161LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTASLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 161lA00
1QT8A 2RBSA 148LE 159LA 1L95A 3OE8A 1CU6A 4ARMA 1D3FA 1DYAA 1KY0A 4ARMB 1L54A 2F47A 1LYEA 1L35A 2Q9EA 3FADA 169LA 4W59A 1L77A 1G1WA 3HUAA 1L74A 1JTNA 186LA 3CDOA 4I7PA 151LA 183LA 1C6FA 1T8AA 1G0JA 2QARC 205LA 249LA 1L68A 2LZMA 2RB2X 1DYDA 1TLAA 3G3VA 1OWYA 4I7SA 1XJTA 4W55A 1L75A 1ZWNA 2B6XA 1L86A 1CX6A 1L94A 1L29A 234LA 155LA 1L90A 1QT4A 4I7QA 3C8QA 114LA 239LA 4W56A 3C7YA 1XEPA 4I7MA 3DN2A 1QUDA 4I7OA 1L14A 2Z6BA 1L93A 1QTVA 146LA 3DKEX 253LA 1L61A 1P7SA 142LA 1P5CA 1L10A 2RBQA 1L64A 1L24A 1L13A 182LA 1L55A 228LA 1C6TA 1G07A 1PQKA 1EPYA 2RBRA 7LZMA 1L42A 1OVKA 2O4WA 196LA 150LA 1C69A 1LLHA 2OE7X 1SWYA 1G1VA 125LA 4W54A 1L51A 1L32A 246LA 3F9LA 5LZMA 189LA 1OV7A 2LCBA 1PQJA 2Q9DA 1L36A 3G3XA 4ARLA 1SSWA 1L80A 1G06A 252LA 138LA 1G0QA 1L43A 1PQMA 113LA 160LA 3HU8A 3GUPA 1L26A 1C6LA 3HT9A 147LA 1CTWA 1L23A 1P3NA 255LA 170LA 1CU0A 1L98A 1LI3A 1L25A 4ARQB 216LA 212LA 1L50A 215LA 2QB0B 4W51A 2RBPA 167LA 1DYCA 1L79A 1QTZA 1L82A 180LA 248LA 2B73A 3DNAA 1L56A 206LA 171LA 2OU0X 256LA 1L89A 112LA 4I7TA 1OYUA 4EKQA 2CUUA 1L88A 1QT7A 2OU8A 3SB9A 3FI5A 2B75A 211LA 1C6KA 172LA 185LA 240LA 2B6ZA 1D2YA 1PQOA 3JR6A 3SB8A 173LA 2RB0X 1C61A 1L18A 1LI6A 1L37A 243LA 2RH1A 1P46A 1C63A 1B6IA 3HDFA 3GUMA 241LA 1OV5A 128LA 1PQIA 1KNIA 1L69A 1DYBA 137LA 1C66A 1PQDA 1OVHA 3SBAA 2O7AA 222LA 2OU9A 1P37A 1L39A 1LYGA 126LA 1QUGA 219LA 4EXMA 1CU2A 1L01A 3DMVA 3QAKA 4K5YA 3NY8A 4OO9A 184LA 3DN6A 1C65A 177LA 1LGUA 1L84A 4YXAC 110LA 213LA 1C6AA 1L96A 1LYHA 181LA 3OE0A 1C6QA 1L91A 3UONA 1L59A 2A4TA 1CVKA 1D3JA 3C8RA 6LZMA 188LA 3HUQA 1P36A 4LDLA 195LA 1L49A 1KW7A 131LA 3C7WA 1JTMA 3CDQA 1L52A 1C60A 3HH4A 4PK0A 1L57A 1LGWA 4EPFA 232LA 3C80A 1JQUA 3HT7A 140LA 1LWGA 2NTHA 2ANXA 262LA 4W52A 1C6BA 4DKLA 2ANVA 1QS5A 3DN8A 1QTHA 250LA 1OWZA 1SX2A 3FA0A 2B6TA 1LWKA 1P2RA 1WTHA 2RBOA 1L0JA 1C6PA 1OVJA 1L46A 165LA 158LA 191LA 149LA 2HULA 2B72A 118LA 1L38A 1CU3A 1P6YA 3RZEA 4W57A 1L27A 1L21A 1P64A 