1HHLA

The three-dimensional structure of pheasant and guinea-fowl egg lysozymes
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNSQATNRNTDGSTDYGVLQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALQSSDITATANCAKKIVSDGDGMNAWVAWRKHCKGTDVRVWIKGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of pheasant and guinea fowl egg-white lysozymes
pubmed rcsb
molecule keywords GUINEA FOWL LYSOZYME
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Numida meleagris
total genus 49
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1993-05-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1hhlA00
1W08A 4WM4A 5T3FA 1IWVA 4MSTA 5FCPA 4NHSA 1YAMA 4CJ2A 1XEKA 5K7OA 1CNSA 1NKHA 2YVBA 4NWHA 4AXTA 4RW2A 1H6MA 1LSGA 3AZ5A 1NBZC 2C8OA 3WUMA 1LZEA 4TX7A 4DD1A 1YROA 1KXYA 3LZ2A 1GFEA 5ILCA 3A8ZA 3ATNA 1H87A 1GPQC 5KXZA 1B7NA 1LZSA 1GF3A 1EQ5A 3LYTA 1V7TA 1IR9A 1LPIA 3TXHA 1MLCE 4C3WA 4WLTA 4YENA 2HECA 2C8PA 4NGZA 2BQKA 4ETDA 3AZ6A 1I56A 2ZWBA 2LZTA 1DPWA 2HEEA 1JSEA 4OOTA 1QUSA 1G7HC 5DM9A 1UCOA 1FKVA 3J4GA 4OOOA 1LYOA 1VDTA 4YEOA 4H9CA 1JJ1A 4GCBA 1DXJA 1LHJA 1N4FA 3LYZA 1UIAA 5L9JA 4RDSA 5I54A 3KAMA 4XJGA 1AKIA 5I5QA 1NQIA 1OUIA 1DPXA 1KIQC 1VEDA 2BAAA 1QDRA 1LJFA 4L41A 4RLMA 1OUGA 3P66A 3TXKA 1LJGA 1DI4A 4DD0A 1LZTA 4YM8A 4HV1A 1VFBC 3A92A 2DQHY 2B5ZA 5KXRA 1F6SA 1GFKA 3D9AC 4IASA 1YQVY 4II8A 6LYZA 1REMA 1GFGA 1IOCA 1LJKA 2HUBA 4H9EA 1UC0A 2FYCA 4TWSA 3TXGA 5LA8A 3WW5A 1XGRC 5B1FA 1AM7A 4J1BA 5LVHA 4LYCA 4ZEEA 2Y8PA 4WLYA 4H9IA 3CT1A 1IWZA 1T3PA 134LA 2Z38A 1B5WA 1HEPA 2EIZC 2MECA 4P2EA 5IELA 5KXWA 1GFJA 154LA 1EL1A 2N5ZA 4PJ2C 1FN5A 4QGZA 5B05A 2D4IA 1DZBX 1LCNA 4LYOA 1IP1A 1FLWA 1JITA 1GE3A 1HNLA 1LKRA 5IHGA 4HV2A 1HSWA 1NMMA 2Z12A 2BQIA 4AGAA 1YAOA 4B4JA 3WW6A 2DBTA 3A3QA 5LVKA 2PC2A 4G4CA 1ZV5L 4GCEA 1G7MC 1RI8B 1GXV2 3A34A 1B5VA 3A6CY 1A4VA 3EO5A 2YBHA 1JTTL 5KKJA 1OUCA 3G3BB 4U3XB 