1HF4A

Structural effects of monovalent anions on polymorphic lysozyme crystals
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
publication title Structural Effects of Monovalent Anions on Polymorphic Lysozyme Crystals
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-11-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1hf4A00
1CJ8A 4OWCA 1BQLY 1LZGA 1NDMC 1UIDA 4ETDA 4HSFA 3VWOA 1YAMA 5DN5A 5AMYA 1HFYA 5APEA 4XYYA 4H9FA 5KXXA 2LHMA 4PRQA 1QDTA 2Z12A 1HELA 1UUZC 1WQNA 4WLDA 1GB8A 1QTKA 4LYZA 1DPWA 1F6RA 1JKAA 4XADA 2G4PA 1IWWA 1IR7A 1NDGC 1WVVA 1LOZA 2LYMA 4GCCA 4NGKA 1NKHA 2XJWA 3AGGG 1G7LC 1OQMA 1YL1X 1FLUA 1CKDA 3TMWA 2BPUA 1A4VA 1JKDA 4WG1A 1CJ6A 1GHLA 1GFTA 3G3BB 4CFOA 1GAZA 4DD1A 2CGIA 2MEGA 4NSHA 1JWRA 4TX7A 1WTMA 2F4GA 1LSDA 2ZYCA 2ZIKA 1D6QA 1GBWA 4ZEEA 1HC0A 1GDXA 4OWHA 1C43A 1LJNA 4BAPA 1WQMA 4NEBA 2BQLA 4NY5A 4WL6A 1B5VA 1T3PA 2YBIA 2YBMA 3GXKA 1LKSA 4N1EI 3B0IA 4RLMA 1HEQA 5J7CA 1HNLA 2Z18A 3FI7A 2I6ZA 2BQCA 1FN5A 1LKRA 1VDPA 5EBHA 5APCA 5FELA 2HEAA 4ETBA 1GDWA 2YVBA 5B07A 3D3DA 5KXYA 1DKJA 2BQOA 4ET8A 1XEKA 1JUGA 4KT3A 4LFPA 4CHXA 5KXTA 2DQDY 2Z37A 4Z46A 1DXJA 1GPQC 1O23A 4MCKA 1B7QA 1LHJA 1LAAA 5LYMA 4DT3A 1GFGA 4ETCA 1VDTA 4PPOA 1DI4A 2D4KA 1QQYA 3LYZA 2DQIY 1HMLA 1LJEA 1PZYA 1RFPA 4TSBA 4DDBA 2Z2FA 5B59A 1UIGA 1GE4A 1EL1A 1LZEA 3SP3A 4H9AA 2AUBA 1LCNA 4B4IA 1GBXA 4YF2A 2RSCA 4H8XA 4GN4A 4NHTA 3BKVA 1GXXA 5APDA 4M4OA 2XBSA 4WMGA 4NSGA 3TXJA 4AXTA 2BQNA 1IWZA 3T36A 4U3XB 1LZAA 2BQKA 5L9JA 5HNCA 4D9ZA 4LYBA 1HEWA 1IOSA 4H9BA 3IJVA 3ZEKA 5KKJA 2DQJY 1WQPA 1LSBA 1ZVYB 1JJ1A 1IR8A 4WM6A 1BWIA 1D9UA 1HEPA 1MELL 2DQCY 4NHPA 1LHLA 1BVKC 2BQDA 4XJBA 1GFAA 1LHKA 2ZQ4A 1GEZA 1UIEA 1REMA 5LAFA 1LJKA 1HSWA 1FKVA 2H9JA 4IATA 3ULRA 3WW6A 1LPIA 1CKHA 1BWJA 4B4JA 1BB5A 1F6SA 3B72A 4OWBA 5I5QA 3WPLA 1LTMA 1LJ4A 4HV2A 1JKBA 