1L99A 4E97A 3RUNA 3HTFA 3C81A 2B6WA 1L63A 3CDVA 254LA 2NTGA 217LA 1LGXA 3HDEA 1C6EA 260LA 2RAZX 1CV0A 1LYFA 144LA 210LA 3F8VA 1SSYA 4ARQA 2OTYX 218LA 2F2QA 103LA 174LA 1L67A 198LA 3C83A 3HTBA 2B70A 3L2XA 1C6NA 2OE4X 1L60A 259LA 4PJZA 141LA 4IAPA 4EKSA 1QS9A 1KS3A 4I7NA 3HTGA 3VW7A 1C68A 115LA 1C6MA 1L16A 1L58A 242LA 201LA 175LA 4I7LA 1LW9A 156LA 3SB7A 120LA 3CDRA 1LYIA 139LA 1G0MA 4LDEA 162LA 123LA 1L47A 4W53A 1L08A 1C62A 231LA 1L04A 102LA 3V2WA 1L92A 3DMZA 230LA 1L30A 1L85A 1T8GA 1L15A 145LA 1P56A 2O79A 1L71A 2IGCA 1C6HA 229LA 1L11A 1D3MA 1L70A 223LA 3DN0A 1L02A 168LA 3EMLA 3ODUA 3HWLA 1L45A 107LA 2RB1X 235LA 1K28A 111LA 258LA 3HU9A 3C82A 3L64A 3CDTA 1L40A 1KW5A 1QTBA 1QUHA 3V2YA 233LA 166LA 5I14A 1CV5A 178LA 4GBRB 176LA 4ARPA 1CV4A 4W58A 1QTDA 127LA 1T6HA 2L78A 1L62A 3DN3A 1SWZA 3GUIA 1G0GA 4EJ4A 164LA 1D3NA 1KY1A 1L22A 1L97A 2B7XA 1LYJA 3NY9A 1CV3A 4DJHA 4ARJA 130LA 163LA 1C6DA 3HH5A 1CUPA 4LDOA 3HH3A 1L33A 1L0KA 1L09A 1QT3A 1QSQA 3SB6A 1C6GA 3C7ZA 1L73A 4ZPUA 1QTCA 3GUOA 1L06A 1CV1A 1QT5A 3GUKA 4LZMA 1QSBA 1LPYA 236LA 152LA 3DMXA 4I7RA 1QUOA 199LA 4EKRA 214LA 2RBNA 1L66A 1L17A 1L12A 2B74A 2HUKA 3HH6A 1T97A 1L65A 3SBBC 143LA 245LA 225LA 1SX7A 119LA 4EKPA 3GUNA 1L00A 1L44A 1XJUA 3DN4A 3SB5A 3DN1A 157LA 1ZURA 3PDSA 3OE6A 161LA 1L34A 3C8SA 187LA 1C6IA 1C6CA 2OEAX 1CX7A 1P2LA 3PBLA 1D2WA 221LA 1G0PA 2RAYX 3D4SA 1G0LA 1DYGA 261LA 4YXCA 237LA 3GUJA 192LA 2F32A 2HUMA 104LA 197LA 109LA 1D9WA 1L83A 1L81A 3SN6R 108LA 1NHBA 224LA 226LA 1C64A 2OE9X 251LA 257LA 1QT6A 4YX7C 3HUKA 3OE9A 3HTDA 200LA 247LA 1CU5A 1L48A 1L05A 3K2RA 4EPIA 1L41A 1LI2A 190LA 1T8FA 1L53A 1LYDA 129LA 1DYFA 1C67A 244LA 1G0KA 4I7KA 1L87A 3G3WA 3LZMA 1L20A 4S0WA 122LA 4I7JA 1L31A 1ZYTA 238LA 1I6SA 3GULA 4AQNA 1CUQA 209LA 4GRVA 1L07A 3NYAA 1L28A 1DYEA 2B6YA 220LA 1L03A 2LC9A 1CV6A 4DAJA 1L19A 3HT8A 2OTZX 1C6JA 3HT6A 1L76A 227LA 1L72A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QT8A 148LE 1IWVA 1D3FA 1KY0A 2W1YA 2Z39A 2F47A 3HBHA 4NY5A 1L35A 3FADA 1L77A 1G1WA 4MCKA 4I7PA 2LYZA 1OUFA 183LA 2BQMA 1T8AA 3ZEKA 