3AZ4A 1KIRC 1BB7A 3TXDA 1QSAA 2Z18A 2BQAA 2F30A 1DKKA 4HTQA 4BADA 3WU9A 1LJHA 3W6AA 1GF8A 1GBSA 1QUTA 3OJPA 4NGIA 1FDLY 1RFPA 1TDYA 3ATOA 4OWCA 4CGEA 5APCA 1LJEA 4E3UA 3TXEA 4Z3MA 2BLXA 1YKYX 1OUAA 2BQGA 1OUHA 1LZDA 1JKAA 1IVMA 1W6ZA 2DQAA 1OUJA 1HFZA 1YL1X 3ULRA 1LZBA 133LA 1JTOL 1O23A 2ZQ4A 3N9EA 2MEIA 5L3IA 1RE2A 4NGVA 5HLLA 4LT3A 1B7MA 4WM5A 1BB4A 5EBHA 4TSBA 2W1XA 2A7FA 4QEQA 1D0MA 2DKVA 5HMVA 2ZQ3A 1LSZA 4PGJB 1GBYA 1HEMA 2BQMA 1C7PA 1CJ7A 3ZEKA 4DD2A 5LINA 2DQJY 4NGJA 4CHXA 1J1PY 5JENB 1QTKA 2BQOA 4YOPA 3WVXA 1CJ9A 4ETBA 5E9RA 1LSBA 2I25L 3W3EA 1C43A 1GB0A 1HHLA 1WQRA 4XJHA 3P68A 4H93A 1JPOA 2HU3A 1GWDA 1IOQA 4FJRA 3GXRA 4H8XA 1OP9B 2D4KA 1LHKA 4NG8A 1FKQA 1FLYA 4NGYA 4PPOA 1UIBA 1YL0X 4NGKA 5L3HA 1HSXA 5KXMA 4DD7A 2ZIKA 1XGTC 4DWXA 1GAYA 3CB7A 4RLNA 4LZTA 4B0DA 1HC0A 1DKJA 3F6ZA 5F16A 1GDWA 4EMNA 3N9CA 1FLUA 1XEIA 4NFVA 1GFVA 2XBSA 2YBJA 193LA 1LHMA 1LZAA 4Z41A 1D6PA 1LYZA 4GCDA 3W6EA 4BS7A 1GEZA 2LHMA 1VATA 2AUBA 4B49A 1B2KA 1JEFA 1LZ4A 1HF4A 1BVKC 1IORA 5I4WA 3GXKA 2DQCY 2RSCA 4J7VA 4DC4A 4PRQA 4G9SA 4M6DA 4QDNA 2BQDA 1GF9A 3QE8A 2Z39A 4WOAA 2VB1A 3AB6A 3HFMY 1UIHA 1IO5A 4XADA 2IHLA 1F6RA 3P4ZA 1JSFA 4HJZA 2XJWA 5KXNA 2HEAA 1GB2A 1OUFA 1PS5A 5KXLA 4ZFPA 1GE1A 1IP5A 1GFHA 2BQNA 4XJBA 1IP4A 4CFPA 4DD9A 5LA5A 1AT6A 2H5ZA 1QQYA 1IWUA 4Z46A 4IATA 1UACY 4WM6A 2Z37A 1OUBA 1GB8A 2Q0MX 1GB6A 3A91A 5APFA 1EQ4A 4BAPA 1JJ0A 3B6LA 1LHLA 194LA 1CJ8A 2CGIA 3HBDA 3WPLA 3EXDA 1NBYC 4G4BA 4NHQA 5KJ9A 1OUEA 5KXSA 1B7PA 3D3DA 1BB5A 2NWDX 3B0IA 3WXUA 4B4IA 2LYMA 4KPMA 3J6KA 1T6VL 4H8ZA 2HEBA 1GB7A 3W6CA 3TMXA 4H1PA 5M1YA 2EPEA 1QTEA 5AMYA 4ETAA 2CJLA 4HP0A 4WG7A 4LYTA 4O34A 1VDQA 3VWOA 1F10A 5F14A 5LAGA 1HMKA 1ZVHL 3M3UA 3WPKA 4ETCA 1LZRA 5DLAA 1XGPC 4DYGA 4NGOA 1EQEA 5A3EA 3CT0A 1LTMA 1YKZX 2BQFA 4I8SA 4LT1A 4WMGA 3IJVA 5C6LA 1CKFA 4HJVA 3LYMA 2Z2EA 1GF0A 1LMQA 4DDBA 5I4YA 5APDA 1B5YA 3TXFA 4MCKA 