1BHZA

Low temperature middle resolution structure of hen egg white lysozyme from masc data
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Multiwavelength anomalous solvent contrast (MASC): derivation of envelope structure-factor amplitudes and comparison with model values.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
molecule tags Hydrolase
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1998-06-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1bhzA00
4PRUA 1GB6A 4NSIA 1PS5A 1LZ9A 4H9HA 2LYZA 1YAQA 1BHZA 1LZ5A 4I8SA 1FLQA 5D5CA 4CFPA 1D0KA 2YBHA 2YBNA 2W1YA 1W08A 1HELA 1JEFA 1IR9A 5KXSA 4NHTA 1GBWA 4HV1A 1LZRA 2Z12A 3J4GA 4OWEA 1IY3A 4U3XB 2DQEY 5B1FA 4XJDA 3TXGA 1JPOA 5KXRA 5F9UA 2BLXA 4MSTA 4ML7A 2HEAA 4PGJB 1BB7A 4DC4A 1ZVHL 4ZFPA 1GWDA 1HNLA 1UCOA 1DKKA 3FE0A 3AGGG 1KIQC 1GFTA 4KT3A 2FBBA 4RDSA 4IJ4A 5IDDA 3B0KA 1WQPA 1XEIA 3A6BY 5B06A 1GXV2 134LA 4RW2A 3W6DA 1ZMYL 1B7QA 2H9KA 2AUBA 4WG1A 4KL7A 1YQVY 1CKCA 1JIYA 2W1LA 5LINA 3ATOA 4DWXA 4LT2A 1LZ4A 1NWGA 1LMNA 4TWSA 2MEHA 2RSCA 5M1YA 1REZA 1LOZA 2C8OA 1FDLY 1GB8A 1I20A 1NDGC 1XSFA 1TBYA 2I26L 5F81A 1YKZX 4DDAA 1LJNA 2HEDA 1IP2A 1HEWA 3W6BA 5I4YA 4H9IA 3CT5A 4LT3A 1YL0X 5LVIA 5C6JA 4DD9A 4DD2A 4ANRA 5HLLA 1HENA 5FDJA 1F6RA 5KXLA 4N9RA 154LA 5KXZA 1OUHA 1JKCA 4R6CA 132LA 1LKRA 3IWRA 1IP3A 4IASA 4EOFA 5DN4A 3A95A 1J1PY 1TCYA 2W1MA 5L9JA 4H9BA 1JJ0A 3HFMY 1MELL 4H1PA 2HEEA 1D9UA 3TXFA 1LJGA 3A3RX 1JKDA 1JSEA 1LZAA 1RE2A 4B4JA 1LSGA 1LZ8A 4DT3A 1GDXA 2D4JA 2DQGY 208LA 5HNLA 1T3PA 1NF5A 3IJUA 3OK0A 4J0LA 5LYTA 1I56A 5KXPA 5KXYA 1LHLA 1QTEA 5KXMA 1YL1X 2GV0A 1GE3A 2XTHA 1DKJA 1GB7A 1OP9B 4PPOA 4GCEA 1LZ1A 4NEBA 1B7RA 1LSPA 3WW6A 3HBDA 5APFA 1ZV5L 4WLYA 4XJFA 1HSXA 9LYZA 2CDSA 1LZGA 3AB6A 5EBHA 4XJIA 4QGZA 3TMUA 3ATNA 1QIOA 1B5UA 3F6ZA 3ZVQB 1LJ4A 3EMSA 4LYBA 3D9AC 4LGKA 1YILA 2BQBA 4NHQA 2F30A 3ZEKA 4OOTA 3TMVA 4QEQA 2Z38A 1GE0A 4LFPA 3FI7A 1P2CC 3EXDA 4H9FA 4NWHA 4BAFA 4C3WA 1IWXA 1LMTA 1CKHA 4UWUA 1IWZA 4HPIA 2BQAA 1F10A 1HEPA 1UBZA 5F9XA 3A34A 1Z55A 4N8ZA 3QE8A 1GFJA 1BB4A 4GCDA 1RI8B 2BQJA 4H91A 