172LA

Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of t4 lysozyme
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNCFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 172lA00
1L34A 4I7PA 1L13A 1QSQA 2Z6BA 2RB1X 1QTZA 244LA 3GUJA 1L33A 2OU9A 3D4SA 123LA 2RB0X 2RBSA 1L81A 236LA 3CDQA 1C62A 2RBRA 1TLAA 190LA 233LA 1KW7A 3CDOA 3L2XA 3NY9A 1QTBA 1C6AA 255LA 1G0GA 1OWYA 3FA0A 1L06A 4W58A 1L80A 3C8QA 3C8RA 3HH3A 1QT8A 1G07A 4K5YA 174LA 1D2YA 1B6IA 1G1VA 3C82A 2RBQA 4ARJA 222LA 1QUGA 1EPYA 1LLHA 206LA 3SB6A 138LA 1LWGA 1PQOA 1L92A 1CU3A 1L38A 1P36A 2B74A 4I7SA 1L27A 1L60A 4W59A 1P46A 1QTHA 2RAZX 119LA 3OE0A 1L52A 4W51A 4W57A 3C8SA 3UONA 1LGUA 253LA 3PDSA 1LGXA 143LA 1CV3A 3GUKA 192LA 4S0WA 1PQDA 1C6PA 219LA 252LA 1L74A 1OVKA 1L89A 2LCBA 3GUMA 4PK0A 1C61A 1PQJA 1L16A 3C7YA 1DYEA 151LA 2OTYX 114LA 1C6TA 157LA 3DN1A 178LA 1OWZA 4I7RA 1DYCA 1L57A 163LA 3HTGA 1L66A 111LA 254LA 4I7MA 221LA 1L53A 226LA 1DYAA 1OYUA 260LA 1P3NA 1D9WA 3C7WA 228LA 185LA 2F32A 1XEPA 149LA 3GUOA 1LYDA 2A4TA 262LA 1LYJA 1C6CA 1G0PA 1C60A 1L15A 1L36A 3V2YA 128LA 1L90A 1L28A 112LA 3C83A 3DKEX 1JTNA 1L64A 3HU8A 1L48A 107LA 196LA 1L63A 1L07A 1OVJA 3SB5A 216LA 184LA 4I7JA 1CVKA 1K28A 152LA 1P5CA 1G0JA 246LA 1QSBA 2OU0X 189LA 1L47A 1L94A 4I7OA 1L22A 1LYIA 4PJZA 187LA 227LA 1CV4A 3SBBC 4EKQA 3OE6A 1CU6A 1L58A 142LA 1L02A 220LA 1KNIA 1OV7A 1L71A 4EXMA 3HTDA 1C6QA 4YXCA 217LA 1C6DA 140LA 1L72A 3SB7A 3K2RA 144LA 1L50A 1P64A 257LA 1G0KA 1L70A 1C6FA 250LA 3NY8A 1XJUA 212LA 181LA 4I7QA 4I7TA 159LA 2LC9A 210LA 1CV0A 3GUNA 3C7ZA 231LA 4ARPA 1DYDA 1LW9A 1C6GA 1QUOA 211LA 1QT4A 4IAPA 195LA 1KY1A 1L0KA 1L10A 1C6HA 129LA 4EKRA 3F8VA 5I14A 1L37A 165LA 1D3FA 1QTVA 126LA 167LA 1L32A 1L96A 215LA 1LYHA 1I6SA 127LA 1L00A 3PBLA 1T8GA 3DN8A 2O4WA 1L40A 2QB0B 1CV5A 230LA 1L87A 172LA 191LA 1C63A 7LZMA 1SSWA 3CDRA 1KY0A 2CUUA 3EMLA 2B6WA 1QT6A 158LA 1KW5A 3CDVA 1L17A 188LA 1CU2A 209LA 2O79A 175LA 1CUPA 4ARMB 1L61A 1P56A 3HUKA 4E97A 229LA 235LA 1L43A 130LA 4W54A 1T8AA 156LA 1CX6A 1L41A 2OE7X 4GRVA 2OEAX 256LA 251LA 182LA 3HH4A 102LA 1L88A 