1B7PA

Verification of spmp using mutant human lysozymes
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Experimental verification of the 'stability profile of mutant protein' (SPMP) data using mutant human lysozymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
total genus 51
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1998-05-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1b7pA00
1H87A 1DI3A 1GDXA 193LA 1DKKA 1LJEA 4NWEA 1TBYA 2BQHA 5KXSA 1WQRA 1B7LA 2MEEA 3B6LA 1BB3A 1JITA 1DKJA 3P64A 2BQKA 4UWVA 1V7TA 5IHGA 5J7CA 1OQMA 1XGRC 4WO6A 1TDYA 4BAFA 1IP5A 4GN5C 3FI7A 1B7QA 5KXOA 1WVUA 2Z39A 3B0KA 4LT1A 3W6BA 5E9RA 4C3WA 4BS7A 1LSAA 4WL6A 5LAGA 5ILFA 4WG7A 2WARA 2H9JA 1LSGA 2EPEA 4DD2A 2BQFA 1GFEA 208LA 2Z38A 3W6DA 3WH1A 1LSCA 5B1GA 4N8ZA 4B4JA 4QDNA 1E8LA 1B5YA 1MLCE 4II8A 1GB3A 3P65A 1TEWA 4N5RA 2MEFA 4OOOA 4PJ2C 4DC4A 1GFUA 1A2YC 2XBRA 4H8YA 1LAAA 1DQJC 4IATA 3WXUA 4BAPA 3BKVA 5LYMA 1F6SA 1BB6A 4LFXA 4GCCA 1GF5A 3EO5A 1IWXA 3A92A 3T36A 3N9AA 1LMOA 4H93A 1GFGA 3TXEA 3B0OA 2LYOA 1LJIA 1LTMA 4ZEEA 1W6ZA 4ETAA 1KIPC 1VATA 3HBEX 5FCPA 5KKJA 4G9SA 4LYMA 1HEOA 3A3QA 1JIYA 1NWGA 1OUHA 2XJWA 1REXA 4H1PA 4MR1A 1GBYA 2HEFA 3AGHA 3B72A 1FLQA 2HU1A 2Z18A 4N1EI 5KXPA 1XSFA 4W96A 5KXRA 5HNLA 2GV0A 2LHMA 1FLWA 3AGGG 4NG1A 1LOZA 1AT5A 2CJLA 1GEZA 4WM5A 1QTEA 2MEGA 3WU7A 1HSWA 4H8XA 1KIRC 5II3A 1UC0A 4YF2A 3CT1A 1OUAA 3TMVA 1NDGC 4UWUA 1B7PA 1T6VL 3CSZA 4WLXA 4GN4A 4OWAA 1UIGA 1NBZC 135LA 1IOTA 1IR9A 1F10A 2DBTA 1JJ3A 1BB7A 1B7OA 1MELL 2YBHA 3A34A 4LZTA 4XJDA 4YEOA 5B05A 4E3UA 4AXTA 1DPWA 1OUEA 1AT6A 1GF6A 2XBSA 1GAZA 1HERA 1SQ2L 2Y8PA 2LYZA 3P68A 2F2NA 4NHQA 4WL7A 1OUJA 5T3FA 1YANA 4ETDA 5KXTA 2F4AA 1LYYA 1B7NA 4B1AA 4ETEA 1HSXA 4WO9A 1JJ0A 3A95A 4GLAA 4NGIA 1GWDA 1JSFA 5LVKA 1PS5A 3LYMA 4IJ4A 4ET9A 5I4WA 4GCBA 1BWJA 3AYQA 4MCKA 4P2EA 3W6AA 3AW7A 1IY4A 4RLMA 1NDMC 1QTKA 1LSNA 1LZCA 1GE3A 1LJ3A 1QQYA 1GXV2 4HPEA 1GFKA 4NHSA 1G7HC 1FN5A 2HUBA 1EQEA 4B0DA 3RZ4A 1WQNA 1DI5A 3A6CY 1LZTA 1FKQA 1IP3A 1RFPA 3FE0A 3RNXA 1IWWA 2BQJA 1BWIA 5LA5A 5M1YA 4PRUA 