1EQEA

Crystal structures of salt bridge mutants of human lysozyme
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRNVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Contribution of salt bridges near the surface of a protein to the conformational stability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 52
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1eqeA00
2BAAA 1IY4A 1I20A 1FLWA 2DKVA 2I25L 3AW7A 2C8PA 1LZ1A 2HU3A 3GXKA 1LSAA 3J4GA 1OUDA 4NSIA 3N9CA 1GE0A 4WOAA 1DZBX 3TMXA 3HFMY 4WL7A 4DD7A 1B7SA 3LZ2A 4C5FA 1UIHA 1IWXA 4DDBA 4WLYA 1LZRA 3AZ7A 1QSWA 4XJHA 3TXIA 1HEWA 3P68A 3M3UA 1HF4A 4N9RA 1DPWA 1A2YC 2MEDA 4CHXA 2VB1A 2BLYA 2Z18A 1LHIA 1YAPA 4GN3A 1XSFA 1OUHA 2BPUA 3TXHA 4NG8A 5LIOA 1QSAA 1UIAA 1J1OY 2HEAA 1W08A 1GF9A 2WARA 2YBJA 1B5WA 4Z98A 4NEBA 3AB6A 3A93A 2RSCA 3E3DA 1GFTA 1OUAA 5LAGA 4H8YA 1UIGA 1IOCA 4Z46A 1GBXA 5KXOA 194LA 1B0DA 1XFPL 2LZ2A 1J1PY 1HEPA 1UCOA 1B5XA 2CDSA 1TBYA 1GFRA 2GV0A 2PC2A 1NKHA 2Z12A 2FYDA 2ZYPA 4LYOA 4NHQA 3TMUA 1JPOA 9LYZA 2YBNA 1GDWA 1MELL 2NWDX 4YEMA 2HECA 5A3ZA 1LMPA 1JHLA 4DDAA 1MLCE 5I54A 1IR7A 1CKHA 2YBIA 1WVUA 1B9OA 2F4AA 1HSWA 1LSYA 2IHLA 3WU8A 1LSDA 4NWEA 4WM1A 2EIZC 2DBTA 3AGGG 1EL1A 3OK0A 1IEEA 1UICA 5LINA 1GF3A 1TAYA 4H94A 4WG7A 5FHWA 1HMLA 1JIYA 3FE0A 4HPEA 4NSHA 1RCMA 3TXDA 5KXWA 1NBYC 3TMVA 1D6QA 1DQJC 1LMQA 2Z2EA 1PS5A 1TEWA 2D6BA 3HBEX 4P2EA 5F14A 2MEGA 1GXV2 4D9ZA 1D9UA 1GXXA 1OUBA 1YAQA 4NFVA 1AM7A 1RE2A 1LYSA 2H9JA 4RW1A 1CJ8A 5IELA 1N4FA 2YBMA 3RNXA 4TWSA 1NF5A 3LN2A 1GF5A 1GF0A 1QIOA 5B06A 4ZIXA 1LJ3A 1DPXA 2G4QA 5I4XA 1D0LA 4U3XB 4DD3A 1J1XY 2DQJY 4X3BA 5KXSA 2LYMA 1B2KA 4XJIA 1GB2A 1XGPC 2BQMA 1A4VA 2B5ZA 4CFPA 4TTDA 3CSRA 4YENA 3QY4A 5A3EA 5L3HA 1O23A 1HFYA 1SQ2L 1LYYA 1IWVA 1LZSA 4XJFA 5F9XA 4BADA 1LZTA 1HC0A 1BGIA 3ULRA 1IP3A 1OUCA 1DI5A 1VAUA 3A92A 3WPKA 