1JSEA 3BKHA 3CB7A 3W3EA 1G7IC 1IR9A 1XGTC 1YIKA 3KAMA 2LZTA 4LYMA 3W6DA 5I4YA 1UIFA 1UICA 1ZVHL 1GBZA 4KL7A 1NBZC 1GBYA 4BADA 1HFXA 1UIBA 1GFJA 2BAAA 1FBIX 2YBJA 193LA 1B5XA 1GB3A 3AZ6A 4FJRA 1UIHA 2YDGA 4WLXA 4XJFA 4XN6A 1INUA 4HV1A 1OUJA 1EQ5A 1XEIA 1LZ9A 1GB5A 1D0MA 1GFEA 2PC2A 5L3HA 4N8ZA 4BS7A 6LYTA 1BGIA 8LYZA 3RW8A 2BQBA 1WQOA 3A91A 1DZBX 2MEEA 4PJ2C 1VDSA 1AT6A 3IWRA 3CSZA 2NWDX 4H9CA 1GFKA 2BQGA 4J0LA 1GEVA 1OUIA 1LHIA 4I8SA 1IEEA 5DL9A 2B5ZA 3CSQA 3CT0A 1GXV2 4UWUA 5KXWA 2EKSC 1LZ5A 2C8PA 1JITA 1BHZA 4XJIA 1E8LA 1LMOA 4NIJA 1NBYC 1B7NA 1RCMA 4HTKA 1GBOA 3WUNA 1J1XY 1REXA 4H9EA 5F14A 2H5ZA 4PHIA 4UWVA 3WVYA 3A96A 1GWDA 1B7PA 1XGQC 3IJUA 1IWYA 5LVHA 1LJJA 1JKCA 1RE2A 1LZ8A 1NQIA 2MEFA 4LYTA 1JISA 5LA5A 5LINA 4XJHA 4HTNA 1LSGA 2BQHA 1NHEA 1HEMA 1JJ0A 2BQEA 4X3BA 1WQQA 2A7FA 5LVJA 2ZNXY 3AJNA 1OUAA 2LYZA 3GXRA 5I53A 1D0LA 3W6FA 2CWIA 3TXGA 3A90A 5LVIA 1B5YA 2DQFC 4RW2A 1BB6A 1IP2A 1AZFA 4WOAA 2F2NA 1CKGA 5DN4A 1LSFA 1P2CC 5E9RA 5II3A 5IDDA 4J1AA 5ILCA 1KXXA 3J4GA 1RJCB 1HENA 1VDQA 5D5CA 2D6BA 3AZ7A 4KXIA 2CDSA 1DQJC 1OUHA 1QUTA 7LYZA 4YM8A 4R6CA 1AKIA 1IP1A 1GF7A 3CT5A 1GFRA 4C3WA 5B1GA 2HU3A 3WXTA 5T3FA 5LXWA 1LMCA 4LYCA 1YKXX 4LZTA 1XFPL 1VFBC 1NMMA 2BQAA 1LSAA 1VATA 1CKCA 2DBTA 4G4BA 4NGVA 3A92A 4J7VA 1AT5A 1GE1A 4TTDA 154LA 1YROA 1GB9A 1JEFA 3LN2A 5DLAA 3W6CA 2YBHA 4L41A 4QGZA 2MEBA 4PGJB 5LVKA 5IHGA 4GCFA 4P2EA 4WM1A 3TXKA 3M3UA 1UCOA 2ZWBA 4UWNA 3AZ4A 3AGHA 3AW6A 4GN3A 1IWVA 1KIRC 2XBRA 1OUEA 4N0JA 4OOTA 3WYHA 1LHHA 3B0OA 1V7SA 1EQ4A 5KXOA 4PRUA 1LJ3A 3M18B 5KXLA 3AYQA 1BB7A 1LZ4A 3CQLA 4A7DA 4RW1A 4NGWA 5KXKA 5LA8A 133LA 1NWGA 1YANA 4DC4A 4HP0A 1LMTA 1LSCA 2YBNA 2ZIJA 4GCEA 4DDCA 3P65A 1HEOA 1YKYX 4HJYA 1LSYA 5KY1A 1OUFA 1XGUC 4ZFPA 3LHMA 5KXRA 2FBBA 2YSSC 4H1PA 1I1ZA 4G49A 4W94A 5FDJA 5M1YA 2G4NA 2MEHA 5HNLA 2ZILA 4CFPA 