4PGJB 5L9JA 5B59A 1QSAA 1YL1X 4G4BA 1UCOA 2ZYCA 3A90A 2HTXA 1JUGA 4H9AA 4XJFA 5L3HA 3ZVQA 3W6FA 4EMNA 1IC5Y 1JTOL 4I8SA 1B5ZA 1V7SA 4PRQA 1GB0A 1N4FA 5L3IA 1VEDA 1LSFA 3HBHA 3TXHA 1IP6A 4B49A 4DD7A 1CKDA 154LA 4LYBA 1REMA 4HJZA 1B5WA 3F6ZA 1B5XA 4B4EA 5C6JA 3AGIA 3SP3A 1ZVYB 1D9UA 1IY3A 1YKYX 5I53A 1BB4A 4NGZA 5A3EA 3G3AB 2Z12A 1LMCA 2HU3A 1BGIA 4RLNA 1LYZA 1IOSA 2DKVA 3LYZA 4WM1A 1C10A 1XGPC 1IWYA 2EQLA 3J4GA 5B06A 5F9XA 1NF5A 3WUAA 2NWDX 4I0CA 5K7OA 5LVIA 1GE2A 1IORA 1OP9B 4NGKA 1LMNA 4NGYA 5AMYA 4WM3A 5ILCA 1QDTA 1I56A 3WU9A 5IDDA 2DQAA 1FDLY 1HHLA 4IASA 1LHLA 4H9EA 1GE0A 2HEAA 5LAFA 1IR8A 1LYSA 1YKXX 1YQVY 1JEFA 1BB5A 1QDRA 5LINA 1OUCA 1J1PY 1IC4Y 1UIBA 1O23A 1LZ8A 1F0WA 3GXRA 1CNSA 1JTPL 1CKGA 1HEQA 3AZ5A 2DQDY 3P4ZA 4BADA 4Z3MA 2BQNA 2BQDA 1VFBC 3WUNA 1Z55A 1EL1A 5DLAA 4NHPA 4TSCA 1GF8A 4UWNA 5KY1A 3WYHA 3AZ7A 1LZ4A 2BQOA 4KPMA 1D6PA 2Z37A 4CGEA 4HJYA 2PC2A 4PPOA 1G7IC 1GF9A 4DDAA 1GF0A 1IWVA 1LSDA 1AZFA 1QUSA 4RDSA 2YSSC 1ZMYL 4U3XB 2YDGA 1YIKA 1LSZA 3A94A 5APFA 2LYMA 2A7FA 2W1MA 4NGWA 5HQ1A 3QE8A 1LZ5A 4RW1A 4NWHA 1JKBA 5KJ9A 4DT3A 1HFYA 1QIOA 5KXYA 3TXFA 2CWIA 5B07A 2Z19A 5FELA 4OWEA 1NQIA 1C7PA 9LYZA 3TXIA 3CB7A 1HEPA 3RT5X 4CFOA 1LZGA 1EQ5A 4MSTA 4CHXA 4XADA 4H90A 5KXWA 5D5FA 1BQLY 5I4XA 1HNLA 4QGZA 132LA 4H91A 4C5FA 3WL2A 1JKAA 5KXZA 4FJRA 1CKCA 4O34A 3TXJA 4G4HA 1C46A 1IP4A 4Z41A 3LHMA 4ZFPA 2Z2FA 4H94A 3K3TA 2D91A 5KXNA 1WQPA 5EBHA 1B7RA 4H9FA 3BKHA 3G3BB 4G49A 1J1XY 4HJVA 4XENA 5JENB 2YVBA 5KKIA 3IJUA 3IWRA 4GCFA 1GXXA 5DM9A 2HEDA 5IELA 1GF3A 1NBYC 1LHMA 4G4CA 1GFHA 1RJCB 1HFXA 2A7DA 3N9CA 1DZBX 1UUZC 3WUMA 5KXLA 4DD3A 1WQOA 2ZILA 4HP0A 2BQLA 3A96A 3EBAB 3TXBA 1IVMA 4KT3A 2DQEY 2EKSC 2IFFY 3OK0A 1GFJA 5F81A 1CJ8A 3AJNA 1TAYA 3KAMA 4TSBA 2D4KA 2ZIJA 133LA 1GBZA 2HEBA 1GBOA 1KXXA 4PHIA 4H9CA 1GFRA 2MEBA 3A93A 194LA 4OWHA 2YBNA 1ALCA 1W08A 1B7MA 1G7LC 3LN2A 2X0AA 1WVVA 3E3DA 3IJVA 4TTDA 2BAAA 1LJJA 5F16A 4DWXA 1YILA 3CSQA 3WW5A 1HF4A 5I4YA 3TXKA 1YROA 5LIOA 4WLYA 2DQCY 4WG1A 4DDCA 4DYGA 3TMWA 1WTNA 1XFPL 2MEDA 4Z46A 1WQMA 1LMPA 1LKSA 1BVKC 4NGLA 