1B7PA

Verification of spmp using mutant human lysozymes
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Experimental verification of the 'stability profile of mutant protein' (SPMP) data using mutant human lysozymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 51
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1998-05-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1b7pA00
2IFFY 1PZYA 2AUBA 1ZMYL 2B5ZA 4UWUA 4PJ2C 4Z98A 1VDQA 5LA8A 1JUGA 5A3EA 4WMGA 4GCFA 2CWIA 4NGIA 1HELA 1LZTA 4NIJA 1WQPA 3WULA 3J4GA 1YKZX 5HNCA 1AZFA 3T36A 5JENB 9LYZA 1GF7A 1GB5A 5IHGA 1IP2A 4R0FA 4LYBA 1DQJC 1LAAA 1IWYA 1AT6A 4RW2A 2G4NA 4H8YA 2MEDA 6LYZA 4B1AA 4KXIA 1IC5Y 4DD0A 2XJWA 2G4PA 4L41A 4ETBA 1UIGA 4G4BA 5IELA 1JITA 4ML7A 5E4PA 5T3FA 3M18B 4CFOA 2Z12A 4NGJA 1DPXA 4B4IA 4DD7A 2FYCA 1LJHA 1FLWA 1BB7A 2H9JA 4LYZA 1LYOA 4NHTA 3W6FA 1YROA 1NBZC 3WUMA 4LFPA 3F6ZA 1YKYX 5D5CA 2DQCY 2BQIA 4XJBA 5FSTA 4FDYA 1IR8A 1GB6A 3A91A 1NDMC 1V7TA 1YL1X 2D4JA 4FJRA 4G9SA 4D9ZA 4DDBA 4YF2A 1IWVA 1CKFA 1YIKA 1QDTA 1XGQC 1TBYA 1LKRA 4TSBA 3B0OA 1IP3A 3GXRA 4OWEA 1KIRC 3CB7A 1OUGA 1B7SA 1LZ6A 1FKQA 2A7FA 1GFRA 4H9HA 4IATA 4NGKA 4PHIA 1BWHA 4B49A 1HERA 4H9BA 4HJYA 1XFPL 2Z18A 4HTQA 2F30A 1P2CC 1GE3A 2YBLA 1LJIA 1LYZA 4YEOA 2EKSC 2DQAA 2PC2A 1GFKA 1C46A 1UACY 3TXEA 1GF6A 1QTEA 1QUTA 3RZ4A 4OW1A 5A3ZA 4M4OA 1JEFA 1JJ1A 1NHEA 1D0MA 1FKVA 1D9UA 1B7NA 4RLNA 1YQVY 1LSNA 3TMUA 1JKDA 5KXTA 2DBTA 1GF4A 1NDGC 5B59A 4H9AA 1IY3A 2W1XA 4LYMA 5K7OA 1D0LA 1LZ8A 1DPWA 4NWHA 3M3UA 3FE0A 3WYHA 4BS7A 2HEAA 3A93A 1LSCA 1F10A 1QDRA 1DXJA 2LZ2A 3TXGA 5FCPA 1LSAA 3W6CA 1GDXA 2ZNWY 1RJCB 1LSGA 3A94A 4X3BA 3CQLA 1B5WA 4H90A 1HNLA 5B06A 3A90A 1GFGA 4RLMA 1LHHA 2MEIA 1JISA 2BQEA 3G3AB 1G7IC 5L9JA 1HENA 2YDGA 4N5RA 5F16A 3A6BY 3P65A 4UWNA 4WOAA 2G4QA 3AZ7A 1GEZA 5II3A 3MGWA 4LZTA 4OWHA 5HQ1A 