167LA

Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of t4 lysozyme
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNCFEMLRCDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 167lA00
3OE8A 3QAKA 1L97A 165LA 1L73A 1PQDA 3L2XA 3GUNA 177LA 3GUMA 149LA 1OV5A 218LA 4EPIA 144LA 2HUKA 2RBNA 1C68A 1T8FA 1CV3A 2OE7X 3C7YA 1C67A 1G0LA 1L28A 3LZMA 1CVKA 4S0WA 1L27A 1DYAA 146LA 211LA 148LE 220LA 3DN1A 1SX2A 4W56A 108LA 1LYIA 1L02A 1L80A 186LA 4EKPA 107LA 4W51A 2B74A 3CDRA 1G06A 3C7WA 196LA 1L07A 1P6YA 1L04A 1DYFA 3RZEA 7LZMA 3HH4A 123LA 1CX6A 1L93A 4EXMA 3GUIA 1C6GA 3F8VA 114LA 1LGUA 3HH6A 4I7PA 1L44A 3RUNA 1C60A 4DKLA 1B6IA 3NY8A 221LA 1P3NA 1L32A 104LA 2Q9DA 4W58A 1L72A 255LA 1L43A 166LA 3SB9A 1L96A 1KY0A 142LA 170LA 210LA 1L41A 3G3VA 3HH5A 1LGXA 1C6AA 171LA 1L98A 1G0KA 102LA 1L29A 246LA 259LA 1LYJA 1C6QA 1CV6A 4I7LA 141LA 198LA 1PQMA 1L23A 1L52A 1QS5A 1LYFA 3NYAA 178LA 2ANXA 1SSWA 1L83A 1L33A 1LYHA 185LA 234LA 3HUQA 1P56A 1JQUA 3GUPA 1JTMA 5I14A 1PQJA 1CU3A 5LZMA 4EJ4A 244LA 3F9LA 2B73A 4ARQA 2NTHA 3NY9A 1L84A 192LA 2IGCA 238LA 2B6YA 1L87A 205LA 2RBSA 3HU9A 1L18A 2O7AA 3HTDA 112LA 180LA 1L20A 4I7QA 1LI6A 3SB5A 111LA 1L06A 1L74A 3VW7A 3PDSA 224LA 253LA 1L47A 1D3NA 2HUMA 226LA 1OWZA 1C6KA 222LA 1CV1A 122LA 163LA 3HDEA 4W55A 139LA 4EPFA 212LA 1TLAA 258LA 2OEAX 228LA 1QTCA 195LA 1D3JA 261LA 1G1VA 125LA 1T8GA 247LA 1P64A 1LI3A 2CUUA 3C81A 1L24A 217LA 173LA 1C6CA 4ARMA 1C6NA 216LA 1QT3A 4W53A 1L26A 243LA 262LA 2Q9EA 1L14A 1L30A 3K2RA 1L50A 2F32A 1EPYA 1L22A 2RBPA 1XJUA 3HU8A 110LA 109LA 128LA 252LA 2RBQA 1G0GA 3HUKA 150LA 3HTGA 1L45A 1CU5A 183LA 1OVKA 126LA 4GBRB 175LA 1L35A 1QUOA 191LA 1L66A 1L62A 159LA 129LA 214LA 152LA 1L55A 130LA 1QT4A 4GRVA 4I7JA 143LA 119LA 3G3XA 1QUHA 2RBRA 3EMLA 1PQKA 1G1WA 1L53A 158LA 1L77A 4YX7C 4ARPA 3L64A 1L05A 1L89A 206LA 2RB0X 1CU0A 1XJTA 1LW9A 1WTHA 1L60A 2B70A 3SN6R 1D3FA 215LA 138LA 1G0JA 3DN0A 1L17A 1C64A 1L0KA 4LDOA 189LA 1L37A 1DYEA 1KW7A 1L92A 1T6HA 3HH3A 3CDVA 236LA 4ARLA 1L63A 1QT7A 1G07A 3CDTA 3C82A 1L71A 2B72A 3GUOA 1L76A 3JR6A 242LA 103LA 