1FLQA

Hen egg white lysozyme mutant with alanine substituted for glycine
Total Genus 51

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKATDVQAWIRGCRL

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
EMPTYTI1 (39-42)TI'1 (36-39)3H3 (120-124)AH1 (5-15)TII4 (124-127)TII1 (17-20)O2 (6-127)AH2 (25-36)3H1 (20-22)AH3 (88-100)TII'1 (103-106)TI3 (54-57)S1 (43-45)S2 (51-53)TI2 (46-49)TI4 (59-62)S3 (58-59)TI8 (105-108)TI5 (60-63)TI6 (74-77)TII2 (69-72)TIV1 (66-69)3H2 (80-83)TVIII1 (85-88)TIV2 (101-104)TI7 (104-107)AH4 (109-115)TII3 (115-118)O1 (118-120)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
source organism Gallus gallus
publication title Relationship between local structure and stability in hen egg white lysozyme mutant with alanine substituted for glycine
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
total genus 51
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1flqA00
2D6BA 4YEMA 1F6RA 2A7FA 1DKKA 4UWVA 1F10A 1TBYA 3FE0A 5ILCA 1AT5A 5F81A 1LZRA 1D0MA 1LSDA 3D9AC 4WM2A 4GLVA 2Z19A 1IC7Y 4PJ2C 4YF2A 4GN3A 3RT5X 3WH1A 2C8OA 4LYZA 4N1EI 1HERA 4R0FA 1NHEA 1UIHA 3P65A 4WMGA 3TXDA 1GXV2 3A67Y 5LAFA 4LT0A 5II3A 1EL1A 1CKGA 1LZ6A 1GE2A 4PRQA 1LJFA 5F14A 1LZ4A 1LZCA 2MEEA 2DQJY 4FJRA 1ZVHL 4BAPA 2CGIA 1LSGA 2GV0A 4LYCA 1QDRA 1WQPA 4GN4A 2HECA 4D9ZA 5ILFA 1C08C 1FKQA 1GE3A 1QUSA 4H8XA 1YL0X 208LA 4NGKA 5B1FA 3WMKA 3HBHA 1GBZA 2YDGA 1LZYA 1JHLA 3A91A 2NWDX 1GB8A 3W6EA 4LZTA 1REZA 3M18B 4CGEA 1LJJA 1LHLA 1SLYA 2YBLA 1GBXA 4N9RA 3LYTA 1LMQA 4LYBA 1IP7A 2H9KA 4QDNA 3HFMY 1LKRA 1WVVA 2F30A 1EQ5A 4XJBA 1GAYA 5B06A 1N4FA 1IP4A 4NEBA 1XGPC 4NGLA 1LMPA 5KXNA 4PPOA 1ZV5L 4OWCA 2HU1A 1DQJC 2FBBA 4H94A 1UIBA 4B0DA 1BVXA 4Z3MA 1JWRA 2MEFA 1UBZA 2A7DA 1GFRA 3P68A 3AZ7A 4N0JA 1GBOA 1YQVY 3W6DA 2EKSC 4LT1A 1JJ3A 4XADA 1CKFA 4XJFA 1ZMYL 2EQLA 1GFKA 1B9OA 1XEIA 1GFEA 3TXGA 1DI5A 1UIAA 1V7SA 1I1ZA 4B4IA 4TWSA 2YVBA 1D0LA 3A34A 5HMJA 2YBHA 4ETEA 4NG8A 1IWWA 4WM5A 5HNLA 4B4EA 1IWXA 5K7OA 1CKDA 1WQRA 2I26L 4YM8A 3WYHA 1HEQA 1HHLA 1LZ1A 2DQHY 4HTKA 4P2EA 1GE0A 3SP3A 1VDTA 4GCFA 1MLCE 2BLXA 4DD0A 2EPEA 1IWYA 3WVYA 1HC0A 1WQOA 1NF5A 2DQGY 3WPJA 4PRUA 1LSPA 