1HSWA

Lysozyme (mucopeptide n-acetylmuramyl hydrolase)
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of orthorhombic lysozyme grown at basic pH and its low-humidity variant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
molecule tags Hydrolase
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1998-06-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1hswA00
2CJLA 2XJWA 1HEMA 1UIHA 4TUNA 4WM2A 1LHHA 2DQHY 4LFXA 4WO6A 2A7DA 5II3A 3TXBA 5F9UA 5HNCA 1WQPA 1DZBX 2BQNA 1UIBA 1XGQC 2EIZC 3QNGA 134LA 5KXPA 3TMUA 4G4HA 5KJ9A 4ML7A 3G3AB 1H6MA 1LYSA 1H87A 1LTMA 3BKHA 5KXRA 2AUBA 1UACY 2BQEA 4NGZA 1UUZC 2W1YA 3AZ5A 3K3TA 2X0AA 2EPEA 1Z55A 4HJYA 5B06A 1XFPL 4CJ2A 1TDYA 5LVGA 4HPIA 2HEBA 3CSQA 4XENA 3J4GA 3A6BY 2HEEA 4BS7A 4DD0A 3W6AA 1LZAA 5KXZA 4DT3A 1RCMA 5C6JA 1OUEA 1GDWA 1J1OY 1QTKA 4NGWA 1YAMA 3WXUA 1B7QA 5KXLA 1LZNA 1OUHA 1B9OA 4LT1A 1LSYA 1TAYA 1B5UA 1HMLA 1GE1A 1N4FA 3WPKA 3N9CA 1IORA 2BQLA 5FHWA 4TX7A 1HFZA 3W3EA 5A3ZA 1LSCA 2ZIKA 1VDQA 3P68A 4NHIA 4H9AA 2YBHA 1LHJA 1GE2A 4QEQA 3CSZA 4I0CA 1LZSA 1REYA 4ETCA 1HERA 3EXDA 1ZMYL 2D4JA 1DQJC 4OOTA 2BPUA 4ZIXA 4GCFA 1LYZA 1HEQA 1INUA 5LYZA 1BWHA 4NHPA 1JISA 3VWOA 1A4VA 1CKFA 1IOCA 1JKBA 1LYYA 5APEA 1WQQA 1WQRA 1I1ZA 2MEAA 2Q0MX 4H9BA 3AZ6A 1GB2A 3LN2A 1VDPA 1JPOA 3RT5X 2BQBA 1OUCA 1GBWA 5B1FA 4NGOA 1NHEA 2MECA 4WLXA 5LIOA 5E9RA 4N5RA 1MLCE 4PJ2C 2ZNWY 5FDJA 4GLVA 4YEMA 1DKJA 5EBHA 5I4YA 1GB6A 1IP2A 1GBXA 2LZ2A 1GF0A 1QDTA 4DDBA 1YAOA 5LAGA 1V7TA 1IC4Y 4H91A 208LA 1LSPA 1JWRA 3WPJA 4NEBA 3A94A 3P66A 1YILA 5IDDA 4Z98A 1GB7A 4RW2A 5LVIA 2D4KA 4DWXA 1GPQC 1MELL 4DD2A 2DQFC 1IO5A 4RDSA 3W6FA 1IC5Y 1XGUC 2HU3A 1ZVYB 3TXKA 1GFRA 1F10A 4WG1A 4H9FA 4TSCA 1IWZA 1GF4A 1LZ4A 1YL0X 3SP3A 4YF2A 1E8LA 4NGIA 7LYZA 5C6IA 2YSSC 3CB7A 1NDMC 4O34A 5I53A 1KXXA 1GFUA 4NIJA 5FEKA 5I4WA 3AW6A 2YVBA 5AMYA 