170LA

Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of t4 lysozyme
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNSNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRSALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRCKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 56
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 170lA00
219LA 157LA 1P2LA 1PQOA 4PK0A 3C8RA 1L45A 3FA0A 3GUKA 1T8FA 1L54A 2RAZX 169LA 4W51A 3NY9A 4LDLA 1DYCA 2B6XA 232LA 1L07A 1L42A 2RBQA 172LA 1OV7A 4AQNA 1C61A 1QUHA 2QARC 1L63A 2B6YA 1L90A 3HUAA 3SB8A 3G3XA 4ARJA 3DN3A 1L20A 1D2YA 3GULA 1C6KA 2RBNA 4EKPA 1T8AA 1CUQA 1CV6A 1OVHA 1P6YA 1JQUA 1G0JA 1L93A 1CU5A 231LA 1JTNA 254LA 122LA 1DYEA 4W55A 2OU9A 3D4SA 1L69A 1CV0A 2OE4X 2OE7X 4IAPA 1L88A 1L82A 262LA 3HWLA 1QUOA 2IGCA 3CDVA 174LA 1L92A 1L94A 1T8GA 1CU6A 211LA 2OU0X 3HH3A 1L27A 3HTBA 3C8SA 1C6LA 110LA 190LA 1C6HA 2ANXA 4K5YA 1LYGA 1SX2A 3HTFA 3HT9A 3G3WA 206LA 3HU8A 236LA 214LA 4EKRA 4EXMA 1L53A 4GBRB 1L29A 1QSQA 1L52A 4W52A 216LA 1L37A 1QUDA 4ARQB 3C82A 1QTCA 3SN6R 1KW5A 213LA 2B72A 4ARMA 1L87A 1SX7A 150LA 233LA 5I14A 142LA 123LA 1QTBA 2B75A 4LZMA 3V2YA 1L56A 1L01A 4PJZA 2RBPA 107LA 1ZURA 1L28A 1LGXA 1L68A 1CX7A 140LA 1T97A 1L75A 3GUIA 3HUQA 217LA 176LA 199LA 1L60A 1D3MA 1EPYA 1LYIA 2O4WA 2QB0B 175LA 2F32A 4W54A 2HUKA 4EPFA 3RUNA 1L79A 113LA 1CU2A 4I7SA 158LA 108LA 173LA 1C6MA 4EPIA 1P36A 1L11A 145LA 2HULA 2OTZX 1G06A 3NY8A 1L05A 261LA 1P5CA 3UONA 146LA 3F8VA 156LA 1G0QA 1DYAA 1C68A 1L18A 1QTDA 177LA 4GRVA 1L44A 3HTGA 1C65A 3L2XA 1OV5A 197LA 1L98A 2LCBA 3DN4A 114LA 2RBOA 3CDQA 148LE 1L0KA 1SSWA 3SBAA 1L17A 1L38A 1D3JA 3HDEA 4E97A 130LA 3DMXA 1L97A 3DNAA 1KY0A 2OE9X 1L19A 209LA 3DN2A 1L73A 1I6SA 1L49A 3C81A 1CV4A 1QUGA 137LA 1KW7A 3HU9A 2F2QA 2NTHA 3C80A 119LA 128LA 1CTWA 3CDTA 230LA 1L46A 1QS5A 3EMLA 3RZEA 1L83A 1LW9A 3FI5A 3HH5A 3V2WA 1L16A 1L74A 1G0KA 4I7MA 1P56A 184LA 4YXAC 1L13A 3C7YA 1CU0A 1L81A 1L03A 244LA 2OTYX 1C6PA 258LA 228LA 182LA 215LA 1LPYA 2Q9DA 1OVJA 149LA 3OE6A 3PDSA 4OO9A 1L96A 1XJUA 1L71A 1SWYA 1XJTA 1NHBA 6LZMA 1L34A 1CU3A 4EKSA 1L50A 1L30A 4YX7C 1LWKA 221LA 