1C43A

Mutant human lysozyme with foreign n-terminal residues
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
MVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Effect of foreign N-terminal residues on the conformational stability of human lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (HUMAN LYSOZYME)
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 52
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-08-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1c43A00
3A93A 1GDWA 2W1YA 3ATNA 2DQDY 1LKRA 1IX0A 4FJRA 2DQHY 2G4NA 134LA 5KXKA 2Z37A 3A95A 207LA 3QNGA 1GFEA 1P2CC 1OUBA 2CWIA 4XJGA 4QY9A 4WLYA 3TXDA 1UIBA 5LAFA 1WQNA 2BLYA 4PRQA 5FELA 1LZSA 2H9KA 3AZ4A 4HV1A 3A96A 1JJ3A 4KXIA 1D6PA 1WQMA 1GF0A 3TXGA 1VDTA 2F4GA 1BWIA 1C43A 4H94A 4OOTA 1NBZC 4NSJA 4B4JA 1UC0A 1F0WA 4EMNA 1GBSA 1YANA 4FDYA 1VFBC 1F10A 2HTXA 3AW6A 3M18B 1B5VA 1B7LA 133LA 4NHPA 1JIYA 3A92A 4NEBA 3WU9A 5IHGA 2CGIA 2YBJA 1D9UA 5FDJA 5T3FA 1AT5A 5IELA 2X0AA 4GLVA 1NF5A 1GB7A 1TAYA 1RJCB 3CSQA 2MEFA 1IOQA 4MCKA 1AKIA 1ZVHL 1XGRC 1DKKA 3RT5X 1C7PA 3M3UA 1JSFA 2F30A 1LYOA 4H91A 5DN5A 5HMJA 1CKFA 2BAAA 2ZNWY 4W96A 1TBYA 3ZEKA 153LA 1LZ4A 1HFXA 1B5ZA 1BB7A 3WVYA 1GBOA 1LPIA 1HNLA 3A3QA 1WTMA 4XADA 2LHMA 4DDBA 1IOTA 1BVKC 1V7SA 4NGYA 2LYZA 1LJFA 4ETEA 5KXTA 1QUSA 1HF4A 3TXIA 2W1MA 4XJIA 3VWOA 4H92A 2ZILA 3W6AA 1HFZA 208LA 4AGAA 1IORA 3WPLA 2B5ZA 1LZTA 1OUDA 2C8OA 3CT1A 5A3EA 4M4OA 4NHSA 2DKVA 4G4CA 4N9RA 2F4AA 4II8A 4ANRA 1LJKA 1GF5A 4XJHA 1YL0X 1ALCA 2A7FA 2ZYCA 4OOOA 5LAGA 3WH1A 3FE0A 2DQCY 4GLAA 4DD3A 1JKAA 1YAPA 2ZQ4A 4DD0A 3LHMA 4I8SA 3ATOA 4WMGA 1B7QA 1GB2A 5DN4A 1IWVA 2MEHA 4RDSA 1INUA 2HU3A 4XN6A 5LVGA 1AT6A 1GB6A 1IP5A 1CNSA 1UICA 1BB3A 1YKZX 2ZQ3A 3A3RX 3RW8A 4B4IA 5KXZA 9LYZA 5M1YA 193LA 1XGPC 3A6BY 4G4HA 3TXHA 3TXFA 1J1PY 5L9JA 1JITA 4NGJA 4WLTA 1YAQA 1LJ4A 1IWUA 