1G1WA

T4 lysozyme mutant c54t/c97a/q105m
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFMMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural and thermodynamic analysis of the binding of solvent at internal sites in T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 61
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-10-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1g1wA00
2B75A 3UONA 1C63A 2B6XA 3HTGA 3DKEX 2A4TA 214LA 1L02A 1QSQA 250LA 1L53A 227LA 4W51A 1CV4A 3HH3A 1L96A 1L55A 1CU5A 206LA 1CTWA 4W52A 1L11A 1SX2A 158LA 1QUDA 3GUNA 3CDVA 181LA 1L01A 1ZWNA 142LA 201LA 1G06A 1L83A 1SSYA 1L05A 114LA 5I14A 3GUMA 115LA 3DN6A 1DYEA 3DMXA 3OE0A 1DYGA 4I7LA 4W56A 2F47A 169LA 1G0KA 235LA 1C6FA 198LA 3HTFA 1QUHA 4GRVA 165LA 128LA 172LA 3QAKA 1CV1A 1D3NA 5LZMA 246LA 185LA 1L09A 122LA 118LA 2LC9A 2B70A 2OU9A 4EPIA 173LA 141LA 1P37A 3DN4A 112LA 3C7YA 195LA 253LA 2HULA 1L26A 187LA 1L99A 2OE9X 167LA 200LA 1KY0A 252LA 1L87A 1C6TA 1QTBA 2RBOA 155LA 162LA 1C6HA 1QT7A 213LA 2B7XA 1LW9A 4W53A 3NYAA 1CU0A 4I7NA 3C83A 1NHBA 1L32A 2NTGA 1L33A 1C61A 1L92A 1G07A 4YX7C 1EPYA 4ARQB 3HWLA 1L75A 147LA 1CV6A 1P3NA 2RB2X 222LA 1L50A 1L66A 138LA 3GUOA 1DYFA 4I7JA 1L16A 221LA 3NY8A 4ZPUA 1LI6A 1L63A 1L93A 4EXMA 148LE 1DYCA 1G0MA 152LA 104LA 3GUJA 3LZMA 1C6NA 1OVJA 1CV5A 215LA 2OE7X 1L23A 2RBRA 1JTMA 1CVKA 1CX7A 1G0QA 1LLHA 2OE4X 2Q9DA 1L08A 3GUPA 4LZMA 3K2RA 159LA 1L88A 261LA 1LYDA 1C6GA 3HU9A 3L2XA 223LA 1L80A 3HT8A 123LA 1LYHA 3FA0A 1L51A 4EKQA 1P6YA 2OU8A 1C6CA 2QARC 1PQJA 175LA 1LGXA 1L77A 245LA 1L25A 2IGCA 3HH4A 3RUNA 1LYEA 7LZMA 1T97A 1LWKA 262LA 1OV5A 1L73A 1L61A 3L64A 1C68A 4ARMA 1L37A 2OEAX 3HT7A 1L0KA 111LA 1L98A 1D3MA 149LA 240LA 161LA 1QTCA 1QUOA 180LA 1QTHA 171LA 1CU6A 1L60A 2CUUA 1C66A 1DYDA 211LA 1SSWA 3HTDA 1L86A 1L76A 4I7PA 2F2QA 1L47A 3DMVA 1PQIA 176LA 1L34A 1C65A 3GUIA 160LA 4K5YA 210LA 3C81A 1PQMA 1LI3A 1L65A 3PDSA 