1G0LA

Crystal structure of t4 lysozyme mutant t152v
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITVFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Structural and thermodynamic analysis of the binding of solvent at internal sites in T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1g0lA00
123LA 1CU0A 1L21A 1L34A 1CV6A 1L64A 247LA 2B6TA 1LYFA 211LA 113LA 261LA 110LA 1G0LA 1G0QA 1CX7A 2F2QA 1L87A 4EKSA 126LA 1L67A 4PK0A 245LA 1C6LA 177LA 1L88A 1L49A 4EKRA 4ARMB 200LA 253LA 3HU8A 4LZMA 224LA 1CU2A 1G1VA 236LA 3HT8A 2O7AA 1SX2A 1L70A 2LCBA 4I7OA 7LZMA 1QSBA 1P6YA 225LA 1L51A 1L72A 4W55A 222LA 3GUKA 1P37A 1L73A 1L69A 1L52A 111LA 1L63A 1OV5A 1PQJA 1L84A 102LA 1QTHA 1ZWNA 5LZMA 1SWYA 1SX7A 1L58A 226LA 3DNAA 2HUKA 1QUHA 1G0PA 1NHBA 146LA 187LA 3ODUA 149LA 2RBPA 1D2YA 191LA 131LA 3HDEA 196LA 188LA 140LA 1L68A 206LA 2B6XA 1D3MA 3NY8A 1C6AA 1LYGA 220LA 218LA 1DYFA 3G3VA 197LA 118LA 1G0JA 142LA 2F47A 3CDQA 195LA 3DMZA 129LA 1L11A 4EPFA 150LA 3HH4A 2O79A 2OEAX 3HT6A 139LA 1L17A 4I7RA 1B6IA 4W51A 1DYGA 3QAKA 4S0WA 257LA 115LA 1L27A 1L85A 1C63A 205LA 3CDTA 242LA 1CVKA 4DJHA 1TLAA 243LA 3GUIA 1LYHA 3SB9A 4I7LA 1CV0A 163LA 1L0KA 4I7TA 1L80A 1P36A 2CUUA 141LA 198LA 1C60A 3GUJA 1C6IA 1LYJA 1QT5A 1QT4A 1DYBA 3DN0A 1T8GA 2OE4X 1QTBA 1L02A 1QSQA 1I6SA 1XJTA 2B72A 152LA 2RB2X 2IGCA 3SBBC 1L71A 1L81A 2HUMA 3HH6A 3UONA 4W59A 178LA 2RBSA 180LA 3FA0A 1L42A 3G3XA 171LA 1D9WA 1C65A 130LA 1L66A 1KW7A 250LA 1L96A 1L91A 1L20A 254LA 3HTGA 1C6EA 249LA 3OE9A 1QT8A 1SSWA 1C69A 1C6NA 2OU0X 4GRVA 4EKPA 1L89A 232LA 3DN1A 3C7ZA 4I7KA 1L48A 1QS9A 2O4WA 4IAPA 192LA 3HWLA 3GUOA 1L61A 2B6ZA 1OVHA 1L97A 1PQKA 4W56A 1DYDA 251LA 4EPIA 3K2RA 3OE8A 3C83A 3GUMA 1C68A 1D3JA 3RZEA 3L64A 1L59A 1L47A 1L19A 4LDOA 1C6HA 3HH5A 217LA 1QUGA 4GBRB 4ARQB 128LA 3GULA 2Q9DA 112LA 2RAYX 234LA 1OYUA 235LA 1C6JA 1CV5A 1OWYA 1JTNA 1L37A 210LA 3PBLA 1C6KA 3D4SA 1L60A 1LI2A 3DN3A 1D2WA 2RBNA 1L07A 262LA 1DYAA 3DKEX 1QTCA 1T8AA 1L83A 159LA 4EKQA 1CUQA 3DMXA 1CX6A 1C6DA 144LA 119LA 201LA 2OE7X 1L28A 255LA 155LA 104LA 1P2RA 2B75A 1L04A 244LA 213LA 4ARMA 3GUNA 1L92A 1C6TA 