3TXGA 1UIFA 1LKRA 1UICA 5LYTA 1IOQA 3A6BY 2FYDA 1BVXA 4J1AA 2HEEA 3OJPA 4J1BA 1B2KA 3AW6A 2CDSA 3N9EA 1OUFA 3LYOA 4GCDA 5LYZA 2DQFC 4NGVA 2G4QA 1HMLA 5C6IA 1NHEA 2YBJA 2I26L 1FLUA 5FHWA 3WPLA 1XEKA 1GBWA 3ULRA 4R0FA 1GB2A 1NMMA 1HEWA 4N9RA 1XEJA 2XTHA 3M18B 4LYOA 4ZIXA 3AZ6A 3D9AC 3ATOA 1JKDA 3CT5A 4HTNA 4QEQA 4NG8A 153LA 1DPXA 3ATNA 2Q0MX 1IWZA 2MEAA 5F14A 1BWHA 1GDWA 1LZRA 4ETBA 5LVJA 2I6ZA 4XJBA 3WVYA 1GB7A 2YBIA 2BQEA 2ZNXY 4NSGA 1LSEA 2D4JA 3W6CA 4NEBA 3P66A 1D0LA 4LT3A 2AUBA 5DN5A 3A8ZA 4TX7A 1VDQA 1HFZA 1LZ1A 2BQIA 2ZNWY 3B0IA 1HEMA 4FDYA 4LFPA 4WM2A 1GFVA 1B0DA 1GAYA 2VB1A 3AZ4A 3D3DA 5I5QA 4QY9A 7LYZA 5HNCA 1CKHA 4KXIA 1B9OA 2MECA 1LSPA 4LYTA 4WM4A 2BQAA 3GXKA 1H6MA 2F30A 3A67Y 3M3UA 4H9IA 4LYZA 5APCA 1CJ6A 1T3PA 4TWSA 1GHLA 2C8OA 4B4IA 2MEIA 1EQ4A 3VWOA 1IWTA 1LHKA 4HV1A 2FYCA 4NIJA 2BLYA 4HSFA 4XN6A 3LZTA 1KIQC 1UIEA 3RW8A 1G7JC 1GFTA 4J7VA 1LZDA 4NHIA 2B5ZA 5APDA 5A3ZA 4WMGA 4M4OA 1JTTL 4KL7A 4XYYA 1OUGA 1FKVA 4ET8A 4XJIA 1YAOA 4LGKA 2BLXA 1JSEA 1XGTC 3T6UA 2C8PA 2FBBA 4CJ2A 1RCMA 5KXXA 3WPJA 2Z2EA 3EMSA 1REZA 4L41A 5DN4A 3RU5A 5LVGA 1LJGA 2MEHA 2F4GA 1JKCA 1YAMA 4DD1A 4OWBA 1QUTA 2DQIY 1GFAA 1KXYA 4LT0A 1JHLA 4NY5A 1IWUA 2BQGA 1OUBA 4WOAA 4LYCA 1YAQA 4OWCA 1IC7Y 1NKHA 2W1YA 4NSIA 4CFPA 4HPIA 4YOPA 1IP7A 1HENA 4OOTA 5D5CA 5B1FA 1GEVA 1GBSA 1GPQC 1LMAA 1LYOA 2LZ2A 1REYA 3WPKA 3W3EA 5E4PA 1HELA 2ZQ3A 1CKFA 1IEEA 1VAUA 1YAPA 4NSHA 4N0JA 1GE1A 5DL9A 5KXMA 3CQLA 5C6LA 4ANRA 2IHLA 4XJHA 5FSTA 1GB9A 3TXDA 4GLVA 1GF7A 3CT0A 4YM8A 3MGWA 6LYZA 1GD6A 1D6QA 2DQJY 1OUDA 2D6BA 3EXDA 1B5VA 4H9BA 4X3BA 4WLDA 4WLTA 1LMTA 1LSBA 2DQGY 2ZIKA 5I54A 1LZBA 4Z98A 4ETCA 1G7MC 4RW2A 5APEA 1LJNA 1LZNA 134LA 5FDJA 1CJ7A 4NFVA 1IR7A 1J1OY 1LZEA 4H92A 1VDSA 2N5ZA 4YEMA 1SLYA 1KXWA 5F9UA 2BQCA 1B7SA 4M6DA 1LHHA 4H9HA 1IP1A 1P2CC 1LZYA 3ZVQB 207LA 1LZAA 1LJFA 1VDTA 3J6KA 4WM6A 3WXTA 1LHJA 1YL0X 2BPUA 2EIZC 1HMKA 1LZ9A 3TMUA 1WQQA 1FBIX 1IOCA 3CSRA 4GCEA 1IO5A 3QY4A 2LZTA 1GF4A 1UIDA 2BQBA 3LYTA 5HMVA 1GB6A 5LA8A 1BHZA 1JISA 3TMXA 3WULA 1VDPA 2G4NA 3LZ2A 2ZQ4A 4XJGA 2YBMA 