5JENB 3LYTA 1WVVA 1NDMC 1FLWA 4H8YA 1LJHA 5APCA 1CJ8A 1BWHA 1KXXA 1IR8A 1NMMA 4YEOA 1DPXA 3T6UA 2BQFA 2MEIA 5I54A 2Z2EA 3LYZA 2BQDA 1JSFA 2A7FA 4LYMA 1JITA 2HU1A 2PC2A 3MGWA 4YM8A 4ETCA 1JTTL 3A92A 1NKHA 1XGUC 4PJ2C 1C43A 1LYSA 133LA 1LCNA 2XJWA 2Z2FA 1GFHA 1LYOA 1GBYA 4GCBA 4B4IA 5B59A 193LA 1RCMA 1GFRA 1JWRA 1HF4A 4XN6A 5DLAA 2BQLA 4NG8A 1NBZC 1SQ2L 2MECA 4NG1A 2ZILA 3RU5A 3WMKA 1QQYA 3N9CA 4XENA 2HU3A 2IHLA 1YKXX 2H9JA 4WO6A 4X3BA 3WW5A 4B0DA 1JUGA 4WM4A 3AZ5A 1GEZA 1DQJC 1GFAA 2Y8PA 1KXYA 1LMPA 1UIGA 1GF9A 3W3EA 1WQQA 4BS7A 3TXJA 2BQMA 1BWJA 3BKHA 5ILFA 2YBJA 1GD6A 1XGQC 4J7VA 1CKDA 4QDNA 5T3FA 1A2YC 1UACY 2ZQ3A 2CGIA 3HBHA 1FLUA 1HMKA 4II8A 2HTXA 4LZTA 4DD7A 1UIHA 1GFKA 1REMA 4TTDA 1OUEA 2YDGA 1UIEA 2D4KA 4WO9A 5L3IA 1KXWA 1LJFA 4ETBA 1ZVYB 4CFOA 5APDA 1TEWA 1WTNA 1IP4A 1JTOL 1LTMA 1LZTA 1RJCB 1TDYA 2DQFC 4H8XA 5DM9A 1GF7A 1OUCA 2DQAA 2W1XA 2YBMA 2CWIA 1AT6A 1HEQA 1OUBA 1LSNA 1AM7A 3E3DA 3P65A 6LYZA 4LT1A 3WU8A 1B5WA 5FEKA 1G7JC 1B7OA 1VAUA 5KKJA 1LMAA 3P4ZA 5LVKA 5A3ZA 2BQNA 3P66A 4C5FA 4HP0A 3B6LA 1BGIA 4NSHA 153LA 4H94A 3CSZA 5KXKA 4NFVA 1IOSA 1GB0A 194LA 3CT0A 3SP3A 1FLYA 1BB6A 3WULA 1BVKC 1XGTC 2ZNXY 4WM3A 5F16A 4NWEA 1CKGA 1YAMA 4WOAA 5IELA 1XGPC 1LHMA 1LSAA 4ET9A 3QNGA 2MEDA 3WL2A 2CJLA 3TXEA 1IWWA 3ULRA 4OWAA 1YIKA 4G4HA 1IP5A 4ETEA 5B1GA 3WVXA 1GEVA 2EQLA 3G3BB 4B1AA 1GB5A 1JJ3A 4P2EA 3WU9A 3WXTA 1AZFA 1UIDA 3CSRA 3A96A 2BQHA 1GE2A 5LA8A 3W6FA 4WL6A 2WARA 1LZBA 1V7SA 4NGIA 1IWYA 4XYYA 5APEA 5KKIA 3W6AA 1GXXA 5D5FA 4GN4A 3CQLA 1IP1A 1DXJA 1LSMA 1N4FA 1GFUA 5HNCA 1HEOA 3LZTA 4GLAA 4B49A 1WQMA 4LYCA 3WUMA 1DI3A 4E3UA 4Z46A 1QUSA 1GB2A 207LA 3RW8A 2LYMA 1HMLA 1OUAA 2YBLA 3LYMA 4FJRA 5LXWA 2Q0MX 1REXA 2F2NA 5I53A 1XEJA 3GXRA 3TXKA 4GN5C 1GB9A 1LHJA 5I5QA 4XADA 2ZWBA 4TSBA 3WPLA 5K7OA 1YKYX 1BWIA 4H9AA 4H9EA 1LJ3A 3IJVA 5LIOA 4A7DA 1OUJA 4MR1A 4J1BA 4OWBA 3M18B 4RW1A 4OWHA 4OOOA 4R0FA 4CHXA 2A7DA 2ZYCA 3A90A 3B72A 1FKVA 1LZEA 3WVYA 1NHEA 3A93A 1CJ7A 3AZ6A 4WL7A 1GF0A 1QUTA 2F4GA 5FELA 1OUGA 5DN5A 5LA5A 2BAAA 1B7MA 3LN2A 4J1AA 4NIJA 4NGWA 1LHKA 3TXIA 1LSCA 5HMJA 