1GF0A 207LA 4H8YA 3A95A 3MGWA 1JTPL 3CT1A 5KXZA 3ZVQA 1F10A 5HMVA 1VAUA 2Z39A 1G7JC 3N9EA 1JJ3A 1FLWA 4G4CA 5L3IA 2MEDA 2MECA 1YAOA 1GE3A 1IX0A 1SLYA 2D4JA 3EMSA 4EMNA 3B0KA 2ZNWY 3LZTA 4LT2A 5HQ1A 1V7TA 1AM7A 2I26L 1EQEA 208LA 1LZYA 2HUBA 4CJ2A 4QY9A 1LHMA 1D6PA 2EIZC 1BB3A 4WM2A 4WO6A 1GF4A 2HTXA 1LZSA 4B1AA 4GLVA 2HEDA 5E4PA 1YAPA 1C46A 4H8ZA 194LA 3LZ2A 5F81A 1IP6A 1LZTA 5LVGA 3WMKA 3A3QA 2HEFA 4HPEA 2LZ2A 6LYZA 5DM9A 1GF8A 1HHLA 5FCPA 1J1PY 1IY4A 5C6JA 1GF3A 1GAYA 4RLNA 1WVUA 2HU1A 2D4IA 2BQIA 2DQEY 1GB2A 2BQFA 2W1LA 3A6CY 3TXEA 1QSWA 1UBZA 4NHSA 2YBLA 3HBDA 4XENA 1IOTA 5LYTA 4G4HA 4GCDA 1QSAA 1N4FA 1REYA 4MSTA 4NGZA 5LIOA 2EPEA 3W6EA 4DYGA 1LMPA 4WLTA 2F4AA 1TEWA 3WULA 1B2KA 2W1MA 4H9IA 3W6BA 1B7SA 1T6VL 4DD3A 4IJ4A 2DQGY 4IASA 1B7OA 1IC4Y 3LYMA 3G3AB 4H93A 4DD9A 1LSPA 3RU5A 3LYOA 4OW1A 1GF6A 4YOPA 1B5WA 3WUMA 1LZDA 3B6LA 5IELA 4H90A 1CJ9A 1JIYA 1HERA 1QUSA 3P66A 2CJLA 1UIAA 134LA 3WUAA 3ZVQB 4QDNA 4Z98A 3RT5X 4DD2A 4Z41A 3CSRA 3AZ5A 3RNXA 1LMNA 1IO5A 1DKKA 4HPIA 153LA 2FYCA 3A34A 1TCYA 1LZ6A 4HJVA 4WM5A 3FE0A 4N1CC 1FLQA 2HEEA 4WO9A 4LGKA 2WARA 2D91A 1IOCA 5ILFA 1GB7A 1LZBA 1TAYA 2A7DA 2C8OA 1LZRA 2MEIA 3EO5A 4HTQA 2G4QA 3QY4A 1LMAA 2I25L 1VEDA 1H87A 4QEQA 1D0KA 1B5ZA 5HLLA 3OJPA 4MR1A 3D9AC 1IVMA 1GE0A 3AGIA 3ATOA 4M6DA 4EOFA 1IY3A 3EXDA 2XTHA 3TXFA 1DPXA 1CJ7A 4NWEA 1LSNA 1JTOL 4FDYA 2Y8PA 3HBHA 4TWSA 1J1OY 1GFHA 2ZQ3A 4WM3A 1LSZA 2Z19A 2LYOA 4RDSA 4AGAA 1OUBA 3HBEX 1FKQA 1A2YC 3AB6A 3WW5A 1IWXA 1B7RA 1JHLA 1WQRA 1H6MA 2Z38A 4HJZA 1LJFA 5KXPA 3WU8A 1ZV5L 1XSFA 1W6ZA 5I54A 1YQVY 1GFVA 1QTEA 4XJGA 2HECA 3E3DA 1JTTL 1IC7Y 4YENA 1W08A 2GV0A 4CGEA 1TDYA 1LZCA 1C45A 5B06A 1B7LA 5JENB 1XGRC 4LT1A 1DI5A 4OWEA 3TMXA 1LZ1A 2N5ZA 1MLCE 5B05A 2ZYPA 3OK0A 3EBAB 1IIZA 1NF5A 2Z2EA 4NGOA 4W96A 4GN5C 4B49A 1HFZA 1FDLY 4ETAA 4NG1A 1IP4A 2IHLA 