160LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRALQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 60
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 160lA00
178LA 1L75A 128LA 2OE4X 1D9WA 170LA 158LA 1P5CA 104LA 1L22A 1L71A 1LW9A 1P37A 1CU5A 4I7QA 1P64A 1D3MA 3DN2A 3HT8A 242LA 4YX7C 3GUIA 139LA 1L51A 143LA 1CUQA 1C6JA 1G0QA 1L77A 120LA 1L83A 3GUNA 1L10A 1PQKA 1L00A 3HH4A 1L34A 4EKQA 1JTNA 1C63A 1I6SA 123LA 1DYDA 2L78A 4W54A 3DMVA 1L48A 155LA 1QTHA 259LA 3C8RA 1C6KA 1LYGA 1QTBA 6LZMA 260LA 1CU3A 1LPYA 115LA 226LA 3HU8A 1QUHA 1L87A 1NHBA 2OE7X 3PBLA 1L62A 4I7PA 165LA 246LA 4I7LA 1L43A 4W58A 1LI2A 1CVKA 186LA 146LA 3DN8A 3NYAA 1QTVA 138LA 1L05A 2B6XA 4IAPA 2B75A 211LA 1D2WA 4K5YA 171LA 1LYFA 1G0PA 2RBRA 247LA 1DYCA 1C6MA 1L85A 1G06A 1C61A 1C6TA 2RB0X 2RAZX 243LA 3C7YA 1DYGA 1L46A 225LA 182LA 2HUKA 3DMZA 1G0KA 1OVHA 2OU9A 1L16A 189LA 3SB5A 237LA 1CU0A 5I14A 1L98A 1QSQA 1L68A 145LA 212LA 1PQJA 214LA 1G0MA 195LA 1DYEA 257LA 1C6HA 1CU6A 1L41A 3DN4A 1OVKA 1ZYTA 1G1VA 3F8VA 3HH6A 3LZMA 1P36A 2CUUA 253LA 1LI3A 118LA 2NTHA 4I7RA 1L81A 3HTFA 1QTDA 1L0KA 1DYFA 1P7SA 254LA 4ARMA 196LA 2B73A 3OE8A 141LA 3CDOA 1XEPA 1L94A 1L90A 3VW7A 176LA 1L28A 1LYEA 1C66A 1L57A 1ZURA 3SN6R 3ODUA 1L92A 4EXMA 3V2WA 4ARPA 122LA 4DAJA 1TLAA 210LA 1L42A 1L53A 1L70A 1L84A 1SWZA 114LA 1T97A 3GUOA 4EJ4A 1C6QA 3RUNA 167LA 1QT4A 1C6DA 1L37A 3HT6A 3L64A 209LA 1C67A 240LA 1L35A 1L50A 1QT3A 1OWYA 1C65A 4E97A 4W52A 149LA 1JTMA 2HUMA 3SB6A 1XJUA 4I7NA 1OVJA 252LA 1L25A 4DKLA 1PQOA 2F47A 1L02A 1C6CA 3C7ZA 2QB0B 1OWZA 3NY9A 244LA 222LA 258LA 1L52A 1QTCA 1CV0A 3C8SA 1CX6A 2OTZX 1L24A 177LA 1L31A 169LA 1LYIA 1LWGA 1L49A 261LA 3CDTA 230LA 113LA 197LA 129LA 1C6NA 1PQMA 1L59A 1KW7A 1LYJA 142LA 180LA 3CDQA 4ARQB 4DJHA 2OEAX 1L21A 1L18A 1L44A 2Q9DA 2ANXA 190LA 3G3VA 1C6EA 1C6IA 137LA 1DYBA 1T8AA 183LA 192LA 1L73A 1L32A 1L30A 1L65A 1CTWA 188LA 199LA 1WTHA 1L86A 1QTZA 185LA 1SSYA 4LZMA 1C69A 1L17A 119LA 4W57A 3PDSA 1KY0A 262LA 1B6IA 206LA 1PQDA 2O4WA 1K28A 215LA 219LA 3HUKA 4AQNA 107LA 2B72A 1G0JA 1L55A 256LA 