1BWHA

The 1.8 a structure of ground control grown tetragonal hen egg white lysozyme
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Bound-solvent structures for microgravity-, ground control-, gel- and microbatch-grown hen egg-white lysozyme crystals at 1.8 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
molecule tags Hydrolase
total genus 45
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1998-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1bwhA00
5KXZA 4DC4A 1JJ3A 1JEFA 207LA 1GB9A 134LA 5LVIA 2W1YA 1ALCA 2XBRA 4B4EA 4PRUA 1JKBA 5ILCA 1DZBX 5FCPA 3TXHA 5LYZA 4H90A 1IWWA 4DD0A 2ZILA 1NWGA 1WQPA 4HTKA 4MSTA 5I4XA 4WM1A 1DKJA 1LYSA 2FBDA 1YAOA 3WUMA 3TXIA 5LAGA 1F10A 5E9RA 3HBEX 4WLXA 1XSFA 5KXWA 1XFPL 1OUAA 1JKAA 1C46A 3IWRA 4KXIA 3WPKA 2D6BA 4G4HA 2LYZA 2LYMA 1UIHA 3LZTA 1IO5A 4H9BA 4LT0A 4NGKA 3W6DA 1AZFA 1GWDA 3EO5A 4ETCA 4LYZA 1LYOA 2DQGY 4OW1A 1I1ZA 1IC5Y 3D9AC 4G4BA 1GBYA 1IOQA 4WM5A 3WYHA 1GF8A 194LA 2NWDX 4UWNA 5B1FA 1P2CC 3W6EA 4DYGA 1RCMA 5LYTA 3RT5X 2Z39A 4E3UA 1OUGA 1UIAA 1LAAA 5F16A 4B4IA 4PHIA 1ZMYL 1D0KA 1LMAA 1GEVA 1GB0A 1LZ1A 1G7HC 3ULRA 4OWEA 5I4YA 2IFFY 2FYCA 1VDPA 2YBNA 4XJFA 5F9UA 5HNLA 5HNCA 1C45A 4J7VA 1B7MA 4NGZA 1B7LA 3GXRA 1B5YA 4GN4A 1DI5A 1OQMA 1D6PA 1GE4A 3N9CA 1LZYA 1GB2A 1JHLA 3WVYA 5FDJA 1QSWA 1GAZA 1RFPA 3LN2A 4G9SA 1QUTA 1GB5A 1B5WA 2BQBA 4J0LA 1NHEA 1FDLY 2YBMA 2HEBA 2LHMA 4N1EI 4NSGA 1YILA 3IJVA 1GFAA 4MCKA 133LA 4H8ZA 4L41A 2ZIKA 1JJ0A 4YEMA 5F9XA 3AW7A 1IOSA 1G7LC 4NGYA 1GXV2 2H9KA 1OUFA 2F4AA 3G3AB 5HQ1A 1G7MC 2BQKA 4NFVA 1XGQC 1IIZA 1LOZA 1LHLA 3AZ4A 3B0IA 4DD2A 1YKZX 5KXXA 2HEFA 5I4WA 1IWYA 4LFPA 1LZRA 1IWZA 1LHIA 2MEBA 1B7NA 1GDWA 1KXWA 1LZEA 3QE8A 4GCBA 4PJ2C 4N5RA 1C43A 1GE1A 208LA 1GF6A 4NGIA 1OUDA 1W08A 3WH1A 3OK0A 1TEWA 3AW6A 5DL9A 2BLXA 4LYOA 5L3IA 2X0AA 3A94A 4B4JA 1LZAA 4DDBA 3CQLA 3P66A 4H8XA 3J4GA 2RSCA 3ATNA 1IWUA 1BGIA 1CJ7A 4GCEA 1HSXA 3AGHA 5B59A 4H9IA 5II3A 1HHLA 3AJNA 3A8ZA 2BPUA 4GN3A 4NSIA 4CFOA 1JIYA 4CGEA 5LVHA 153LA 1BB4A 5LIOA 8LYZA 4HV1A 4DDCA 1LZTA 3F6ZA 1RE2A 2W1LA 5JENB 4NHTA 