1GB5A 1FN5A 3AYQA 1TCYA 3A96A 4YM8A 2F4GA 5APFA 2ZWBA 1AM7A 1LSBA 2FYCA 2MEEA 3FE0A 5APCA 154LA 1RE2A 1LPIA 1B7SA 1C45A 5LXWA 2XBSA 1D6QA 1B7NA 2ZQ3A 4B1AA 1LSZA 5I54A 1GDXA 3WXTA 1JKDA 4WM1A 4ANRA 1IWXA 1LJ4A 4ETEA 4PRQA 3T36A 1OUIA 2EQLA 1JHLA 1GF8A 1KXWA 4LYCA 2BQOA 1LZTA 1CKHA 3KAMA 4NSHA 1OUDA 3ZVQB 4J1BA 1JEFA 4ZFPA 1GB8A 2XTHA 2CDSA 3N9AA 1NBZC 5KXTA 2IHLA 1HELA 4XADA 1JTTL 4H8XA 3D3DA 1GB3A 1IIZA 1FLQA 1IP7A 1G7JC 1IP5A 1IP3A 1LJ3A 2BQDA 4OOOA 5L3HA 1IOTA 1GB0A 1SQ2L 2H5ZA 5KXOA 4H90A 4P2EA 1UIDA 1JKCA 5FELA 2D4IA 1IP1A 1C43A 2F30A 1YIKA 3MGWA 2H9JA 1UICA 4GCDA 3HBDA 1GHLA 1WTMA 1B7PA 1BVXA 4W94A 5LINA 2YBMA 1HSXA 1CJ8A 1ALCA 2HEAA 4XJFA 4ETDA 3ZEKA 1AT6A 1REXA 3ATNA 3WU9A 2ZQ4A 2VB1A 1OUAA 3AW7A 1GXV2 1A2YC 1WVUA 2I26L 1FKQA 4EMNA 4G49A 1HENA 2MEDA 1HEWA 1IWWA 1GE3A 1C46A 4Z3MA 5F81A 1IWVA 4IASA 1HFXA 6LYZA 5J7CA 5HLLA 1UIGA 2MEFA 1LSEA 1IWUA 4IJ4A 1LCNA 4C5FA 4N8ZA 2BQGA 4L41A 5LVKA 1XEKA 3AGIA 1IR9A 1JJ0A 3LHMA 1LZ8A 5L9JA 1OQMA 5F14A 4XJGA 132LA 1IOQA 1QUSA 1QSAA 4GN4A 1REZA 193LA 2HU1A 4RLNA 2FBDA 3A3RX 4NG1A 2BQFA 4LT3A 1GF5A 4WOAA 1UIAA 5LAFA 4PGJB 3TXJA 3HBEX 2WARA 4GN3A 3TMWA 1YKZX 1WQMA 1XGPC 2DQJY 1KXYA 1LSDA 4IATA 3CT5A 1UIFA 1LKSA 1XEIA 2HEDA 4KL7A 4WLTA 4NG8A 1LJHA 4H93A 4M6DA 3LZ2A 2ZYCA 4B0DA 3P4ZA 4NGVA 2F2NA 1OUBA 1EQ4A 1T3PA 4HTNA 2D6BA 1B5XA 1BWJA 2BLYA 4A7DA 2HEFA 1XGRC 2YBIA 3W6CA 1GFVA 1LZCA 1YL1X 1C10A 1HEPA 1OUGA 4KT3A 1NMMA 1D0KA 1HHLA 1DI3A 1LZEA 1HSWA 1WQNA 4WLYA 3AGGG 1BB6A 1NQIA 207LA 2Z12A 1CNSA 1LMNA 5HMJA 5IHGA 1I20A 1CKGA 4HV2A 2W1MA 3LYOA 1FLUA 5KXYA 1GF7A 1VDTA 1V7SA 4ETAA 4RW1A 4XYYA 3HBHA 5C6LA 1TEWA 3WYHA 1LZGA 1GD6A 1UCOA 1CKCA 1VEDA 4NGLA 5I5QA 3EBAB 5B07A 2ZYPA 1NKHA 2I25L 1G7HC 1QDRA 3AGHA 4GCBA 4WM4A 3W6BA 4BADA 1JTPL 4LYBA 1BWIA 1GBYA 1YANA 1ZV5L 2G4NA 3WUNA 4NHSA 3WUMA 1LJKA 3W6EA 1CKDA 