1CX7A

T4 lysozyme methionine core mutant
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKMKPVYDSMDAVRRAAMINMVFQMGETGVAGFTNSMRMMQQKRWDEAAVNMAKSRWYNQTPNRAKRVITTMRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Use of differentially substituted selenomethionine proteins in X-ray structure determination.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1cx7A00
1L39A 195LA 157LA 1C6AA 1CUQA 3C7YA 166LA 156LA 1L85A 167LA 3LZMA 4W55A 237LA 1L99A 2HUMA 165LA 191LA 258LA 248LA 171LA 252LA 1EPYA 189LA 1C69A 2NTGA 163LA 1L21A 4I7QA 1L07A 3DNAA 1JTNA 1L57A 192LA 1CX6A 4I7RA 4W52A 3OE6A 1L55A 1QUDA 4EPFA 3CDTA 1LYHA 3D4SA 1CVKA 1QT3A 225LA 2B6ZA 1L51A 1G1VA 4ZPUA 1P64A 2OU8A 3SB8A 247LA 1SWYA 2OTZX 1L37A 1G0MA 169LA 1LGXA 3NY8A 228LA 140LA 231LA 4PJZA 227LA 3C8SA 4OO9A 2ANXA 3G3XA 2RBNA 3SB7A 1G1WA 3GUMA 2HULA 1L64A 230LA 1L23A 224LA 4I7NA 4DAJA 170LA 243LA 1PQMA 1CV1A 1QUHA 184LA 1OVHA 218LA 3DN1A 3HTDA 1P46A 138LA 3FA0A 222LA 3DN8A 1LGWA 1L26A 1D9WA 4ARMA 3HH6A 1L94A 2B70A 1L74A 1L25A 3HTGA 1P6YA 1L73A 1L45A 1QT6A 244LA 1L48A 1C6PA 249LA 1L82A 4LDEA 1G07A 2RBPA 174LA 3GUKA 125LA 1L61A 127LA 2O4WA 253LA 1L63A 3DMVA 3HT8A 110LA 1C6BA 259LA 1L56A 3HWLA 129LA 1G0QA 1OWYA 262LA 1L22A 1L38A 3JR6A 1P7SA 3HH3A 1QT7A 1OV7A 1CU0A 187LA 1QTCA 3GUNA 3RZEA 139LA 1L10A 238LA 1DYDA 4EJ4A 198LA 200LA 1C67A 160LA 3UONA 1L77A 3GUPA 1L18A 1CV5A 107LA 1LYGA 2RH1A 4LDLA 1C6IA 1L29A 3FADA 1L66A 220LA 141LA 1DYBA 161LA 4EKQA 246LA 1G0KA 1WTHA 142LA 3OE0A 2LZMA 108LA 1C64A 215LA 183LA 212LA 229LA 1L71A 3G3VA 1LYEA 123LA 2OTYX 233LA 1G0GA 172LA 3PBLA 3C7ZA 1C60A 2NTHA 4YXCA 3HT9A 2RBQA 175LA 257LA 1I6SA 149LA 7LZMA 2RAYX 3C8QA 3VW7A 3SB6A 1C61A 1ZYTA 4DJHA 1C6LA 1L83A 4W58A 1KW7A 261LA 3HUQA 180LA 2B6TA 4S0WA 1T8AA 4I7SA 4LDOA 3QAKA 3C83A 1CX7A 1LYJA 1C65A 199LA 234LA 1L96A 1C6QA 1KY0A 186LA 1JTMA 4DKLA 1L59A 3GULA 1L01A 2B73A 1L36A 2Q9DA 3C8RA 2RB0X 3C7WA 1C6CA 1C6HA 1QTHA 219LA 1G0PA 4I7MA 1L04A 1L44A 4EKPA 1G0JA 3SBAA 119LA 4ARQB 3HUKA 6LZMA 1QS9A 176LA 1L97A 3SBBC 254LA 188LA 1ZWNA 4I7TA 1L75A 1L53A 2RAZX 1D3FA 255LA 4YX7C 111LA 173LA 146LA 1KS3A 2B6WA 