164LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLAMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 164lA00
258LA 201LA 1L96A 3GULA 1L21A 1L40A 4ARLA 3PDSA 3DNAA 3JR6A 1DYAA 1L34A 171LA 1CV6A 119LA 1CU3A 190LA 1L0KA 4W55A 1L13A 260LA 2RBSA 1LWGA 2O7AA 1C69A 2F2QA 200LA 2B70A 3HT6A 4DAJA 1L77A 1CVKA 2RBQA 1KW5A 1C60A 3HH4A 1L91A 4DKLA 3GUPA 113LA 1OYUA 1SX2A 1L31A 127LA 3HU8A 1C6BA 1L18A 1QTVA 1L36A 1L20A 214LA 2RB0X 254LA 1L01A 215LA 1C67A 3GUNA 1D3FA 1D2WA 178LA 2F47A 225LA 2RBPA 1L06A 145LA 3L2XA 1L69A 2B6TA 174LA 242LA 1L58A 4W51A 2LZMA 4I7TA 1L67A 1L42A 3QAKA 1L54A 1L05A 1L16A 3RZEA 4EKRA 1C6EA 229LA 1P2LA 1I6SA 222LA 232LA 1G0JA 111LA 1LI2A 3DN0A 1C62A 1JQUA 3V2WA 2LCBA 3FI5A 1C6PA 1LW9A 1ZURA 1L87A 1P5CA 1L66A 2A4TA 2OU0X 5I14A 1CV4A 2ANXA 1L63A 4GBRB 3CDQA 1C6IA 1L94A 1P46A 3F9LA 192LA 1LI3A 209LA 1L15A 1L82A 1L83A 1G0GA 3L64A 4S0WA 1C6NA 3CDTA 183LA 1L72A 3C7ZA 4EKSA 231LA 2RBNA 1CUPA 1OWZA 2B6ZA 1LGUA 1L53A 1L62A 3FADA 1QUGA 2F32A 137LA 3DN4A 3HT8A 4K5YA 238LA 2RH1A 261LA 1CU6A 1L85A 1L90A 1L95A 173LA 157LA 1ZYTA 4YX7C 1C6KA 1D2YA 1L24A 1C6CA 3SB9A 138LA 1L41A 1L38A 3DMVA 3HT9A 2O4WA 1L74A 3HT7A 160LA 239LA 2RBRA 199LA 252LA 1L37A 1QTBA 3HH5A 1L32A 3DN2A 102LA 3VW7A 230LA 2CUUA 1QT6A 3DKEX 234LA 1CX6A 1G1WA 1LLHA 122LA 3GUMA 1L61A 224LA 4I7LA 1CX7A 1D9WA 1DYBA 1L57A 1ZWNA 140LA 185LA 1LYIA 3NYAA 4I7SA 197LA 4ARQA 1L29A 3G3VA 3LZMA 1P6YA 125LA 3UONA 1L73A 1L88A 1CV5A 1LGWA 3PBLA 1QS5A 129LA 211LA 1L30A 4I7KA 1C6DA 2HUKA 1L71A 2OTZX 1KY0A 1L35A 1WTHA 1QT7A 1PQIA 233LA 1K28A 1OVJA 4EJ4A 2OEAX 1QSQA 2NTHA 1L28A 4W54A 187LA 3OE6A 180LA 1XJUA 1C6HA 2Q9DA 1L43A 143LA 1G0MA 1L25A 1C6TA 1XJTA 3RUNA 1LYEA 146LA 1CV1A 188LA 1B6IA 1L80A 3NY9A 1L04A 3C82A 4I7QA 3GUIA 3HH6A 1OVHA 4W58A 1SSYA 226LA 3F8VA 118LA 1L48A 4ARQB 1LWKA 205LA 1L64A 218LA 1PQDA 1TLAA 123LA 1L92A 1G0KA 2OE7X 220LA 3FA0A 2NTGA 1JTNA 1QSBA 4AQNA 3DN8A 4I7JA 166LA 1NHBA 3OE8A 4DJHA 4EKQA 1CTWA 163LA 1C66A 184LA 7LZMA 2Q9EA 3SB5A 1L12A 1L52A 2QARC 1QUDA 3HDEA 210LA 3ODUA 1LYJA 1L26A 181LA 196LA 