1RE2A 4N1CC 1AM7A 1LCNA 4A7DA 3HFMY 2D4IA 1LZ6A 1HC0A 1ZV5L 2ZWBA 4AGAA 5HLLA 4R6CA 1LJKA 1D0MA 1C45A 1FLYA 1PZYA 1IIZA 1IP2A 1UACY 1TCYA 2I25L 1XEIA 2ZYPA 2DQHY 1IX0A 1GB8A 4GN3A 1C43A 4EOFA 2G4PA 2YBLA 1GBXA 1UIHA 2FBDA 2W1XA 4HV2A 1LZSA 5HMJA 1D0KA 1I1ZA 3A91A 8LYZA 2BQMA 4J0LA 1ZVHL 1LJHA 4ML7A 4DDBA 1LMQA 1JWRA 4HTKA 3ZEKA 5FEKA 3WMKA 1QSWA 1I20A 1LJ4A 4D9ZA 4DD0A 1CJ9A 2RSCA 1C08C 1UA6Y 4NGJA 3WVXA 1XGQC 1UBZA 1LSMA 1INUA 3HBDA 3QNGA 1UIAA 4YENA 2W1LA 4W94A 2HECA 1OUIA 3A3RX 3WW6A 5LVHA 1GB5A 4HTQA 2CGIA 1YKZX 3W6EA 1DI4A 1GE4A 1LSYA 1F6RA 4H8ZA 1RI8B 1LHIA 1JJ1A 6LYTA 4NSJA 4NGOA 4NHTA 4TUNA 2H9KA 4DD9A 1AKIA 5KXKA 1LPIA 1A4VA 4OW1A 5LXWA 3AB6A 3WU8A 4LT2A 1JPOA 1XGUC 2H5ZA 1WTMA 1DXJA 1B5UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
231LA 1DI3A 4NWEA 1WQRA 1JITA 2B73A 2Z6BA 1OQMA 1IP5A 1WVUA 2Z39A 3B0KA 4C3WA 208LA 4B4JA 196LA 4N8ZA 1B5YA 1OVJA 1CX6A 2LC9A 4OOOA 4N5RA 2XBRA 1DQJC 3BKVA 1L35A 3N9AA 3HT7A 197LA 3TXEA 5KKJA 1L14A 3A3QA 2HEFA 1L77A 3G3VA 1FLQA 3HH6A 150LA 5KXPA 3LZMA 5KXRA 5HNLA 2Q9DA 4W53A 224LA 1AT5A 1LW9A 1QTEA 3WU7A 1KIRC 167LA 1LYJA 2RH1A 1OUAA 253LA 1NDGC 3CSZA 4GN4A 1L01A 1OV7A 135LA 1IR9A 4TWSA 1B7OA 1MELL 1OUEA 1GAZA 257LA 1SQ2L 1P6YA 2LYZA 1OUJA 1L92A 1G0PA 143LA 4ETEA 1JSFA 1QT5A 3NY8A 3SB9A 3LYMA 4IJ4A 1P37A 1L03A 4ET9A 1NDMC 1QTKA 185LA 3HUAA 1GE3A 2ANVA 4EKRA 1G7HC 1EQEA 1LZTA 3FE0A 3RNXA 1IWWA 259LA 4PGJB 5L9JA 1ZYTA 131LA 1C6DA 1JQUA 1JUGA 4EMNA 1DYFA 4PRQA 3OE6A 3DN0A 1L98A 1B5WA 3F6ZA 1D9UA 5I53A 1BB4A 1L36A 1OYUA 2HU3A 1BGIA 4RLNA 3V2YA 1IOSA 2DKVA 1C6GA 1NF5A 1IORA 1OP9B 1LMNA 127LA 5AMYA 4WM3A 3WU9A 1I56A 183LA 1L56A 1KW5A 1FDLY 1L90A 1L69A 1CV0A 147LA 1LYSA 1YKXX 5LINA 2NTHA 3HU9A 1O23A 4YX7C 1F0WA 3HTDA 1L87A 151LA 1L26A 3L64A 1VFBC 1Z55A 3SB8A 2O79A 5DLAA 1QS5A 1GF8A 3AZ7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1H87 A;  1DI3 A;  1GDX A;  193L A;  1DKK A;  1LJE A;  4NWE A;  1TBY A;  2BQH A;  5KXS A;  1WQR A;  1B7L A;  2MEE A;  3B6L A;  1BB3 A;  1JIT A;  1DKJ A;  3P64 A;  2BQK A;  4UWV A;  