4QY9A 2MEGA 2BLXA 4HPIA 1B5UA 1CJ8A 1LPIA 1LKSA 1I1ZA 1YAPA 3TXJA 1GE4A 3AZ6A 3WU8A 5HMJA 3RW8A 4RW1A 1RE2A 4ANRA 3GXKA 5F9XA 1G7JC 2A7DA 3CSZA 2YBNA 3CT5A 5KXPA 1CJ7A 3B0IA 2BQFA 4WM3A 3TMWA 3WH1A 1LSBA 3EBAB 1LHIA 4ZFPA 5KKIA 1GB9A 5KXZA 4ETEA 1IP5A 1BGIA 1Z55A 4G49A 3VWOA 3AW7A 4WL6A 1MELL 2YBJA 4EOFA 132LA 1NF5A 1B7LA 3P68A 4KL7A 4GN5C 135LA 1GB0A 1RFPA 3AGGG 4GLVA 4MSTA 194LA 1LJ3A 1LYYA 4PRQA 4XJDA 1WVUA 2MECA 4H9EA 1LZ5A 4NHIA 2Z37A 1BHZA 2DQEY 193LA 2BQCA 4N1EI 2FBBA 1GF3A 3OJPA 1GBOA 4C5FA 1LMQA 4WO9A 2BQKA 3EO5A 1HC0A 5LAGA 1IC7Y 2HTXA 4LT0A 1VEDA 4WM2A 1UIBA 4TWSA 1WTNA 5I4XA 1GWDA 1KXWA 3W6EA 1FLYA 4NGZA 1YAOA 1GBYA 1DKJA 2F4GA 3WW5A 1WTMA 1QSWA 4WL7A 1BVXA 2LYOA 1BB3A 2ZYCA 5I5QA 1F0WA 1HMKA 2MEFA 207LA 1LSFA 3D9AC 1BWJA 1ZVYB 4NEBA 1IP1A 1XEJA 3HBDA 4NGLA 1LZAA 7LYZA 1UIEA 5KXWA 1GBSA 3LHMA 1OUJA 4H8ZA 4DD2A 1LZSA 3P64A 3LZTA 1LMOA 3IWRA 3LYOA 4WM5A 1GPQC 133LA 1JHLA 1H87A 1XGTC 4W94A 2ZNXY 5KXSA 3G3BB 4W96A 2BPUA 2EIZC 1LJGA 1LZYA 5LXWA 4GN3A 1JTOL 4DD9A 4PRUA 5B05A 3CSQA 2F4AA 4XJHA 1LSDA 4TX7A 1C43A 2IHLA 1UIDA 4NHQA 1J1OY 2Y8PA 1YL0X 4E3UA 1IOCA 1VDPA 1WQQA 1LSMA 2LYMA 1LSYA 1G7HC 2BQOA 2H9KA 4XADA 5KXLA 3LYMA 4NHPA 4ZEEA 1WVVA 1IOTA 1B5ZA 1GE2A 2ZIJA 4NGWA 4O34A 4OOOA 4ET9A 1HFYA 1DI3A 5B07A 4WLYA 1GE0A 3HBHA 1B7QA 3WPKA 4NFVA 5APDA 1GD6A 1UIHA 3WUNA 4A7DA 1UCOA 2LYZA 4BAPA 2I25L 5KXOA 2FBDA 4GLAA 2BQAA 5B1GA 5KXNA 4NSGA 4PPOA 4XYYA 1GF9A 2HEEA 1GAYA 1HEOA 4H92A 5AMYA 1UBZA 4TUNA 5DL9A 2I26L 1GF8A 3AGHA 1JIYA 2DQFC 1B7MA 1VDTA 1HEMA 1CJ9A 2C8PA 2BQBA 4MR1A 1WQOA 3A3RX 4DC4A 1YANA 5ILCA 1CKDA 4H94A 3TMVA 1F6SA 3K3TA 2LHMA 4GN4A 1IEEA 1LMPA 4HTNA 1UICA 2FYDA 3B6LA 1LHKA 1GEVA 1WQRA 2DQGY 4J1BA 1LZRA 1FDLY 1ZVHL 2ZWBA 3AB6A 1DKKA 4ETDA 1B9OA 1CNSA 2BQNA 4Z41A 1GBWA 3WXTA 1HMLA 2BQLA 3AZ4A 4MCKA 4WLTA 5C6IA 5EBHA 3WXUA 1IOQA 1J1PY 