30A 1G0PA 1C6AA 1L36A 3ODUA 125LA 1C6JA 1D3MA 177LA 4I7QA 206LA 3SBAA 4I7TA 259LA 1PQMA 244LA 115LA 2B72A 252LA 1LYEA 1L57A 254LA 3HH5A 1P6YA 1LGWA 1LWGA 219LA 1PQOA 1P64A 1T8FA 189LA 234LA 104LA 108LA 1L94A 4OO9A 3SB7A 1G0MA 2QB0B 1P3NA 3OE9A 1QS5A 242LA 1G07A 3CDQA 137LA 3DN6A 155LA 167LA 1L14A 230LA 3D4SA 2RH1A 3CDTA 3HUQA 4EXMA 1SWYA 1D3JA 1L96A 3PDSA 228LA 1L72A 1L98A 220LA 251LA 253LA 1QTBA 1L56A 157LA 1L55A 2OU0X 4I7LA 4W54A 2O79A 169LA 3DN1A 3GULA 107LA 168LA 4EPFA 1ZWNA 3L64A 3HT6A 2RB0X 3DN0A 1L91A 222LA 1L39A 1P36A 149LA 4LDOA 1L34A 2ANVA 3RUNA 200LA 119LA 3GUJA 3HU8A 1QS9A 1L59A 218LA 3NY8A 1L33A 3GUIA 3F9LA 190LA 1L09A 1L26A 142LA 2OE7X 233LA 1L50A 2CUUA 1LGXA 1L63A 1QTVA 4DKLA 1L25A 171LA 1L42A 4I7SA 1L83A 1CU6A 1LI2A 224LA 1C68A 2OTZX 1L76A 2F32A 1L90A 1QUGA 4W56A 221LA 1WTHA 1QSQA 255LA 2OU9A 1CUQA 1K28A 1DYFA 2OE4X 1L54A 231LA 3NYAA 1CV6A 1DYDA 110LA 1L89A 3CDRA 4EKQA 1LYFA 235LA 3DMVA 2LCBA 1I6SA 1L74A 3V2WA 2RAYX 1G0KA 3SB9A 131LA 201LA 1CV1A 1L95A 1C6KA 1L00A 3HT8A 1LYHA 1OWZA 196LA 3DNAA 1C6EA 1G0LA 3K2RA 1C67A 2L78A 3SB5A 1L99A 225LA 240LA 1P46A 1C62A 3G3WA 239LA 1L27A 4I7MA 4YXCA 1CX6A 170LA 1QSBA 1DYAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OWHA 2MEIA 3HH6A 1BQLY 1L75A 4W58A 1LSMA 3G3VA 1L12A 1CV4A 1CJ9A 3F8VA 1D3FA 4I7OA 1IORA 153LA 4W52A 4WL7A 2D4KA 1D6PA 3V2YA 2HEFA 3TMWA 3C8RA 4DQJA 1GFGA 1CKDA 1QTHA 1QT6A 1W08A 3SN6R 250LA 5B06A 1IEEA 3A3RX 1HENA 1LSPA 4TSBA 4H9BA 2BQAA 4WM2A 4ZPUA 1T6VL 7LYZA 1H6MA 3KAMA 3QAKA 2DQCY 5LYZA 1L80A 3C7YA 1AM7A 4K5YA 1NBYC 1B5ZA 1GE1A 2Z2FA 1L49A 4PHIA 3WH1A 2OEAX 1LPIA 1D9WA 2RBOA 1CU0A 1QT3A 5FHWA 214LA 3HH4A 4H9EA 3D3DA 1HEPA 5KXWA 1HFZA 114LA 3AYQA 161LA 3CSRA 4XYYA 1GE2A 3W6BA 1L93A 3LZMA 1C45A 1ZYTA 4B1AA 1CV5A 3RNXA 4IASA 4H94A 5A3EA 3FI5A 1JTTL 1LLHA 1L28A 