5M1YA 5D5CA 3AZ5A 2ZNWY 2BLYA 3GXRA 5LVIA 1VAUA 1B2KA 2ZNXY 5FDJA 1AT6A 1CKCA 4NHTA 1B5WA 4DC4A 1AKIA 1H6MA 1NBZC 3N9AA 5F9UA 1LZ8A 4J1BA 4AXTA 1WQQA 4HTNA 2F2NA 2BQCA 1BB3A 1NDGC 1YROA 5T3FA 3ZVQB 2BQNA 2Q0MX 1QSAA 2C8PA 1GFHA 1HEWA 2MECA 2PC2A 3AW6A 2MEDA 2W1XA 5DLAA 1GBSA 1JKBA 3RU5A 1BGIA 3IWRA 1LHHA 5E9RA 4H9CA 5LA5A 3RZ4A 4M4OA 1GFVA 4RW2A 5KJ9A 5FHWA 2WARA 4L41A 1B5UA 4G4CA 4WLTA 1LJHA 1CJ7A 2BAAA 1LJ3A 1W6ZA 4GN5C 4H9IA 153LA 1H87A 1LSCA 2LYMA 3EBAB 4KL7A 154LA 1LZTA 1OUGA 3CSZA 2HTXA 3F6ZA 5APDA 3TMWA 1TCYA 2YSSC 4XJIA 5IHGA 3CT1A 4WL7A 1T3PA 1XFPL 2BQEA 1LYYA 2HEEA 1LZNA 1UACY 4II8A 3B0IA 1HSXA 1AZFA 1LJGA 1GF3A 1GFGA 1LKSA 1FKVA 2DQDY 4G4HA 1KIRC 1LYOA 1LZ5A 1CNSA 1HMLA 1T6VL 3CT0A 4LYOA 4TX7A 3W6AA 4A7DA 1IR7A 4NHQA 4EOFA 3AGIA 4AGAA 4ETBA 3A90A 1LMOA 2W1MA 1W08A 1XGTC 2Z39A 4H91A 2DQAA 1OUEA 3AJNA 2LYZA 5A3ZA 3B6LA 1IWZA 3HBEX 4J1AA 193LA 1IWTA 1IWUA 1JJ1A 1GPQC 4UWNA 1GEZA 1GB3A 1QSWA 3CT5A 1HFXA 1JSEA 4XJGA 6LYTA 1HMKA 4G9SA 5HMVA 2HUBA 5KXTA 1UICA 4ETAA 4H93A 2X0AA 2AUBA 1LYZA 3A6BY 1RE2A 1BWIA 194LA 4E3UA 1LJNA 3TXEA 1OUHA 1GF4A 1BHZA 4LYTA 135LA 4IASA 5APEA 5KXZA 4DDCA 3A6CY 1YILA 5B59A 1JUGA 1OUIA 4H9BA 1BB7A 1IWVA 5B07A 3CSRA 2DKVA 1QTEA 1GD6A 2Z2FA 2XTHA 4GCEA 4WM6A 2LHMA 5IELA 5LXWA 1GF6A 1NQIA 5LYTA 4KT3A 1UIGA 3P66A 1RFPA 1NBYC 2EIZC 4NWEA 3AZ4A 1VDSA 1YIKA 2DQEY 1GFAA 1GB7A 1DI4A 4B1AA 1OUBA 4QGZA 1OUCA 1F0WA 1LZ9A 2H9JA 1CJ8A 4HV1A 4LFXA 1GXXA 1IY4A 1DZBX 1JKCA 4G4BA 4RW1A 1CJ9A 1LCNA 2DQCY 1LSMA 1HEPA 1IR8A 4H9FA 4NSHA 3P4ZA 3AGGG 1BQLY 3WUAA 5B05A 1HELA 1KXXA 2F4GA 2MEAA 1HEMA 3AGHA 2ZILA 4N8ZA 1LSBA 2CDSA 4YOPA 1GBWA 3LZ2A 3TXIA 1B0DA 3TXKA 5LYMA 1FLYA 5J7CA 5JENB 1J1PY 2ZYPA 3KAMA 5C6JA 1CJ6A 1RJCB 4H8ZA 3T36A 1BB4A 5I54A 5DN4A 1UIDA 4NSGA 5E4PA 4NSJA 1G7HC 4DDAA 1JSFA 3LZTA 3WUMA 3A8ZA 7LYZA 1TDYA 4NGYA 4GCDA 1QDTA 2I25L 3RNXA 5L3IA 1QUTA 1A2YC 1UCOA 1TEWA 1YANA 3AZ6A 1WTNA 5IDDA 4WOAA 3A94A 4J7VA 5KXWA 2MEBA 2Z18A 4XN6A 1GF7A 2MEGA 5KKJA 1B5ZA 1LOZA 3AB6A 1HFZA 1OUJA 3RW8A 1XSFA 2ZIJA 4XJDA 5KXMA 4PGJB 1BB6A 2BQFA 4KPMA 1FN5A 5KKIA 2LZ2A 1IOCA 4OWAA 3WL2A 3GXKA 1GDWA 1IC4Y 3B0KA 1GB6A 4NIJA 1PS5A 5EBHA 1MELL 1KXWA 4TUNA 