1HHLA

The three-dimensional structure of pheasant and guinea-fowl egg lysozymes
Total Genus 49

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNSQATNRNTDGSTDYGVLQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALQSSDITATANCAKKIVSDGDGMNAWVAWRKHCKGTDVRVWIKGCRL

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
EMPTYTI1 (39-42)TI'1 (36-39)3H4 (121-124)AH1 (5-15)TII4 (124-127)O1 (6-127)AH3 (88-100)AH2 (25-36)TII1 (17-20)3H1 (20-22)AH4 (109-115)TI3 (54-57)S1 (43-45)S2 (51-53)TI2 (46-49)TIV1 (66-69)S3 (58-59)TI4 (59-62)TI5 (60-63)TII2 (69-72)TI6 (74-77)S4 (64-65)S5 (78-79)3H2 (80-83)TVIII1 (85-88)3H3 (104-107)TIV2 (101-104)TII3 (115-118)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Numida meleagris
publication title Crystal structures of pheasant and guinea fowl egg-white lysozymes
pubmed rcsb
molecule keywords GUINEA FOWL LYSOZYME
total genus 49
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1993-05-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1hhlA00
1AT6A 1XGUC 1LZRA 4N8ZA 135LA 2DQAA 1C43A 5APEA 2C8OA 1O23A 3WU9A 1AT5A 2EKSC 3TMXA 1IC7Y 1JTPL 2B5ZA 154LA 2G4PA 5KXZA 5ILCA 1LZBA 4OW1A 1GB8A 1HMLA 1JKBA 1HERA 1LKSA 4ANRA 3W6CA 4HJZA 3ZVQB 4LZTA 3A91A 2ZYPA 4LT2A 3N9EA 4H8XA 1EL1A 1OUGA 4WLXA 4HV2A 4H93A 1HSWA 3LZ2A 3CSRA 3ULRA 5LYTA 1NWGA 2Y8PA 2C8PA 5JENB 4ZEEA 5KXTA 1LYSA 4DD9A 132LA 4PJ2C 6LYZA 1QIOA 1LZDA 1EQEA 4UWUA 1LZ4A 1FKVA 2YBNA 5KY1A 4RW2A 5APCA 4NSGA 2A7FA 4G9SA 4D9ZA 1LZ5A 1XEKA 2D6BA 4H91A 1P2CC 1GBSA 3CT0A 1JJ0A 1JKCA 4NHQA 2BQEA 2XBSA 4WG7A 1REZA 1C7PA 4DD1A 5F14A 5L9JA 1F6SA 2I6ZA 4BS7A 5F9XA 4GCEA 1F0WA 1UIAA 2F4GA 1IY3A 4DDBA 1IIZA 3RW8A 1GB0A 1YAOA 2Z2EA 1NKHA 2LYMA 5HNLA 5IELA 4LT3A 5A3EA 1B7PA 4DWXA 1AM7A 1GAZA 5LAGA 1NBYC 2DQEY 1XFPL 3P64A 1LJEA 1N4FA 1XEJA 5D5CA 1LCNA 