163LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQAKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 163lA00
1L12A 1L70A 3VW7A 1SSYA 1L00A 3GUMA 1L39A 1L11A 2HUKA 170LA 1KW5A 142LA 1OWZA 2A4TA 3HT7A 160LA 139LA 1C6DA 220LA 3HTGA 221LA 3DMVA 1JTMA 128LA 1L38A 1SWYA 1L21A 198LA 1QT8A 3GUOA 1G0QA 3CDRA 1L86A 141LA 1L45A 1LGUA 3K2RA 2IGCA 196LA 3HU8A 241LA 1G0KA 3HH4A 4ARMB 2OTYX 1D2WA 1L66A 1L50A 237LA 1L10A 3DMZA 1QTBA 3C8SA 1L99A 148LE 3UONA 249LA 1KY1A 259LA 103LA 2RBPA 245LA 4EXMA 3D4SA 1CUQA 1L0KA 1C6GA 3SBBC 223LA 3HH6A 2NTHA 1JTNA 225LA 1L13A 1QUHA 123LA 2LC9A 129LA 2RB0X 1CU6A 2RAZX 2RH1A 192LA 3F8VA 3DMXA 4LDOA 1L35A 3RUNA 1T8AA 240LA 262LA 2RB2X 169LA 3G3VA 4E97A 174LA 2RBQA 2LCBA 3OE0A 232LA 250LA 236LA 4PJZA 3DN8A 1LI2A 2OTZX 4EKQA 4YX7C 4EPFA 1PQJA 246LA 1LYFA 3C81A 199LA 1G0LA 211LA 3L2XA 3HTDA 1D3MA 1L14A 3GUKA 184LA 3GUPA 108LA 1L91A 1L97A 4YXCA 1LI6A 1WTHA 1T8FA 222LA 1L19A 1C62A 188LA 167LA 2B7XA 1P46A 1D3JA 131LA 1CV3A 4W58A 1CV1A 3PDSA 143LA 1L82A 1D9WA 1L61A 234LA 165LA 1C6KA 3RZEA 1L69A 3FADA 163LA 4ARQA 3C83A 1G1VA 1L18A 2LZMA 1L90A 181LA 2B6WA 189LA 1L67A 1C6HA 1SX7A 248LA 1G0GA 3GULA 1L27A 1L63A 1QTCA 172LA 1C63A 1L31A 4GBRB 3GUIA 1L51A 1LYGA 130LA 1B6IA 185LA 4DJHA 4EKPA 1L98A 3CDVA 1L25A 126LA 1G07A 1P64A 244LA 1QSBA 1L01A 190LA 1L58A 2B6TA 3NY9A 195LA 119LA 1L68A 1TLAA 7LZMA 233LA 1SSWA 1L52A 178LA 176LA 1C68A 1L80A 1QTVA 260LA 3HT8A 1OVHA 1L53A 3HT6A 3CDQA 4I7MA 1L15A 162LA 1CX6A 229LA 112LA 1L56A 1LWGA 3C8QA 1L0JA 3C8RA 1L44A 2OE9X 1C6NA 1D3NA 161LA 1P6YA 111LA 4OO9A 1L74A 3CDTA 3DN2A 1C64A 235LA 1PQIA 1CUPA 1T6HA 1K28A 2CUUA 1G0MA 4ZPUA 4W57A 4ARMA 4GRVA 1C6JA 2RAYX 175LA 1L46A 1P3NA 3DN4A 1KNIA 1L03A 1G0JA 2B72A 1LWKA 3HDFA 186LA 4EKSA 3FA0A 102LA 214LA 177LA 1QTZA 3CDOA 1LI3A 2ANXA 1KW7A 1CU3A 1P7SA 3DN3A 1L64A 1L92A 1NHBA 1L93A 1QT7A 4ARPA 2F2QA 1CU5A 137LA 210LA 252LA 1QT5A 2OU9A 3SB6A 1DYDA 3SB9A 1ZURA 120LA 3HUKA 1SX2A 4I7NA 242LA 150LA 1OYUA 1C6LA 1LYJA 113LA 140LA 3SB7A 1L60A 1P2RA 3PBLA 173LA 4K5YA 1C61A 4ARJA 1L08A 1T8GA 