1B9OA 1WVUA 1B5ZA 2HECA 4O34A 4WMGA 1C08C 1G7IC 3BKVA 1OUFA 4ZEEA 1GE1A 1VDQA 5B07A 1VFBC 4HTQA 4H93A 1E8LA 2G4NA 1B2KA 1ALCA 2N5ZA 1IP6A 5HMVA 5KXOA 4DD1A 1G7MC 5I4XA 1LSFA 4NGLA 2DBTA 4WG7A 2ZNWY 1NBYC 2ZQ4A 2NWDX 3LYOA 1INUA 4NGZA 1HSWA 3AGHA 5B05A 1CKFA 2MEBA 1AKIA 1LMOA 4M4OA 135LA 1W6ZA 4HPEA 5FCPA 3TXHA 4XJGA 1DZBX 1IC4Y 1FN5A 1LYYA 1B7LA 1DI4A 1IOQA 1EQEA 4RLMA 1EQ5A 1GBOA 1HHLA 1LPIA 2XBRA 4G4CA 1IC5Y 4N1CC 5LAGA 2D4IA 3A67Y 4KXIA 1V7TA 4H90A 2H5ZA 2YBIA 4N1EI 3K3TA 5KJ9A 1LJKA 5LVJA 1QDTA 1LSYA 1IY4A 2FYDA 1NQIA 4NGJA 1JKBA 1B7NA 1QTKA 2ZIJA 1I1ZA 1MLCE 2EIZC 4PHIA 1TAYA 2HEFA 3W6EA 1KIRC 4HJVA 4EMNA 4TX7A 1GDWA 1GBXA 1LSDA 3J6KA 4ETAA 1QSAA 2X0AA 2MEAA 1C46A 2I25L 1LJJA 4ET8A 3RZ4A 3AW6A 2MEEA 3AGIA 1AT5A 1GF6A 4YENA 1T6VL 1EL1A 2LZTA 1REYA 4HTKA 1B7SA 4XJBA 1IVMA 1HFYA 1GF3A 1HC0A 2B5ZA 1B5XA 1GF5A 1FKQA 3AYQA 1UIBA 5KY1A 3WPKA 1SLYA 1OUIA 3RNXA 1OUDA 3AJNA 2BQCA 1A4VA 1GAZA 4TUNA 5IHGA 2BQKA 2Z37A 4TSCA 5C6IA 4NSGA 1IIZA 1CJ9A 4XJHA 1IWUA 1EQ4A 3GXKA 5L3HA 2BQIA 1B7PA 3CSQA 5FHWA 3T36A 2XBSA 4DYGA 4NHIA 1XEKA 1WQOA 4H9CA 4LYOA 4UWNA 4D9ZA 2G4PA 5F14A 2F4AA 3AZ7A 4NGYA 4ETDA 5LYMA 4G49A 1B5YA 1IEEA 4AXTA 4N5RA 3G3AB 3N9EA 2BQGA 2Z39A 4DD3A 2D6BA 3M3UA 4HSFA 5KXXA 1IR7A 3TXDA 2MEGA 1LKSA 2FBDA 1YROA 1UICA 2BLYA 4NGKA 1YAPA 1IP7A 1GBSA 3CT1A 1LZDA 3A91A 2YVBA 2ZIKA 4BAPA 4ZIXA 1BB5A 1JISA 1GFVA 1UC0A 1LZCA 4GCCA 3OJPA 4UWVA 3ZVQA 3VWOA 1J1OY 4HJZA 2EPEA 1GFGA 3B0OA 4B4EA 1VDTA 1DI5A 1G7LC 1F0WA 1BB3A 1VDPA 5KXWA 5E4PA 4WM5A 4LT0A 2BQOA 4LYZA 1IOTA 4GCFA 1JTPL 4NGVA 1D6PA 4Z41A 1GAYA 3QY4A 1D6QA 4YF2A 1O23A 3KAMA 1CJ6A 1OQMA 1UUZC 2DKVA 2G4QA 1LHHA 5DL9A 1LZYA 2BQEA 3AW7A 4WLXA 2D91A 3LZ2A 5C6LA 1BVXA 1VATA 4G9SA 4CGEA 1IC7Y 4KPMA 3WPJA 1CNSA 5HQ1A 4OWCA 2LHMA 3P68A 3N9AA 4HV2A 4IATA 1GE4A 4Z98A 4GN3A 1FBIX 1XFPL 1LMCA 2LZ2A 1GB3A 1B5VA 1LZ6A 1IX0A 2DQJY 4DD0A 3EO5A 4HTNA 2Z19A 1D0LA 3AZ4A 1RFPA 4NGOA 4M6DA 1VDSA 2MEFA 1KIPC 4AGAA 4YEMA 1C10A 1DPWA 1YAOA 3CB7A 4NHSA 4W94A 4YOPA 5FSTA 4I0CA 8LYZA 5LVHA 4NHPA 1J1XY 1LSZA 2DQCY 2Z18A 3WH1A 5II3A 1YANA 3A94A 