1B6IA

T4 lysozyme mutant with cys 54 replaced by thr, cys 97 replaced by ala, thr 21 replaced by cys and lys 124 replaced by cys (c54t,c97a,t21c,k124c)
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDCEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQCRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solid-state synthesis and mechanical unfolding of polymers of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1b6iA00
102LA 1C6EA 1L26A 172LA 3RUNA 119LA 1P7SA 1L87A 1L91A 1L23A 3CDVA 1DYCA 187LA 1C62A 1G0LA 1C6BA 219LA 252LA 226LA 3DN0A 4LZMA 177LA 1G0QA 254LA 104LA 4ARJA 1LGUA 1L47A 1L41A 3VW7A 122LA 1L11A 3C8SA 1SSYA 4PK0A 227LA 1ZYTA 1LYGA 1L75A 146LA 2ANXA 3DN6A 1T97A 1L50A 141LA 4GBRB 215LA 1L34A 140LA 1C6PA 247LA 2O4WA 1L96A 3C8QA 1D2YA 7LZMA 4ARLA 4DKLA 1L19A 1C67A 4K5YA 4EKSA 5LZMA 205LA 196LA 4I7LA 184LA 1CUQA 3GUKA 4ARPA 218LA 3SB6A 107LA 1SSWA 1QTBA 1LLHA 197LA 4W55A 1LWKA 3DMXA 231LA 109LA 4PJZA 1DYAA 1EPYA 1L64A 2B70A 256LA 1LGWA 1L48A 1L61A 1L70A 3HH3A 222LA 2RBPA 1C6LA 3JR6A 1P64A 4LDLA 1D3NA 1L68A 4I7KA 1L92A 1L02A 171LA 4I7SA 1L90A 1L22A 1L67A 1CV5A 1L97A 2LC9A 2CUUA 4GRVA 1L88A 1QT5A 1QUOA 1C6FA 113LA 1I6SA 1QTHA 251LA 1L99A 3CDQA 1KW5A 1L63A 3DN8A 4EXMA 3V2YA 190LA 1L29A 210LA 2O79A 1P37A 125LA 1QUGA 3HU8A 1L0JA 4EPIA 206LA 239LA 2F32A 3FA0A 240LA 1G1WA 1QS9A 244LA 3LZMA 3UONA 259LA 1L30A 3HUKA 229LA 3SBAA 3GUNA 1L0KA 181LA 1SWZA 4I7OA 3DKEX 1QT6A 1L93A 1LPYA 3DMVA 137LA 4I7RA 1LW9A 149LA 3PBLA 1L44A 1QUDA 1L35A 1QTVA 1L76A 4W58A 3HUAA 2A4TA 1C64A 1QUHA 212LA 3HT9A 1L05A 3SB9A 1L49A 4EPFA 238LA 170LA 1G07A 3DN3A 3ODUA 1L89A 1L14A 199LA 217LA 2QB0B 1L10A 1L43A 1QT3A 3C7WA 111LA 1KNIA 182LA 233LA 4ARQB 2LCBA 1L55A 4I7QA 1CTWA 3HT8A 200LA 2LZMA 3FADA 253LA 1L80A 1L24A 151LA 2RB0X 2RBOA 2IGCA 1C6AA 232LA 1L15A 1L71A 2B6XA 1L98A 3HTFA 2B6ZA 3F9LA 3HT7A 1LI2A 1L20A 3HTDA 1B6IA 2B6WA 1DYFA 6LZMA 1G0PA 126LA 1SX7A 2F47A 3G3VA 1DYGA 1C6MA 4W52A 3OE9A 1SX2A 225LA 1CU2A 3NY8A 4EKQA 1T8FA 186LA 1PQKA 1C60A 3OE6A 1T8GA 1L37A 250LA 1LYEA 214LA 128LA 3C8RA 1L69A 209LA 3HDFA 3OE8A 1L62A 1CU0A 4OO9A 1P5CA 1L57A 1P6YA 1PQJA 159LA 1L73A 