168LA 1L79A 148LE 1C6GA 4W56A 243LA 4LDLA 4E97A 2OE4X 4PK0A 1L56A 4W52A 1LYDA 3SB6A 206LA 2B6WA 1JTMA 1C65A 219LA 1L09A 1L81A 3HTBA 104LA 131LA 1L14A 1G0QA 115LA 3HUQA 1LYFA 107LA 3HH3A 1L07A 1G1VA 2OTYX 2IGCA 1L55A 109LA 103LA 259LA 3C80A 236LA 4W53A 1L47A 1G0PA 162LA 1L93A 4IAPA 1EPYA 1P36A 3NY8A 1L39A 3HDFA 1CV3A 1T8AA 1L44A 1CUQA 156LA 1C6FA 217LA 2RAYX 2RAZX 2RB2X 253LA 4PJZA 189LA 1SWYA 4EPIA 4I7NA 1L50A 223LA 1T8FA 245LA 1KS3A 1OV5A 1QS9A 4YXCA 4I7PA 1L65A 1P2RA 251LA 3C8RA 4ARJA 152LA 3HTDA 159LA 1L33A 2B6YA 1C61A 2B7XA 213LA 195LA 4EKPA 3DMXA 177LA 1OV7A 1DYFA 1L27A 172LA 2LC9A 6LZMA 1G0LA 1L0JA 1PQJA 1L19A 3CDOA 1CU2A 3HUKA 249LA 1L00A 221LA 1D3MA 1LYHA 3DN6A 3V2YA 112LA 2RB1X 1L22A 128LA 3DMZA 1L98A 2OU9A 3SB8A 2OU8A 246LA 1D3JA 1P64A 186LA 1L60A 1PQMA 3SN6R 1OWYA 1C6QA 235LA 2OE9X 3HTGA 2HULA 250LA 1L97A 1SWZA 1L17A 191LA 4I7MA 3SB7A 1LYGA 3HTFA 165LA 1QT3A 237LA 4LDOA 1L10A 141LA 158LA 2HUMA 1L51A 4I7OA 1C6MA 108LA 139LA 212LA 198LA 1L75A 1PQKA 4I7RA 228LA 155LA 1SSWA 1CU5A 1LGXA 4W59A 4EPFA 150LA 2B6XA 1CV0A 3GUJA 3CDRA 4EXMA 1G06A 144LA 241LA 1L86A 3C7WA 257LA 1T6HA 1DYGA 1KW7A 126LA 1QUOA 5LZMA 1P56A 1QTCA 1L11A 2RBOA 2B74A 1C64A 4ARMA 1QT5A 3C81A 3GUOA 1L84A 1C6AA 147LA 1QTZA 1XEPA 1T8GA 1DYDA 1L76A 1L02A 3C7YA 120LA 161LA 176LA 255LA 3CDVA 2B72A 2QB0B 1QTDA 1DYCA 1L68A 262LA 1P7SA 2B75A 2O79A 1SX7A 4YXAC 3GUKA 182LA 114LA 1L70A 1P37A 1L49A 3K2RA 4W57A 142LA 1PQOA 1L99A 4OO9A 1KNIA 1L46A 3DN3A 1OVKA 3G3WA 1G07A 2Z6BA 3EMLA 1QUHA 167LA 110LA 4ARPA 175LA 1QT8A 3HU9A 1CU0A 1C6LA 2B73A 1L59A 1L03A 4GRVA 3G3XA 1LPYA 216LA 3OE9A 3HWLA 170LA 1L08A 164LA 4ARMB 1C63A 3C83A 2L78A 130LA 256LA 3DN1A 1L23A 247LA 1T97A 4LZMA 248LA 3C8SA 1KY1A 244LA 1L45A 3C8QA 169LA 3SBBC 1L89A 1DYEA 1QT4A 4LDEA 3OE0A 1QTHA 149LA 1C68A 3HUAA 227LA 1D3NA 1C6JA 1LI6A 1P3NA 3SBAA 4ZPUA 151LA 240LA 2ANVA 3D4SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WH1A 1L21A 1L40A 4ARLA 4HV2A 1LHKA 1IWYA 1CV6A 190LA 4W55A 2RBSA 4DAJA 1VFBC 200LA 2B70A 2W1LA 1C60A 2DQGY 1L91A 1IR8A 1OYUA 1SX2A 