1BWIA 1QDRA 1QTCA 3UONA 1YROA 3EMLA 1YL1X 1BVXA 2B5ZA 1WQMA 145LA 3TMVA 4R6CA 2DQJY 1A4VA 1L92A 3WMKA 3IJUA 1JHLA 1B7QA 1LAAA 1JIYA 2BLXA 3G3BB 1LHIA 1G7JC 1WQRA 4PJZA 211LA 3WVXA 1L04A 5I54A 4ZFPA 1UA6Y 1KXWA 3B0KA 2HTXA 3TXFA 2HECA 2XBSA 3J6KA 4MR1A 1B5UA 1L86A 3F6ZA 3EO5A 1GF7A 1P5CA 216LA 1N4FA 3AW7A 3FE0A 1C6PA 1IWYA 1L60A 1IIZA 1L0KA 3A94A 4H91A 192LA 1C60A 2XBRA 2YVBA 1CJ7A 5C6LA 1GFAA 5IELA 184LA 2ZIJA 1L08A 3FA0A 3TXDA 4CHXA 4BS7A 1LOZA 5F9UA 1MLCE 5LVGA 195LA 3G3AB 186LA 1RE2A 1I1ZA 227LA 5FCPA 5APCA 4CFPA 3TXEA 2A4TA 4AXTA 4H9CA 3P66A 1LZ1A 3ZVQB 1YKYX 2B6XA 1T8AA 1VATA 113LA 5FEKA 1OVHA 4YM8A 3SB6A 217LA 102LA 4GN3A 2O7AA 1IOCA 4ARQB 1LYYA 2B73A 4ZIXA 1F0WA 1C65A 4GN4A 4W53A 1GFKA 1C6MA 4EKRA 1QUOA 1O23A 3E3DA 3GXRA 2B75A 5C6IA 1L31A 1LSEA 1DYBA 1G1VA 2B6YA 3FADA 1GE3A 3P4ZA 3BKHA 4ETBA 1IC4Y 1JUGA 194LA 4E3UA 1CKCA 1GB2A 3C7ZA 4N1EI 2LYZA 2BQOA 1JTMA 172LA 2RBQA 1ALCA 1LPYA 3DN4A 1GDWA 3W6AA 2B7XA 4OOOA 4B49A 1B7RA 4CFOA 1QUHA 1FLWA 4WLDA 4WLXA 1LZTA 3N9EA 159LA 3RZ4A 1C6TA 3PBLA 4W59A 4P2EA 1QUSA 5L3HA 5J7CA 1LJ4A 1I56A 1YANA 3EXDA 3ZEKA 3T36A 3GUMA 2DQGY 1DPWA 3AGGG 140LA 5LYMA 1GPQC 4LYOA 1KIPC 1XEPA 2Y8PA 243LA 256LA 3C82A 1L29A 1L36A 125LA 4H1PA 1UIFA 4I7QA 206LA 4PJ2C 4I7TA 5FELA 1GF5A 259LA 1PQMA 1LJGA 3EMSA 115LA 2B72A 4QY9A 1LYEA 2ZILA 1REMA 5B1GA 219LA 3WXTA 2EPEA 1PZYA 2W1YA 4OO9A 4DD3A 1IY4A 5I5QA 1J1XY 2QB0B 3OE9A 3CDQA 5L9JA 1LZNA 167LA 1RCMA 3D4SA 4MCKA 3CDTA 2CJLA 1D3JA 1GAZA 1VDTA 1L72A 3ATNA 1LSYA 220LA 157LA 1ZMYL 4I7LA 4W54A 2HU1A 3DN1A 107LA 4ETEA 1ZWNA 3L64A 1DQJC 1INUA 4CGEA 2ANVA 3RUNA 1F6SA 2HU3A 1IP7A 119LA 1GB8A 1L59A 4J7VA 3F9LA 1L26A 4XJIA 1BWJA 3FI7A 2VB1A 1GD6A 2BQKA 171LA 1L42A 4I7SA 1L83A 4LFPA 1LI2A 5F9XA 1L76A 3A92A 4WM4A 5B07A 1QUGA 221LA 3TXIA 4X3BA 1QSQA 1CKGA 1OP9B 1LYSA 134LA 1DYFA 