180LA

Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of t4 lysozyme
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYEIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
molecule tags Complex (hydrolase/cell wall)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 180lA00
1DYGA 1QUGA 4YXCA 1P46A 2B73A 3C8RA 3DMXA 3OE8A 4OO9A 4W51A 1T8FA 1L56A 4DAJA 1C65A 1QT4A 2NTGA 1D3MA 3GUOA 138LA 2QB0B 4ARQA 1L27A 1C6DA 1DYEA 2B75A 3C80A 3C81A 2RB0X 247LA 261LA 4PJZA 1L21A 1PQJA 4I7SA 3C82A 2Q9DA 1LWKA 2RBNA 1OVHA 2B6WA 6LZMA 1L86A 170LA 180LA 1L89A 171LA 227LA 4YX7C 165LA 234LA 1C6BA 3C7ZA 1L32A 3L64A 3F8VA 3CDQA 3HDEA 1C6QA 1PQKA 3OE0A 1L54A 1L07A 2RAYX 4EKRA 1L97A 3G3VA 2RBPA 4PK0A 2QARC 3C8QA 151LA 2HUMA 1CV1A 1C6GA 1L88A 1CVKA 238LA 3K2RA 3LZMA 209LA 2B72A 1C6JA 166LA 226LA 3DNAA 2RBQA 1OV7A 3DMZA 1D3NA 123LA 2HUKA 1P37A 102LA 2OE9X 4EKQA 7LZMA 205LA 1LI6A 4GBRB 1L82A 3V2WA 140LA 1C67A 246LA 4ARQB 1L23A 2ANXA 1L99A 4I7LA 1L19A 2RH1A 1L22A 3FADA 3HUAA 1L80A 1C6HA 3C7YA 4EPFA 1C6AA 2OU8A 163LA 220LA 1L42A 4AQNA 1L64A 1T97A 224LA 4DJHA 2OE4X 1L25A 2RBOA 1KY0A 1PQMA 2Q9EA 143LA 1CV4A 228LA 254LA 2ANVA 1G0GA 115LA 1KNIA 1L69A 1QTCA 192LA 1L30A 181LA 233LA 1LW9A 1G0JA 150LA 1KW7A 2B6TA 174LA 2F2QA 4W58A 4EKSA 3DKEX 1L14A 1P64A 1K28A 1T8AA 1C6LA 185LA 1L17A 142LA 210LA 191LA 1C6KA 1CV6A 4ARLA 1DYFA 2B74A 112LA 1G07A 1L85A 1CX7A 1LLHA 1PQIA 3FI5A 213LA 1SX7A 3FA0A 1OVJA 126LA 1L18A 1L46A 1L45A 129LA 3V2YA 2LZMA 3SB9A 1C64A 4IAPA 1CV0A 1L24A 148LE 3RZEA 1L92A 3C83A 1P5CA 236LA 1DYAA 1QSQA 1T8GA 111LA 3DN2A 3F9LA 3G3XA 139LA 172LA 1L90A 196LA 1QTBA 2L78A 1L68A 1L26A 189LA 4I7TA 1L67A 1L06A 162LA 4W57A 1L31A 1EPYA 1G0PA 1C68A 4I7PA 1G0KA 1P56A 177LA 3SB6A 1LI3A 1L83A 1CV3A 1L58A 237LA 3GUMA 1QTDA 2RB2X 1WTHA 3EMLA 2NTHA 2HULA 1L52A 4ZPUA 260LA 3HUKA 1L73A 216LA 3OE6A 218LA 4W54A 3HTBA 1C61A 1G0QA 1CU6A 1L05A 128LA 3GUPA 3DN6A 1CU2A 1QS5A 4I7QA 4ARMA 1CUPA 2RBRA 1G1VA 4I7JA 1L66A 2F32A 219LA 197LA 1G0MA 122LA 2OE7X 1D3JA 1G0LA 