1HEOA

Structural and thermodynamic analysis of compensating mutations within the core of chicken egg white lysozyme
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGVLQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and thermodynamic analysis of compensating mutations within the core of chicken egg white lysozyme.
pubmed rcsb
molecule keywords HEN EGG WHITE LYSOZYME
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Gallus gallus
total genus 49
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1992-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1heoA00
4RW2A 3WXUA 2HUBA 1FLWA 1UIHA 4CFOA 3N9AA 1JSEA 1LSFA 4N8ZA 3W6AA 1IIZA 1IR9A 133LA 5C6LA 4G4CA 1JIYA 1CJ9A 1I1ZA 5FCPA 1JKDA 4NSHA 4DD1A 1JJ0A 4OOTA 4QDNA 1LPIA 4DD7A 3RU5A 4NHIA 3WUAA 1NMMA 4H9IA 1YIKA 2BQBA 3SP3A 4W96A 1EQ4A 4GCFA 5DLAA 1B7MA 1Z55A 4NGZA 1VEDA 1BWHA 4EOFA 1SQ2L 2DQEY 5LVIA 3BKVA 1QSWA 5KXKA 4LYMA 5F9XA 1YAPA 4N5RA 5B59A 3A91A 1OP9B 1RI8B 4XN6A 1J1OY 1LSDA 1BGIA 2W1YA 2Z18A 1D0MA 4NFVA 1C08C 2F30A 2H9KA 4HTNA 4ET8A 1LZDA 1REMA 3HBEX 3A3QA 3P66A 4NEBA 3WU8A 4YF2A 1IWZA 1WQPA 2HECA 1B5ZA 3HBDA 3W6BA 2Z39A 5ILCA 1GF5A 1LZRA 1LZAA 1UBZA 1QDRA 3A34A 1LZNA 4Z3MA 2Y8PA 1INUA 2BQDA 1IP1A 1HSWA 5KXLA 1GBXA 4DD3A 1B5VA 3AZ5A 3AYQA 4NGKA 4AXTA 1UIGA 1FLQA 4HV1A 4B4JA 5FSTA 1KIPC 2HEDA 1D9UA 4NGIA 1FBIX 1C46A 1GD6A 1LSZA 4YEMA 1DKJA 2W1LA 1LZTA 1LHIA 2C8PA 3M18B 4HTKA 4ETAA 1UIAA 2W1MA 2CJLA 4LYBA 1G7LC 1QQYA 1BHZA 1WTNA 5KXYA 2MEFA 4II8A 4BAFA 4WM6A 1RE2A 4GLVA 4B49A 4G4BA 2BQCA 4WM4A 1OUFA 4H92A 3TXBA 132LA 3TXGA 1LHMA 1IORA 3AZ6A 1HEWA 4YOPA 1HEQA 5E4PA 4NGWA 1C10A 4C5FA 5IELA 4OWCA 2ZYCA 5APDA 2D91A 2LYOA 3TXDA 5IHGA 1D0KA 1G7IC 1GFJA 2WARA 2ZILA 1YKYX 4TUNA 1IP2A 1IEEA 1YQVY 4NGYA 1B5WA 1LSNA 1LZ9A 3FI7A 1IR7A 1UIDA 3N9EA 2AUBA 1T6VL 2Z19A 1PZYA 154LA 1GDXA 1FKQA 1UIBA 4WM3A 1JTOL 4LFXA 4NIJA 3A90A 1BB4A 2CWIA 1BB7A 1LZYA 2LYZA 1CKFA 1BVKC 1GFGA 5KXMA 1GFAA 1I20A 3B0KA 5I53A 1GF3A 4LT3A 1GB9A 2MEIA 3WUMA 4DYGA 1GPQC 3EMSA 4Z41A 1CJ6A 1GBYA 4NG8A 4TWSA 2BQNA 4NHPA 1JSFA 1QDTA 4MR1A 1YKXX 2Z2EA 3K3TA 5M1YA 