1BWHA

The 1.8 a structure of ground control grown tetragonal hen egg white lysozyme
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Bound-solvent structures for microgravity-, ground control-, gel- and microbatch-grown hen egg-white lysozyme crystals at 1.8 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
molecule tags Hydrolase
total genus 45
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1998-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1bwhA00
1XGQC 1TBYA 2DQDY 1IP2A 1B5WA 1BB4A 1OUBA 1LZYA 1OUFA 1QUTA 1JTOL 1IR7A 1HEOA 135LA 1OUGA 1IC5Y 1GFRA 4XJGA 1IOCA 5II3A 1J1OY 4OWHA 4G9SA 1IWXA 1NKHA 1P2CC 1GXV2 2MEAA 2FBDA 3RNXA 1HENA 2XBSA 2XBRA 4KPMA 4G4BA 4XJDA 4A7DA 4NHPA 2ZWBA 1G7IC 1GD6A 1LJFA 1LHLA 1LZ5A 2D91A 1LSFA 3WW6A 5B1FA 2ZIJA 2ZQ4A 4DT3A 1HEMA 1UCOA 1JTPL 5KXZA 1B7RA 4LFXA 4WOAA 3BKHA 3ATOA 4H8ZA 5LYMA 2ZIKA 4LT1A 3N9EA 4DD9A 5APFA 1HEQA 1KXWA 1VEDA 1INUA 4XYYA 5KXTA 1TAYA 1GB2A 1LJHA 1LSYA 4BADA 3WXUA 1A4VA 1FLQA 1GPQC 3LYMA 4HJYA 2Z37A 2WARA 5KXRA 1B5XA 2YBJA 2ZNXY 3AJNA 4DD0A 4WL6A 1GF9A 1LSMA 4H9EA 1GEVA 5AMYA 1BGIA 4H8XA 4ZEEA 1EQ5A 3A96A 4HV1A 4LT0A 1NBYC 4TWSA 1REZA 2D4KA 3WPKA 1GFAA 4PHIA 3P68A 5LA5A 1ZV5L 2VB1A 2LYZA 4LZTA 2F30A 4WL7A 4NGOA 5KXLA 4WLDA 1LJJA 4H1PA 1UICA 5LINA 4PPOA 4RLNA 2HEEA 5I4XA 4YOPA 5KXKA 2BQKA 4RLMA 1GFEA 2PC2A 3CB7A 4KL7A 5JENB 4H9BA 2MEBA 4U3XB 1GF0A 2NWDX 4N1CC 5LIOA 2CGIA 1IWYA 2YBHA 1LSDA 4QDNA 5DLAA 4OOTA 1FKVA 1KXXA 1GF8A 1IP3A 3A91A 3CT0A 4DD1A 4GLAA 4NSGA 3P66A 1IY3A 1GAYA 1DPWA 5KXNA 2A7FA 5B07A 3VWOA 5LVKA 2BQDA 1GF4A 1ALCA 3EBAB 1REXA 3LHMA 1DKKA 1PZYA 5IDDA 4H9IA 1GB5A 4NG1A 1JHLA 4B4JA 5HMVA 3ZVQB 3M18B 1BB3A 3OJPA 4PGJB 1LZ1A 2CJLA 2YBLA 1GB0A 2Z38A 3AB6A 4GCCA 4YM8A 5I53A 3CQLA 2X0AA 1LZNA 3LYTA 1NDGC 1YAMA 2EQLA 2Y8PA 5L3HA 1DI5A 4H8YA 1LAAA 4NIJA 1YL1X 4TUNA 1OUAA 2F2NA 1HC0A 5L9JA 3LYZA 4J0LA 3B6LA 4Z98A 1BB5A 2YDGA 4G4CA 4H92A 2G4PA 3AZ4A 2BPUA 2LHMA 5C6IA 4CJ2A 1WQQA 4NSHA 5LVHA 4TTDA 4NGIA 1LZDA 154LA 3AGGG 4UWVA 1IP4A 1JJ1A 1KIRC 2LYOA 3WH1A 5KXWA 1AM7A 1GAZA 5B59A 4NWHA 1GFHA 