1GEVA

Buried polar mutant human lysozyme
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCETARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Contribution of polar groups in the interior of a protein to the conformational stability.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords LYSOZYME
total genus 51
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1gevA00
1AT6A 2LZ2A 4HTNA 5B06A 1DI4A 4DDBA 4HV2A 1QTKA 3AYQA 1YAQA 4HJZA 1BHZA 1BB5A 4X3BA 3B6LA 3WU9A 4OWCA 1WQRA 1UIGA 1LYSA 4UWUA 2MEGA 2XBSA 4H91A 4RDSA 3W3EA 4TUNA 3W6CA 2DQIY 1LJJA 4GCCA 5KKIA 1B5UA 2C8PA 1B9OA 4NG8A 1UCOA 3AB6A 4H90A 1HEWA 1RI8B 1B5WA 3T6UA 3K3TA 1C43A 3EBAB 1LZYA 4LYZA 4TX7A 2NWDX 4XJBA 3CB7A 3AZ6A 2F2NA 4CFPA 1GFJA 1LJKA 1YANA 5JENB 3A6BY 5L9JA 5B1GA 2DQAA 1SQ2L 1YIKA 4J0LA 1LYYA 2CWIA 2W1MA 3M3UA 4H8YA 4N9RA 1LJHA 4DD1A 1B7LA 1TCYA 3AZ4A 1J1OY 4PRUA 5HLLA 3ZVQB 1B7MA 2RSCA 5E4PA 1F0WA 3A92A 5ILCA 4WM3A 3TXGA 1B7QA 1JIYA 1XEIA 2HEDA 4NGWA 4ET8A 5I4YA 1HC0A 4N8ZA 4HV1A 4IJ4A 207LA 3TXEA 5FDJA 1IEEA 4P2EA 4QDNA 4LYBA 5LA8A 4TTDA 2ZWBA 5KXYA 1LSDA 4I8SA 5LVJA 4H94A 1GBOA 5KXZA 4H8XA 5EBHA 1CJ9A 1ZVHL 1B7SA 208LA 3LYMA 5APEA 4KL7A 1GB3A 1GB9A 4MCKA 1VDTA 4GLAA 1JTOL 1JITA 3B0IA 1LTMA 4YEMA 1LSMA 5I4WA 3F6ZA 2LYZA 2F4GA 1XEKA 4GCBA 4NHIA 1LMAA 5B1FA 1AZFA 4XJIA 2BQIA 1RE2A 5AMYA 1QUSA 1VDPA 3LHMA 1HMLA 2VB1A 4OOOA 1DQJC 3WU7A 1GF4A 5L3IA 1QIOA 4LYCA 5FCPA 4LT1A 1T3PA 4WM5A 2AUBA 1LSCA 2MECA 1RJCB 2Z37A 3A3RX 4RW1A 1BB6A 4PJ2C 1GXV2 2H9JA 1B7OA 3J6KA 4ETBA 5C6LA 5FEKA 4LYMA 2XBRA 1GAZA 1KXYA 5LAFA 4B0DA 2YBIA 1LMPA 1I1ZA 4WG1A 5K7OA 2HEFA 4N0JA 1GEZA 4GN4A 1GE2A 2BQBA 4WM2A 4M6DA 2ZNWY 3W6FA 4LT0A 3IJVA 4EOFA 1JJ0A 1REZA 1LSEA 4GN3A 5KXLA 5HNCA 1IO5A 2CDSA 5C6JA 4WLTA 4WO6A 3CSZA 3CSQA 1LZ9A 3AW6A 7LYZA 1BWIA 5KXSA 4LGKA 1IOQA 3W6AA 2HECA 1BWHA 5II3A 5DM9A 1JHLA 1NHEA 4BADA 1GE1A 5M1YA 1LJGA 3OK0A 1LYOA 1IY3A 1MELL 4ETDA 2Z39A 5IHGA 1LSBA 1D0KA 1YAPA 9LYZA 5I53A 1JKCA 2I26L 3W6EA 4RLNA 3QY4A 3BKVA 4NWHA 132LA 3P4ZA 1GXXA 5LVGA 1B7NA 3P68A 3ZVQA 2BQEA 5F81A 