3LZ2A 4PHIA 5T3FA 5LYMA 1IP4A 1WQNA 1DI3A 2BQGA 3WXTA 2Q0MX 4E3UA 1LOZA 1ALCA 2BPUA 2MEDA 3P4ZA 4XJHA 1GXV2 1XGUC 4DD9A 1VDTA 2YBIA 194LA 1HFYA 1REXA 1JPOA 1F6RA 3HBHA 2PC2A 4NHQA 1GE1A 5AMYA 4H9AA 5KJ9A 1BQLY 3CSQA 3A6CY 2D6BA 1IC5Y 5KXSA 4NHSA 3IWRA 2ZQ3A 5LVKA 1DPXA 1JEFA 4HJYA 1DQJC 1AZFA 3AGGG 5L9JA 1LSMA 5KXTA 2YBNA 1CJ8A 5KXPA 2F4GA 1GBOA 3A67Y 193LA 2DBTA 1RCMA 1J1PY 4N1CC 2BQKA 4H9FA 3AGHA 3GXRA 3RT5X 4BAPA 1NBZC 1WQMA 1ZMYL 5I4XA 1YAMA 2IFFY 5FELA 5HNCA 4ET9A 2X0AA 1GB0A 1NDMC 1C45A 3LN2A 1JJ3A 4OWAA 1OUDA 3WYHA 1CKDA 4Z46A 1D6PA 4HJVA 135LA 1H6MA 1LSPA 3M3UA 4YENA 5LYZA 1UC0A 1OUJA 4HV2A 3TXJA 1BWJA 5APFA 2ZIJA 4QEQA 1IWTA 4BS7A 1ZV5L 1GEZA 1AM7A 2FBBA 1XEKA 5HMJA 1FDLY 2Z37A 1HMKA 4NGLA 4B4IA 4B0DA 5LA5A 2YBMA 1GDWA 1GE2A 5LAFA 5F9UA 3CT5A 5C6JA 1C7PA 1LZ1A 4NGJA 4LT1A 3D9AC 2BQHA 4H8ZA 4LYOA 1LZ5A 4QY9A 1HFZA 3A3RX 3LYZA 4MSTA 2H5ZA 5KKJA 4NSJA 4RLNA 1LZBA 1LZGA 3T36A 1LJEA 3WMKA 3HFMY 1LYYA 1GEVA 1YAQA 2GV0A 3TXIA 1IX0A 1VDQA 4L41A 4D9ZA 1JKCA 1IWWA 4IJ4A 4LT0A 1JJ1A 3LYTA 1GBZA 4OW1A 1OUAA 1XFPL 1LJGA 1H87A 1A2YC 3OK0A 4YEOA 4WMGA 4LT2A 3A6BY 1IY4A 4HSFA 3BKHA 1LJHA 3A94A 4C3WA 4ETDA 1BB3A 2CGIA 2DQFC 2G4PA 4PJ2C 4U3XB 1B0DA 3AZ4A 3LYOA 3N9CA 4N1EI 1VFBC 4CJ2A 1D6QA 1GXXA 1LYZA 1LMOA 4NHTA 5APCA 1LMNA 1WQQA 4H8XA 2DQJY 3G3BB 4X3BA 1LHHA 5E9RA 3WW6A 4ETBA 2F4AA 3EXDA 3ATNA 1VAUA 2BLYA 2HEEA 2A7DA 1HEPA 1RJCB 4YM8A 1G7MC 1QIOA 4OWHA 1LSYA 2N5ZA 4ETCA 1G7HC 1REYA 3WVYA 4GCDA 1REZA 1JKBA 4XENA 2BQLA 1NKHA 1HERA 1JISA 2LHMA 1YILA 3FE0A 1GHLA 4WG1A 4R0FA 1YL0X 3WUNA 4DDCA 5LXWA 1DPWA 4LGKA 2YSSC 3G3AB 5II3A 2Z38A 4NSIA 5LIOA 5A3EA 3W6EA 1DI5A 4GCCA 3WPLA 3A96A 4RDSA 1VDSA 1BVXA 1AT6A 4HPEA 2XBSA 2EPEA 4PRUA 1UCOA 4HJZA 1LAAA 2BLXA 4H9EA 4DD0A 2B5ZA 1XGPC 2EQLA 2H9JA 1KIQC 1TAYA 1UUZC 4Z98A 1HC0A 3E3DA 1NDGC 4ZIXA 4DDBA 3ZVQB 1GFVA 1OUGA 2EIZC 2MECA 1GE0A 3F6ZA 1LMAA 3W6FA 1LKSA 4KPMA 4IASA 5LYTA 1LMQA 4WLXA 1OUIA 153LA 3B0OA 1EL1A 1IP3A 1TCYA 2BAAA 1LHLA 1GF0A 4P2EA 2RSCA 1AT5A 1BB5A 4TSCA 1GE4A 4H9CA 1VATA 3P64A 1YKZX 1VDPA 4HTQA 5B1GA 1LMTA 1ZVYB 4MCKA 4B4EA 4XADA 1B7QA 1JKAA 