4H9HA 4NY5A 1C08C 1WVUA 1IOTA 2CDSA 4WM3A 4LGKA 3A93A 1GXXA 1XEJA 1XFPL 1YIKA 2BQJA 2WARA 4FDYA 4WM1A 1P2CC 1YANA 1MELL 2FBDA 4HPEA 4NGWA 1REXA 1JUGA 1LAAA 3IJUA 4KXIA 4X3BA 4GLVA 2LYZA 1YAQA 2Z19A 1IX0A 2ZNXY 1WQQA 4LYBA 5HNLA 2HEDA 4XJFA 5F81A 5F9UA 2CWIA 1LMTA 4XYYA 3CSRA 4UWVA 2ZNWY 1VAUA 1LMNA 1GD6A 3AGHA 4BAFA 1D0LA 1HEQA 1KIPC 5APEA 4D9ZA 1D9UA 2ZYCA 1IY4A 3WMKA 1LJ3A 208LA 3WUAA 1G7LC 4J0LA 5DL9A 1IP3A 3BKHA 4OWHA 3WULA 4ET9A 1GB3A 1REZA 3A90A 4KT3A 1IC5Y 4H92A 4GCCA 1B9OA 2ZIJA 1NDMC 1VDSA 4NSJA 2H9KA 1NDGC 3WYHA 1GBZA 1B7OA 1GE0A 1RCMA 3TXJA 1IP7A 1LSMA 1LZGA 1LZ9A 2BQBA 1J1OY 1TEWA 5FELA 1KXXA 1LSDA 4PRUA 4WM2A 1B5XA 1YILA 3TXIA 1Z55A 1HERA 1ZMYL 2FYDA 5J7CA 3LZTA 1VDPA 1IOSA 3B0KA 4GN4A 5IDDA 3LN2A 4OWBA 2XBRA 2YBIA 4LYMA 5F9XA 3W6FA 1IWWA 2BQLA 1CKGA 3CT5A 2MEFA 3LYOA 1G7JC 5LVIA 3RNXA 1LSEA 2ZYPA 1OQMA 1GEVA 3A94A 3IWRA 4GN5C 5KXKA 3EBAB 4NSIA 4NG1A 5HQ1A 2A7DA 1LSYA 3QY4A 4H9FA 4WO9A 4XJDA 5KXXA 3CQLA 4HPIA 4LT0A 3A67Y 5LYTA 4R0FA 2F4AA 2MEEA 3AGIA 5C6IA 3AGGG 4HSFA 1UIFA 1B7QA 4LYZA 5DN5A 4WL6A 1NF5A 4MR1A 2DQFC 2H9JA 4UWUA 1V7SA 4TTDA 5B07A 4A7DA 2G4QA 1LJ4A 1G7IC 1HFYA 5FDJA 4EOFA 1JKBA 1YKXX 1PZYA 2F4GA 4WL7A 3RT5X 1GBXA 3W6DA 1BWIA 4N9RA 135LA 1DI3A 1GAZA 1OUDA 4GCFA 1GBWA 2GV0A 5KXYA 3WH1A 3WVYA 1WTMA 4TSCA 1IWYA 2D4JA 5LYMA 1LJJA 4ANRA 3B72A 1GB5A 1B0DA 4NSHA 3TMWA 2YBNA 2G4PA 3HBEX 2MEHA 5HNCA 1HEWA 1SQ2L 1JJ3A 2BPUA 3HBHA 153LA 1GFRA 9LYZA 1QDTA 1WQPA 1FBIX 4XENA 3ZVQB 1ZVYB 2DQIY 5LYZA 1LSAA 5KXPA 1WQOA 5KKIA 3CSZA 4H90A 2IFFY 1LZ8A 3AYQA 1HMLA 2W1YA 2YDGA 4GN3A 4HTKA 3LHMA 1QIOA 3WU7A 1GBOA 5E4PA 3A95A 1JIYA 1TBYA 4H8YA 1A2YC 1CKHA 1DI5A 1GFTA 1BB6A 1GFUA 3WXTA 4WLDA 1LSPA 207LA 1NHEA 4XJIA 5LXWA 4B1AA 4KL7A 4W94A 2EQLA 2HTXA 5B1GA 1IWTA 1WVVA 3A96A 5FHWA 4OWEA 7LYZA 1QSWA 1SLYA 4H94A 4IJ4A 3EMSA 1AT5A 1BVXA 1B7RA 4NHTA 2DQGY 4NSGA 1LMAA 3M18B 1IP2A 2LZ2A 1IEEA 