1EQ4A 1SLYA 3AGGG 3ATOA 1BB4A 5LVHA 1QUTA 1WTMA 1FKQA 1B7PA 1LZCA 4DT3A 4LFPA 1IWUA 4DD3A 5KKJA 1HFZA 1XFPL 1F10A 2ZQ4A 3N9CA 4H9HA 2F30A 1IP7A 1EQ5A 1GD6A 1OUEA 5ILFA 1B5YA 4GCDA 1IP5A 1BB3A 1CJ7A 4C3WA 1LZSA 1C7PA 3QNGA 1LZBA 1C45A 2LHMA 4GN5C 1GFUA 5LYTA 2YBMA 2HTXA 1GBZA 5APCA 3N9EA 1C10A 1F6RA 3LN2A 1BGIA 2FBBA 4NHTA 4R0FA 1FN5A 4WM4A 1CKDA 4HSFA 1IC5Y 4NFVA 3WUAA 5KXPA 3A90A 1LZRA 1YL1X 4G4HA 1UIFA 1NBYC 1TDYA 1IWZA 4KXIA 1LZ4A 1I20A 4MR1A 5LXWA 1XGRC 1LSGA 3WU8A 1JSFA 3TMXA 4BS7A 1JTTL 1NBZC 4ZIXA 4WM6A 1CNSA 1W6ZA 4H9FA 1LMTA 5FHWA 1T6VL 2ZIJA 4HTKA 3WULA 1C46A 1C08C 1GBWA 2Z18A 2EIZC 3CSRA 1HHLA 4HPIA 1LOZA 1LZ5A 4G4BA 4DD9A 1GE0A 4XADA 1GF5A 2G4QA 5FSTA 4WLYA 1BVKC 3LYOA 4QEQA 5APFA 4XENA 1IR7A 1BVXA 1VAUA 4WMGA 1KIQC 4WLXA 1UBZA 4PGJB 1EL1A 1DI3A 1UIHA 4HPEA 1XEJA 2XJWA 1XGTC 4L41A 5T3FA 4WG7A 1LJ3A 1LKRA 3WH1A 4A7DA 1VATA 1GFHA 1HEMA 1VDSA 2DQFC 1QDTA 4H9AA 3EXDA 4PRQA 3WPJA 3SP3A 4B49A 4Z46A 4YEOA 2W1LA 1LZEA 1KXWA 1N4FA 1GEVA 4XYYA 2BQJA 5APDA 3RZ4A 1LSYA 1GFVA 1G7HC 1OUGA 1IOCA 1H87A 4H9BA 2MEBA 2IFFY 1JEFA 1GE3A 4QGZA 4ETEA 2BQDA 3TXKA 4TSBA 1LZNA 4J1BA 1LPIA 1YL0X 3WYHA 1LSNA 1OUHA 3LZTA 4D9ZA 4AXTA 1RFPA 4O34A 5KJ9A 1GF0A 2H5ZA 3J4GA 1JKAA 1LMOA 2BQFA 1OUAA 1YQVY 1B2KA 2BQGA 3HBDA 1JTPL 1WVVA 4I0CA 1LMCA 1AM7A 3MGWA 1UC0A 2G4NA 1IR8A 4ET9A 1TBYA 1IP3A 2DBTA 4R6CA 3WXUA 4M4OA 5DLAA 1LZTA 1PZYA 3P66A 4H9CA 1BQLY 4TSCA 1IOTA 3BKHA 3B0KA 5KXNA 1E8LA 4NY5A 1YAMA 4WOAA 1V7SA 4YENA 3LYTA 1LSFA 1G7JC 2YBLA 1GB6A 1HNLA 4W94A 1LJ4A 1HEOA 1ZMYL 1XGPC 5HNLA 4XJFA 1IC7Y 1UACY 2D4IA 2DKVA 2W1XA 3EO5A 4ZFPA 1CKCA 1IWWA 5IELA 3A91A 3WMKA 4KPMA 1LZDA 1LZ1A 1ZVYB 2HEEA 3TXHA 2BPUA 2I6ZA 3TXIA 4MSTA 1GF8A 4NHSA 1JSEA 1ALCA 1GDXA 1JWRA 3E3DA 4NHQA 5F9UA 3CQLA 4DWXA 3CT0A 1LHHA 2GV0A 3TXDA 4B4EA 4Z3MA 3RNXA 4LZTA 4NIJA 1GWDA 5FELA 3ZEKA 1MLCE 1IOSA 2ZYPA 3G3AB 1GB0A 3GXKA 1HF4A 1LSAA 4NGLA 4H1PA 3T36A 1CKFA 1NWGA 1HENA 4DD2A 5KXKA 2ZQ3A 4N1CC 1DPWA 4BAFA 4H9EA 4IASA 5DN4A 1KIPC 1OQMA 4HP0A 2EPEA 3RU5A 4XJHA 3AZ7A 2WARA 5I4XA 1IP1A 1CJ6A 5KY1A 5KXMA 1GF9A 