1WQNA 2I6ZA 1QSWA 4QY9A 1QDRA 3WYHA 4CJ2A 1LSBA 1LSEA 3WXUA 1IOCA 1GFEA 4WLDA 4DDBA 4DDCA 1G7HC 4LYTA 3TMWA 1C45A 4PRQA 4GLVA 4HJYA 1GPQC 3D3DA 5AMYA 1LJEA 1BQLY 3EBAB 3RT5X 5ILCA 2DQDY 4NSJA 1JHLA 1WTMA 1LMQA 5LYZA 4BADA 4WM6A 5E9RA 1UIFA 1HERA 1D0MA 2VB1A 3WUAA 4WM2A 3LHMA 5KXTA 2HUBA 1IWTA 1IO5A 2IFFY 5LVGA 1LJIA 2YSSC 1LAAA 4L41A 4N0JA 1WQRA 1GF4A 4H8ZA 4OW1A 2DQHY 3A3QA 4H92A 4WLTA 5I4WA 4MCKA 1JKAA 7LYZA 2EKSC 1GHLA 3TXBA 4Z3MA 3WU7A 3TMXA 4G4BA 6LYTA 1HFXA 1H6MA 1UIAA 1IORA 2DQIY 1B0DA 4WM1A 1C7PA 3P64A 3WUNA 1LZNA 1LYZA 2HEBA 5J7CA 4RLNA 1PZYA 4W96A 3HBEX 1HFZA 2BPUA 2FYCA 1UA6Y 1GBZA 4NY5A 1JJ1A 5LAFA 1F6SA 4FDYA 3W6CA 5KXNA 1GF8A 3A8ZA 2C8PA 4LFXA 2ZYPA 1H87A 5A3EA 3B0IA 1XGRC 1IWVA 1LZSA 1VEDA 1HEMA 2LYOA 3A6CY 1LHIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
243LA 2LYZA 1D0KA 1L45A 1P46A 1JEFA 3J4GA 4U3XB 2DQEY 1L88A 5KXRA 2HEAA 1ZVHL 1KW7A 4ARMB 4RDSA 5IDDA 1EPYA 3HUQA 134LA 1C6CA 3UONA 1L04A 2AUBA 2W1LA 5LINA 4DWXA 4LT2A 1LMNA 2MEHA 2RSCA 1I20A 2Z6BA 1YKZX 1IP2A 5I4YA 1L10A 123LA 3CT5A 3RZEA 5LVIA 1HENA 5FDJA 5KXLA 4N9RA 154LA 5KXZA 132LA 1LYFA 4IASA 3G3XA 1J1PY 1TCYA 1DYCA 3TXFA 1LJGA 2NTGA 3A3RX 1C67A 1LZAA 4IAPA 1T3PA 5LYTA 5KXYA 1QTEA 1YL1X 2XTHA 4PPOA 3WW6A 227LA 1L35A 1ZV5L 1LI2A 3NY9A 9LYZA 3AB6A 254LA 4QGZA 1LJ4A 178LA 244LA 3D9AC 215LA 3TMVA 200LA 4QEQA 1CU6A 1GE0A 237LA 1L71A 1L20A 4W57A 1C68A 2BQAA 4N8ZA 1BB4A 2BQJA 3LYTA 1WVVA 1NDMC 1FLWA 4H8YA 3SBBC 1LJHA 3LZMA 1NMMA 1L11A 2BQFA 2MEIA 1CV4A 2BQDA 1JSFA 1L00A 4ETCA 1JTTL 1DYGA 142LA 1XGUC 173LA 4B4IA 193LA 2B6ZA 1JWRA 1HF4A 5DLAA 262LA 3C7ZA 148LE 1NBZC 2MECA 1L21A 1QTDA 2XQOA 1QQYA 1L12A 2IHLA 104LA 1SSWA 1L67A 2Y8PA 1PQDA 3HDFA 1KXYA 3W3EA 4BS7A 2BQMA 5ILFA 3BKHA 3SB8A 3HBHA 1FLUA 1L49A 1GFKA 1L19A 4TTDA 1OUEA 2D4KA 1KXWA 3DMVA 169LA 1ZVYB 1TEWA 1LTMA 2DQFC 1TDYA 3HDEA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4PRU A;  1GB6 A;  4NSI A;  1PS5 A;  1LZ9 A;  4H9H A;  2LYZ A;  1YAQ A;  1BHZ A;  1LZ5 A;  4I8S A;  1FLQ A;  5D5C A;  4CFP A;  1D0K A;  2YBH A;  2YBN A;  2W1Y A;  1W08 