1I1ZA 3OK0A 1HENA 1RJCB 2D91A 1KXWA 4W96A 1IC7Y 1UICA 1IY3A 2W1LA 1BWHA 4DD3A 1LZ1A 3WL2A 1TAYA 1LMPA 1UIGA 3FI7A 4HJYA 1C45A 4G4HA 4B4EA 2YSSC 1IP6A 1LJIA 2F2NA 4NHIA 1LYSA 1ALCA 2FBBA 5LVJA 3RZ4A 3T36A 1HEOA 4DDAA 1GHLA 4GLAA 4OWAA 1REYA 3AZ7A 1UBZA 4R6CA 1LJNA 4NHPA 2I6ZA 3BKVA 1LZNA 4G49A 4N5RA 2HU1A 4XN6A 1UIEA 1XGUC 4YEMA 1LHIA 4LT2A 1LHHA 2DQEY 1IWXA 5ILFA 4ZIXA 1TCYA 4WG1A 2Z2FA 5DN4A 5II3A 4H9BA 6LYTA 1B7SA 2HEFA 3WU8A 5LAFA 1LOZA 4N1EI 1JKCA 2MEDA 1IC4Y 3P64A 1GF7A 3A6BY 4RW1A 1I20A 3AJNA 4N8ZA 3WPJA 5LVGA 4DDCA 1C46A 4WO6A 2DQDY 5I4XA 1JKDA 1B5UA 2MEGA 2YBLA 4ML7A 4TUNA 3ZVQA 3AW7A 3TXBA 1JISA 5D5FA 3P65A 4HTNA 2BQHA 1LZ6A 3T6UA 1UA6Y 2MEAA 3A3RX 4ETEA 5B59A 1FLQA 3RU5A 1CKDA 3RW8A 1LZ5A 1E8LA 1BWJA 1C10A 1GE4A 1UIDA 4DT3A 5LIOA 4YF2A 1GF5A 4WLXA 1WTNA 3MGWA 1AZFA 1JHLA 1D0KA 5FSTA 2MEBA 3K3TA 4OW1A 5B06A 2G4NA 4CFOA 1LSNA 1B5ZA 3N9AA 1NWGA 4UWNA 1LZCA 4M4OA 1HELA 1GDXA 2LYOA 1GF6A 2YBMA 8LYZA 5KY1A 4H9AA 1LZYA 4H91A 1D6QA 4I0CA 132LA 1XGQC 2EKSC 5KXOA 5D5CA 1BGIA 2ZILA 2BQCA 3AW6A 4J1AA 1INUA 1BQLY 5FEKA 3TMVA 3FE0A 2I26L 5I53A 1CJ6A 2XTHA 4QY9A 3E3DA 4C5FA 5A3ZA 1J1XY 3B0OA 2BLYA 1LSCA 1XSFA 1CKCA 1GB9A 1B7LA 4LFPA 4PHIA 1GE2A 1IIZA 3QNGA 3TMUA 5C6JA 5KXTA 1WQNA 1UUZC 1HFXA 1F0WA 1BB3A 2W1MA 1GFAA 3G3AB 4N1CC 1WQMA 2X0AA 1LKSA 1DQJC 1JTPL 3CSQA 3SP3A 1JWRA 1LMOA 1YAPA 4N0JA 1LYYA 4NWEA 4ET8A 1LMCA 1LSFA 4NIJA 4LFXA 1GF4A 1BHZA 2BQEA 3W6BA 4NGLA 1IR8A 3WUNA 4NEBA 5HMJA 2D6BA 4Z98A 1IR7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CJ2A 1CNSA 1H6MA 1C65A 2C8OA 4TX7A 5ILCA 1GPQC 260LA 1EQ5A 3LYTA 1QS9A 1LPIA 3L64A 3TXHA 1L73A 4WLTA 1C6BA 2C8PA 2LZTA 2HEEA 4OOTA 4YEOA 1L02A 4GCBA 1DXJA 1UIAA 1L44A 4XJGA 1P56A 5I5QA 1L71A 2B6TA 4DD0A 1OUGA 1LZTA 3A92A 1C6NA 2B70A 4IASA 3D9AC 3K2RA 2QARC 163LA 6LYZA 1LJKA 1WTHA 157LA 1L28A 5LA8A 5LVHA 4ZEEA 2Y8PA 1L82A 4H9IA 1QT8A 3C83A 