2EKSC 1CJ9A 2YBJA 3EO5A 1XEJA 3P65A 4WL6A 2W1LA 5KXMA 2N5ZA 4MR1A 3LYMA 1BVKC 3AJNA 1FKVA 4W96A 2DQIY 1IX0A 1GE4A 3A92A 2HTXA 4HJVA 4QDNA 1LZRA 1B0DA 4RLMA 1IVMA 1DI5A 1IWTA 2MEHA 4N9RA 5DLAA 2YBLA 1QUTA 2ZNXY 4X3BA 3ATOA 4G4BA 4GCEA 4MCKA 4XJHA 4E3UA 3GXRA 3AB6A 1G7MC 3WW6A 1DPWA 2Z2FA 4WMGA 3E3DA 5M1YA 2MEBA 4UWUA 2LYZA 2HUBA 2RSCA 3P64A 1LZ6A 3AZ4A 2G4PA 2BQKA 2CGIA 3M18B 2DQEY 3QY4A 4I8SA 4HP0A 4NWHA 4TSBA 4B49A 1KIQC 1IY4A 1AZFA 1YAQA 2G4QA 1GWDA 1LZ9A 3WULA 3IWRA 4XJBA 4H9HA 4LT0A 4QY9A 5A3EA 2DQCY 4OWEA 3RNXA 1UBZA 1QQYA 133LA 1GBOA 3CQLA 1B5WA 1B7RA 4NFVA 1FDLY 1TBYA 2BQJA 1F6RA 1G7IC 1HFYA 1GB9A 4J0LA 4G4CA 1LMOA 2XBRA 5I4XA 1AT5A 2H9KA 1NBYC 1XGTC 3A3QA 5DM9A 1GBZA 2GV0A 2ZIJA 3TMXA 3RW8A 1D0LA 1LHKA 3QE8A 1LSNA 2Z37A 3GXKA 4C3WA 1SLYA 3CT1A 4WL7A 1B5YA 4HJZA 2MEIA 4AXTA 5B05A 1EL1A 3AZ7A 5ILCA 3B6LA 3T6UA 1HF4A 4N0JA 4PPOA 4QGZA 3TXIA 3WU7A 1WVVA 4H8YA 4BAPA 4N1EI 3WL2A 2LYOA 1JUGA 1GF9A 3LYTA 1EQ5A 1LMPA 5DL9A 3WMKA 4OWAA 4WM3A 1JKAA 4NSJA 1JJ1A 3OJPA 1PS5A 4BAFA 135LA 1LMTA 1LZ5A 3ULRA 5KXNA 2BQHA 4NWEA 4H9IA 4HTKA 4YENA 2Z19A 1I56A 2A7FA 5E4PA 5LYMA 4M4OA 4OWBA 1QSWA 4WG7A 4CGEA 2W1XA 1LMQA 4B4EA 1LMAA 4G9SA 4R6CA 1T6VL 1LYOA 194LA 1GE0A 1IP4A 2Y8PA 3TXDA 3WUAA 5KXKA 1O23A 1IP6A 1REMA 1ZVHL 2BQIA 5L3IA 1LHLA 3G3BB 4GCCA 8LYZA 3CT0A 1GEVA 1IR7A 3A90A 1DI4A 4LZTA 4XJDA 4UWVA 1GFHA 3A95A 3FI7A 4R0FA 4TWSA 1J1XY 1CJ7A 1YKYX 1B5VA 4NGKA 4H92A 3RU5A 4CHXA 4LT2A 5DN5A 5B59A 4ZEEA 3IJVA 3A8ZA 4J7VA 1GF3A 1IC7Y 4ET8A 1LZDA 1IEEA 3TXHA 4H94A 4DYGA 4HV1A 4CFPA 2F4AA 4KPMA 1LMCA 4HTQA 4NHTA 1LJGA 1FLYA 5D5CA 3RZ4A 1LHIA 1GBSA 1QTEA 1LJEA 4DC4A 3M3UA 2Z18A 1LOZA 2LZTA 1JJ3A 1IR8A 3A67Y 4HSFA 4WLDA 1HC0A 1BB3A 1UC0A 4WM6A 4H8ZA 1VATA 4B4JA 3A93A 4GN5C 1LKRA 3HFMY 2YBNA 1JSEA 1JIYA 1LJIA 3D9AC 5HMVA 1LZYA 1VFBC 2YDGA 1GFKA 1W08A 2LYMA 1LSGA 