1PQKA 168LA 1L64A 1L76A 1D3FA 2NTGA 1L06A 1L51A 3CDRA 3DMVA 1P3NA 1L72A 3G3VA 1L14A 4W59A 127LA 1C6NA 2LZMA 1L66A 4ARLA 2L78A 1QT8A 4LDEA 102LA 4DKLA 1C6AA 1L67A 3SB9A 1P2RA 1C69A 1C6FA 239LA 1L70A 1L58A 1ZWNA 1LI2A 220LA 255LA 125LA 195LA 3ODUA 1QT5A 234LA 3DN8A 1D9WA 245LA 222LA 188LA 1L95A 1TLAA 186LA 1L32A 4YXCA 3GUPA 237LA 115LA 1L61A 256LA 3GUJA 3QAKA 1PQJA 3C7WA 5LZMA 1JTMA 3VW7A 1OVKA 3PBLA 3HH4A 2B6TA 131LA 1C6DA 166LA 1G0LA 3HT8A 1P46A 181LA 3K2RA 4I7QA 1KS3A 1LYEA 252LA 4EJ4A 1QT7A 2O79A 1CV3A 138LA 1QTHA 1C62A 180LA 2A4TA 3HDFA 160LA 4I7JA 178LA 167LA 1L0JA 196LA 1DYDA 4I7LA 1XEPA 4I7RA 1D3NA 1L39A 3DN6A 1L36A 4DJHA 109LA 1QTVA 3SBBC 159LA 4ARMB 227LA 118LA 1L22A 1LYHA 218LA 1L80A 1C66A 1L26A 4I7PA 1PQMA 1L25A 201LA 120LA 189LA 260LA 1DYGA 7LZMA 1L85A 1QT6A 3GUNA 3SB6A 129LA 1WTHA 2B73A 243LA 3HUKA 3HT6A 1LYDA 1C67A 1LGWA 147LA 4S0WA 1C6IA 4I7NA 200LA 1PQIA 2OEAX 1L86A 225LA 144LA 212LA 152LA 1C6TA 1L23A 2Z6BA 111LA 163LA 248LA 224LA 242LA 4ARQA 2ANVA 1L12A 187LA 2B6ZA 3HH6A 3OE8A 1G07A 2RH1A 1L99A 223LA 3JR6A 241LA 1QSBA 1L04A 3HT7A 192LA 3L64A 1L33A 126LA 1L02A 1C6CA 1G0PA 3GUMA 1LI6A 1ZYTA 162LA 1L41A 198LA 4W58A 251LA 1CVKA 1T6HA 2HUMA 1L48A 1LYJA 2B74A 185LA 1LLHA 2B7XA 1P37A 4LDOA 1L77A 1OWZA 112LA 171LA 1L59A 1OWYA 1SSYA 3DN0A 1C6QA 1LWGA 1G1VA 1QT4A 235LA 1OYUA 1LI3A 2F47A 3CDOA 1QTZA 1L15A 1CUPA 1C6EA 1K28A 1L65A 1L00A 165LA 2RB0X 1DYBA 4I7KA 3OE9A 3LZMA 1C63A 1G1WA 1PQDA 3F9LA 1L35A 1LYFA 3SB5A 1LGUA 2Q9EA 191LA 226LA 3DN1A 1CV5A 3C83A 151LA 1QT3A 4I7OA 4W57A 2RBSA 1L09A 1L21A 3FADA 2B70A 3OE0A 3DKEX 1L89A 4ZPUA 1B6IA 1QS9A 246LA 2O7AA 103LA 1L24A 1L84A 3C7ZA 1L55A 1CV1A 3SB7A 3HTDA 3NYAA 240LA 2OU8A 1D2WA 1CX6A 1KNIA 3GUOA 1P64A 155LA 1C6GA 238LA 2CUUA 1G0MA 1L91A 4W53A 1L47A 1C60A 143LA 1L40A 3C8QA 183LA 259LA 4W56A 2LC9A 1L57A 1L08A 1L43A 1L31A 1KY1A 1DYFA 249LA 2RB1X 1C6JA 4I7TA 253LA 250LA 2RB2X 229LA 3DMZA 170LA 1C64A 210LA 2RAYX 257LA 205LA 139LA 1L10A 4DAJA 1L62A 1C6BA 2B6WA 4EKQA 1P7SA 1SWZA 104LA 2RBRA 141LA 4ARPA 164LA 1G0GA 161LA 247LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LZ4A 1P2LA 