2OTZX 1L55A 1LYGA 1L84A 3UONA 244LA 1C6FA 3PDSA 1JTNA 2IGCA 3HH4A 1LYHA 1L01A 1SSWA 176LA 215LA 201LA 1OWZA 3C7WA 1C63A 3SB7A 1QTZA 1KY1A 1QTVA 4I7MA 4S0WA 1L03A 1L95A 161LA 1L76A 3HTFA 1I6SA 251LA 1OYUA 225LA 2RBSA 1LGWA 1JQUA 1L53A 1CUQA 3HWLA 199LA 1QT7A 158LA 104LA 3SB8A 167LA 130LA 2B6YA 2O7AA 3GUJA 156LA 252LA 1L0KA 1D3FA 4LZMA 4W53A 1L70A 1CV5A 146LA 262LA 1LGUA 4K5YA 222LA 3OE9A 1L11A 1QUOA 3CDRA 3C8SA 4ARMB 1QT8A 159LA 4YXAC 3SBAA 4I7KA 2LC9A 1L33A 1L09A 190LA 3RUNA 4E97A 1L44A 1L77A 3GUKA 2A4TA 5LZMA 141LA 1QUDA 1CTWA 3HTGA 1QUHA 3G3WA 1DYDA 3DN1A 1C6IA 178LA 1L13A 1C6NA 200LA 3HH3A 1KS3A 1C62A 1L43A 1L40A 1SWYA 1KW5A 1L41A 1D2YA 3PBLA 3JR6A 3HH5A 214LA 1NHBA 1P2RA 3DN3A 3VW7A 1SX2A 232LA 149LA 125LA 1L37A 1LYIA 3GUIA 1L10A 160LA 4DKLA 2F47A 1CU3A 3CDVA 1DYCA 1QTHA 3QAKA 3NYAA 212LA 231LA 1XJUA 1LYFA 3HU9A 1QT6A 1B6IA 3DN0A 249LA 182LA 1L12A 1L47A 248LA 4W52A 1JTMA 2O4WA 4I7RA 1LYEA 113LA 2B6ZA 145LA 1ZWNA 4EJ4A 4I7NA 240LA 2OU9A 4ARJA 1L51A 195LA 1L87A 256LA 1L57A 1G06A 2OEAX 257LA 184LA 109LA 3D4SA 1L49A 186LA 103LA 3DN8A 2RB1X 229LA 3NY9A 3DMVA 5I14A 1L0JA 3HTDA 1D2WA 1C66A 3HT8A 1OVKA 1PQOA 1L74A 1CX6A 1L39A 1C60A 1QT5A 1D9WA 187LA 1L60A 1C6TA 1LGXA 1L00A 3CDOA 1L08A 118LA 1L15A 147LA 4LDEA 230LA 1OWYA 131LA 137LA 1CU5A 1L04A 1LWGA 217LA 175LA 2O79A 1C6MA 2OTYX 2B6XA 120LA 110LA 250LA 169LA 2B70A 255LA 3HDFA 168LA 1C6CA 1DYBA 4I7OA 1C6PA 3L2XA 1P3NA 119LA 3HT7A 1L98A 3ODUA 114LA 3HU8A 1L72A 1L93A 4W56A 1L91A 4GRVA 1LYJA 3SN6R 239LA 1XEPA 3SBBC 4EXMA 4ARPA 155LA 1C6EA 1SSYA 3HT9A 4LDOA 1L94A 3HT6A 258LA 1L75A 1L79A 1C69A 2RAZX 1L65A 1TLAA 211LA 1P36A 3CDTA 1QS9A 2LCBA 173LA 1L28A 1T6HA 2B7XA 1ZURA 235LA 1G1WA 198LA 1PQDA 1L61A 253LA 3GULA 3HUQA 1L29A 2CUUA 1P6YA 1L48A 164LA 1ZYTA 221LA 4W55A 4EPIA 1L62A 1L35A 1L36A 1CU0A 1XJTA 223LA 1L81A 1QT3A 144LA 259LA 1OV5A 2OU0X 1P7SA 2Z6BA 1L59A 127LA 157LA 242LA 3SB5A 1QSBA 3NY8A 1L16A 243LA 188LA 1LPYA 4EKPA 206LA 1L96A 108LA 1L20A 4W59A 152LA 1L34A 1L02A 241LA 