1C63A

T4 lysozyme mutant c54t/c97a/l121a in the presence of 8 atm argon
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMAQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Size versus polarizability in protein-ligand interactions: binding of noble gases within engineered cavities in phage T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1c63A00
259LA 1L85A 1P56A 1L40A 164LA 4EKRA 1C6JA 2HULA 1I6SA 1CV1A 1SX7A 2RBSA 200LA 1C6TA 2ANVA 198LA 126LA 1L04A 191LA 1CV3A 3F9LA 142LA 2Q9EA 2ANXA 108LA 244LA 1D3NA 1PQDA 205LA 3C7WA 4I7NA 4I7PA 1T6HA 3ODUA 3SB9A 4W57A 1LI2A 2OU0X 189LA 247LA 1L59A 1G0PA 1QTBA 1L96A 1L89A 2RBNA 1L21A 1K28A 3G3VA 3HT8A 4I7JA 241LA 1L50A 1KY1A 4EKPA 224LA 119LA 2OU8A 1L44A 1QTCA 111LA 1QUHA 1SSYA 255LA 3RZEA 4I7TA 145LA 1QUDA 238LA 1SX2A 1P5CA 217LA 1PQJA 1L55A 143LA 4EJ4A 144LA 2RBQA 1QS9A 2B6WA 1CV5A 114LA 251LA 220LA 3QAKA 1ZWNA 199LA 4ZPUA 3HH3A 1C63A 1P7SA 1QTDA 1L63A 1LGWA 232LA 2OE4X 1CX7A 4W54A 3HTBA 2RBRA 1C6IA 2LZMA 6LZMA 3C81A 4W56A 253LA 1DYBA 109LA 1L84A 2B6TA 1L99A 1G1VA 1L53A 1L11A 3C83A 3FI5A 258LA 1D9WA 1L20A 1C60A 1QT6A 1LI6A 1C6DA 1D3MA 1LW9A 1G06A 4W51A 3GUKA 4YXAC 209LA 1OVKA 3VW7A 1L30A 1PQKA 1G0LA 174LA 138LA 1L24A 3HH6A 1L87A 246LA 2RB0X 1C6AA 262LA 221LA 192LA 195LA 1L28A 2B7XA 1CVKA 2B6ZA 3JR6A 166LA 3C82A 3HDFA 1LLHA 1PQMA 128LA 1CU3A 180LA 7LZMA 3D4SA 3NY8A 4LDEA 1L33A 1XJTA 243LA 1L34A 110LA 1NHBA 226LA 1KW5A 1P64A 4W58A 3HT9A 175LA 1G0QA 1L00A 1L19A 3L2XA 2O4WA 2L78A 1OV5A 1LI3A 4EXMA 4EKSA 1QTZA 171LA 1OWZA 3OE0A 152LA 1DYAA 1QTVA 1L01A 1L76A 3DN1A 1XJUA 1CUPA 1QUGA 1C6EA 3HU9A 4LDLA 2LCBA 1L16A 3GUNA 1CU5A 1CU6A 1XEPA 1L82A 1G0MA 2RB2X 215LA 1L75A 2OE7X 183LA 1B6IA 1LWKA 1L56A 1C69A 2B74A 1L12A 248LA 102LA 1CV6A 123LA 1D3FA 1JQUA 1L0KA 1L45A 1P6YA 1L64A 4I7MA 3HUAA 234LA 1G0GA 3DN2A 1KNIA 176LA 1L38A 125LA 5LZMA 1QT5A 3OE8A 1L03A 1L83A 1L65A 250LA 2O79A 3CDQA 1C6MA 1QT4A 115LA 127LA 1LWGA 1QSBA 1G07A 2B73A 1LYJA 113LA 4DKLA 1D2WA 1L14A 223LA 2F2QA 1L37A 150LA 4I7OA 4AQNA 3HT7A 1LGUA 177LA 1C6BA 151LA 3HUQA 3K2RA 1C65A 260LA 1OV7A 141LA 3OE6A 1L05A 137LA 