1OUDA 1DI4A 2Z39A 1G7LC 1N4FA 4J7VA 4EMNA 1KIQC 2DQIY 4YOPA 1O23A 3TMXA 2XBRA 2I6ZA 1KIPC 4H93A 1B5YA 4H9CA 1IP7A 4WG7A 2BAAA 3ATOA 4J1AA 3D3DA 5FELA 2WARA 2D4KA 1INUA 4WLDA 1B2KA 4B0DA 3AZ5A 1W08A 1NBYC 1B7PA 3A92A 1FLQA 3WUAA 1FBIX 208LA 2HU3A 3ULRA 5FHWA 1TAYA 4KPMA 2BQHA 2D6BA 5FEKA 4CJ2A 2D4IA 5APEA 4I8SA 2XBSA 3WL2A 5KKJA 6LYTA 2Z19A 1GDWA 3CT0A 4IJ4A 1B7OA 1SQ2L 3WPLA 3QE8A 1FN5A 3WU9A 4UWVA 134LA 4XENA 1E8LA 1C7PA 3N9AA 1RCMA 4LGKA 4NGOA 3N9EA 4NWEA 3WVYA 1H6MA 4NSJA 2W1LA 5APFA 2HU1A 2HEBA 3IJVA 4CHXA 1GB7A 2MEBA 2BQDA 1LZGA 4P2EA 1QIOA 2BQJA 3AW6A 3TXHA 4DYGA 1VDSA 2LZTA 2GV0A 2CJLA 3N9CA 4LT1A 1LZDA 2DQDY 3ZEKA 1WQNA 1GBXA 1LOZA 1JKAA 2YBMA 1OUAA 1GXXA 4CFPA 4LYCA 2H5ZA 4I0CA 4BAFA 2DQJY 2ZQ3A 2MEAA 4DWXA 1LZCA 4Z3MA 5KY1A 4N8ZA 5DN5A 5KXMA 1GB3A 153LA 1UC0A 2EQLA 1LMTA 2MEHA 4RDSA 1LJ4A 3ZVQA 1NKHA 2YVBA 4DT3A 1LTMA 1BWIA 1HEPA 8LYZA 4R6CA 1QUSA 1BB6A 1IX0A 1LZ9A 1XGPC 1XGRC 1BB5A 1IR7A 4B4EA 4ETCA 3A34A 5LIOA 1HSWA 3BKHA 4WO6A 2DKVA 4LYTA 4PGJB 3TXBA 1REZA 1BQLY 1GFVA 1KXYA 2Z38A 3EXDA 3WW6A 2YBIA 4HSFA 1LZEA 1IC4Y 4B4JA 1LCNA 4NGVA 1NMMA 4LT2A 1RI8B 4OWCA 1IVMA 1UIAA 5KXXA 5KJ9A 2CDSA 3AGIA 3J6KA 4CGEA 1D0KA 1LMCA 1OUEA 1GB2A 2W1MA 4II8A 1VATA 3CSRA 1NQIA 3RNXA 2N5ZA 5F81A 1G7MC 1IWTA 1XSFA 4DDAA 1LJNA 1OUIA 4XJIA 4NSHA 1IORA 3IJUA 2DQHY 4N0JA 5LYMA 1EQ4A 1JSEA 1C08C 1GFEA 1LJFA 1D6PA 1REXA 3WVXA 1HEQA 1OUCA 1OUHA 1B5XA 1GFTA 1LSEA 1BVKC 4WM6A 1IWUA 1MLCE 1XEIA 5B1FA 3LYZA 4GCEA 1W6ZA 5HNLA 1JSFA 4XJFA 1GB8A 1IWWA 4HV1A 3W3EA 5LYTA 5KXRA 1IP6A 3P4ZA 3B72A 1OUBA 4OWBA 2YSSC 2D91A 1YAQA 3TXDA 4ZIXA 1IWXA 1JJ3A 4U3XB 1WQMA 4NHSA 1REMA 1GE1A 3ZVQB 1NWGA 2ZILA 4HJVA 4WG1A 4OOTA 1ZV5L 1GFJA 1HFZA 2W1YA 4TSCA 1LZNA 5FDJA 4H9IA 4LYOA 4LT3A 4H1PA 5DLAA 4M6DA 1VFBC 3T6UA 2Z2EA 4NY5A 1FLUA 1CKHA 1CKCA 4H9FA 1V7SA 3QY4A 2YBHA 2RSCA 1B5VA 4AGAA 