4LYCA 1IY3A 1HMKA 1IC4Y 4WM5A 2MEEA 4NSHA 3TXEA 1QIOA 3AGGG 4N1CC 1LSNA 4DT3A 4WLXA 2Z2EA 1FLQA 4H1PA 4Z41A 2D4IA 3P66A 4C3WA 1NDGC 2BQGA 1FLUA 1W6ZA 4DD1A 1LMCA 1FLWA 1FDLY 1GFAA 2ZNXY 1CJ7A 3G3BB 1JTOL 1LZ6A 4NGOA 3WYHA 1GBYA 3T36A 4ZFPA 2BQMA 1JPOA 2HEDA 1FBIX 5L3IA 5LVIA 1LZ9A 1FKQA 5LA5A 5C6LA 1LZEA 3EXDA 2Y8PA 4YM8A 1GF4A 1YIKA 1OUGA 5LA8A 4BADA 3TXJA 1LZNA 1YILA 5B06A 4HTKA 1BB6A 1RE2A 4HTNA 2FBBA 2HEAA 3F6ZA 3W6BA 1UACY 1SQ2L 3QE8A 5J7CA 4NWEA 4UWUA 1LJ3A 3TMUA 5LXWA 4OWAA 1I1ZA 1G7MC 1IC7Y 4L41A 1VATA 4N1EI 5LYMA 2BQOA 1JWRA 3OJPA 1REXA 3LZ2A 4Z3MA 1REZA 3WW6A 2FYCA 1I56A 1DPXA 1IWTA 2EIZC 2ZIJA 4XJBA 1LJNA 1W08A 2N5ZA 3AB6A 2LZTA 3W6DA 5LYZA 1HSWA 1BQLY 2DQAA 5I4WA 3ZVQA 4LT0A 3IWRA 4GN5C 1LHMA 1XEIA 1A4VA 1B5UA 1LZGA 3J4GA 4MSTA 1IWYA 5LVKA 2DQEY 3BKHA 5HMVA 5F14A 1XGTC 1CJ6A 1OUAA 4NSGA 1IOSA 1NWGA 1DPWA 1B7PA 2ZWBA 5HQ1A 4ETCA 1GPQC 2CJLA 5LYTA 1IOCA 3LN2A 1LMPA 4R0FA 4TTDA 4ETDA 4YF2A 1XFPL 3HBEX 5FEKA 1GF6A 1HEOA 1HC0A 1GFGA 1LZDA 1G7LC 3A6CY 2BQFA 1GFTA 1DZBX 4DDCA 1KXWA 1B7SA 1B5XA 1HERA 3CT5A 4Z98A 4WO9A 3LYOA 4H9FA 1IP4A 2HEEA 2EKSC 3ULRA 4B1AA 1YAOA 2MEBA 4QEQA 1GE1A 1OUEA 1XEJA 3P68A 4N0JA 2EQLA 3WUNA 5JENB 2Z2FA 4DC4A 1NBYC 1GE0A 1JKCA 4TSCA 1GF8A 1OP9B 1LMTA 4CGEA 2PC2A 1LCNA 1WQOA 5LVJA 1UIFA 1REMA 2BQDA 5KJ9A 4H9CA 4WL6A 1BHZA 1JUGA 2D4KA 1C45A 1GXXA 3N9CA 5E4PA 1E8LA 5LINA 2IHLA 1LSDA 2IFFY 4OW1A 1DXJA 3G3AB 3N9AA 2AUBA 1B2KA 4NGWA 5B1GA 4RLMA 5B05A 4W94A 4DDAA 5KXLA 2MEGA 4CFOA 1GB8A 2BQAA 3CSZA 4LYZA 1GWDA 1GFRA 5EBHA 1VDQA 2HEBA 154LA 4KL7A 1UIEA 3N9EA 2D91A 2G4QA 1J1XY 4KPMA 1TCYA 4J1BA 4NGKA 1LSCA 4WO6A 4ZIXA 1AM7A 1LZYA 1TEWA 4NHQA 4G9SA 3WXUA 3P64A 4QGZA 2ZIKA 4WM2A 4WM6A 4DD2A 4YEMA 1IR9A 1DKJA 1H87A 4I0CA 1DI3A 1KIPC 4NG8A 1OUFA 4J0LA 4A7DA 1O23A 5APDA 1QDTA 1CJ9A 1QTEA 3B6LA 1GF7A 4HJVA 3WUAA 2F2NA 1UBZA 3P65A 4WOAA 2FBDA 1IY4A 