2MEFA 4II8A 3WXUA 1LZCA 5HMJA 3ZVQB 2CGIA 1BWIA 3IJUA 4KT3A 4DDAA 4CFPA 2BQOA 1OUEA 4B0DA 1GE0A 1FBIX 2HEAA 1VDSA 1UCOA 1NKHA 1Z55A 1GD6A 1HF4A 1IP3A 4LT2A 4A7DA 1IC4Y 4HSFA 1IVMA 4YM8A 1F6RA 1LZ5A 2D4IA 1WTMA 3LYTA 5L9JA 1GFVA 1SLYA 5E4PA 1DPWA 4OOOA 5LVJA 2YBHA 1JUGA 3HFMY 1HFZA 4OOTA 5DM9A 3B6LA 1LZBA 4HJVA 1BB7A 3AGGG 4W96A 4C5FA 1GF9A 1HFXA 2PC2A 4WG7A 5KXPA 5F81A 1B7PA 1UC0A 3W3EA 1LHKA 3K3TA 5FEKA 1GFJA 1GB3A 4ETEA 2MEIA 1JJ1A 1QSAA 3P64A 1HEOA 4RLNA 2MECA 1LSMA 4NWEA 5KXNA 1LSEA 3A6BY 1B5UA 4N8ZA 4WLTA 3P68A 1HEPA 2BQLA 4H9AA 1GE3A 1QTKA 1GXXA 4XJDA 1HMLA 2Z38A 4LFXA 5C6JA 4ZFPA 1JKCA 1WQQA 1IC7Y 1IY4A 1LSYA 1LMOA 4HTQA 1DPXA 4RW1A 3P65A 4H94A 2DQFC 3WMKA 3WXTA 1XGUC 2Q0MX 2G4QA 5B05A 3LYOA 1DKKA 2D4KA 1LSCA 1GFHA 2EIZC 135LA 2HU3A 4HV2A 1IR8A 3B72A 1LJ4A 5B06A 2XBSA 3N9AA 4HP0A 4TTDA 5A3ZA 1NMMA 1LMNA 3J6KA 5LINA 4UWUA 1IP4A 2C8PA 2HEEA 3TXKA 4NGLA 3W6AA 1GFEA 1JSFA 1YQVY 4AGAA 3B0OA 1G7IC 1BB6A 1HELA 2G4PA 3QY4A 3ZVQA 1T6VL 1A4VA 2BQJA 2ZNWY 1EL1A 1UIGA 4B49A 1IP6A 1QUSA 1NF5A 1V7TA 4HJYA 4RW2A 1C7PA 4XJHA 2Z12A 4CHXA 4N1CC 1VDTA 3A67Y 1GB6A 1WQMA 1HSWA 2XTHA 2Z2EA 2BQAA 1IP5A 1J1XY 1JPOA 2LZTA 4HPIA 4B1AA 3D3DA 1B9OA 1O23A 3WPLA 3TXFA 1E8LA 3CT1A 1GBZA 1LCNA 1GF0A 5D5CA 5M1YA 1TCYA 1XEJA 2Z37A 4ETAA 2YBLA 1IR7A 1LYYA 1OP9B 4OWAA 3A91A 1LZ8A 4XJIA 2VB1A 3T36A 1HENA 4NSJA 1GBOA 5B1GA 4TX7A 3A96A 1QQYA 1B7SA 1GEZA 4GLVA 1D9UA 1LMQA 4H91A 2CDSA 4XJGA 1FLQA 1ZV5L 5LAFA 4WM6A 4QGZA 1LSBA 1JTPL 1RJCB 4WOAA 5KXSA 3WL2A 3AGIA 1BB5A 1XGPC 1RI8B 1LMCA 4AXTA 3RZ4A 1W6ZA 3GXKA 4TSCA 4MR1A 4J1AA 2D91A 4BAFA 1REYA 1LHMA 2B5ZA 1IR9A 1LSFA 5B07A 3M3UA 4DD9A 1REMA 1HERA 4XADA 2G4NA 1GBSA 1IWTA 1V7SA 1F0WA 2XJWA 1BWHA 4J1BA 3WU9A 1B5VA 1KXYA 1EQEA 1WQRA 2DQCY 1AM7A 1QDTA 2EQLA 3HBHA 3A92A 4IATA 4N9RA 2YDGA 4YOPA 1GE2A 1HC0A 3MGWA 4I0CA 4NEBA 4R6CA 2HUBA 3LYMA 4PGJB 1WVUA 2A7FA 3CB7A 3WVXA 3A3QA 1IWXA 2DKVA 5HLLA 1TDYA 1EQ5A 1GFUA 4H9FA 5J7CA 2IHLA 5HMVA 1QIOA 1DI4A 1LJNA 1HNLA 4LT3A 4DD1A 1YROA 1UICA 4ET9A 2DQIY 2GV0A 1YAMA 4GLAA 5KXLA 4I8SA 1LYZA 5DN5A 1XGRC 3A6CY 1FLWA 4H9CA 