1JTOL 1B2KA 2NWDX 1YROA 3IJUA 1LJNA 4OW1A 2ZILA 2Z38A 4DD1A 2Z2EA 1C7PA 4II8A 2DQDY 5DN4A 4NSIA 1DXJA 1J1PY 1YAPA 5IELA 3TMVA 1NWGA 4KXIA 5F16A 1D6PA 2DBTA 4D9ZA 3B0KA 1GAZA 1LSAA 1UA6Y 1BQLY 2BLXA 2FBBA 1LSMA 1D0MA 1XSFA 2LHMA 4H9CA 4Z41A 1GFEA 2BQMA 4CFOA 3B0IA 3WVXA 1W6ZA 4XJIA 5LA8A 4DDCA 1IY3A 4LFPA 1GFGA 2DQAA 4LYOA 4NHQA 1GXXA 1GFAA 1C08C 4B4IA 3WW5A 4ETBA 4OWHA 1HMKA 1DKKA 1VAUA 1GEZA 2DKVA 1PZYA 4NGJA 1B7MA 1FLWA 4U3XB 4YOPA 5HNLA 4DD7A 5KKIA 4ET9A 3WH1A 4LYZA 4HPEA 5LYTA 1D9UA 1F6SA 1CJ6A 2B5ZA 1P2CC 4DD9A 5LA5A 4DD3A 5KXWA 1WQOA 153LA 1BB7A 1RFPA 3A34A 4N1CC 2HECA 5B1GA 6LYTA 1LZBA 4H1PA 5FSTA 3OK0A 4NGYA 4FDYA 4NY5A 3F6ZA 4H9EA 1BB5A 2C8PA 3J6KA 3LYZA 4J1AA 3CSRA 5JENB 1B7OA 1FBIX 1RI8B 5D5FA 5KXSA 1IWYA 1GFJA 1NDGC 2CWIA 4YEOA 3WPLA 4LGKA 2FYDA 4EOFA 1DPXA 1LJFA 1AKIA 5HQ1A 4MSTA 1RJCB 2BQCA 1G7LC 1YKXX 1KIPC 2Z39A 2MEGA 1LZ1A 2I6ZA 5ILFA 1UIEA 1OUFA 1NF5A 3B72A 4NSGA 3A91A 4FJRA 4Z46A 5KKJA 4PRUA 1LHMA 5K7OA 3WVYA 3TXGA 3EMSA 4PHIA 1IOSA 5APDA 5LVHA 1F0WA 3N9EA 4OWCA 3BKVA 1BB4A 4WO9A 4WM5A 1BHZA 1QIOA 4TTDA 3ZVQA 2C8OA 1KIRC 4LYTA 5F9XA 9LYZA 4DDAA 1HEOA 2DQGY 4AGAA 3B0OA 2BQAA 3W6DA 1OUJA 2PC2A 2D91A 1BGIA 1WTNA 2BAAA 1B5ZA 4XN6A 1VDSA 5KY1A 4GLAA 1JSFA 3WU8A 5T3FA 4LYMA 3TXEA 1HNLA 5KXXA 3A6CY 4UWNA 1LAAA 5LVJA 1EQEA 1GFTA 1LJJA 1YQVY 5FCPA 3TXFA 1B7LA 1GAYA 1LSFA 1GF6A 1OP9B 2IFFY 3LZTA 1JITA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2CJLA 2XJWA 1HEMA 242LA 2A7DA 5F9UA 1L28A 2BQNA 1KS3A 1XGQC 5KXPA 5KJ9A 4G4HA 1P37A 172LA 3G3AB 5KXRA 1UACY 2BQEA 4NGZA 3K3TA 1SWZA 1OWZA 1TDYA 4XENA 1L58A 2HEEA 4BS7A 1RCMA 198LA 3WXUA 1LZNA 1XJTA 1TAYA 1N4FA 1GE1A 1C6EA 4TX7A 5A3ZA 1PQKA 3P68A 1L18A 145LA 4EXMA 1DYBA 2BPUA 1LGWA 1INUA 4NHPA 1JISA 1IOCA 123LA 5APEA 1L32A 4ARLA 4H9BA 4ARJA 1L07A 3C82A 1L88A 2ANVA 1GBWA 1L89A 1GB6A 1GBXA 