1RFPA 2XTHA 4H9HA 1OUHA 1WVUA 1NMMA 4HSFA 5A3ZA 1WQPA 2MECA 4CHXA 5KXWA 4HTQA 1HEPA 3WW5A 2GV0A 3RU5A 1REYA 3KAMA 1GFUA 4YEOA 1I20A 1OUCA 3AGHA 4GCFA 1A2YC 4GN3A 1J1OY 1GE2A 3AJNA 1DQJC 4NGLA 1LHJA 3A34A 1SLYA 2ZYPA 4BS7A 3A94A 2W1LA 5FHWA 1EQ5A 5KXRA 3E3DA 1GHLA 5F9XA 1CKHA 4G4BA 4C5FA 4AXTA 1LSPA 4H90A 1IP3A 1YL1X 2D4JA 1XGQC 1UIHA 4HPEA 3WPJA 4H9BA 1G7HC 1UIAA 4YENA 5APFA 4MR1A 1LYZA 1IP6A 1HHLA 1UUZC 2I25L 4IATA 5FSTA 1IIZA 4NHIA 4WG7A 3B0IA 4XENA 1GAZA 4U3XB 1N4FA 1XEKA 1MLCE 1FN5A 4GCDA 2LYMA 2NWDX 4RW2A 3GXRA 5LIOA 1BGIA 1YAMA 1MELL 4OWEA 4B4EA 1GFJA 4NGZA 3TMXA 5I5QA 2Q0MX 4LGKA 3P4ZA 2BQHA 1LZBA 2H9JA 2Z38A 3LZTA 1IVMA 1JTTL 2BPUA 2YBHA 3AW7A 1GDXA 5HNLA 1D0LA 5D5FA 1OQMA 2YBIA 1NQIA 3LYZA 3WMKA 2XBRA 4HP0A 4YOPA 4LYMA 1VAUA 3CSRA 4TUNA 4H8ZA 3EMSA 4RW1A 1JKDA 4WL7A 5HNCA 1HEMA 1LAAA 1BWJA 1LJEA 1LSMA 1QSWA 2I6ZA 3MGWA 4NGVA 5F16A 3J6KA 1XSFA 2FYDA 2G4PA 4R6CA 3AZ6A 4X3BA 5I53A 2YBMA 3WU7A 1C10A 1HELA 3FI7A 4WLDA 5KXXA 1OUJA 5IDDA 4ET8A 3RZ4A 1C08C 3EO5A 2DQJY 1D6QA 4GCBA 5KXYA 1WQRA 1AZFA 1NDMC 1H6MA 4KT3A 4ETBA 3D3DA 5I54A 1ZMYL 1IR7A 1B5YA 1LMOA 4XJFA 5KKIA 1UIDA 1PS5A 4TX7A 1KIQC 1GFVA 5KXNA 1UIGA 6LYZA 2BQNA 4NWHA 4B49A 4NY5A 1IWZA 1LSFA 5F9UA 1JKBA 1GAYA 3SP3A 1WTNA 4BAPA 4ET9A 1LYYA 2Z39A 2BLXA 2W1XA 1D0KA 2BQLA 1GB5A 1G7JC 4E3UA 1V7TA 5KXSA 1IC5Y 3TXKA 2DQGY 4NSIA 1JISA 1GBZA 2BQBA 4LT2A 5HLLA 2H5ZA 2DQFC 2YBLA 5B07A 3AZ7A 1LOZA 4TSBA 2YSSC 2EPEA 3RNXA 5II3A 1IWWA 3W3EA 1UA6Y 4H9EA 2BQCA 1YQVY 4OWHA 1LHKA 4DD7A 1LZCA 4LFPA 1NHEA 1XGUC 1IEEA 2D6BA 1LZRA 1LZ1A 3WPKA 1JJ1A 1QQYA 3AYQA 4TWSA 1LZAA 3CQLA 1GB9A 1JTPL 3W6CA 4NHTA 5K7OA 2HUBA 5F81A 1LSGA 3A8ZA 1JHLA 4HPIA 1GBXA 1YKXX 2XBSA 2YDGA 3B0OA 1B7OA 8LYZA 1JJ0A 2I26L 3OK0A 1QTKA 4ETAA 1BB5A 1GEZA 3IJUA 1LZ8A 5KXPA 4N5RA 4NGIA 1C46A 4BAFA 3W6EA 5KY1A 3TXBA 4WG1A 1RI8B 2WARA 4B0DA 4P2EA 4DD9A 1KIRC 