2HUKA 230LA 1XJTA 147LA 1L52A 2OTYX 1L16A 2RBNA 115LA 1C6KA 1LYDA 1L72A 192LA 1G0JA 144LA 2O7AA 1QSQA 4IAPA 220LA 2B7XA 2OU0X 4ARQA 1L74A 3G3XA 3HU9A 262LA 2OU8A 4EKRA 4W54A 3C81A 1L46A 163LA 1P2RA 1QTCA 2RB2X 3GUOA 2OU9A 1QT8A 3GUIA 3NYAA 4W53A 3V2WA 195LA 3NY9A 1L84A 2RB1X 1DYDA 4DAJA 1P46A 211LA 1C6GA 1C6TA 246LA 3D4SA 4YXAC 1C68A 1P36A 1PQOA 114LA 216LA 3C80A 3FI5A 3SB7A 1OV5A 243LA 1G0KA 2OEAX 3CDRA 1OV7A 4ZPUA 4EJ4A 1G1VA 1L08A 1CU3A 4W59A 258LA 138LA 223LA 131LA 1CX7A 1L12A 1L39A 237LA 260LA 1CV3A 152LA 183LA 2ANVA 3GUPA 4EKPA 1L07A 1L59A 1DYEA 2OTZX 3HH6A 3OE0A 130LA 236LA 191LA 1PQIA 4I7MA 1XJUA 1DYBA 1L33A 1LYHA 1L00A 3QAKA 1CVKA 1P3NA 1QTDA 3HWLA 1XEPA 2RBRA 3GULA 257LA 2B6TA 4I7PA 1KY1A 245LA 1LYJA 224LA 127LA 1OVHA 1LI6A 1L79A 2RBQA 3F8VA 3DNAA 1C69A 120LA 3SB8A 3SB5A 1T6HA 1JTMA 1QT4A 4I7NA 1G0GA 1L54A 175LA 1D3MA 3EMLA 1L27A 4LDOA 4W56A 129LA 1D9WA 3C82A 160LA 4I7JA 2OE4X 1CV1A 1D2WA 2NTGA 4ARMB 255LA 1G06A 3C83A 1L86A 103LA 3HH5A 248LA 2RH1A 1L01A 3DMZA 148LE 1L42A 2NTHA 1L06A 162LA 2HUMA 1L45A 4LDEA 1C63A 221LA 156LA 3DN2A 1C6HA 1CU6A 234LA 235LA 142LA 4E97A 2L78A 1L85A 164LA 1T8AA 1G0MA 3C7ZA 1C6JA 1CV6A 1L95A 3GUMA 2HULA 2B73A 2B72A 3K2RA 123LA 118LA 1QTZA 1ZWNA 4I7TA 198LA 1L51A 2Q9EA 1D3JA 3RZEA 143LA 3HDEA 1CUPA 188LA 1L94A 1QS5A 1L82A 1C6NA 1L60A 242LA 1KY0A 1L18A 1OYUA 1L66A 1LWGA 3PDSA 4AQNA 1CX6A 1CV4A 1L21A 2QARC 2RAYX 5I14A 1C6QA 1K28A 3HT6A 3HTGA 1KS3A 2B75A 2B6YA 1L56A 1L36A 108LA 1C6CA 3G3WA 4ARMA 3HH4A 173LA 174LA 1OWZA 2Q9DA 1LI3A 3HTBA 1JTNA 1L04A 2RAZX 1OVJA 189LA 241LA 1L09A 1C65A 1L65A 150LA 1TLAA 1L03A 1L13A 1P2LA 178LA 1KW7A 2Z6BA 249LA 180LA 157LA 1C6IA 1PQDA 1L81A 155LA 213LA 1PQMA 1L53A 2RBSA 1L17A 169LA 1D3FA 1CV0A 201LA 1OVKA 1L40A 4YXCA 1L77A 1CU5A 166LA 261LA 1SWYA 4S0WA 139LA 1L25A 1L83A 1LYIA 4W57A 176LA 1LGXA 1L58A 1L28A 158LA 1ZURA 3CDTA 228LA 168LA 4DJHA 1C61A 161LA 112LA 3HUQA 3L64A 1C66A 185LA 2OE9X 1NHBA 1L31A 165LA 1OWYA 1QSBA 1L32A 1C6DA 2OE7X 2F2QA 3CDOA 145LA 1JQUA 1LYFA 3L2XA 3DN1A 4YX7C 3DN4A 2B74A 3SBBC 167LA 3C7YA 3SN6R 4W51A 1WTHA 1QT7A 110LA 3GUJA 1L38A 1P56A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YSSC 