1HSWA

Lysozyme (mucopeptide n-acetylmuramyl hydrolase)
Total Genus 48

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTI1 (39-42)TI'2 (36-39)3H2 (120-123)AH1 (5-15)TII5 (124-127)TII1 (17-20)O1 (6-127)AH2 (25-36)TII2 (19-22)TI'1 (20-23)AH3 (88-101)TII'1 (103-106)TI3 (54-57)TVIII1 (85-88)S1 (43-45)TI2 (46-49)S2 (51-53)S3 (58-59)TI4 (59-62)TI7 (105-108)TI5 (60-63)TI6 (74-77)S4 (64-65)TII3 (69-72)TIV1 (66-69)S5 (78-79)3H1 (80-83)AH4 (109-115)TII4 (115-118)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
publication title Structures of orthorhombic lysozyme grown at basic pH and its low-humidity variant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1998-06-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1hswA00
2BAAA 2YBIA 1VFBC 2YBNA 5F9UA 1W08A 4B4EA 1XEKA 4B4IA 1LZBA 1LSNA 1TEWA 1GFVA 5HNLA 1YQVY 153LA 4H9BA 1B5VA 1ZMYL 4H9EA 4O34A 1GEVA 1WQNA 3WUMA 1GF9A 2FYDA 4H1PA 2Y8PA 1LJKA 1GB0A 1V7TA 1JKBA 2XJWA 3D9AC 1RE2A 1YILA 3A94A 4HPIA 1DI4A 4ETDA 3SP3A 4OWAA 1IEEA 4LYBA 2Z2FA 1LZAA 4RLNA 2ZQ4A 4BAPA 1LJFA 1IY3A 4DYGA 1VDTA 1GB8A 1TAYA 2BQNA 4NGZA 4HTKA 5KXXA 1AM7A 1LHKA 1LSBA 3WPKA 4OWEA 5J7CA 1XGQC 1LSDA 1RFPA 4QDNA 2BLXA 5LVJA 2DQAA 1VAUA 1LCNA 4H92A 1LMCA 5KXMA 1IP2A 1LKRA 4A7DA 1LJIA 3M3UA 1IWTA 4Z3MA 1KIQC 3AYQA 3A34A 1IP4A 4OWHA 4U3XB 1ALCA 1LZDA 1BGIA 5L3HA 5ILFA 3T6UA 1LHHA 4WO6A 3W6CA 1GF6A 5IDDA 4NHIA 2IHLA 1LZNA 2BLYA 1B7SA 1UC0A 2ZYPA 1N4FA 2BQMA 4GCCA 4XJGA 2BQHA 2C8OA 2HTXA 5LVIA 4B1AA 3CSQA 3B0OA 1GDWA 2MECA 1B5WA 1IC4Y 1LJHA 3HBDA 3QY4A 1LMAA 1LSAA 4G4HA 5FEKA 5C6IA 4AXTA 1OUHA 1UIGA 4DD1A 1LZ8A 1RI8B 1C43A 4NFVA 1EL1A 4LZTA 1GFHA 4NGOA 3J4GA 1UIEA 1QQYA 1B7PA 4HPEA 2Q0MX 4OWBA 1GB3A 1C10A 1BWHA 208LA 4H9AA 3TXJA 4Z46A 1IC7Y 2I26L 3A3RX 3BKHA 4LFXA 1IOQA 4N9RA 1GAZA 3OJPA 3ZVQB 1IP7A 2IFFY 3KAMA 1DZBX 2LZTA 3G3BB 4H8ZA 1B7NA 1NBYC 2YBMA 4LT3A 2HEDA 1C46A 4PJ2C 2F30A 2XTHA 1QDTA 5A3EA 2HEBA 1GB6A 3TMUA 3E3DA 4GN4A 4TTDA 1GFGA 4X3BA 5LAFA 2W1XA 1LZ4A 3AZ7A 1KIPC 1QUSA 4LT2A 1UA6Y 4XJFA 4G4CA 1JJ1A 1GE4A 1WVVA 1YAOA 1BWIA 1MELL 2BQKA 2MEGA 2YBHA 2Z19A 3CT1A 4DT3A 1DPWA 4MCKA 5C6LA 4G9SA 