5LA5A 4ET8A 3A67Y 1LZ4A 2HEFA 4Z46A 1IO5A 1HF4A 3AJNA 1XGUC 4H8XA 1LYSA 1LZBA 4HTKA 4OWAA 5HLLA 1GHLA 1LZ1A 4N9RA 1HFXA 5LVHA 2Q0MX 3HBEX 2HECA 1LJKA 4HJZA 3WPJA 3B0KA 5LYZA 1LJJA 3W6BA 1LMAA 1DI5A 1EL1A 1B0DA 1JTPL 5L3HA 1A2YC 4BADA 2HEDA 4HP0A 4J0LA 3LYTA 5J7CA 2EPEA 5KXKA 1HEWA 4WM4A 4XN6A 4GCCA 1YILA 2BLYA 2C8OA 5F9UA 4N1CC 5I4WA 2BQGA 4ETAA 5LVJA 4YEMA 1I20A 4HV2A 3QNGA 154LA 5APCA 2XTHA 5L3IA 4KT3A 3LZ2A 4NG8A 1IR9A 4IASA 5IDDA 1YKXX 3AYQA 1GFUA 3TXIA 1C10A 1DZBX 1QQYA 3OK0A 5LINA 1GF5A 4HPEA 1OQMA 1IP4A 1VAUA 1EQ5A 1XEKA 1GFHA 1JWRA 4C3WA 1IOSA 1UUZC 1AT5A 1TDYA 4NG1A 1TCYA 1JTTL 1TEWA 2CGIA 3W6AA 1OP9B 1JPOA 4GCDA 1AKIA 1JJ0A 1J1XY 4QEQA 5KXYA 3WMKA 4WLXA 1JKCA 3HFMY 5D5FA 1UA6Y 1A4VA 3TXFA 3E3DA 1ALCA 1T3PA 1GAZA 1IIZA 1GF0A 5DM9A 1LHLA 5F14A 5I4YA 1GFAA 1CKGA 3EMSA 3A6CY 4LFXA 4QGZA 3A96A 1KXXA 1QTKA 5ILFA 1LSZA 3LN2A 2NWDX 2ZYPA 5DN4A 5LVIA 5C6LA 1LHMA 4DD1A 3KAMA 1AM7A 1UIFA 1SLYA 1EQEA 1REYA 3CT1A 4XJGA 3A8ZA 4DDCA 1D6QA 4GCBA 2ZIKA 3P66A 4TTDA 4YENA 5M1YA 4H91A 1IWZA 1PS5A 1T6VL 2X0AA 5LVKA 1IY4A 1HSXA 3SP3A 3FI7A 5E9RA 1YAMA 1LJEA 2VB1A 4NSIA 5LAFA 3RU5A 5HMVA 5LVGA 1LHJA 4WM1A 3A95A 3W6DA 1I56A 1OUFA 5I54A 4DD3A 1QSAA 3A3QA 4QDNA 1GBZA 4YM8A 4G4HA 1JKBA 3WU7A 1CJ6A 1B7RA 5I53A 2F2NA 2MEEA 1BB4A 1C45A 4AXTA 1LSPA 4NGYA 1F6RA 2Z2FA 3TXKA 1LMNA 2HUBA 3BKVA 1HHLA 3ATNA 4G4CA 2BQMA 3RT5X 2ZQ4A 1GXV2 5C6JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2IFFY 2B5ZA 4UWUA 4PJ2C 4EXMA 1VDQA 4WMGA 4GCFA 4NIJA 3WULA 5HNCA 3T36A 130LA 4R0FA 230LA 2G4NA 2MEDA 1OVKA 6LYZA 1PQOA 1CUPA 4DD0A 2G4PA 2RBSA 4ETBA 195LA 1JITA 1SWYA 119LA 5T3FA 3M18B 4EPFA 4NGJA 1DPXA 1G1VA 146LA 1P5CA 1SSWA 4LYZA 3W6FA 2DQCY 5FSTA 4XJBA 1L81A 1T8AA 1V7TA 1P64A 4FJRA 4W59A 1XGQC 1LKRA 4TSBA 206LA 1B7SA 1LZ6A 1GFRA 4B49A 5I14A 4HTQA 2CUUA 1CU6A 1GE3A 1LJIA 2EKSC 