3GUNA 1LYDA 1P2LA 245LA 183LA 3HH6A 1L38A 107LA 3DN4A 1SWZA 1L71A 1L63A 4LDLA 1L50A 1LI2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IP5A 4DT3A 1AT6A 1JISA 3J6KA 1YKYX 1CKFA 5L3HA 4W51A 1WQPA 4DAJA 4L41A 3TMWA 1LZYA 2BLYA 1CJ7A 3C80A 2YVBA 4PJZA 2YDGA 4I7SA 4PHIA 1IIZA 2BPUA 1LWKA 1OVHA 5I4XA 4WM5A 180LA 4WMGA 171LA 3B72A 1JKCA 234LA 4MSTA 4DYGA 1B7RA 1L07A 2RAYX 2X0AA 4GCBA 5IELA 1QTKA 3C8QA 1REYA 4WL7A 238LA 3LZMA 1LZDA 4HV1A 2DBTA 153LA 166LA 226LA 5HMVA 1OV7A 1F0WA 4ZFPA 1REMA 3DMZA 4LT1A 123LA 4TSCA 5I54A 5LVHA 1XGTC 1WVVA 4U3XB 140LA 1LCNA 246LA 4IASA 1L99A 1IOCA 1F6RA 2RH1A 4I7LA 4J1AA 1GPQC 1C6AA 2OU8A 163LA 1F6SA 3B0KA 4YEOA 1T97A 1DXJA 224LA 3IJUA 5FEKA 1FLYA 4WOAA 1YIKA 228LA 254LA 4BADA 1GXV2 3AZ4A 4WLXA 1LKSA 4YOPA 4HJYA 192LA 4XJDA 3W6BA 5LYMA 2LYOA 1GB0A 1IP3A 1B7LA 1IWZA 174LA 2F2QA 1GAYA 1D6PA 2LHMA 1HEPA 3DKEX 5DL9A 3WVXA 4H8YA 1C6LA 185LA 1L17A 2EPEA 1ZVYB 4ARLA 5DLAA 1NDGC 3WU7A 2BQKA 4DD0A 1LLHA 1IOQA 1SX7A 3WW5A 1OVJA 4LT0A 2VB1A 4X3BA 4DDAA 3V2YA 4IAPA 1B7MA 4ETBA 1CV0A 3RZEA 3C83A 1DPXA 1GF6A 4OWEA 5APDA 3G3XA 1XGRC 3LN2A 172LA 1BGIA 1GHLA 1BWHA 3CT1A 3P64A 1L26A 2DQEY 4KXIA 1G0PA 2G4NA 1P56A 1L58A 237LA 1QTDA 3EMLA 2HULA 4UWVA 3SP3A 4N0JA 4WLDA 3HUKA 1LMOA 4H91A 1CU6A 3GUPA 3DN6A 1GBZA 1CUPA 1UA6Y 1G1VA 1REXA 1L66A 219LA 1OUIA 4NFVA 1EL1A 122LA 1LHKA 1L55A 1D6QA 1L84A 5C6LA 2BQNA 1LYZA 1L01A 1TEWA 3WH1A 1SSWA 1W08A 1NQIA 5FELA 4RW2A 4B4EA 1J1XY 1T3PA 1L03A 1IOSA 1LJEA 1LHMA 1JKBA 225LA 1LGWA 1REZA 1ZVHL 4WM1A 5A3ZA 1HERA 4A7DA 156LA 1LMAA 1FLQA 1UACY 3EXDA 9LYZA 1GFVA 1AM7A 1L11A 1DQJC 1XEIA 4Z46A 4N9RA 3CDRA 4HV2A 3B0IA 2BQOA 4ARMB 3WXUA 1RFPA 3SBAA 4YENA 1C08C 5JENB 3RUNA 3TMVA 3WPKA 1GE0A 4E97A 5I4YA 4LFPA 5LZMA 1CTWA 1BVXA 1LSAA 4II8A 135LA 200LA 3HH3A 1ALCA 2MEDA 1WTNA 1C62A 1UICA 1B5VA 2D4IA 1L40A 4AGAA 1SWYA 4Z3MA 1LHLA 2ZQ4A 1IWVA 1N4FA 1LYIA 1L10A 160LA 4DKLA 2F30A 2BQAA 194LA 1LZ8A 1LZCA 1QTHA 1B6IA 1L12A 3N9CA 2HEFA 4I7RA 2B6ZA 1LJ4A 4OWCA 4EJ4A 1QDTA 1RJCB 240LA 4IJ4A 195LA 4XADA 