134LA 1B5WA 2F47A 1CV5A 168LA 1L20A 5IELA 1EL1A 2N5ZA 4QGZA 5B05A 1L75A 4LYOA 1IP1A 1L50A 2Z12A 4ARJA 5LVKA 2PC2A 1KW5A 1RI8B 3A34A 4EPIA 170LA 198LA 2YBHA 191LA 1L62A 5KKJA 2F32A 4U3XB 213LA 3TXDA 1PQDA 1QSAA 4I7RA 1QT3A 5LZMA 1GBSA 1QUTA 4NGIA 1FDLY 2OE4X 4CGEA 4E3UA 4Z3MA 1K28A 4I7TA 1L22A 143LA 1L30A 1L38A 250LA 1KS3A 4W53A 3N9EA 2NTGA 4LT3A 173LA 4WM5A 4TSBA 3CDQA 2DKVA 4OO9A 2BQMA 2DQJY 2Q9DA 2BQOA 178LA 1L33A 2I25L 1WQRA 1LPYA 4H8XA 2D4KA 4NGYA 1FLYA 1UIBA 1YL0X 1L41A 4DD7A 1C63A 4B0DA 5F16A 3N9CA 1FLUA 1XEIA 1C6GA 4NFVA 123LA 193LA 3HH4A 3HU8A 3HT7A 4GCDA 1LYDA 1HF4A 1IORA 3GXKA 1CUQA 2LCBA 1GF9A 4W55A 1KY1A 3HFMY 3NY8A 1PS5A 4ZFPA 148LE 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1W08 A;  4WM4 A;  5T3F A;  1IWV A;  4MST A;  5FCP A;  4NHS A;  1YAM A;  4CJ2 A;  1XEK A;  5K7O A;  1CNS A;  1NKH A;  2YVB A;  4NWH A;  4AXT A;  4RW2 A;  1H6M A;  1LSG A;  3AZ5 A;  1NBZ C;  2C8O A;  3WUM A;  1LZE A;  4TX7 A;  4DD1 A;  1YRO A;  1KXY A;  3LZ2 A;  1GFE A;  5ILC A;  3A8Z A;  3ATN A;  1H87 A;  1GPQ C;  5KXZ A;  1B7N A;  1LZS A;  1GF3 A;  1EQ5 A;  3LYT A;  1V7T A;  1IR9 A;  1LPI A;  3TXH A;  1MLC E;  4C3W A;  4WLT A;  4YEN A;  2HEC A;  2C8P A;  4NGZ A;  2BQK A;  4ETD A;  3AZ6 A;  1I56 A;  2ZWB A;  2LZT A;  1DPW A;  2HEE A;  1JSE A;  4OOT A;  1QUS A;  1G7H C;  5DM9 A;  1UCO A;  1FKV A;  3J4G A;  4OOO A;  1LYO A;  1VDT A;  4YEO A;  4H9C A;  1JJ1 A;  4GCB A;  1DXJ A;  1LHJ A;  1N4F A;  3LYZ A;  1UIA A;  5L9J A;  4RDS A;  5I54 A;  3KAM A;  4XJG A;  1AKI A;  5I5Q A;  1NQI A;  1OUI A;  1DPX A;  1KIQ C;  1VED A;  2BAA A;  1QDR A;  1LJF A;  4L41 A;  4RLM A;  1OUG A;  3P66 A;  3TXK A;  1LJG A;  1DI4 A;  4DD0 A;  1LZT A;  4YM8 A;  4HV1 A;  1VFB C;  3A92 A;  2DQH Y;  2B5Z A;  5KXR A;  1F6S A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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