1I6SA

T4 lysozyme mutant c54t/c97a/n101a
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALIAMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and thermodynamic analysis of the binding of solvent at internal sites in T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2001-03-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1i6sA00
4EPIA 1SX7A 4DKLA 2HUMA 4ARQA 145LA 2RBSA 3CDVA 111LA 1D3FA 171LA 1L87A 1L16A 1L93A 218LA 3RUNA 1C67A 248LA 3C8SA 1OV5A 1QT4A 232LA 4YXAC 1ZYTA 2RBOA 212LA 224LA 1G0GA 1I6SA 3HUQA 3SBBC 176LA 1G1WA 4AQNA 1L53A 3DKEX 252LA 148LE 1LGWA 4EKPA 1PQKA 1L00A 162LA 1JQUA 1KNIA 130LA 3DN8A 1G0JA 1G0MA 1L0KA 2RBPA 180LA 1QUHA 3FA0A 4YX7C 1L76A 129LA 261LA 142LA 3HU8A 170LA 1C6FA 3PBLA 128LA 1L99A 3UONA 139LA 3HH6A 4I7JA 4EKRA 3RZEA 4I7RA 1C6DA 2OU0X 3DMXA 1G07A 1C6GA 1L65A 3CDTA 1T6HA 1C6BA 1PQJA 184LA 1D3MA 3HTFA 4I7TA 127LA 1L28A 3FI5A 199LA 226LA 2OE4X 2RBNA 214LA 1C64A 150LA 1L82A 4YXCA 197LA 1QUDA 4ARPA 1OVKA 1QT8A 1L61A 1L15A 4OO9A 258LA 3SB7A 1CV0A 1G0PA 4EXMA 1NHBA 1T8GA 1L41A 1L83A 3HDEA 1L38A 1TLAA 156LA 4ARMA 3DN4A 3V2YA 1QSBA 2NTGA 1L02A 1L85A 182LA 1OWYA 1G0QA 1G0KA 168LA 2LZMA 259LA 244LA 1DYCA 3K2RA 2RAZX 163LA 3DN0A 1L20A 3GUMA 243LA 1L49A 161LA 3SBAA 120LA 191LA 245LA 1L92A 4W54A 1LLHA 1L32A 3SB8A 4E97A 1L18A 1P7SA 118LA 1P37A 1QT3A 1C66A 4W58A 3HT9A 1P5CA 1L52A 1L58A 1DYFA 1EPYA 3HU9A 3OE8A 4EPFA 1C6NA 234LA 1L90A 211LA 2OE7X 1C61A 205LA 169LA 181LA 3OE0A 4IAPA 2OTYX 1L84A 1JTNA 1L39A 1CUPA 2O4WA 1L21A 188LA 1L74A 3L64A 3C80A 1QUOA 1CU5A 4LZMA 1CU6A 221LA 250LA 1LYFA 173LA 1LGXA 247LA 2B6YA 144LA 3L2XA 158LA 1L86A 1SSWA 3C7YA 1ZURA 255LA 3GUIA 1P3NA 3HT6A 236LA 3GUJA 1DYEA 1CV5A 1T8AA 1CU0A 164LA 2Q9DA 2B6XA 1L63A 1L98A 2ANXA 2B75A 107LA 1OYUA 1L77A 4W52A 189LA 3GULA 1QTBA 3HH3A 2B7XA 178LA 3V2WA 2L78A 213LA 4W55A 1P2RA 237LA 1DYBA 5I14A 5LZMA 1L12A 2Z6BA 3SN6R 1L69A 1CUQA 206LA 3G3XA 1QT5A 2LC9A 187LA 1C65A 1L95A 3DN3A 1L22A 1C60A 1OV7A 1L59A 1L54A 4I7LA 2B74A 2RH1A 3DN6A 1PQDA 1L72A 4I7PA 1C6EA 260LA 241LA 1QS9A 177LA 143LA 3DN1A 1L40A 2B6WA 2OU9A 4EJ4A 1D3JA 3HTBA 1L68A 3C83A 1C6TA 1L79A 1LYEA 1L27A 219LA 1C6KA 1PQMA 2B70A 220LA 1K28A 4I7MA 159LA 1CV1A 1QT7A 1L10A 185LA 1QTDA 