2HUBA 4WLXA 3WUNA 5C6JA 1V7SA 2MEHA 1LJ3A 1LOZA 4TX7A 1JKCA 1HMLA 2DQHY 5FSTA 4RW2A 1UIEA 1CKGA 4WLYA 5KXYA 1FKQA 4IJ4A 4NHTA 4OW1A 1PS5A 4IASA 1A2YC 3J4GA 1JKBA 2Z2FA 3WUAA 4PRUA 1IWUA 3ZEKA 1FN5A 1G7JC 1B5ZA 1J1XY 1UIGA 4HP0A 4HPEA 2D4IA 4LYCA 1XSFA 1TEWA 2IHLA 3M3UA 208LA 1IOTA 4GLVA 4WG7A 3TXJA 3E3DA 1GE3A 1HEWA 3WU7A 1GFGA 1HERA 2Z18A 3HBHA 4W94A 1AZFA 1IWZA 1QSWA 2BQEA 3D9AC 1T3PA 1LZ8A 1BWJA 1JKAA 1RE2A 4GCFA 4KXIA 4NGVA 134LA 1NQIA 1XFPL 1LMAA 2I26L 3T36A 2CDSA 4GCDA 1IP7A 1SQ2L 2DQCY 1KIQC 4WO9A 3W6FA 1GE4A 2DQGY 2F4GA 4H94A 1F6SA 1F10A 1TDYA 4LYMA 1QTEA 2A7DA 3QNGA 3RT5X 1LZEA 2BQGA 1GF3A 2DQAA 3IWRA 4II8A 1B7OA 4B4IA 1JSEA 3TXEA 4PRQA 1C08C 1FDLY 1GF6A 3AW6A 4L41A 2YSSC 4XJHA 3QE8A 1HSXA 4IATA 5KJ9A 1IWVA 3A6CY 1B0DA 4H9CA 5DN4A 4NHIA 1D6PA 4UWNA 1GFUA 4XENA 4HTQA 1YKZX 5KKJA 6LYZA 1IC7Y 1GDWA 4OWAA 1CKCA 5LYTA 2Q0MX 4NSIA 4H9AA 4CGEA 1GBWA 1JSFA 3G3BB 3B0OA 1QTKA 5ILCA 3GXKA 4ML7A 1D0KA 1RJCB 1LHHA 1LSNA 1MELL 4W96A 3TXIA 4NGKA 5M1YA 3AZ6A 1JPOA 5LXWA 1WTMA 1H87A 3LN2A 5APCA 4HJZA 1XGRC 3KAMA 4B4EA 1UBZA 1WVUA 1O23A 2Z39A 4H9HA 5A3EA 3N9AA 3B0KA 5FEKA 5FHWA 4B0DA 4ANRA 1TCYA 4OWBA 1QIOA 3WYHA 1YKXX 1B5VA 4J7VA 1D0LA 1LJKA 2YBMA 4N8ZA 4M6DA 4GN4A 4GCBA 4WO6A 1DPXA 3A6BY 1XEJA 1LZ4A 4NGWA 4NGYA 1YROA 1CKDA 5FCPA 1BVXA 2G4NA 4C5FA 3W6DA 2EIZC 4QY9A 1B7QA 1Z55A 4Z41A 5EBHA 5HQ1A 1VAUA 1LHJA 1LMQA 1B7LA 5D5CA 4TSBA 3W6CA 1GHLA 4Z3MA 1DZBX 1GB3A 1VATA 1C10A 5A3ZA 4HPIA 5LVGA 4I0CA 3RU5A 1YANA 1B7PA 3GXRA 3TMUA 1HFYA 5D5FA 1LSBA 1JEFA 207LA 3WVYA 1JIYA 2EKSC 1EQ4A 2XTHA 1LJNA 1IP5A 4XJFA 1LYSA 5DN5A 2FYCA 1QQYA 1NBZC 2G4QA 1W08A 4WM2A 1GBYA 3MGWA 1LZAA 1T6VL 5LAFA 1HFZA 2N5ZA 5I54A 1AT6A 5IELA 3EMSA 4NHSA 1WTNA 1GBSA 4ETCA 1CJ6A 4HTKA 3W6EA 1LZSA 4B49A 1OP9B 1UIDA 1JUGA 1OUHA 3CSRA 1JWRA 3WVXA 1F6RA 1GF7A 1NHEA 2EPEA 3AYQA 4MSTA 3QY4A 4WM1A 1FLWA 1GEZA 3TXBA 1B7SA 1WQRA 3WUMA 3ZVQA 4C3WA 5B05A 1OUDA 4FJRA 1VFBC 2BQBA 3CT1A 1C45A 1GBOA 4HJVA 2Z19A 1DXJA 4CFPA 4NG8A 2YBNA 1GBXA 1AKIA 1AT5A 1LJIA 2H9KA 2DQIY 1LZ6A 1CJ8A 4I8SA 2I25L 1QDTA 4ETEA 1D9UA 5F16A 193LA 1XGTC 