205LA 1IP2A 1TLAA 4DQ7A 4W55A 5KXZA 1L75A 1B7MA 4NGJA 2B6XA 1L86A 4UWNA 1IP6A 1GXV2 114LA 1BGIA 1GFVA 4M6DA 3C7YA 1BWIA 1QUDA 5FELA 3RU5A 253LA 4WO9A 1UIHA 4DQJA 1I20A 4OW1A 2YVBA 1L24A 4XYYA 1C6TA 1PQKA 1EPYA 1LZRA 1GF5A 2O4WA 4NWEA 1LAAA 4J1BA 4PRQA 4HPEA 5KXYA 4N1CC 246LA 5LZMA 4B1AA 2HECA 1PQJA 5APDA 1LMAA 3G3XA 1IP1A 2HU3A 2WARA 4C5FA 113LA 1KXYA 1GFUA 3HU8A 3GUPA 2BQOA 2W1MA 1Z55A 255LA 2HTXA 2YBNA 5F9XA 2BQEA 5A3ZA 1YAQA 5KKIA 1BB7A 216LA 215LA 1LJFA 4NHPA 4WLXA 1LZ4A 1LYYA 3WVXA 1B7RA 1GB6A 206LA 1LZNA 4NHSA 2CUUA 2XBSA 1OUBA 2Z2FA 4J0LA 5L3HA 4CFOA 1OUJA 4H9BA 4TWSA 4H1PA 240LA 3CT5A 1FDLY 3FI7A 1B7OA 173LA 4KPMA 2RH1A 1P46A 1B6IA 4GCEA 1GFGA 3GUMA 128LA 1T6VL 1L69A 3WMKA 1LSMA 2BQKA 2BLYA 126LA 1CU2A 5KXPA 3QAKA 3NY8A 177LA 3EO5A 3WUAA 3TMWA 181LA 1L91A 4XADA 4LYTA 3WYHA 3WL2A 1DPWA 3C8RA 4ET9A 195LA 2DQGY 1L49A 1IY4A 1H6MA 1O23A 1L57A 1LGWA 4NG8A 1JISA 3HT7A 4J7VA 1DKJA 1YROA 1LZDA 5KY1A 4G49A 1YQVY 3DN8A 1DZBX 2MEEA 1LSAA 1OWZA 1LSZA 3WULA 1LSBA 1PZYA 1P2RA 1B7LA 1LYOA 2HULA 2B72A 3EBAB 1L38A 1ZVYB 1NDMC 4W57A 3VWOA 2C8PA 1IOSA 3RUNA 2HUBA 1HENA 2MEFA 3C81A 254LA 2MEHA 2Z12A 1UC0A 4EOFA 3HDEA 144LA 2VB1A 4ARQA 2OTYX 2DQCY 5KXOA 2XQOA 103LA 198LA 3C83A 4KT3A 1GF6A 2G4QA 1C6NA 2OE4X 3AW7A 1GB0A 4FDYA 2CGIA 4IAPA 1QTKA 2HEDA 5K7OA 1QS9A 1KS3A 1XSFA 3VW7A 5KXLA 4LYZA 1C6MA 1L16A 4I7LA 1GBWA 3SB7A 5LVGA 120LA 1VDTA 3EMSA 1BWHA 4DDAA 4NSGA 4OWHA 4BAPA 4DYGA 1L04A 2H5ZA 3V2WA 1LKSA 1L85A 2BQAA 1B5ZA 4YEMA 4GCDA 1L70A 223LA 4WLYA 4WLTA 1YANA 1JWRA 168LA 2LZTA 153LA 1L45A 2RB1X 3IJVA 3HU9A 5LVJA 1HHLA 2RSCA 4YOPA 1CKCA 3V2YA 1GEZA 233LA 1CKGA 176LA 4Z41A 1IX0A 1QTDA 5LA8A 4WLDA 3GUIA 6LYZA 3A3QA 164LA 1NBZC 5HNLA 5JENB 1L97A 2B7XA 1VAUA 1FN5A 1QUTA 5ILFA 3WPKA 3TMXA 1C43A 130LA 163LA 4LDOA 3W6FA 1QSQA 3SB6A 3A90A 1QTCA 1L06A 4LZMA 4WM3A 1QSBA 4I7RA 1QUOA 4EKRA 9LYZA 1L66A 4NSJA 1CJ8A 2H9KA 3AZ5A 4EKPA 4WO6A 5II3A 1KXXA 2HEBA 3CQLA 3OE6A 4ETBA 1C6IA 1P2LA 2DQAA 3SP3A 1G0PA 4OOOA 4YXCA 237LA 3ATNA 192LA 197LA 1L83A 1L81A 3SN6R 108LA 1LHHA 4B0DA 1IOCA 1VDPA 1BHZA 251LA 3HUKA 