168LA 4I7LA 1L90A 3SB8A 1L77A 245LA 173LA 3DMXA 4E97A 1C61A 3GUOA 3L64A 131LA 3FADA 3PBLA 3SN6R 2OE9X 1L73A 3HTDA 4PJZA 4W53A 1L13A 3DMZA 4EPFA 3DN4A 1QTHA 1OWYA 1L17A 3HH5A 1L60A 155LA 3FA0A 1L68A 2RBPA 184LA 2B6YA 1OVHA 188LA 3HWLA 1L25A 107LA 3CDTA 1L79A 1KS3A 2NTGA 1LYFA 2RAYX 1L48A 1PQOA 4GRVA 4ARMA 1L23A 3DKEX 1L09A 4IAPA 4DJHA 4YX7C 1L57A 1L35A 1C66A 2LC9A 1P3NA 1P36A 140LA 3C7ZA 3GUJA 212LA 211LA 122LA 1LYDA 1L70A 163LA 3C8SA 3GULA 3DNAA 1G0KA 4PK0A 4S0WA 1L58A 242LA 2Z6BA 1L07A 1L47A 1L41A 1L54A 231LA 3SB6A 1QT8A 219LA 1L95A 1SWZA 235LA 249LA 256LA 227LA 4DAJA 4W55A 3C7YA 5I14A 1P2RA 1T97A 197LA 1CV0A 1L91A 2NTHA 1L98A 190LA 1L86A 167LA 218LA 4W59A 4ARQA 172LA 165LA 206LA 1C68A 139LA 1L46A 1LYIA 1L61A 3DN6A 3OE9A 3HUKA 1CUQA 1T8AA 169LA 2F32A 229LA 222LA 1DYFA 257LA 4I7QA 130LA 3NYAA 1C6QA 3UONA 2CUUA 2A4TA 2RB1X 1L71A 1L92A 1C6LA 1KY0A 1CTWA 1OYUA 2OU9A 4LZMA 1L18A 157LA 2RH1A 1L49A 210LA 2B70A 3C8RA 185LA 1ZYTA 182LA 158LA 4I7RA 1P46A 1P37A 2OTZX 2QB0B 3V2YA 1CX6A 1L0JA 1C6PA 1QS5A 233LA 213LA 4YXCA 261LA 2Q9DA 1L22A 161LA 3LZMA 4ARJA 3DN3A 103LA 3GUPA 201LA 1L29A 2RAZX 3SB7A 1TLAA 1C67A 1L31A 1EPYA 2B72A 1C6HA 4ARMB 2B6XA 1L39A 3HTFA 162LA 1QT7A 4OO9A 1CU2A 1L66A 1LPYA 3SBBC 1C6GA 1JTNA 230LA 3HT6A 178LA 1C64A 1QSQA 216LA 3SB5A 1JTMA 236LA 2B75A 1CU0A 1C6CA 1G1WA 3GUMA 4I7KA 1L32A 3SBAA 2OEAX 239LA 225LA 3CDVA 3DN0A 1DYCA 3HDEA 1CV4A 1L26A 156LA 1L97A 1L93A 1L36A 1KW7A 160LA 3HH4A 4I7SA 1L52A 1L15A 1T8GA 2HUKA 1L72A 4ARLA 1D3JA 3DMVA 1LGXA 2HUMA 1SSWA 112LA 1T8FA 4ARQB 1L51A 3HTGA 2OTYX 237LA 187LA 186LA 1G0JA 1L10A 146LA 1L62A 1L88A 4ARPA 1L94A 1QUOA 4LDOA 1L06A 1DYDA 3CDOA 148LE 1WTHA 2O7AA 1SWYA 120LA 1C6NA 129LA 4W52A 1L42A 1D2YA 1PQIA 1L27A 1L80A 1L81A 1LYEA 2RBOA 4GBRB 2F47A 4EKQA 181LA 3PDSA 3V2WA 104LA 1QT3A 1LYHA 1L02A 254LA 2IGCA 1P2LA 118LA 3DN8A 1L69A 1L08A 4K5YA 3C8QA 3CDRA 3HU8A 1ZURA 170LA 3G3WA 3EMLA 3GUIA 149LA 1C6FA 2QARC 3C80A 3G3XA 1C62A 1DYGA 1L74A 159LA 3NY9A 252LA 214LA 228LA 1OVJA 1C6KA 3F8VA 4EPIA 1L67A 1DYEA 1L43A 147LA 1LYGA 196LA 240LA 3RUNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