5LVGA 3J6KA 1C45A 4TTDA 5APCA 4W94A 1C43A 3A3QA 4HJZA 1B7QA 1I56A 4IJ4A 4MSTA 4NG1A 1VEDA 4OOTA 4WO9A 4DD2A 2BQJA 3CQLA 1LHMA 3QE8A 5C6IA 2MEHA 5A3EA 4PHIA 4ET9A 2BQMA 1GB0A 5C6LA 1FLUA 1IVMA 1IY3A 1JEFA 1O23A 1V7TA 1VDPA 2BQLA 2YBIA 4NGIA 1C46A 1REMA 1JKDA 1LMNA 3A92A 2HU3A 4BS7A 4ZEEA 1XEKA 1UUZC 3LYMA 1GF8A 1B7NA 1KXYA 4H92A 5L3HA 1OUDA 1GDXA 2HEFA 4DD9A 4EMNA 4Z46A 3LYZA 1IP1A 1LTMA 4IATA 2YBJA 3ZVQA 1LMCA 1RI8B 5LINA 1UC0A 2BQBA 1P2CC 4XENA 4NGJA 3A93A 1JITA 4I0CA 5KXOA 1AM7A 1QIOA 4GCBA 3OJPA 1IO5A 4CHXA 4QY9A 1HFYA 1HEOA 4NSIA 1YL1X 2D4KA 4Z98A 3TMVA 1QQYA 3TXHA 3WXTA 3P64A 1JTPL 4OWHA 1IEEA 1XGUC 1OUFA 2BQOA 5FEKA 4RLNA 2W1LA 1DPXA 3WU8A 5DN5A 1C10A 4H90A 4OWBA 2B5ZA 1LSAA 1IR9A 4HJVA 1VDQA 5D5FA 4WLXA 1G7MC 4C5FA 4B4JA 2Z38A 1IC5Y 2LZTA 1LZAA 1LZGA 1B7PA 1KIQC 2D91A 1UIFA 2FYCA 4LT3A 1IOSA 4NHSA 2DQIY 1IOTA 1WVUA 1BWJA 4NGVA 1BWHA 4HTQA 1LHJA 3WUNA 4B49A 1LMAA 1LSFA 4WM3A 4X3BA 5APFA 1CKHA 4WM1A 4GCCA 1IP3A 1J1XY 1LZBA 4WM4A 5DM9A 1GAZA 5KXYA 1QTKA 5HLLA 1NWGA 1YKZX 3N9CA 4LGKA 3TXBA 4DDBA 4DD3A 3WVXA 5I5QA 2H5ZA 3A96A 2N5ZA 2ZIKA 1GHLA 133LA 1JTTL 4H8YA 5LIOA 4MR1A 3N9EA 5I53A 3A3RX 1LSZA 1IORA 5LA8A 2MEIA 4ETCA 2W1YA 4U3XB 1JPOA 1LYSA 4H9HA 5AMYA 1C7PA 4W96A 1B7LA 3HBDA 3WU9A 2F4AA 4WLYA 207LA 3QNGA 5I4WA 1LJ4A 1LHIA 3CSQA 3IJUA 4NFVA 4DT3A 2Z37A 4YEOA 4ANRA 3AW7A 4J0LA 4N1CC 1EQEA 1GF9A 3TMUA 1B7SA 4BADA 1B5VA 1GFTA 5KXXA 1VATA 4BAFA 1WQNA 1E8LA 1Z55A 1LZSA 2FYDA 1HENA 1BB5A 3EO5A 3A95A 1FLWA 4WO6A 1YAQA 2I6ZA 1HF4A 3BKHA 4RLMA 3WPKA 1B5XA 2ZQ4A 4HV2A 3WPLA 3WU7A 4C3WA 2HEDA 1B5YA 2BPUA 2BQGA 2Z2EA 2BQIA 1LJKA 5HQ1A 1GB9A 1ZVYB 3TXFA 1TAYA 4ETDA 2CJLA 1D9UA 1GF0A 2G4QA 3MGWA 5F16A 1OUAA 1D6QA 4NGZA 3WXUA 5KXKA 1JJ0A 4G49A 5KY1A 132LA 1UIEA 4H1PA 4O34A 4OOOA 3WW6A 4DD1A 1REXA 5I4YA 4HP0A 4XJHA 1XEJA 1DI3A 2HEBA 1HNLA 4HPIA 4I8SA 3WW5A 3FI7A 134LA 1HSWA 2D4JA 4NY5A 4OW1A 1NMMA 3J4GA 1D6PA 1EQ4A 3AYQA 2G4PA 4TSBA 3EXDA 1I20A 5LVHA 1G7LC 1LJIA 1DPWA 1BVKC 3W6CA 2Z12A 1GB2A 2VB1A 2ZQ3A 1UA6Y 3D3DA 3LN2A 3T6UA 3OK0A 3WULA 3G3AB 2XJWA 4TSCA 2IHLA 4RDSA 3QY4A 1J1OY 1IP5A 2ZYCA 4WG7A 5KXRA 2YBMA 5B1GA 4ET8A 2RSCA 1PZYA 5KXLA 1NKHA 1FDLY 3CB7A 3B72A 