1GEVA

Buried polar mutant human lysozyme
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCETARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Contribution of polar groups in the interior of a protein to the conformational stability.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords LYSOZYME
total genus 51
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1gevA00
1LZ6A 1YL1X 1GDXA 1LSZA 1HEMA 3AZ5A 1IP4A 4I0CA 1JJ1A 1IP7A 1CJ7A 3ATOA 2HU3A 207LA 5I4YA 4WG7A 4WM1A 5B05A 3EXDA 5J7CA 4DT3A 2MEHA 1HHLA 3B0IA 2D4IA 4P2EA 5IHGA 3CT1A 1GB0A 1LSMA 2DBTA 2F4GA 3LHMA 1GWDA 4YEMA 1GB5A 3GXRA 2NWDX 5DN5A 1NBYC 2D4KA 4YM8A 5C6JA 5ILCA 1C45A 1GF4A 2IHLA 5KXKA 1GF0A 4LT1A 4LFXA 4LFPA 1NDGC 4NGZA 1LSPA 4D9ZA 5M1YA 1DPWA 1GB8A 1UUZC 2Z2FA 1LHJA 2LZ2A 1GF9A 1LMOA 4H1PA 4HJVA 1NKHA 1FDLY 4XADA 1GFVA 1JKDA 1GAZA 1LJ4A 1Z55A 2I6ZA 2YBJA 2CWIA 1PZYA 1LMTA 1B7PA 1LZGA 3ATNA 4MSTA 1F6SA 4KT3A 1YILA 4DD3A 2HTXA 4B49A 1IWXA 5FSTA 2PC2A 1GB3A 2BQKA 3W6FA 2BQHA 1FLUA 1VATA 1XGTC 4PJ2C 5APFA 1N4FA 3AGHA 1JITA 2YBLA 3IJVA 1GE4A 1LZYA 1REXA 3TMUA 5K7OA 2HEAA 1D0KA 4II8A 4WLTA 1CNSA 2BQLA 5LVIA 1LZ1A 1UC0A 1IWZA 1XGQC 3AYQA 4WL7A 4NG1A 3G3BB 4HPEA 1LTMA 2W1LA 1YIKA 1GF6A 4WO6A 1GF8A 3RW8A 3TXFA 1NF5A 5L3HA 2RSCA 3WPKA 4H8YA 3B0OA 4WLYA 1CJ9A 4CGEA 1LAAA 3M18B 2BQEA 1D0MA 1C7PA 4DD2A 1P2CC 2Z2EA 3WUMA 1FN5A 1GFJA 4M4OA 5LA5A 4OOOA 5B1FA 1GFAA 2MEIA 3LYTA 1UACY 5I4XA 1B5UA 1LHMA 5KXNA 1GFEA 2DQFC 1AKIA 1LJKA 3AZ7A 1GB6A 1F0WA 2C8OA 3ZVQA 4LYZA 2BPUA 3LYOA 2BQIA 2W1YA 1A2YC 3HBEX 6LYZA 4NGOA 4N9RA 1GE2A 1HMKA 1KIRC 4Z46A 4HPIA 4E3UA 2DQDY 3F6ZA 3RU5A 3A34A 1HEWA 3OK0A 1IP6A 1B5YA 2D91A 4Z41A 5B06A 5DL9A 1HERA 3WULA 2ZNXY 1B7SA 135LA 1O23A 1JKBA 1YROA 1C08C 3M3UA 4X3BA 3WU9A 1GE3A 2EPEA 3TXIA 1LMQA 1JWRA 1EQEA 1W6ZA 2Z18A 2G4QA 3CT0A 1REZA 4WG1A 3WU8A 4B1AA 4ET8A 5A3ZA 3LYMA 1GFRA 1B5ZA 3WW5A 1C43A 1KIPC 1IEEA 1IC7Y 2Z39A 3HFMY 1LSNA 1HFYA 1LPIA 4U3XB 4XYYA 1OQMA 3WMKA 5KXLA 4H91A 4N1EI 2Z37A 3D3DA 3TXKA 4NGVA 3WUAA 1JSFA 1BB5A 4DYGA 1D0LA 1DI5A 5FEKA 4CFPA 1VDSA 