1IWTA 4II8A 3W3EA 1C08C 1BWHA 1FBIX 2DBTA 2ZNXY 3A3QA 5L3IA 5LVHA 1TDYA 1NQIA 4XADA 5D5FA 4G49A 3AJNA 4WLTA 1LSPA 1PZYA 1UIBA 1CKDA 1OUEA 3TXJA 1JSEA 1CKFA 4KPMA 1LYYA 2BQIA 2BQFA 5KXRA 3WUMA 1EQ4A 1TBYA 2Z18A 3BKVA 1GE1A 3B0OA 4PHIA 2DQGY 1DXJA 1IR9A 1GEZA 1LZNA 4H9BA 1LSCA 4TTDA 1D6PA 4X3BA 3TXDA 5II3A 3T6UA 208LA 1B5UA 1B7LA 1LZYA 3QNGA 2D91A 4ML7A 4ETBA 1KXXA 2Z37A 5M1YA 1REXA 3K3TA 3CT1A 1QUTA 4WM4A 3P65A 5KXPA 1LZEA 3AW6A 4HPIA 4NGVA 4PRUA 2CJLA 4WMGA 5T3FA 1QSWA 3AZ4A 1OP9B 3A92A 1FKQA 1UIDA 2MEIA 1GF5A 5LA5A 3BKHA 1GBZA 3AZ5A 3W6AA 7LYZA 1NMMA 1HENA 1WTNA 1IX0A 2WARA 5LYMA 3WMKA 4R0FA 4H1PA 3A6BY 2W1YA 1T6VL 2ZYCA 3CQLA 4XJBA 1I20A 1IOCA 5AMYA 1VFBC 2HU1A 5DM9A 4BAFA 1QTEA 1GB5A 5DN5A 1HEMA 5IDDA 5I4XA 1GF9A 5DLAA 4KXIA 2EIZC 2GV0A 1UIEA 1WQMA 2RSCA 3AB6A 5J7CA 3EBAB 2LHMA 2MEFA 1OUJA 3AGHA 1LZ9A 4LYCA 4E3UA 1REMA 1GF3A 1IWVA 1B5WA 5LVJA 5KKIA 1IP4A 3T36A 1IWZA 2PC2A 3GXKA 4NGIA 2IFFY 5APDA 3A95A 1DI5A 1J1PY 3LN2A 2FBBA 2Z39A 1FLWA 1WQOA 2W1LA 4WLDA 3OJPA 1LZ6A 1JWRA 4ET8A 1VDQA 1IEEA 193LA 1YL1X 3TXGA 1B7RA 3A94A 5LYZA 1LJFA 3WW6A 2FBDA 1LZ8A 1CJ6A 1OQMA 1GF7A 4NGYA 1CJ8A 4DD7A 1LJKA 3CB7A 4YOPA 4R6CA 5EBHA 2MEHA 4NFVA 4N1CC 1GFVA 4AXTA 3HFMY 4WG1A 5I4WA 1JEFA 1G7LC 4XENA 5DL9A 5B1GA 1LSEA 3FI7A 1LYOA 2D4JA 4ETEA 1LSFA 4W94A 2FYDA 4MCKA 1OUIA 1D0MA 4QY9A 1LMCA 1YL0X 5HNCA 1HF4A 1I56A 1LSBA 3N9AA 4NHPA 3ZEKA 4HV1A 5HMJA 2VB1A 1B7NA 4C3WA 1DKKA 1GE2A 2H9JA 4M4OA 1JJ1A 3CSQA 4HPEA 1B5XA 1VEDA 1YANA 5FDJA 4IASA 2EQLA 1IWWA 2LZ2A 2HEEA 1BB5A 4HJYA 1JUGA 4NWEA 2BQLA 1B5VA 1J1XY 2BQOA 1HHLA 2Z2FA 4NWHA 1GFAA 1IWUA 1GE4A 3A90A 1XSFA 1DKJA 2CWIA 2XBRA 2XJWA 5FELA 4ETAA 5KXNA 2DQFC 4PPOA 4GCFA 1QDRA 1T3PA 1UIHA 2F2NA 1C10A 2LYOA 5KXKA 3WPJA 3W6DA 2BQNA 1Z55A 4TWSA 1QUSA 1V7TA 4XYYA 4OWAA 3TMUA 207LA 1D6QA 3B6LA 3M3UA 1GBWA 4LGKA 