1DYGA 239LA 1LLHA 4W51A 3PDSA 4I7PA 3HTBA 3CDVA 4ARQA 1CV0A 4YXAC 4GBRB 1CU5A 1L98A 128LA 143LA 197LA 223LA 1L52A 236LA 118LA 3DMXA 1C66A 1PQKA 3DN2A 4ARPA 178LA 1CTWA 214LA 1QT8A 1QT4A 1LI2A 1C6DA 102LA 3L64A 1ZURA 4W57A 113LA 1L02A 1KW5A 1L49A 1C6JA 1L90A 3OE8A 4I7LA 1QUOA 2Z6BA 1K28A 1L80A 1G06A 1L05A 4K5YA 1L87A 145LA 1QTVA 1LPYA 1L20A 1LW9A 205LA 4EKRA 1L46A 181LA 1L03A 1L70A 1CU3A 3HTFA 1L41A 3DN4A 1DYCA 1L31A 1SSWA 1L19A 1L30A 4AQNA 109LA 120LA 1L24A 1L0KA 1L33A 1L72A 2OEAX 2RBSA 3HT7A 1T8FA 241LA 1PQJA 1G0LA 211LA 2QB0B 1L88A 1PQDA 206LA 3DN0A 1C6EA 1LYDA 1L14A 1C62A 226LA 3HDFA 190LA 4IAPA 1QSQA 162LA 4E97A 1QTBA 1L40A 3ODUA 2Q9EA 1L00A 1L79A 151LA 4W54A 1P5CA 256LA 201LA 1C6TA 2RBRA 1CUPA 3RUNA 1DYAA 245LA 1C63A 1TLAA 4PK0A 1L11A 1SX2A 1T6HA 1L27A 221LA 1C6MA 1SX7A 2OU9A 251LA 1XJUA 2B74A 1L62A 1XEPA 4LZMA 2QARC 3HH5A 1P2RA 1C6KA 3F9LA 1P56A 1OVJA 1CU6A 1QS5A 114LA 2LCBA 2B72A 2CUUA 3F8VA 1QSBA 1L54A 3HT6A 1QUGA 2A4TA 3DN3A 4EXMA 4W53A 168LA 1L08A 1L0JA 1NHBA 1C6GA 152LA 240LA 1D3JA 196LA 1PQIA 2HUKA 2F47A 1L12A 2IGCA 3SB5A 3SB9A 112LA 3CDOA 1L81A 122LA 1L50A 1L16A 3OE9A 1KNIA 1QTZA 115LA 2B6XA 3HU8A 2RB1X 4I7OA 126LA 3EMLA 3C82A 1P3NA 3GUOA 1P36A 3NYAA 1CV3A 2OE9X 3FI5A 232LA 1B6IA 2B6YA 242LA 5I14A 1CU2A 1L93A 1L43A 185LA 4W56A 4EKSA 1LYIA 1LI6A 1L17A 104LA 3NY9A 3SN6R 1L68A 3DKEX 2O79A 4ARMB 1LWKA 3HU9A 3DMZA 1L86A 4ARJA 1L95A 1CV6A 216LA 1L35A 5LZMA 1OWZA 1D3NA 1L69A 1LI3A 2O7AA 4EPIA 1OV5A 209LA 1C6NA 3V2WA 4I7JA 1L67A 177LA 213LA 103LA 1XJTA 1L91A 1L58A 158LA 1L60A 1D2WA 1C68A 2OE4X 1QT5A 3DN6A 3HUAA 147LA 2B7XA 3GUJA 144LA 1L15A 1QTDA 159LA 164LA 1SWZA 2RBOA 3L2XA 3CDQA 1KY1A 1T8GA 1OYUA 148LE 2F32A 1L13A 1P2LA 1CV4A 1DYEA 260LA 1D3MA 1OVKA 3C80A 235LA 1L65A 3C81A 3G3WA 1L84A 1L28A 1C6FA 1LGUA 2LC9A 3HDEA 250LA 4W59A 3K2RA 2RB2X 1P37A 2ANVA 131LA 130LA 1D2YA 137LA 1L92A 2L78A 1JQUA 1LWGA 1L32A 1T97A 1L42A 2B75A 1L76A 3HH4A 3GUIA 155LA 4GRVA 217LA 4ARLA 1L47A 1LYFA 1PQOA 1SSYA 1DYFA 1L09A 150LA 3V2YA 2OE7X 2OU0X 1L34A 3CDRA 1L06A 2F2QA 210LA 1L89A 4I7KA 182LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IWYA 