162LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLAQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 60
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 162lA00
3HT7A 1L81A 206LA 3V2WA 4E97A 260LA 2LZMA 1L67A 2RAZX 1L00A 1CUPA 1LGWA 3HTFA 3DN2A 1KW7A 4I7OA 3HT8A 250LA 2QB0B 1L0JA 1P2RA 201LA 3HTGA 1T8FA 2B74A 2OE7X 1CX7A 1L05A 3C83A 1SSYA 1C62A 4I7JA 3HU8A 6LZMA 1QTHA 4ARPA 1QT7A 245LA 1CUQA 1L30A 212LA 247LA 137LA 251LA 173LA 4LZMA 1LYDA 1SX2A 4PJZA 4YXCA 1C68A 1K28A 2F2QA 2HULA 2RB0X 4EKRA 1LYHA 1QT8A 234LA 1C6DA 1L53A 1G06A 189LA 3C7WA 4I7QA 1L33A 4LDOA 3FADA 3GUPA 4ZPUA 113LA 4EPFA 3F8VA 111LA 1L97A 3HH5A 149LA 1XEPA 1G0JA 1QS5A 159LA 241LA 167LA 1I6SA 3HWLA 3SB9A 144LA 3CDQA 1C6NA 3FI5A 1L64A 227LA 3DNAA 1QTBA 1L28A 1L48A 1OVKA 238LA 3C7YA 1LI2A 4EXMA 1P37A 1L93A 1T8AA 184LA 3GUMA 2OU9A 1C6IA 259LA 3D4SA 157LA 1L25A 1C6MA 2B6YA 1DYFA 2F32A 1L15A 3C82A 255LA 3V2YA 1SWYA 1L27A 1G1VA 156LA 1P56A 1PQJA 1OVHA 4ARMB 1L46A 104LA 3HH3A 216LA 1SSWA 1OWYA 1JTMA 1L60A 2Q9DA 1C6PA 1C67A 169LA 1DYGA 1G0PA 1L34A 3DN0A 1LYFA 123LA 2OEAX 1QT6A 1L90A 1G0LA 165LA 2RBQA 1L50A 1L19A 2HUKA 1L31A 1L10A 3HT6A 219LA 112LA 1CV3A 1L42A 180LA 239LA 128LA 3DN8A 1SWZA 1D3NA 1WTHA 2OU8A 1QTCA 3OE6A 1KY0A 262LA 1L18A 162LA 1G1WA 3ODUA 1L63A 1CV6A 4YXAC 1OV7A 4I7KA 197LA 1L29A 3L64A 1LPYA 1LWKA 1L36A 2RBOA 4YX7C 3DN1A 1LYIA 3HUAA 1QTDA 220LA 175LA 218LA 3HDFA 2B70A 1XJUA 246LA 1L24A 1L80A 2HUMA 3CDVA 1PQOA 3DN3A 240LA 4EPIA 1CU3A 249LA 3CDRA 4W53A 125LA 1QUHA 2OE4X 181LA 1QTVA 3HU9A 1P5CA 1TLAA 3SB8A 1L02A 1L47A 3SB6A 170LA 196LA 177LA 1L22A 192LA 3DKEX 122LA 4I7LA 3DMVA 174LA 1QSBA 4LDLA 120LA 1L13A 2B6TA 3F9LA 1C60A 3HH6A 1L69A 3GULA 1P2LA 2Z6BA 1LI3A 152LA 1DYBA 1L38A 2B73A 4LDEA 3CDOA 2NTHA 4GRVA 158LA 3CDTA 4GBRB 143LA 1JQUA 1G07A 1L75A 1JTNA 186LA 243LA 3OE9A 3C7ZA 236LA 256LA 1L73A 1G0GA 1LLHA 3DN6A 2ANVA 4W54A 3C81A 2B6WA 168LA 1L95A 224LA 3FA0A 1C66A 1L37A 1B6IA 1L92A 1L82A 1L72A 1LYGA 131LA 2OTZX 1L66A 1LI6A 1QTZA 178LA 3SB5A 1L21A 1C65A 190LA 182LA 146LA 215LA 1L16A 3OE0A 1P36A 4W55A 