4XJDA 4GN3A 1C45A 1GB7A 1B2KA 3EO5A 3QY4A 1FDLY 5F16A 4B0DA 1BQLY 1NHEA 1B5ZA 1G7HC 1YAQA 1IR8A 1EQ5A 2YBLA 4HTNA 1ALCA 1HMKA 4OOOA 1LSZA 3WW5A 1OUBA 5F9UA 4GCCA 2YBMA 1VDTA 3LYOA 5FSTA 3TXEA 4NSJA 1KXWA 4NIJA 1IP5A 2BQJA 2ZILA 1JHLA 5HLLA 3TMVA 3ZVQA 5HMVA 4G4HA 2N5ZA 3SP3A 1WQRA 5FHWA 3A3RX 1GFGA 3HBHA 1IP2A 3D3DA 4LYZA 1JPOA 2ZNWY 4NGKA 1YILA 3A6CY 3A93A 3LHMA 1UC0A 2HEFA 4NHSA 4LT0A 1KIQC 4WM1A 2I26L 1BVKC 1BVXA 1NDGC 3W6BA 1JISA 3WXUA 1LZAA 1UBZA 1D0LA 2MEGA 5E9RA 3WVYA 4G4CA 3WU8A 4ZFPA 194LA 4FDYA 1RI8B 4YEOA 1LSYA 1XGTC 3G3BB 4H9EA 1B7MA 3OK0A 5IHGA 2DKVA 2ZWBA 2YBHA 4YENA 3GXRA 3RNXA 134LA 2BLXA 2D4KA 1OUAA 4CFOA 3P4ZA 4DYGA 1LJ3A 2BQBA 3ATNA 4EMNA 1LJHA 2NWDX 4NSHA 1BB6A 1YIKA 1LTMA 1LJJA 1W08A 2DQDY 4GLVA 1WQQA 4NG8A 2G4QA 1D9UA 4NSIA 4H8YA 4B4JA 4FJRA 4I8SA 1LAAA 4AGAA 2AUBA 2BAAA 4GCDA 5KXYA 5LVKA 1LKRA 5LXWA 3TXBA 4DD0A 4LYBA 4A7DA 4ZIXA 2YDGA 3E3DA 4DDAA 4UWNA 5I54A 3HBEX 1RCMA 4MR1A 1LSDA 2F4AA 1FLQA 4NEBA 4H9FA 4YF2A 1DI4A 1IY4A 1BWJA 1MLCE 1WVVA 2BPUA 5B1FA 4Z46A 2HEBA 4XJFA 4WM3A 4WM2A 4M6DA 1LHIA 2Q0MX 3B0IA 4J0LA 4LT1A 2W1XA 5ILFA 4NG1A 1LSGA 2H9KA 1JJ3A 2ZQ3A 4H94A 3AW7A 1XGQC 1WQPA 1GBOA 1HC0A 4XN6A 2MEAA 3P66A 4B49A 1UUZC 2MEEA 1XGRC 1LMQA 4Z3MA 4P2EA 3A96A 1GD6A 1B5YA 4OOTA 1BB4A 3M18B 4L41A 1BB7A 1GF4A 4IATA 1XEIA 4GN5C 5A3ZA 1J1OY 1F10A 2IHLA 4J1BA 1GDXA 1GF6A 1HEQA 1UIGA 4J1AA 1LOZA 2ZQ4A 1CJ9A 1GE3A 4RW1A 4WM6A 1IP1A 1GFHA 4TSCA 4NGWA 2Z38A 2DQHY 4I0CA 4MSTA 4LFXA 3WUAA 1JKAA 4Z41A 2MEBA 3AYQA 5KXOA 4N5RA 1LHMA 1LMPA 5I4YA 1E8LA 1JTOL 1MELL 1JTTL 1LZCA 4B1AA 1LMAA 3TXKA 1CKCA 1WVUA 1YAPA 2I25L 4EOFA 1KIPC 1IP3A 1SQ2L 1C46A 2HU3A 9LYZA 2XTHA 3AZ7A 3RT5X 2W1MA 4H9AA 4H9CA 3WPKA 4W96A 4CFPA 1INUA 4HP0A 1V7SA 5L3HA 4N1EI 4HTKA 1B0DA 1IR7A 1WTMA 3ATOA 4HTQA 4OWHA 1GWDA 5DN4A 1G7MC 1G7IC 1HEOA 4CJ2A 