1GE3A 2BQIA 4LFXA 1GXV2 4WM4A 4ZEEA 4D9ZA 1ZVYB 2LZ2A 1GBWA 5L3HA 1T3PA 3WL2A 3WU8A 2RSCA 1HMLA 5D5CA 5DLAA 5B1FA 3WUMA 4CJ2A 1FKVA 1GFKA 4LYTA 2LYOA 2Z18A 5LVHA 1F6RA 4HJZA 4XJDA 132LA 1GE4A 4WM3A 4NFVA 4NIJA 2HECA 1RCMA 1GEVA 3A90A 7LYZA 3LYMA 1GF3A 4EOFA 3HBDA 1ZV5L 1LHIA 4H9IA 3AZ5A 1DI5A 3ZVQB 4XYYA 5I4XA 1D0MA 2Z12A 4OWCA 1BB4A 4GCCA 4HV2A 1IWXA 5DL9A 4Z46A 4O34A 1EL1A 4LYOA 1PZYA 1Z55A 4ML7A 3GXKA 1LSYA 2BQEA 1DI4A 4PHIA 1LJGA 3W6FA 1YROA 5APEA 2CDSA 1YKYX 1IO5A 1G7IC 2C8PA 4GN4A 1EQ4A 5KXMA 1CKCA 2YBNA 1KXXA 1CKGA 1LHLA 5APCA 2MEIA 4G49A 1IR8A 194LA 5E9RA 1VEDA 1B9OA 1WVVA 2DQIY 2YVBA 1GB0A 1CKDA 4H8XA 3A91A 3A67Y 3IJVA 5AMYA 1TDYA 4H9AA 4M6DA 1LJHA 4CFPA 1HFYA 4UWVA 4UWNA 1F6SA 5C6IA 5I4YA 3WVXA 3QY4A 2MEDA 4H8YA 1GB3A 1B0DA 5B59A 1IP1A 4HJYA 1CJ8A 1EQEA 4PJ2C 2VB1A 4J7VA 4PPOA 1LMQA 1OUIA 1LSAA 2DBTA 1B7MA 4RLNA 3B0KA 1KXYA 1LJIA 1QUTA 3BKVA 3CB7A 1GD6A 1IP7A 1HENA 4OWBA 1HSXA 2XJWA 2HEFA 4H93A 5DM9A 1GFHA 2BQKA 1VDSA 1FLYA 6LYTA 5ILFA 1HEWA 4DWXA 1LSEA 1LZ5A 1LMAA 3HBHA 1LMNA 1QDRA 4LT1A 1B7RA 4IASA 4N8ZA 1BVXA 1T6VL 1LTMA 135LA 5FCPA 5KXOA 2A7DA 4PGJB 1B5WA 4LT3A 1LYSA 4LYBA 3TMWA 2Z19A 2HU1A 1NKHA 1B7NA 1LKSA 3EBAB 4WM1A 1LSZA 2BQJA 1VDPA 3AGIA 3K3TA 1WQQA 1GF9A 3B72A 3D9AC 1JSEA 1LJJA 5ILCA 1QSAA 4DYGA 3TMVA 4J1AA 1UCOA 2MEAA 4LZTA 3HFMY 4GCEA 1HEQA 5KKJA 4PRUA 1JEFA 3LYTA 1LHHA 3WULA 1LSBA 3T6UA 1BWHA 3CT0A 4QDNA 3WXTA 5C6JA 1IP2A 4NG1A 4IJ4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GDWA 2DQDY 134LA 2Z37A 4QY9A 3TXDA 2RH1A 5FELA 1JJ3A 1G07A 3TXGA 1PQDA 1BWIA 4NSJA 4B4JA 1CU0A 3AW6A 1JIYA 5IHGA 1AT5A 2X0AA 4GLVA 1GB7A 3HTDA 3L2XA 1IOQA 4MCKA 1CX7A 1JSFA 1LYOA 5HMJA 3GUKA 2BAAA 2ZNWY 4ARQA 1L33A 3PBLA 3A3QA 2LHMA 4NGYA 2LYZA 1L80A 3VWOA 2B7XA 3WPLA 1XEPA 1P6YA 232LA 1OUDA 1L89A 5A3EA 4NHSA 2DKVA 4XJHA 1YL0X 1G0MA 5LAGA 1L95A 3FE0A 4K5YA 2ZQ4A 