173LA

Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of t4 lysozyme
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLEIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLEMLQQKRWDEAAVNLAESRWYNQTPNRAERVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 173lA00
2RB1X 2RB2X 141LA 1L07A 1L45A 251LA 2NTHA 1C6IA 3HUQA 3G3XA 125LA 2OE7X 1L16A 149LA 1JTMA 1P7SA 4I7MA 1G0PA 4W57A 1L85A 1C6DA 4I7KA 186LA 1OVHA 184LA 1L40A 226LA 199LA 1L79A 219LA 1L06A 3C8RA 4I7NA 1L96A 3RZEA 2Z6BA 1L60A 3FI5A 2B70A 104LA 1D2WA 2HULA 3HT8A 1L92A 1L01A 4W55A 221LA 131LA 2HUKA 3L2XA 1I6SA 1P64A 3LZMA 1NHBA 234LA 4ARMA 113LA 1C6PA 1KW5A 1L64A 1OVJA 2OU8A 1L91A 1OWYA 228LA 256LA 243LA 2B72A 4PK0A 211LA 1KS3A 2F2QA 1C6TA 1L76A 1L74A 3HH4A 216LA 4EXMA 1LI2A 2Q9EA 1L67A 1LYIA 3ODUA 4LDEA 220LA 1XJTA 2B74A 1L32A 1CV1A 3OE8A 1QSQA 1QT6A 242LA 1QUHA 2OEAX 1L24A 249LA 1LW9A 1OWZA 1L0JA 1SX7A 1QT7A 3SBAA 3GUPA 115LA 3CDQA 160LA 4EPFA 3V2WA 1L08A 1D3FA 244LA 4W56A 3SB8A 1L61A 145LA 4IAPA 1L28A 1L65A 1L75A 3C7ZA 1G1VA 1KNIA 4DKLA 1ZYTA 139LA 1XEPA 4I7PA 3DMVA 4I7RA 3HH6A 1L02A 3HWLA 3L64A 4ARLA 1T6HA 1LI3A 3CDVA 3DN0A 3HT7A 1L30A 4YXAC 4LDOA 168LA 2LZMA 155LA 1L20A 3G3VA 1P2RA 118LA 2O7AA 239LA 182LA 1SSWA 1C6AA 1PQMA 259LA 1KY1A 3GUNA 1QT8A 3HU9A 3DN4A 107LA 1LYJA 7LZMA 1L34A 1L94A 1CV0A 2OTYX 1DYAA 3C81A 4OO9A 1KW7A 1CV6A 1LLHA 4W51A 4DAJA 157LA 1L72A 1G0LA 2F32A 130LA 1L14A 4YX7C 1D3JA 3GUOA 1EPYA 3OE0A 1LYFA 162LA 2B73A 3EMLA 1C64A 201LA 1L29A 1QTVA 3G3WA 3HTFA 3C83A 210LA 227LA 3C7WA 240LA 108LA 1D9WA 2ANVA 3CDTA 1CU0A 1L15A 2RBRA 237LA 4DJHA 1C67A 1OYUA 167LA 3FADA 1DYEA 241LA 1P36A 2HUMA 1JTNA 156LA 4I7SA 1L81A 1L51A 209LA 143LA 2OU0X 4EKRA 1LWKA 4EKQA 1P6YA 112LA 1KY0A 2O4WA 2OTZX 1PQDA 3DN6A 5I14A 1CVKA 1L22A 246LA 1C6EA 3DKEX 1L38A 200LA 1CU5A 2RBSA 248LA 1L95A 1L56A 1PQJA 1L43A 4I7QA 4LZMA 262LA 190LA 148LE 3SB9A 247LA 1DYFA 1L46A 1CX7A 180LA 1TLAA 119LA 1QT4A 2F47A 4GBRB 1L36A 1L39A 215LA 1L09A 1PQIA 1C69A 3D4SA 3PDSA 1C61A 2CUUA 4W59A 3F9LA 1CUPA 1CU6A 1L89A 122LA 3JR6A 3FA0A 146LA 1L57A 212LA 1QTDA 189LA 1PQKA 1CTWA 