1CU6A

T4 lysozyme mutant l91a
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSADAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Methionine and alanine substitutions show that the formation of wild-type-like structure in the carboxy-terminal domain of T4 lysozyme is a rate-limiting step in folding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1cu6A00
241LA 5LZMA 120LA 1QSQA 1C67A 2B75A 6LZMA 222LA 187LA 1L93A 1C6CA 1L10A 1L06A 255LA 1L73A 1G06A 125LA 3SB7A 1L97A 1L09A 4EPIA 1L22A 1P7SA 4LZMA 236LA 1C6HA 1L15A 1L65A 1L84A 1DYGA 1DYFA 1C6GA 186LA 4EPFA 3HT8A 2RB1X 1L40A 1L12A 1XJTA 234LA 151LA 5I14A 3HDFA 1L20A 1OVJA 1P3NA 144LA 242LA 2B74A 4YXAC 211LA 2OTZX 1LI3A 1C6TA 1L00A 2OE7X 185LA 1CVKA 3RUNA 4OO9A 115LA 206LA 1KY1A 3SB9A 173LA 3FA0A 2B6WA 3DN2A 4I7SA 188LA 3G3VA 1SWYA 1L68A 1G0QA 1D3FA 212LA 1L47A 3SBBC 1L38A 198LA 3NYAA 4I7NA 1L90A 1SSWA 4GRVA 1SWZA 1L0JA 1CV5A 3C83A 1L54A 1G0LA 3V2YA 1L19A 108LA 252LA 4EKSA 1L17A 140LA 3LZMA 4W59A 126LA 181LA 1CU3A 1P46A 1L27A 2B6XA 2NTHA 1L42A 1D9WA 1P64A 3G3XA 3HWLA 4ARLA 1QTHA 1CTWA 1G1WA 1L36A 1TLAA 3C7WA 4PK0A 2IGCA 1C60A 220LA 1L21A 2CUUA 156LA 1P36A 3HH3A 114LA 2LZMA 176LA 4LDOA 167LA 1L81A 3PDSA 159LA 1L04A 4W52A 1L08A 1NHBA 1G0PA 245LA 1L45A 4W56A 1L71A 3GUNA 3HTBA 4I7OA 2B6TA 1KW5A 3SB5A 3C81A 164LA 1L01A 2RBOA 1L96A 1CV0A 231LA 4W55A 1C6IA 1T8AA 4I7JA 4IAPA 1L58A 191LA 1PQMA 1QT6A 157LA 3L64A 3C7ZA 177LA 2B6YA 3DMVA 1L48A 3DN3A 1ZURA 162LA 1L55A 3HT7A 4EKRA 149LA 1PQJA 3OE8A 4ARQA 118LA 1T8GA 2ANXA 2OU0X 1QUGA 1P37A 171LA 109LA 1L99A 249LA 3G3WA 1QUOA 3SBAA 2NTGA 1CU2A 1ZWNA 1G0JA 4LDLA 4I7KA 3DN4A 1QT4A 1L79A 150LA 178LA 213LA 103LA 1L13A 166LA 2HUMA 2LC9A 112LA 1KY0A 3D4SA 209LA 1DYBA 139LA 1L69A 1L86A 3CDQA 3QAKA 1LYGA 2RBQA 4DJHA 1LGWA 1L89A 1L46A 1L26A 1L32A 1L70A 3SB8A 143LA 1L57A 3C82A 226LA 205LA 192LA 2OEAX 1L0KA 1OWZA 1L44A 3HU8A 225LA 250LA 1I6SA 1OYUA 1C6NA 262LA 4PJZA 1LI2A 1C6JA 1C66A 259LA 1P6YA 1JQUA 1QUDA 2A4TA 3NY8A 1C64A 1C6PA 240LA 215LA 3DMXA 1D3MA 4S0WA 2Q9EA 145LA 256LA 1C61A 1DYEA 3DMZA 3L2XA 235LA 1L50A 1C6BA 1C6LA 200LA 1L24A 104LA 1L62A 