5F9XA 3E3DA 4UWUA 1YAMA 4HJYA 4YENA 3ZEKA 1LSNA 1B7OA 1NDMC 2DQFC 4QEQA 2G4NA 4NGWA 1IP2A 1YKYX 9LYZA 3K3TA 3TMXA 3G3BB 4CFPA 4ZIXA 1LSEA 4LT2A 1REYA 4Z41A 1WQMA 1LSYA 1LMTA 2BQAA 1OP9B 1IIZA 1XGQC 4NWHA 1D0KA 3EMSA 1GWDA 1RCMA 1F6SA 5KXSA 5LVJA 1LJEA 5LYZA 1LAAA 4DD7A 3TXJA 2BQHA 2FBDA 2IFFY 1DKJA 3IJVA 1YAPA 4ZFPA 3BKVA 1LZEA 4ML7A 4FDYA 1GE4A 4HSFA 4HPEA 1G7IC 1FLQA 1IP6A 1G7JC 2ZWBA 3M3UA 4H9EA 2XBRA 2Y8PA 4CFOA 2DBTA 4R6CA 5HNCA 4CJ2A 1JTOL 1GF5A 4NHIA 1VFBC 1YAOA 6LYZA 1YKXX 4WLDA 2YBNA 1GFJA 3B0OA 4LFPA 1ALCA 2LYOA 1IX0A 5KXPA 1GEVA 1GFUA 1KIPC 3ATOA 4NHPA 5LVKA 4DYGA 2CWIA 1GB5A 4LYMA 4N5RA 4NGOA 8LYZA 3W3EA 2HEAA 5I4XA 4KXIA 4GLAA 3W6FA 1GBYA 1B7RA 5FCPA 4WG1A 4H9AA 3LYOA 4M6DA 4WL6A 5FSTA 1SQ2L 1LZDA 1XGRC 3VWOA 1A4VA 1INUA 5L9JA 1FBIX 1OQMA 5FELA 2XBSA 4XYYA 1JISA 2D4IA 1B7MA 4MCKA 1IOQA 1LHKA 2BQDA 3ULRA 3LHMA 1WTMA 3W6BA 1GE1A 1DXJA 1JKAA 1LPIA 1JIYA 4DWXA 3ATNA 2BQKA 5LAGA 5DL9A 4OWEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2D6BA 1F6RA 1DKKA 4UWVA 249LA 5ILCA 1AT5A 5F81A 1LZRA 1IC7Y 3WH1A 2C8OA 149LA 3P65A 3NYAA 5II3A 1T97A 4LT0A 5LAFA 1CKGA 3DKEX 1P64A 2B6YA 199LA 5F14A 1P36A 4FJRA 4GN4A 4D9ZA 1GE3A 3HU9A 1JHLA 2NWDX 1L57A 4LZTA 3M18B 1C64A 1L67A 1P5CA 1T6HA 4CGEA 1CV3A 186LA 4N9RA 1L18A 1WVVA 4XJBA 259LA 5B06A 1XGPC 1LMPA 4PPOA 2A7DA 4N0JA 130LA 4LT1A 1C6TA 4PJZA 2EQLA 1XEIA 3HTGA 1GFEA 1DI5A 1UIAA 1XEPA 1V7SA 4I7OA 3FA0A 1D0LA 3A34A 226LA 2YBHA 4NG8A 5HNLA 5K7OA 1CKDA 1WQRA 4PK0A 2DQHY 191LA 1GE0A 2B72A 1LI2A 1L80A 3WVYA 1NF5A 231LA 3WPJA 2A4TA 5D5CA 2BLYA 2OEAX 3GXRA 5LVIA 1L36A 1D3JA 1NBZC 3N9AA 4AXTA 233LA 2BQCA 4LDLA 2MECA 3DN3A 4EPIA 1GBSA 1L12A 1JKBA 1BGIA 3K2RA 4L41A 3DN0A 1LJHA 201LA 153LA 3EBAB 109LA 154LA 1LZTA 1L07A 3TMWA 1TCYA 4XJIA 5IHGA 1L25A 1XFPL 250LA 255LA 3V2WA 1AZFA 1ZWNA 1KIRC 4TX7A 4EOFA 209LA 1XGTC 2LYZA 3B6LA 4GRVA 1JJ1A 1GPQC 6LYTA 4H93A 2AUBA 194LA 1L04A 4ARPA 3L2XA 4DDCA 1L45A 5B59A 4LDOA 245LA 4GCEA 172LA 3CDOA 4NWEA 4B1AA 185LA 4LFXA 1GXXA 1IY4A 1SWZA 1IR8A 4NSHA 3P4ZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2D6B A;  4YEM A;  1F6R A;  2A7F A;  1DKK A;  4UWV A;  1F10 A;  1TBY A;  3FE0 A;  