5C6IA 1C6EA 172LA 4WM4A 2I26L 4PGJB 2HEBA 4NSJA 3W6EA 2LZTA 1L87A 1DKKA 219LA 1C6BA 3DN0A 226LA 4I8SA 4GCEA 1IWXA 2ZQ3A 1L47A 1B7SA 122LA 1L11A 1SSYA 3ULRA 227LA 1ZYTA 2Z39A 5LVJA 1UIFA 5KXMA 146LA 2ANXA 3DN6A 3EMSA 1HEOA 1L34A 2O4WA 1D2YA 4ZIXA 1OUDA 1LSDA 1IOQA 1G7MC 205LA 1KIQC 4LT1A 184LA 1MELL 1UICA 3AJNA 3OJPA 1AZFA 1LJHA 1LMCA 4QDNA 4B4JA 1KIPC 1WTNA 2DKVA 2B70A 2FYDA 3AGIA 1GBZA 4GLAA 1D6QA 3HH3A 4MSTA 1PS5A 3P65A 1L92A 1L02A 1T6VL 4G49A 1L90A 1L22A 1LZ8A 1BB6A 1CV5A 4N1EI 2LC9A 4RLNA 4WM1A 4FDYA 4XADA 4NHIA 1L88A 4GN3A 1JPOA 1FKVA 1L99A 4EXMA 3KAMA 1LZDA 1L29A 1P37A 2FBBA 125LA 3RNXA 1C43A 4LFPA 206LA 239LA 4G4HA 1LMOA 2MEFA 3LZMA 1TAYA 2LHMA 4ETEA 4KPMA 3HUKA 229LA 1IVMA 3GUNA 1GB6A 3M18B 2BPUA 4W96A 2H5ZA 1QT6A 1L93A 3DMVA 137LA 2BQNA 4I7RA 1QUDA 1QTVA 2A7DA 4W58A 4H94A 1B7MA 212LA 2BAAA 1L05A 1L49A 4PJ2C 1BVXA 3WW6A 2D4JA 3D3DA 4Z46A 5KXTA 5ILFA 1UUZC 5KXLA 5LAFA 1LTMA 3C7WA 1HC0A 111LA 1KNIA 4ARQB 2DQFC 1GBSA 2LZMA 5DLAA 2F4AA 3A6BY 2CDSA 1FDLY 232LA 1VFBC 3HT7A 1UACY 1LI2A 4RDSA 1DYFA 1F10A 4TUNA 126LA 1REMA 2LYOA 1SX2A 1GB5A 1WQNA 1CU2A 1I1ZA 4EKQA 1PQKA 1T8GA 250LA 1LYEA 2HU3A 1QUTA 1DZBX 1HSXA 1YL0X 1L57A 1LSYA 3TXBA 1GFEA 1VAUA 147LA 2RBNA 2A7FA 1C6KA 4HV2A 1F6SA 5KXOA 1GFAA 1LJNA 3TMXA 4QEQA 4H91A 3RT5X 1CKHA 1NHEA 1L74A 4LT0A 3RW8A 1GE0A 1IC4Y 1ZV5L 1FLWA 2G4QA 4NGKA 4ETAA 3NYAA 4XJGA 3FE0A 1P46A 1BQLY 1B7OA 3D4SA 4Z3MA 1XGUC 4M4OA 1LPIA 1P36A 3A8ZA 1REZA 2LYMA 114LA 1FLUA 216LA 4H8YA 1JKAA 3A92A 1OV5A 1G0KA 3CDRA 3EBAB 4UWNA 1B9OA 1AT5A 1G1VA 1JSFA 4ET9A 138LA 223LA 1YL1X 237LA 1CV3A 1L59A 1DYEA 2OTZX 3OE0A 1LZ6A 236LA 3AZ5A 1CJ7A 1XJUA 1DYBA 3ZVQA 4NHQA 1QTDA 1OUCA 3GULA 2B6TA 1KY1A 4DD7A 1OVHA 4TX7A 3DNAA 3ATNA 3P68A 2BQAA 3SB5A 1JTMA 3A90A 1HENA 3E3DA 193LA 1G0GA 1GFUA 1L54A 3C82A 1XGQC 1HFXA 1D2WA 4ARMB 1G06A 1L86A 3HH5A 1IP6A 4YOPA 148LE 1ZVHL 4LDEA 3LYTA 2F30A 156LA 1JJ1A 234LA 142LA 4N0JA 4E97A 1GFGA 2L78A 3WU8A 1SLYA 164LA 4E3UA 1C6JA 1LHKA 4DDCA 3T36A 2HULA 2MEGA 4J1BA 118LA 3W6CA 198LA 1QIOA 1ZVYB 3RZEA 2Q9EA 1CUPA 5LA5A 1YQVY 1IIZA 1KXYA 1LHMA 1KY0A 1L18A 1F0WA 1CV4A 2QARC 5ILCA 4H8ZA 4TSBA 