2DQAA 139LA 1L43A 3OE9A 3RZ4A 1D0MA 1G0GA 4RLNA 1B7NA 1LSNA 3TMUA 2DBTA 2OU8A 5B59A 3SB8A 5K7OA 4EKSA 3W6CA 1GDXA 2ZNWY 1RJCB 4X3BA 4DQ5A 3G3AB 1G7IC 5L9JA 2YDGA 3A6BY 4WOAA 2G4QA 5HQ1A 2MEGA 2BLXA 2RB0X 1B5UA 2OEAX 3TXJA 1GE4A 3WU8A 4RW1A 5F9XA 1G7JC 1D2YA 1QTHA 3WH1A 1LSBA 5KKIA 1GB9A 5KXZA 4ETEA 1BGIA 3VWOA 4WL6A 1CVKA 1B7LA 257LA 3AGGG 4GLVA 123LA 1LZ5A 2DQEY 3FI5A 3OJPA 4C5FA 4WO9A 2BQKA 5LAGA 4WM2A 1VEDA 1LWKA 1KXWA 3W6EA 5I5QA 262LA 1BB3A 1HMKA 4DAJA 1ZYTA 3HH3A 1DYFA 2L78A 4W96A 1P7SA 7LZMA 260LA 1LZYA 1JTOL 4PRUA 2F4AA 1LSDA 4E3UA 1IOCA 1VDPA 2RAYX 1G7HC 2H9KA 1WVVA 1IOTA 1B5ZA 1GE2A 4ARJA 4I7QA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2IFF Y;  1PZY A;  2AUB A;  1ZMY L;  2B5Z A;  4UWU A;  4PJ2 C;  4Z98 A;  1VDQ A;  5LA8 A;  1JUG A;  5A3E A;  4WMG A;  4GCF A;  2CWI A;  4NGI A;  1HEL A;  1LZT A;  4NIJ A;  1WQP A;  3WUL A;  3J4G A;  1YKZ X;  5HNC A;  1AZF A;  3T36 A;  5JEN B;  9LYZ A;  1GF7 A;  1GB5 A;  5IHG A;  1IP2 A;  4R0F A;  4LYB A;  1DQJ C;  1LAA A;  1IWY A;  1AT6 A;  4RW2 A;  2G4N A;  4H8Y A;  2MED A;  6LYZ A;  4B1A A;  4KXI A;  1IC5 Y;  4DD0 A;  2XJW A;  2G4P A;  4L41 A;  4ETB A;  1UIG A;  4G4B A;  5IEL A;  1JIT A;  4ML7 A;  5E4P A;  5T3F A;  3M18 B;  4CFO A;  2Z12 A;  4NGJ A;  1DPX A;  4B4I A;  4DD7 A;  2FYC A;  1LJH A;  1FLW A;  1BB7 A;  2H9J A;  4LYZ A;  1LYO A;  4NHT A;  3W6F A;  1YRO A;  1NBZ C;  3WUM A;  4LFP A;  3F6Z A;  1YKY X;  5D5C A;  2DQC Y;  2BQI A;  4XJB A;  5FST A;  4FDY A;  1IR8 A;  1GB6 A;  3A91 A;  1NDM C;  1V7T A;  1YL1 X;  2D4J A;  4FJR A;  4G9S A;  4D9Z A;  4DDB A;  4YF2 A;  1IWV A;  1CKF A;  1YIK A;  1QDT A;  1XGQ C;  1TBY A;  1LKR A;  4TSB A;  3B0O A;  1IP3 A;  3GXR A;  4OWE A;  1KIR C;  3CB7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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