1CX7A

T4 lysozyme methionine core mutant
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKMKPVYDSMDAVRRAAMINMVFQMGETGVAGFTNSMRMMQQKRWDEAAVNMAKSRWYNQTPNRAKRVITTMRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Use of differentially substituted selenomethionine proteins in X-ray structure determination.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1cx7A00
1K28A 1C66A 3HH5A 1QT8A 3CDRA 4I7SA 221LA 1L71A 1LI6A 1L67A 4EPFA 4EPIA 1L94A 4W56A 2B6XA 2QARC 1LWKA 155LA 3SN6R 144LA 1CV4A 4W53A 184LA 1P36A 1C60A 1C6AA 2LZMA 1PQOA 233LA 1L14A 3HTDA 1L49A 191LA 217LA 2QB0B 3GUPA 3SBBC 3HT6A 1KNIA 1D2WA 238LA 1L28A 1C67A 1L77A 167LA 2B6YA 4LZMA 1SSWA 1L30A 1C69A 1L39A 1CUPA 1L06A 1SSYA 2OE7X 4ARMB 1QS9A 1L54A 1L83A 1LLHA 4ARMA 1L0KA 200LA 152LA 1L31A 3DN8A 1L68A 261LA 1L53A 4DKLA 2NTGA 2RB1X 3DMXA 205LA 7LZMA 1L11A 1L21A 4YXAC 4I7RA 1LYDA 4E97A 2F2QA 1T8AA 168LA 2OU9A 3K2RA 126LA 3HTBA 1NHBA 232LA 118LA 3GULA 254LA 1SX2A 1C6CA 1L08A 3HUKA 1L33A 4I7JA 1L58A 2OEAX 225LA 4I7OA 1L36A 1L92A 104LA 177LA 1G0JA 2B74A 257LA 174LA 3G3VA 1PQKA 227LA 139LA 1LI2A 2RAYX 4EKSA 1D2YA 1L44A 2B75A 1XEPA 1C64A 2B70A 110LA 3DN6A 4ARLA 2LCBA 1L47A 250LA 1LPYA 1P5CA 1XJUA 1L86A 1L19A 4W54A 1OYUA 3UONA 111LA 3HH3A 3HUAA 3OE9A 1L91A 3L64A 147LA 1LGXA 206LA 4EKRA 3EMLA 128LA 143LA 3RUNA 241LA 247LA 3VW7A 1QTZA 165LA 1C65A 4I7KA 2B72A 1L56A 258LA 1D3JA 1JTNA 1L72A 2RB0X 4YX7C 240LA 181LA 1L65A 1L62A 2RB2X 3C83A 4K5YA 160LA 228LA 4W57A 142LA 1LYIA 6LZMA 3DN2A 2B6WA 141LA 3CDTA 1QT6A 172LA 1C68A 1L0JA 1P64A 4GRVA 4LDOA 1T8GA 1LYFA 1P2RA 1L79A 1L73A 122LA 1OV7A 215LA 249LA 1L20A 2ANVA 1QTVA 3HT9A 1QT7A 1QTBA 1SWYA 237LA 3ODUA 3FA0A 1L70A 123LA 2ANXA 3F8VA 3C8SA 1L40A 1L04A 163LA 2LC9A 2RBOA 1DYGA 1C6BA 3HU9A 145LA 157LA 1PQMA 3DMVA 1C6IA 1L26A 1C6MA 1P46A 1OVJA 2OTZX 3GUKA 3D4SA 114LA 1T97A 1QT5A 3HDFA 3HUQA 4S0WA 4EKQA 2B6ZA 3SB9A 1D3NA 2OE4X 1OVKA 