4YENA 1F10A 1L20A 2PC2A 1XSFA 178LA 225LA 2RBPA 5I4YA 3A93A 3CSQA 2RSCA 3LZTA 3L2XA 1L69A 4MSTA 3N9EA 4WM3A 1NBYC 5LA5A 1L42A 5LVIA 4YEOA 1L54A 1L05A 4H9EA 3EXDA 4GLVA 2ZYPA 1LHMA 1P2LA 5JENB 4TTDA 3DN0A 1LJNA 3FI5A 3TXJA 1LW9A 1P5CA 1L66A 1NBZC 1YL1X 1CV4A 4GLAA 1L63A 1C6IA 1B5VA 1LI3A 1B5XA 5C6LA 3AZ5A 4J0LA 1G0GA 1IP6A 4DD9A 4Z41A 1HF4A 2RBNA 3WUNA 1OWZA 1LGUA 1QUGA 1OP9B 1IC7Y 261LA 1LJJA 5F9XA 1L85A 157LA 2C8OA 2CWIA 1C6KA 1REYA 1T3PA 3A6CY 4CHXA 1GBOA 1GXXA 138LA 1L41A 5AMYA 3DMVA 2O4WA 4N1CC 160LA 1LZ8A 2Z39A 1GFTA 2RBRA 1AT5A 1REZA 1QTBA 3HH5A 1CKCA 1WQRA 1LZ6A 102LA 2I26L 5I54A 1QT6A 1G1WA 2N5ZA 1GF0A 5LXWA 5HQ1A 4HJZA 2BQDA 1ALCA 4XJBA 1ZWNA 3HFMY 1GPQC 1F6RA 2GV0A 3LZMA 3QNGA 125LA 3MGWA 4QEQA 1ZVYB 1RCMA 211LA 1C6DA 2HUKA 1YAQA 1L71A 1L35A 1LSAA 1QT7A 3ULRA 2HEEA 4LZTA 135LA 1OVJA 4EJ4A 2OEAX 1WQQA 3OJPA 4H9HA 1L28A 4W54A 4NGIA 1AKIA 1XGTC 1L43A 2ZNWY 1GB9A 1G0MA 1C6TA 4AGAA 1IOCA 5LA8A 1L80A 3LHMA 4W58A 5D5CA 1L48A 1BGIA 4YOPA 1LWKA 1GB5A 3LYMA 1L92A 2H5ZA 2OE7X 3FA0A 2NTGA 1JTNA 5HMJA 3DN8A 4RLMA 4EKQA 4HPEA 2F4AA 1ZV5L 1VDPA 3SB5A 4XJDA 1IP5A 2QARC 1QUDA 3HDEA 4BAFA 196LA 5M1YA 1JTOL 4ETAA 4HPIA 4E97A 2OE4X 1L56A 1C7PA 1OQMA 4W52A 1C43A 3SB6A 2F30A 1UICA 1LSYA 1UIFA 133LA 1L09A 131LA 1BWIA 115LA 1GE0A 3A95A 4CFOA 5L9JA 107LA 1LZTA 1IWZA 2AUBA 3A67Y 3SP3A 1L07A 5DN5A 1G1VA 2IGCA 1L55A 109LA 5B59A 1L93A 4IAPA 1EPYA 1D0LA 1GBSA 5E4PA 4CJ2A 2LYZA 2EIZC 3HDFA 4G9SA 1YQVY 4N8ZA 3ZVQA 5B1FA 217LA 1GFVA 1UIAA 2Q0MX 3GXRA 1J1OY 1OV5A 1QS9A 4M6DA 2Z2FA 2FYCA 5FELA 1L65A 5IELA 177LA 4M4OA 1FLYA 1DYFA 1OUGA 2LC9A 1L0JA 1L19A 1GB3A 3AZ7A 1LYHA 4Z98A 4TSBA 4XADA 1HSXA 246LA 1D3JA 1FBIX 186LA 1L60A 1DKJA 1QSWA 1GB6A 4D9ZA 1L17A 4NGZA 5APDA 1L10A 141LA 1GFAA 1KIPC 4I7OA 139LA 1IC4Y 4RW1A 5KXMA 1D6QA 1LYOA 1LGXA 1JPOA 2B6XA 2BQEA 2YBNA 4XENA 6LYZA 2MEGA 5FEKA 3CDRA 4EXMA 4BS7A 1OUAA 1L86A 3C7WA 3G3AB 2BQIA 3WXTA 1LZ1A 1B7LA 5LZMA 4LT2A 1P56A 1QTCA 1L11A 2B74A 4NHSA 3ATOA 1LSCA 4ARMA 3C81A 1IO5A 1C6AA 1L84A 1JIYA 2MEFA 3TXIA 1C10A 1H6MA 1QTZA 1QIOA 1XEPA 255LA 2Z37A 4LT3A 1DI3A 