174LA 1L89A 2RB1X 4ARJA 3HH4A 2OTZX 3C8RA 3DNAA 3HTDA 1XEPA 1LI6A 257LA 1C6LA 7LZMA 183LA 149LA 1PQOA 3C8QA 1QTHA 3DN2A 1C69A 1C63A 1KW7A 3NYAA 1L05A 2OE9X 4LDLA 1LI2A 1CX6A 1SWYA 228LA 1L06A 4EKSA 131LA 2B6ZA 1L66A 138LA 2O7AA 222LA 1LW9A 2RB0X 3C81A 1L96A 1L51A 3NY9A 3C7WA 4LDEA 146LA 1L03A 2OEAX 4S0WA 2F32A 112LA 1LYJA 1PQIA 215LA 1CV6A 1QSQA 1ZWNA 1T97A 1CTWA 3PDSA 3CDQA 3F8VA 1LWGA 4I7SA 4W56A 1XJTA 2Q9EA 137LA 1DYDA 2CUUA 2RB2X 155LA 1C6QA 1G06A 1C6AA 2QARC 242LA 227LA 3LZMA 1L01A 192LA 2A4TA 125LA 1P36A 1C6CA 1QTVA 3HWLA 1C6IA 1WTHA 102LA 1L70A 1LI3A 1KS3A 3G3WA 140LA 1OWZA 157LA 2NTHA 1P46A 1L50A 4LDOA 1OVJA 2LCBA 3DMVA 3HUAA 1L62A 172LA 3C7ZA 1L14A 249LA 223LA 246LA 104LA 4I7QA 1L26A 3DMZA 4ARQB 235LA 1D9WA 110LA 1L73A 196LA 1L13A 1SX2A 1L37A 1LPYA 1L08A 4W59A 1L25A 1L30A 1DYAA 1L09A 209LA 1CU3A 1L0JA 2F2QA 1L46A 165LA 1L94A 233LA 3C82A 108LA 167LA 2HULA 1OVHA 1SWZA 3D4SA 1L47A 4W53A 151LA 1P64A 1L17A 240LA 2RBRA 1QTCA 1D2YA 109LA 3CDRA 1L31A 1D2WA 1LYGA 126LA 3HT8A 1L33A 166LA 3HDFA 123LA 190LA 2QB0B 1L64A 1L24A 3QAKA 2OU8A 1L57A 3GUNA 4W57A 1CV4A 6LZMA 1L36A 1L67A 1KY1A 4PK0A 4GBRB 1L55A 1L42A 1CX7A 1DYGA 3GUOA 201LA 253LA 3FADA 1C6HA 254LA 1L81A 4GRVA 3JR6A 1LYDA 4I7KA 256LA 1L80A 1L43A 1LYIA 2O79A 4ZPUA 2B72A 1L71A 195LA 4I7OA 115LA 3SB6A 1LGUA 238LA 2RBQA 1QTZA 4ARLA 3GUKA 262LA 1L75A 3SB9A 4DJHA 3ODUA 1G1VA 1L35A 1C6PA 114LA 1QS5A 1C6MA 1JTMA 1P6YA 3F9LA 1LYHA 3GUPA 1CU2A 1L91A 1L11A 3EMLA 4ARMB 3VW7A 3OE6A 239LA 1B6IA 1LWKA 1L48A 225LA 4I7NA 230LA 103LA 3HTGA 1KW5A 1L29A 1T8FA 1C68A 1C62A 175LA 217LA 2IGCA 1P56A 1L44A 122LA 1L88A 1QT6A 1L23A 1L34A 3NY8A 2RAYX 3HT7A 198LA 2HUKA 141LA 1C6JA 1L97A 147LA 1CVKA 3G3VA 3OE9A 4EKQA 4DAJA 113LA 1L56A 2B6TA 1XJUA 1L60A 2ANVA 4W51A 251LA 231LA 160LA 152LA 1L07A 1D3NA 3HUKA 1QUGA 4PJZA 1L19A 210LA 3CDOA 4K5YA 186LA 216LA 229LA 3SB5A 3HH5A 2F47A 1SSYA 1G0LA 1P2LA 2B73A 119LA 1L04A 200LA 1CV3A 1L45A 1KY0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3A6CY 1FBIX 2AUBA 2HUMA 1IEEA 111LA 4GLAA 218LA 1C67A 4NG1A 1OV5A 4YXAC 2DQCY 1ZYTA 1I6SA 3SBBC 4WG7A 4Z3MA 4WL6A 1PQKA 4CHXA 5I5QA 1W6ZA 1QUHA 1EQ4A 1H6MA 1HEQA 2A7FA 1LMPA 4DD7A 1C6FA 1F0WA 128LA 1L99A 3HH6A 3RZEA 2BLXA 4LYZA 