1HNLA 1WTNA 4L41A 1LZSA 1UICA 1C45A 4H94A 1H6MA 4TUNA 4XJHA 5KXWA 1HFZA 2MEHA 2MEEA 1LJ4A 1LSGA 2G4QA 7LYZA 1HELA 1WTMA 3P66A 3FE0A 4OWCA 4HSFA 2ZIJA 5I4WA 4B49A 1HMLA 4DDBA 2C8PA 3J6KA 1GFRA 5F16A 4B4JA 4KT3A 4WMGA 4N8ZA 1LJGA 1EQ4A 5II3A 4NHQA 1ZVYB 3TXBA 4BAFA 1FKVA 3EMSA 1LZGA 1FLUA 1YAMA 2BQAA 1OP9B 4NSGA 4KPMA 5APEA 3RZ4A 5APFA 5LAGA 5T3FA 2MEIA 1P2CC 4M4OA 1LAAA 193LA 3D3DA 3TXEA 1GE3A 2Z38A 5LINA 1GAYA 1IY4A 1WVUA 4WL6A 1YKZX 4PRUA 2BPUA 1YKYX 1DXJA 4NGKA 8LYZA 3WVXA 5ILCA 2DQEY 1UUZC 2ZNXY 1FLYA 4YOPA 2MEAA 1O23A 3W6EA 1PZYA 2MEDA 4DD0A 4NWEA 4PHIA 2XBRA 4GCBA 4YENA 1QIOA 2D4IA 3EO5A 3TXFA 3ULRA 5KXRA 9LYZA 2BQEA 1FBIX 3ZVQA 1GF0A 3GXKA 4PGJB 3AZ4A 4HJZA 4WO9A 3A93A 4J1BA 4NWHA 4HV1A 3IWRA 4LYCA 2HEEA 5LA5A 1CJ6A 1CJ9A 1HFYA 1GEZA 1DQJC 1LZ1A 1QTEA 2Z37A 4HTQA 5FELA 5FHWA 1JTPL 2F4AA 1B5XA 3W6BA 1GE1A 2F2NA 4E3UA 4XADA 1CKFA 2BQCA 4N1EI 1GFEA 1IP5A 1XGPC 3QNGA 1GFAA 1IOTA 1G7IC 4LGKA 4WM1A 3LYZA 4RW2A 4M6DA 5HMJA 5AMYA 4MSTA 4GCDA 2ZNWY 3WW5A 3W6DA 4N5RA 2DBTA 4IJ4A 3TXDA 1DI5A 2H5ZA 1GDXA 3B72A 4NIJA 4UWVA 4ML7A 5I5QA 1A4VA 1NBZC 4NG1A 1JTTL 2DKVA 1HSXA 2G4PA 1LZ6A 1CKDA 4NEBA 3WU9A 1HEMA 1HENA 4NGIA 2BQIA 4PRQA 2LYZA 4KXIA 4NY5A 5FSTA 2DQIY 4NSIA 1LMOA 3LZ2A 4II8A 2HEFA 2W1LA 3G3AB 4ETBA 1GBXA 4XYYA 2FYCA 1W6ZA 5FCPA 1CJ7A 1MLCE 2ZIKA 4J7VA 5KXLA 1A2YC 1GB9A 1GHLA 4WLTA 5LVGA 5APDA 4DDAA 1AT6A 4BS7A 1WQRA 1G7LC 2Z39A 4H91A 2B5ZA 5APCA 1CNSA 1UIFA 3K3TA 1D0LA 2LYMA 1IP6A 4WL7A 3OK0A 4NHPA 1NQIA 1IO5A 4RW1A 4Z41A 1IP3A 2F4GA 1GE0A 3ATNA 1JWRA 1TCYA 1KIRC 2DQHY 3HBEX 2AUBA 4WM3A 1FLWA 3WXUA 1IWZA 5I53A 2DQDY 1YKXX 4XENA 3W3EA 1LSEA 2CGIA 1IP1A 1HEWA 4XJBA 4J1AA 2WARA 1CJ8A 1D0KA 1SQ2L 1VDQA 4DWXA 4RDSA 1GD6A 3A8ZA 1H87A 1B5UA 1IWWA 1TDYA 2PC2A 5LA8A 1IOCA 4H9IA 3AGHA 4CHXA 2X0AA 4R6CA 2YSSC 1G7MC 2I6ZA 1BB7A 2BQGA 2XBSA 4DD3A 1V7SA 2H9JA 5FDJA 1VDPA 1WQOA 4G49A 5LXWA 1GFTA 5KXOA 3TMVA 5LYTA 5KXNA 1GB5A 3WMKA 5E4PA 1GBZA 4IASA 3A96A 4NGVA 4H8YA 2DQFC 4WG1A 5B1GA 2HECA 1I56A 1GB7A 1GB2A 2W1YA 4GN5C 2D6BA 3RNXA 2HU1A 1J1PY 1F6RA 3AJNA 1GF5A 1LHMA 1XSFA 1E8LA 5HQ1A 4H8XA 1NMMA 6LYTA 1DKJA 4TSCA 5LYMA 5B06A 1D0MA 6LYZA 