1LYEA 138LA 3G3XA 4ARQB 2RAYX 1L71A 1SX7A 151LA 3RUNA 109LA 1P7SA 5I14A 1C61A 1L87A 1G0KA 2RBPA 1L86A 140LA 1L79A 4PK0A 185LA 1L49A 225LA 2NTGA 3C8QA 1L06A 1L51A 1PQDA 257LA 3DMXA 1QT5A 4DJHA 4ARJA 1C6BA 209LA 3JR6A 3NY8A 1L96A 4AQNA 2LC9A 3K2RA 103LA 1DYEA 1L41A 1QUOA 211LA 3HUKA 3GUOA 2B6XA 161LA 176LA 3GUJA 1CU0A 2L78A 1L03A 1L88A 1QT3A 4I7RA 1PQKA 1CX6A 1L55A 1L44A 1CV4A 1DYCA 2RB1X 2RBNA 148LE 1L62A 1L85A 1L54A 1DYDA 1L32A 130LA 1C6GA 1D3FA 3DN4A 3RZEA 4I7NA 172LA 1P6YA 183LA 217LA 3PDSA 254LA 1QSQA 1L56A 1EPYA 1P3NA 3HUQA 252LA 199LA 4IAPA 2B7XA 147LA 118LA 4I7MA 237LA 187LA 155LA 253LA 3GUIA 1L84A 2RH1A 4OO9A 1NHBA 129LA 1L14A 1L89A 2IGCA 1CU2A 1KS3A 261LA 1CV5A 1L99A 3GUKA 107LA 1L59A 3NY9A 1D3JA 1C6HA 258LA 1L0KA 2QARC 1L68A 4W52A 242LA 232LA 1L11A 1T6HA 1KNIA 1QT4A 1L40A 119LA 3OE8A 2LCBA 2RBSA 210LA 191LA 231LA 114LA 1C6FA 205LA 1C64A 3SN6R 1DYAA 4DAJA 4K5YA 1QUDA 4W51A 1PQIA 1LYJA 1L01A 2ANXA 1KW5A 2CUUA 1XJTA 2O7AA 1L17A 222LA 3GUNA 3QAKA 1LGUA 4S0WA 164LA 3NYAA 3G3VA 4I7TA 150LA 1C69A 4EKPA 2OE9X 4EJ4A 171LA 141LA 4I7SA 3HTBA 1OVJA 4W59A 1L77A 3HT9A 1QS9A 1CV1A 166LA 1L26A 1QUGA 1OWZA 198LA 1L35A 4I7PA 139LA 1L08A 4EKQA 7LZMA 163LA 1L57A 3C8RA 108LA 1LGXA 1L52A 1L61A 1ZURA 4W56A 221LA 3DMZA 1L39A 223LA 3UONA 3G3WA 1D9WA 1CU6A 1KY1A 1L23A 1C6JA 3HTDA 1L07A 3HDEA 1C6LA 2O4WA 2B6ZA 244LA 3PBLA 3LZMA 188LA 1D3MA 1ZWNA 2Q9EA 2OTYX 2RB2X 1CV0A 1D2WA 142LA 1L65A 1L91A 1C6TA 1L04A 214LA 1L74A 1C6AA 4ARQA 235LA 1L09A 1L70A 2OU0X 3SBAA 1T8GA 115LA 1CTWA 1L45A 127LA 1G0QA 3C8SA 160LA 1G0MA 226LA 5LZMA 248LA 1C6QA 1LW9A 4ARMA 3L2XA 3VW7A 1C6KA 1L94A 1CVKA 1P64A 1LWGA 3SBBC 229LA 2B75A 3SB7A 102LA 1CU5A 1L43A 1OV5A 2A4TA 110LA 1L20A 1L12A 4ARLA 1D2YA 1L83A 4W57A 1T97A 233LA 1P46A 1OYUA 1C63A 3HH4A 2B72A 4EKSA 2RBRA 3EMLA 1PQMA 200LA 145LA 3C80A 4W58A 213LA 1C6CA 228LA 230LA 126LA 2F47A 1L76A 1L98A 4DKLA 195LA 1L58A 2O79A 1C6EA 1ZYTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HTKA 2BQBA 2LZMA 1B7LA 2RAZX 1TEWA 1REXA 154LA 2BQGA 1P2RA 3TXFA 2BLYA 5F81A 2MEHA 2HU3A 5LVIA 245LA 1CUQA 