1L33A 3HUKA 3DN1A 150LA 4I7JA 4PJZA 1L97A 3SBBC 225LA 3OE9A 3HT9A 252LA 2A4TA 174LA 3C8QA 1WTHA 2RAYX 3V2YA 1QTHA 1L68A 191LA 1QTCA 138LA 1CU2A 1LGXA 1L49A 1L54A 1L99A 4W53A 2OU9A 224LA 1L04A 1L03A 1G0KA 1C6BA 257LA 1P3NA 140LA 1L44A 1C6LA 1C6MA 1SX2A 4E97A 236LA 1CV3A 1L77A 2RBQA 2IGCA 1T8GA 3DMXA 1L88A 1D3NA 1QS9A 3VW7A 3DN3A 188LA 1L05A 1L25A 1L55A 3C80A 1G06A 1JQUA 142LA 4I7TA 3HU8A 165LA 192LA 1CV4A 1L58A 4I7OA 147LA 6LZMA 4EKSA 1P5CA 1C6QA 206LA 163LA 2RBOA 217LA 177LA 1L18A 1LI6A 1LGUA 2O79A 3HH3A 1QUGA 238LA 166LA 1C60A 5LZMA 3K2RA 1C66A 3DNAA 2B6XA 3GUIA 3C7YA 1G0JA 159LA 172LA 213LA 3GUMA 171LA 1G1WA 1L0KA 1L83A 253LA 169LA 187LA 2B6YA 4EPIA 173LA 1QTZA 1DYDA 3HDFA 1QSBA 1L70A 1L00A 1C68A 3DMZA 2ANXA 4LDLA 1L37A 1ZWNA 3GUKA 102LA 176LA 1OV5A 185LA 3F8VA 4YXCA 129LA 4W54A 4ARQB 3NY9A 198LA 1PQOA 181LA 255LA 3UONA 1L90A 1QUDA 1L42A 1D3MA 1L86A 1CV5A 245LA 1L82A 2QB0B 158LA 1L31A 214LA 3NYAA 205LA 1P46A 3HDEA 161LA 4GRVA 114LA 1CU3A 3HUAA 120LA 1DYGA 2B6ZA 3HTBA 4EJ4A 3C8SA 3DN8A 4K5YA 1SWYA 232LA 1C6KA 1C6FA 4ZPUA 1P2LA 2QARC 1C6HA 1G0MA 3GUJA 2NTGA 3QAKA 1LYGA 1L87A 1LPYA 1SWZA 1L69A 2LC9A 1QT3A 1G0GA 261LA 2B6WA 1L13A 1SSYA 1XJUA 4ARJA 123LA 4EKPA 1C6CA 4S0WA 3CDOA 1QUOA 222LA 1C6NA 1L80A 2B6TA 2B75A 1L19A 1K28A 1L23A 127LA 1QT5A 1ZURA 1QTBA 103LA 1DYCA 4W52A 1L21A 1L35A 218LA 1LWGA 1L48A 1L10A 4ARQA 1LYDA 195LA 1L27A 2OE4X 258LA 111LA 3HH5A 1L47A 1T8FA 1L62A 1LYEA 3HTDA 3C82A 1CUQA 254LA 4ARPA 3OE6A 1T97A 1D2YA 1L11A 4W58A 1CX6A 1LGWA 1G0QA 1L50A 1L93A 1T8AA 3GULA 1LYHA 1L66A 3SB6A 1L98A 1C6GA 1L52A 233LA 196LA 152LA 2L78A 164LA 2RBNA 3CDRA 3RUNA 3NY8A 2LCBA 2OE9X 1L17A 1L84A 223LA 197LA 3SN6R 4AQNA 1L73A 231LA 4ARMB 1C62A 109LA 1L12A 128LA 1G07A 151LA 260LA 183LA 2B7XA 1L53A 1L71A 1B6IA 110LA 2Q9DA 3SB7A 1L63A 1OV7A 2RBPA 3PBLA 126LA 2RAZX 3DN2A 1QS5A 1C6JA 235LA 230LA 144LA 1P37A 3HT6A 2RH1A 1P56A 175LA 2RB0X 250LA 1OVKA 1L41A 1L26A 3HTGA 1C65A 170LA 1C63A 1L59A 3SB5A 137LA 178LA 1DYBA 4I7LA 229LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DKKA 4HJZA 1OUEA 3EO5A 4HPEA 1HC0A 1IOCA 