5KY1A 1B7RA 4H9FA 1IORA 5KXYA 2BQGA 3F6ZA 3TXEA 4B4IA 5I4YA 1B7LA 4DD9A 1GFJA 4NGZA 4DYGA 3AGHA 4OWEA 4YM8A 1LSFA 1CJ7A 4DWXA 5KJ9A 1IIZA 1BB3A 1LMAA 5F9UA 2X0AA 1LZ8A 5LA5A 1LZ4A 1RI8B 208LA 2BQDA 4N0JA 1IWZA 1YKXX 3B0KA 4OOTA 1GE2A 154LA 3A3QA 4J1BA 4HSFA 5I5QA 5C6IA 5LXWA 1JKBA 7LYZA 5DLAA 1LJ4A 1IVMA 1IP5A 4PRQA 5D5FA 1HELA 4H9CA 3TXGA 1JUGA 3D3DA 3P4ZA 1UACY 2ZILA 1C10A 3ATNA 4GN5C 1GDXA 1WTMA 1V7SA 5C6LA 4GN4A 3G3BB 3A6CY 4WLTA 1GF4A 1V7TA 1YKYX 5DN4A 4KXIA 3T6UA 1G7JC 5KXKA 1IWYA 4MR1A 1GBOA 1DI4A 1NDGC 1OUGA 1FLYA 2ZNWY 4NGIA 4DD0A 4ML7A 4BAPA 3AZ4A 4WL6A 2Z37A 5APCA 1LSPA 5HLLA 1QDTA 1LHLA 4LT3A 1INUA 4M6DA 4Z3MA 1F6RA 4XYYA 1EQ5A 1LJIA 4QGZA 2I6ZA 2A7FA 2MEEA 4HJVA 4Z41A 5HQ1A 1QUSA 1UBZA 3A8ZA 1LZEA 4KPMA 4UWUA 3QNGA 5J7CA 2W1YA 1FDLY 1LKRA 1WQPA 3HBHA 2XBRA 1PZYA 2XBSA 2EKSC 4G9SA 3WH1A 1JKCA 1GFAA 4LZTA 193LA 1LMTA 4ETAA 4G4HA 4R0FA 3AJNA 1UA6Y 5HMJA 4ANRA 1YAMA 4WMGA 5LVIA 4GLVA 2H9KA 1OP9B 2BQNA 1GBYA 1OUJA 4LYCA 3OJPA 4HJYA 2F30A 1VFBC 1JJ0A 2BQCA 1LZBA 4OOOA 3WUNA 4ETEA 4QY9A 1IO5A 2DQCY 2W1MA 3A67Y 1IWUA 3N9EA 4LYTA 4NGVA 3WPLA 3WU9A 5JENB 1QDRA 1CKFA 1IP6A 1JISA 2IFFY 1D0KA 2HEBA 4MSTA 4H9AA 1B7NA 4H9EA 4B0DA 4B4JA 1QUTA 2W1XA 4YEOA 1C08C 2FBDA 1TDYA 3LYTA 1B7QA 1F6SA 1BB4A 4R6CA 1YIKA 4DD2A 5B05A 4QDNA 4RLMA 1HENA 2Z39A 5LA8A 3WUMA 1LZ6A 4WO6A 1GB0A 5IDDA 1JTPL 2DQDY 1HFZA 1GE3A 1QTKA 4OWCA 5APFA 1IC5Y 4OWAA 1LZCA 1XGQC 1VDTA 3TMWA 1TCYA 2YBHA 2HU1A 1DI3A 5KXRA 3B0IA 2G4NA 1GFUA 1CKDA 4NHSA 4TX7A 1GBSA 4DD1A 4LT0A 2EQLA 4WLDA 1WQQA 3AYQA 5AMYA 1RJCB 5FELA 1HEQA 134LA 1GD6A 2G4PA 4GCBA 2D4KA 4ZFPA 1FKVA 1EQ4A 1LZAA 4I0CA 4NGWA 4ET9A 135LA 4LT2A 2MEBA 1OUIA 2Z2FA 3SP3A 1B5YA 1H87A 1ZVYB 3AGIA 3W6BA 4NG1A 4H9HA 2XJWA 3B72A 1FLUA 2N5ZA 3WULA 4L41A 1GBWA 3W6DA 4ETCA 4WO9A 5LYTA 2YDGA 3A34A 1B5VA 3D9AC 2D91A 1GFHA 2LHMA 4ZEEA 