2BQLA 4CFOA 4GN5C 1VDQA 4G49A 1GFVA 3RW8A 3IJVA 2BAAA 3WU9A 1YAQA 2BQJA 1IVMA 1B5YA 1W6ZA 5DM9A 1BWIA 1BHZA 1OUCA 2HEDA 4WM4A 5APDA 5L3IA 3AZ5A 1N4FA 4NHQA 1J1PY 2YBIA 3A90A 5LAGA 4X3BA 2IFFY 3TXDA 1B7NA 3W6BA 3WXTA 2MEEA 3HBDA 1I20A 4NWEA 4DD3A 2C8OA 1GFKA 4ET9A 3WU8A 4EOFA 1BB6A 2LZ2A 3FI7A 5ILFA 3T6UA 1FLUA 1ZVHL 1IIZA 5FDJA 4DYGA 4ET8A 4WG1A 4WM5A 1IO5A 2MECA 2AUBA 3LZ2A 5E9RA 4N9RA 2DQJY 1RCMA 1HEPA 4OWCA 5KXOA 1QDRA 5KXPA 1DI4A 4J1AA 4MCKA 1LMTA 2CWIA 3TXGA 3A92A 5KXMA 1GXXA 3F6ZA 4N5RA 1BQLY 1CJ7A 3K3TA 4LFPA 1LZRA 3B72A 1QSAA 4NGLA 2ZQ3A 4ZIXA 1LHMA 1GE1A 1OQMA 1JJ3A 4ETBA 1FLYA 2HTXA 4LYBA 4G4HA 2XJWA 2DKVA 5K7OA 4EMNA 4J1BA 5KKIA 1BVKC 3BKVA 2FYDA 4O34A 1HMKA 1C7PA 1LHIA 5LA8A 1WQPA 1IOSA 1IP6A 1LSPA 3AGIA 4AXTA 4B1AA 1B2KA 1CNSA 5B06A 2GV0A 4GCEA 1HHLA 1B7MA 4NY5A 4BAFA 1OUJA 4DC4A 2MEIA 4YENA 4NGZA 1LSGA 1LZGA 1REMA 3A93A 1IWTA 1IY4A 3WULA 4NFVA 3TMWA 1B5UA 1CKFA 4WM3A 2LYMA 1LMPA 2F4AA 2Z2EA 3TMXA 1JKDA 3IJUA 1LSZA 1LTMA 4M4OA 1NMMA 3WMKA 2H9JA 5DL9A 1YKYX 2W1YA 4LGKA 9LYZA 3ULRA 1DKJA 1IR9A 2Z12A 5LYZA 4LYTA 2I6ZA 1LYZA 1IX0A 1XGPC 4WMGA 3P4ZA 5B1GA 4YF2A 4E3UA 1JISA 1IWWA 3P64A 4DD2A 5HLLA 1DI3A 4H93A 3A94A 1LMOA 4MR1A 3TXFA 5T3FA 4BAPA 1WQNA 1WVVA 4H9FA 1WQMA 2RSCA 1LYOA 1YILA 3TMVA 1EL1A 4XADA 6LYTA 2C8PA 1NWGA 4BS7A 194LA 1C43A 1JTTL 4DDBA 1D0MA 1DQJC 3D3DA 3EO5A 3G3AB 1G7LC 4DDCA 4WLTA 4ETAA 1LJGA 3LZTA 1IC4Y 3A67Y 1YL0X 1V7TA 1ZVYB 1VDSA 4ETDA 4HSFA 1LZ9A 1VDTA 1LCNA 132LA 1LJEA 1SLYA 2W1XA 3AZ7A 4LYOA 1F0WA 1G7HC 4UWUA 4ZFPA 3W3EA 1QUSA 1YAPA 1VDPA 1LPIA 4HTNA 4KT3A 4QEQA 1IOQA 4D9ZA 153LA 2B5ZA 1KIPC 1LZTA 1UACY 4H91A 1D6QA 1UUZC 1UIAA 1YAOA 3A3RX 1RFPA 1LKSA 4CHXA 4NGJA 1CKHA 3OK0A 4LYZA 4PJ2C 1LSCA 2BQAA 4WM6A 2DBTA 4NEBA 5HNLA 3SP3A 3J6KA 4DDAA 3CT5A 2ZYPA 5LVIA 3A95A 1CJ9A 2BQIA 1HELA 3WL2A 2HU1A 1B9OA 1IR8A 1OUIA 1G7MC 1RI8B 1XEKA 5KXXA 1H6MA 3WPJA 4N1EI 1OUEA 2BQCA 1GFJA 1GB7A 2YVBA 5IHGA 1GDXA 2BQMA 5E4PA 3P65A 3TXKA 4XJIA 2HECA 1LYYA 4Z46A 1FBIX 1IP1A 2BQFA 2BQNA 1GB8A 2HEFA 4R6CA 3RZ4A 2ZYCA 3B0IA 3EXDA 1GB6A 4XJBA 1HNLA 4H90A 4LT2A 1JJ0A 