3VWOA 1GFKA 1UCOA 1JIYA 1LHKA 4LYOA 4BAPA 1VATA 1LJGA 4OWEA 4NGZA 3N9CA 4N0JA 2FYCA 1OUCA 4NY5A 3F6ZA 1B7OA 1LHJA 1UA6Y 4WLYA 4DT3A 1UICA 4ETDA 2X0AA 1ZMYL 1OUHA 1LHHA 1F6RA 3D9AC 1YQVY 5FEKA 4WM5A 4U3XB 1IVMA 4DD3A 3HBDA 1IOQA 3TMWA 4LFPA 4ETCA 1TEWA 1RFPA 3TXIA 4GCBA 1CKGA 2Z12A 4BADA 1GB2A 5C6JA 1DQJC 2YBJA 3A8ZA 4XJIA 3TXFA 2F30A 1YKYX 1B9OA 4XJGA 4H8ZA 1LMTA 1GE0A 1HFYA 3CT5A 3IJUA 4NGOA 5F81A 1I1ZA 4NGLA 3LYMA 1GB3A 1FN5A 5APFA 1GF8A 3W6FA 5B07A 1YKXX 3CSZA 3B72A 1GXV2 1LPIA 4RLMA 1TCYA 1H87A 1OUDA 4KL7A 3AZ6A 5LAFA 5KXXA 2CDSA 3MGWA 1LZSA 1JSFA 1IWYA 3TXHA 1FLUA 4LYMA 5I5QA 1REYA 1HFXA 2ZIKA 3WH1A 1G7JC 1LSMA 1GDWA 3WU7A 1CNSA 1IO5A 1JKDA 1LSNA 4KT3A 5KXMA 4IJ4A 4PRQA 2HECA 2HTXA 4HSFA 3WVXA 4QDNA 1A4VA 1SLYA 2MECA 6LYTA 1HELA 1WQNA 2MEDA 5C6LA 4H9IA 1H6MA 1HSXA 5LINA 1NF5A 1BB3A 1QDTA 1GF0A 2DQJY 1KIRC 3WYHA 1GB6A 4B4EA 4DC4A 1RJCB 4UWVA 1CJ7A 3IWRA 3FE0A 3LYTA 1UACY 4WOAA 1IOTA 3P68A 1XGPC 1AZFA 2HEDA 3WL2A 5FCPA 4G4BA 4O34A 1DPWA 1JITA 1LJ4A 2YBIA 3LYZA 2BQDA 5HQ1A 1A2YC 1IP7A 4NHTA 4CHXA 1NDMC 4HJVA 3LZTA 3AGGG 4C5FA 1LSAA 4OWCA 1IORA 4DD2A 1AKIA 2Z19A 2BQHA 3EXDA 5C6IA 1LJNA 4PGJB 4N9RA 2YVBA 1GHLA 4YEMA 3J4GA 1DPXA 3RZ4A 1HEWA 1ZVHL 1GBXA 4DDCA 1FLYA 1YAMA 1ZV5L 1YROA 153LA 4GN4A 1LMOA 3A34A 3QE8A 1HFZA 3J6KA 2G4NA 1UIFA 4H92A 5E4PA 2A7DA 3KAMA 3B0KA 4GLAA 5LIOA 1GBYA 1VDPA 3AGIA 1GPQC 1D0KA 1OUFA 1GFEA 1IC5Y 2LYZA 4QEQA 5KXLA 2BQAA 1GAYA 1GEVA 3W6EA 2DQIY 1IOSA 1QSAA 2BQMA 2DQCY 4TSBA 5LA8A 1HEPA 8LYZA 4H9HA 1B7QA 1BGIA 1GFRA 1W6ZA 2BQCA 1HNLA 1LZGA 2LZTA 3G3AB 4H90A 5B59A 1KXYA 1NBZC 5KJ9A 3A67Y 1LHLA 4WL7A 1GXXA 4TX7A 4WO6A 4Z98A 2D4IA 1GB9A 2ZIJA 4B4IA 4XJHA 4WL6A 3RU5A 3WXTA 5B05A 4LYTA 4ET9A 4NGJA 1LJIA 4QGZA 4J7VA 2BQKA 1IC4Y 1GFJA 3WULA 5KKJA 1B7SA 1VAUA 1ZVYB 2CGIA 4TUNA 4YM8A 5I53A 5LVIA 1GFUA 2HUBA 1QQYA 