193LA 2YBIA 3A3RX 1BHZA 1L57A 1G06A 4ZEEA 257LA 5M1YA 109LA 5KXKA 4BAPA 1LSMA 1HMLA 5FCPA 2RB1X 229LA 3NY9A 4ETAA 1L0JA 3HT8A 1PQOA 1CX6A 4HJVA 2D6BA 1D9WA 1CKCA 1D0KA 1C6TA 1GB5A 1YANA 1A4VA 1L08A 4B4IA 3CT0A 1L15A 4TTDA 4XENA 4H9FA 137LA 1EQEA 2O79A 4TUNA 1LJGA 1IC5Y 169LA 1UIAA 1IP6A 2FBBA 3HDFA 4DDCA 2BQLA 2PC2A 1G7HC 2BQHA 4H9CA 239LA 4ETEA 1GF9A 3SBBC 4NGWA 1IWTA 3QNGA 1YAQA 3D9AC 1HENA 3FE0A 258LA 4N1EI 2H5ZA 2BQIA 1B5UA 1P36A 1GFTA 1QS9A 2B7XA 1GE4A 4DD2A 235LA 2W1YA 5LVJA 1WTMA 1G1WA 3D3DA 2I26L 253LA 1L29A 2CUUA 3AB6A 3WL2A 221LA 3A8ZA 1GFGA 1QSAA 1LYSA 1CU0A 1XJTA 223LA 1HC0A 5B59A 5B1GA 259LA 3AW6A 4DD1A 4H93A 1GB8A 4TSBA 2OU0X 4CHXA 3A94A 4XJIA 1LZ5A 4DD7A 1ZV5L 1LYYA 1JTPL 206LA 1CKHA 1P2LA 3F6ZA 3OJPA 1SWZA 1L71A 1L63A 1IWWA 4LDLA 1OUCA 1FKQA 1LSBA 4YXCA 4G49A 2B73A 4RLNA 1Z55A 3W6FA 3TXFA 2YBNA 1XEKA 1C65A 1QT4A 1HHLA 4HTQA 5LXWA 4ARQA 1C6DA 2N5ZA 2RB0X 247LA 1WVUA 1FKVA 2HEAA 1HEWA 2B6WA 4NG8A 6LZMA 170LA 2ZNXY 1L89A 3TXIA 3TXGA 1VEDA 1MELL 5LVIA 3B0OA 3F8VA 1GB7A 3CDQA 2D91A 4NSHA 4EKRA 1BVKC 1L97A 2QARC 1CV1A 2EIZC 1L88A 1CVKA 4NGVA 4XN6A 1IO5A 4GCDA 2B72A 1NMMA 5C6JA 2BQEA 2F4GA 4DQ5A 1KIQC 4WLTA 5LA8A 4NGLA 5B07A 1P37A 102LA 4UWUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2CUU A;  1P6Y A;  1L48 A;  164L A;  1ZYT A;  221L A;  4W55 A;  4EPI A;  1L62 A;  1L35 A;  1L36 A;  1CU0 A;  1XJT A;  223L A;  1L81 A;  1QT3 A;  144L A;  259L A;  1OV5 A;  2OU0 X;  1P7S A;  2Z6B A;  1L59 A;  127L A;  157L A;  242L A;  3SB5 A;  1QSB A;  3NY8 A;  1L16 A;  243L A;  188L A;  1LPY A;  4EKP A;  206L A;  1L96 A;  108L A;  1L20 A;  4W59 A;  152L A;  1L34 A;  1L02 A;  241L A;  3GUN A;  1LYD A;  1P2L A;  245L A;  183L A;  3HH6 A;  1L38 A;  107L A;  3DN4 A;  1SWZ A;  1L71 A;  1L63 A;  4LDL A;  1L50 A;  1LI2 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1IP5 A;  4DT3 A;  1AT6 A;  1JIS A;  3J6K A;  1YKY X;  1CKF A;  5L3H A;  4W51 A;  1WQP A;  4DAJ A;  4L41 A;  3TMW A;  1LZY A;  2BLY A;  1CJ7 A;  3C80 A;  2YVB A;  