4HJZA 3QE8A 4EPIA 4DD0A 2F4GA 1D0KA 1T8FA 5HLLA 1GE1A 3WXTA 1UIBA 1G0KA 1XGUC 3LZMA 2I25L 1L31A 209LA 1FKVA 4GRVA 1CJ7A 5LYZA 1L28A 1CJ9A 1L03A 1LSPA 1NMMA 1L19A 4H9IA 4WL7A 1QDRA 4UWVA 5KXMA 4OWBA 1YAPA 4NGYA 4ARMA 5B59A 1LYEA 4OOTA 4W59A 4H9CA 4I0CA 186LA 6LYTA 151LA 1C6FA 4G4CA 2ZQ4A 4NHIA 1NDGC 3BKHA 3G3VA 1OWYA 3CSZA 1TCYA 5LA5A 1ZVHL 5FCPA 1IP7A 155LA 1L90A 1HC0A 4QGZA 3A92A 1JHLA 1HEPA 2D4JA 1RCMA 2Z6BA 4B49A 4P2EA 4QEQA 3W3EA 2XJWA 1QTVA 146LA 3TXDA 3W6EA 4GN5C 142LA 1L10A 2RBQA 1L64A 2Y8PA 1L13A 182LA 1ALCA 1G07A 1L42A 4ML7A 150LA 1C69A 1LLHA 1LMOA 2OE7X 2LYMA 1G1VA 1REXA 1LZ8A 4W54A 1L51A 1YILA 1L32A 3J4GA 189LA 1REZA 3M18B 1EQEA 1G06A 252LA 4R6CA 138LA 1G0QA 1PQMA 4LZTA 1LJ4A 1B5YA 4WG7A 2MEBA 1WVUA 147LA 1CTWA 170LA 1CU0A 2ZWBA 1LYSA 5DLAA 4GCBA 1LI3A 1L25A 3AGIA 4ARQB 4NEBA 2RBPA 167LA 3P65A 4NIJA 248LA 2B73A 1L56A 1XEKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1QT8 A;  148L E;  1IWV A;  1D3F A;  1KY0 A;  2W1Y A;  2Z39 A;  2F47 A;  3HBH A;  4NY5 A;  1L35 A;  3FAD A;  1L77 A;  1G1W A;  4MCK A;  4I7P A;  2LYZ A;  1OUF A;  183L A;  2BQM A;  1T8A A;  3ZEK A;  205L A;  1IP2 A;  1TLA A;  4DQ7 A;  4W55 A;  5KXZ A;  1L75 A;  1B7M A;  4NGJ A;  2B6X A;  1L86 A;  4UWN A;  1IP6 A;  1GXV 2;  114L A;  1BGI A;  1GFV A;  4M6D A;  3C7Y A;  1BWI A;  1QUD A;  5FEL A;  3RU5 A;  253L A;  4WO9 A;  1UIH A;  4DQJ A;  1I20 A;  4OW1 A;  2YVB A;  1L24 A;  4XYY A;  1C6T A;  1PQK A;  1EPY A;  1LZR A;  1GF5 A;  2O4W A;  4NWE A;  1LAA A;  4J1B A;  4PRQ A;  4HPE A;  5KXY A;  4N1C C;  246L A;  5LZM A;  4B1A A;  2HEC A;  1PQJ A;  5APD A;  1LMA A;  3G3X A;  1IP1 A;  2HU3 A;  2WAR A;  4C5F A;  113L A;  1KXY A;  1GFU A;  3HU8 A;  3GUP A;  2BQO A;  2W1M A;  1Z55 A;  255L A;  2HTX A;  2YBN A;  5F9X A;  2BQE A;  5A3Z A;  1YAQ A;  5KKI A;  1BB7 A;  216L A;  215L A;  1LJF A;  4NHP A;  4WLX A;  1LZ4 A;  1LYY A;  3WVX A;  1B7R A;  1GB6 A;  206L A;  1LZN A;  4NHS A;  2CUU A;  2XBS A;  1OUB A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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