1L01A 1L36A 3FA0A 1L0JA 1D2YA 4EKQA 1D3MA 1L86A 169LA 2Z6BA 1C66A 1ZYTA 3G3WA 3SB7A 2F47A 1CX7A 2LC9A 162LA 2B75A 1P46A 2OE9X 1L90A 249LA 4YXAC 1DYGA 131LA 239LA 2O4WA 1L79A 4PJZA 1KNIA 2O79A 1QS9A 4I7NA 219LA 1LWGA 3HT8A 3SB8A 1C6DA 1C6FA 1I6SA 1L09A 1OVJA 2OU0X 3GULA 4ZPUA 3ODUA 1CU2A 237LA 3HWLA 3OE9A 4I7SA 4I7KA 140LA 1C6HA 1L12A 1P2RA 1L48A 1KW5A 167LA 1OYUA 1SX7A 2OU8A 2QB0B 1L10A 4DJHA 151LA 4IAPA 200LA 1L65A 2B6WA 3OE6A 3SB6A 225LA 1L58A 1P5CA 3D4SA 182LA 3HT6A 1OVHA 1C62A 1C63A 4EKSA 1L49A 1T97A 137LA 233LA 1OV7A 3CDQA 1CTWA 1C6PA 3DMVA 1L99A 2ANVA 1QUGA 1C6TA 3DMZA 1CV0A 229LA 161LA 1C61A 232LA 190LA 1L61A 1LYDA 1SWZA 4LZMA 1L69A 2HULA 1L13A 157LA 1L42A 3C8QA 1L94A 1L82A 4W57A 1L19A 1QTHA 1T8AA 1L67A 1KS3A 4EKRA 6LZMA 2OE4X 1P7SA 2B6ZA 3GUJA 160LA 3PBLA 1L70A 1SSYA 1L31A 2QARC 1QT8A 1LWKA 3OE0A 181LA 174LA 1L34A 1DYDA 3HDFA 3GUKA 145LA 3CDOA 197LA 1P37A 3UONA 1C6IA 1L68A 4DAJA 1L38A 1P2LA 1QTDA 4I7TA 1L95A 3DN4A 213LA 257LA 1QUDA 1LYGA 2RAYX 1L03A 3V2YA 1G0QA 260LA 2B7XA 1QT6A 251LA 1C6MA 1L59A 2F2QA 1L46A 3DN2A 3C7ZA 3SBAA 156LA 199LA 1CV4A 3C83A 1G0MA 3DMXA 1K28A 1C6LA 1L85A 250LA 1L15A 1L21A 3C80A 115LA 3C8RA 1QSBA 248LA 1OWYA 176LA 4LDEA 1L57A 1NHBA 2RH1A 2RB1X 4ARJA 1QTBA 1L40A 1L64A 240LA 4W52A 4YXCA 1D9WA 1L16A 1C6EA 4OO9A 2OTYX 4I7OA 2LZMA 1CUPA 4ARQB 1L25A 4W54A 1PQOA 223LA 230LA 120LA 3DNAA 4I7RA 1L54A 3DN3A 3FI5A 2LCBA 1C6BA 245LA 2RBOA 4I7MA 1QTVA 4LDLA 1L51A 2NTGA 209LA 2RAZX 1L08A 235LA 1SWYA 164LA 1CV5A 1L39A 1CUQA 4AQNA 1C6JA 1CU6A 256LA 3HTBA 3HUAA 1LPYA 1KY1A 1QTZA 2B6TA 188LA 172LA 2A4TA 2OU9A 4E97A 3HT9A 1DYCA 4PK0A 2L78A 201LA 1L88A 1L00A 3C8SA 1G0PA 147LA 1ZURA 3HT7A 4K5YA 1LYEA 118LA 187LA 184LA 3DN6A 3DN8A 1L75A 1C69A 2B6XA 1PQIA 1ZWNA 1LGWA 231LA 1XEPA 1C65A 1LI2A 241LA 168LA 1LLHA 254LA 4W59A 155LA 4ARMB 127LA 1JTNA 3FADA 1D2WA 1L91A 2RB2X 3HTFA 1P36A 1QSQA 1DYBA 1L56A 1QT5A 3V2WA 113LA 227LA 1L81A 1L11A 2OTZX 3DKEX 3SBBC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OE8A 1L97A 165LA 3LHMA 4B49A 5KXWA 4PRQA 2YBJA 3GUMA 149LA 144LA 1B9OA 