162LA 1L57A 1KW5A 235LA 4PK0A 130LA 229LA 1L64A 2NTHA 1DYAA 252LA 5I14A 169LA 1L98A 223LA 166LA 1LGWA 212LA 2RAZX 3GUJA 1L89A 4W58A 2OE9X 3HWLA 1L81A 2CUUA 190LA 3PBLA 1L48A 4EKPA 5LZMA 150LA 1QTCA 3DN1A 125LA 1L10A 197LA 1QT3A 1OWYA 1L22A 2B7XA 4LDEA 1L85A 1C6FA 1L13A 236LA 260LA 1QSQA 1L63A 3F9LA 1L29A 4I7TA 4I7PA 4OO9A 1QUOA 1LYGA 3NYAA 216LA 2RBQA 3DN4A 248LA 4I7NA 4I7QA 1CUQA 1L07A 3C7YA 3GUNA 1C6GA 189LA 243LA 1L42A 1L41A 1L38A 4W59A 3LZMA 1P7SA 1OVHA 1CV1A 1LYEA 1OWZA 214LA 1G0MA 1C6LA 1C6PA 2RBRA 113LA 164LA 1L84A 1L23A 1L80A 1L76A 103LA 176LA 1QT4A 230LA 246LA 3C80A 138LA 1QTHA 1KY0A 3V2WA 171LA 4W52A 1L90A 3HH4A 108LA 1SX7A 158LA 244LA 4IAPA 1L74A 1C6TA 2HULA 198LA 3SB7A 1L66A 2O7AA 1SWZA 213LA 148LE 3DKEX 3HH6A 3PDSA 115LA 1L15A 4ARQB 1B6IA 4ARQA 1LYHA 1CX7A 129LA 1LWGA 1DYEA 4YXCA 1CU2A 1L05A 4I7MA 1XJTA 4GBRB 1PQJA 1ZURA 1L60A 1G1VA 1D9WA 3GUOA 3C8RA 4EJ4A 1L75A 1QSBA 1G07A 224LA 1CVKA 3JR6A 3GUMA 1G06A 1L02A 1CV3A 119LA 1L55A 4I7LA 1TLAA 3C81A 146LA 1P6YA 196LA 1CU3A 1L95A 1KS3A 245LA 251LA 1QUHA 2F47A 3CDQA 1L24A 4EXMA 1KW7A 1L32A 1CU5A 1LI3A 1C62A 199LA 1C6KA 234LA 3CDVA 1L25A 1LGUA 127LA 4DJHA 3L2XA 1C6DA 2L78A 1QUGA 2B6TA 175LA 3NY9A 4ARPA 1L97A 137LA 3DN3A 180LA 1P2LA 1L03A 1L34A 219LA 2OTYX 2A4TA 3C82A 1L69A 1L61A 3HTGA 170LA 3DN0A 3OE6A 1QUDA 209LA 3G3WA 3HT8A 107LA 3SBAA 151LA 187LA 1CX6A 1P3NA 1C63A 1L50A 1QS5A 3C7ZA 4LDLA 173LA 1L37A 1G0LA 1G0KA 1C61A 1L35A 226LA 231LA 4ARJA 1L12A 2HUKA 102LA 1PQDA 2F32A 2RBPA 4ZPUA 1D3MA 3FADA 1L45A 1EPYA 3SB8A 2OU8A 2O4WA 1L17A 140LA 3SB6A 1L27A 1JTMA 1G0GA 2O79A 149LA 3HDEA 156LA 161LA 188LA 242LA 1C6HA 159LA 3GUIA 1G0PA 1DYBA 1L00A 4DAJA 1L96A 131LA 1ZYTA 3RZEA 3OE0A 182LA 255LA 253LA 4W55A 210LA 1LW9A 1L18A 1L51A 186LA 256LA 1LYJA 211LA 220LA 2RBSA 3QAKA 218LA 1C6QA 3CDOA 3C7WA 1CV6A 2Q9DA 239LA 1C6NA 3FI5A 3NY8A 4AQNA 262LA 1L88A 2Z6BA 1CU0A 222LA 195LA 4W51A 4PJZA 