2XBRA 2B75A 1LYZA 1UC0A 2DQDY 3AGGG 1HEPA 3G3WA 4ML7A 3T6UA 1FBIX 1IWWA 3AZ6A 135LA 5KY1A 4NGVA 4GCDA 2IHLA 1LI3A 3HTBA 4HJYA 1JTNA 1J1XY 1L04A 4TWSA 5F16A 5FEKA 189LA 5KJ9A 4LFXA 1L65A 150LA 1TLAA 1L13A 1XGRC 1YAMA 1P2LA 5LYTA 1IP1A 1LMQA 1NF5A 1C6IA 3WPKA 1L53A 2FBDA 4OWHA 169LA 1LZ1A 1DPWA 1UIBA 2D6BA 1KXXA 4LYMA 1L40A 1GHLA 1L77A 1CU5A 5I54A 5FDJA 4S0WA 1LZNA 139LA 4XENA 1LYIA 4W57A 2DBTA 176LA 4LT2A 1L58A 5KXPA 1L28A 5IELA 1PZYA 112LA 1JEFA 1VDPA 1EL1A 2F2QA 5B07A 3TXKA 145LA 2BQDA 1LYSA 1QSWA 3SBBC 4WOAA 4W51A 110LA 1GFTA 1HMLA 1HNLA 4DD9A 1GD6A 3LN2A 3A96A 1G7LC 1P7SA 2HEDA 4ET8A 4WM3A 3WU7A 1G0LA 177LA 3WULA 1IWTA 104LA 4GCBA 1L41A 2G4PA 5KXNA 3VW7A 1N4FA 4U3XB 4PPOA 1LSGA 1NBZC 1T97A 3AB6A 4LYOA 4GBRB 1LSZA 1C6PA 247LA 5LIOA 7LZMA 4LYBA 1B7LA 4M6DA 2ZNXY 2ZNWY 1CUQA 1J1OY 1SSWA 2F4GA 197LA 4W55A 1JITA 1C46A 2BQKA 3AW6A 1YKYX 5KXYA 3F6ZA 256LA 1LGWA 3WUAA 1B7RA 222LA 2RBPA 1LJ4A 1C6LA 1D3NA 1QDTA 1NWGA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2YSS C;  5C6I A;  1C6E A;  172L A;  4WM4 A;  2I26 L;  4PGJ B;  2HEB A;  4NSJ A;  3W6E A;  2LZT A;  1L87 A;  1DKK A;  219L A;  1C6B A;  3DN0 A;  226L A;  4I8S A;  4GCE A;  1IWX A;  2ZQ3 A;  1L47 A;  1B7S A;  122L A;  1L11 A;  1SSY A;  3ULR A;  227L A;  1ZYT A;  2Z39 A;  5LVJ A;  1UIF A;  5KXM A;  146L A;  2ANX A;  3DN6 A;  3EMS A;  1HEO A;  1L34 A;  2O4W A;  1D2Y A;  4ZIX A;  1OUD A;  1LSD A;  1IOQ A;  1G7M C;  205L A;  1KIQ C;  4LT1 A;  184L A;  1MEL L;  1UIC A;  3AJN A;  3OJP A;  1AZF A;  1LJH A;  1LMC A;  4QDN A;  4B4J A;  1KIP C;  1WTN A;  2DKV A;  2B70 A;  2FYD A;  3AGI A;  1GBZ A;  4GLA A;  1D6Q A;  3HH3 A;  4MST A;  1PS5 A;  3P65 A;  1L92 A;  1L02 A;  1T6V L;  4G49 A;  1L90 A;  1L22 A;  1LZ8 A;  1BB6 A;  1CV5 A;  4N1E I;  2LC9 A;  4RLN A;  4WM1 A;  4FDY A;  4XAD A;  4NHI A;  1L88 A;  4GN3 A;  1JPO A;  1FKV A;  1L99 A;  4EXM A;  3KAM A;  1LZD A;  1L29 A;  1P37 A;  2FBB A;  125L A;  3RNX A;  1C43 A;  4LFP A;  206L A;  239L A;  4G4H A;  1LMO A;  2MEF A;  3LZM A;  1TAY A;  2LHM A;  4ETE A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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