2RBNA 4OWAA 1T8FA 1LJ3A 1ZV5L 3W6FA 1B5VA 3C7YA 4RDSA 1IOTA 4DC4A 4R6CA 211LA 2LZ2A 4NGJA 108LA 1LYIA 1B5ZA 1LJHA 5KJ9A 2XJWA 1GFTA 4EKPA 4YF2A 5KXSA 1G06A 4ZFPA 3C7WA 1LMNA 1CKCA 5DN4A 1L04A 4ETAA 2Y8PA 3F6ZA 7LZMA 1CX6A 2MEDA 1J1PY 1CJ7A 1IY3A 1C6GA 3F8VA 114LA 3BKVA 4XJGA 1LGUA 4I7PA 1GB2A 3RUNA 1C60A 1L32A 104LA 1OUBA 4NHPA 4LYZA 1BVXA 4NEBA 4IASA 210LA 1L41A 1YANA 3HH5A 1LGXA 1SLYA 171LA 1IWVA 1LYFA 4N9RA 3NYAA 2ANXA 1DZBX 1L33A 4NSHA 1VFBC 1TCYA 1LMOA 5LZMA 3CB7A 244LA 5HNLA 1JISA 2B73A 2BQIA 4B0DA 3NY9A 1L84A 1GE4A 2B6YA 1L87A 4Z41A 2RBSA 1LZSA 4HJYA 5I4YA 2O7AA 1QTEA 1BB6A 112LA 4WM4A 4OWEA 1LMCA 4I7QA 1GE1A 4LT0A 3VW7A 1DI4A 3ATOA 253LA 9LYZA 1LYYA 2HUMA 1GF9A 1OWZA 2DQJY 1YIKA 1AM7A 2A7FA 1C6KA 1CV1A 122LA 163LA 4WM5A 5B07A 1FLQA 212LA 1OP9B 1QTCA 2AUBA 261LA 4H9CA 1P64A 5APEA 3C81A 208LA 1L24A 173LA 1FLYA 1C6CA 4PRUA 1C6NA 1L26A 3TXEA 4GCCA 3P4ZA 1L30A 1L50A 2F32A 4N8ZA 4H8ZA 110LA 4EMNA 4MSTA 1DPWA 183LA 1D0LA 2CGIA 5HLLA 1UBZA 4OWHA 1PS5A 1VDPA 5KXZA 130LA 4I7JA 4XJHA 1IR7A 5F81A 1PQKA 1B7QA 1LSNA 1L53A 2MECA 4ETEA 3L64A 3A92A 1L89A 2DKVA 1GF0A 1FLUA 2D6BA 3SN6R 1B7PA 4WLTA 138LA 3DN0A 1GB0A 189LA 2D91A 2BQKA 1XFPL 3CDVA 4B1AA 4ET8A 1GB6A 4TWSA 3P65A 3RNXA 1E8LA 242LA 1FBIX 1GBOA 2ZQ3A 4TX7A 2ZNWY 2Z6BA 4WM1A 1IIZA 1LZBA 3AZ7A 2LC9A 2B75A 3TXHA 4YXAC 2D4IA 2O4WA 1L79A 1IOSA 3D3DA 4TSCA 219LA 3A6BY 4G4HA 4PPOA 1UC0A 3SB8A 1I6SA 2OU0X 4ET9A 237LA 1YKYX 4I7SA 1LJNA 1L12A 1UA6Y 1B2KA 5LA5A 2OU8A 1I1ZA 1L10A 2LYMA 4IAPA 1L65A 3OE6A 182LA 1DI3A 3HT6A 1C63A 4HTQA 3WH1A 5LINA 3CDQA 1CTWA 3DMVA 2ANVA 4N1EI 1C6TA 3DMZA 4H1PA 1LZEA 3TXDA 161LA 2WARA 1SWZA 1L61A 1LYDA 157LA 3C8QA 1SQ2L 1L19A 2BQEA 4UWNA 1LSBA 2B6ZA 1OUDA 2F30A 1SSYA 3WULA 2C8OA 1LWKA 4DQ7A 4WO9A 181LA 1JTTL 1LYOA 2DQIY 1GB5A 197LA 3UONA 1GHLA 3OJPA 1QTDA 3ULRA 3AYQA 3DN4A 213LA 5ILFA 1QUDA 2RAYX 1L03A 3AJNA 3EXDA 1C6MA 1IR8A 3C7ZA 1FDLY 5LVJA 1K28A 1QTKA 4AGAA 2EPEA 1L85A 3B0IA 3WPJA 4E3UA 1HHLA 115LA 1IWZA 1YROA 1NBZC 4W94A 1OWYA 4LDEA 1L57A 1HENA 2RH1A 3IJUA 4LYTA 1NQIA 2DQCY 3TXIA 4W52A 1D9WA 4OO9A 3A3RX 