A;  1HEL A;  1JEF A;  1IR9 A;  5KXS A;  4NHT A;  1GBW A;  4HV1 A;  1LZR A;  2Z12 A;  3J4G A;  4OWE A;  1IY3 A;  4U3X B;  2DQE Y;  5B1F A;  4XJD A;  3TXG A;  1JPO A;  5KXR A;  5F9U A;  2BLX A;  4MST A;  4ML7 A;  2HEA A;  4PGJ B;  1BB7 A;  4DC4 A;  1ZVH L;  4ZFP A;  1GWD A;  1HNL A;  1UCO A;  1DKK A;  3FE0 A;  3AGG G;  1KIQ C;  1GFT A;  4KT3 A;  2FBB A;  4RDS A;  4IJ4 A;  5IDD A;  3B0K A;  1WQP A;  1XEI A;  3A6B Y;  5B06 A;  1GXV 2;  134L A;  4RW2 A;  3W6D A;  1ZMY L;  1B7Q A;  2H9K A;  2AUB A;  4WG1 A;  4KL7 A;  1YQV Y;  1CKC A;  1JIY A;  2W1L A;  5LIN A;  3ATO A;  4DWX A;  4LT2 A;  1LZ4 A;  1NWG A;  1LMN A;  4TWS A;  2MEH A;  2RSC A;  5M1Y A;  1REZ A;  1LOZ A;  2C8O A;  1FDL Y;  1GB8 A;  1I20 A;  1NDG C;  1XSF A;  1TBY A;  2I26 L;  5F81 A;  1YKZ X;  4DDA A;  1LJN A;  2HED A;  1IP2 A;  1HEW A;  3W6B A;  5I4Y A;  4H9I A;  3CT5 A; 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 1VDS A;  2MEF A;  1KIP C;  4AGA A;  4YEM A;  1C10 A;  1DPW A;  1YAO A;  3CB7 A;  4NHS A;  4W94 A;  4YOP A;  5FST A;  4I0C A;  8LYZ A;  5LVH A;  4NHP A;  1J1X Y;  1LSZ A;  2DQC Y;  2Z18 A;  3WH1 A;  5II3 A;  1YAN A;  3A94 A;  1WQN A;  2I6Z A;  1QSW A;  4QY9 A;  1QDR A;  3WYH A;  4CJ2 A;  1LSB A;  1LSE A;  3WXU A;  1IOC A;  1GFE A;  4WLD A;  4DDB A;  4DDC A;  1G7H C;  4LYT A;  3TMW A;  1C45 A;  4PRQ A;  4GLV A;  4HJY A;  1GPQ C;  3D3D A;  5AMY A;  1LJE A;  1BQL Y;  3EBA B;  3RT5 X;  5ILC A;  2DQD Y;  4NSJ A;  1JHL A;  1WTM A;  1LMQ A;  5LYZ A;  4BAD A;  4WM6 A;  5E9R A;  1UIF A;  1HER A;  1D0M A;  2VB1 A;  3WUA A;  4WM2 A;  3LHM A;  5KXT A;  2HUB A;  1IWT A;  1IO5 A;  2IFF Y;  5LVG A;  1LJI A;  2YSS C;  1LAA A;  4L41 A;  4N0J A;  1WQR A;  1GF4 A;  4H8Z A;  4OW1 A;  2DQH Y;  3A3Q A;  4H92 A;  4WLT A;  5I4W A;  4MCK A;  1JKA A;  7LYZ A;  2EKS C;  1GHL A;  3TXB A;  4Z3M A;  3WU7 A;  3TMX A;  4G4B A;  6LYT A;  1HFX A;  1H6M A;  1UIA A;  1IOR A;  2DQI Y;  1B0D A;  4WM1 A;  1C7P A;  3P64 A;  3WUN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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