1LJNA 4WL7A 1LSPA 4NSIA 1JUGA 3WUMA 4CGEA 4NG1A 4RLMA 2ZILA 3CT1A 4OW1A 194LA 1DKKA 1QSAA 3WVXA 2F4AA 1LHLA 2N5ZA 4UWVA 3RT5X 4KT3A 1JKDA 1FLUA 1G7LC 1XGQC 2YVBA 5I54A 1TEWA 2BQMA 3IJUA 2DQEY 4YOPA 1GHLA 1GPQC 1QTEA 4NGVA 1GBYA 2MEHA 3P65A 2HEAA 4HTQA 1DPXA 2BQNA 4DD0A 4ETAA 3QE8A 3A96A 1IP6A 2HU3A 1NDMC 1PS5A 1GFKA 2LYOA 4EMNA 5E9RA 3HFMY 8LYZA 1IWXA 4GLVA 2DQJY 2H9KA 2MEEA 4HJYA 3WVYA 4ZEEA 134LA 1FKVA 1J1XY 1WTNA 1GAYA 2DQCY 4ANRA 5LYZA 1IWTA 1NF5A 1GBXA 4G49A 4G4CA 1IX0A 4FDYA 1WQQA 1GFAA 5LINA 1LHMA 4LYTA 4XN6A 3P64A 5DL9A 3TMWA 5LVIA 1V7TA 3WXTA 4ETCA 3A67Y 2DQHY 1VDQA 2ZYCA 1IP2A 1BWJA 2FBDA 1GDWA 1YKXX 5B05A 3A34A 1CJ8A 2LZTA 2DQDY 3HBHA 3G3BB 2Y8PA 1GB5A 1OUFA 4B1AA 5D5FA 5LVKA 1JPOA 3IWRA 1IIZA 1A2YC 2BLYA 2D4JA 1W08A 4PPOA 3W6DA 1UUZC 1D0LA 1DZBX 1G7IC 1GFGA 1DKJA 2YBJA 1F6SA 1LZGA 5KXOA 2PC2A 3TXBA 2IHLA 4H9IA 1JKBA 1GB2A 1UICA 1HMKA 2BLXA 2MEDA 1D9UA 5A3ZA 1UIBA 1GB7A 5F16A 2MEIA 4DDAA 1JJ1A 1O23A 1LZ8A 2YSSC 4LT3A 4GCEA 4N5RA 4OWAA 2A7DA 3A3QA 3M18B 4II8A 4LT2A 5LA5A 1CKGA 1QQYA 1IR9A 5F9XA 193LA 4HJVA 1DXJA 1VFBC 3A93A 1OUDA 3GXRA 4NWEA 5KXWA 1HFXA 1RCMA 1EQEA 1B5VA 4NGIA 3FE0A 4DYGA 1B7RA 1NKHA 3TXFA 4NGJA 5LAGA 1D6QA 1GE4A 1HSWA 1IC4Y 4G9SA 1AKIA 1YKYX 3WL2A 4DDCA 3D9AC 1FLWA 1HFYA 1J1PY 1LAAA 3A94A 4Z41A 2BAAA 2BQKA 4OWBA 1B5ZA 2YBHA 1GFEA 3HBEX 5HMVA 1YAOA 1IORA 5J7CA 1IY4A 1LHIA 1REXA 1REYA 1LJFA 4NSJA 4WL6A 3RW8A 3WPKA 1GFRA 4AGAA 5B59A 1G7MC 3N9AA 1D0MA 1HSXA 4W96A 3EMSA 1LZAA 2EQLA 3AW7A 1QSWA 4NSGA 3WUNA 4QY9A 2W1YA 1H6MA 4CFOA 1IP4A 2ZIKA 1LYZA 3B0OA 1UIAA 4H92A 3W6BA 5KXXA 3AGIA 4OWHA 1LJIA 2D91A 1LSZA 1I56A 1QDRA 1UA6Y 2BQCA 2XTHA 2CJLA 3A6CY 3ATNA 2Z2FA 2Z2EA 1HEPA 1WQNA 3LZ2A 4NEBA 4BAPA 1KIRC 1LCNA 2HU1A 2Z38A 2Z12A 6LYTA 1GF6A 2B5ZA 4XJGA 1CKHA 1LZ6A 4NGOA 2DQGY 1B5XA 2MEAA 4H8ZA 4WM1A 4C5FA 6LYZA 5LYMA 4OOTA 1GF3A 5F14A 2D4KA 1WQOA 4N1EI 1IWVA 3TXJA 1OUJA 1GF7A 2MEFA 2Q0MX 1HEQA 3TMUA 4B4JA 4UWNA 5D5CA 5IDDA 4OWEA 4LFXA 4ML7A 2LYMA 1XGUC 3D3DA 1NQIA 4NGKA 1UIEA 2BQOA 1TAYA 3CT5A 2BQHA 1WVUA 3LYZA 4H93A 2CGIA 4NGYA 1GFTA 