1P56A 2RH1A 3SB5A 1QTDA 1L52A 1CV0A 185LA 2RBNA 109LA 183LA 1DYCA 1L82A 1T8FA 1T6HA 3HT7A 1WTHA 1L93A 2IGCA 1P37A 1DYDA 1L16A 1I6SA 2Q9EA 3C8QA 1C6EA 1D3FA 120LA 1L09A 1L46A 3HU8A 259LA 1CU6A 1L01A 1DYFA 112LA 1JQUA 1KY1A 3DNAA 1ZWNA 3G3XA 1G0QA 1L87A 1L59A 1L99A 1OV5A 3OE8A 1C6JA 1CTWA 178LA 3DMZA 2OU0X 1G1WA 192LA 1CV5A 2HUMA 1PQIA 1L43A 3V2YA 2B73A 201LA 3HTFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NGYA 4EPFA 1CJ6A 4D9ZA 155LA 1EQEA 134LA 1LMNA 2ZIKA 3HTDA 191LA 1B7RA 1TCYA 1J1OY 1DI4A 3GUPA 5M1YA 5IHGA 1ALCA 1LKSA 2PC2A 4XJFA 1LHHA 1CUPA 1SSYA 4ARMB 1KXXA 1BWJA 1L54A 4N5RA 1HEOA 1L0KA 1L31A 3N9EA 3DN8A 1L68A 261LA 1NWGA 1G7LC 5LYMA 4E97A 2OU9A 1QDTA 1FLQA 4DD2A 1F6RA 1NHBA 1NBZC 5B59A 1BB3A 3HUKA 5LAGA 1B7QA 1IP2A 225LA 1L36A 1QTKA 1G0JA 4GCEA 3W6AA 139LA 1LI2A 2B75A 1GFRA 2H9KA 4XADA 1C64A 2LCBA 1LZTA 1XJUA 1HFZA 1L19A 1OYUA 1REZA 3HUAA 3OE9A 1SLYA 1L91A 1WQMA 1LGXA 1JJ3A 5ILCA 3EMLA 3RUNA 4HJVA 3A3QA 5KXYA 4H90A 5DLAA 2B72A 258LA 4OOTA 2RB0X 4YM8A 1VEDA 4YX7C 1HNLA 1L62A 2RB2X 4YEMA 4LT2A 5FCPA 160LA 2LHMA 1WVUA 1YAPA 3DN2A 2B6WA 4N0JA 141LA 1LJ3A 5B1GA 3WW5A 5KXLA 5LYTA 4GRVA 1LYFA 3AGGG 1L73A 215LA 4WL7A 249LA 3LN2A 1FKQA 2DQJY 1LZNA 1SWYA 4AGAA 4Z3MA 2AUBA 3F8VA 9LYZA 1O23A 3P4ZA 1JSEA 2RBOA 1C6BA 5KXPA 5KY1A 1UIEA 1C6MA 4QGZA 4P2EA 1LSEA 3RZ4A 114LA 4Z41A 3FI7A 3A96A 1YIKA 4S0WA 2W1XA 1D3NA 1LJHA 5B06A 1L57A 5J7CA 1HSXA 229LA 2NTHA 1DYAA 252LA 1J1PY 4RDSA 4WM6A 4N1EI 1C7PA 1L89A 4W58A 1IR9A 5FHWA 4XJIA 1LZAA 1L81A 2CUUA 1GB2A 2Z38A 150LA 197LA 1IR7A 4NGZA 3HFMY 2B7XA 3A67Y 1L13A 4OWBA 1TDYA 4I7TA 135LA 1JJ1A 1G7IC 4N1CC 1LZ6A 3ATOA 1LYGA 3NYAA 3DN4A 1CUQA 4LGKA 4QEQA 8LYZA 243LA 3ZVQB 1OUHA 3LZMA 1P7SA 1BB7A 2ZNXY 1LSGA 3RT5X 5LVJA 5I53A 1GBWA 5KXWA 113LA 1GDXA 1LZEA 164LA 1GB7A 3B72A 1L23A 1H87A 3TXHA 3T36A 1XSFA 1QTHA 5HNLA 5HLLA 4YEOA 3AW7A 4HV1A 2BQDA 1D6PA 4LYZA 1SX7A 2DBTA 5HMVA 1GB9A 1SWZA 3DKEX 