1L14A 1LYGA 1L67A 1C64A 1LI6A 1C66A 3HH6A 3OE8A 1T8FA 1L76A 164LA 3ODUA 1LYFA 1L86A 3RZEA 4ARLA 1L62A 2B6YA 4GBRB 1L45A 1SX2A 1QS9A 4EPIA 122LA 162LA 1L19A 1L25A 2NTHA 145LA 197LA 2HUKA 1SWZA 3DMXA 2OU8A 4LZMA 2HUMA 108LA 1L03A 3GUIA 4I7KA 183LA 1L59A 173LA 131LA 234LA 1L51A 1C6NA 3HWLA 4EJ4A 168LA 3DN0A 6LZMA 245LA 1CV1A 3FI5A 4W55A 1L97A 241LA 3CDTA 1D2WA 240LA 243LA 1G0QA 3SB9A 4ARQB 248LA 2RH1A 3FADA 1L77A 1ZURA 2RBOA 115LA 3HT6A 3DMVA 4OO9A 3RUNA 3DNAA 1C69A 1QTDA 258LA 3GULA 141LA 201LA 3DN3A 2B6TA 200LA 146LA 1L98A 2Q9EA 3LZMA 177LA 3HTFA 1L85A 1D3NA 1QUHA 2B6XA 1SSYA 3VW7A 150LA 103LA 1L69A 1L46A 1C6BA 3DN2A 1L01A 1G1WA 1G0MA 2NTGA 1LI2A 4W56A 2OTZX 1L23A 3G3VA 1QT3A 1L04A 3SN6R 1C67A 1L35A 1L73A 1C6JA 1L12A 176LA 213LA 3HUQA 232LA 1PQKA 2B73A 4YX7C 1QUDA 1CTWA 1P2RA 3HT8A 1DYFA 225LA 1WTHA 2RBPA 1L75A 2F47A 3L64A 1C68A 1L20A 2LZMA 3SB8A 170LA 1XJTA 1LWKA 155LA 1C65A 1L93A 1L55A 249LA 1C6MA 1CX7A 2L78A 2B72A 4ARMA 113LA 1CUQA 4EPFA 1L31A 109LA 1L83A 1L24A 1DYBA 1QT7A 2B6ZA 3C81A 4AQNA 3NYAA 1NHBA 259LA 2HULA 3JR6A 1PQMA 1P7SA 1L91A 1C6LA 3HTBA 104LA 1P2LA 148LE 125LA 261LA 3V2WA 1SX7A 4LDOA 1L05A 3HH5A 1L44A 3DN4A 1L54A 1QS5A 3HDEA 1CU0A 1L42A 3HDFA 1L99A 1SWYA 147LA 242LA 2RB2X 3QAKA 1L82A 1T6HA 1LPYA 1L79A 1P6YA 3HU9A 1P37A 1C6IA 199LA 4YXAC 1LYEA 161LA 1ZYTA 1L11A 3SBAA 2RBNA 214LA 238LA 224LA 186LA 2OE4X 218LA 1QT5A 1L08A 1JTMA 223LA 4DKLA 3DN6A 5LZMA 110LA 1OV5A 3HUAA 2ANVA 1ZWNA 2ANXA 2OE9X 3DMZA 4ARQA 169LA 1C6EA 1G06A 1QTCA 3HT9A 2B75A 118LA 4W52A 160LA 4EKSA 180LA 1L84A 4DAJA 3G3XA 1L95A 1L56A 139LA 1D3MA 137LA 2O7AA 3G3WA 4W53A 237LA 2B70A 1G0LA 1DYGA 247LA 2QARC 2B7XA 1L21A 198LA 1C6KA 3F9LA 4I7LA 1LGWA 1KS3A 1D3JA 1L09A 239LA 1L30A 4ZPUA 1L39A 120LA 4DJHA 2F2QA 3HT7A 4I7NA 3C80A 1L29A 205LA 171LA 2RAYX 166LA 1LI3A 2Q9DA 1OVHA 1PQIA 4LDEA 1L49A 4LDLA 1T97A 1L65A 1JQUA 2IGCA 1L68A 1CV6A 1CU5A 1L18A 3OE9A 1L26A 1L0JA 3GUPA 4EKPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5KXYA 2A7DA 1NF5A 1QTZA 3W6EA 1O23A 3TXEA 123LA 4NGLA 4RW2A 1GB8A 4TSCA 2DQEY 2G4NA 4WLDA 190LA 1LCNA 