1BB7A 2BQLA 4E3UA 1FDLY 2A7FA 2Z19A 1OUCA 3B72A 1OUBA 1YILA 3WPLA 1YROA 1GB8A 1KXXA 2C8OA 2X0AA 3A8ZA 5LIOA 1FLQA 4TWSA 4YM8A 2D6BA 1LMQA 3TMVA 1WQPA 2HUBA 4WO9A 1UIDA 5C6IA 5HQ1A 1LJEA 5KXRA 4XJDA 2I25L 4IATA 5KXTA 3FI7A 1DI5A 1NDGC 1VEDA 4J1AA 5L3HA 1GBSA 2ZNXY 1JJ3A 1LKSA 4DD7A 1AT5A 2BQAA 5DN5A 5B07A 5HMJA 1FLYA 2YBNA 1HERA 4J7VA 3AGHA 4GCFA 2HEBA 1HELA 4PHIA 4WLDA 3A95A 1OUIA 4B4IA 2FYDA 1XSFA 2G4PA 3WW6A 1IWYA 4DC4A 5A3EA 1OP9B 5I5QA 4Z98A 4LYOA 153LA 1NMMA 1LHJA 4NSHA 1INUA 3AZ5A 3WW5A 3AJNA 4FJRA 4NGZA 3OJPA 1LMNA 1D6PA 154LA 133LA 2EKSC 4NHPA 4U3XB 1ZV5L 135LA 3VWOA 4CHXA 4YF2A 1B0DA 2FYCA 4CJ2A 1P2CC 4RW2A 3ULRA 2YDGA 1JISA 1IVMA 1Z55A 1FBIX 1YKZX 1A4VA 1LHKA 1WQMA 3KAMA 1REMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HTNA 4HV2A 1QTKA 3B6LA 1QTVA 1UIGA 1WQRA 4H91A 4TUNA 4EPFA 3GUMA 3W6CA 5KKIA 4I7RA 3AB6A 175LA 1RI8B 1SX2A 1C43A 1LZYA 4XJBA 3CB7A 227LA 4CFPA 1D9WA 1PQIA 5L9JA 1OV7A 4H8YA 1TCYA 2RSCA 5E4PA 4WM3A 1XEIA 4N8ZA 4HV1A 5FDJA 4QDNA 5LA8A 4TTDA 4I8SA 1GBOA 1D3MA 1ZVHL 1L50A 1GB3A 4YEMA 1LTMA 1LSMA 1QT4A 2F4GA 4GCBA 1LMAA 1RE2A 1VDPA 4OOOA 115LA 3LZMA 1QIOA 4LYCA 1T3PA 2AUBA 1L89A 3A3RX 4RW1A 5C6LA 2QARC 4LYMA 1KXYA 2OU8A 1CV6A 4WG1A 191LA 2B72A 1T8AA 6LZMA 1GEZA 4GN4A 2OTZX 1GE2A 1P2LA 3K2RA 2CDSA 1L51A 3CSQA 1DYCA 4ARLA 140LA 5KXSA 4LGKA 1L26A 3SB8A 5II3A 1QS5A 4BADA 5M1YA 2RBQA 3OK0A 5IHGA 1LSBA 1D0KA 1YAPA 1NHBA 1L41A 5I53A 1C6NA 1L67A 198LA 132LA 1L62A 2F47A 2OE4X 3P4ZA 5LVGA 1SLYA 1L96A 4YXCA 1FKQA 1HFZA 109LA 1IP7A 1L47A 1B5YA 4C3WA 1LZSA 1C6JA 245LA 1PQDA 2B7XA 4GN5C 1L19A 5APCA 3N9EA 1QTHA 1BGIA 1FN5A 4WM4A 182LA 1L65A 1IC5Y 4NFVA 5KXPA 1LYDA 1YL1X 1KY0A 3HH3A 1LZ4A 5LXWA 1LSGA 3WU8A 1JTNA 1G0MA 1W6ZA 3OE6A 233LA 3WULA 1C08C 1HHLA 1C61A 1LOZA 4G4BA 1GE0A 5FSTA 4QEQA 1L68A 1BVXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1AT6 A;  2LZ2 A;  4HTN A;  5B06 A;  1DI4 A;  4DDB A;  4HV2 A;  1QTK A;  3AYQ A;  1YAQ A;  4HJZ A;  1BHZ A;  1BB5 A;  4X3B A;  3B6L A;  3WU9 A;  4OWC A;  1WQR A;  1UIG A;  1LYS A;  4UWU A;  