212LA 3WW6A 1GBOA 1IY3A 4YXCA 2F2QA 2RB0X 4EKRA 1LYHA 1UIBA 1B2KA 194LA 4I7QA 1UIGA 4EPFA 2W1MA 4QGZA 2NWDX 4CJ2A 5C6IA 159LA 1B7OA 3SB9A 4KPMA 1B0DA 3FI5A 1LZRA 1QTBA 1L28A 2YDGA 4LYCA 1IP5A 5B1GA 1YILA 259LA 2B6YA 1L25A 2BQJA 2F32A 3WU9A 3C82A 255LA 1OUHA 4XJFA 5KXXA 1LZGA 3TXBA 1PQJA 1QTEA 1IR9A 5I4XA 2DQHY 3A8ZA 1OVHA 1B5XA 4ARMB 3HH3A 1O23A 1LSEA 4DQ5A 5FHWA 5FSTA 3T36A 1UIEA 1JIYA 2MEFA 1BB3A 1IWWA 5LA8A 1LZEA 2HUKA 1L10A 219LA 2W1LA 4M6DA 1D0KA 3WH1A 2BQOA 3OE6A 1QTCA 1IVMA 3ZVQB 5LIOA 4KXIA 4G4BA 3ODUA 1OP9B 5D5CA 1H6MA 1IC4Y 197LA 1L29A 1LWKA 2RBOA 3WPJA 2CDSA 1AT5A 5LYMA 1CU3A 3CDRA 1GEZA 4W53A 1TBYA 4DYGA 3LN2A 2BQMA 177LA 1HEOA 174LA 5EBHA 4LDLA 4KT3A 1N4FA 120LA 2B6TA 3F9LA 1CKDA 1GBSA 1C60A 3GULA 5APEA 1YANA 4C3WA 1ALCA 1FDLY 4UWNA 3M18B 4LDEA 3CDOA 1IO5A 4GBRB 1LHIA 186LA 243LA 4B1AA 1L73A 3AJNA 3DN6A 1DKJA 3C81A 1IIZA 1L95A 224LA 2Z2FA 1LZ8A 4OWCA 1JJ0A 3SP3A 5LAGA 1NBYC 1KIQC 5KKIA 1C66A 1L37A 4XJBA 3W6AA 3A6CY 4WG1A 4DD3A 5KXMA 1C65A 190LA 1HEMA 182LA 4G49A 1WTMA 1IR8A 2DQFC 3N9CA 5E9RA 4LFPA 1IWTA 1XGTC 4BAFA 4ZIXA 2MEAA 1CKCA 5KXWA 132LA 1C61A 1XGRC 1HFZA 2DQEY 1L86A 2D4JA 4ZEEA 225LA 3TMUA 2MEDA 1PQDA 3DMXA 4LT3A 2F4GA 3BKVA 4AQNA 3K2RA 1DYEA 1LKRA 1XEIA 1NDMC 5KJ9A 1MELL 176LA 1L03A 1INUA 1QT3A 5KXPA 3CSRA 1YAMA 1LZ4A 4HJYA 3FI7A 1JISA 5LXWA 1L85A 3CT1A 3P64A 1NQIA 1JSEA 1L32A 130LA 1IWXA 3A6BY 3DN4A 4DD2A 4PRQA 5I4YA 5II3A 4FDYA 1HMLA 199LA 1LMNA 2B7XA 4IAPA 147LA 2G4QA 1LSDA 3WUNA 1HENA 5L3HA 1EQ4A 3WXUA 1L84A 3RZ4A 4TWSA 1UIAA 1NHBA 1L89A 5T3FA 2IGCA 1KXYA 1LPIA 2YBMA 1D3JA 3ZVQA 4R0FA 1JUGA 4HPIA 258LA 1L0KA 1OUBA 1EL1A 2YBJA 232LA 1T6HA 3QY4A 1KNIA 5FELA 1GXXA 3OE8A 2LCBA 3CSZA 231LA 1C6FA 3SN6R 1DYAA 4DAJA 2F4AA 1QUDA 4WO9A 4NGOA 1AKIA 4XYYA 1L01A 2ANXA 2MEEA 1QDRA 2DQDY 5KXYA 2CJLA 1JTPL 164LA 150LA 4XJHA 4NGKA 1GFJA 5B1FA 1LHHA 4NG8A 208LA 166LA 1GWDA 4TX7A 1W6ZA 4I7PA 1L08A 7LZMA 4N8ZA 1L52A 1L61A 3RT5X 1C10A 1NF5A 4ETEA 3DMZA 1E8LA 1L39A 3G3WA 1JKCA 1D9WA 3W6FA 4WM3A 1T3PA 1KY1A 2PC2A 1P2CC 3HDEA 4H9EA 4TUNA 3RU5A 5M1YA 4KL7A 2BQIA 2Q9EA 4AGAA 2LZ2A 2RB2X 