3C80A 4W56A 1C6IA 6LZMA 4EKRA 1C6QA 3C7WA 1PQMA 118LA 1OWYA 104LA 3SN6R 1L88A 3C82A 258LA 1G06A 2F32A 2OE7X 2RBRA 201LA 1OV7A 152LA 3C7ZA 3DN0A 4LDLA 2L78A 1L85A 1LYDA 1L33A 1L17A 2B73A 2B70A 3HUQA 1P56A 1L24A 1L40A 144LA 110LA 1L16A 1LW9A 200LA 2OEAX 1C60A 1ZWNA 1OV5A 138LA 3HDEA 2B6ZA 1D2YA 2RBNA 3DN1A 239LA 1L06A 1L28A 1L55A 253LA 1XJUA 1L05A 1C6AA 1L59A 1L84A 2O4WA 1LLHA 1QUDA 1L09A 1L94A 149LA 1P37A 1L32A 1L30A 217LA 4I7OA 1L29A 4I7PA 228LA 1PQKA 3SB5A 1L96A 3QAKA 166LA 4I7LA 230LA 1L75A 2B6YA 4I7TA 1L36A 2ANVA 3V2YA 1DYBA 2F47A 1C6FA 2QB0B 157LA 1P2LA 1L79A 218LA 1L76A 191LA 1CV5A 1L87A 1QS9A 1L48A 146LA 251LA 1QT4A 1EPYA 1L73A 3HUAA 215LA 3JR6A 3G3WA 1OVKA 1CVKA 1L20A 216LA 3F9LA 4W51A 243LA 3HTBA 3C7YA 1OVJA 127LA 1L22A 2RBOA 1T97A 2QARC 187LA 3GUNA 1C6BA 1CV6A 1DYAA 1L07A 1L43A 1XJTA 1SWZA 4W52A 1QTDA 1QT3A 254LA 2O7AA 1G1WA 2HUMA 114LA 1LYIA 107LA 1LGWA 4DKLA 2Q9DA 180LA 4W55A 1L49A 1CX7A 1L42A 1L77A 4W54A 1L23A 4I7KA 158LA 2OU8A 1C6CA 3DNAA 3NY8A 1ZYTA 1PQOA 1C6TA 4EPIA 1QUOA 1QT6A 3GUJA 213LA 1L54A 1CV0A 1L37A 155LA 1QS5A 231LA 4ARLA 261LA 1D3FA 3NYAA 1G0PA 151LA 4AQNA 3HWLA 238LA 1L02A 1JQUA 1DYFA 1C67A 1P5CA 4S0WA 1XEPA 1C6EA 256LA 109LA 1L71A 3HTFA 1C66A 1CU2A 1L95A 1L89A 5LZMA 2B74A 1DYEA 3DKEX 1C6MA 3FI5A 212LA 1LPYA 1L57A 219LA 2Z6BA 4PK0A 145LA 156LA 159LA 1QTHA 182LA 209LA 3L64A 2OE4X 4W59A 255LA 1CU0A 5I14A 3ODUA 2RB1X 197LA 3OE6A 3HT9A 1L41A 1L83A 3DN6A 1L72A 2NTGA 4LDEA 3EMLA 1L26A 3LZMA 205LA 1LYHA 3SBAA 247LA 1L47A 1QUGA 3HH3A 115LA 227LA 3HU9A 1C65A 2RBSA 3HH5A 122LA 1CTWA 1L62A 1LGXA 206LA 1LYEA 2B6XA 3G3XA 1C69A 4I7QA 1CV4A 4DAJA 3OE9A 224LA 2Q9EA 168LA 1QSQA 125LA 3SB8A 4I7RA 4ARQB 1I6SA 1PQDA 164LA 1P36A 4I7SA 2OU0X 1L04A 1KS3A 2O79A 183LA 1DYGA 2B75A 1L34A 226LA 4W53A 1L65A 257LA 4I7JA 3V2WA 4YXAC 147LA 4IAPA 3OE8A 4LZMA 1C6PA 1KY0A 2HULA 4EJ4A 171LA 1DYCA 1L81A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L12A 2MEGA 1SSYA 2YBIA 3GUMA 4WG1A 1KW5A 1OWZA 1JKCA 2Y8PA 160LA 3HT7A 2EPEA 1CKFA 3TXIA 1OUHA 1C43A 4LT0A 1G0QA 2DQAA 1GF0A 1F10A 