1GAYA 4N0JA 1FLUA 1CNSA 1HMLA 4KL7A 1IR8A 3AB6A 4FJRA 5I54A 4H93A 4I0CA 1B5UA 2HEAA 1FLYA 2Z2FA 2ZNWY 3LZTA 3MGWA 1GF7A 4ML7A 1QTKA 3TXKA 1NF5A 1UACY 4DD2A 2XTHA 3WPJA 4J7VA 1GFTA 1GAZA 3CT0A 5LAGA 9LYZA 1IOQA 1B9OA 5B05A 207LA 3A92A 1B7LA 3WU9A 4I8SA 3KAMA 1IWXA 1LMCA 1GB8A 2MEBA 4DT3A 3A8ZA 4KXIA 4WLTA 3W6CA 4PPOA 4RLMA 1D0LA 3TXFA 5B06A 4LYTA 1CKHA 4GN5C 3TMWA 2BQAA 1LZ4A 5ILFA 1DI4A 4WLYA 1GFUA 1PS5A 2Z12A 3D3DA 2BQIA 4GN4A 5DN4A 2C8OA 4B1AA 5KXRA 1GB6A 5F14A 1LHJA 1TBYA 3T6UA 1LZCA 1HF4A 1WQRA 1XEIA 2BQEA 1GF8A 5HQ1A 1E8LA 1SLYA 3TMUA 1KXXA 1YANA 208LA 2F2NA 1A4VA 3LHMA 4WM2A 1HHLA 1RFPA 1V7SA 2MEHA 5HMVA 4H90A 4A7DA 4WL7A 4CHXA 5KXXA 2YBLA 3WL2A 1MELL 1GF4A 1XEJA 2MEGA 5D5FA 8LYZA 2D4IA 1F6SA 2I26L 2YVBA 3B72A 4G9SA 1LKRA 3CSRA 1JUGA 4O34A 1JTTL 1GB2A 1G7JC 134LA 4TX7A 5LVGA 3EO5A 3WU7A 4NWEA 5KXNA 1LZ8A 1B5XA 1HNLA 1GBSA 1LJ3A 1LZ6A 4ETEA 1DZBX 2NWDX 5IDDA 5FDJA 2FYCA 1GFEA 2DQGY 4DC4A 1AKIA 1EQ5A 3ATOA 3LYMA 3RW8A 4WLDA 3W3EA 2HU1A 1JTPL 5KY1A 1LZEA 4UWVA 4DDAA 1B7NA 2DQIY 5KXOA 3J4GA 2BQJA 4HPIA 4WM5A 5D5CA 3WULA 7LYZA 1IC4Y 4ZEEA 1C43A 5JENB 1LCNA 1B7SA 1DKKA 3CSZA 2ZQ4A 4XJFA 5DL9A 4ZFPA 4NWHA 4XJGA 1V7TA 4AGAA 5DM9A 4RW1A 4H91A 4CGEA 4XYYA 2HTXA 4H8YA 5HNLA 2EKSC 1NQIA 2YBHA 5J7CA 2I25L 3OJPA 2IHLA 4WM1A 4WO6A 1XSFA 3AZ7A 4NG1A 1QSAA 4PRQA 1ZVHL 5KKIA 3A93A 5C6IA 4GLAA 1LYSA 1IO5A 1LHKA 1YAOA 1FN5A 1WTMA 1LZSA 1IWVA 3AW7A 1WVUA 4XJDA 1IC7Y 1IWUA 4J1BA 3RZ4A 1NWGA 1I56A 1J1XY 2D4JA 2HEFA 3CQLA 1LMPA 1LTMA 1JITA 1BWIA 1UA6Y 3AJNA 3EBAB 1IP7A 2I6ZA 4XJIA 4BADA 1FKVA 4G49A 4FDYA 5HLLA 3ULRA 5I4WA 4NY5A 5DN5A 3QY4A 5FEKA 4TSBA 2XBRA 1HEMA 3GXKA 5L3HA 1HELA 4IATA 1TDYA 4WL6A 4UWUA 3ZEKA 2FYDA 3TMXA 1LSBA 4NSGA 4UWNA 1DXJA 1W6ZA 3TXEA 1LSEA 6LYZA 1IWYA 1GWDA 1UIEA 1UICA 1CJ7A 2G4NA 1B7OA 2ZIKA 3QE8A 4N9RA 4M6DA 1OUCA 2YDGA 4OWBA 4H94A 3WVXA 1HEOA 3WW5A 1IP6A 2DKVA 4XJBA 3WH1A 4J1AA 4NGVA 1LJKA 4H1PA 4W94A 3P68A 4GCBA 1HFXA 5KXWA 2FBDA 1QUSA 1B7RA 2XJWA 1GFHA 3ZVQA 5LVHA 1GB7A 1IOSA 1LJIA 4WG7A 4ANRA 4OOOA 4TTDA 1LSCA 5L3IA 5LA8A 1LJNA 1GFRA 1GE3A 4HP0A 1YROA 1UIFA 5F16A 4G4HA 1GF9A 