5ILC A;  1AT5 A;  5F81 A;  1LZR A;  1D0M A;  1LSD A;  3D9A C;  4WM2 A;  4GLV A;  2Z19 A;  1IC7 Y;  4PJ2 C;  4YF2 A;  4GN3 A;  3RT5 X;  3WH1 A;  2C8O A;  4LYZ A;  4N1E I;  1HER A;  4R0F A;  1NHE A;  1UIH A;  3P65 A;  4WMG A;  3TXD A;  1GXV 2;  3A67 Y;  5LAF A;  4LT0 A;  5II3 A;  1EL1 A;  1CKG A;  1LZ6 A;  1GE2 A;  4PRQ A;  1LJF A;  5F14 A;  1LZ4 A;  1LZC A;  2MEE A;  2DQJ Y;  4FJR A;  1ZVH L;  4BAP A;  2CGI A;  1LSG A;  2GV0 A;  4LYC A;  1QDR A;  1WQP A;  4GN4 A;  2HEC A;  4D9Z A;  5ILF A;  1C08 C;  1FKQ A;  1GE3 A;  1QUS A;  4H8X A;  1YL0 X;  208L A;  4NGK A;  5B1F A;  3WMK A;  3HBH A;  1GBZ A;  2YDG A;  1LZY A;  1JHL A;  3A91 A;  2NWD X;  1GB8 A;  3W6E A;  4LZT A;  1REZ A;  3M18 B;  4CGE A;  1LJJ A;  1LHL A;  1SLY A;  2YBL A;  1GBX A;  4N9R A;  3LYT A;  1LMQ A;  4LYB A;  1IP7 A;  2H9K A;  4QDN A;  3HFM Y;  1LKR A;  1WVV A;  2F30 A;  1EQ5 A;  4XJB A;  1GAY A;  5B06 A;  1N4F A;  1IP4 A;  4NEB A;  1XGP C;  4NGL A; 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 2I6Z A;  1HF4 A;  3BKH A;  4RLM A;  3WPK A;  1B5X A;  2ZQ4 A;  4HV2 A;  3WPL A;  3WU7 A;  4C3W A;  2HED A;  1B5Y A;  2BPU A;  2BQG A;  2Z2E A;  2BQI A;  1LJK A;  5HQ1 A;  1GB9 A;  1ZVY B;  3TXF A;  1TAY A;  4ETD A;  2CJL A;  1D9U A;  1GF0 A;  2G4Q A;  3MGW A;  5F16 A;  1OUA A;  1D6Q A;  4NGZ A;  3WXU A;  5KXK A;  1JJ0 A;  4G49 A;  5KY1 A;  132L A;  1UIE A;  4H1P A;  4O34 A;  4OOO A;  3WW6 A;  4DD1 A;  1REX A;  5I4Y A;  4HP0 A;  4XJH A;  1XEJ A;  1DI3 A;  2HEB A;  1HNL A;  4HPI A;  4I8S A;  3WW5 A;  3FI7 A;  134L A;  1HSW A;  2D4J A;  4NY5 A;  4OW1 A;  1NMM A;  3J4G A;  1D6P A;  1EQ4 A;  3AYQ A;  2G4P A;  4TSB A;  3EXD A;  1I20 A;  5LVH A;  1G7L C;  1LJI A;  1DPW A;  1BVK C;  3W6C A;  2Z12 A;  1GB2 A;  2VB1 A;  2ZQ3 A;  1UA6 Y;  3D3D A;  3LN2 A;  3T6U A;  3OK0 A;  3WUL A;  3G3A B;  2XJW A;  4TSC A;  2IHL A;  4RDS A;  3QY4 A;  1J1O Y;  1IP5 A;  2ZYC A;  4WG7 A;  5KXR A;  2YBM A;  5B1G A;  4ET8 A;  2RSC A;  1PZY A;  5KXL A;  1NKH A;  1FDL Y;  3CB7 A;  3B72 A;  5F9X A;  3E3D A;  4UWU A;  1YAM A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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