3RZ4A 1IWVA 3CDTA 1LZAA 127LA 2RBNA 4WM5A 1GF4A 1C64A 1LMQA 1MELL 2DQJY 4DYGA 1D0KA 5LXWA 1LZSA 1D0LA 1GF9A 4FDYA 4E3UA 1GDXA 1FLQA 1L61A 3ZVQA 1JJ1A 1NHBA 1T8GA 1L41A 1TLAA 1Z55A 156LA 2Z39A 4ARMA 3AGIA 3DN4A 5FEKA 1G0QA 1CKHA 1GBWA 5F16A 1B7RA 2RAZX 3WUMA 1L20A 1NDMC 3GUMA 2DQDY 120LA 245LA 3A8ZA 1L92A 5KXMA 3SB8A 1D6PA 4YM8A 118LA 1P37A 2GV0A 1QT3A 4W58A 3HT9A 4J7VA 1C6NA 4II8A 4J1BA 4Z46A 2Z19A 2ZYCA 1FLWA 205LA 4NGOA 4LYMA 1HNLA 2IHLA 2MECA 3AGHA 2BQBA 2OTYX 1L84A 5FDJA 1OUAA 3ZEKA 1C10A 1IP3A 3A34A 1HHLA 4GLVA 3C80A 4HJZA 1CU5A 4LZMA 1CU6A 1DQJC 250LA 1LYFA 1LGXA 1T3PA 1L86A 1LMOA 3M18B 3GUJA 1T8AA 2Q9DA 3RT5X 1HEMA 1YAPA 4GCFA 1L98A 3OK0A 3ULRA 1LZ6A 2B7XA 4TWSA 1WQPA 1DYBA 1L69A 3G3XA 5E4PA 2DQAA 4ML7A 3ATOA 2XQOA 3WL2A 3DN3A 4ETBA 4I7LA 3A93A 1PQDA 241LA 1GF8A 3QY4A 2D4KA 4EJ4A 3HTBA 3C83A 1HFYA 3LYMA 4D9ZA 1L79A 4WM1A 1NHEA 2B70A 5FSTA 4H92A 1GBSA 159LA 1QT7A 185LA 1W08A 2RB1X 2OTZX 3RU5A 4ETDA 4NEBA 257LA 3IWRA 4LYCA 3C8QA 149LA 1V7TA 5KXRA 4UWNA 1GFHA 1OUBA 1OP9B 5LAFA 1SWYA 2MEEA 1NBZC 1LSDA 3B0OA 4R0FA 2O7AA 1NBYC 1GDWA 2RB0X 4ET9A 3C81A 5LVKA 2YVBA 5KXNA 4HPIA 2ZNWY 4WLTA 146LA 1GBOA 1UIBA 2OEAX 112LA 2BQGA 3T36A 2Z2FA 1LAAA 1LJHA 1B7LA 215LA 1ZWNA 1T97A 1CKCA 5KXYA 1XGUC 1GFVA 1IWXA 4DDAA 2CUUA 1G06A 2QARC 1JJ0A 3LZMA 1L01A 4NGVA 5FELA 192LA 1NKHA 3CSRA 5KXTA 125LA 1WVUA 3HWLA 102LA 2W1XA 1LI3A 1C7PA 3G3WA 1IC5Y 157LA 1XGPC 3DMVA 3G3BB 4HP0A 249LA 246LA 1KIRC 1F10A 1IO5A 1SX2A 1AZFA 1F6RA 3A96A 4NSJA 1LPYA 1L08A 4W59A 1L30A 1L09A 1DI3A 1L0JA 2F2QA 1DKJA 2XBRA 4UWUA 1L47A 3J4GA 1P64A 1RI8B 2RBRA 1D2YA 126LA 3HT8A 4CFOA 1L33A 1YKXX 1JTOL 1LJEA 123LA 1REMA 2H9JA 1L64A 1DKKA 1XFPL 3GUNA 4NGKA 1L36A 1HELA 5D5FA 5HMJA 4PK0A 1L42A 1LSAA 253LA 3FADA 1VDQA 1JKCA 4GRVA 3OJPA 4W96A 1I20A 1L80A 1L71A 1B7MA 2BQJA 4I7OA 4NHSA 3M3UA 4NGZA 2RBQA 1IWYA 4ARLA 3GUKA 1TCYA 3SB9A 1G1VA 5B1GA 3ZVQB 1GWDA 1OUCA 114LA 135LA 1LZYA 3HBEX 1VDPA 4ARMB 3EMLA 1GE0A 2ZIJA 3VW7A 1B6IA 1L48A 225LA 1KW5A 2HTXA 5KXXA 1T8FA 1C68A 1P56A 2ZNXY 3CT1A 3B6LA 1L23A 1L34A 4HJYA 4LFPA 1XEJA 4MCKA 1L97A 147LA 3GXRA 1UIGA 1IP5A 1JKDA 2MEHA 3LYZA 3TXJA 1CKDA 4AXTA 3RW8A 1GB7A 4GCBA 1IY4A 134LA 4Z41A 4ET8A 3CDOA 4K5YA 216LA 3WPLA 3HH5A 3FI7A 1BVXA 1SSYA 2YBLA 1I1ZA 4KXIA 2BQAA 1CV3A 1L45A 1SX7A 4DKLA 1TDYA 4ARQA 145LA 4H8YA 171LA 3RUNA 1LHJA 4H1PA 248LA 4C5FA 1F6SA 1G0GA 1OUIA 2BQKA 2YDGA 176LA 1G1WA 4AQNA 1L53A 252LA 1LGWA 4B0DA 5LYTA 1L00A 1JQUA 1KNIA 1B5YA 1G0JA 1G0MA 2WARA 5KXPA 5KKJA 180LA 1LKSA 1L76A 5M1YA 261LA 2Z2EA 2HEBA 5F9XA 3UONA 1GFJA 2YBMA 1GF5A 3W3EA 3DMXA 1G07A 1L65A 1T6HA 1PQJA 1KXWA 3HTFA 4RDSA 1L28A 199LA 214LA 4CFPA 1IOCA 1RFPA 1LSGA 1QT8A 4N8ZA 1GXV2 258LA 3G3AB 4OWEA 1CV0A 1AM7A 1G0PA 4EXMA 1SLYA 1BWHA 3CT0A 1L83A 1L38A 1OQMA 1UIDA 6LYZA 3V2YA 3EO5A 1QSBA 1L85A 2H9KA 182LA 4XJFA 5B1FA 2F4AA 4DC4A 1XEIA 4HTQA 4G4HA 1G0KA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1T8G A;  1L41 A;  1L83 A;  3HDE A;  1L38 A;  1TLA A;  156L A;  4ARM A;  3DN4 A;  3V2Y A;  1QSB A;  2NTG A;  1L02 A;  1L85 A;  182L A;  1OWY A;  1G0Q A;  1G0K A;  168L A;  2LZM A;  259L A;  244L A;  1DYC A;  3K2R A;  2RAZ X;  163L A;  3DN0 A;  1L20 A;  3GUM A;  243L A;  1L49 A;  161L A;  3SBA A;  120L A;  191L A;  245L A;  1L92 A;  4W54 A;  1LLH A;  1L32 A;  3SB8 A;  4E97 A;  1L18 A;  1P7S A;  118L A;  1P37 A;  1QT3 A;  1C66 A;  4W58 A;  3HT9 A;  1P5C A;  1L52 A;  1L58 A;  1DYF A;  1EPY A;  3HU9 A;  3OE8 A;  4EPF A;  1C6N A;  234L A;  1L90 A;  211L A;  2OE7 X;  1C61 A;  205L A;  169L A;  181L A;  3OE0 A;  4IAP A;  2OTY X;  1L84 A;  1JTN A;  1L39 A;  1CUP A;  2O4W A;  1L21 A;  188L A;  1L74 A;  3L64 A;  3C80 A;  1QUO A;  1CU5 A;  4LZM A;  1CU6 A;  221L A;  250L A;  1LYF A;  173L A;  1LGX A;  247L A;  2B6Y A;  144L A;  3L2X A;  158L A;  1L86 A;  1SSW A;  3C7Y A;  1ZUR A;  255L A;  3GUI A;  1P3N A;  3HT6 A;  236L A;  3GUJ A;  1DYE A;  1CV5 A;  1T8A A;  1CU0 A;  164L A;  2Q9D A;  2B6X A;  1L63 A; 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 2HUL A;  1OVH A;  1SWZ A;  3D4S A;  1L47 A;  4W53 A;  151L A;  1P64 A;  1L17 A;  240L A;  2RBR A;  1QTC A;  1D2Y A;  109L A;  3CDR A;  1L31 A;  1D2W A;  1LYG A;  126L A;  3HT8 A;  1L33 A;  166L A;  3HDF A;  123L A;  190L A;  2QB0 B;  1L64 A;  1L24 A;  3QAK A;  2OU8 A;  1L57 A;  3GUN A;  4W57 A;  1CV4 A;  6LZM A;  1L36 A;  1L67 A;  1KY1 A;  4PK0 A;  4GBR B;  1L55 A;  1L42 A;  1CX7 A;  1DYG A;  3GUO A;  201L A;  253L A;  3FAD A;  1C6H A;  254L A;  1L81 A;  4GRV A;  