1C6GA 4XN6A 3GULA 1KW7A 1YKZX 3A3RX 4B4IA 189LA 1P56A 4NGJA 1L47A 1L98A 1L13A 4C3WA 165LA 122LA 4DD1A 261LA 1CUQA 4NGOA 129LA 4DKLA 1LZ9A 1FKQA 5C6LA 3DN3A 1L28A 3HT7A 1OUGA 2RB2X 5B06A 1OWZA 4HTNA 2FBBA 3F6ZA 3TMUA 1IC7Y 4N1EI 3UONA 2BQOA 158LA 2FYCA 1IWTA 4XJBA 126LA 1L02A 3W6DA 1HSWA 3HH3A 1XEIA 3J4GA 1LZGA 4MSTA 1OUAA 2RB1X 1NWGA 1B7PA 1L81A 4R0FA 4ETDA 225LA 3DMXA 3CT5A 3C82A 3C8RA 3ULRA 4B1AA 1YAOA 188LA 1GE1A 3GUOA 131LA 1JKCA 130LA 2PC2A 1WQOA 2LC9A 1REMA 2BQDA 5KJ9A 3SN6R 4E97A 2IFFY 3G3AB 1L92A 5B05A 206LA 4CFOA 3CSZA 154LA 1UIEA 1L16A 1QS9A 4WO6A 1TCYA 4J1BA 4NGKA 1AM7A 4NHQA 1QTZA 4WM2A 4YEMA 4NG8A 4I0CA 1L60A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3A93 A;  1GDW A;  2W1Y A;  3ATN A;  2DQD Y;  1LKR A;  1IX0 A;  4FJR A;  2DQH Y;  2G4N A;  134L A;  5KXK A;  2Z37 A;  3A95 A;  207L A;  3QNG A;  1GFE A;  1P2C C;  1OUB A;  2CWI A;  4XJG A;  4QY9 A;  4WLY A;  3TXD A;  1UIB A;  5LAF A;  1WQN A;  2BLY A;  4PRQ A;  5FEL A;  1LZS A;  2H9K A;  3AZ4 A;  4HV1 A;  3A96 A;  1JJ3 A;  4KXI A;  1D6P A;  1WQM A;  1GF0 A;  3TXG A;  1VDT A;  2F4G A;  1BWI A;  1C43 A;  4H94 A;  4OOT A;  1NBZ C;  4NSJ A;  4B4J A;  1UC0 A;  1F0W A;  4EMN A;  1GBS A;  1YAN A;  4FDY A;  1VFB C;  1F10 A;  2HTX A;  3AW6 A;  3M18 B;  1B5V A;  1B7L A;  133L A;  4NHP A;  1JIY A;  3A92 A;  4NEB A;  3WU9 A;  5IHG A;  2CGI A;  2YBJ A;  1D9U A;  5FDJ A;  5T3F A;  1AT5 A;  5IEL A;  2X0A A;  4GLV A;  1NF5 A;  1GB7 A;  1TAY A;  1RJC B;  3CSQ A;  2MEF A;  1IOQ A;  4MCK A;  1AKI A;  1ZVH L;  1XGR C;  1DKK A;  3RT5 X;  1C7P A;  3M3U A;  1JSF A;  2F30 A;  1LYO A;  4H91 A;  5DN5 A;  5HMJ A;  1CKF A;  2BAA A;  2ZNW Y;  4W96 A;  1TBY A;  3ZEK A;  153L A;  1LZ4 A;  1HFX A;  1B5Z A;  1BB7 A;  3WVY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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