259LA 4B4EA 5LVKA 3CSQA 1G7JC 1C6JA 1CV1A 1SX7A 200LA 4TUNA 1C6TA 4LFXA 1CV3A 4NIJA 2Q9EA 5FDJA 2ANXA 1E8LA 1D3NA 1LJHA 2YBJA 3C7WA 1F6SA 1IY4A 4KT3A 3ODUA 1JKCA 4NSGA 3WPKA 3SB9A 1G0PA 1WQNA 2RBNA 3G3VA 1KY1A 4NGYA 1BB6A 2CGIA 1QTCA 111LA 4CJ2A 4WLXA 1B2KA 255LA 1ZV5L 4HJVA 1RFPA 3N9AA 1GFRA 217LA 1L55A 4EJ4A 4TTDA 2H5ZA 1YAMA 3HFMY 1C10A 1ZWNA 199LA 1XGPC 4H93A 1P7SA 3ATOA 1CX7A 4ETAA 2W1MA 4G4CA 6LZMA 1JIYA 3C81A 4W56A 1ZVYB 5LA8A 1L11A 1NKHA 3C83A 6LYZA 3LYMA 4W51A 3GUKA 4H94A 1OVKA 1LYSA 2A7DA 1GDXA 1IP3A 4RLNA 133LA 262LA 192LA 3CB7A 2B6ZA 166LA 3HDFA 5C6LA 3WXUA 128LA 180LA 1KXXA 2MEBA 2DQHY 3A94A 2ZWBA 1NHBA 226LA 1INUA 175LA 2YBMA 5DLAA 4NG1A 2O4WA 5HMJA 2L78A 4ET8A 4EKSA 1OWZA 4LT0A 4U3XB 3WXTA 4I0CA 4H9EA 4XJDA 3DN1A 1IOTA 1LKRA 1CUPA 4H90A 5LINA 1IOCA 5B1GA 3AB6A 4DDBA 2Z2FA 1BB7A 3EMSA 1IO5A 1CU6A 1GF3A 1G0MA 2RB2X 2OE7X 1LWKA 3M18B 1LSBA 1YKZX 2W1YA 4NWHA 1B7OA 2Y8PA 2B74A 1L12A 1CV6A 3A95A 1JQUA 1L0KA 4MSTA 1UA6Y 1L64A 4HPEA 4I7MA 1LJKA 1REMA 1D0MA 1KNIA 1XGUC 1L38A 4GN4A 3OE8A 1BVKC 1C6MA 1GF0A 3HBHA 127LA 1LWGA 4H8XA 1LYJA 113LA 3RZ4A 1L14A 4EMNA 1L37A 4AQNA 1LOZA 2F30A 177LA 2MEHA 1MELL 2ZIJA 5JENB 1IR7A 1GF8A 137LA 5J7CA 1DPWA 1L90A 4H1PA 2XQOA 1C61A 1OUFA 3SN6R 1L73A 3IJVA 4EPFA 1UACY 5L3HA 4GLAA 1L68A 3WUAA 2B6YA 1OVHA 4W96A 1WTNA 1LYFA 2RAYX 1PQOA 4GRVA 3MGWA 4YX7C 1JKBA 1P36A 2LHMA 1GBOA 1GFVA 5KXNA 1GFAA 4PK0A 1I20A 4XYYA 3CT0A 3WULA 1QSAA 231LA 4NSIA 3WVYA 1LSPA 5ILFA 3WPLA 1WVVA 4NGLA 4W59A 3WMKA 172LA 165LA 206LA 1C68A 1IWWA 1OUAA 2HUBA 4DDAA 194LA 1A4VA 1BWJA 1HSWA 2F32A 3WUMA 4B0DA 2CUUA 2A4TA 1LZAA 1L71A 1C6LA 5B06A 4N5RA 1HFXA 5FCPA 5F81A 1B7PA 2FBDA 3CSZA 1GXV2 1L49A 210LA 2B70A 3AYQA 1BWHA 1P37A 4XADA 5HLLA 2OTZX 4HPIA 2QB0B 3V2YA 1CX6A 1C6PA 2YDGA 5KJ9A 1LJNA 5DM9A 1L22A 4WLDA 1WQQA 3GUPA 1QTEA 2EQLA 1TLAA 1GAYA 4ETEA 2Z19A 2B72A 4ARMB 1XFPL 2VB1A 162LA 135LA 1IP4A 5KXSA 1CU2A 1GFTA 1C6GA 1QUTA 1C64A 4GCEA 4H8ZA 1C6CA 1G1WA 1I1ZA 1FDLY 2Z39A 1JWRA 2MEAA 3CDVA 4DT3A 4ETCA 4DDCA 1OUEA 3P66A 3HDEA 1AM7A 3WL2A 4N8ZA 1L36A 1UIEA 4MR1A 4DD0A 1UBZA 1LSNA 1LGXA 3SP3A 2HUMA 4NHTA 1SSWA 