3CSQA 4WL6A 1B7QA 4XJFA 1B7NA 4EOFA 3W6BA 4HTKA 1OUFA 5KXMA 4NGYA 1HENA 1WQMA 3LZ2A 1DI3A 1RE2A 2F4AA 3WW6A 5LVJA 3J6KA 133LA 4GCBA 1D9UA 3AW7A 4H90A 1IR7A 4N1CC 4NIJA 3A6BY 1IR9A 5KKIA 1B5XA 2MEBA 3A91A 3B0KA 1YAPA 2DQJY 5FHWA 4GLVA 5ILFA 1QDTA 4IASA 1HEPA 3A90A 1XGPC 4LYTA 5APEA 4PGJB 5I53A 4BADA 5KXXA 3A67Y 3CSZA 1HC0A 1BB6A 1H6MA 2H9JA 1IOCA 4NWEA 4H93A 1B5VA 3T6UA 4ETAA 1CKFA 3FI7A 3ULRA 5JENB 4NHQA 5F81A 2BQMA 2BQAA 4KXIA 1QIOA 1CKGA 4CFOA 1XEIA 1LKSA 1NDMC 4MCKA 4H9FA 5F16A 4H9HA 4XJDA 154LA 2Z38A 3CT5A 4I8SA 4XN6A 4C3WA 1V7SA 2FBBA 1JTPL 1FLWA 1YAMA 1HMLA 1WTMA 1UIHA 4RLNA 5KJ9A 194LA 1BB3A 1ZVHL 4WM4A 4ET9A 2YBMA 1IC4Y 5AMYA 5B07A 3TXJA 5DN4A 4LZTA 5DM9A 4AGAA 2Y8PA 4LYOA 1OUBA 2HEBA 5LA8A 2ZWBA 1JHLA 3LYZA 1DXJA 1UIEA 2HU1A 4DDCA 4YF2A 1LJGA 2LZTA 1GEZA 4HJZA 1B9OA 1LKRA 1WQRA 4OWEA 4IJ4A 1DZBX 1IORA 4H92A 4J0LA 1HELA 3W6AA 1TEWA 4H9BA 5C6LA 1B2KA 1H87A 1CJ6A 1IWYA 2A7DA 3TMVA 1JSEA 1IVMA 4IATA 1LZAA 5EBHA 1JJ0A 1DKKA 1BWHA 5L9JA 3A93A 2MECA 1GFKA 4NSGA 1GFTA 1JIYA 1OP9B 1B7LA 4J1AA 4NHSA 1D6PA 1JUGA 3GXKA 4ETCA 2G4PA 9LYZA 4NHIA 1J1OY 1LJFA 2DKVA 4QGZA 5HLLA 4N0JA 1V7TA 4GLAA 3T36A 1GFGA 4CHXA 2FYCA 3P4ZA 1GBWA 1GE1A 4XJGA 4RLMA 4TSBA 1ZV5L 1RI8B 2YDGA 4WM3A 1CKHA 4WM5A 5C6IA 2IFFY 3SP3A 4DDAA 1LSBA 2ZQ3A 3B72A 4DDBA 1NMMA 2HEFA 1LHLA 4BS7A 5D5CA 1CKDA 1WQOA 2LYZA 1UCOA 5F9UA 3WXUA 1F6RA 1QTKA 5LIOA 4DD7A 2GV0A 1QDRA 5FCPA 2HUBA 2ZQ4A 4N5RA 4NGKA 1IP3A 1LZBA 5KXYA 4WLDA 4PHIA 3W6CA 1QTEA 2LYOA 1YKXX 1I56A 1LMNA 1OUEA 3OJPA 1WTNA 4NHTA 3W6EA 1YL0X 3IJUA 4OWBA 3B6LA 5HQ1A 1C10A 1GF5A 1GXV2 3FE0A 1AM7A 1RFPA 3RNXA 4EMNA 1GFUA 4HJYA 1LZCA 5F9XA 1BWIA 5D5FA 1KIQC 3N9CA 4DD9A 2MEFA 2DQIY 1BVKC 2ZIKA 1GD6A 1HF4A 1QSWA 1QQYA 2YBHA 1JPOA 1LJJA 2G4NA 5HNCA 1GBXA 3AGIA 2CDSA 1LZSA 1CJ8A 4KL7A 1QUTA 4XJBA 4A7DA 2BQDA 3K3TA 4XENA 5LYZA 3A96A 5DLAA 4GCEA 5APDA 4XJIA 2A7FA 1MELL 1REMA 6LYTA 1BQLY 1DI4A 1LSDA 3BKHA 1IOTA 3AZ6A 1YANA 4UWUA 1BB4A 4B4IA 3AZ4A 3EMSA 4RDSA 2DQAA 3TXEA 2EIZC 1LZ9A 3WXTA 1LZTA 5KXOA 1GBZA 1JEFA 3G3AB 3HBDA 4C5FA 3N9AA 2W1MA 2LHMA 