1LJ3A 1UUZC 3HBEX 4ET8A 2DQJY 1QTKA 3GUKA 207LA 4FDYA 1P37A 1BVXA 2A7DA 2XJWA 4NEBA 5FHWA 142LA 2DQIY 1B0DA 3GXKA 3ZEKA 1L46A 1GF5A 1LZAA 5KXSA 5F16A 1F0WA 3G3WA 5DN4A 3A91A 2Z6BA 167LA 110LA 1GE3A 2LYMA 175LA 4DWXA 1GFRA 3FI7A 1C6LA 4GRVA 1GFKA 1L03A 4BADA 2YSSC 3AW7A 216LA 1OUJA 3OE9A 2BPUA 1JJ0A 4NHQA 1J1XY 3G3BB 5I53A 5I5QA 4NSGA 4ZEEA 1L45A 169LA 3SBBC 1L89A 1DYEA 4LDEA 4H8YA 4ZIXA 3RT5X 4CFPA 1P3NA 1TBYA 4NWEA 1NF5A 201LA 2HEAA 3DNAA 3JR6A 4E3UA 1V7SA 1J1PY 1L34A 171LA 1UC0A 119LA 1O23A 1L13A 4NY5A 2RBQA 3HH4A 132LA 4DKLA 3HBHA 3HU8A 1G7HC 1QTVA 4WM2A 214LA 2RB0X 1L01A 3FE0A 1XEJA 1D3FA 5LYTA 5I4WA 1VDSA 1JKBA 5T3FA 1PZYA 1D6PA 1L06A 3WVXA 242LA 1KXWA 1L58A 4W51A 3TMXA 2LZMA 9LYZA 4I7TA 5E9RA 2YBLA 4NGOA 1XGQC 1GDWA 4EKRA 229LA 4BAPA 4G4HA 222LA 2X0AA 1C62A 4DC4A 5FSTA 1WVUA 4H90A 1NKHA 1C6PA 5IDDA 1YKXX 1ZURA 1BB7A 4WLTA 2CGIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3WH1 A;  1L21 A;  1L40 A;  4ARL A;  4HV2 A;  1LHK A;  1IWY A;  1CV6 A;  190L A;  4W55 A;  2RBS A;  4DAJ A;  1VFB C;  200L A;  2B70 A;  2W1L A;  1C60 A;  2DQG Y;  1L91 A;  1IR8 A;  1OYU A;  1SX2 A;  4YEN A;  1F10 A;  1L20 A;  2PC2 A;  1XSF A;  178L A;  225L A;  2RBP A;  5I4Y A;  3A93 A;  3CSQ A;  2RSC A;  3LZT A;  3L2X A;  1L69 A;  4MST A;  3N9E A;  4WM3 A;  1NBY C;  5LA5 A;  1L42 A;  5LVI A;  4YEO A;  1L54 A;  1L05 A;  4H9E A;  3EXD A;  4GLV A;  2ZYP A;  1LHM A;  1P2L A;  5JEN B;  4TTD A;  3DN0 A;  1LJN A;  3FI5 A;  3TXJ A;  1LW9 A;  1P5C A;  1L66 A;  1NBZ C;  1YL1 X;  1CV4 A;  4GLA A;  1L63 A;  1C6I A;  1B5V A;  1LI3 A;  1B5X A;  5C6L A;  3AZ5 A;  4J0L A;  1G0G A;  1IP6 A;  4DD9 A;  4Z41 A;  1HF4 A;  2RBN A;  3WUN A;  1OWZ A;  1LGU A;  1QUG A;  1OP9 B;  1IC7 Y;  261L A;  1LJJ A;  5F9X A;  1L85 A;  157L A;  2C8O A;  2CWI A;  1C6K A;  1REY A;  1T3P A;  3A6C Y;  4CHX A;  1GBO A;  1GXX A;  138L A;  1L41 A;  5AMY A;  3DMV A;  2O4W A;  4N1C C;  160L A;  1LZ8 A;  2Z39 A;  1GFT A;  2RBR A;  1AT5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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