4XJFA 4ZEEA 149LA 1GAZA 1JTMA 1P7SA 4W57A 1OUHA 3W6FA 1L40A 2A7FA 2YBJA 2MEHA 4I7NA 3LN2A 1HFYA 1LJIA 1F10A 4W55A 221LA 1NHBA 1REZA 1J1OY 4A7DA 1TDYA 3HBEX 2EKSC 228LA 4NFVA 4PK0A 2F2QA 1L76A 4E3UA 3HH4A 216LA 1L67A 1LYIA 3ATNA 1BWHA 1CV1A 4LFPA 1QSAA 3OE8A 1QT6A 2OEAX 1YILA 4EOFA 4H8ZA 1LMTA 2LYMA 3CDQA 2MEBA 3V2WA 1DQJC 1B5WA 1C08C 1YAQA 1DZBX 1ZVHL 1HEWA 4GN3A 5LIOA 2H5ZA 4XJHA 2HU1A 5B06A 1KNIA 4DKLA 2EQLA 4DDAA 1B5ZA 4I7PA 1AM7A 1WQOA 1CJ8A 1L02A 3L64A 5APFA 1H87A 1GB0A 3CDVA 1AKIA 1G7HC 1IC7Y 2Z2EA 1WQNA 1P2RA 239LA 1CJ7A 1WQPA 1GFUA 259LA 5HMJA 1UUZC 5L3IA 1L94A 2OTYX 4DAJA 1G0LA 4WG1A 5DLAA 1IWYA 1C10A 2B73A 1GF3A 1UIFA 1BB7A 227LA 3ATOA 2Z38A 1LJ3A 2ANVA 2D4JA 3CDTA 1LHHA 2PC2A 1LTMA 1OYUA 4KXIA 1LMPA 1JUGA 1XEIA 1JTNA 1DPWA 209LA 1WQMA 3CSRA 3EXDA 3TMUA 4EKQA 4QDNA 1KY0A 2O4WA 1D0KA 1BVKC 1JTTL 4KL7A 5AMYA 5KXNA 2BQBA 246LA 5LYTA 3TXHA 248LA 3TXDA 1VDTA 3EBAB 4PPOA 4YEMA 1LSBA 1PQJA 1KXYA 5LVIA 4CGEA 1DYFA 1CX7A 1KIPC 1YROA 2F47A 3LYOA 1KIQC 1L36A 1NQIA 3F6ZA 1PQIA 3W6AA 1BB3A 1CUPA 3AW7A 1KXWA 1LJFA 1IO5A 4B1AA 146LA 3SBBC 1IR7A 4I7JA 1L97A 252LA 3C8QA 174LA 2GV0A 3AGHA 1YKXX 1L68A 191LA 2LZ2A 138LA 1UA6Y 4NGIA 1L49A 1B7LA 4WMGA 4W53A 3IJVA 2OU9A 1GFAA 1ALCA 2BAAA 1IOQA 1L04A 1LYOA 4CFOA 1C6LA 5F81A 4WL6A 2RBQA 4X3BA 3DMXA 4KT3A 3TXJA 1D3NA 5FEKA 1YL1X 1YL0X 3C80A 142LA 4LFXA 3HU8A 4I7OA 4YEOA 3N9AA 4WG7A 5KXXA 2CGIA 2MECA 1EQEA 2YDGA 1LJJA 5LVJA 3TXBA 5KY1A 3DNAA 2W1MA 2Z19A 1REXA 3M3UA 3C7YA 159LA 172LA 1IIZA 1LMCA 3AZ4A 4OWHA 5FCPA 4HTKA 1L0KA 1L83A 4LYTA 1DXJA 1G7MC 1FLUA 4NGYA 1YQVY 2BQAA 1ZWNA 1GDWA 102LA 2HTXA 2EIZC 3WW5A 3A6CY 2HEEA 4QY9A 1B2KA 1CV5A 5I5QA 2Z37A 1GE4A 2XQOA 1UBZA 3IJUA 161LA 3CQLA 3DN8A 4G4CA 5KXZA 1IORA 1BGIA 1I56A 3QAKA 4LT0A 1G7LC 2BQFA 1LPYA 2LZTA 4WM5A 3B0IA 1LZYA 2LC9A 1D0MA 2MEAA 2B6WA 1GFTA 1XJUA 4EKPA 3LYMA 4N5RA 1LJKA 1L19A 1CKFA 127LA 1TCYA 2DKVA 1OUJA 4DT3A 1LHKA 1L48A 1FBIX 1HERA 133LA 1IP7A 258LA 1T8FA 4UWNA 1D2YA 4NSHA 2D6BA 4TUNA 1YKZX 1GBXA 1LGWA 1G0QA 1QDTA 1AT5A 4LYZA 1B0DA 233LA 1IP6A 164LA 2RBNA 3ZVQB 3NY8A 4AQNA 231LA 5KXSA 1L12A 4HJVA 1G07A 4ETDA 