2H5ZA 1LYZA 4RLNA 1BWIA 5KXSA 1QTKA 1TAYA 5KXWA 1LZ1A 1DI3A 1LZTA 2HEAA 3IJVA 4OWBA 1BHZA 3EMSA 1GFTA 1LMNA 4WO9A 1CKHA 1DZBX 1RE2A 1YKZX 4NHIA 3WUNA 2BLYA 1IP6A 5B06A 1PS5A 2YSSC 1VDSA 5LVGA 5K7OA 3WPLA 4CGEA 2BQGA 133LA 1IWXA 4RDSA 2EPEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XGUC 240LA 1LZRA 3RUNA 168LA 241LA 1IC7Y 1QT8A 154LA 1LZBA 4OW1A 1HMLA 234LA 3A91A 4ARLA 1L31A 4H8XA 1EL1A 1QT7A 1C6PA 1HSWA 3CSRA 3ULRA 2Y8PA 5JENB 6LYZA 1QIOA 1LZDA 1LYIA 1FKVA 251LA 5APCA 2A7FA 1KNIA 4H91A 1GBSA 3GUIA 2BQEA 1C7PA 4DD1A 5F14A 4GCEA 1F0WA 2F4GA 1IY3A 260LA 1C67A 2Z2EA 5HNLA 4LT3A 1SSWA 1L80A 1AM7A 4W53A 2OE4X 1KY1A 1NBYC 229LA 1LJEA 1OVHA 227LA 1LCNA 112LA 3DN6A 1IWTA 156LA 2ZNXY 5LVHA 1TDYA 4G49A 2B6ZA 1LSPA 1C6MA 162LA 1OUEA 1JSEA 2BQFA 173LA 2Z18A 1GE1A 2L78A 1QTDA 4DQ7A 1LZNA 102LA 2B6YA 1B7LA 1L34A 1KXXA 3DNAA 1P36A 4WM4A 4PRUA 4NGVA 1OP9B 1UIDA 1GF5A 3AZ5A 1L33A 5LYMA 2W1YA 1T6VL 1XEPA 1LYFA 1VFBC 167LA 1L72A 1L56A 5I4XA 2GV0A 1UIEA 3GUMA 3AGHA 1LZ9A 1C6BA 5KKIA 1IP4A 3T36A 3GXKA 2RB0X 262LA 2HUKA 1WQOA 1C6IA 182LA 1C6FA 1VDQA 3UONA 1XJUA 1C62A 3A94A 1LZ8A 4W57A 3CB7A 3NYAA 5EBHA 1KW5A 2MEHA 1GFVA 254LA 4WG1A 120LA 1LYOA 2D4JA 1L29A 1OUIA 1YL0X 1KS3A 1GE2A 1JJ1A 1CU5A 131LA 1B5XA 3C8QA 1G07A 4IAPA 1IWWA 2LZ2A 3C82A 1BB5A 2BQLA 1HHLA 1XSFA 2XBRA 2CWIA 1CU3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1AT6 A;  1XGU C;  1LZR A;  4N8Z A;  135L A;  2DQA A;  1C43 A;  5APE A;  2C8O A;  1O23 A;  3WU9 A;  1AT5 A;  2EKS C;  3TMX A;  1IC7 Y;  1JTP L;  2B5Z A;  154L A;  2G4P A;  5KXZ A;  5ILC A;  1LZB A;  4OW1 A;  1GB8 A;  1HML A;  1JKB A;  1HER A;  1LKS A;  4ANR A;  3W6C A;  4HJZ A;  3ZVQ B;  4LZT A;  3A91 A;  2ZYP A;  4LT2 A;  3N9E A;  4H8X A;  1EL1 A;  1OUG A;  4WLX A;  4HV2 A;  4H93 A;  1HSW A;  3LZ2 A;  3CSR A;  3ULR