217LA 2RBNA 1QTZA 248LA 1L21A 3G3VA 1C60A 1L40A 212LA 4I7KA 2LZMA 2OTYX 3DMZA 1L31A 151LA 1CU2A 1L48A 126LA 216LA 1L85A 1D9WA 3DN8A 184LA 1OV7A 109LA 1L18A 254LA 218LA 4W55A 4ARPA 2B72A 2RB1X 1KS3A 1L56A 3SB6A 1L06A 1SWZA 1L20A 3HTBA 1L74A 237LA 2O4WA 3FADA 157LA 1L24A 1CU3A 1P5CA 4PJZA 1L03A 1P7SA 1D2WA 249LA 3HDEA 3RZEA 257LA 1L57A 1LYFA 2B6ZA 2NTHA 188LA 3SN6R 1L72A 1D2YA 3DN1A 1D3JA 1ZYTA 183LA 166LA 196LA 1L67A 241LA 4E97A 4EJ4A 2RAYX 3D4SA 2ANXA 1L52A 1C6IA 2HUKA 234LA 1P46A 119LA 102LA 1L81A 4YXAC 1L14A 4ARJA 238LA 4W58A 1L22A 1QT4A 1L54A 1QT6A 110LA 1LGWA 4I7SA 174LA 4W59A 1QT5A 4ARMB 1L43A 1L46A 219LA 2B6YA 4DJHA 1L39A 2B6WA 145LA 1XJUA 3HUAA 1L30A 108LA 1T8GA 1P36A 150LA 4I7OA 2RBQA 6LZMA 2RBSA 259LA 1G0JA 3V2WA 4PK0A 1L36A 233LA 3C8QA 1L71A 256LA 3C80A 226LA 197LA 139LA 3HU8A 1L58A 1SWYA 4AQNA 1L13A 1L19A 3G3WA 4EKRA 3CDQA 1P56A 3DN2A 3DN3A 1LYJA 1L44A 1QTDA 1OVKA 1C6EA 1C6BA 3DN0A 3SBBC 1L94A 1G0GA 3OE6A 1G0PA 4LDLA 2RH1A 3C8SA 1C6LA 4EKSA 127LA 2Z6BA 225LA 1C6AA 258LA 1L41A 1PQKA 1C6KA 182LA 2OU0X 231LA 3VW7A 205LA 4ARLA 1C69A 220LA 178LA 1KNIA 230LA 242LA 1I6SA 3V2YA 3HH6A 244LA 3G3XA 125LA 4EKPA 113LA 1L45A 1PQDA 1KY1A 3HUKA 1C67A 1L15A 170LA 2F32A 3C7ZA 1D3FA 2L78A 2RAZX 1B6IA 144LA 192LA 4EPFA 229LA 1LYGA 4W54A 3JR6A 1L28A 1C6PA 163LA 1CUQA 3PBLA 4DAJA 1P64A 130LA 4YXCA 3SBAA 3CDTA 4DKLA 247LA 189LA 1L97A 1T6HA 1L59A 4I7QA 3GULA 164LA 1OWYA 1DYBA 3SB9A 1CUPA 1C6DA 1L04A 1C6JA 3HDFA 129LA 2B74A 1QS9A 3SB8A 1L82A 3F8VA 1JQUA 3FI5A 3HUQA 107LA 1L00A 1L49A 1LWGA 1G0LA 1PQOA 186LA 1JTNA 2RBPA 3OE9A 1KW5A 1KW7A 1P2LA 3DNAA 4I7MA 199LA 177LA 3HT9A 1L69A 1QS5A 1OWZA 1G1VA 1XJTA 2B73A 1L95A 2LCBA 1SX7A 1C62A 3SB7A 137LA 1L91A 3ODUA 1C6QA 1CV3A 2B6TA 3HH5A 1QTVA 255LA 3OE8A 4GBRB 140LA 3F9LA 3C8RA 3HT6A 190LA 120LA 1L70A 1CV0A 4I7TA 156LA 232LA 1L10A 1L29A 1QT3A 4W57A 1P2RA 243LA 131LA 4S0WA 1QSBA 1DYAA 1LPYA 2QB0B 4OO9A 1T8AA 