1G7LC 3B6LA 3EMSA 1LSNA 4H90A 2Z19A 1YROA 1IOTA 1HEOA 1VDPA 1OUEA 5KXMA 1GE4A 1JKAA 1LKSA 4NHPA 3G3AB 1IX0A 1RFPA 1GFGA 3IWRA 1XGRC 1OUFA 3LYOA 4WLXA 1WQOA 1LYZA 5B59A 5FSTA 4LT1A 4O34A 2HEDA 1QQYA 5LVGA 4W94A 2HEEA 1GE1A 1IC4Y 1LJHA 2ZIJA 5L3IA 5FDJA 1VDQA 2AUBA 4J1AA 5K7OA 3B0OA 3W3EA 4GCFA 2BQEA 2MEFA 4NGJA 3WUAA 4AGAA 4YF2A 1D6PA 1LJJA 4G4CA 4WM6A 1YL1X 2BQOA 4H9IA 4XENA 1EQEA 5LYZA 1LOZA 4EOFA 1JSFA 1JWRA 5M1YA 1XGTC 4HTKA 1HFXA 4H1PA 4YOPA 5KXXA 1WQNA 5E9RA 1BWJA 1NWGA 1UIBA 1IP7A 3RW8A 1HNLA 2LYZA 5KXZA 1C43A 2DQGY 3P64A 1GFKA 4XJDA 2A7DA 3A6BY 1LSMA 3IJVA 4IATA 5LYMA 2CWIA 3CSQA 4FJRA 4GCCA 1GB5A 5KXNA 4NHIA 2I26L 3WVXA 1C46A 2YBLA 4NY5A 4NGLA 4A7DA 3QE8A 1KIRC 1LZNA 1FBIX 2FBBA 1FLQA 1LJFA 3FI7A 1HHLA 4LYMA 1IR8A 4DDCA 3A96A 1DXJA 2DQEY 3EXDA 1LHJA 1H6MA 2CGIA 4PJ2C 3LHMA 3EBAB 1QTEA 4IJ4A 2EPEA 1BB7A 4TUNA 3N9AA 3ATOA 1GBZA 1IOQA 2MECA 1YKZX 1C7PA 1BVXA 1F10A 2Y8PA 3RU5A 4N5RA 4HJZA 3GXRA 3MGWA 1LZGA 2D4JA 2DQAA 4HPIA 4N1CC 1IWTA 1FN5A 3P65A 3VWOA 207LA 4PPOA 1REYA 2ZWBA 2Z38A 4HTNA 4WM2A 4GLAA 1YQVY 1CKCA 2LYOA 3WU7A 133LA 1GB9A 4TSBA 3AZ5A 2BQBA 1I1ZA 1B7MA 1GB3A 1LJGA 2ZQ3A 1BB6A 1AT5A 5T3FA 1LZDA 1GB7A 5LVJA 4H8ZA 1REZA 1UUZC 3W6CA 5ILFA 5FCPA 3RZ4A 1GWDA 5KXTA 1AT6A 1LZ5A 3KAMA 2DQFC 1ZMYL 2HUBA 4MCKA 1CJ9A 3BKVA 1GAZA 5II3A 1REMA 5B1GA 1CKGA 1CNSA 6LYTA 3WXUA 1NBZC 3CT1A 3LYMA 4PRUA 1LYOA 5I4WA 4LFXA 1LZYA 3W6FA 1ZV5L 4G49A 5IHGA 1I56A 1LPIA 1DKKA 1KIQC 4NHTA 1P2CC 2XTHA 4DC4A 4HTQA 3WW6A 2F2NA 4M4OA 1UIFA 1W6ZA 5DL9A 1XEKA 1IC7Y 1KXXA 2DQHY 3RT5X 1VATA 1LMOA 5KKJA 5LVKA 1AZFA 3CQLA 1LHKA 2MEAA 4H92A 1UIEA 4II8A 3TXFA 4BS7A 1BHZA 1LZ9A 1IP2A 4XADA 5F16A 1GF7A 5KKIA 2BQJA 2BQLA 3HBDA 1UIDA 1IY3A 4B4EA 1JTOL 5HMVA 1YAOA 1VEDA 4DT3A 4NSJA 5KXPA 1JEFA 4W96A 1LMNA 3WL2A 3ZVQB 1GB6A 4IASA 1JJ3A 1YILA 5APEA 1LAAA 1F0WA 2H5ZA 4WG1A 5LAFA 