1G0GA

Crystal structure of t4 lysozyme mutant t152a
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITAFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and thermodynamic analysis of the binding of solvent at internal sites in T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 60
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1g0gA00
258LA 2RB1X 1OWZA 1C67A 1QSQA 4EKRA 148LE 2B72A 1QTVA 4ZPUA 1I6SA 3GUPA 1QTZA 175LA 7LZMA 1G0GA 122LA 113LA 3C8SA 4K5YA 3D4SA 2Z6BA 2RBQA 262LA 1L18A 4W51A 1CU0A 1CV1A 1P46A 1SX2A 209LA 2QB0B 236LA 1L0KA 1QSBA 2F32A 1QT6A 1C6HA 115LA 1CU3A 140LA 1SSYA 1L40A 1P7SA 1L85A 1L42A 2ANVA 1PQDA 1CV3A 1L04A 2IGCA 1C65A 4I7LA 1L68A 222LA 1L0JA 1C69A 2B6XA 112LA 3SB9A 1L24A 1XEPA 3SB6A 4YX7C 1DYCA 3OE9A 3CDVA 4ARQB 147LA 192LA 1LPYA 240LA 4GBRB 2O79A 1LW9A 1QT5A 227LA 1C64A 1L77A 1ZURA 257LA 2NTHA 1C6NA 228LA 3CDRA 1C60A 1D9WA 102LA 1L22A 3DN8A 3SB5A 1PQIA 1C6TA 4I7SA 2L78A 2B6YA 3HUKA 4I7MA 3C83A 2RBOA 5I14A 4W56A 3DMVA 1L03A 3CDQA 3NY9A 1L09A 169LA 1DYBA 181LA 1KW7A 4EPFA 129LA 180LA 196LA 1G0PA 5LZMA 221LA 200LA 4EKQA 1L63A 1P3NA 2RBRA 1L88A 3RZEA 1LLHA 1OVJA 1SSWA 245LA 191LA 3FADA 4I7NA 6LZMA 185LA 2B75A 1L99A 156LA 2LZMA 3HH6A 1L32A 2RAYX 1JTNA 1C66A 1QUOA 1LGWA 1L21A 250LA 2OU8A 4I7KA 4PJZA 1L98A 2RBSA 1PQOA 1D2YA 1L92A 1D3FA 1L81A 3DNAA 4EPIA 1D2WA 1L39A 137LA 143LA 1L08A 1L01A 1LI2A 3G3VA 214LA 3HH3A 3SBAA 108LA 146LA 2F47A 4DAJA 1DYEA 3OE8A 1L45A 226LA 3V2YA 234LA 2OTYX 3G3XA 149LA 182LA 1C6GA 4LDEA 201LA 1G0MA 3K2RA 1C61A 127LA 1XJUA 4OO9A 1C6FA 1L66A 2HULA 161LA 1L46A 3HUAA 1DYFA 3PBLA 1KY0A 120LA 2HUKA 160LA 1L56A 2RAZX 3HWLA 3QAKA 1LI6A 2OE4X 2O7AA 217LA 150LA 1G07A 1L36A 1KNIA 3DN3A 1KW5A 1LI3A 1L16A 1L71A 195LA 1OVHA 216LA 210LA 163LA 2NTGA 4DJHA 254LA 1L37A 1LYFA 3GUMA 1SWYA 3C8RA 1OWYA 109LA 1P56A 1L91A 233LA 118LA 1L97A 1PQJA 1L14A 3DN1A 253LA 4S0WA 1CVKA 223LA 1L72A 176LA 1QUDA 1PQKA 1LYIA 1L10A 1QTDA 1L54A 1LYDA 145LA 249LA 3LZMA 1D3NA 1KY1A 1C6EA 3F9LA 1C6AA 2Q9DA 1T8FA 1L43A 3SBBC 1P6YA 1PQMA 2B6WA 164LA 1L00A 1B6IA 235LA 251LA 4I7QA 152LA 104LA 4EXMA 2LC9A 