5KJ9A 1WTNA 9LYZA 4H9HA 1GE2A 2DQHY 1IP7A 1G7MC 3TXIA 3WXUA 1BVXA 1B5UA 1C7PA 1REZA 1XEJA 2DKVA 4NGLA 3P64A 1SQ2L 5APFA 3A93A 3F6ZA 3N9AA 5K7OA 3A67Y 4H92A 5F9UA 4GLAA 5FEKA 1KXWA 1LSMA 1IP5A 1CNSA 1TBYA 132LA 1LZNA 1KIQC 4KPMA 1GB6A 1LYZA 1BWHA 3J6KA 4NGJA 4ML7A 3A8ZA 4Z3MA 5C6LA 1IC5Y 1JSFA 2VB1A 4WG7A 1C08C 4WL7A 4NGIA 1HF4A 4YEOA 4ETEA 2EQLA 4NSJA 1I56A 1QDRA 4NHQA 1C10A 3WU9A 4NWHA 5F9XA 4YEMA 3A94A 1OUDA 4TSCA 4I0CA 1YKZX 3WPKA 4O34A 3TXBA 1JPOA 1IP3A 3RZ4A 2IFFY 4R0FA 1LMQA 4NFVA 3W6AA 3ATNA 1IOQA 1IWTA 2FYDA 3A3RX 4BAFA 3K3TA 4NHIA 5I4XA 1LYOA 1PS5A 1LYSA 1ZMYL 1OUCA 2FBDA 5C6IA 1HMKA 4J1BA 4OOOA 3TMUA 3LYTA 1BB4A 4WLYA 5KXNA 5D5FA 1GF5A 3WH1A 5A3EA 3TMVA 3WPJA 4DD0A 2BLYA 1LYYA 1YL0X 5FHWA 4LYOA 1RI8B 3TXHA 1LSEA 1UC0A 3AW7A 3HFMY 3N9CA 5B1FA 4LT0A 2H9KA 5A3ZA 1UACY 3WL2A 3T6UA 2W1XA 1KIPC 2BLXA 1OP9B 1XGPC 4N5RA 3QNGA 2DQAA 5FSTA 4XJDA 4DWXA 4H94A 1IWUA 4GCBA 4N9RA 4TUNA 1G7HC 2BQJA 3A6BY 1I20A 4C5FA 2BQMA 4H91A 3TXDA 5HMJA 1Z55A 4DD7A 4LFXA 5I4WA 4B4EA 4DDAA 1UA6Y 2X0AA 4NGYA 1IORA 1QIOA 4G9SA 1B9OA 1KXYA 1ALCA 1OUGA 2MEAA 3QE8A 4NG8A 1F0WA 1GD6A 2HEBA 2Q0MX 1GF9A 1YAQA 4II8A 1FLYA 4ET9A 1YILA 4E3UA 3WU7A 1LJGA 3P4ZA 3P68A 1B7MA 1HSXA 1DI3A 4LT3A 4NSIA 1CKFA 135LA 5LAGA 4B0DA 1GB0A 1GFUA 2F30A 5LYZA 4OWAA 5KXMA 4ANRA 2W1YA 5KXSA 5F16A 1GBSA 1LJHA 1LJIA 3WVXA 5KKIA 4WM4A 1B0DA 4ZIXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
104LA 1P37A 1LYEA 4PRQA 1QDTA 1QTKA 4XADA 2G4PA 1C6BA 1WVVA 2XJWA 1OQMA 1FLUA 2BPUA 1CJ6A 180LA 1GHLA 3G3BB 3DN8A 1GAZA 2MEGA 168LA 4TX7A 191LA 1D6QA 1GBWA 3NY8A 1GDXA 1C43A 200LA 1B5VA 3GXKA 2RBSA 1HNLA 2YVBA 3D3DA 1XEKA 4CHXA 1C6AA 1L04A 127LA 1L05A 1GPQC 1QTBA 1B7QA 1L36A 1VDTA 2D4KA 1QQYA 2OTYX 4TSBA 1PZYA 4DDBA 1KNIA 1GE4A 1EL1A 3SP3A 1L20A 3EMLA 1L77A 4H8XA 4M4OA 4NHTA 3BKVA 4PJZA 4K5YA 