1GF0A 4I7KA 4GRVA 208LA 3WPJA 3A94A 3P66A 1YILA 4Z98A 3D4SA 4RW2A 5LVIA 4DWXA 3K2RA 4RDSA 4W58A 1ZVYB 3DN8A 1L16A 4WG1A 226LA 4NGIA 1KXXA 1FN5A 3AYQA 1AM7A 4W54A 3FE0A 1C45A 4DKLA 1I6SA 1B7NA 4B1AA 1IWXA 3RUNA 3HTBA 1CKHA 2OE7X 2RBPA 2CDSA 1QSBA 1GB3A 1IP5A 5KXOA 1JKCA 1LWGA 2D4IA 1C43A 2H9JA 4GCDA 1GHLA 1LLHA 1HSXA 2HEAA 1REXA 2ZQ4A 2VB1A 1K28A 3OE0A 1HENA 1P2RA 3DN6A 1C46A 171LA 221LA 1UIGA 4C5FA 1CV4A 5LVKA 3AGIA 1L01A 140LA 1CU5A 3LHMA 5L9JA 1P46A 1QUSA 1QSAA 2HU1A 158LA 2FBDA 1GF5A 1JTMA 3L64A 1L91A 1WQMA 213LA 2DQJY 4LDLA 4I7PA 1L33A 234LA 1C6LA 2ZYCA 1CX7A 2F2NA 3JR6A 4I7SA 4A7DA 1D2WA 1L15A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2CJL A;  2XJW A;  1HEM A;  1UIH A;  4TUN A;  4WM2 A;  1LHH A;  2DQH Y;  4LFX A;  4WO6 A;  2A7D A;  5II3 A;  3TXB A;  5F9U A;  5HNC A;  1WQP A;  1DZB X;  2BQN A;  1UIB A;  1XGQ C;  2EIZ C;  3QNG A;  134L A;  5KXP A;  3TMU A;  4G4H A;  5KJ9 A;  4ML7 A;  3G3A B;  1H6M A;  1LYS A;  1H87 A;  1LTM A;  3BKH A;  5KXR A;  2AUB A;  1UAC Y;  2BQE A;  4NGZ A;  1UUZ C;  2W1Y A;  3AZ5 A;  3K3T A;  2X0A A;  2EPE A;  1Z55 A;  4HJY A;  5B06 A;  1XFP L;  4CJ2 A;  1TDY A;  5LVG A;  4HPI A;  2HEB A;  3CSQ A;  4XEN A;  3J4G A;  3A6B Y;  2HEE A;  4BS7 A;  4DD0 A;  3W6A A;  1LZA A;  5KXZ A;  4DT3 A;  1RCM A;  5C6J A;  1OUE A;  1GDW A;  1J1O Y;  1QTK A;  4NGW A;  1YAM A;  3WXU A;  1B7Q A;  5KXL A;  1LZN A;  1OUH A;  1B9O A;  4LT1 A;  1LSY A;  1TAY A;  1B5U A;  1HML A;  1GE1 A;  1N4F A;  3WPK A;  3N9C A;  1IOR A;  2BQL A;  5FHW A;  4TX7 A;  1HFZ A;  3W3E A;  5A3Z A;  1LSC A;  2ZIK A;  1VDQ A;  3P68 A;  4NHI A;  4H9A A;  2YBH A;  1LHJ A;  1GE2 A;  4QEQ A;  3CSZ A;  4I0C A;  1LZS A;  1REY A;  4ETC A;  1HER A;  3EXD A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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