1L67A 1L92A 1LYEA 210LA 1C68A 3GUKA 1L74A 3C8RA 1CU0A 2B72A 1C6FA 161LA 184LA 2OE4X 2RH1A 199LA 129LA 4ARMA 251LA 2RAYX 3CDVA 257LA 1K28A 260LA 1LLHA 1QT3A 1G0KA 1DYAA 4W54A 1WTHA 3HUKA 168LA 1QSBA 1L80A 4I7RA 1L94A 197LA 3EMLA 3HUQA 2QARC 1L77A 1L53A 3C8SA 2O79A 3OE6A 113LA 1P2RA 1QT7A 3CDRA 123LA 2L78A 1DYDA 137LA 1C6AA 3PBLA 1C6KA 1CX6A 254LA 2RB0X 224LA 2HUKA 237LA 3HTGA 1L02A 1C62A 1L28A 1KW7A 3HDEA 1QS5A 4I7TA 4YXCA 4GBRB 174LA 3RZEA 1DYCA 1ZYTA 163LA 1B6IA 102LA 230LA 1L76A 2B6ZA 1T6HA 2F2QA 2RBPA 4W57A 4YX7C 4I7MA 1G0GA 1L49A 1L60A 3CDOA 258LA 248LA 1CV1A 223LA 1SX2A 1PQOA 4DAJA 190LA 3HTFA 217LA 1QTVA 1L82A 1L51A 1L07A 4W58A 1C65A 1L23A 3HU9A 216LA 111LA 1LYJA 2B73A 3NY9A 180LA 1C6QA 4W53A 1L05A 4ARJA 2QB0B 1CV4A 1L63A 3OE0A 1KS3A 107LA 3DNAA 1L03A 3SB6A 3JR6A 1L25A 1G1VA 1L83A 1LYFA 1LYIA 1L37A 2F32A 141LA 1L75A 2ANVA 4ARQB 1G0MA 3HH6A 1QS9A 4EXMA 128LA 1T97A 3VW7A 201LA 7LZMA 1L41A 243LA 1L56A 2Z6BA 1L18A 1L29A 2RBRA 229LA 221LA 169LA 3DKEX 175LA 1C6MA 1L31A 1L88A 1PQDA 1JTMA 1LYDA 246LA 2F47A 3ODUA 3GUOA 155LA 1CV3A 2OTYX 1XJUA 1T8FA 233LA 3UONA 1G07A 1P5CA 1PQKA 3HT6A 2RB2X 1L35A 1LWKA 2B7XA 1EPYA 4W51A 122LA 196LA 2OU9A 3F8VA 1QT8A 3GULA 1L34A 3DN6A 1L16A 147LA 1CUQA 148LE 1L72A 1L14A 2RBNA 1L87A 195LA 1L85A 3GUJA 2O7AA 3HH5A 1QTDA 238LA 1LGUA 1LGXA 3FADA 3C8QA 2LCBA 3CDTA 1D3JA 4K5YA 4LDEA 1P2LA 3HH4A 3FI5A 138LA 182LA 1L39A 3DN8A 1D3NA 4DKLA 158LA 1CV6A 3HTDA 1PQIA 232LA 239LA 1LI6A 1LPYA 1L98A 2Q9DA 1C6DA 1CX7A 227LA 1OV5A 119LA 1JTNA 3DN1A 3GUMA 4I7LA 152LA 4EKPA 1QTCA 1KNIA 1L52A 253LA 1OWYA 1CU5A 3K2RA 218LA 3OE9A 1L30A 244LA 1LW9A 1SSYA 130LA 1QTBA 1QT5A 1OV7A 3C7YA 4ARMB 3C80A 1L11A 1OVHA 4ARPA 2HULA 4E97A 110LA 165LA 172LA 1L95A 3HUAA 3HT9A 189LA 1P56A 4AQNA 1SX7A 1L33A 183LA 261LA 2OU8A 1D2WA 3DN0A 1LYHA 2O4WA 4I7QA 4EJ4A 1L59A 160LA 127LA 2B70A 3GUPA 1L61A 3GUIA 1L91A 1C63A 1QUHA 1L64A 2RBSA 1L43A 170LA 2OE9X 214LA 219LA 1CUPA 1QTZA 1D2YA 247LA 131LA 1CU6A 4EKQA 1OVKA 142LA 3SN6R 1XEPA 1C6EA 228LA 4ZPUA 4I7PA 146LA 1L66A 1LWGA 2RAZX 1C69A 3F9LA 3V2WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5IELA 241LA 