1V7T A;  5IHG A;  5J7C A;  1OQM A;  1XGR C;  4WO6 A;  1TDY A;  4BAF A;  1IP5 A;  4GN5 C;  3FI7 A;  1B7Q A;  5KXO A;  1WVU A;  2Z39 A;  3B0K A;  4LT1 A;  3W6B A;  5E9R A;  4C3W A;  4BS7 A;  1LSA A;  4WL6 A;  5LAG A;  5ILF A;  4WG7 A;  2WAR A;  2H9J A;  1LSG A;  2EPE A;  4DD2 A;  2BQF A;  1GFE A;  208L A;  2Z38 A;  3W6D A;  3WH1 A;  1LSC A;  5B1G A;  4N8Z A;  4B4J A;  4QDN A;  1E8L A;  1B5Y A;  1MLC E;  4II8 A;  1GB3 A;  3P65 A;  1TEW A;  4N5R A;  2MEF A;  4OOO A;  4PJ2 C;  4DC4 A;  1GFU A;  1A2Y C;  2XBR A;  4H8Y A;  1LAA A;  1DQJ C;  4IAT A;  3WXU A;  4BAP A;  3BKV A;  5LYM A;  1F6S A;  1BB6 A;  4LFX A;  4GCC A;  1GF5 A;  3EO5 A;  1IWX A;  3A92 A;  3T36 A;  3N9A A;  1LMO A;  4H93 A;  1GFG A;  3TXE A;  3B0O A;  2LYO A;  1LJI A;  1LTM A;  4ZEE A;  1W6Z A;  4ETA A;  1KIP C;  1VAT A;  3HBE X;  5FCP A;  5KKJ A;  4G9S A; 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 2BPU A;  2EIZ C;  1HMK A;  1LZ9 A;  3TMU A;  1WQQ A;  1FBI X;  1IOC A;  3CSR A;  4GCE A;  1IO5 A;  3QY4 A;  2LZT A;  1GF4 A;  1UID A;  2BQB A;  3LYT A;  5HMV A;  1GB6 A;  5LA8 A;  1BHZ A;  1JIS A;  3TMX A;  3WUL A;  1VDP A;  2G4N A;  3LZ2 A;  2ZQ4 A;  4XJG A;  2YBM A;  1RE2 A;  4N1C C;  1AM7 A;  1LCN A;  4A7D A;  3HFM Y;  2D4I A;  1LZ6 A;  1HC0 A;  1ZV5 L;  2ZWB A;  4AGA A;  5HLL A;  4R6C A;  1LJK A;  1D0M A;  1C45 A;  1FLY A;  1PZY A;  1IIZ A;  1IP2 A;  1UAC Y;  1TCY A;  2I25 L;  1XEI A;  2ZYP A;  2DQH Y;  1IX0 A;  1GB8 A;  4GN3 A;  1C43 A;  4EOF A;  2G4P A;  2YBL A;  1GBX A;  1UIH A;  2FBD A;  2W1X A;  4HV2 A;  1LZS A;  5HMJ A;  1D0K A;  1I1Z A;  3A91 A;  8LYZ A;  2BQM A;  4J0L A;  1ZVH L;  1LJH A;  4ML7 A;  4DDB A;  1LMQ A;  1JWR A;  4HTK A;  3ZEK A;  5FEK A;  3WMK A;  1QSW A;  1I20 A;  1LJ4 A;  4D9Z A;  4DD0 A;  1CJ9 A;  2RSC A;  1C08 C;  1UA6 Y;  4NGJ A;  3WVX A;  1XGQ C;  1UBZ A;  1LSM A;  1INU A;  3HBD A;  3QNG A;  1UIA A;  4YEN A;  2W1L A;  4W94 A;  2HEC A;  1OUI A;  3A3R X;  3WW6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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