2CDSA 3HFMY 1QUTA 4L41A 1UBZA 3NYAA 4EKQA 4TUNA 4NHSA 1KXYA 4IJ4A 3QE8A 1GBWA 4J0LA 1L95A 1GXV2 2GV0A 1BB6A 1OWZA 4WM1A 5KY1A 4HTNA 1GBYA 3SB5A 1F6RA 1L99A 5KJ9A 2H9KA 1L20A 103LA 1IP3A 3NY9A 1JKBA 148LE 1ZVHL 1D3NA 1XGRC 1LZYA 2G4QA 2HUKA 4NEBA 4LT3A 1L10A 1NMMA 1BGIA 1REXA 2B6ZA 5ILCA 4NGKA 5LXWA 4Z3MA 1KW7A 1T6HA 1AT6A 4ETAA 260LA 4C5FA 5E9RA 5L3IA 3HTFA 205LA 4WMGA 1WQQA 1B9OA 2RAZX 4ML7A 1LSGA 4O34A 1XJUA 152LA 3OE0A 4QGZA 175LA 4N0JA 1L05A 2X0AA 1IVMA 1GDXA 3A96A 126LA 2MEBA 4G9SA 5B05A 5F16A 5I4YA 1B5XA 3HWLA 3D9AC 3GUKA 1YIKA 1L15A 4LYCA 1L38A 1PS5A 1KY1A 3HUAA 2H5ZA 2B74A 5KXOA 1CKFA 4ZEEA 1AZFA 3HT7A 4LDLA 1DI4A 1LZ5A 1LSZA 1FN5A 173LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4OWH A;  2MEI A;  3HH6 A;  1BQL Y;  1L75 A;  4W58 A;  1LSM A;  3G3V A;  1L12 A;  1CV4 A;  1CJ9 A;  3F8V A;  1D3F A;  4I7O A;  1IOR A;  153L A;  4W52 A;  4WL7 A;  2D4K A;  1D6P A;  3V2Y A;  2HEF A;  3TMW A;  3C8R A;  4DQJ A;  1GFG A;  1CKD A;  1QTH A;  1QT6 A;  1W08 A;  3SN6 R;  250L A;  5B06 A;  1IEE A;  3A3R X;  1HEN A;  1LSP A;  4TSB A;  4H9B A;  2BQA A;  4WM2 A;  4ZPU A;  1T6V L;  7LYZ A;  1H6M A;  3KAM A;  3QAK A;  2DQC Y;  5LYZ A;  1L80 A;  3C7Y A;  1AM7 A;  4K5Y A;  1NBY C;  1B5Z A;  1GE1 A;  2Z2F A;  1L49 A;  4PHI A;  3WH1 A;  2OEA X;  1LPI A;  1D9W A;  2RBO A;  1CU0 A;  1QT3 A;  5FHW A;  214L A;  3HH4 A;  4H9E A;  3D3D A;  1HEP A;  5KXW A;  1HFZ A;  114L A;  3AYQ A;  161L A;  3CSR A;  4XYY A;  1GE2 A;  3W6B A;  1L93 A;  3LZM A;  1C45 A;  1ZYT A;  4B1A A;  1CV5 A;  3RNX A;  4IAS A;  4H94 A;  5A3E A;  3FI5 A;  1JTT L;  1LLH A;  1L28 A;  1BWI A;  1QDR A;  1QTC A;  3UON A;  1YRO A;  3EML A;  1YL1 X;  1BVX A;  2B5Z A;  1WQM A;  145L A;  3TMV A;  4R6C A;  2DQJ Y;  1A4V A;  1L92 A;  3WMK A; 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