1LSYA 1WTNA 1HF4A 3C7YA 4WL6A 156LA 4CJ2A 5F9UA 1IVMA 237LA 1LZ1A 191LA 1Z55A 4H92A 258LA 4ET8A 3TXGA 252LA 1EPYA 3WUAA 1LTMA 163LA 4G49A 1JTNA 1GFHA 1RCMA 4FDYA 1L55A 4LT2A 4EPFA 3D4SA 3N9AA 1JKDA 1QT3A 5KXTA 1NMMA 4UWNA 3SB8A 4ETDA 1QQYA 1TBYA 1FBIX 247LA 1SWYA 4XN6A 1J1PY 169LA 5DN5A 4HJVA 2H5ZA 4D9ZA 227LA 2DQJY 1IORA 170LA 1PQMA 184LA 1OVHA 4EMNA 1BB3A 222LA 3EBAB 3DN8A 1L26A 4NGYA 4J0LA 2B70A 4ZEEA 1L74A 1F0WA 4CFPA 1L25A 3HTGA 1LZCA 4H9BA 1VDQA 1L73A 1GE3A 1D0KA 4RLNA 4CFOA 4G9SA 2G4NA 3WVYA 4WM6A 1LZYA 5IELA 253LA 1L63A 5I4WA 1C6BA 1GB3A 1LYSA 3AB6A 4AXTA 1ZV5L 3JR6A 1QT7A 1NKHA 3RZEA 238LA 2I25L 1WQOA 2XQOA 1B7RA 160LA 3UONA 194LA 2WARA 4BAFA 1LZAA 1QUSA 107LA 1LYGA 1YILA 1MELL 1AZFA 1L66A 3F6ZA 5JENB 1E8LA 4B49A 161LA 3IJUA 4W96A 3LZ2A 3AGHA 215LA 1LMCA 229LA 1L71A 1ALCA 4M4OA 1FLQA 4N1EI 2A7DA 2W1YA 1ZYTA 1C6LA 1YL0X 1C45A 1KW7A 1FN5A 4S0WA 2B6TA 1T8AA 3TXIA 1XSFA 4LYOA 3J6KA 3QAKA 1CX7A 1GFJA 1L96A 3GULA 4H9EA 1LJ3A 2XBRA 2IFFY 5K7OA 3CT1A 4A7DA 4NHQA 2Y8PA 1GB6A 1WTMA 1GE0A 1IR7A 4H9CA 2CDSA 3WH1A 1G0PA 1LCNA 4NGJA 119LA 176LA 4WM3A 254LA 1NDGC 1JKAA 4YOPA 1KXWA 111LA 146LA 4W51A 4I7PA 4ARQA 4PJ2C 1CU5A 4QGZA 4H1PA 5DN4A 2YBHA 2MEDA 2ZQ3A 4NIJA 1JTOL 4XJBA 1CTWA 1LJJA 1LZNA 2X0AA 1ZURA 2ZYPA 2BQJA 2DQFC 3ULRA 1D6QA 1B0DA 3MGWA 1L90A 4QEQA 1OUJA 2D4IA 2Z6BA 1K28A 5IHGA 1L87A 1LPYA 205LA 3OJPA 1HEQA 181LA 4B4IA 1EQEA 3HTFA 1L31A 1L30A 1L24A 1FKVA 3HT7A 1HMLA 1LHLA 1HEMA 2DQCY 4HPIA 4NSHA 1UIEA 1BWIA 3HDFA 3WW5A 1QSQA 162LA 1LMQA 1QTBA 2ZYCA 5FCPA 2Q9EA 151LA 1WQPA 4W54A 1UACY 256LA 2DQGY 2RBRA 3WMKA 1LYOA 1TLAA 4PK0A 1SX2A 1T6HA 3D9AC 1L27A 221LA 1C6MA 2D4JA 1CJ8A 2OU9A 4OWAA 4WLYA 1XEPA 1OUEA 3HH5A 4Z3MA 2Z12A 6LYZA 5KXXA 5FDJA 1BWJA 1IWTA 4PRUA 2LCBA 2CUUA 3T6UA 3TXEA 1QSBA 1UIHA 1I1ZA 2A4TA 2XTHA 168LA 3QE8A 2H9JA 1NHBA 1D9UA 4H91A 2CWIA 1L12A 4N5RA 1GF8A 4OWBA 3CDOA 3FE0A 1BWHA 1MLCE 1LSZA 1L50A 1L16A 3AW6A 5D5FA 1KNIA 4NEBA 115LA 3HU8A 1TDYA 1IP2A 4X3BA 4OWEA 4CGEA 1P3NA 135LA 3NYAA 4GLAA 4WLXA 1RFPA 242LA 4NHTA 1B2KA 1L43A 1XGPC 3WL2A 185LA 1LI6A 1UIFA 1KXXA 1REZA 104LA 3NY9A 4XJGA 5KY1A 5A3ZA 3A6CY 4ARJA 1L95A 216LA 2G4QA 