237LA 3EMLA 1LWKA 159LA 4IAPA 168LA 167LA 3SB7A 3C81A 1QT3A 256LA 218LA 1L17A 3HU9A 173LA 212LA 3DKEX 4DKLA 1L70A 3JR6A 3GUOA 1L84A 1WTHA 131LA 242LA 1L62A 255LA 4EKPA 1L34A 4YXAC 4PK0A 119LA 1NHBA 1XJTA 2O4WA 1L53A 1L55A 3NYAA 1DYGA 4W54A 4ARJA 1L13A 1L67A 1L73A 247LA 3GULA 3GUIA 4AQNA 103LA 1OV7A 1L80A 3HT6A 3HUQA 1L87A 1L64A 1L51A 1C6KA 1SX7A 3DN6A 174LA 1QS5A 199LA 4W58A 2OU9A 1JQUA 1L74A 3G3WA 177LA 155LA 4EKSA 1D3MA 3C7YA 1P2LA 1T6HA 1G1WA 126LA 2OE7X 1OYUA 1DYAA 3SB8A 3CDOA 1L95A 1CV4A 1L23A 1KS3A 1L19A 141LA 1CX7A 1L12A 1QTHA 215LA 3HTFA 243LA 1L27A 197LA 1L86A 1LGXA 1CV0A 2LCBA 1LYGA 3DN4A 1LYEA 184LA 1QTCA 1P37A 1C6IA 1L79A 220LA 232LA 1T97A 3HT8A 1L57A 4GRVA 1SWZA 3UONA 2CUUA 239LA 3F8VA 1C6DA 1G0JA 1CU2A 1L49A 1L05A 3HTBA 130LA 4W52A 1P36A 3SN6R 1CU6A 1L82A 1L20A 111LA 1LYHA 3FA0A 1G0KA 1LYJA 1C6PA 3OE6A 1L58A 206LA 238LA 2B70A 205LA 186LA 3HTDA 4ARQA 246LA 2F2QA 2OEAX 4YXCA 190LA 1L38A 3HTGA 171LA 1L61A 2OE9X 1K28A 1QUGA 172LA 2Q9EA 3C7ZA 3HU8A 3NY8A 3C7WA 125LA 1P2RA 2HUMA 4I7TA 1C68A 107LA 1C6JA 1QS9A 4I7JA 1C6MA 1P5CA 1L52A 1L25A 1QT8A 3PDSA 151LA 3HDEA 1ZWNA 3HT9A 1P64A 1L30A 189LA 1L69A 230LA 3L64A 1C6CA 1T8GA 3VW7A 1L41A 114LA 1L29A 1C6QA 1G1VA 3GUNA 4I7RA 2B6ZA 1D3JA 2OU0X 2RBNA 219LA 183LA 3DMXA 1L28A 252LA 1LWGA 211LA 3FI5A 4W59A 1TLAA 1L94A 3GUKA 1L15A 1L65A 2B7XA 1T8AA 1QT7A 4LZMA 1L93A 4W55A 1L89A 1EPYA 162LA 3HT7A 198LA 3CDTA 4EJ4A 1L31A 1L35A 4LDLA 4ARLA 1CUQA 3V2WA 3OE0A 1L26A 1L48A 213LA 4W53A 166LA 261LA 187LA 1L60A 1G0QA 1OVKA 1QT4A 178LA 229LA 4I7OA 157LA 248LA 1C6LA 244LA 3DN2A 231LA 165LA 1C63A 1L11A 1JTMA 128LA 1L76A 1L33A 4ARMA 2B74A 3GUJA 188LA 3C8QA 224LA 3C82A 3ODUA 1L96A 1L75A 2B6TA 144LA 260LA 110LA 259LA 2RB2X 142LA 139LA 4ARPA 1CTWA 3RUNA 1C62A 1L44A 1L47A 3HDFA 3HH5A 1DYDA 1C6BA 4LDOA 1L06A 2B73A 225LA 4E97A 1L50A 1CV5A 2RB0X 1CUPA 1OV5A 2ANXA 4W57A 1ZYTA 158LA 3L2XA 123LA 1LGUA 170LA 1G06A 1CX6A 3DN0A 2OTZX 2QARC 241LA 1L83A 3C80A 1L90A 2A4TA 4ARMB 4I7PA 1L02A 2RH1A 3HH4A 2RBPA 1CV6A 1L07A 138LA 3DMZA 1G0LA 1QUHA 1L59A 1QTBA 1CU5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3P68A 