223LA 2RAZX 108LA 1PQDA 4DAJA 229LA 1L30A 3SB7A 4I7SA 182LA 3HTBA 109LA 4ARQA 1L90A 103LA 167LA 3HT9A 212LA 1C6BA 2RBQA 1QUOA 1D3NA 1LW9A 1KNIA 3C7WA 3DN4A 1QT7A 227LA 4ZPUA 1C6CA 1CU5A 1L06A 1L65A 5I14A 160LA 1L36A 157LA 1OV7A 2B6WA 1C6PA 3C80A 215LA 3OE0A 4ARPA 3C81A 158LA 3FI5A 2OE9X 1JTMA 3HTFA 127LA 1L31A 1L99A 1C66A 1XEPA 1L40A 107LA 2B7XA 1K28A 1P7SA 165LA 1L50A 1LWGA 1ZYTA 1DYEA 1CU6A 2NTGA 1LPYA 173LA 248LA 2B74A 161LA 1L15A 4YX7C 1C64A 1C61A 240LA 1LI6A 1L33A 1C6QA 4I7PA 1CU3A 114LA 122LA 137LA 2LC9A 148LE 4YXAC 1OVKA 3V2WA 209LA 4OO9A 4W52A 4AQNA 4EXMA 2Z6BA 1G0MA 1L0JA 2QB0B 1PQOA 1L24A 1L38A 172LA 3DMVA 230LA 2OTYX 1L95A 1L62A 3FADA 1L94A 1WTHA 175LA 3F9LA 151LA 184LA 176LA 1QTZA 1QUDA 3SN6R 3HDFA 1L44A 1P56A 3C8QA 256LA 1L00A 1L16A 162LA 174LA 3CDRA 2RBRA 1L43A 1P64A 1G07A 216LA 2B73A 1L10A 1L01A 1XJUA 4ARLA 1SSYA 1L82A 1L75A 169LA 1CV3A 3HH3A 4DKLA 1L41A 3NYAA 1L32A 4ARJA 1QS5A 1L86A 143LA 3SB6A 252LA 1OWZA 3DN2A 4YXCA 1L09A 1LYIA 1LGXA 1QT6A 2B70A 1CV1A 1L79A 1L76A 1P5CA 214LA 3HUAA 4W53A 3GUPA 4PJZA 1KY1A 1L29A 1LWKA 4K5YA 246LA 1L18A 228LA 3DN8A 4LDLA 241LA 3HU9A 1L54A 2B6YA 3C8RA 3L2XA 1L05A 3RUNA 138LA 1P3NA 1D3FA 3HUKA 1L13A 1L93A 1QT3A 1QTDA 189LA 4I7MA 1KS3A 1G06A 2OU8A 183LA 1LI3A 239LA 4W57A 1P2LA 1L03A 1DYCA 3NY9A 3CDOA 3SB8A 4I7JA 2Q9EA 233LA 258LA 231LA 3LZMA 1PQMA 1L74A 1L23A 3HUQA 3G3WA 164LA 3HTDA 1LGUA 2RB1X 259LA 3HT7A 3EMLA 3V2YA 3OE6A 186LA 1T6HA 2RB0X 3JR6A 1L22A 1L08A 3SB5A 4W54A 1JQUA 1L56A 4EJ4A 1CUPA 1C6GA 125LA 4I7NA 2L78A 1G0GA 1G1WA 1G0KA 1L12A 1CTWA 1KY0A 1L26A 1L57A 1ZURA 1T8FA 2HULA 3VW7A 1EPYA 1LGWA 3C8SA 3DN6A 4I7QA 1L35A 2OU9A 2RBOA 3F8VA 219LA 1L53A 6LZMA 190LA 1PQIA 1KW5A 1L46A 221LA 1CV4A 1C67A 3C82A 3SBAA 120LA 2RH1A 199LA 1L25A 2A4TA 1L14A 4E97A 1SWZA 3CDVA 1LYDA 1C6FA 1OVJA 1C62A 170LA 4W58A 145LA 2F32A 2LZMA 237LA 156LA 1L98A 168LA 2NTHA 4LDEA 1C6MA 2ANXA 181LA 1L55A 1T97A 1QTVA 2ANVA 1L39A 3PDSA 3C7YA 1P46A 1LYEA 1L77A 2QARC 260LA 147LA 166LA 185LA 1LLHA 1L45A 2OTZX 238LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Z37A 3TXJA 3WU7A 1LYFA 2A7DA 1CX7A 1HMKA 