1ZMYL 4G9SA 1IY3A 4YOPA 8LYZA 5KKJA 4TSCA 132LA 1OUCA 4M6DA 4W94A 1LJIA 4DD1A 4WM2A 4NY5A 134LA 3TXHA 3WUNA 2LYMA 3EO5A 2H5ZA 4WOAA 2XJWA 1E8LA 4G4BA 1EQ5A 4NFVA 4B4JA 1LZ5A 1LJNA 4NSIA 4H9AA 1IP2A 1LJ3A 1LMPA 4ZEEA 5B59A 4OOTA 5I5QA 1MLCE 1HNLA 4PRQA 4YENA 1IX0A 1OUIA 2F30A 1UBZA 3QE8A 4ZFPA 5I54A 2BLXA 3P66A 1XFPL 1B7OA 2HEDA 1LJHA 3ZVQB 1LHKA 1XGUC 4J7VA 4BAFA 5F14A 2BQNA 1GHLA 2Z19A 4FDYA 4HTQA 1OUHA 4XJHA 1VFBC 2F2NA 1G7JC 4G4CA 3WPLA 3AB6A 4DD0A 3ZEKA 2XTHA 1LHIA 1UIGA 1GEVA 1IWTA 3A8ZA 2D4JA 5LAFA 1JKAA 1LSFA 1GXXA 1UICA 1ZVYB 4CJ2A 3WL2A 1CKCA 1JTTL 5KXWA 2YVBA 4GCDA 1IP1A 2YSSC 4NEBA 2CJLA 1QSAA 4H8XA 4H9IA 4UWVA 3HBHA 4G4HA 1BWJA 2MEGA 1XEJA 4ANRA 1FBIX 2ZILA 4H8ZA 5E9RA 1OUAA 4L41A 5FELA 1IWUA 1IP5A 1FKVA 1QUSA 2BAAA 4HV1A 1GB2A 2MEDA 3TXDA 1GBSA 1IR8A 3W3EA 4ETBA 2B5ZA 3VWOA 3W6DA 1IC5Y 3IWRA 2ZYCA 2EKSC 5HNLA 4OWHA 4LYMA 1NBZC 4LT2A 2ZYPA 1EL1A 1GE0A 1C46A 1LSYA 5IELA 3CSRA 5LVHA 4HSFA 1KXXA 2DQGY 1LYZA 1OUGA 2FYDA 4GCFA 3WPJA 4B0DA 4ZIXA 3RZ4A 1SLYA 1INUA 5LYMA 4GN3A 4ML7A 1UIDA 1UIAA 4MR1A 2XBRA 5L3IA 4ETDA 2HECA 1I20A 1JJ3A 1GDWA 3EBAB 1GB9A 3AJNA 1IWVA 4TTDA 1VDQA 1LSCA 4H9EA 1AT6A 4NHPA 1HSWA 3WVYA 193LA 4G49A 2DQHY 2I25L 2VB1A 4HV2A 153LA 1LZEA 4ETEA 3QNGA 4TUNA 2C8PA 4WMGA 1PS5A 1LMCA 1HEOA 4QEQA 1GAYA 1VDPA 1JISA 4R6CA 2DQEY 1B0DA 3KAMA 5IDDA 1NHEA 2MEEA 1JTOL 3P64A 3BKVA 4H9CA 5HMVA 2YBIA 1WVVA 4OW1A 4NSJA 2X0AA 3TMXA 1UIFA 1YKZX 2BQCA 5II3A 2Q0MX 2CGIA 3CB7A 4W96A 4DC4A 5E4PA 4TWSA 5KY1A 3WYHA 5LAGA 4N8ZA 1LZ4A 1YAQA 1OUDA 1UIBA 4Z3MA 2N5ZA 1TCYA 4WO9A 3AW6A 1G7HC 3AGGG 5KXPA 1DPXA 1HSXA 4PPOA 3D9AC 4OWCA 4NGIA 2XBSA 3TMWA 1GF3A 1OUJA 4KPMA 1G7IC 3A6CY 4NWHA 1LCNA 1JKCA 5KXTA 1IOSA 2AUBA 5HMJA 1YKYX 1IO5A 2EQLA 4WM6A 1T3PA 1A4VA 3WU7A 1LZNA 1BHZA 5KXZA 5LVGA 1XEKA 4QDNA 1LSEA 1KXYA 5LINA 1GB7A 1LZ8A 3A92A 3A95A 1J1XY 3TXGA 1LZRA 1GF7A 5KXRA 3LZTA 1LHHA 1NQIA 1B7MA 3QY4A 4HP0A 4RW1A 4B4EA 1REYA 1LSGA 5LVKA 1HFXA 4GCCA 2I26L 4WLXA 1GBOA 4BAPA 1WQPA 1AT5A 4GN5C 1LYSA 1TBYA 1FKQA 4YEOA 1SQ2L 4FJRA 3CQLA 1IY4A 1G7LC 1LMAA 2D6BA 