4LDOA 3EMLA 1LI2A 1ZURA 1L90A 1K28A 3SB5A 1L62A 1L27A 1L84A 1OVHA 1L07A 103LA 1L17A 3CDOA 1T8FA 3NY9A 209LA 1L0JA 168LA 1L79A 251LA 191LA 1L64A 3C82A 2OTZX 1L42A 2ANVA 146LA 1C64A 2O7AA 1C6MA 1QUGA 1TLAA 2O79A 1WTHA 4I7RA 1QT8A 228LA 4ARQA 1CX6A 1LYIA 1L35A 1XEPA 3C7WA 3CDRA 236LA 260LA 2RB0X 1OYUA 239LA 2Q9EA 1L38A 4IAPA 1G1WA 1LGUA 1L89A 1L68A 1L12A 2HUMA 224LA 3GUKA 143LA 4LDEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3UONA 4Z41A 3G3BB 1RCMA 2F2NA 1KIRC 3GXKA 1HMKA 5L3IA 4NSJA 4LT1A 5KXWA 1LSEA 3HH3A 2VB1A 1L96A 1LZ6A 4GN4A 1L11A 1SX2A 1GF0A 3GUNA 1A2YC 1YKZX 3CDVA 1ZWNA 1SSYA 3F6ZA 1LYZA 2CJLA 5I14A 1WQQA 1FLWA 1H87A 3OE0A 1HEPA 1DQJC 3TXKA 169LA 1IX0A 1D0LA 4J0LA 1GEVA 3HTFA 4GRVA 172LA 4GLVA 1YAMA 2YBNA 2EQLA 4NHSA 4BADA 1D3NA 2BPUA 246LA 1L09A 118LA 2B70A 2OU9A 5DN4A 2BLYA 3C7YA 253LA 4DDBA 5LA5A 200LA 3WW5A 5AMYA 155LA 4DT3A 1QT7A 1J1OY 213LA 2B7XA 1NBYC 1EQ5A 1G7MC 4W53A 4WM1A 1CU0A 1NHBA 1IP7A 2XJWA 5I4WA 1UIFA 1JTPL 1IP6A 4CFPA 4WM2A 1C08C 2BQMA 4LFXA 1JJ1A 148LE 1UIBA 1LJFA 3IJUA 152LA 1J1XY 3LZMA 1C6NA 2RBRA 2Z39A 3A6BY 1JPOA 5D5CA 4NHPA 4HV1A 3GUPA 1LYDA 1C6GA 2C8OA 3A3QA 3L2XA 1GFGA 4B4IA 3HT8A 123LA 1L51A 2OU8A 1LJEA 1GDWA 175LA 1EL1A 2A7DA 1LYEA 1LWKA 5KXNA 1L61A 1C68A 2OEAX 1L98A 1D3MA 2HU3A 240LA 4J1BA 161LA 1QTCA 2CUUA 5B59A 1DYDA 4NG8A 1OUAA 1XGQC 1L86A 2F2QA 2GV0A 4CHXA 2MEAA 1BWJA 7LYZA 3LYTA 4U3XB 1PQMA 4X3BA 4WLYA 1DI3A 2RBNA 3W6AA 4HTKA 1LZ5A 1L40A 4I7KA 2YBIA 3W6EA 1BVXA 1CU2A 1B9OA 3LYMA 1GB8A 1OV7A 1B5UA 2Q0MX 1GBZA 3A90A 5F9XA 4DQ5A 1KS3A 4ANRA 1JJ3A 3HTBA 2O4WA 3A3RX 3FADA 1L24A 1LZEA 1P5CA 1GB9A 1GPQC 1P7SA 4ET8A 207LA 1L57A 2B6ZA 1VFBC 188LA 3SN6R 5APEA 1LZAA 1LSPA 1XGPC 3DN1A 1WTMA 1DI5A 183LA 1F0WA 1CJ6A 1GF3A 166LA 3AB6A 2W1XA 241LA 5C6JA 1BB4A 4H9AA 1L52A 2DQHY 4ETDA 234LA 1IY4A 2BQJA 1L81A 1HFYA 2CDSA 1IORA 1L22A 1QT4A 1WQPA 4I7SA 4N8ZA 2MEEA 2BQIA 1L43A 1OUEA 2B6YA 3GXRA 2XBRA 1C7PA 