120LA 222LA 187LA 1HNLA 1UA6Y 3WVYA 1KXYA 4ANRA 1BB6A 1WVVA 2LYMA 236LA 4MCKA 3W6FA 1LOZA 1L84A 1PS5A 1UCOA 4AXTA 186LA 1W6ZA 2FBDA 1B7MA 3F6ZA 5L9JA 4XJFA 1GB5A 4NFVA 1L40A 1LHIA 4LT2A 1L12A 5APEA 5I14A 3HDFA 4YXAC 1OUEA 1YAPA 4HV2A 4PPOA 3N9CA 1L00A 3TXFA 2DQFC 4OO9A 4QEQA 4N1CC 4DD7A 3FA0A 4I7SA 1GDWA 1AT6A 5M1YA 1D3FA 2DQDY 4NEBA 5DN5A 1LZBA 4J1AA 1L47A 3LN2A 3SBBC 4NIJA 1HEOA 1HF4A 4GRVA 4WMGA 3WXUA 3ULRA 1LHLA 1L17A 3WUAA 1GBXA 4W59A 4GCFA 4ARLA 1D9WA 3AGHA 1G1WA 3C7WA 4MR1A 156LA 1P36A 4WG7A 1LJ3A 1LTMA 2LZMA 4GCEA 1L81A 4HSFA 1GAYA 159LA 3GUNA 1L71A 2DQJY 2B6TA 3C81A 1L01A 2RBOA 1CV0A 231LA 1NHEA 3B0KA 1IWZA 157LA 1HEQA 3HT7A 4EKRA 1PQJA 1OUCA 1B7RA 1QUGA 1L99A 5LA8A 4J7VA 2NTGA 1CU2A 1UIHA 4TSCA 4NGKA 1RI8B 4I7KA 1F10A 4NGOA 1B7PA 1IP7A 1QT4A 1QUTA 1WQRA 2BQJA 1C45A 1GDXA 213LA 3A3RX 1LPIA 2HEBA 2HUMA 1LKRA 4QDNA 2XBSA 6LYTA 4H92A 1LJHA 4G4BA 1IR9A 2FBBA 3QAKA 3M18B 2BQKA 1L89A 1L26A 1UIGA 4NG8A 2AUBA 1LZSA 225LA 4H9BA 4Z3MA 262LA 3D9AC 4PJZA 1LI2A 1C6JA 1OQMA 1YILA 1LSYA 2NWDX 1JQUA 2A4TA 3LHMA 1C6PA 4S0WA 4ETCA 4E3UA 4YEOA 2Q9EA 145LA 1IWVA 1QUSA 1C61A 4ET9A 3L2XA 1HEPA 1L50A 1KIRC 1UICA 4M4OA 4XN6A 1JIYA 4DQ7A 4DQJA 1L92A 3WXTA 1L74A 3D3DA 4XYYA 2BQMA 3C8RA 1LZ6A 2YSSC 2OE4X 5FSTA 3WYHA 2D6BA 3WPLA 1DI3A 4ARMA 5LVJA 2RAYX 4GN4A 4H8ZA 257LA 2BQIA 4H93A 1B0DA 1QT3A 2HEDA 4TSBA 3HUKA 3LYZA 2HEEA 1L94A 4AGAA 197LA 2EKSC 5LVIA 1L77A 4HP0A 2O79A 3HBHA 4N9RA 2XBRA 5FDJA 4NGYA 254LA 3P4ZA 3HTGA 2BQHA 1L28A 2C8PA 2YBLA 2PC2A 4GBRB 1LMCA 4LYZA 4YXCA 4WLTA 2ZQ4A 174LA 3RZEA 102LA 230LA 2B6ZA 3TXJA 1G0GA 1L49A 4NGLA 2VB1A 1CV1A 1SX2A 4H1PA 1OUIA 2A7DA 4DD1A 1LZ9A 2G4NA 4W58A 4HJYA 111LA 3NY9A 2DQGY 2QB0B 1LSFA 1I20A 3OE0A 4RDSA 4NGZA 4B4EA 4G4HA 5KXNA 5JENB 2EIZC 4WOAA 2DQIY 1L37A 2F32A 2BQAA 141LA 4WLYA 1G0MA 1KIPC 4NGWA 1BWHA 1L41A 1GBYA 2W1LA 4PRQA 2RBRA 4OWEA 229LA 1HEMA 1C6MA 1L31A 1RE2A 2F47A 4IASA 2Z2EA 3WL2A 2I26L 3UONA 1P5CA 2RB2X 1LWKA 1EPYA 1JJ0A 4LYOA 122LA 4LYBA 1XGTC 1QT8A 1FKQA 1L16A 1J1OY 2B5ZA 3EO5A 1HSWA 1IOSA 1JKDA 1UACY 4NHPA 3LYOA 1LZ5A 1GWDA 3AYQA 3HH5A 1AZFA 5I4YA 2HEFA 3GXKA 1D3JA 4NWEA 5KXKA 4K5YA 138LA 3HTDA 