5B1FA 4H9HA 2A7FA 2BQOA 5FHWA 1JWRA 6LYTA 1QTEA 1NHEA 3W6DA 1TEWA 1MLCE 1LSGA 3TXHA 5F81A 4GCEA 4PGJB 5B07A 1OQMA 1IOCA 3CT1A 1KIRC 2CDSA 2LZ2A 2D4KA 5EBHA 1B7PA 1F0WA 3IJUA 4OWEA 4WOAA 4QGZA 1NBYC 4WO9A 2HU3A 5LVJA 5KXZA 4H9BA 3B0IA 3AGIA 5I4YA 2MEEA 4DWXA 1GB3A 1LSAA 2ZYPA 2HEBA 5K7OA 1LJFA 1XGQC 1WVVA 1T3PA 1OUHA 1IP5A 1KXYA 1GBWA 1O23A 2BQMA 5A3ZA 3TMVA 1KXWA 2DQHY 2DQCY 3RNXA 4M4OA 1YL1X 1GFKA 2LZTA 1HSXA 3P65A 1CKCA 4EMNA 2BQFA 3AW6A 3IJVA 1W08A 2G4QA 1IY3A 1BB6A 1LJJA 2LYMA 1HENA 5APEA 3QNGA 1B5YA 2YBJA 4LYZA 1EQEA 1WQOA 2VB1A 2ZNXY 2ZWBA 4LZTA 3WPKA 4CFPA 1F10A 4NGOA 1JHLA 1XGTC 5LINA 1QUTA 3A95A 1IVMA 2W1XA 1B2KA 1GF6A 1P2CC 1XGRC 2DQDY 2MEAA 1OUEA 3B6LA 3J6KA 4GN3A 4KT3A 2DQAA 3VWOA 1N4FA 1CKGA 4LFPA 3CB7A 1LYOA 1LJ4A 1GB5A 4LYCA 4R6CA 5I5QA 4J0LA 1IOTA 1OUBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RW2A 3CDVA 1G0QA 127LA 1FLWA 2LZMA 3HH4A 3N9AA 4N8ZA 1IIZA 133LA 1JIYA 2RAZX 5FCPA 4NSHA 4DD1A 4OOTA 1L51A 2RBNA 1NMMA 3C7YA 4H9IA 3G3XA 1EQ4A 1VEDA 1SQ2L 2DQEY 3BKVA 3A91A 1J1OY 1DYFA 4NFVA 1G0JA 2H9KA 4HTNA 3HBEX 1LYFA 1SSYA 3HBDA 5LZMA 5ILCA 1C6MA 1LZRA 1NHBA 3A34A 1LZNA 1IP1A 255LA 1FLQA 4HV1A 4YEMA 2W1LA 183LA 3DN4A 5KXYA 4WM6A 3CDTA 253LA 4B49A 1OUFA 3TXBA 132LA 1LHMA 5E4PA 4C5FA 5APDA 2D91A 1C68A 5IHGA 2WARA 224LA 4EKSA 1LZ9A 1T6VL 154LA 1PZYA 1PQMA 2OE9X 1BB7A 150LA 3NYAA 2LYZA 1BVKC 5I53A 1GF3A 4OO9A 3F8VA 4PK0A 4NG8A 1G0PA 1QT3A 1WQNA 3WXTA 1GXV2 194LA 1HFYA 1REXA 1JPOA 2PC2A 1L47A 1DYAA 1GE1A 1BQLY 3A6CY 2D6BA 5KXSA 1L86A 1JEFA 1C6NA 1DQJC 248LA 3AGGG 4HJYA 1LSMA 1D3FA 3A67Y 2NTGA 1LPYA 1L08A 3C8QA 1J1PY 2B75A 4N1CC 1SWYA 3GXRA 4H9FA 1ZMYL 1YAMA 2IFFY 4ET9A 2LC9A 4W51A 1NDMC 1C45A 1JJ3A 4W59A 1LGWA 1L04A 4Z46A 135LA 4YENA 4HV2A 2ZIJA 4QEQA 1ZV5L 2FBBA 2Z37A 4B4IA 4B0DA 2YBMA 1GDWA 1C7PA 157LA 3D9AC 2BQHA 4LYOA 1LZ5A 1HFZA 1OV7A 115LA 5KKJA 1LZBA 1LJEA 1P6YA 3WMKA 4D9ZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4RW2 A;  3WXU A;  2HUB A;  1FLW A;  1UIH A;  4CFO A;  3N9A A;  1JSE A;  1LSF A;  4N8Z A;  3W6A A;  1IIZ A;  1IR9 A;  133L A;  5C6L A;  4G4C A;  1JIY