258LA 2RB1X 1OWZA 1C67A 148LE 5KKJA 1HFXA 4ZPUA 1I6SA 1LZ6A 175LA 5ILCA 1G0GA 4AXTA 1IC7Y 3D4SA 262LA 4IASA 4ET8A 1WQMA 1CV1A 2QB0B 2F32A 1C6HA 115LA 1E8LA 2Z12A 1AM7A 1GFHA 4PJ2C 1HHLA 1L0JA 3WMKA 4FJRA 4CGEA 112LA 3A3QA 1NBYC 3SB6A 1UIDA 2FYDA 4QEQA 1IOSA 147LA 2CWIA 2LYOA 1LW9A 3MGWA 1OUDA 2C8OA 1LZ4A 1L77A 1LHLA 1B7RA 3CQLA 1LSBA 1GDWA 1GF3A 3CT5A 1D9WA 3WU7A 5I54A 1GFTA 5T3FA 1FN5A 5LVJA 2L78A 2X0AA 2YBLA 3DMVA 3NY9A 169LA 4XENA 5DLAA 4EPFA 196LA 1G0PA 3IJUA 200LA 3WU9A 1IOQA 5L3HA 4R6CA 3RZEA 1LLHA 1OVJA 4NGYA 191LA 4J7VA 1JTNA 1QUOA 1NDGC 1LGWA 1OUGA 3AGIA 1L81A 2LYMA 1L39A 2XQOA 1NWGA 3HBEX 3G3VA 146LA 5B1GA 4DD9A 153LA 5E4PA 3V2YA 2OTYX 208LA 2BQHA 4B1AA 3D9AC 1B5VA 5FEKA 127LA 4U3XB 4OO9A 2DKVA 1FLQA 5KXOA 3WULA 1HMLA 2HUKA 160LA 2LZ2A 1GE0A 1T3PA 2O7AA 5EBHA 4HTNA 1G07A 2F2NA 4DQ5A 1KNIA 1L16A 195LA 1OVHA 216LA 2NTGA 3SP3A 4DDCA 1IO5A 3GXRA 3CSQA 1L91A 4H9FA 1G7MC 1GF4A 253LA 1CVKA 1JUGA 1QUDA 1PQKA 1CKDA 1BQLY 3LZMA 1KY1A 4O34A 1L43A 3SBBC 1PQMA 2F4AA 3KAMA 164LA 3CT1A 3A93A 235LA 4MCKA 3EO5A 1DI4A 4H9CA 5IELA 104LA 2EIZC 1BB4A 1LSZA 167LA 4AGAA 1QT3A 218LA 4PHIA 4NG8A 1GBOA 212LA 3DKEX 2XTHA 4DKLA 1L70A 1BVKC 1L84A 5DN4A 4EKPA 3W6CA 4PK0A 1AT5A 1LSDA 1CJ9A 3ATOA 4H9IA 1RFPA 5IDDA 1GXXA 1LJHA 3WUNA 1UIEA 3NYAA 4W54A 1GFGA 1MELL 5I53A 1DKKA 2DBTA 1IP4A 4AQNA 103LA 4C5FA 1LHHA 2YBJA 2CGIA 3HUQA 3OJPA 4WLDA 1L51A 2Z2FA 4WLXA 199LA 4TUNA 2BQOA 3LYMA 4H8XA 1L74A 4XYYA 1FLWA 1T6HA 3LZTA 4NGOA 5JENB 1B5ZA 1INUA 3A8ZA 4DC4A 5A3EA 1OQMA 3RT5X 1LMNA 3AYQA 5KXLA 215LA 1L86A 1CV0A 2LCBA 1LYGA 2D4JA 1LKRA 4NGJA 1P37A 1C6IA 1GFUA 1L79A 4TSCA 1UIGA 4HP0A 1GB6A 1L57A 3UONA 239LA 3F8VA 1XSFA 1L49A 4H9AA 130LA 4XN6A 4ETCA 1OUFA 3SN6R 5L3IA 1GWDA 2ZYPA 1G0KA 1LYJA 4M4OA 1C6PA 206LA 186LA 1EL1A 1REMA 246LA 2F2QA 4YXCA 1K28A 1QUGA 2EKSC 1LMTA 3NY8A 3C7WA 3ZVQA 2HUMA 1LZYA 107LA 4I7JA 5LA8A 3AW6A 1LZ5A 4B4EA 1LYOA 4WLYA 1YAQA 1OUJA 1P64A 1BB3A 230LA 1HMKA 4N1EI 3VW7A 114LA 5LVKA 4OWBA 4DDBA 193LA 2OU0X 183LA 3DMXA 1L28A 1SQ2L 3HBHA 1REYA 1LZRA 211LA 1TLAA 4GN5C 1GBSA 1LHMA 1UCOA 1JSFA 3TXFA 4W55A 5DL9A 3CDTA 4DD0A 