1LHHA 3TXKA 1CX7A 1GE4A 1OV5A 1JTNA 3A95A 1NBZC 4I7LA 5KXMA 194LA 3LYTA 4EKPA 5LVHA 4LFPA 1KNIA 253LA 1GFEA 1B5XA 1IO5A 1Z55A 4N5RA 4GLAA 1OV7A 2YBNA 4ARMB 4FJRA 2HULA 3AGIA 1L95A 2ZIKA 5HNCA 2RSCA 1P56A 1LYHA 4WO9A 127LA 3CSQA 2B70A 1QUHA 1L64A 2RBSA 2OE9X 3AZ5A 5LA5A 3CB7A 1O23A 2ZNWY 247LA 131LA 1CU6A 1I56A 4N1EI 1WTNA 2CDSA 4NHTA 1L66A 2Z2FA 5LZMA 1C67A 1GB7A 2B75A 2EQLA 4CHXA 1C6CA 1JPOA 1BB5A 1TAYA 1DI5A 4YF2A 1LHJA 3SB7A 1L97A 1LYZA 1L22A 1IWYA 1QDRA 2BAAA 1DKJA 4IATA 1QIOA 1C6HA 4LT0A 1C6GA 5L3IA 3HT8A 4OOTA 4KT3A 5APDA 2BLYA 1XJTA 5HNLA 1JISA 4B1AA 234LA 1L20A 3A92A 211LA 2OTZX 1LI3A 1C6TA 1GF7A 115LA 1KY1A 173LA 4XADA 3CSZA 5B06A 188LA 1LSBA 3AZ4A 1SWYA 3G3VA 4EMNA 3A93A 1IP3A 2BLXA 1J1XY 1NMMA 212LA 1WVUA 1XGQC 1L38A 198LA 4NSIA 1D9UA 2W1XA 1SWZA 1GE2A 1PZYA 252LA 4EKSA 1T6VL 3LZMA 126LA 2NTHA 3HWLA 4NHQA 1L42A 2D91A 1CTWA 1D6PA 2C8OA 2CUUA 5KY1A 3HH3A 114LA 3TXIA 4LDOA 167LA 1REYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5IEL A;  241L A;  120L A;  222L A;  187L A;  1HNL A;  1UA6 Y;  3WVY A;  1KXY A;  4ANR A;  1BB6 A;  1WVV A;  2LYM A;  236L A;  4MCK A;  3W6F A;  1LOZ A;  1L84 A;  1PS5 A;  1UCO A;  4AXT A;  186L A;  1W6Z A;  2FBD A;  1B7M A;  3F6Z A;  5L9J A;  4XJF A;  1GB5 A;  4NFV A;  1L40 A;  1LHI A;  4LT2 A;  1L12 A;  5APE A;  5I14 A;  3HDF A;  4YXA C;  1OUE A;  1YAP A;  4HV2 A;  4PPO A;  3N9C A;  1L00 A;  3TXF A;  2DQF C;  4OO9 A;  4QEQ A;  4N1C C;  4DD7 A;  3FA0 A;  4I7S A;  1GDW A;  1AT6 A;  5M1Y A;  1D3F A;  2DQD Y;  4NEB A;  5DN5 A;  1LZB A;  4J1A A;  1L47 A;  3LN2 A;  3SBB C;  4NIJ A;  1HEO A;  1HF4 A;  4GRV A;  4WMG A;  3WXU A;  3ULR A;  1LHL A;  1L17 A;  3WUA A;  1GBX A;  4W59 A;  4GCF A;  4ARL A;  1D9W A;  3AGH A;  1G1W A;  3C7W A;  4MR1 A;  156L A;  1P36 A;  4WG7 A;  1LJ3 A;  1LTM A;  2LZM A;  4GCE A;  1L81 A;  4HSF A;  1GAY A;  159L A;  3GUN A;  1L71 A;  2DQJ Y;  2B6T A;  3C81 A;  1L01 A;  2RBO A;  1CV0 A;  231L A;  1NHE A;  3B0K A;  1IWZ A;  157L A;  1HEQ A;  3HT7 A;  4EKR A;  1PQJ A;  1OUC A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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