1L04A 1B9OA 1L70A 1QDTA 1GFRA 2OU0X 1CTWA 1L45A 160LA 1G0MA 3B0IA 4MCKA 1C6QA 2B5ZA 3GXRA 3L2XA 5IHGA 3F6ZA 4GN5C 3B0OA 1L94A 3D3DA 5B06A 102LA 4GLVA 1VAUA 4YOPA 2Z18A 1B7RA 1LJGA 1NMMA 2HU1A 1ZVHL 233LA 1P46A 2BAAA 1LZAA 1B7SA 3A3QA 1WQPA 4W58A 4N0JA 213LA 1C6CA 228LA 1L76A 4ETAA 1L58A 1GFEA 260LA 1WTNA 1LGWA 2QB0B 201LA 1OUIA 2OE7X 4MR1A 1L05A 1MLCE 4I7JA 3A34A 1F0WA 4DD0A 1W08A 3WL2A 1NHEA 4LZMA 1IP6A 1K28A 9LYZA 2HEAA 189LA 3C7WA 3A91A 1IWVA 1QQYA 4BAPA 1BB4A 4WM6A 4ZPUA 4ET9A 3F8VA 111LA 1QSWA 4DDBA 5FDJA 3HH5A 149LA 1G0JA 167LA 1I6SA 2HECA 4B4IA 1JSFA 2A7FA 4NGVA 4I0CA 1YQVY 4H9FA 1LMTA 238LA 2FBBA 1B5WA 3GUMA 184LA 1C6IA 1HELA 1DYFA 1NDGC 2F2NA 5E4PA 1GF5A 3AGGG 3V2YA 1L27A 2ZIKA 1LCNA 1P56A 4H1PA 1IOCA 2H9JA 1I20A 2YVBA 1G7JC 216LA 1PS5A 3CB7A 1L60A 4J0LA 1C67A 169LA 4XADA 4YENA 1G0PA 1LYSA 4NGZA 1L34A 4LYMA 3DN0A 3T6UA 2FYDA 1GAZA 2OEAX 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4HTK A;  2BQB A;  2LZM A;  1B7L A;  2RAZ X;  1TEW A;  1REX A;  154L A;  2BQG A;  1P2R A;  3TXF A;  2BLY A;  5F81 A;  2MEH A;  2HU3 A;  5LVI A;  245L A;  1CUQ A;  212L A;  3WW6 A;  1GBO A;  1IY3 A;  4YXC A;  2F2Q A;  2RB0 X;  4EKR A;  1LYH A;  1UIB A;  1B2K A;  194L A;  4I7Q A;  1UIG A;  4EPF A;  2W1M A;  4QGZ A;  2NWD X;  4CJ2 A;  5C6I A;  159L A;  1B7O A;  3SB9 A;  4KPM A;  1B0D A;  3FI5 A;  1LZR A;  1QTB A;  1L28 A;  2YDG A;  4LYC A;  1IP5 A;  5B1G A;  1YIL A;  259L A;  2B6Y A;  1L25 A;  2BQJ A;  2F32 A;  3WU9 A;  3C82 A;  255L A;  1OUH A;  4XJF A;  5KXX A;  1LZG A;  3TXB A;  1PQJ A;  1QTE A;  1IR9 A;  5I4X A;  2DQH Y;  3A8Z A;  1OVH A;  1B5X A;  4ARM B;  3HH3 A;  1O23 A;  1LSE A;  4DQ5 A;  5FHW A;  5FST A;  3T36 A;  1UIE A;  1JIY A;  2MEF A;  1BB3 A;  1IWW A;  5LA8 A;  1LZE A;  2HUK A;  1L10 A;  219L A;  2W1L A;  4M6D A;  1D0K A;  3WH1 A;  2BQO A;  3OE6 A;  1QTC A;  1IVM A;  3ZVQ B;  5LIO A;  4KXI A;  4G4B A;  3ODU A;  1OP9 B;  5D5C A;  1H6M A;  1IC4 Y;  197L A;  1L29 A;  1LWK A;  2RBO A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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