1KW7A 3CDOA 1C6AA 1OWYA 1L80A 1WTMA 2FBDA 5F16A 5I5QA 1G07A 2H5ZA 5KXZA 2W1XA 222LA 3ZVQB 138LA 1AT5A 1LWGA 5FDJA 1L92A 1CU3A 4I7SA 1L27A 1LHLA 1L60A 1LHKA 1N4FA 2YSSC 1QTHA 1LZ5A 4XADA 1L52A 1B5WA 1YANA 1LJ4A 1B5ZA 4WG7A 3TXFA 3PDSA 143LA 1CV3A 4WM3A 1QTKA 5LA8A 3CB7A 3AJNA 3GUMA 1FN5A 1DYEA 4NGOA 2BQIA 1C6TA 157LA 1XGUC 178LA 4I7RA 1L66A 254LA 4MSTA 1JKBA 1L53A 4J0LA 1D9WA 2W1YA 228LA 3B0IA 1XEPA 4H91A 4N8ZA 1C7PA 1LYJA 4WO9A 1IR9A 1G0PA 4R6CA 1L15A 2Z12A 4NHTA 3CSQA 4NG8A 4YEMA 4L41A 5I54A 3CSZA 4GN4A 3DKEX 1JTNA 5KXLA 4H8ZA 107LA 196LA 1IP1A 1L07A 3SB5A 1CVKA 1LJ3A 3HBDA 4B0DA 1QSBA 1FBIX 4I7OA 1L22A 4PJZA 2C8OA 227LA 4G4CA 1LMQA 3ULRA 5F9XA 3TXDA 1GHLA 2Z19A 1GBSA 2DQDY 4J1BA 3OE6A 2Q0MX 3B72A 4EXMA 3HBHA 4YXCA 3EXDA 1C10A 3K2RA 144LA 3AB6A 1L50A 4H1PA 212LA 1IOCA 4I7TA 2Z38A 1LAAA 5DLAA 1XGTC 3TXBA 1GB9A 4CHXA 1LPIA 1LZRA 211LA 1H87A 1QT4A 1L0KA 1L10A 1C6HA 4EKRA 1JKCA 1QTVA 1DPWA 2Z2EA 1CNSA 1L32A 1QIOA 3W6CA 1LMOA 5E4PA 2NWDX 1OUHA 3DN8A 5LYMA 2MEIA 3A3RX 3CDRA 3TXKA 2I26L 2CUUA 4RW1A 4KL7A 1KW5A 1ALCA 1L17A 4LT1A 3HUKA 4E97A 1SQ2L 1DI4A 3B0OA 1CJ9A 4HJZA 256LA 1LJHA 2D91A 3WUNA 2BQAA 4W96A 1LI6A 3HH6A 1L76A 4ARLA 2B6YA 4WM5A 1L45A 1QS9A 1GBZA 4EPIA 4LT3A 122LA 162LA 4BAPA 1L19A 1L25A 4H93A 1WQNA 1KIPC 1L03A 3GUIA 4WM6A 1DQJC 3QE8A 4PGJB 4CGEA 234LA 1HEWA 3HWLA 245LA 1L97A 3WU8A 3WMKA 243LA 4ARQB 3CT5A 3GXRA 1ZURA 3HT6A 3DMVA 1JJ3A 4GLVA 258LA 1JWRA 5HMVA 1C45A 5E9RA 3TMWA 3A93A 1L98A 1DKKA 2Q9EA 4GN5C 3GXKA 5C6IA 5A3ZA 4ETEA 1QUHA 8LYZA 2B6XA 2N5ZA 1TBYA 2HTXA 103LA 1L69A 1FKVA 3M3UA 1D0MA 2NTGA 1LI2A 1DXJA 5FEKA 1QT3A 4WOAA 1L35A 1C6JA 1QDRA 4H92A 4H9IA 1PQKA 1QUDA 3RU5A 1CTWA 1LYZA 1P2RA 4DD3A 4OWHA 2LZMA 2LZTA 1LWKA 1L93A 1VFBC 2G4PA 2L78A 4NGIA 4ARMA 109LA 1DYBA 1HNLA 2B6ZA 3NYAA 1REYA 2HULA 1UIHA 2RSCA 1GBYA 1QQYA 104LA 1REXA 261LA 1L05A 1LKRA 5LYZA 1L44A 2YBNA 4N5RA 1QS5A 1IWWA 1HMKA 1L42A 1OUCA 3WUMA 147LA 2DQIY 2AUBA 1BQLY 1B7MA 3HU9A 1P37A 1OUFA 1BHZA 1C6IA 199LA 1LYEA 1ZYTA 1L11A 1B5XA 3EBAB 5ILCA 2EIZC 218LA 1LZYA 223LA 3DN6A 1ZWNA 5IELA 194LA 3DMZA 1VATA 1RFPA 4GLAA 