1B7OA 1IIZA 3HH6A 4LFXA 3PDSA 1LYHA 4H9IA 2ZQ3A 1CU2A 4GBRB 1PQJA 2CDSA 1G1VA 4EJ4A 3WXTA 4G4HA 1GF6A 2MEAA 3JR6A 1FLYA 3ZEKA 1GBOA 1CV3A 4H8ZA 2I25L 196LA 1CU3A 1L95A 1KS3A 3CDQA 1KW7A 1GF0A 1L25A 1LGUA 1LZGA 4DJHA 1C43A 1LSNA 2L78A 2I6ZA 3DN3A 1JPOA 180LA 1ZMYL 219LA 2OTYX 5LVHA 1G7HC 170LA 4LFPA 2ZWBA 5KXKA 3SBAA 151LA 187LA 4HTQA 1LSBA 2BAAA 2DQGY 3A6BY 1BHZA 173LA 3TXJA 1G0LA 1L35A 1C61A 1PQDA 2F32A 1HELA 4YF2A 4CJ2A 1D3MA 3FADA 4C5FA 1EPYA 2H9JA 2BQMA 4NHIA 1UA6Y 1L27A 1JTMA 2MEBA 3HDEA 1IWYA 2F4AA 3GUIA 4NGWA 1L00A 5KKIA 1FLWA 1OUFA 2W1YA 1HEPA 2BQNA 3EXDA 3WW6A 1LJKA 5LAFA 3TXKA 182LA 4W55A 1A4VA 2XBSA 2BQAA 1L51A 1JWRA 211LA 1YROA 2RBSA 1QUTA 4LYBA 4R0FA 3A92A 3NY8A 1LZ4A 2Z6BA 1LYSA 1CU0A 1YAMA 1GWDA 195LA 2YBNA 3J6KA 1IWVA 1LSMA 4HPIA 1LZSA 1VATA 1IP5A 185LA 109LA 1VDPA 2GV0A 3HT7A 1L93A 1L16A 5KXMA 2MEFA 1GB6A 1DXJA 1C6EA 1D3FA 4RLMA 3MGWA 5L3HA 2ZYPA 259LA 1CU6A 1AT6A 4DQ5A 1TAYA 1ZWNA 3G3XA 1L59A 2CGIA 3AGIA 2HEDA 178LA 2ZIJA 1MLCE 4I0CA 1LHLA 1CV5A 4Z98A 3ULRA 1GBYA 1PQIA 2LZ2A 1L43A 3V2YA 1KXWA 1E8LA 5F81A 4DD3A 5KXTA 1FDLY 4W94A 2QARC 1LWKA 4XJHA 3SN6R 4PGJB 1CV4A 1JHLA 1XGTC 1C60A 1C6AA 1UACY 3AZ6A 1L49A 4TSBA 1GFTA 3BKVA 1LAAA 4DWXA 238LA 1L28A 1F0WA 1L77A 3A93A 167LA 2B6YA 1B5ZA 1LZ8A 1C69A 1L39A 1LLHA 4DD7A 1LJFA 4W96A 152LA 1JIYA 3CB7A 4B4EA 4DKLA 1GEVA 2RB1X 205LA 7LZMA 3A3RX 1UC0A 1L11A 1L21A 4I7RA 1LYDA 2F2QA 1A2YC 2DQIY 1GE3A 4TSCA 1GF8A 4J7VA 2LYOA 3K2RA 3HTBA 1PS5A 118LA 1SX2A 5FELA 4I7JA 2OEAX 1GBZA 4WO9A 177LA 3TXGA 1IC5Y 174LA 227LA 5LXWA 1D2YA 5D5FA 3DN6A 1P2CC 4ARLA 1L47A 1GFEA 4W54A 4E3UA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4NGY A;  4EPF A;  1CJ6 A;  4D9Z A;  155L A;  1EQE A;  134L A;  1LMN A;  2ZIK A;  3HTD A;  191L A;  1B7R A;  1TCY A;  1J1O Y;  1DI4 A;  3GUP A;  5M1Y A;  5IHG A;  1ALC A;  1LKS A;  2PC2 A;  4XJF A;  1LHH A;  1CUP A;  1SSY A;  4ARM B;  1KXX A;  1BWJ A;  1L54 A;  