3AZ5A 1LTMA 1CKCA 3TMWA 1EQ5A 1LJEA 1GBYA 1LSPA 1B5YA 1WQMA 3CQLA 3W6AA 4D9ZA 4LYMA 5I54A 1LZTA 5DL9A 3A90A 2LYOA 1D6QA 1BWJA 4J0LA 1UACY 4ETEA 4OOTA 5DLAA 1LSFA 3B0KA 1IORA 1I20A 2BQOA 1BHZA 1UIBA 4GN3A 1YAPA 5DN5A 4ANRA 1REZA 1G7HC 1IWXA 4PPOA 2BQLA 1I1ZA 3AW6A 1JITA 3HFMY 4HP0A 4NHTA 1OUBA 1AZFA 2CWIA 4WLDA 3WL2A 4ZIXA 1VATA 1LSZA 1HSWA 1YL1X 5I4YA 1FKQA 2YVBA 1YANA 4FJRA 1REMA 3LZTA 4TSBA 1YL0X 1HHLA 1C08C 2RSCA 1LOZA 1NHEA 4YEOA 1B0DA 1IVMA 4N0JA 2EPEA 1B9OA 5DN4A 1B7QA 3WXTA 5KXYA 2EQLA 4EMNA 1INUA 1LSMA 2Z12A 4LFPA 4NGYA 1KXWA 2D4KA 4ZEEA 4N1CC 1JKDA 3B6LA 1AT5A 1J1XY 1ZVHL 4EOFA 1LMPA 1LZ9A 2EKSC 2MEFA 1LPIA 3LHMA 154LA 2N5ZA 5DM9A 1F10A 3A67Y 4P2EA 3P65A 4FDYA 1GFUA 5IHGA 1GPQC 4CFOA 3HBHA 1UIAA 2ZYCA 2ZILA 1T6VL 5KXPA 4WM4A 1GFKA 1GF4A 5D5FA 1LHIA 4MR1A 4WM6A 1LZRA 1IWVA 1GFJA 1JSFA 1YROA 1UIDA 1UIHA 2HUBA 4ET9A 2A7FA 5B1FA 1XGUC 3P68A 3LYTA 1B5ZA 3WPLA 4H9FA 3RU5A 1LKSA 1JEFA 1OUAA 1HEOA 1LJ3A 3TXKA 2LHMA 4ZFPA 3LYMA 3QE8A 4NHSA 4WM5A 4OOOA 5LVHA 3AGIA 5B05A 2H9KA 5KKIA 3WVYA 5KXKA 4XJIA 1HMKA 4WG7A 1OUDA 1HEPA 4YM8A 1B7RA 1FDLY 1HERA 3IJVA 4H90A 2Z18A 3CT0A 4UWUA 1QSWA 1QTKA 1BB6A 4ETAA 4HTNA 1J1OY 4WM2A 3EBAB 3P4ZA 2VB1A 2W1MA 1HF4A 1GF3A 2BQBA 4ETCA 3AW7A 5LYZA 5LIOA 3AGGG 3MGWA 2CJLA 1HEQA 1IR8A 2Z2EA 1G7JC 1KXXA 1IOSA 3WH1A 3W6FA 1JHLA 4LT0A 1IIZA 1BB5A 1C7PA 1B2KA 1GBSA 1YAQA 1RJCB 1GF7A 3BKVA 4W96A 1NDMC 2MEBA 4LYZA 1KXYA 1D6PA 132LA 1GXXA 2BQJA 1F0WA 2YBLA 3WUAA 4DDCA 4NGWA 5KJ9A 3AB6A 2FBDA 1QDRA 3A92A 3F6ZA 4W94A 1CKGA 3CT5A 1NWGA 1IC5Y 1QSAA 4H93A 4DC4A 5LVKA 1GXV2 2LZ2A 2NWDX 4NG8A 1GBWA 1LMQA 1OUGA 4XN6A 4GCFA 4RLMA 1LSYA 3N9CA 1OUJA 2G4NA 4B0DA 1B7OA 1GBOA 2CDSA 4WLXA 5K7OA 1UBZA 5F14A 1FN5A 1HC0A 1LSCA 3M18B 5B07A 4I8SA 5KXZA 4DD9A 4AGAA 5E9RA 4Z98A 3T36A 1REXA 1FLQA 5KY1A 1BVKC 2DQGY 1HFXA 1OUFA 1SLYA 194LA 4LT1A 4WOAA 1LYSA 3EXDA 1JJ0A 4YEMA 4BADA 1Z55A 1IX0A 1LHLA 1LYOA 3FI7A 1B7LA 5D5CA 1DPXA 2YBJA 3A6CY 3GXRA 1GWDA 1LYYA 4GCEA 2ZWBA 1TBYA 3WW6A 1BQLY 1EQEA 1BB3A 5KXSA 3B0IA 1JKAA 133LA 1XGTC 3CSZA 3N9EA 3TXIA 1JKCA 1UCOA 5HMVA 4NGLA 1T3PA 4KL7A 5KKJA 4HJVA 5L3IA 5L9JA 1GF8A 1VDSA 3A91A 4WLYA 