4B49A 5E4PA 1IOSA 4NIJA 4XJGA 1ZVHL 4XN6A 1GFVA 2YSSC 4C3WA 1XGUC 4FDYA 1NHEA 5L9JA 4PHIA 3ZVQA 1XEIA 1LSGA 3WMKA 1IWWA 5F81A 1LSBA 4UWNA 3WYHA 4KT3A 3ZEKA 4AXTA 5HNLA 2BQHA 3CSZA 1LJNA 2ZYCA 4N1EI 2HEFA 1BB5A 4H8XA 2W1LA 2BQFA 1JKDA 1T3PA 2BQAA 1D0MA 1GFEA 3A3RX 3A94A 1LCNA 4EMNA 3M18B 2LZTA 3LYZA 4NGKA 1GHLA 5KXLA 4RW2A 4WM5A 1WQRA 4H91A 1JSEA 5APDA 1AKIA 3W6AA 1WQMA 4KL7A 2CJLA 4HV2A 4OWHA 3WXTA 4QEQA 3EO5A 1SLYA 1KIPC 4OW1A 1HMKA 1VDSA 1B7PA 1YANA 5D5CA 4J0LA 3CB7A 1YL0X 8LYZA 4HP0A 1G7MC 3WVYA 2BLXA 1IP4A 4LGKA 4LYZA 2DQIY 3P66A 2ZQ4A 2YVBA 4PGJB 1C45A 3TXBA 3WW5A 5DM9A 4E3UA 1UC0A 3WPJA 1LTMA 2MEIA 4H9BA 2FYCA 4B1AA 4ETDA 1B7OA 4BAFA 1JJ1A 1LHMA 1LMCA 4NGOA 1G7IC 1BWHA 1GPQC 1GF8A 1JITA 1T6VL 2BQIA 3A95A 3CT0A 2Q0MX 4GCEA 5DN5A 1G7HC 4ET8A 4LYBA 5LVHA 1IP1A 1BVKC 1FKQA 5I53A 1NMMA 1GEZA 2D4IA 3IJUA 5ILCA 4G4BA 1REXA 4HV1A 1LJEA 4NGYA 4WM4A 4CJ2A 1GEVA 5B07A 1KXYA 3TXKA 1BQLY 5C6JA 4H93A 1Z55A 3K3TA 2BQKA 1E8LA 1GAYA 3AW6A 1JTTL 4ETBA 1GF6A 3TXJA 4CFOA 2HTXA 1LSEA 3A90A 5FEKA 1IR9A 1HEMA 1LSCA 4J7VA 1XEJA 3A91A 4RLNA 4WM3A 1LJKA 4I8SA 1HERA 1NDMC 1B5ZA 1CJ6A 1NQIA 4OWBA 4TSCA 1WVVA 153LA 4NWHA 132LA 3W6EA 1B5UA 1ALCA 2ZIKA 4NSGA 3BKHA 2C8OA 3AZ6A 3T36A 1HSXA 2ZNXY 3CT5A 4RDSA 4GCDA 3LZTA 4UWVA 6LYZA 2F4GA 1OQMA 1BWIA 4LFPA 4N8ZA 1GB8A 1KXWA 1LHHA 4XJBA 1WTNA 5EBHA 5B1FA 2MEHA 4CGEA 5HNCA 1DKJA 3J6KA 1LSZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KW5A 1IY4A 1I20A 2C8PA 1LZ1A 3HH4A 1L13A 242LA 3OE9A 3TMXA 3HFMY 1B7SA 1UIHA 3PBLA 1LZRA 3AZ7A 2OTZX 1L98A 3P68A 4W51A 1LHIA 1LI3A 4GN3A 1J1OY 2HEAA 1W08A 2YBJA 118LA 1C6MA 1UIGA 1IOCA 1C6NA 1GBXA 1B0DA 3WPKA 5I4YA 1TBYA 2PC2A 1C69A 1OV7A 4DD9A 1CU3A 1GDWA 1LYIA 1OWYA 4DDAA 1L53A 1L41A 3GUOA 1LSYA 4NWEA 1L69A 1DYFA 3AGGG 3RUNA 3C7WA 1IEEA 1P7SA 2ANVA 4I7SA 4WG7A 1JIYA 3FE0A 4NSHA 1RCMA 