2ZWBA 2IGCA 1LSZA 1JJ3A 241LA 4QDNA 1G0KA 4ARMB 1UIDA 4WM4A 3LN2A 3DMZA 1QTBA 1IWVA 3UONA 1GXXA 3IJVA 259LA 1LAAA 4WLTA 1C6GA 3HH6A 5IDDA 1BB5A 1IWYA 1QUHA 2BQGA 123LA 2RB0X 2I6ZA 3WU8A 1CU6A 3FI7A 4WO6A 1HC0A 1ZV5L 3TXEA 2RH1A 1LJJA 1LZBA 1GFTA 2AUBA 3T36A 1GEVA 1KXWA 240LA 262LA 3WU7A 3TXBA 1B7OA 3OE0A 232LA 1HELA 250LA 236LA 1QUTA 1LJ3A 1LI2A 1LSFA 2OTZX 1BHZA 1LYFA 4TSBA 1GE1A 4NSHA 3HTDA 1CJ8A 1GFEA 5APDA 1WTHA 1V7TA 1VAUA 222LA 5LA8A 4EOFA 188LA 4N8ZA 4YOPA 1CV1A 5KXYA 5F81A 1L82A 1D9WA 1L61A 1XEJA 3A6CY 1G1VA 1L90A 2FBBA 181LA 4DD1A 5HQ1A 4AXTA 1C6HA 4WM6A 1L27A 1QTCA 4OWBA 1IO5A 1FBIX 1MLCE 1L31A 3N9AA 2LYMA 3WVXA 185LA 2VB1A 4H9CA 4HJYA 2YBHA 1CNSA 1LSAA 1G07A 1QSBA 4NGZA 4PRQA 4B49A 4HV2A 4XJGA 1L52A 1LZRA 3HT8A 1CX6A 1H87A 229LA 2DQCY 3E3DA 3C8QA 1L0JA 4MSTA 5LIOA 111LA 4OO9A 1C64A 4NGKA 1L46A 1P3NA 1KNIA 1G7LC 1G0JA 1HHLA 4FJRA 1IVMA 4UWVA 2ZYCA 1BB3A 214LA 4NG8A 1LMCA 1B5ZA 4WLDA 1LSBA 1KXYA 1LI3A 2ANXA 4M4OA 4YEOA 3B0IA 1L92A 2F2QA 3A92A 1GFVA 1CU5A 1LZYA 1GB7A 4J1BA 2XBSA 1BVKC 4GCBA 4I7NA 1HEQA 4QY9A 2Z38A 4H9HA 4H8XA 1C6LA 140LA 4H9EA 4WMGA 1L60A 4XN6A 1LZ1A 1GAYA 1LZ9A 1V7SA 1C61A 1L08A 1LMTA 4I0CA 5C6IA 3RU5A 4H93A 1GPQC 1GDWA 104LA 4LYOA 1L88A 3C82A 1B7SA 3MGWA 4N5RA 2OE7X 201LA 1OV7A 152LA 4PGJB 3W6FA 4B0DA 1LJEA 1LYDA 1LZ6A 1L17A 1LZ8A 1B7PA 1HEMA 1D6QA 2W1LA 7LYZA 138LA 1D2YA 4Z41A 1GBOA 1JIYA 1L55A 4A7DA 1LHIA 1XJUA 1L05A 1C6AA 2DKVA 3RW8A 1AT5A 1IOSA 1P37A 5LA5A 2HEEA 5DM9A 135LA 228LA 1OUFA 1CKCA 3QAKA 1UIEA 5I4XA 1NDMC 4YF2A 1C6FA 2QB0B 157LA 1L79A 4L41A 218LA 1WQMA 191LA 1CV5A 2MEEA 1LSCA 3HUAA 4OW1A 4B4IA 1RI8B 2BAAA 1IC7Y 1OVKA 1CVKA 1L20A 5I4WA 4DQ7A 1L22A 2RBOA 3GUNA 1LZNA 187LA 1L43A 1SWZA 1DKKA 1NBYC 1QT3A 1G1WA 4XJIA 1UICA 4ET9A 4GLVA 1GB0A 2YBLA 2BQJA 3HFMY 1GFUA 1L42A 1NDGC 1L77A 4W54A 4DYGA 2OU8A 1LYSA 1HEPA 2Z39A 1B7MA 1Z55A 1PQOA 4EPIA 1GF9A 1FDLY 3P4ZA 2C8PA 1B9OA 2HU1A 1CV0A 1IWWA 1REMA 4H8YA 1OUGA 1E8LA 3CSRA 1QS5A 3WW5A 1D3FA 2Z18A 5FCPA 3P64A 1C67A 3EBAB 1XEPA 1C6EA 3HTFA 1CU2A 1L89A 3WULA 1LKSA 2BQFA 1CJ9A 1DYEA 1IP1A 1GD6A 3EMSA 