3A3RX 3W6FA 1GB7A 2MEHA 3RU5A 1HEQA 1GFRA 2WARA 3AZ6A 1LZ9A 1GB8A 1VATA 3WU7A 1UBZA 4RDSA 5KXKA 1LJJA 1UIEA 5D5FA 1GF4A 2AUBA 1GF5A 4Z3MA 2BLYA 1MLCE 4O34A 3WULA 132LA 1OUIA 2DQHY 3T6UA 4BAPA 3WW5A 4Z41A 5LXWA 1YAQA 4C3WA 2ZYPA 1CKFA 1WQNA 1KIPC 1YAPA 5ILFA 5LYMA 4HTNA 5FHWA 1IOCA 1CKGA 4FJRA 1UIFA 4H1PA 3BKVA 3WPJA 1LJHA 1I56A 3CSRA 3M18B 4WL7A 5APDA 2Y8PA 1YKYX 154LA 1LKSA 3LHMA 4ZEEA 1B0DA 1MELL 4N0JA 1DXJA 1IY3A 1AKIA 1LSPA 1GFGA 1LZNA 3AYQA 5APEA 5C6IA 2MEAA 4ET8A 1LTMA 2H5ZA 2I26L 4G49A 4YF2A 4Z98A 4KL7A 4GCCA 2HECA 3EMSA 1UIBA 1B7QA 1VAUA 3A90A 4WO6A 5IDDA 5KJ9A 5IHGA 1WVVA 4H92A 1LZ6A 5DLAA 3WU8A 3B0KA 1LJGA 1LJFA 4GN5C 4NGWA 5APCA 4BADA 1JITA 2ZWBA 4P2EA 1YIKA 1KIQC 193LA 4H9EA 4XENA 1BQLY 1GF3A 2W1XA 4NHPA 1CJ6A 4ETBA 4NGJA 4ZIXA 1B2KA 2Z19A 4M4OA 1KXXA 1GFTA 1LSZA 2FBBA 1IP1A 4PPOA 2DBTA 2LYOA 4LYCA 5I53A 5APFA 1IP7A 5I54A 4WM2A 1WQOA 2YBIA 5FELA 1BB3A 1BVXA 2Z2FA 1DQJC 3W6BA 2CWIA 1NBZC 1CKCA 4OWCA 4WO9A 2MEDA 3BKHA 4X3BA 1B5XA 1YKXX 3N9EA 1NBYC 3TXEA 1IEEA 3FI7A 4TUNA 4WL6A 4TSBA 4NG1A 5KXOA 3RW8A 1D0MA 1G7JC 4WG1A 3AZ7A 3RNXA 3WUAA 2F4GA 3VWOA 4ANRA 4FDYA 4QY9A 1HMKA 4QDNA 5LA5A 4NIJA 5LVKA 1CJ8A 1OUCA 4IJ4A 3EBAB 4NG8A 3TMXA 4NGVA 4NHQA 4CJ2A 3A93A 5KXRA 1GBXA 1LSNA 4KPMA 5AMYA 2I6ZA 1WTNA 2YVBA 3FE0A 3HBDA 3TMUA 4WM3A 5IELA 1DI3A 4OWBA 3ZEKA 4XJBA 3TXDA 9LYZA 5LA8A 5KKIA 1EQ4A 1LZSA 2YBJA 4EMNA 4LYTA 1JSEA 1LSDA 2ZIJA 2I25L 2MEEA 3KAMA 1XEIA 1LZGA 1D6QA 1QDRA 2BQHA 1QTEA 2H9JA 5EBHA 1REXA 1JWRA 4XN6A 1BWJA 1LPIA 2ZQ4A 1UUZC 2Z18A 2YSSC 1INUA 5DN4A 1LSAA 4WLYA 1A2YC 2DQDY 5I5QA 1KIRC 2BQGA 2BQDA 2BQFA 3P4ZA 5A3EA 1YL0X 2F30A 4WLDA 4M6DA 6LYZA 1NDGC 4NHIA 5C6LA 1LKRA 3WW6A 4ETDA 2ZYCA 3TMWA 3TXGA 2BQMA 3G3BB 2LZ2A 4HPEA 2HU1A 4IASA 3TMVA 1GDXA 2DQEY 2MEGA 1F6SA 5KKJA 4ML7A 5KXMA 1VFBC 1UA6Y 4PRQA 1LHHA 5T3FA 4NGOA 4R0FA 1I20A 1GAYA 1YL1X 3CT5A 1LMTA 4H93A 1AT6A 1C10A 1GPQC 2D4JA 3QNGA 3SP3A 5KXTA 1LZ4A 1AT5A 1YANA 3A34A 2EKSC 2N5ZA 3ATOA 3LZ2A 4GCFA 1B5ZA 1LMPA 1H6MA 1FKVA 1FKQA 1OUBA 4LGKA 4XYYA 1LJIA 4NHSA 1H87A 2BQCA 4D9ZA 4H9HA 3EXDA 1T3PA 3E3DA 1BHZA 