4H9HA 5I4XA 1JPOA 4C5FA 4GLVA 3RT5X 3VWOA 4DD7A 1WQQA 1NF5A 4G4BA 4QY9A 4R0FA 4NGJA 3IJUA 1XEJA 1OUCA 2DQJY 1LMNA 4NSJA 1CKHA 1OUEA 1IR7A 3N9AA 1AKIA 2ZQ3A 5M1YA 4GLAA 1JTOL 2D4JA 1JSEA 207LA 4I0CA 4DD2A 1D9UA 1DKKA 2DQCY 4QGZA 3ZEKA 4TX7A 4HV2A 5HLLA 1LHJA 2A7DA 1LZ5A 3AZ6A 1OQMA 5F9XA 3TXHA 3LN2A 1IR9A 1JUGA 3LYOA 3WULA 2D91A 1OUIA 135LA 2HEAA 1RCMA 4H9CA 4UWNA 1BB4A 1JJ3A 1PS5A 2FBBA 3CB7A 5B59A 1VEDA 1XGRC 1B7MA 2EIZC 1LJNA 3RW8A 5C6JA 3CSRA 5EBHA 5A3ZA 5HNCA 3WYHA 3WU7A 4C3WA 1LZYA 3A3QA 3WPJA 1NDGC 1JISA 134LA 1LYZA 1YIKA 4LYTA 4OW1A 1IWUA 3P64A 3A6BY 4LYOA 4ET8A 5KXTA 2HU3A 1NKHA 4CFPA 5IELA 2I25L 4YF2A 2BQDA 1DI3A 4QEQA 1LJJA 3A95A 4XJDA 1GE2A 1JIYA 3TMXA 2YDGA 3WU8A 5F81A 4CJ2A 1BVXA 1IWYA 1XFPL 1LZCA 4TWSA 1WQPA 1QUTA 1XEIA 3TXGA 2GV0A 4IATA 1F6SA 1LMTA 2BQFA 4NSHA 3WUNA 3ATOA 1LZEA 4CGEA 1REYA 4HJYA 5JENB 1ZV5L
chains in the Genus database with same CATH superfamily
102LA 1LSNA 153LA 1B5VA 1ZMYL 4OO9A 1WQNA 1GF9A 4PK0A 2FYDA 1C6NA 111LA 1DI4A 3SP3A 158LA 1LJFA 1CUPA 1LHKA 2CUUA 199LA 4OWEA 1C6CA 1LCNA 4H92A 241LA 1KIQC 1BGIA 1GF6A 4NHIA 2IHLA 1LZNA 4XJGA 2C8OA 5LVIA 3CSQA 217LA 3B0OA 1CX7A 2OEAX 1IC4Y 3HBDA 1LMAA 5C6IA 1OUHA 1UIGA 1CU6A 1C43A 4NFVA 1C67A 3J4GA 1C63A 1BWHA 1PQMA 1IC7Y 4LFXA 1L68A 237LA 1IP7A 2YBMA 3C81A 2HEDA 2F30A 5A3EA 3VW7A 2HEBA 1LZ4A 1DYAA 2B6XA 1L32A 1DPWA 4L41A 4H94A 1LWGA 5KXWA 1D2YA 4OWCA 2ZIJA 5I4WA 4B49A 2C8PA 159LA 1GFRA 4B4JA 1QUDA 4KT3A 1L15A 4N8ZA 4BAFA 2BQAA 3QAKA 142LA 1OP9B 4KPMA 1SWZA 5APFA 1G0GA 2MEIA 1C6IA 1GAYA 1IY4A 4PRUA 4NGKA 1L41A 3W6EA 1O23A 1PZYA 4DD0A 1P7SA 4NWEA 2LCBA 2D4IA 6LZMA 4IAPA 4PGJB 4DAJA 1OV7A 4LDEA 2RBPA 4HV1A 2HEEA 2O7AA 1CJ9A 2Z37A 1ZWNA 2BQCA 118LA 1L49A 3QNGA 4I7NA 4RW2A 4MSTA 1L66A 1QTHA 2DBTA 3F9LA 2H5ZA 165LA 1LI2A 4NIJA 5I5QA 119LA 4NG1A 1JTTL 127LA 1HEMA 5FSTA 177LA 2FYCA 4J7VA 5LVGA 4DDAA 5APCA 2B5ZA 1CNSA 4YXCA 1D0LA 1L87A 1C6JA 4WL7A 2F4GA 191LA 1KIRC 2DQHY 3HBEX 2AUBA 4WM3A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2BAA A;  2YBI A;  1VFB C;  2YBN A;  5F9U A;  1W08 A;  4B4E A;  1XEK A;  4B4I A;  1LZB A;  1LSN A;  1TEW A;  1GFV