112LA 4ARQB 1L51A 5KY1A 1LZGA 1GHLA 3W6DA 187LA 1OUDA 1FLQA 1QDRA 1LZDA 4YEOA 5B07A 5LIOA 1L88A 4WLYA 4A7DA 1QUOA 2LZ2A 4DWXA 134LA 4H9IA 1B9OA 148LE 2O7AA 1PQIA 5KXRA 1GE4A 4GBRB 2F47A 4EKQA 181LA 104LA 1WVUA 1LHIA 2IGCA 3DN8A 1T6VL 3C8QA 1BWIA 1KXYA 4BADA 4GCFA 1C6FA 4WMGA 3C80A 3G3XA 1B5UA 252LA 1TEWA 1GBYA 1BGIA 5C6IA 5KXXA 1L67A 3A3RX 2BLYA 188LA 3TXGA 4OWCA 1L85A 1P56A 1L40A 1G7IC 4EKRA 1B7QA 153LA 4FDYA 2ANVA 132LA 1EQEA 4LYMA 205LA 4CHXA 1UC0A 1JSEA 3BKVA 2AUBA 2D4KA 4NEBA 189LA 1GBXA 1LZYA 1GB3A 1C46A 1I56A 2MECA 1GF7A 1AT5A 4G4HA 1XGRC 3TXHA 5AMYA 1FKQA 1QUHA 1YL0X 1UIDA 2C8PA 1C7PA 1QUDA 2BQKA 4H8YA 1GBSA 1LMOA 4P2EA 4TWSA 5M1YA 1VDQA 4LYOA 2ZIKA 1W6ZA 2H9JA 2B6WA 4GLVA 1G7HC 1CV5A 1J1XY 1VATA 1QUSA 1GF4A 2X0AA 251LA 5B59A 220LA 1GB8A 4IJ4A 5E4PA 4G4BA 1L63A 2Q0MX 3B6LA 232LA 4XJIA 1WQRA 1YROA 1Z55A 4W54A 3HTBA 1C6IA 3W6BA 5KXOA 109LA 4E3UA 1L99A 1L53A 2ZYCA 3FI5A 1YAOA 1C60A 1QT6A 4RW1A 1LI6A 2GV0A 2YVBA 1D3MA 1LW9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 259L A;  4B4E A;  5LVK A;  3CSQ A;  1G7J C;  1C6J A;  1CV1 A;  1SX7 A;  200L A;  4TUN A;  1C6T A;  4LFX A;  1CV3 A;  4NIJ A;  2Q9E A;  5FDJ A;  2ANX A;  1E8L A;  1D3N A;  1LJH A;  2YBJ A;  3C7W A;  1F6S A;  1IY4 A;  4KT3 A;  3ODU A;  1JKC A;  4NSG A;  3WPK A;  3SB9 A;  1G0P A;  1WQN A;  2RBN A;  3G3V A;  1KY1 A;  4NGY A;  1BB6 A;  2CGI A;  1QTC A;  111L A;  4CJ2 A;  4WLX A;  1B2K A;  255L A;  1ZV5 L;  4HJV A;  1RFP A;  3N9A A;  1GFR A;  217L A;  1L55 A;  4EJ4 A;  4TTD A;  2H5Z A;  1YAM A;  3HFM Y;  1C10 A;  1ZWN A;  199L A;  1XGP C;  4H93 A;  1P7S A;  3ATO A;  1CX7 A;  4ETA A;  2W1M A;  4G4C A;  6LZM A;  1JIY A;  3C81 A;  4W56 A;  1ZVY B;  5LA8 A;  1L11 A;  1NKH A;  3C83 A;  6LYZ A;  3LYM A;  4W51 A;  3GUK A;  4H94 A;  1OVK A;  1LYS A;  2A7D A;  1GDX A;  1IP3 A;  4RLN A;  133L A;  262L A;  192L A;  3CB7 A;  2B6Z A;  166L A;  3HDF A;  5C6L A;  3WXU A;  128L A;  180L A;  1KXX A;  2MEB A;  2DQH Y;  3A94 A;  2ZWB A;  1NHB A;  226L A;  1INU A;  175L A;  2YBM A;  5DLA A;  4NG1 A;  2O4W A;  5HMJ A; 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