2MEG A;  2XBS A;  4H91 A;  4RDS A;  3W3E A;  4TUN A;  3W6C A;  2DQI Y;  1LJJ A;  4GCC A;  5KKI A;  1B5U A;  2C8P A;  1B9O A;  4NG8 A;  1UCO A;  3AB6 A;  4H90 A;  1HEW A;  1RI8 B;  1B5W A;  3T6U A;  3K3T A;  1C43 A;  3EBA B;  1LZY A;  4LYZ A;  4TX7 A;  2NWD X;  4XJB A;  3CB7 A;  3AZ6 A;  2F2N A;  4CFP A;  1GFJ A;  1LJK A;  1YAN A;  5JEN B;  3A6B Y;  5L9J A;  5B1G A;  2DQA A;  1SQ2 L;  1YIK A;  4J0L A;  1LYY A;  2CWI A;  2W1M A;  3M3U A;  4H8Y A;  4N9R A;  1LJH A;  4DD1 A;  1B7L A;  1TCY A;  3AZ4 A;  1J1O Y;  4PRU A;  5HLL A;  3ZVQ B;  1B7M A;  2RSC A;  5E4P A;  1F0W A;  3A92 A;  5ILC A;  4WM3 A;  3TXG A;  1B7Q A;  1JIY A;  1XEI A;  2HED A;  4NGW A;  4ET8 A;  5I4Y A;  1HC0 A;  4N8Z A;  4HV1 A;  4IJ4 A;  207L A;  3TXE A;  5FDJ A;  1IEE A;  4P2E A;  4QDN A;  4LYB A;  5LA8 A;  4TTD A;  2ZWB A;  5KXY A;  1LSD A; 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 4N1E I;  1IWV A;  3TXJ A;  1OUJ A;  1GF7 A;  2MEF A;  2Q0M X;  1HEQ A;  3TMU A;  4B4J A;  4UWN A;  5D5C A;  5IDD A;  4OWE A;  4LFX A;  4ML7 A;  2LYM A;  1XGU C;  3D3D A;  1NQI A;  4NGK A;  1UIE A;  2BQO A;  1TAY A;  3CT5 A;  2BQH A;  1WVU A;  3LYZ A;  4H93 A;  2CGI A;  4NGY A;  1GFT A;  1BB7 A;  2BQL A;  4E3U A;  1FDL Y;  2A7F A;  2Z19 A;  1OUC A;  3B72 A;  1OUB A;  1YIL A;  3WPL A;  1YRO A;  1GB8 A;  1KXX A;  2C8O A;  2X0A A;  3A8Z A;  5LIO A;  1FLQ A;  4TWS A;  4YM8 A;  2D6B A;  1LMQ A;  3TMV A;  1WQP A;  2HUB A;  4WO9 A;  1UID A;  5C6I A;  5HQ1 A;  1LJE A;  5KXR A;  4XJD A;  2I25 L;  4IAT A;  5KXT A;  3FI7 A;  1DI5 A;  1NDG C;  1VED A;  4J1A A;  5L3H A;  1GBS A;  2ZNX Y;  1JJ3 A;  1LKS A;  4DD7 A;  1AT5 A;  2BQA A;  5DN5 A;  5B07 A;  5HMJ A;  1FLY A;  2YBN A;  1HER A;  4J7V A;  3AGH A;  4GCF A;  2HEB A;  1HEL A;  4PHI A;  4WLD A;  3A95 A;  1OUI A;  4B4I A;  2FYD A;  1XSF A;  2G4P A;  3WW6 A;  1IWY A;  4DC4 A;  5A3E A;  1OP9 B;  5I5Q A;  4Z98 A;  4LYO A;  153L A;  1NMM A;  1LHJ A;  4NSH A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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