2HU3A 8LYZA 5F9UA 5HNCA 5KY1A 3W6AA 5I4YA 1HF4A 1WQOA 1LSEA 5C6LA 1LZCA 1LMCA 3A3QA 3WPLA 2LZTA 1IEEA 5HMJA 3A8ZA 2D4JA 1BWHA 2W1LA 2ZILA 4DWXA 3N9CA 2W1MA 4FDYA 1LSAA 2BLXA 1GF5A 3AGHA 2MEGA 1BB7A 3CSZA 1E8LA 4R0FA 5J7CA 3A34A 1IORA 2BQOA 1UIHA 2MEFA 2HEBA 5F81A 5I5QA 3HFMY 5FELA 1XEIA 1YQVY 4RW1A 4AGAA 1LMNA 1EQEA 1LZBA 4NSJA 1GFTA 4TSCA 2DQFC 3TXHA 3LYOA 1I1ZA 1GB9A 1C46A 5I4WA 3AW7A 2BLYA 133LA 4XN6A 5KXSA 1UIBA 3HBEX 1YIKA 1XGUC 2HEAA 1REYA 5F9XA 4DD7A 1NDMC 1GE0A 2H5ZA 4LT3A 2ZNWY 7LYZA 4GN3A 2DQEY 1HFXA 1LKRA 1GBZA 1UA6Y 4N0JA 4YEOA 4P2EA 1GWDA 5F14A 4HV2A 1UC0A 1LJ4A 2BQHA 4OOOA 1LHKA 1MLCE 4RDSA 1ZMYL 2MEDA 3ATNA 3FE0A 5LVJA 1JITA 2D6BA 5APEA 4YEMA 2FBBA 1KXYA 1I56A 4OWEA 3WW5A 1UIFA 1HSWA 3CSQA 1GE2A 1NF5A 4QGZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2OU8A 1XGQC 1B6IA 1TBYA 4OO9A 2DQDY 1B5WA 5B1FA 1QUTA 1LZYA 2RBRA 2O4WA 4OWHA 1IWXA 3RNXA 1L47A 161LA 4G4BA 3HDFA 3GUOA 3HT9A 2ZWBA 1GD6A 1LJFA 4W52A 1LSFA 2ZQ4A 1CTWA 1L03A 3C80A 1B7RA 103LA 4LFXA 1OWYA 4DD9A 1INUA 1I6SA 1LSYA 3GUPA 3WXUA 1FLQA 2WARA 1QT4A 1B5XA 4W53A 2ZNXY 1GF9A 4I7TA 165LA 4ZEEA 4HV1A 1L00A 3WPKA 1L86A 2LYZA 1C66A 4LZTA 2F30A 5KXLA 1L55A 2NTHA 1L74A 1QUDA 5JENB 2B6TA 4U3XB 2NWDX 2CGIA 5DLAA 4OOTA 1GF8A 1L58A 1CX6A 1LW9A 2Q9EA 2A7FA 3VWOA 160LA 1QS5A 1PZYA 4H9IA 2CJLA 4YM8A 258LA 2X0AA 3LYTA 1YAMA 2EQLA 2XQOA 4NIJA 162LA 1OUAA 1OVKA 2G4PA 2LHMA 5C6IA 4CJ2A 1WTHA 4TTDA 4I7OA 1IP4A 5B59A 200LA 259LA 2HUBA 2MEHA 4TX7A 251LA 2DQHY 1D3MA 1PS5A 1JKBA 2Z2FA 125LA 2ANVA 1C6TA 1L99A 1UIGA 4WO9A 1XSFA 1TEWA 2IHLA 4GLVA 3TXJA 1IOTA 3WU7A 3E3DA 1HEWA 4EKPA 1GFGA 2Z18A 2OTYX 3C82A 3D9AC 4NGVA 104LA 1BWJA 1JKAA 2I26L 1NQIA 2RB0X 1IP7A 1SQ2L 2DQCY 1KIQC 1P2LA 3NYAA 1L12A 3C8RA 1GF3A 1G1VA 1CV5A 4B4IA 1C08C 3AW6A 1L67A 2F32A 139LA 1HSXA 1C68A 3A6CY 4XENA 1YKZX 5KKJA 6LYZA 2Q0MX 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1XGQ C;  1TBY A;  2DQD Y;  1IP2 A;  1B5W A;  1BB4 A;  1OUB A;  1LZY A;  1OUF A;  1QUT A;  1JTO L;  1IR7 A;  1HEO A;  135L A;  1OUG A;  1IC5 Y;  1GFR A;  4XJG A;  1IOC