A;  5HNL A;  1YQV Y;  153L A;  4H9B A;  1B5V A;  1ZMY L;  4H9E A;  4O34 A;  1GEV A;  1WQN A;  3WUM A;  1GF9 A;  2FYD A;  4H1P A;  2Y8P A;  1LJK A;  1GB0 A;  1V7T A;  1JKB A;  2XJW A;  3D9A C;  1RE2 A;  1YIL A;  3A94 A;  4HPI A;  1DI4 A;  4ETD A;  3SP3 A;  4OWA A;  1IEE A;  4LYB A;  2Z2F A;  1LZA A;  4RLN A;  2ZQ4 A;  4BAP A;  1LJF A;  1IY3 A;  4DYG A;  1VDT A;  1GB8 A;  1TAY A;  2BQN A;  4NGZ A;  4HTK A;  5KXX A;  1AM7 A;  1LHK A;  1LSB A;  3WPK A;  4OWE A;  5J7C A;  1XGQ C;  1LSD A;  1RFP A;  4QDN A;  2BLX A;  5LVJ A;  2DQA A;  1VAU A;  1LCN A;  4H92 A;  1LMC A;  5KXM A;  1IP2 A;  1LKR A;  4A7D A;  1LJI A;  3M3U A;  1IWT A;  4Z3M A;  1KIQ C;  3AYQ A;  3A34 A;  1IP4 A;  4OWH A;  4U3X B;  1ALC A;  1LZD A;  1BGI A;  5L3H A;  5ILF A;  3T6U A;  1LHH A;  4WO6 A;  3W6C A;  1GF6 A;  5IDD A;  4NHI A;  2IHL A;  1LZN A;  2BLY A;  1B7S A;  1UC0 A;  2ZYP A;  1N4F A;  2BQM A;  4GCC A;  4XJG A; 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 4KL7 A;  5KKJ A;  4HJV A;  5L3I A;  5L9J A;  1GF8 A;  1VDS A;  3A91 A;  4WLY A;  4H9H A;  5I4X A;  1JPO A;  4C5F A;  4GLV A;  3RT5 X;  3VWO A;  4DD7 A;  1WQQ A;  1NF5 A;  4G4B A;  4QY9 A;  4R0F A;  4NGJ A;  3IJU A;  1XEJ A;  1OUC A;  2DQJ Y;  1LMN A;  4NSJ A;  1CKH A;  1OUE A;  1IR7 A;  3N9A A;  1AKI A;  2ZQ3 A;  5M1Y A;  4GLA A;  1JTO L;  2D4J A;  1JSE A;  207L A;  4I0C A;  4DD2 A;  1D9U A;  1DKK A;  2DQC Y;  4QGZ A;  3ZEK A;  4TX7 A;  4HV2 A;  5HLL A;  1LHJ A;  2A7D A;  1LZ5 A;  3AZ6 A;  1OQM A;  5F9X A;  3TXH A;  3LN2 A;  1IR9 A;  1JUG A;  3LYO A;  3WUL A;  2D91 A;  1OUI A;  135L A;  2HEA A;  1RCM A;  4H9C A;  4UWN A;  1BB4 A;  1JJ3 A;  1PS5 A;  2FBB A;  3CB7 A;  5B59 A;  1VED A;  1XGR C;  1B7M A;  2EIZ C;  1LJN A;  3RW8 A;  5C6J A;  3CSR A;  5EBH A;  5A3Z A;  5HNC A;  3WYH A;  3WU7 A;  4C3W A;  1LZY A;  3A3Q A;  3WPJ A;  1NDG C;  1JIS A;  134L A;  1LYZ A;  1YIK A;  4LYT A;  4OW1 A;  1IWU A;  3P64 A;  3A6B Y;  4LYO A;  4ET8 A;  5KXT A;  2HU3 A;  1NKH A;  4CFP A;  5IEL A;  2I25 L;  4YF2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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