5KKJA 245LA 3IJUA 1C6LA 177LA 3ULRA 4B4IA 1GB9A 253LA 4J1BA 1JHLA 224LA 5KXLA 3M18B 5K7OA 7LZMA 4OWHA 1QSBA 1P6YA 4G9SA 1LJIA 2EPEA 1L72A 1LSNA 1KXYA 4ET8A 1HF4A 2LYOA 4CFOA 1L52A 4PGJB 1YIKA 4ANRA 5HMVA 102LA 1G7MC 5LZMA 1SX7A 1NHBA 3OK0A 1T6VL 3ODUA 2RBPA 1KXWA 140LA 2YBJA 1GF6A 5LYZA 1L68A 1GF7A 3NY8A 3N9CA 220LA 218LA 4ETAA 2I25L 1BB4A 5LVKA 1WQOA 197LA 2B5ZA 1VATA 2F47A 3EBAB 129LA 4EPFA 3HH4A 3HT6A 139LA 1L17A 1B6IA 3CB7A 3P68A 4S0WA 1L27A 1L85A 4BADA 2F30A 242LA 1CVKA 2Z18A 4HTKA 1TLAA 4WG7A 2IFFY 1L0KA 4DD0A 3FI7A 3WMKA 3CSQA 4I0CA 1LSAA 141LA 4TTDA 1EQEA 1DYBA 3DN0A 1T8GA 4G4BA 4OWCA 4GLAA 1QSQA 1XJTA 2B72A 4GN4A 1GXXA 1LSFA 4ETCA 1LZ6A 3HH6A 4GLVA 4W59A 5F9UA 4LYCA 3G3XA 4LT0A 250LA 4H90A 1L96A 1L20A 1C6EA 5L9JA 1IC5Y 1GB7A 1QT8A 1SSWA 1GBXA 4PPOA 1IR7A 2Z38A 1LAAA 1UCOA 5KXXA 2O4WA 1LZTA 4RW1A 1L97A 1D6QA 2BQLA 5KXKA 1CJ8A 4DD3A 4W56A 3D3DA 3M3UA 2DQAA 1D3JA 2HEAA 4LDOA 1C6HA 2C8PA 1QUGA 1JPOA 3LHMA 1LMPA 2N5ZA 234LA 1OYUA 1LSBA 3A93A 4NHIA 4HPIA 1C6KA 3P65A 1KIPC 2RBNA 262LA 5FEKA 5C6JA 4EKQA 1CUQA 3DMXA 1C6DA 1HFZA 2HEBA 4YM8A 1JJ1A 119LA 201LA 2OE7X 1TCYA 1P2RA 1CKDA 4QY9A 1G7JC 244LA 3RNXA 4H9AA 135LA 4UWUA 3SP3A 1PQDA 1BWIA 3A94A 1XEJA 2ZQ3A 182LA 4H1PA 4GCFA 5LYMA 1I56A 4ML7A 3HT9A 1C6BA 4AXTA 1LMTA 2MEIA 2MEAA 4NSHA 1V7SA 1RE2A 1RI8B 5HMJA 1CU5A 2EQLA 1L65A 5KXNA 3EO5A 1L36A 4XJIA 157LA 1OV7A 3C80A 3OE0A 2NWDX 9LYZA 3FI5A 4EMNA 2FYDA 127LA 3HTFA 1XEPA 1HMLA 5FELA 1P7SA 4ZEEA 1DYEA 1JJ0A 4NWHA 1LSMA 2B74A 173LA 3WULA 2BLXA 1C64A 3W6FA 3E3DA 2HEEA 1L33A 1QTEA 1C6QA 3B72A 1CU3A 1LSZA 153LA 4Z3MA 1H6MA 3G3AB 1GFGA 4GN3A 1IX0A 2ZIJA 172LA 5DN4A 230LA 4DQ7A 184LA 4I8SA 4KXIA 2MEEA 3C8QA 162LA 5DLAA 4OOTA 1L43A 1B5XA 5F14A 3HH3A 1OUIA 4WLXA 1L32A 1QS5A 1L86A 1B5VA 4H9CA 2BQJA 3J4GA 4LT2A 4YXCA 1INUA 1BHZA 1LGXA 2B70A 1CV1A 1LZ8A 1L76A 4NGOA 4W53A 4TX7A 3P4ZA 1WQPA 1GF8A 1FBIX 5M1YA 228LA 1C08C 241LA 4M6DA 4WL6A 1YAQA 1GB5A 1HSWA 3HUKA 5DM9A 1RFPA 1JUGA 1P2LA 3NY9A 3CDOA 2MEGA 2YBLA 2Z39A 1G7HC 231LA 1LZGA 1PQMA 2MEDA 3G3WA 164LA 1LGUA 3HBDA 4PRQA 5D5CA 5HQ1A 1SQ2L 3V2YA 2LZTA 1T6HA 2RB0X 2F4GA 4W54A 1IP2A 