1HSXA 3LYZA 3QE8A 183LA 4NG8A 2FYDA 2MEFA 1L53A 1L71A 110LA 3SB7A 1L63A 126LA 235LA 3HT6A 4AGAA 3IWRA 2RH1A 1NBZC 2RB0X 3A96A 250LA 1QUTA 3P64A 4XJBA 5EBHA 1C63A 5ILCA 5LAFA 3VWOA 4NHTA 229LA 2YBHA 2RB1X 2RB2X 141LA 4RLNA 1IC4Y 5F16A 1C6IA 1IP5A 3HUQA 125LA 1QIOA 4H92A 5APDA 3FI7A 3WUAA 4RDSA 1LHIA 1L85A 5M1YA 1GFVA 186LA 184LA 226LA 2DQEY 3C8RA 1LOZA 1CJ9A 4GCEA 2Z6BA 2F4AA 1L60A 3FI5A 1D2WA 1PZYA 1L01A 1GPQC 2YBIA 131LA 1LMNA 2BQEA 2HUKA 1I6SA 1LMOA 1LKRA 1BB5A 5HNLA 234LA 4ARMA 1GB2A 2OU8A 3K3TA 1L74A 1LI2A 4WM1A 4H9IA 220LA 3W3EA 1GFEA 1L24A 4OW1A 2VB1A 1FLYA 4XYYA 2IFFY 1LW9A 1OWZA 1L0JA 1WQRA 2BQKA 3GUPA 3J6KA 3A92A 160LA 2DBTA 1IP2A 1L61A 145LA 1TEWA 1GF8A 1L65A 5JENB 4WM4A 1G1VA 1ZYTA 4Z98A 1GB6A 2LHMA 2ZWBA 1T6HA 1LJNA 1HMLA 3HT7A 1EL1A 1L30A 3CB7A 1B7QA 4ZFPA 4UWVA 1KXXA 2MEEA 5F9XA 3G3VA 1VFBC 2C8OA 1KY1A 5KKJA 3WULA 3WXTA 2LYOA 1L34A 3WPJA 2CDSA 5B1GA 3C81A 4Z41A 4W51A 1UIBA 1L72A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1DKK A;  4HJZ A;  1OUE A;  3EO5 A;  4HPE A;  1HC0 A;  1IOC A;  4XJF A;  4ZEE A;  149L A;  1GAZ A;  1JTM A;  1P7S A;  4W57 A;  1OUH A;  3W6F A;  1L40 A;  2A7F A;  2YBJ A;  2MEH A;  4I7N A;  3LN2 A;  1HFY A;  1LJI A;  1F10 A;  4W55 A;  221L A;  1NHB A;  1REZ A;  1J1O Y;  4A7D A;  1TDY A;  3HBE X;  2EKS C;  228L A;  4NFV A;  4PK0 A;  2F2Q A;  1L76 A;  4E3U A;  3HH4 A;  216L A;  1L67 A;  1LYI A;  3ATN A;  1BWH A;  1CV1 A;  4LFP A;  1QSA A;  3OE8 A;  1QT6 A;  2OEA X;  1YIL A;  4EOF A;  4H8Z A;  1LMT A;  2LYM A;  3CDQ A;  2MEB A;  3V2W A;  1DQJ C;  1B5W A;  1C08 C;  1YAQ A;  1DZB X;  1ZVH L;  1HEW A;  4GN3 A;  5LIO A;  2H5Z A;  4XJH A;  2HU1 A;  5B06 A;  1KNI A;  4DKL A;  2EQL A;  4DDA A;  1B5Z A;  4I7P A;  1AM7 A;  1WQO A;  1CJ8 A;  1L02 A;  3L64 A;  5APF A;  1H87 A;  1GB0 A;  3CDV A;  1AKI A;  1G7H C;  1IC7 Y;  2Z2E A;  1WQN A;  1P2R A;  239L A;  1CJ7 A;  1WQP A;  1GFU A;  259L A;  5HMJ A;  1UUZ C;  5L3I A;  1L94 A;  2OTY X;  4DAJ A;  1G0L A;  4WG1 A;  5DLA A;  1IWY A;  1C10 A;  2B73 A;  1GF3 A;  1UIF A;  1BB7 A;  227L A;  3ATO A;  2Z38 A;  1LJ3 A;  2ANV A;  2D4J A;  3CDT