219LA 3B72A 4PK0A 159LA 182LA 209LA 3L64A 5HNLA 1MELL 255LA 4N9RA 1IP3A 4GCDA 3ULRA 1G7JC 5DL9A 3DN6A 4HV1A 1OUDA 5LXWA 1VEDA 247LA 5LVGA 3P65A 3AGHA 1IP6A 1IWUA 5E4PA 1EQEA 4WM5A 122LA 1CTWA 4ZEEA 5F9XA 3G3XA 1C69A 4J7VA 1YKYX 1LZSA 3OE9A 2MEFA 4XYYA 2I25L 1XEIA 1LTMA 4I7RA 1BVXA 1LMNA 1P36A 1BWHA 4CJ2A 4BADA 1GE0A 1G7HC 5APCA 1WTMA 3TXKA 3WXTA 147LA 2BQMA 4LZMA 1C6PA 1KY0A 1VDSA 1IP5A 1YKXX 194LA 3M3UA 1C46A 4PRUA 5F9UA 1IORA 1JKAA 3P66A 3ZVQA 1JSFA 5IELA 3HTGA 5APFA 1LZ4A 1JTMA 128LA 1CKGA 1UIFA 5DLAA 1L21A 198LA 1QT8A 4H90A 3GUOA 1L45A 1LGUA 3AGGG 1BB6A 1QQYA 1LMOA 1D2WA 1GFJA 1L10A 1L99A 2ZIJA 1A4VA 249LA 1B5XA 3AZ5A 3J4GA 4EXMA 4LGKA 1CJ6A 1EQ5A 2Z12A 4NEBA 1IOCA 2NTHA 1JTNA 129LA 1IC4Y 1VFBC 5FSTA 2MECA 3OK0A 2RAZX 4Z46A 1B7RA 1OUBA 192LA 1B5YA 3D9AC 2HEFA 2CGIA 1LYYA 2RB2X 4E97A 2RBQA 2LCBA 5LVHA 4NSGA 1YILA 1LCNA 5B1GA 4BAFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1L12 A;  2MEG A;  1SSY A;  2YBI A;  3GUM A;  4WG1 A;  1KW5 A;  1OWZ A;  1JKC A;  2Y8P A;  160L A;  3HT7 A;  2EPE A;  1CKF A;  3TXI A;  1OUH A;  1C43 A;  4LT0 A;  1G0Q A;  2DQA A;  1GF0 A;  1F10 A;  2ZWB A;  2IGC A;  1LSZ A;  1JJ3 A;  241L A;  4QDN A;  1G0K A;  4ARM B;  1UID A;  4WM4 A;  3LN2 A;  3DMZ A;  1QTB A;  1IWV A;  3UON A;  1GXX A;  3IJV A;  259L A;  1LAA A;  4WLT A;  1C6G A;  3HH6 A;  5IDD A;  1BB5 A;  1IWY A;  1QUH A;  2BQG A;  123L A;  2RB0 X;  2I6Z A;  3WU8 A;  1CU6 A;  3FI7 A;  4WO6 A;  1HC0 A;  1ZV5 L;  3TXE A;  2RH1 A;  1LJJ A;  1LZB A;  1GFT A;  2AUB A;  3T36 A;  1GEV A;  1KXW A;  240L A;  262L A;  3WU7 A;  3TXB A;  1B7O A;  3OE0 A;  232L A;  1HEL A;  250L A;  236L A;  1QUT A;  1LJ3 A;  1LI2 A;  1LSF A;  2OTZ X;  1BHZ A;  1LYF A;  4TSB A;  1GE1 A;  4NSH A;  3HTD A;  1CJ8 A;  1GFE A;  5APD A;  1WTH A;  1V7T A;  1VAU A;  222L A;  5LA8 A;  4EOF A;  188L A;  4N8Z A;  4YOP A;  1CV1 A;  5KXY A;  5F81 A;  1L82 A;  1D9W A;  1L61 A;  1XEJ A;  3A6C Y;  1G1V A;  1L90 A;  2FBB A;  181L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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