3JR6 A;  1LYD A;  4I7K A;  256L A;  1L80 A;  1L43 A;  1LYI A;  2O79 A;  4ZPU A;  2B72 A;  1L71 A;  195L A;  4I7O A;  115L A;  3SB6 A;  1LGU A;  238L A;  2RBQ A;  1QTZ A;  4ARL A;  3GUK A;  262L A;  1L75 A;  3SB9 A;  4DJH A;  3ODU A;  1G1V A;  1L35 A;  1C6P A;  114L A;  1QS5 A;  1C6M A;  1JTM A;  1P6Y A;  3F9L A;  1LYH A;  3GUP A;  1CU2 A;  1L91 A;  1L11 A;  3EML A;  4ARM B;  3VW7 A;  3OE6 A;  239L A;  1B6I A;  1LWK A;  1L48 A;  225L A;  4I7N A;  230L A;  103L A;  3HTG A;  1KW5 A;  1L29 A;  1T8F A;  1C68 A;  1C62 A;  175L A;  217L A;  2IGC A;  1P56 A;  1L44 A;  122L A;  1L88 A;  1QT6 A;  1L23 A;  1L34 A;  3NY8 A;  2RAY X;  3HT7 A;  198L A;  2HUK A;  141L A;  1C6J A;  1L97 A;  147L A;  1CVK A;  3G3V A;  3OE9 A;  4EKQ A;  4DAJ A;  113L A;  1L56 A;  2B6T A;  1XJU A;  1L60 A;  2ANV A;  4W51 A;  251L A;  231L A;  160L A;  152L A;  1L07 A;  1D3N A;  3HUK A;  1QUG A;  4PJZ A;  1L19 A;  210L A;  3CDO A;  4K5Y A;  186L A;  216L A;  229L A;  3SB5 A;  3HH5 A;  2F47 A;  1SSY A;  1G0L A;  1P2L A;  2B73 A;  119L A;  1L04 A;  200L A;  1CV3 A;  1L45 A;  1KY0 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3A6C Y;  1FBI X;  2AUB A;  2HUM A;  1IEE A;  111L A;  4GLA A;  218L A;  1C67 A;  4NG1 A;  1OV5 A;  4YXA C;  2DQC Y;  1ZYT A;  1I6S A;  3SBB C;  4WG7 A;  4Z3M A;  4WL6 A;  1PQK A;  4CHX A;  5I5Q A;  1W6Z A;  1QUH A;  1EQ4 A;  1H6M A;  1HEQ A;  2A7F A;  1LMP A;  4DD7 A;  1C6F A;  1F0W A;  128L A;  1L99 A;  3HH6 A;  3RZE A;  2BLX A;  4LYZ A;  3RZ4 A;  1IWV A;  3CDT A;  1LZA A;  127L A;  2RBN A;  4WM5 A;  1GF4 A;  1C64 A;  1LMQ A;  1MEL L;  2DQJ Y;  4DYG A;  1D0K A;  5LXW A;  1LZS A;  1D0L A;  1GF9 A;  4FDY A;  4E3U A;  1GDX A;  1FLQ A;  1L61 A;  3ZVQ A;  1JJ1 A;  1NHB A;  1T8G A;  1L41 A;  1TLA A;  1Z55 A;  156L A;  2Z39 A;  4ARM A;  3AGI A;  3DN4 A;  5FEK A;  1G0Q A;  1CKH A;  1GBW A;  5F16 A;  1B7R A;  2RAZ X;  3WUM A;  1L20 A;  1NDM C;  3GUM A;  2DQD Y;  120L A;  245L A;  3A8Z A;  1L92 A;  5KXM A;  3SB8 A;  1D6P A;  4YM8 A;  118L A;  1P37 A;  2GV0 A;  1QT3 A;  4W58 A;  3HT9 A;  4J7V A;  1C6N A;  4II8 A;  4J1B A;  4Z46 A;  2Z19 A;  2ZYC A;  1FLW A;  205L A;  4NGO A;  4LYM A;  1HNL A;  2IHL A; 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