A;  1LHH A;  2PC2 A;  1LTM A;  1OYU A;  4KXI A;  1LMP A;  1JUG A;  1XEI A;  1JTN A;  1DPW A;  209L A;  1WQM A;  3CSR A;  3EXD A;  3TMU A;  4EKQ A;  4QDN A;  1KY0 A;  2O4W A;  1D0K A;  1BVK C;  1JTT L;  4KL7 A;  5AMY A;  5KXN A;  2BQB A;  246L A;  5LYT A;  3TXH A;  248L A;  3TXD A;  1VDT A;  3EBA B;  4PPO A;  4YEM A;  1LSB A;  1PQJ A;  1KXY A;  5LVI A;  4CGE A;  1DYF A;  1CX7 A;  1KIP C;  1YRO A;  2F47 A;  3LYO A;  1KIQ C;  1L36 A;  1NQI A;  3F6Z A;  1PQI A;  3W6A A;  1BB3 A;  1CUP A;  3AW7 A;  1KXW A;  1LJF A;  1IO5 A;  4B1A A;  146L A;  3SBB C;  1IR7 A;  4I7J A;  1L97 A;  252L A;  3C8Q A;  174L A;  2GV0 A;  3AGH A;  1YKX X;  1L68 A;  191L A;  2LZ2 A;  138L A;  1UA6 Y;  4NGI A;  1L49 A;  1B7L A;  4WMG A;  4W53 A;  3IJV A;  2OU9 A;  1GFA A;  1ALC A;  2BAA A;  1IOQ A;  1L04 A;  1LYO A;  4CFO A;  1C6L A;  5F81 A;  4WL6 A;  2RBQ A;  4X3B A;  3DMX A;  4KT3 A;  3TXJ A;  1D3N A;  5FEK A;  1YL1 X;  1YL0 X;  3C80 A;  142L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1DKK A;  4HJZ A;  1OUE A;  3EO5 A;  4HPE A;  1HC0 A;  1IOC A;  4XJF A;  4ZEE A;  149L A;  1GAZ A;  1JTM A;  1P7S A;  4W57 A;  1OUH A;  3W6F A;  1L40 A;  2A7F A;  2YBJ A;  2MEH A;  4I7N A;  3LN2 A;  1HFY A;  1LJI A;  1F10 A;  4W55 A;  221L A;  1NHB A;  1REZ A;  1J1O Y;  4A7D A;  1TDY A;  3HBE X;  2EKS C;  228L A;  4NFV A;  4PK0 A;  2F2Q A;  1L76 A;  4E3U A;  3HH4 A;  216L A;  1L67 A;  1LYI A;  3ATN A;  1BWH A;  1CV1 A;  4LFP A;  1QSA A;  3OE8 A;  1QT6 A;  2OEA X;  1YIL A;  4EOF A;  4H8Z A;  1LMT A;  2LYM A;  3CDQ A;  2MEB A;  3V2W A;  1DQJ C;  1B5W A;  1C08 C;  1YAQ A;  1DZB X;  1ZVH L;  1HEW A;  4GN3 A;  5LIO A;  2H5Z A;  4XJH A;  2HU1 A;  5B06 A;  1KNI A;  4DKL A;  2EQL A;  4DDA A;  1B5Z A;  4I7P A;  1AM7 A;  1WQO A;  1CJ8 A;  1L02 A;  3L64 A;  5APF A;  1H87 A;  1GB0 A;  3CDV A;  1AKI A;  1G7H C;  1IC7 Y;  2Z2E A;  1WQN A;  1P2R A;  239L A;  1CJ7 A;  1WQP A;  1GFU A;  259L A;  5HMJ A;  1UUZ C;  5L3I A;  1L94 A;  2OTY X;  4DAJ A;  1G0L A;  4WG1 A;  5DLA A;  1IWY A;  1C10 A;  2B73 A;  1GF3 A; 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