4N5R A;  1HEO A;  1L0K A;  1L31 A;  3N9E A;  3DN8 A;  1L68 A;  261L A;  1NWG A;  1G7L C;  5LYM A;  4E97 A;  2OU9 A;  1QDT A;  1FLQ A;  4DD2 A;  1F6R A;  1NHB A;  1NBZ C;  5B59 A;  1BB3 A;  3HUK A;  5LAG A;  1B7Q A;  1IP2 A;  225L A;  1L36 A;  1QTK A;  1G0J A;  4GCE A;  3W6A A;  139L A;  1LI2 A;  2B75 A;  1GFR A;  2H9K A;  4XAD A;  1C64 A;  2LCB A;  1LZT A;  1XJU A;  1HFZ A;  1L19 A;  1OYU A;  1REZ A;  3HUA A;  3OE9 A;  1SLY A;  1L91 A;  1WQM A;  1LGX A;  1JJ3 A;  5ILC A;  3EML A;  3RUN A;  4HJV A;  3A3Q A;  5KXY A;  4H90 A;  5DLA A;  2B72 A;  258L A;  4OOT A;  2RB0 X;  4YM8 A;  1VED A;  4YX7 C;  1HNL A;  1L62 A;  2RB2 X;  4YEM A;  4LT2 A;  5FCP A;  160L A;  2LHM A;  1WVU A;  1YAP A;  3DN2 A;  2B6W A;  4N0J A;  141L A;  1LJ3 A;  5B1G A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 4NGY A;  4EPF A;  1CJ6 A;  4D9Z A;  155L A;  1EQE A;  134L A;  1LMN A;  2ZIK A;  3HTD A;  191L A;  1B7R A;  1TCY A;  1J1O Y;  1DI4 A;  3GUP A;  5M1Y A;  5IHG A;  1ALC A;  1LKS A;  2PC2 A;  4XJF A;  1LHH A;  1CUP A;  1SSY A;  4ARM B;  1KXX A;  1BWJ A;  1L54 A;  4N5R A;  1HEO A;  1L0K A;  1L31 A;  3N9E A;  3DN8 A;  1L68 A;  261L A;  1NWG A;  1G7L C;  5LYM A;  4E97 A;  2OU9 A;  1QDT A;  1FLQ A;  4DD2 A;  1F6R A;  1NHB A;  1NBZ C;  5B59 A;  1BB3 A;  3HUK A;  5LAG A;  1B7Q A;  1IP2 A;  225L A;  1L36 A;  1QTK A;  1G0J A;  4GCE A;  3W6A A;  139L A;  1LI2 A;  2B75 A;  1GFR A;  2H9K A;  4XAD A;  1C64 A;  2LCB A;  1LZT A;  1XJU A;  1HFZ A;  1L19 A;  1OYU A;  1REZ A;  3HUA A;  3OE9 A;  1SLY A;  1L91 A;  1WQM A;  1LGX A;  1JJ3 A;  5ILC A;  3EML A;  3RUN A;  4HJV A;  3A3Q A;  5KXY A;  4H90 A;  5DLA A;  2B72 A;  258L A;  4OOT A;  2RB0 X;  4YM8 A;  1VED A;  4YX7 C;  1HNL A;  1L62 A;  2RB2 X;  4YEM A;  4LT2 A;  5FCP A;  160L A;  2LHM A;  1WVU A;  1YAP A;  3DN2 A;  2B6W A;  4N0J A;  141L A;  1LJ3 A;  5B1G A; 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