A;  5II3 A;  1J1O Y;  4OWH A;  4G9S A;  1IWX A;  1NKH A;  1P2C C;  1GXV 2;  2MEA A;  2FBD A;  3RNX A;  1HEN A;  2XBS A;  2XBR A;  4KPM A;  4G4B A;  4XJD A;  4A7D A;  4NHP A;  2ZWB A;  1G7I C;  1GD6 A;  1LJF A;  1LHL A;  1LZ5 A;  2D91 A;  1LSF A;  3WW6 A;  5B1F A;  2ZIJ A;  2ZQ4 A;  4DT3 A;  1HEM A;  1UCO A;  1JTP L;  5KXZ A;  1B7R A;  4LFX A;  4WOA A;  3BKH A;  3ATO A;  4H8Z A;  5LYM A;  2ZIK A;  4LT1 A;  3N9E A;  4DD9 A;  5APF A;  1HEQ A;  1KXW A;  1VED A;  1INU A;  4XYY A;  5KXT A;  1TAY A;  1GB2 A;  1LJH A;  1LSY A;  4BAD A;  3WXU A;  1A4V A;  1FLQ A;  1GPQ C;  3LYM A;  4HJY A;  2Z37 A;  2WAR A;  5KXR A;  1B5X A;  2YBJ A;  2ZNX Y;  3AJN A;  4DD0 A;  4WL6 A;  1GF9 A;  1LSM A;  4H9E A;  1GEV A;  5AMY A;  1BGI A;  4H8X A;  4ZEE A;  1EQ5 A;  3A96 A;  4HV1 A;  4LT0 A;  1NBY C;  4TWS A;  1REZ A;  2D4K A;  3WPK A;  1GFA A;  4PHI A; 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 1GDX A;  2BQM A;  5E4P A;  3P65 A;  3TXK A;  4XJI A;  2HEC A;  1LYY A;  4Z46 A;  1FBI X;  1IP1 A;  2BQF A;  2BQN A;  1GB8 A;  2HEF A;  4R6C A;  3RZ4 A;  2ZYC A;  3B0I A;  3EXD A;  1GB6 A;  4XJB A;  1HNL A;  4H90 A;  4LT2 A;  1JJ0 A;  2HU3 A;  8LYZ A;  5F9U A;  5HNC A;  5KY1 A;  3W6A A;  5I4Y A;  1HF4 A;  1WQO A;  1LSE A;  5C6L A;  1LZC A;  1LMC A;  3A3Q A;  3WPL A;  2LZT A;  1IEE A;  5HMJ A;  3A8Z A;  2D4J A;  1BWH A;  2W1L A;  2ZIL A;  4DWX A;  3N9C A;  2W1M A;  4FDY A;  1LSA A;  2BLX A;  1GF5 A;  3AGH A;  2MEG A;  1BB7 A;  3CSZ A;  1E8L A;  4R0F A;  5J7C A;  3A34 A;  1IOR A;  2BQO A;  1UIH A;  2MEF A;  2HEB A;  5F81 A;  5I5Q A;  3HFM Y;  5FEL A;  1XEI A;  1YQV Y;  4RW1 A;  4AGA A;  1LMN A;  1EQE A;  1LZB A;  4NSJ A;  1GFT A;  4TSC A;  2DQF C;  3TXH A;  3LYO A;  1I1Z A;  1GB9 A;  1C46 A;  5I4W A;  3AW7 A;  2BLY A;  133L A;  4XN6 A;  5KXS A;  1UIB A;  3HBE X;  1YIK A;  1XGU C;  2HEA A;  1REY A;  5F9X A;  4DD7 A;  1NDM C;  1GE0 A;  2H5Z A;  4LT3 A;  2ZNW Y;  7LYZ A;  4GN3 A;  2DQE Y;  1HFX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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