2OTYX 4I7OA 1LKSA 4LFPA 4DD3A 4W54A 4WG1A 4NY5A 4DD9A 1LHHA 1JSEA 2FYCA 2HEEA 3FI5A 1C6BA 2RBOA 4LDLA 2NTGA 5K7OA 1OUIA 4GCEA 1L39A 2C8PA 4AQNA 1B7OA 1UIHA 4OOOA 4NHSA 3ZEKA 256LA 3HUAA 5C6IA 4Z3MA 5LVKA 1KY1A 2B6TA 188LA 3QY4A 3B0OA 1C45A 4E97A 201LA 3WVYA 1L00A 5HNCA 3TMXA 4K5YA 1LYEA 5DL9A 3QNGA 1L75A 1GFAA 231LA 3WW5A 4I0CA 1C65A 5IELA 2BPUA 4NGWA 2VB1A 4ARMB 4C5FA 1JTNA 1D2WA 3A6CY 2G4NA 2BQCA 1P36A 3A90A 1LSFA 1YKXX 113LA 227LA 1L81A 1KIRC 2OTZX 1HF4A 5LVGA 3QAKA 2HU3A 1GB7A 1L73A 5LYMA 1PQDA 3L2XA 3GUNA 218LA 2HUKA 2EIZC 2DQAA 1BB3A 1DKKA 3TXFA 2DQEY 3LZMA 2HUBA 2MEFA 4LYOA 1L27A 1DQJC 3E3DA 1C43A 2Z38A 5FCPA 107LA 1YL0X 1KIQC 196LA 1L07A 3TXJA 4NWHA 1XEKA 1B5XA 1BQLY 4XJBA 4EXMA 1JJ0A 3CQLA 3GUIA 4WLXA 5HMVA 1F10A 1OUCA 4BADA 4DKLA 1BVKC 1IR9A 1P3NA 1GFGA 1GE0A 1GXV2 2YBHA 1L43A 1IP1A 142LA 170LA 1JWRA 1EL1A 1AZFA 1L98A 1D0MA 1G0KA 1GD6A 259LA 1LYJA 1C6QA 1CV6A 1O23A 1IVMA 4DWXA 2CWIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3OE8 A;  1L97 A;  165L A;  3LHM A;  4B49 A;  5KXW A;  4PRQ A;  2YBJ A;  3GUM A;  149L A;  144L A;  1B9O A;  2RBN A;  4OWA A;  1T8F A;  1LJ3 A;  1ZV5 L;  3W6F A;  1B5V A;  3C7Y A;  4RDS A;  1IOT A;  4DC4 A;  4R6C A;  211L A;  2LZ2 A;  4NGJ A;  108L A;  1LYI A;  1B5Z A;  1LJH A;  5KJ9 A;  2XJW A;  1GFT A;  4EKP A;  4YF2 A;  5KXS A;  1G06 A;  4ZFP A;  3C7W A;  1LMN A;  1CKC A;  5DN4 A;  1L04 A;  4ETA A;  2Y8P A;  3F6Z A;  7LZM A;  1CX6 A;  2MED A;  1J1P Y;  1CJ7 A;  1IY3 A;  1C6G A;  3F8V A;  114L A;  3BKV A;  4XJG A;  1LGU A;  4I7P A;  1GB2 A;  3RUN A;  1C60 A;  1L32 A;  104L A;  1OUB A;  4NHP A;  4LYZ A;  1BVX A;  4NEB A;  4IAS A;  210L A;  1L41 A;  1YAN A;  3HH5 A;  1LGX A;  1SLY A;  171L A;  1IWV A;  1LYF A;  4N9R A;  3NYA A;  2ANX A;  1DZB X;  1L33 A;  4NSH A;  1VFB C;  1TCY A;  1LMO A;  5LZM A;  3CB7 A;  244L A;  5HNL A;  1JIS A;  2B73 A;  2BQI A;  4B0D A;  3NY9 A;  1L84 A;  1GE4 A;  2B6Y A;  1L87 A;  4Z41 A;  2RBS A;  1LZS A;  4HJY A;  5I4Y A;  2O7A A;  1QTE A;  1BB6 A;  112L A;  4WM4 A; 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