4NG8A 1T8FA 2RAZX 3NY9A 1DPXA 1GE4A 3RU5A 4CJ2A 1JKCA 1GE1A 5F81A 1C61A 1QUHA 3SB8A 1L90A 4ARJA 5FELA 1CKFA 3A8ZA 1C6KA 5I54A 1EQ5A 4EKPA 3W3EA 4NWEA 1G0JA 1CU5A 231LA 1LZ9A 122LA 1GFKA 2OU9A 4PRUA 1L69A 1CV0A 3WULA 3HWLA 3E3DA 1LTMA 174LA 1LZAA 211LA 2OU0X 4NSIA 2FBDA 1HELA 1LHKA 5APEA 1L27A 3C8SA 4TTDA 1HFZA 1SX2A 5LVHA 1DQJC 1XEJA 236LA 3W6BA 1XEIA 1L53A 1L29A 1UIFA 1OUEA 2YDGA 1JJ0A 4W52A 4EMNA 1KW5A 213LA 1CJ8A 4GLVA 1P2CC 4FDYA 4EOFA 1GBZA 2DQAA 1GF9A 4LZMA 3V2YA 5I4XA 4NEBA 1DI4A 1L56A 4PJZA 1GWDA 1ZURA 1L68A 140LA 2HEBA 3SP3A 3GUIA 3FI7A 2ZYCA 3ZVQA 4J1BA 2QB0B 5KXWA 2HUKA 4EPFA 1JEFA 1HEOA 1IP3A 1C6MA 1P36A 2OTZX 5E9RA 4DQJA 4ET9A 1JTTL 4DD7A 1DKKA 4OWBA 1QTDA 2GV0A 4DDBA 4IASA 1OV5A 2RBOA 1L0KA 1W6ZA 1L38A 1D3JA 2MEEA 1L97A 1LHIA 1KY0A 1L19A 1HFXA 3KAMA 4HPEA 1I6SA 208LA 1IWZA 1IWWA 1QUGA 4Z41A 2I6ZA 1KW7A 3A91A 5KKIA 1GEZA 2NTHA 128LA 4NGLA 1EQ4A 3EMLA 4TSBA 3FI5A 1REYA 5IELA 4X3BA 1B5WA 1KXYA 4YM8A 1L13A 1EQEA 3AB6A 3C7YA 4N5RA 4W94A 4H8XA 1C6PA 4H92A 228LA 1C46A 1LYOA 4H9BA 2I26L 2HU3A 1YL0X 1CU3A 1JITA 1D6QA 1L76A 3P64A 1L06A 1P3NA 1L14A 1C6NA 4H1PA 1JISA 4ARLA 5L3HA 1B5UA 2ZWBA 4R0FA 1LSDA 3SB9A 1C6FA 5F9XA 1LI2A 220LA 1G7HC 1QT5A 1WQQA 4WM5A 1QSAA 3DN8A 4HTNA 1D9WA 2YBLA 2VB1A 1L61A 3GUJA 5LZMA 1KXWA 4DD2A 1JTMA 3VW7A 1E8LA 1OVKA 131LA 1C6DA 1KIRC 1G0LA 3A3QA 3K2RA 1GE2A 3WPKA 4BAFA 2G4NA 1LMPA 4EJ4A 2O79A 4XJIA 2HEDA 1BB5A 2B5ZA 2BAAA 1LZ1A 1C62A 160LA 4M4OA 1D0MA 1NBYC 3A6BY 3WPLA 1IP2A 2EQLA 4G49A 4I7LA 2DKVA 1MELL 1QIOA 1L39A 1QUSA 4QGZA 2A7FA 2Z12A 1LJ3A 4Z46A 1OUGA 3RT5X 1LJIA 2D4JA 1L80A 1L25A 201LA 4XYYA 4LGKA 189LA 4LYMA 2DQIY 3GUNA 243LA 1LSZA 3HT6A 4GN4A 1GEVA 1OUAA 1B5ZA 4S0WA 1RI8B 200LA 3TMXA 3ZVQB 2LYMA 1L86A 1GB2A 1JUGA 1LKRA 1L23A 2G4QA 4J7VA 133LA 248LA 5LIOA 4ARQA 3AZ7A 1OUFA 1YILA 2B6ZA 5KXKA 1LSFA 3N9CA 1LMAA 3JR6A 1HENA 5KXZA 3HT7A 4RLMA 1GD6A 1T6VL 1L33A 1VFBC 2MEBA 3ZEKA 2DQGY 5HMVA 3GUMA 1G0PA 4NGVA 1LMCA 2LYZA 4RDSA 4ETBA 3EMSA 3M3UA 2BQFA 2HUMA 5F16A 1LYJA 1IVMA 1G7MC 1XSFA 4KPMA 4OW1A 1P37A 1LSGA 4WLYA 4WM6A 171LA 2D6BA 1SSYA 2MEGA 3A67Y 1LI3A 1UIDA 1QTZA 1QDTA 1K28A 1C6EA 1L00A 1G7IC 5B59A 