2B6WA 3HUAA 1LJ4A 3HFMY 1P36A 1LYYA 1RJCB 1WQNA 1TCYA 1WQMA 1LMQA 3WU8A 3RW8A 2G4QA 4UWNA 1WQRA 1OUDA 4HTQA 1L58A 1JTOL 1P56A 5FHWA 4TX7A 4YM8A 3DN2A 3DN3A 1L44A 1OUHA 3P65A 1C6BA 1QUTA 1AZFA 1TBYA 1G0GA 3OE6A 1JKBA 1GE1A 3CSQA 3C8SA 193LA 3W6DA 2Z6BA 4OWHA 1C6AA 4A7DA 258LA 1GFTA 4XJIA 4UWVA 1L41A 2I25L 3T36A 5L9JA 2OU0X 4H94A 3CT0A 1I6SA 244LA 125LA 4EKPA 113LA 1UC0A 4M6DA 1L15A 1WTNA 2F32A 2Y8PA 4WG1A 1JSFA 2XQOA 5B05A 1B6IA 4EPFA 229LA 4W54A 1L28A 1LZYA 1C6PA 1CUQA 3A93A 3EXDA 3PBLA 1ZVYB 4YXCA 4ET9A 1REYA 1REZA 1QUSA 1FLYA 3TXHA 4I7QA 1WQOA 4GCFA 164LA 1OWYA 1DYBA 4H8YA 1CUPA 1QS9A 3QNGA 3W6BA 4WLXA 4GCDA 4LYBA 4IASA 1L49A 1LZ4A 1UICA 4QDNA 2RBPA 2DQJY 3ATOA 1OWZA 1F6SA 1REXA 2BQLA 2LCBA 2DQFC 1BB3A 137LA 1LZGA 4IJ4A 4GBRB 4OWAA 4HJYA 3C8RA 1GE2A 4HJZA 190LA 120LA 2DQCY 1IY3A 4I7TA 1W08A 4KT3A 1UA6Y 4W57A 4C5FA 1P2RA 131LA 4J7VA 3RZ4A 2QB0B 1HFZA 1IC7Y 4LDOA 5D5FA 1L62A 1XEJA 5I53A 1L07A 103LA 3NY9A 168LA 1L79A 191LA 2OTZX 1L42A 146LA 1LMNA 1LZDA 1C6MA 228LA 1SQ2L 1DXJA 1CX6A 1B7QA 1JISA 3C7WA 236LA 260LA 3P64A 4IAPA 4WO6A 1P2CC 5APDA 224LA 1IEEA 9LYZA 2HTXA 2AUBA 2A4TA 2YBJA 1IP3A 1QSQA 250LA 1GB6A 4DC4A 4TUNA 3AJNA 1CV4A 1L55A 3RU5A 206LA 5B1GA 1GBXA 201LA 1LHHA 1L05A 1Z55A 3D9AC 1KXYA 3DN6A 1DYEA 4WM3A 3DMXA 4W56A 2F47A 4B4JA 3AW7A 5LIOA 4C3WA 198LA 2LHMA 1QUHA 1LZ1A 1BQLY 4HTNA 3HBEX 1CV1A 2NWDX 4LYMA 4ETCA 4NIJA 1DZBX 5LVGA 1ZVHL 5DLAA 2ZWBA 4H92A 1HF4A 1V7SA 1L26A 1NKHA 4DD7A 1IWUA 3W3EA 5LYTA 5KXSA 1KY0A 252LA 3AGIA 1L87A 1C6TA 4EMNA 1QTBA 1IOTA 4LGKA 4NHIA 162LA 1C6HA 2MECA 1HERA 2WARA 1PZYA 1B7OA 2NTGA 1UIGA 4H91A 1J1PY 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3UON A;  4Z41 A;  3G3B B;  1RCM A;  2F2N A;  1KIR C;  3GXK A;  1HMK A;  5L3I A;  4NSJ A;  4LT1 A;  5KXW A;  1LSE A;  3HH3 A;  2VB1 A;  1L96 A;  1LZ6 A;  4GN4 A;  1L11 A;  1SX2 A;  1GF0 A;  3GUN A;  1A2Y C;  1YKZ X;  3CDV A;  1ZWN A;  1SSY A;  3F6Z A;  