1L99A 1C6GA 3OE0A 1L95A 2B6TA 4EPFA 3CDRA 1L82A 1D3JA 1L91A 160LA 1P2RA 248LA 1SWYA 250LA 1DYAA 3JR6A 3SBBC 205LA 5LZMA 3GUKA 1CV6A 3HDEA 2IGCA 3HTDA 1JQUA 1L97A 3HTBA 234LA 111LA 4W55A 1QUOA 4PK0A 1L09A 216LA 1LI6A 2NTGA 1L01A 2RB2X 1QS9A 1L04A 4ZPUA 229LA 2OU8A 3C81A 4I7JA 4EKRA 1L66A 1L74A 1C6PA 2RBSA 1L79A 3NY8A 1LLHA 4EPIA 231LA 4YXCA 221LA 1L67A 1L80A 200LA 1L36A 2RBQA 1P2LA 3FADA 4GBRB 1T6HA 3HDFA 4YXAC 3SB9A 1L20A 3UONA 1XJTA 4EKPA 1L08A 130LA 148LE 2RBPA 1L38A 3C7WA 3DNAA 1T8GA 232LA 227LA 3G3WA 1C6FA 1L89A 1SSWA 3HUQA 4LDLA 1CU2A 1L61A 1L64A 1D2YA 3DN3A 1QT5A 1L0JA 103LA 1L12A 3GUMA 1P6YA 2RH1A 1L11A 108LA 1L54A 151LA 1L63A 2LZMA 161LA 187LA 4GRVA 175LA 127LA 1L13A 1CV3A 238LA 1P46A 3HTGA 218LA 1L33A 3SBAA 233LA 2B6WA 228LA 1G07A 2Z6BA 3QAKA 1L47A 1P3NA 1CV1A 3GULA 2B6YA 7LZMA 3SB8A 2A4TA 4I7OA 1L40A 245LA 1PQIA 3DKEX 255LA 181LA 235LA 1QUDA 1LYDA 150LA 163LA 1C6LA 1QSBA 2OTYX 3F9LA 1CUPA 1D3FA 3C8QA 109LA 3DMXA 4I7KA 1SX2A 1CV4A 191LA 3DN0A 2OE9X 1T8FA 2OU0X 3FA0A 3C80A 1D3NA 1KS3A 4PJZA 166LA 4W56A 1OYUA 2O7AA 147LA 1L72A 1L96A 1L58A 4LDEA 3HWLA 1L06A 1SX7A 3OE9A 3HUAA 4W53A 201LA 2LCBA 1QT7A 102LA 1KY1A 1C60A 1G0GA 4ARJA 217LA 1LGWA 4ARMB 1LWKA 1L15A 125LA 2O79A 1L88A 159LA 1C62A 2B6ZA 2ANVA 3D4SA 3HT9A 1L27A 1G0LA 3HT7A 4S0WA 172LA 223LA 3G3XA 3HH5A 2RAYX 4I7TA 2F2QA 112LA 1L03A 1L26A 2RBNA 1L69A 1KNIA 236LA 1L23A 126LA 4ARQA 3DN1A 251LA 131LA 110LA 1L76A 3OE6A 1C64A 224LA 2B74A 2LC9A 1C6AA 4I7SA 174LA 162LA 2QARC 3SB7A 1EPYA 1LYHA 1QT8A 173LA 1LGUA 1ZWNA 3GUJA 156LA 198LA 1C6BA 3K2RA 3RZEA 2RB1X 140LA 3C83A 1KW5A 1OV5A 4W51A 4LDOA 2HULA 157LA 184LA 3DN6A 3HU9A 3FI5A 3CDVA 168LA 1LGXA 1L14A 2B70A 152LA 1P56A 3L2XA 220LA 1QS5A 2Q9EA 1OV7A 1L60A 3EMLA 144LA 3GUPA 4ARLA 1L93A 241LA 4EKSA 3HH3A 1C68A 3C82A 1L56A 3V2YA 1L19A 239LA 1CV5A 1L29A 1CX7A 1L45A 1QT6A 2RBOA 213LA 2F32A 4W59A 4I7MA 1QUGA 4OO9A 2B7XA 1L39A 249LA 164LA 1G1WA 1L07A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