4IAPA 1IWZA 4U3XB 1L50A 1LGWA 2BQKA 4ZPUA 150LA 1WQPA 1LSBA 3TXDA 1IR8A 2DQCY 1D9UA 3F9LA 1QT8A 1LHLA 1GFAA 1LHKA 3G3WA 5LAFA 4IATA 4B4JA 3RZEA 5I5QA 1L66A 4YXCA 4LYMA 2F2QA 1UICA 1ZVHL 1GBZA 1GBYA 4BADA 4I7MA 1NHBA 3AZ6A 2YDGA 4XN6A 149LA 4HV1A 1OUJA 1XEIA 1D0MA 1LZ9A 3F8VA 1DYCA 148LE 1VDSA 1TLAA 3CSZA 4H9CA 1OUIA 1LHIA 4I8SA 3HTDA 5DL9A 5KXWA 1JITA 236LA 2RAYX 3NY9A 4PK0A 4XJIA 1E8LA 1L17A 189LA 4H9EA 4UWVA 3WVYA 3A96A 1GWDA 198LA 1C61A 1XGQC 1IWYA 3ODUA 4I7PA 1NQIA 128LA 241LA 1LWGA 4HTNA 1LSGA 2BQHA 1L63A 2OEAX 2BQEA 3HUAA 2ZNXY 2LYZA 2O79A 3W6FA 5LVIA 1B5YA 1QTVA 5II3A 1C6TA 1LGXA 1P2CC 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1CJ8 A;  4OWC A;  1BQL Y;  1LZG A;  1NDM C;  1UID A;  4ETD A;  4HSF A;  3VWO A;  1YAM A;  5DN5 A;  5AMY A;  1HFY A;  5APE A;  4XYY A;  4H9F A;  5KXX A;  2LHM A;  4PRQ A;  1QDT A;  2Z12 A;  1HEL A;  1UUZ C;  1WQN A;  4WLD A;  1GB8 A;  1QTK A;  4LYZ A;  1DPW A;  1F6R A;  1JKA A;  4XAD A;  2G4P A;  1IWW A;  1IR7 A;  1NDG C;  1WVV A;  1LOZ A;  2LYM A;  4GCC A;  4NGK A;  1NKH A;  2XJW A;  3AGG G;  1G7L C;  1OQM A;  1YL1 X;  1FLU A;  1CKD A;  3TMW A;  2BPU A;  1A4V A;  1JKD A;  4WG1 A;  1CJ6 A;  1GHL A;  1GFT A;  3G3B B;  4CFO A;  1GAZ A;  4DD1 A;  2CGI A;  2MEG A;  4NSH A;  1JWR A;  4TX7 A;  1WTM A;  2F4G A;  1LSD A;  2ZYC A;  2ZIK A;  1D6Q A;  1GBW A;  4ZEE A;  1HC0 A;  1GDX A;  4OWH A;  1C43 A;  1LJN A;  4BAP A;  1WQM A;  4NEB A;  2BQL A;  4NY5 A;  4WL6 A;  1B5V A;  1T3P A;  2YBI A;  2YBM A;  3GXK A;  1LKS A;  4N1E I;  3B0I A;  4RLM A;  1HEQ A;  5J7C A;  1HNL A;  2Z18 A;  3FI7 A;  2I6Z A;  2BQC A;  1FN5 A;  1LKR A;  1VDP A;  5EBH A;  5APC A;  5FEL A;  2HEA A;  4ETB A;  1GDW A;  2YVB A;  5B07 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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