1L31A 4OWHA 4ARLA 1LZAA 1CUQA 3ZVQB 1IIZA 3A91A 3OE0A 1L26A 213LA 2Z38A 4YF2A 166LA 2B5ZA 1JITA 4NHSA 1OVKA 1HEMA 1LSEA 1GD6A 4WL6A 4H91A 2G4QA 1JTMA 4OWAA 4H93A 1IWTA 5I4WA 1VEDA 1GE3A 3E3DA 2WARA 1JSEA 1CKHA 3GUJA 188LA 3C8QA 1XFPL 1GAYA 4LT2A 144LA 5C6LA 1QSAA 2RB2X 3CSRA 1CTWA 2MEFA 4Z98A 1L47A 3WU8A 1IX0A 3HDFA 1DYDA 3A6CY 4ZFPA 1CUPA 4H9BA 3RW8A 4R0FA 123LA 3G3AB 1B0DA 4GCBA 7LYZA 1GF5A 2OTZX 1F6RA 241LA 1L83A 3A95A 5HMVA 1I1ZA 4DT3A 1B7LA 3HH4A 1RCMA 1HFZA 4DD7A 1GFAA 2BQAA 1QTBA 5B05A 4DD3A 2ZILA 2B72A 1DZBX 3HFMY 2LYZA 3LN2A 4MR1A 4NSGA 113LA 2BQMA 3C8SA 2MEBA 4K5YA 5F16A 1GBZA 4FDYA 4W51A 1YQVY 1OUBA 1B5XA 3RNXA 236LA 1CKFA 1QSBA 207LA 1QT6A 2RSCA 4GCDA 140LA 3CT0A 1P7SA 2DQAA 5KXRA 1IP2A 4WM2A 1L04A 1CNSA 3LYZA 1C65A 4H90A 4I7LA 222LA 3AZ7A 1C69A 1J1PY 5I4YA 4NGWA 3OE9A 2I25L 3BKHA 1FBIX 192LA 1LPYA 4HV1A 1GE1A 1LSAA 1AZFA 1QT5A 4LYOA 1LZDA 2W1MA 3A3RX 1C64A 3T36A 4LGKA 2NTHA 1C60A 3SB5A 2BQFA 3W6EA 1AKIA 2MEIA 1HEWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3P68 A;  258L A;  2RB1 X;  1OWZ A;  1C67 A;  148L E;  5KKJ A;  1HFX A;  4ZPU A;  1I6S A;  1LZ6 A;  175L A;  5ILC A;  1G0G A;  4AXT A;  1IC7 Y;  3D4S A;  262L A;  4IAS A;  4ET8 A;  1WQM A;  1CV1 A;  2QB0 B;  2F32 A;  1C6H A;  115L A;  1E8L A;  2Z12 A;  1AM7 A;  1GFH A;  4PJ2 C;  1HHL A;  1L0J A;  3WMK A;  4FJR A;  4CGE A;  112L A;  3A3Q A;  1NBY C;  3SB6 A;  1UID A;  2FYD A;  4QEQ A;  1IOS A;  147L A;  2CWI A;  2LYO A;  1LW9 A;  3MGW A;  1OUD A;  2C8O A;  1LZ4 A;  1L77 A;  1LHL A;  1B7R A;  3CQL A;  1LSB A;  1GDW A;  1GF3 A;  3CT5 A;  1D9W A;  3WU7 A;  5I54 A;  1GFT A;  5T3F A;  1FN5 A;  5LVJ A;  2L78 A;  2X0A A;  2YBL A;  3DMV A;  3NY9 A;  169L A;  4XEN A;  5DLA A;  4EPF A;  196L A;  1G0P A;  3IJU A;  200L A;  3WU9 A;  1IOQ A;  5L3H A;  4R6C A;  3RZE A;  1LLH A;  1OVJ A;  4NGY A;  191L A;  4J7V A;  1JTN A;  1QUO A;  1NDG C;  1LGW A;  1OUG A;  3AGI A;  1L81 A;  2LYM A;  1L39 A;  2XQO A;  1NWG A;  3HBE X;  3G3V A;  146L A;  5B1G A;  4DD9 A;  153L A;  5E4P A;  3V2Y A;  2OTY X;  208L A;  2BQH A; 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