128LA 1KIRC 4NHIA 134LA 170LA 1D9WA 4DD0A 3KAMA 1OUCA 4H9CA 2BQJA 1BQLY 3EO5A 1HFZA 2VB1A 1LZ4A 3DN2A 242LA 3VWOA 4IJ4A 1C43A 3GUNA 1PQKA 2NWDX 5LYMA 1OUGA 1C63A 1DYDA 4W54A 2DQAA 1IOTA 3DMVA 259LA 260LA 1LPYA 115LA 4RW2A 3FI7A 3ZVQB 4BAFA 4HV2A 4WG1A 1G7HC 1L43A 1XFPL 3CT5A 4YM8A 1UACY 3WUNA 1LKRA 138LA 1OUBA 1JEFA 2D4IA 2B6XA 4FJRA 211LA 4K5YA 1G0PA 2IFFY 3FE0A 5J7CA 1C6MA 1VDSA 1JSFA 3W6CA 5KXXA 182LA 5B1GA 2CDSA 1OVHA 1Z55A 2Z37A 3A6CY 1QSQA 4G4CA 1IWWA 1G7JC 3TXFA 1PQJA 1IR9A 5DN4A 1RE2A 4NSGA 195LA 2G4QA 2HU1A 1C6HA 1L41A 1ZYTA 2BLYA 1G1VA 3F8VA 4G4HA 3HH6A 4C3WA 1KIQC 2YBHA 118LA 2ZQ4A 4NSIA 1L81A 2PC2A 1P7SA 4NGYA 1LJ3A 3G3AB 4DD2A 1XEPA 1KXYA 1GXXA 2LZ2A 1YL0X 1L92A 4DAJA 3WW5A 122LA 1I20A 2D91A 1L84A 132LA 1SWZA 4EJ4A 3RUNA 3QE8A 1C6DA 1GB9A 1L37A 1LJJA 1LYYA 5II3A 3AZ7A 4LFXA 1LOZA 4OW1A 1IEEA 1JTTL 4W52A 1JTMA 2HUMA 5E9RA 2MEHA 1XJUA 5I53A 252LA 1B7SA 1PQOA 1C6CA 2BQIA 3NY9A 4R0FA 2HEDA 4L41A 1DKJA 1L52A 1QTCA 1L24A 5HLLA 4DDBA 1GF9A 261LA 3AJNA 4I0CA 1QIOA 230LA 1JJ3A 5LVIA 1UBZA 1GB8A 129LA 3SP3A 1FLQA 1OQMA 1LSNA 1L21A 5IDDA 1L18A 3TXKA 2XBRA 1LJFA 2I25L 4NEBA 4DD1A 3M18B 1LTMA 1C6IA 1GFKA 1GAYA 137LA 183LA 5I4XA 1L32A 1B7MA 1L30A 1YANA 1BB7A 2EKSC 1QQYA 199LA 3D3DA 4D9ZA 1WTHA 1GFVA 1L86A 1OUFA 3OJPA 5APDA 185LA 1C69A 4G4BA 2YVBA 4W57A 4CHXA 1KY0A 3J4GA 2O4WA 1MELL 135LA 215LA 4NFVA 3HUKA 4AQNA 3WXTA 2BQEA 1LJNA 1L99A 1C6GA 1L95A 1GFGA 1L82A 1D3JA 3A3RX 1YKXX 4H9FA 2MEAA 248LA 3TXEA 5A3EA 1JSEA 1V7TA 5KJ9A 3B0OA 1J1OY 1QUTA 1GFEA 1LHKA 1CV6A 2FBBA 3MGWA 4Z98A 1JQUA 3HTBA 3A90A 2CJLA 2X0AA 1QUOA 3EBAB 4Z46A 3ZVQA 1INUA 1QS9A 2OU8A 1BB5A 4DQJA 1L66A 133LA 3NY8A 231LA 1GFUA 221LA 200LA 1L36A 1NBYC 3EXDA 1LKSA 5DLAA 1TAYA 1XJTA 1DKKA 1L08A 1YROA 2RBPA 1L38A 3C7WA 3DNAA 3BKVA 4ETAA 1JJ1A 1T8GA 3W3EA 5HQ1A 1CJ9A 1IO5A 3LZTA 1TDYA 1O23A 3W6BA 1QT5A 2DQFC 4GCDA 103LA 1NQIA 3A94A 1RJCB 2RH1A 4EMNA 2LYZA 4GRVA 1SLYA 127LA 2DQCY 1L13A 1P46A 218LA 1GBXA 2Z6BA 4XJIA 3GULA 2B6YA 3AGHA 2MEIA 4WM5A 1FN5A 1VDPA 1L40A 9LYZA 1OP9B 1PQIA 3RNXA 2DQGY 1D0KA 235LA 4FDYA 5KXMA 163LA 3A95A 2LZTA 4B4JA 1UC0A 1QDTA 166LA 5K7OA 1GB6A 1L96A 1L58A 1IY4A 2D6BA 3OE9A 