A;  5LYT A;  1NWG A;  2Y8P A;  2C8P A;  5JEN B;  4ZEE A;  5KXT A;  1LYS A;  4DD9 A;  132L A;  4PJ2 C;  6LYZ A;  1QIO A;  1LZD A;  1EQE A;  4UWU A;  1LZ4 A;  1FKV A;  2YBN A;  5KY1 A;  4RW2 A;  5APC A;  4NSG A;  2A7F A;  4G9S A;  4D9Z A;  1LZ5 A;  1XEK A;  2D6B A;  4H91 A;  1P2C C;  1GBS A;  3CT0 A;  1JJ0 A;  1JKC A;  4NHQ A;  2BQE A;  2XBS A;  4WG7 A;  1REZ A;  1C7P A;  4DD1 A;  5F14 A;  5L9J A;  1F6S A;  2I6Z A;  4BS7 A;  5F9X A;  4GCE A;  1F0W A;  1UIA A;  2F4G A;  1IY3 A;  4DDB A;  1IIZ A;  3RW8 A;  1GB0 A;  1YAO A;  2Z2E A;  1NKH A;  2LYM A;  5HNL A;  5IEL A;  4LT3 A;  5A3E A; 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 4N9R A;  2YVB A;  1GHL A;  4YEM A;  3J4G A;  1DPX A;  3RZ4 A;  1HEW A;  1ZVH L;  1GBX A;  4DDC A;  1FLY A;  1YAM A;  1ZV5 L;  1YRO A;  153L A;  4GN4 A;  1LMO A;  3A34 A;  3QE8 A;  1HFZ A;  3J6K A;  2G4N A;  1UIF A;  4H92 A;  5E4P A;  2A7D A;  3KAM A;  3B0K A;  4GLA A;  5LIO A;  1GBY A;  1VDP A;  3AGI A;  1GPQ C;  1D0K A;  1OUF A;  1GFE A;  1IC5 Y;  2LYZ A;  4QEQ A;  5KXL A;  2BQA A;  1GAY A;  1GEV A;  3W6E A;  2DQI Y;  1IOS A;  1QSA A;  2BQM A;  2DQC Y;  4TSB A;  5LA8 A;  1HEP A;  8LYZ A;  4H9H A;  1B7Q A;  1BGI A;  1GFR A;  1W6Z A;  2BQC A;  1HNL A;  1LZG A;  2LZT A;  3G3A B;  4H90 A;  5B59 A;  1KXY A;  1NBZ C;  5KJ9 A;  3A67 Y;  1LHL A;  4WL7 A;  1GXX A;  4TX7 A;  4WO6 A;  4Z98 A;  2D4I A;  1GB9 A;  2ZIJ A;  4B4I A;  4XJH A;  4WL6 A;  3RU5 A;  3WXT A;  5B05 A;  4LYT A;  4ET9 A;  4NGJ A;  1LJI A;  4QGZ A;  4J7V A;  2BQK A;  1IC4 Y;  1GFJ A;  3WUL A;  5KKJ A;  1B7S A;  1VAU A;  1ZVY B;  2CGI A;  4TUN A;  4YM8 A;  5I53 A;  5LVI A;  1GFU A;  2HUB A;  1QQY A;  2H5Z A;  1LYZ A;  4RLN A;  1BWI A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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