A;  1CJ9 A;  1I1Z A;  5FCP A;  1JKD A;  4NSH A;  4DD1 A;  1JJ0 A;  4OOT A;  4QDN A;  1LPI A;  4DD7 A;  3RU5 A;  4NHI A;  3WUA A;  1NMM A;  4H9I A;  1YIK A;  2BQB A;  3SP3 A;  4W96 A;  1EQ4 A;  4GCF A;  5DLA A;  1B7M A;  1Z55 A;  4NGZ A;  1VED A;  1BWH A;  4EOF A;  1SQ2 L;  2DQE Y;  5LVI A;  3BKV A;  1QSW A;  5KXK A;  4LYM A;  5F9X A;  1YAP A;  4N5R A;  5B59 A;  3A91 A;  1OP9 B;  1RI8 B;  4XN6 A;  1J1O Y;  1LSD A;  1BGI A;  2W1Y A;  2Z18 A;  1D0M A;  4NFV A;  1C08 C;  2F30 A;  2H9K A;  4HTN A;  4ET8 A;  1LZD A;  1REM A;  3HBE X;  3A3Q A;  3P66 A;  4NEB A;  3WU8 A;  4YF2 A;  1IWZ A;  1WQP A;  2HEC A;  1B5Z A;  3HBD A;  3W6B A;  2Z39 A;  5ILC A;  1GF5 A;  1LZR A;  1LZA A;  1UBZ A;  1QDR A;  3A34 A;  1LZN A;  4Z3M A;  2Y8P A;  1INU A;  2BQD A;  1IP1 A;  1HSW A;  5KXL A;  1GBX A;  4DD3 A;  1B5V A;  3AZ5 A;  3AYQ A;  4NGK A;  4AXT A;  1UIG A;  1FLQ A; 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 1IOS A;  1LJI A;  4WG7 A;  4ANR A;  4OOO A;  4TTD A;  1LSC A;  5L3I A;  5LA8 A;  1LJN A;  1GFR A;  1GE3 A;  4HP0 A;  1YRO A;  1UIF A;  5F16 A;  4G4H A;  1GF9 A;  5B1F A;  4H9H A;  2A7F A;  2BQO A;  5FHW A;  1JWR A;  6LYT A;  1QTE A;  1NHE A;  3W6D A;  1TEW A;  1MLC E;  1LSG A;  3TXH A;  5F81 A;  4GCE A;  4PGJ B;  5B07 A;  1OQM A;  1IOC A;  3CT1 A;  1KIR C;  2CDS A;  2LZ2 A;  2D4K A;  5EBH A;  1B7P A;  1F0W A;  3IJU A;  4OWE A;  4WOA A;  4QGZ A;  1NBY C;  4WO9 A;  2HU3 A;  5LVJ A;  5KXZ A;  4H9B A;  3B0I A;  3AGI A;  5I4Y A;  2MEE A;  4DWX A;  1GB3 A;  1LSA A;  2ZYP A;  2HEB A;  5K7O A;  1LJF A;  1XGQ C;  1WVV A;  1T3P A;  1OUH A;  1IP5 A;  1KXY A;  1GBW A;  1O23 A;  2BQM A;  5A3Z A;  3TMV A;  1KXW A;  2DQH Y;  2DQC Y;  3RNX A;  4M4O A;  1YL1 X;  1GFK A;  2LZT A;  1HSX A;  3P65 A;  1CKC A;  4EMN A;  2BQF A;  3AW6 A;  3IJV A;  1W08 A;  2G4Q A;  1IY3 A;  1BB6 A;  1LJJ A;  2LYM A;  1HEN A;  5APE A;  3QNG A;  1B5Y A;  2YBJ A;  4LYZ A;  1EQE A;  1WQO A;  2VB1 A;  2ZNX Y;  2ZWB A;  4LZT A;  3WPK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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