4EOFA 4NHTA 1GF0A 4N9RA 1ALCA 2Z2FA 4ARMB 8LYZA 4XJGA 2O79A 1L88A 4NG1A 2B6ZA 3HT9A 1G0LA 3W6EA 2RAYX 3P68A 112LA 1L03A 5LA8A 1JKBA 2BQBA 5KXZA 2ZILA 3WL2A 236LA 3CT1A 1IC5Y 251LA 2BQFA 1LZNA 1YAPA 4WL7A 131LA 1L76A 4H8YA 3OE6A 2XBSA 4G49A 1LZRA 162LA 2F4AA 1UUZC 5IHGA 1IVMA 198LA 2F2NA 1CJ8A 2RB1X 140LA 1NDMC 5KXKA 1QSAA 3TXIA 1V7SA 4J7VA 5HNLA 3DN6A 3WVYA 1CKCA 1C46A 1QS5A 3ATNA 3WUAA 1D9UA 2W1LA 1GFJA 1HELA 1HMLA 1LSDA 4EKSA 3CB7A 5KKIA 3GXKA 5IELA 1IC7Y 1NKHA 3CT0A 4LT2A 1QT6A 4TUNA 1BHZA 4XN6A 4TSBA 4XJHA 2BQCA 2B7XA 2BQAA 4WM4A 1L39A 249LA 1GE1A 164LA 1ZURA 2MEGA 4B0DA 1LMQA 1B7LA 1A4VA 1LW9A 1L71A 1P37A 1DI4A 1VFBC 4I7QA 1D3MA 3IJVA 4IATA 4OWAA 3AGIA 1JJ0A 1L51A 143LA 1CUQA 4TSCA 5FSTA 1L77A 1BVXA 3HH4A 4EKQA 1JTNA 2G4PA 2C8OA 1I6SA 5FCPA 1WTNA 2L78A 208LA 4DC4A 1C6KA 1QTBA 1CU3A 3HU8A 4CJ2A 2H9KA 1L62A 4I7PA 165LA 246LA 1HSWA 4W58A 1LI2A 7LYZA 1QTVA 3TXDA 1L05A 1D2WA 1LYFA 1BB6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 128L A;  1KIR C;  4NHI A;  134L A;  170L A;  1D9W A;  4DD0 A;  3KAM A;  1OUC A;  4H9C A;  2BQJ A;  1BQL Y;  3EO5 A;  1HFZ A;  2VB1 A;  1LZ4 A;  3DN2 A;  242L A;  3VWO A;  4IJ4 A;  1C43 A;  3GUN A;  1PQK A;  2NWD X;  5LYM A;  1OUG A;  1C63 A;  1DYD A;  4W54 A;  2DQA A;  1IOT A;  3DMV A;  259L A;  260L A;  1LPY A;  115L A;  4RW2 A;  3FI7 A;  3ZVQ B;  4BAF A;  4HV2 A;  4WG1 A;  1G7H C;  1L43 A;  1XFP L;  3CT5 A;  4YM8 A;  1UAC Y;  3WUN A;  1LKR A;  138L A;  1OUB A;  1JEF A;  2D4I A;  2B6X A;  4FJR A;  211L A;  4K5Y A;  1G0P A;  2IFF Y;  3FE0 A;  5J7C A;  1C6M A;  1VDS A;  1JSF A;  3W6C A;  5KXX A;  182L A;  5B1G A;  2CDS A;  1OVH A;  1Z55 A;  2Z37 A;  3A6C Y;  1QSQ A;  4G4C A;  1IWW A;  1G7J C;  3TXF A;  1PQJ A;  1IR9 A;  5DN4 A;  1RE2 A;  4NSG A;  195L A;  2G4Q A;  2HU1 A;  1C6H A;  1L41 A;  1ZYT A;  2BLY A;  1G1V A;  3F8V A;  4G4H A;  3HH6 A;  4C3W A;  1KIQ C;  2YBH A;  118L A;  2ZQ4 A;  4NSI A;  1L81 A;  2PC2 A;  1P7S A;  4NGY A;  1LJ3 A;  3G3A B;  4DD2 A;  1XEP A;  1KXY A;  1GXX A;  2LZ2 A; 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