5LYTA 3F9LA 3LYOA 1LGUA 3DN1A 1LJJA 1VEDA 3WU9A 2RBSA 1L09A 1L21A 3OJPA 3AW6A 4ZPUA 2B70A 1L89A 1QS9A 5LVJA 246LA 3A94A 1LJKA 2ZNXY 3SB7A 1OQMA 5B07A 1KNIA 1YAOA 8LYZA 1CKGA 1V7TA 1AT5A 2CUUA 1L47A 3C8QA 3WXUA 1B7QA 2LC9A 1KY1A 1DYFA 2RB1X 5IDDA 1GF5A 250LA 1RE2A 3DMZA 2RAYX 1IOQA 257LA 194LA 139LA 1L10A 4DAJA 4MSTA 5M1YA 4PJ2C 2RBRA 247LA 4HSFA 1IORA 4MCKA 5JENB 3G3AB 1FDLY 1LSBA 3HFMY 3FA0A 4GCCA 1GFUA 1D9UA 4DDCA 1TDYA 2B6XA 1LSNA 172LA 3TXEA 1UICA 2B6YA 3G3XA 3IWRA 2DBTA 1D2YA 4NGIA 4NSHA 1IP4A 1T8AA 4IJ4A 4DT3A 1OVHA 5APFA 5ILCA 5LXWA 2BQAA 1JJ3A 1LJNA 2W1LA 1DYEA 1UIAA 4W55A 5HQ1A 3TXBA 2PC2A 4H93A 1YL1X 1L88A 1L82A 4YEOA 262LA 4LYTA 4P2EA 1B5VA 5L3IA 1CJ9A 1LJEA 3CDVA 3LZ2A 3CSZA 1FLYA 1SLYA 1DZBX 4NSJA 3BKVA 1DXJA 4N9RA 1C6LA 1C6HA 4B4JA 3LN2A 4TX7A 1JSEA 2BQIA 1LYGA 3HTFA 3G3WA 5D5FA 4EXMA 3ULRA 4HTQA 216LA 3CT0A 4ARQB 2BQLA 1IWUA 1QTCA 3SN6R 1LSAA 1GDXA 2B72A 2YBMA 1UA6Y 4ARMA 1SX7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1LZ4 A;  1P2L A;  4NG8 A;  1T8F A;  2RAZ X;  3NY9 A;  1DPX A;  1GE4 A;  3RU5 A;  4CJ2 A;  1JKC A;  1GE1 A;  5F81 A;  1C61 A;  1QUH A;  3SB8 A;  1L90 A;  4ARJ A;  5FEL A;  1CKF A;  3A8Z A;  1C6K A;  5I54 A;  1EQ5 A;  4EKP A;  3W3E A;  4NWE A;  1G0J A;  1CU5 A;  231L A;  1LZ9 A;  122L A;  1GFK A;  2OU9 A;  4PRU A;  1L69 A;  1CV0 A;  3WUL A;  3HWL A;  3E3D A;  1LTM A;  174L A;  1LZA A;  211L A;  2OU0 X;  4NSI A;  2FBD A;  1HEL A;  1LHK A;  5APE A;  1L27 A;  3C8S A;  4TTD A;  1HFZ A;  1SX2 A;  5LVH A;  1DQJ C;  1XEJ A;  236L A;  3W6B A;  1XEI A;  1L53 A;  1L29 A;  1UIF A;  1OUE A;  2YDG A;  1JJ0 A;  4W52 A;  4EMN A;  1KW5 A;  213L A;  1CJ8 A;  4GLV A;  1P2C C;  4FDY A;  4EOF A;  1GBZ A;  2DQA A;  1GF9 A;  4LZM A;  3V2Y A;  5I4X A;  4NEB A;  1DI4 A;  1L56 A;  4PJZ A;  1GWD A;  1ZUR A;  1L68 A;  140L A;  2HEB A;  3SP3 A;  3GUI A;  3FI7 A;  2ZYC A;  3ZVQ A;  4J1B A;  2QB0 B;  5KXW A;  2HUK A;  4EPF A;  1JEF A;  1HEO A;  1IP3 A;  1C6M A;  1P36 A;  2OTZ X;  5E9R A;  4DQJ A;  4ET9 A;  1JTT L;  4DD7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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