4PJZ A;  2YDG A;  4I7S A;  4PHI A;  1IIZ A;  2BPU A;  1LWK A;  1OVH A;  5I4X A;  4WM5 A;  180L A;  4WMG A;  171L A;  3B72 A;  1JKC A;  234L A;  4MST A;  4DYG A;  1B7R A;  1L07 A;  2RAY X;  2X0A A;  4GCB A;  5IEL A;  1QTK A;  3C8Q A;  1REY A;  4WL7 A;  238L A;  3LZM A;  1LZD A;  4HV1 A;  2DBT A;  153L A;  166L A;  226L A;  5HMV A;  1OV7 A;  1F0W A;  4ZFP A;  1REM A;  3DMZ A;  4LT1 A;  123L A;  4TSC A;  5I54 A;  5LVH A;  1XGT C;  1WVV A;  4U3X B;  140L A;  1LCN A;  246L A;  4IAS A;  1L99 A;  1IOC A;  1F6R A;  2RH1 A;  4I7L A;  4J1A A;  1GPQ C;  1C6A A;  2OU8 A;  163L A;  1F6S A;  3B0K A;  4YEO A;  1T97 A;  1DXJ A;  224L A;  3IJU A;  5FEK A;  1FLY A;  4WOA A;  1YIK A;  228L A;  254L A;  4BAD A;  1GXV 2;  3AZ4 A;  4WLX A;  1LKS A;  4YOP A;  4HJY A;  192L A;  4XJD A;  3W6B A;  5LYM A;  2LYO A;  1GB0 A;  1IP3 A;  1B7L A;  1IWZ A;  174L A;  2F2Q A;  1GAY A;  1D6P A;  2LHM A;  1HEP A;  3DKE X;  5DL9 A;  3WVX A;  4H8Y A;  1C6L A;  185L A;  1L17 A;  2EPE A;  1ZVY B;  4ARL A;  5DLA A;  1NDG C;  3WU7 A;  2BQK A;  4DD0 A;  1LLH A;  1IOQ A;  1SX7 A;  3WW5 A;  1OVJ A;  4LT0 A;  2VB1 A;  4X3B A;  4DDA A;  3V2Y A;  4IAP A;  1B7M A;  4ETB A;  1CV0 A;  3RZE A;  3C83 A;  1DPX A;  1GF6 A;  4OWE A;  5APD A;  3G3X A;  1XGR C;  3LN2 A;  172L A;  1BGI A;  1GHL A;  1BWH A;  3CT1 A;  3P64 A;  1L26 A;  2DQE Y;  4KXI A;  1G0P A;  2G4N A;  1P56 A;  1L58 A;  237L A;  1QTD A;  3EML A;  2HUL A;  4UWV A;  3SP3 A;  4N0J A;  4WLD A;  3HUK A;  1LMO A;  4H91 A;  1CU6 A;  3GUP A;  3DN6 A;  1GBZ A;  1CUP A;  1UA6 Y;  1G1V A;  1REX A;  1L66 A;  219L A;  1OUI A;  4NFV A;  1EL1 A;  122L A;  1LHK A;  1L55 A;  1D6Q A;  1L84 A;  5C6L A;  2BQN A;  1LYZ A;  1L01 A;  1TEW A;  3WH1 A;  1SSW A;  1W08 A;  1NQI A;  5FEL A;  4RW2 A;  4B4E A;  1J1X Y;  1T3P A;  1L03 A;  1IOS A;  1LJE A;  1LHM A;  1JKB A;  225L A;  1LGW A;  1REZ A;  1ZVH L;  4WM1 A;  5A3Z A;  1HER A;  4A7D A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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