1LJEA 4LT0A 1D6QA 4UWNA 208LA 1YAOA 2ZIJA 3P65A 3RT5X 2H9KA 3N9EA 1RCMA 1IIZA 1W08A 2ZNWY 4RW2A 5FDJA 1GPQC 1WQNA 4LT3A 4LYBA 5B1GA 5LYTA 2BQFA 5LXWA 1IOQA 1AZFA 1GBYA 1BGIA 1J1PY 4J1BA 1LYOA 1GFHA 5T3FA 1UA6Y 1LOZA 4QY9A 2BQGA 1IWWA 1VDTA 4NGJA 1NWGA 5I4WA 1ALCA 5APCA 4H94A 1BVXA 1XSFA 1LYYA 4O34A 1YQVY 2Z12A 3LN2A 1VEDA 3J4GA 4DWXA 3A3RX 2YBNA 3MGWA 1LSAA 1I1ZA 4NGWA 7LYZA 2BQBA 5KXSA 2MEAA 4OWAA 2W1XA 1EQ4A 1HEQA 4LYCA 1HFZA 1BB7A 1B5WA 1DKJA 1LZDA 1WQQA 4LGKA 4Z98A 3WH1A 1KXWA 5A3EA 2BQJA 1DQJC 1XGRC 3A3QA 1B7RA 3A94A 3P68A 4AXTA 2FBDA 3E3DA 1RJCB 2DQCY 4R0FA 1TAYA 1FLQA 4NG8A 2BLYA 4NSHA 1WVUA 2HEEA 4GN4A 4PRUA 4HTNA 1T6VL 2WARA 1VAUA 1TDYA 3WVXA 4TX7A 1FLYA 1G7MC 4NGLA 1F10A 3TXBA 2BQOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ANVA 3AZ5A 2HU3A 2O79A 2Q9EA 5B05A 2MEHA 1JTMA 1GB0A 1GWDA 1K28A 254LA 5C6JA 2D4KA 4YM8A 4W55A 4LFXA 1LSPA 5M1YA 1GB8A 2LZ2A 3C7YA 1NKHA 1FDLY 1LYFA 2YBJA 1GAZA 1G0QA 1LJ4A 4I7OA 4K5YA 4MSTA 3HH6A 4DD3A 4YX7C 3DMZA 2BQKA 3C82A 1P64A 1N4FA 3IJVA 1LZYA 1D3MA 2OE4X 2BQLA 4WL7A 1CU5A 4NG1A 4HPEA 1YIKA 1GF6A 216LA 3TXFA 2RSCA 3B0OA 1FN5A 1GFJA 4M4OA 4OOOA 5B1FA 1QS9A 3HH3A 3LYTA 1L14A 1UACY 1LHMA 2DQFC 3AZ7A 1PQMA 4LYZA 3LYOA 2ANXA 2Z6BA 4HPIA 4E3UA 3A34A 1HERA 1YROA 4X3BA 3WU9A 4LDLA 3TXIA 1LMQA 1EQEA 3CT0A 2G4QA 4B1AA 127LA 1D3FA 3HTGA 3LYMA 222LA 1IEEA 1IC7Y 3WMKA 4H91A 3D3DA 3WUAA 1C68A 4WL6A 4HTKA 3D4SA 4EKPA 5KXMA 4ARQA 1L96A 1RE2A 3GUJA 4I7PA 3J6KA 2IGCA 4H90A 4GRVA 250LA 2HUMA 137LA 1IR9A 3DNAA 2RBQA 1B5XA 3A91A 4EKRA 5ILFA 4ZPUA 4IASA 1HEPA 4LYTA 4W52A 4NWEA 1CKFA 244LA 1QIOA 200LA 1XEIA 4MCKA 2Z38A 1JTPL 1FLWA 1D3NA 4ET9A 2YBMA 5AMYA 1CV1A 2RH1A 2Y8PA 4LYOA 1OUBA 1KY0A 3LYZA 1DXJA 4DDCA 2OU0X 1GEZA 4OWEA 1L22A 130LA 143LA 103LA 1JSEA 1IVMA 1L80A 1LI3A 1BWHA 1WTHA 1GFTA 104LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1LZ6 A;  1YL1 X;  1GDX A;  1LSZ A;  1HEM A;  3AZ5 A;  1IP4 A;  4I0C A;  1JJ1 A;  1IP7 A;  1CJ7 A;  3ATO A;  2HU3 A;  207L A;  5I4Y A;  4WG7 A;  4WM1 A;  5B05 A;  3EXD A;  5J7C A;  4DT3 