1UIAA 3B0IA 1CUPA 1GF5A 2DQGY 2DQEY 1G0KA 1L12A 4LYMA 4PJ2C 1L26A 1L57A 1XFPL 1JKAA 1GXV2 3WPKA 3LZTA 3WH1A 1BB6A 1LZAA 3D9AC 1LYOA 1JSEA 3AJNA 1KW5A 4Z46A 4A7DA 1C67A 5C6LA 3SBAA 2RH1A 3AB6A 1SWZA 3CQLA 4W58A 4NHTA 4LDEA 1WQRA 1VFBC 2YBHA 1L39A 3AW7A 5APDA 4GCDA 1AZFA 1B5WA 2QARC 1HFYA 185LA 3VW7A 4NGLA 1IWXA 123LA 1CU0A 1HHLA 1QQYA 1CV6A 110LA 1HENA 3AGGG 133LA 1G0QA 2F2QA 1LJGA 1IP4A 126LA 1L67A 1P2CC 2D4JA 4PK0A 4O34A 5LA5A 2DQFC 4EKRA 5HLLA 3HU8A 1G1VA 3HT8A 5LA8A 5F9XA 1LJEA 4II8A 4DQ5A 1LZEA 1UUZC 5KJ9A 225LA 1BWHA 4W55A 222LA 4QGZA 1L69A 1LJFA 1L63A 2Z2FA 1ZWNA 1SWYA 1QUSA 3N9AA 3ZVQB 4NG1A 5L3IA 4NIJA 1HEQA 1D2YA 1IOCA 131LA 4LYZA 188LA 206LA 5IHGA 1D3MA 1LZ9A 4HJYA 1IY4A 1LYGA 4DDCA 1BVKC 118LA 3CDQA 142LA 4NSIA 5AMYA 4HP0A 3DMZA 1L11A 1XGQC 3W6BA 4W51A 2VB1A 1YKXX 3QAKA 257LA 115LA 2HUBA 5DL9A 1J1PY 5J7CA 1GFKA 4C5FA 207LA 5I54A 3CDTA 1LSEA 3GUIA 1JITA 3ZVQA 1LYHA 4I7LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2Z37 A;  3TXJ A;  3WU7 A;  1LYF A;  2A7D A;  1CX7 A;  1HMK A;  5KKJ A;  245L A;  3IJU A;  1C6L A;  177L A;  3ULR A;  4B4I A;  1GB9 A;  253L A;  4J1B A;  1JHL A;  224L A;  5KXL A;  3M18 B;  5K7O A;  7LZM A;  4OWH A;  1QSB A;  1P6Y A;  4G9S A;  1LJI A;  2EPE A;  1L72 A;  1LSN A;  1KXY A;  4ET8 A;  1HF4 A;  2LYO A;  4CFO A;  1L52 A;  4PGJ B;  1YIK A;  4ANR A;  5HMV A;  102L A;  1G7M C;  5LZM A;  1SX7 A;  1NHB A;  3OK0 A;  1T6V L;  3ODU A;  2RBP A;  1KXW A;  140L A;  2YBJ A;  1GF6 A;  5LYZ A;  1L68 A;  1GF7 A;  3NY8 A;  3N9C A;  220L A;  218L A;  4ETA A;  2I25 L;  1BB4 A;  5LVK A;  1WQO A;  197L A;  2B5Z A;  1VAT A;  2F47 A;  3EBA B;  129L A;  4EPF A;  3HH4 A;  3HT6 A;  139L A;  1L17 A;  1B6I A;  3CB7 A;  3P68 A;  4S0W A;  1L27 A;  1L85 A;  4BAD A;  2F30 A;  242L A;  1CVK A;  2Z18 A;  4HTK A;  1TLA A;  4WG7 A;  2IFF Y;  1L0K A;  4DD0 A;  3FI7 A;  3WMK A;  3CSQ A;  4I0C A;  1LSA A;  141L A;  4TTD A;  1EQE A;  1DYB A;  3DN0 A;  1T8G A;  4G4B A;  4OWC A;  4GLA A;  1QSQ A;  1XJT A;  2B72 A;  4GN4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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