1LW9A 1DQJC 5F14A 1LYJA 2H9JA 1CJ8A 1N4FA 2YBMA 1GF0A 1L68A 5B06A 4ZIXA 173LA 1LJ3A 1D0LA 1L38A 1CUPA 1L85A 3CSRA 1LZSA 5F9XA 4BADA 1HC0A 1OUCA 1DI5A 1B7LA 2O4WA 4NGZA 3HU9A 4DYGA 4YM8A 1LSFA 4OO9A 1IIZA 5F9UA 5LA5A 208LA 4J1BA 4HSFA 184LA 5C6IA 5LXWA 7LYZA 1LJ4A 1IP5A 4H9CA 3D3DA 3P4ZA 1LYFA 1UACY 1C6BA 1V7SA 4DQ5A 1CUQA 1CV5A 1L73A 5KXKA 4W59A 1DYBA 1NDGC 4NGIA 2ZNWY 140LA 177LA 3CDTA 4WL6A 1L27A 2Z37A 1LHLA 2F2QA 2A7FA 2MEEA 2Z6BA 4UWUA 1LZEA 1FDLY 2XBRA 1PZYA 4G9SA 2EKSC 3WH1A 1JKCA 193LA 4G4HA 4R0FA 4ANRA 1L93A 1L30A 1L99A 221LA 4GLVA 2H9KA 1OUJA 1LZBA 1IO5A 3N9EA 1IWUA 212LA 1IP6A 4MSTA 125LA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2BAA A;  1IY4 A;  1I20 A;  1FLW A;  2DKV A;  2I25 L;  3AW7 A;  2C8P A;  1LZ1 A;  2HU3 A;  3GXK A;  1LSA A;  3J4G A;  1OUD A;  4NSI A;  3N9C A;  1GE0 A;  4WOA A;  1DZB X;  3TMX A;  3HFM Y;  4WL7 A;  4DD7 A;  1B7S A;  3LZ2 A;  4C5F A;  1UIH A;  1IWX A;  4DDB A;  4WLY A;  1LZR A;  3AZ7 A;  1QSW A;  4XJH A;  3TXI A;  1HEW A;  3P68 A;  3M3U A;  1HF4 A;  4N9R A;  1DPW A;  1A2Y C;  2MED A;  4CHX A;  2VB1 A;  2BLY A;  2Z18 A;  1LHI A;  1YAP A;  4GN3 A;  1XSF A;  1OUH A;  2BPU A;  3TXH A;  4NG8 A;  5LIO A;  1QSA A;  1UIA A;  1J1O Y;  2HEA A;  1W08 A;  1GF9 A;  2WAR A;  2YBJ A;  1B5W A;  4Z98 A;  4NEB A;  3AB6 A;  3A93 A;  2RSC A;  3E3D A;  1GFT A;  1OUA A;  5LAG A;  4H8Y A;  1UIG A;  1IOC A;  4Z46 A;  1GBX A;  5KXO A;  194L A;  1B0D A;  1XFP L;  2LZ2 A;  1J1P Y;  1HEP A;  1UCO A;  1B5X A;  2CDS A;  1TBY A;  1GFR A;  2GV0 A;  2PC2 A;  1NKH A;  2Z12 A;  2FYD A;  2ZYP A;  4LYO A;  4NHQ A;  3TMU A;  1JPO A;  9LYZ A;  2YBN A;  1GDW A;  1MEL L;  2NWD X;  4YEM A;  2HEC A;  5A3Z A;  1LMP A;  1JHL A;  4DDA A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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