4KXIA 1LSGA 1OV5A 3M18B 4TX7A 4II8A 3V2WA 1B7NA 4I7JA 1B5YA 2MEEA 1L91A 4HJZA 1IP3A 158LA 1L60A 4LT1A 2OE4X 1LPIA 3N9EA 4RW1A 3GUJA 2EKSC 1D0LA 4H94A 4HV1A 1WVUA 2RSCA 1JITA 4PRQA 4HTKA 2F32A 1L13A 260LA 1GHLA 3A3RX 3C80A 1GB0A 250LA 1DQJC 1XGUC 1D6PA 1P37A 2ANVA 131LA 130LA 1L92A 5LAGA 1JQUA 4N0JA 1L32A 1JIYA 3QY4A 3HH4A 4XJDA 1L47A 4DD2A 1LHMA 150LA 5EBHA 3V2YA 4QY9A 1UBZA 164LA 182LA 4TTDA 1L39A 157LA 4O34A 3IJVA 166LA 5LVHA 2BQDA 1L85A 1CJ7A 248LA 3AZ5A 4R0FA 189LA 1GFVA 3VWOA 4GN3A 4WM1A 1B5WA 4W52A 3OE6A 1GDWA 5KXLA 1LSDA 4ZIXA 3FI7A 4LYTA 1L51A 2N5ZA 1G1VA 3CT0A 1P64A 5LA8A 4UWVA 3A6BY 5KKJA 3B0IA 1L37A 1LGXA 2ZNWY 4Z46A 4LFXA 2ZIJA 1NDMC 1W08A 2EIZC 2ANXA 3LN2A 3G3XA 3SB7A 4LYCA 3TXKA 1G7LC 1L23A 1QUHA 208LA 2I6ZA 3DN1A 3HTDA 1LSAA 138LA 4NHIA 3FA0A 1LSCA 4ZFPA 4R6CA 2BQMA 1LGWA 1D9WA 1G7IC 4ARMA 1GAYA 1LMNA 1LJNA 5KXNA 1DI4A 1IP5A 4L41A 2Z37A 244LA 1GFRA 1LZ8A 1C6PA 249LA 2ZILA 3WUMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1IWY A;  1LSY A;  1WTN A;  1HF4 A;  3C7Y A;  4WL6 A;  156L A;  4CJ2 A;  5F9U A;  1IVM A;  237L A;  1LZ1 A;  191L A;  1Z55 A;  4H92 A;  258L A;  4ET8 A;  3TXG A;  252L A;  1EPY A;  3WUA A;  1LTM A;  163L A;  4G49 A;  1JTN A;  1GFH A;  1RCM A;  4FDY A;  1L55 A;  4LT2 A;  4EPF A;  3D4S A;  3N9A A;  1JKD A;  1QT3 A;  5KXT A;  1NMM A;  4UWN A;  3SB8 A;  4ETD A;  1QQY A;  1TBY A;  1FBI X;  247L A;  1SWY A;  4XN6 A;  1J1P Y;  169L A;  5DN5 A;  4HJV A;  2H5Z A;  4D9Z A;  227L A;  2DQJ Y;  1IOR A;  170L A;  1PQM A;  184L A;  1OVH A;  4EMN A;  1BB3 A;  222L A;  3EBA B;  3DN8 A;  1L26 A;  4NGY A;  4J0L A;  2B70 A;  4ZEE A;  1L74 A;  1F0W A;  4CFP A;  1L25 A;  3HTG A;  1LZC A;  4H9B A;  1VDQ A;  1L73 A;  1GE3 A;  1D0K A;  4RLN A;  4CFO A;  4G9S A;  2G4N A;  3WVY A;  4WM6 A;  1LZY A;  5IEL A;  253L A;  1L63 A;  5I4W A;  1C6B A;  1GB3 A;  1LYS A;  3AB6 A;  4AXT A;  1ZV5 L;  3JR6 A;  1QT7 A;  1NKH A;  3RZE A;  238L A;  2I25 L;  1WQO A;  2XQO A;  1B7R A;  160L A;  3UON A;  194L A;  2WAR A;  4BAF A;  1LZA A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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