A;  2MEH A;  1HHL A;  3B0I A;  2D4I A;  4P2E A;  5IHG A;  3CT1 A;  1GB0 A;  1LSM A;  2DBT A;  2F4G A;  3LHM A;  1GWD A;  4YEM A;  1GB5 A;  3GXR A;  2NWD X;  5DN5 A;  1NBY C;  2D4K A;  4YM8 A;  5C6J A;  5ILC A;  1C45 A;  1GF4 A;  2IHL A;  5KXK A;  1GF0 A;  4LT1 A;  4LFX A;  4LFP A;  1NDG C;  4NGZ A;  1LSP A;  4D9Z A;  5M1Y A;  1DPW A;  1GB8 A;  1UUZ C;  2Z2F A;  1LHJ A;  2LZ2 A;  1GF9 A;  1LMO A;  4H1P A;  4HJV A;  1NKH A;  1FDL Y;  4XAD A;  1GFV A;  1JKD A;  1GAZ A;  1LJ4 A;  1Z55 A;  2I6Z A;  2YBJ A;  2CWI A;  1PZY A;  1LMT A;  1B7P A;  1LZG A;  3ATN A;  4MST A;  1F6S A;  4KT3 A;  1YIL A;  4DD3 A;  2HTX A;  4B49 A;  1IWX A;  5FST A;  2PC2 A;  1GB3 A;  2BQK A;  3W6F A;  2BQH A;  1FLU A;  1VAT A;  1XGT C;  4PJ2 C;  5APF A;  1N4F A;  3AGH A;  1JIT A;  2YBL A;  3IJV A;  1GE4 A;  1LZY A;  1REX A;  3TMU A;  5K7O A; 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 3LZT A;  1LHH A;  1NQI A;  1B7M A;  3QY4 A;  4HP0 A;  4RW1 A;  4B4E A;  1REY A;  1LSG A;  5LVK A;  1HFX A;  4GCC A;  2I26 L;  4WLX A;  1GBO A;  4BAP A;  1WQP A;  1AT5 A;  4GN5 C;  1LYS A;  1TBY A;  1FKQ A;  4YEO A;  1SQ2 L;  4FJR A;  3CQL A;  1IY4 A;  1G7L C;  1LMA A;  2D6B A;  1LJE A;  4LT0 A;  1D6Q A;  4UWN A;  208L A;  1YAO A;  2ZIJ A;  3P65 A;  3RT5 X;  2H9K A;  3N9E A;  1RCM A;  1IIZ A;  1W08 A;  2ZNW Y;  4RW2 A;  5FDJ A;  1GPQ C;  1WQN A;  4LT3 A;  4LYB A;  5B1G A;  5LYT A;  2BQF A;  5LXW A;  1IOQ A;  1AZF A;  1GBY A;  1BGI A;  1J1P Y;  4J1B A;  1LYO A;  1GFH A;  5T3F A;  1UA6 Y;  1LOZ A;  4QY9 A;  2BQG A;  1IWW A;  1VDT A;  4NGJ A;  1NWG A;  5I4W A;  1ALC A;  5APC A;  4H94 A;  1BVX A;  1XSF A;  1LYY A;  4O34 A;  1YQV Y;  2Z12 A;  3LN2 A;  1VED A;  3J4G A;  4DWX A;  3A3R X;  2YBN A;  3MGW A;  1LSA A;  1I1Z A;  4NGW A;  7LYZ A;  2BQB A;  5KXS A;  2MEA A;  4OWA A;  2W1X A;  1EQ4 A;  1HEQ A;  4LYC A;  1HFZ A;  1BB7 A;  1B5W A;  1DKJ A;  1LZD A;  1WQQ A;  4LGK A;  4Z98 A;  3WH1 A;  1KXW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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