1LYZ A;  2CJL A;  5I14 A;  1WQQ A;  1FLW A;  1H87 A;  3OE0 A;  1HEP A;  1DQJ C;  3TXK A;  169L A;  1IX0 A;  1D0L A;  4J0L A;  1GEV A;  3HTF A;  4GRV A;  172L A;  4GLV A;  1YAM A;  2YBN A;  2EQL A;  4NHS A;  4BAD A;  1D3N A;  2BPU A;  246L A;  1L09 A;  118L A;  2B70 A;  2OU9 A;  5DN4 A;  2BLY A;  3C7Y A;  253L A;  4DDB A;  5LA5 A;  200L A;  3WW5 A;  5AMY A;  155L A;  4DT3 A;  1QT7 A;  1J1O Y;  213L A;  2B7X A;  1NBY C;  1EQ5 A;  1G7M C;  4W53 A;  4WM1 A;  1CU0 A;  1NHB A;  1IP7 A;  2XJW A;  5I4W A;  1UIF A;  1JTP L;  1IP6 A;  4CFP A;  4WM2 A;  1C08 C;  2BQM A;  4LFX A;  1JJ1 A;  148L E;  1UIB A;  1LJF A;  3IJU A;  152L A;  1J1X Y;  3LZM A;  1C6N A;  2RBR A;  2Z39 A;  3A6B Y;  1JPO A;  5D5C A;  4NHP A;  4HV1 A;  3GUP A;  1LYD A;  1C6G A;  2C8O A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 3UON A;  4Z41 A;  3G3B B;  1RCM A;  2F2N A;  1KIR C;  3GXK A;  1HMK A;  5L3I A;  4NSJ A;  4LT1 A;  5KXW A;  1LSE A;  3HH3 A;  2VB1 A;  1L96 A;  1LZ6 A;  4GN4 A;  1L11 A;  1SX2 A;  1GF0 A;  3GUN A;  1A2Y C;  1YKZ X;  3CDV A;  1ZWN A;  1SSY A;  3F6Z A;  1LYZ A;  2CJL A;  5I14 A;  1WQQ A;  1FLW A;  1H87 A;  3OE0 A;  1HEP A;  1DQJ C;  3TXK A;  169L A;  1IX0 A;  1D0L A;  4J0L A;  1GEV A;  3HTF A;  4GRV A;  172L A;  4GLV A;  1YAM A;  2YBN A;  2EQL A;  4NHS A;  4BAD A;  1D3N A;  2BPU A;  246L A;  1L09 A;  118L A;  2B70 A;  2OU9 A;  5DN4 A;  2BLY A;  3C7Y A;  253L A;  4DDB A;  5LA5 A;  200L A;  3WW5 A;  5AMY A;  155L A;  4DT3 A;  1QT7 A;  1J1O Y;  213L A;  2B7X A;  1NBY C;  1EQ5 A;  1G7M C;  4W53 A;  4WM1 A;  1CU0 A;  1NHB A;  1IP7 A;  2XJW A;  5I4W A;  1UIF A;  1JTP L;  1IP6 A;  4CFP A;  4WM2 A;  1C08 C;  2BQM A;  4LFX A;  1JJ1 A;  148L E;  1UIB A;  1LJF A;  3IJU A;  152L A;  1J1X Y;  3LZM A;  1C6N A;  2RBR A;  2Z39 A;  3A6B Y;  1JPO A;  5D5C A;  4NHP A;  4HV1 A;  3GUP A;  1LYD A;  1C6G A;  2C8O A; 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