5D5CA 169LA 1C6EA 2B75A 118LA 4W52A 160LA 2HEAA 4EKSA 1B9OA 180LA 1QSAA 6LYZA 5KXTA 3AYQA 1L95A 1D3MA 4B4IA 1C43A 4HV1A 4LFPA 2B7XA 1C6KA 1L30A 2HEEA 2YBMA 4KPMA 1L29A 171LA 1HENA 4AGAA 1OVHA 4LDEA 1L49A 4NSIA 1I20A 3OE9A 1GWDA 3GUPA 1LZBA 3WPKA 1L13A 2Z6BA 2RB1X 4DD0A 133LA 2RBSA 4N9RA 236LA 4NWHA 3ATNA 4LYMA 3B6LA 3P66A 1GF8A 2BQOA 3C8QA 3QY4A 4YENA 1LHIA 1GF5A 1IR7A 4IJ4A 5HMJA 1HFXA 3A92A 1LYSA 4P2EA 2RBQA 2ZNXY 2ZYPA 1LLHA 206LA 5I4XA 1PQOA 1IP5A 1LSNA 1DZBX 2BLYA 1XFPL 119LA 3N9EA 2HU1A 3GUKA 1GF6A 1PQDA 5HQ1A 5LA5A 1IP4A 5J7CA 4WL6A 4PK0A 1PQJA 2LYZA 3C7YA 2MEGA 151LA 1TCYA 2OTYX 3DN1A 1OWZA 163LA 226LA 4GCBA 5KXOA 2F32A 1VDTA 2BAAA 3GUOA 1LYDA 1B7NA 1BB5A 2A4TA 1A2YC 262LA 5II3A 1BWJA 1C6CA 1OUJA 1L36A 2BQDA 4NGZA 3HU8A 4RLNA 3A90A 1L63A 152LA 3WU9A 1LJKA 1L47A 1HC0A 4QDNA 2H9JA 2BQEA 1LYIA 5KXMA 187LA 2MEHA 3TMXA 1REZA 4EKQA 1IY3A 1BB4A 3RT5X 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5KXY A;  2A7D A;  1NF5 A;  1QTZ A;  3W6E A;  1O23 A;  3TXE A;  123L A;  4NGL A;  4RW2 A;  1GB8 A;  4TSC A;  2DQE Y;  2G4N A;  4WLD A;  190L A;  1LCN A;  1KW7 A;  3CDO A;  1C6A A;  1OWY A;  1L80 A;  1WTM A;  2FBD A;  5F16 A;  5I5Q A;  1G07 A;  2H5Z A;  5KXZ A;  2W1X A;  222L A;  3ZVQ B;  138L A;  1AT5 A;  1LWG A;  5FDJ A;  1L92 A;  1CU3 A;  4I7S A;  1L27 A;  1LHL A;  1L60 A;  1LHK A;  1N4F A;  2YSS C;  1QTH A;  1LZ5 A;  4XAD A;  1L52 A;  1B5W A;  1YAN A;  1LJ4 A;  1B5Z A;  4WG7 A;  3TXF A;  3PDS A;  143L A;  1CV3 A;  4WM3 A;  1QTK A;  5LA8 A;  3CB7 A;  3AJN A;  3GUM A;  1FN5 A;  1DYE A;  4NGO A;  2BQI A;  1C6T A;  157L A;  1XGU C;  178L A;  4I7R A;  1L66 A;  254L A;  4MST A;  1JKB A;  1L53 A;  4J0L A;  1D9W A;  2W1Y A;  228L A;  3B0I A;  1XEP A;  4H91 A;  4N8Z A;  1C7P A;  1LYJ A;  4WO9 A;  1IR9 A;  1G0P A;  4R6C A;  1L15 A;  2Z12 A;  4NHT A;  3CSQ A;  4NG8 A;  4YEM A;  4L41 A;  5I54 A;  3CSZ A;  4GN4 A;  3DKE X;  1JTN A;  5KXL A;  4H8Z A;  107L A;  196L A;  1IP1 A;  1L07 A;  3SB5 A;  1CVK A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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