4G4CA 2DQAA 6LYTA 4RLMA 3WUNA 2DQJY 4NWHA 4H8YA 4OWHA 3LYZA 1J1OY 3CT0A 1OUJA 2HTXA 1NDMC 5LVGA 1LHJA 1J1PY 2A7DA 3OJPA 4LZTA 2FYDA 1CJ9A 1CNSA 1NQIA 1GFKA 2F2NA 5KXYA 4WMGA 1UACY 1C08C 4YEOA 4BS7A 1IX0A 1JKDA 2BAAA 1PS5A 4LT1A 4NSHA 4DD3A 4DT3A 2C8OA 1LJKA 7LYZA 2HEDA 2W1MA 1HEWA 1XGTC 4GCDA 4YENA 1FLUA 1GBWA 2BQEA 5F14A 1JTOL 1B7OA 2ZQ3A 1IP2A 5FSTA 1FN5A 5K7OA 4U3XB 1VEDA 1IOTA 4NY5A 1LJ3A 1D0LA 1FLYA 3AB6A 1JISA 1N4FA 3AZ5A 4W94A 2BQIA 1IORA 3TXJA 4Z46A 1ZVYB 5KY1A 1TAYA 1B7RA 2CJLA 3CSZA 1ZVHL 1OUHA 2BQNA 4HJZA 1GHLA 4LYMA 1PZYA 1UIDA 3W6CA 4DWXA 3A95A 1CKHA 1IWVA 1HFYA 1LSGA 4TWSA 4WM4A 4DD7A 1REZA 4LYBA 4QEQA 3TXBA 1CKDA 1GF7A 1TBYA 1XEKA 4EOFA 3CSQA 2ZNXY 1LZDA 2EPEA 1VDQA 5L3HA 1LJEA 1SQ2L 1HEMA 1BVKC 1JTTL 4UWVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5KXZA 3OE6A 4W51A 1CV3A 4I7OA 4EKQA 3HDFA 220LA 1QS5A 5LYZA 4H90A 2OU0X 2ZILA 198LA 1YAOA 1QSQA 3TXIA 1XSFA 1XFPL 1DYCA 3WPKA 1L66A 2LYMA 3LZTA 4H9BA 3W6DA 4LYZA 159LA 1I1ZA 4G4BA 238LA 4AQNA 4DYGA 2L78A 2RB0X 5LYTA 1L11A 234LA 1KW7A 1UIAA 4PHIA 5I4YA 2OTYX 2FYCA 1B7MA 2B74A 3GXRA 2O79A 1LZYA 1LYJA 3WVYA 223LA 4G9SA 2RAZX 3GUMA 3HTDA 4J0LA 3NY9A 155LA 4N1EI 160LA 1QT4A 4I7QA 4L41A 1XEPA 1C64A 3UONA 2F4AA 3FA0A 1XGQC 1IIZA 3B0IA 145LA 4LFPA 1IWZA 1LHIA 3QE8A 2B72A 250LA 1GF6A 4NGIA 1W08A 1QTVA 1TEWA 2X0AA 4PJZA 3CQLA 3P66A 1BGIA 2B70A 1HSXA 1CX6A 5II3A 186LA 4EJ4A 4CFOA 8LYZA 4DDCA 224LA 1P3NA 2MEFA 3CDOA 2LC9A 4B0DA 1GE0A 1UCOA 4IAPA 1HF4A 1IP3A 4LT2A 1IC4Y 4HSFA 2D4IA 5L9JA 5E4PA 4OOOA 4I7RA 3HFMY 4OOTA 3B6LA 1LZBA 3EMLA 3HT7A 1QTZA 181LA 1HFXA 4WG7A 164LA 5F81A 3W3EA 1GFJA 251LA 4EXMA 3P64A 4WLTA 3P65A 3HWLA 4DAJA 2G4QA 3LYOA 1DKKA 1L81A 3B72A 2XBSA 4TTDA 5LINA 1LMNA 1L32A 1L42A 4UWUA 141LA 4ARQA 4AGAA 1BB6A 1LI6A 1L47A 1L53A 2BQJA 213LA 1UIGA 1NF5A 1L56A 4CHXA 3CDQA 3A67Y 2Z2EA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5KXZ A;  4DC4 A;  1JJ3 A;  1JEF A;  207L A;  1GB9 A;  134L A;  5LVI A;  2W1Y A;  1ALC A;  2XBR A;  4B4E A;  4PRU A;  1JKB A;  5ILC A;  1DZB X;  5FCP A;  3TXH A;  5LYZ A;  4H90 A;  1IWW A;  4DD0 A;  2ZIL A;  1NWG A;  1WQP A;  4HTK A;  4MST A;  5I4X A;  4WM1 A;  1DKJ A;  1LYS A;  2FBD A;  1YAO A;  3WUM A;  3TXI A;  5LAG A;  1F10 A;  5E9R A;  3HBE X;  4WLX A;  1XSF A;  5KXW A;  1XFP L;  1OUA A;  1JKA A;  1C46 A;  3IWR A;  4KXI A;  3WPK A;  2D6B A;  4G4H A;  2LYZ A;  2LYM A;  1UIH A;  3LZT A;  1IO5 A;  4H9B A;  4LT0 A;  4NGK A;  3W6D A;  1AZF A;  1GWD A;  3EO5 A;  4ETC A;  4LYZ A;  1LYO A;  2DQG Y;  4OW1 A;  1I1Z A;  1IC5 Y;  3D9A C;  4G4B A;  1GBY A;  1IOQ A;  4WM5 A;  3WYH A;  1GF8 A;  194L A;  2NWD X;  4UWN A;  5B1F A;  1P2C C;  3W6E A;  4DYG A;  1RCM A;  5LYT A;  3RT5 X;  2Z39 A;  4E3U A;  1OUG A;  1UIA A;  1LAA A;  5F16 A;  4B4I A;  4PHI A;  1ZMY L;  1D0K A;  1LMA A;  1GEV A;  1GB0 A;  1LZ1 A;  1G7H C;  3ULR A;  4OWE A;  5I4Y A;  2IFF Y;  2FYC A;  1VDP A;  2YBN A;  4XJF A;  5F9U A;  5HNL A; 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 1AT5 A;  1YAN A;  3A34 A;  2EKS C;  2N5Z A;  3ATO A;  3LZ2 A;  4GCF A;  1B5Z A;  1LMP A;  1H6M A;  1FKV A;  1FKQ A;  1OUB A;  4LGK A;  4XYY A;  1LJI A;  4NHS A;  1H87 A;  2BQC A;  4D9Z A;  4H9H A;  3EXD A;  1T3P A;  3E3D A;  1BHZ A;  4G4C A;  2DQA A;  6LYT A;  4RLM A;  3WUN A;  2DQJ Y;  4NWH A;  4H8Y A;  4OWH A;  3LYZ A;  1J1O Y;  3CT0 A;  1OUJ A;  2HTX A;  1NDM C;  5LVG A;  1LHJ A;  1J1P Y;  2A7D A;  3OJP A;  4LZT A;  2FYD A;  1CJ9 A;  1CNS A;  1NQI A;  1GFK A;  2F2N A;  5KXY A;  4WMG A;  1UAC Y;  1C08 C;  4YEO A;  4BS7 A;  1IX0 A;  1JKD A;  2BAA A;  1PS5 A;  4LT1 A;  4NSH A;  4DD3 A;  4DT3 A;  2C8O A;  1LJK A;  7LYZ A;  2HED A;  2W1M A;  1HEW A;  1XGT C;  4GCD A;  4YEN A;  1FLU A;  1GBW A;  2BQE A;  5F14 A;  1JTO L;  1B7O A;  2ZQ3 A;  1IP2 A;  5FST A;  1FN5 A;  5K7O A;  4U3X B;  1VED A;  1IOT A;  4NY5 A;  1LJ3 A;  1D0L A;  1FLY A;  3AB6 A;  1JIS A;  1N4F A;  3AZ5 A;  4W94 A;  2BQI A;  1IOR A;  3TXJ A;  4Z46 A;  1ZVY B;  5KY1 A;  1TAY A;  1B7R A;  2CJL A;  3CSZ A;  1ZVH L;  1OUH A;  2BQN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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